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6y9z

Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-13,9)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 159.5 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Gag-Pol polyprotein

Human immunodeficiency virus 1

UniProt P0C6F2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 133–352 链 B； UniProt 133–352 链 C； UniProt 133–352 链 D； UniProt 133–352 链 G； UniProt 133–352 链 H； UniProt 133–352 链 N； UniProt 133–352 链 Y； UniProt 133–352 链 d； UniProt 133–352 链 e； UniProt 133–352 链 j； UniProt 133–352 链 k； UniProt 133–352 未记录 Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A × 1 （P62937） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6Y9Z Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3LP3 p15 HIV RNaseH domain with inhibitor MK3 提交 2010-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1014–1149（136 aa） 片段：residues 1014-1149
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 LP9 3-[4-(diethylamino)phenoxy]-6-(ethoxycarbonyl)-5,8-dihydroxy-7-oxo-7,8-dihydro-1,8-naphthyridin-1-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 6.8；298 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.0, 15-20% PEG 8000, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.288
3LP3 p15 HIV RNaseH domain with inhibitor MK3 提交 2010-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1014–1149（136 aa） 片段：residues 1014-1149
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 2 LP9 3-[4-(diethylamino)phenoxy]-6-(ethoxycarbonyl)-5,8-dihydroxy-7-oxo-7,8-dihydro-1,8-naphthyridin-1-ium × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 6.8；298 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.0, 15-20% PEG 8000, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.288
3LP3 p15 HIV RNaseH domain with inhibitor MK3 提交 2010-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1014–1149（136 aa） 片段：residues 1014-1149
链 B 1014–1149（136 aa） 片段：residues 1014-1149
未记录 MN MANGANESE (II) ION × 4 LP9 3-[4-(diethylamino)phenoxy]-6-(ethoxycarbonyl)-5,8-dihydroxy-7-oxo-7,8-dihydro-1,8-naphthyridin-1-ium × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 hanging drop；pH 6.8；298 K；0.1 M Sodium citrate pH 5.0, 15-20% PEG 8000, hanging drop, temperature 298K
分辨率 2.80 Å R-free 0.288
3TH9 Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant Q7K V32I L63I with a cyclic sulfonamide inhibitor 提交 2011-08-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 489–587（99 aa） 片段：HIV protease
链 B 489–587（99 aa） 片段：HIV protease
突变：Q7K V32I L63I 突变：Q7K V32I L63I 9Y9 tert-butyl {(2S,3R)-4-[(4S)-7-fluoro-4-methyl-1,1-dioxido-4,5-dihydro-1,2-benzothiazepin-2(3H)-yl]-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M sodium acetate buffer, 0.4M NaCl, pH 5.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.34 Å R-free 0.190
3VFA Crystal Structure of HIV-1 Protease Mutant V82A with novel P1'-Ligands GRL-02031 提交 2012-01-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
链 B 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 501-599
突变：Q507K, L33I5, L563I, C567A, V582A, C595A 突变：Q507K, L33I5, L563I, C567A, V582A, C595A 031 (3aS,5R,6aR)-hexahydro-2H-cyclopenta[b]furan-5-yl [(1S,2R)-1-benzyl-2-hydroxy-3-([(4-methoxyphenyl)sulfonyl]{[(2R)-5-oxopyrrolidin-2-yl]methyl}amino)propyl]carbamate × 1 NA SODIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；298 K；0.6M NaCl, 0.1M Sodium Acetate buffer pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.43 Å R-free 0.218
4I8W Crystal structure of wild type HIV-1 protease in complex with non-peptidic inhibitor, GRL007 提交 2012-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 489–587（99 aa）
链 B 489–587（99 aa）
未记录 G07 4-{[(2R,3S)-3-({[(3R,3aS,6aR)-hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yloxy]carbonyl}amino)-2-hydroxy-4-phenylbutyl](2-methylpropyl)sulfamoyl}benzoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；1.6 M ammonium sulfate (precipitant) in 0.1 M BICINE buffer, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.96 Å R-free 0.233
4I8Z Crystal structure of wild type HIV-1 protease in complex with non-peptidic inhibitor, GRL008 提交 2012-12-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 489–587（99 aa）
链 B 489–587（99 aa）
未记录 G08 (3R,3aS,6aR)-hexahydrofuro[2,3-b]furan-3-yl [(2S,3R)-4-{[(4-carbamoylphenyl)sulfonyl](2-methylpropyl)amino}-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；298 K；1.6 M ammonium sulfate (precipitant) in 0.1 M BICINE buffer, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.75 Å R-free 0.220
4MC1 HIV protease in complex with SA526P 提交 2013-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 489-587
链 B 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 489-587
突变：Q7K V32I L63I 突变：Q7K V32I L63I CL CHLORIDE ION × 3 526 (3S)-tetrahydrofuran-3-yl {(2S,3R)-4-[(4S)-4-tert-butyl-7-fluoro-1,1-dioxido-4,5-dihydro-1,2-benzothiazepin-2(3H)-yl]-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295 K；0.7 M sodium chloride, 100 mM sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.39 Å R-free 0.188
4MC2 HIV protease in complex with SA525P 提交 2013-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 489-587
链 B 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 489-587
突变：Q7K V32I L63I 突变：Q7K V32I L63I 525 (3S)-tetrahydrofuran-3-yl {(2S,3R)-4-[(4R)-4-tert-butyl-7-fluoro-1,1-dioxido-4,5-dihydro-1,2-benzothiazepin-2(3H)-yl]-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 2 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295 K；0.7 M sodium chloride, 100 mM sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.56 Å R-free 0.207
4MC6 HIV protease in complex with SA499 提交 2013-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 489-587
链 B 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 489-587
突变：Q7K V32I L63I 突变：Q7K V32I L63I 23K 1-tert-butyl-3-{(2S,3R)-4-[(4R)-7-fluoro-1,1-dioxido-4-(propan-2-yl)-4,5-dihydro-1,2-benzothiazepin-2(3H)-yl]-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl}urea × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295 K；0.7 M sodium chloride, 100 mM sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.31 Å R-free 0.198
4MC9 HIV protease in complex with AA74 提交 2013-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 489-587
链 B 489–587（99 aa） 片段：UNP residues 489-587
突变：Q7K V32I L63I 突变：Q7K V32I L63I 23L (3S)-tetrahydrofuran-3-yl {(2S,3R)-4-[(4R)-7-fluoro-1,1-dioxido-4-(propan-2-yl)-4,5-dihydro-1,2-benzothiazepin-2(3H)-yl]-3-hydroxy-1-phenylbutan-2-yl}carbamate × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2 CL CHLORIDE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；295 K；0.7 M sodium chloride, 100 mM sodium citrate, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.19 Å R-free 0.195
4NYF HIV integrase in complex with inhibitor 提交 2013-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1199–1357（159 aa） 片段：Integrase catalytic domain residues 1199-1357
链 B 1199–1357（159 aa） 片段：Integrase catalytic domain residues 1199-1357
突变：C56S, W131D, F139D, F185K 突变：C56S, W131D, F139D, F185K 4BI (2S)-tert-butoxy[4-(4-chlorophenyl)-2-methylquinolin-3-yl]ethanoic acid × 1 CD CADMIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；297 K；1.2 -1.5 M Ammonium Sulfate, 100mM Na citrate pH 5.6, 50mM Cadmium chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
分辨率 1.90 Å R-free 0.223
4QGI X-ray crystal structure of HIV-1 protease variant G48T/L89M in complex with Saquinavir 提交 2014-05-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 489–587（99 aa） 片段：HIV-1 Protease Chain A, unp residues 489-587
链 B 489–587（99 aa） 片段：HIV-1 Protease Chain A, unp residues 489-587
突变：G48T, L89M 突变：G48T, L89M ROC (2S)-N-[(2S,3R)-4-[(2S,3S,4aS,8aS)-3-(tert-butylcarbamoyl)-3,4,4a,5,6,7,8,8a-octahydro-1H-isoquinolin-2-yl]-3-hydroxy-1 -phenyl-butan-2-yl]-2-(quinolin-2-ylcarbonylamino)butanediamide × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；293 K；0.1 M Sodium citrate, 20% 2-propanol, 20% PEG 4000 , pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.246
5K14 HIV-1 Reverse Transcriptase in complex with a 2,6-difluorophenyl DAPY analog 提交 2016-05-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 588–1027（440 aa）
未记录 IB1 4-{[4-(2,6-difluoro-4-methoxybenzene-1-carbonyl)pyrimidin-2-yl]amino}benzonitrile × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；293 K；1.0M K/Na tartrate 100mM MES pH 6.0
分辨率 2.40 Å R-free 0.261
6Y9V Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-8,13) 提交 2020-03-10 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 133–352（220 aa）
链 B 133–352（220 aa）
链 C 133–352（220 aa）
链 D 133–352（220 aa）
链 G 133–352（220 aa）
链 H 133–352（220 aa）
链 N 133–352（220 aa）
链 Y 133–352（220 aa）
链 d 133–352（220 aa）
链 e 133–352（220 aa）
链 j 133–352（220 aa）
链 k 133–352（220 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6Y9W Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-13,8) 提交 2020-03-10 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 133–352（220 aa）
链 B 133–352（220 aa）
链 C 133–352（220 aa）
链 D 133–352（220 aa）
链 G 133–352（220 aa）
链 H 133–352（220 aa）
链 N 133–352（220 aa）
链 Y 133–352（220 aa）
链 d 133–352（220 aa）
链 e 133–352（220 aa）
链 j 133–352（220 aa）
链 k 133–352（220 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6Y9X Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-13,7) 提交 2020-03-10 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 133–352（220 aa）
链 B 133–352（220 aa）
链 C 133–352（220 aa）
链 D 133–352（220 aa）
链 G 133–352（220 aa）
链 H 133–352（220 aa）
链 N 133–352（220 aa）
链 Y 133–352（220 aa）
链 d 133–352（220 aa）
链 e 133–352（220 aa）
链 j 133–352（220 aa）
链 k 133–352（220 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6Y9Y Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-7,13) 提交 2020-03-10 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 133–352（220 aa）
链 B 133–352（220 aa）
链 C 133–352（220 aa）
链 D 133–352（220 aa）
链 G 133–352（220 aa）
链 H 133–352（220 aa）
链 N 133–352（220 aa）
链 Y 133–352（220 aa）
链 d 133–352（220 aa）
链 e 133–352（220 aa）
链 j 133–352（220 aa）
链 k 133–352（220 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
9JA0 The capsid protein of HIV 1 提交 2024-08-23 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 A 133–353（221 aa）
链 B 133–353（221 aa）
链 C 133–353（221 aa）
链 D 133–353（221 aa）
链 E 133–353（221 aa）
链 F 133–353（221 aa）
链 G 133–353（221 aa）
链 H 133–353（221 aa）
链 I 133–353（221 aa）
链 J 133–353（221 aa）
链 K 133–353（221 aa）
链 L 133–353（221 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.14 Å

共 17 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 POL_HV1LW
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 B； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 C； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 D； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 G； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 H； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 N； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 Y； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 d； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 e； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 j； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352 作者链 k； PDB构建体 1–220； UniProt 133–352

Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A

Homo sapiens

UniProt P62937

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白拷贝数一致 链 J； UniProt 2–165 未记录 Gag-Pol polyprotein × 12 （P0C6F2） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.80 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6Y9Z Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1AK4 HUMAN CYCLOPHILIN A BOUND TO THE AMINO-TERMINAL DOMAIN OF HIV-1 CAPSID 提交 1997-05-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；THE PROTEIN SOLUTION WAS 0.25 MM CYPA AND 0.25 MM CA(151) IN 10 MM TRISHCL (PH 8.0) AND 1 MM 2-MERCAPTOETHANOL. THE RESERVOIR SOLUTION WAS 1ML OF 1.0 M LICL, 0.1 M BICINE (PH 7.0), AND 22% POLYETHYLENE GLYCOL 8000. THE INITIAL DROP WAS 6 MICROL OF A 1:1 MIX OF PROTEIN AND RESERVOIR SOLUTIONS.
分辨率 2.36 Å R-free 0.306
1AK4 HUMAN CYCLOPHILIN A BOUND TO THE AMINO-TERMINAL DOMAIN OF HIV-1 CAPSID 提交 1997-05-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；THE PROTEIN SOLUTION WAS 0.25 MM CYPA AND 0.25 MM CA(151) IN 10 MM TRISHCL (PH 8.0) AND 1 MM 2-MERCAPTOETHANOL. THE RESERVOIR SOLUTION WAS 1ML OF 1.0 M LICL, 0.1 M BICINE (PH 7.0), AND 22% POLYETHYLENE GLYCOL 8000. THE INITIAL DROP WAS 6 MICROL OF A 1:1 MIX OF PROTEIN AND RESERVOIR SOLUTIONS.
分辨率 2.36 Å R-free 0.306
1AWQ CYPA COMPLEXED WITH HAGPIA (PSEUDO-SYMMETRIC MONOMER) 提交 1997-10-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 1.58 Å R-free 0.433
1AWR CYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 1.58 Å R-free 0.461
1AWR CYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 1.58 Å R-free 0.461
1AWR CYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 1.58 Å R-free 0.461
1AWR CYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 1.58 Å R-free 0.461
1AWR CYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 1.58 Å R-free 0.461
1AWR CYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 1.58 Å R-free 0.461
1AWS SECYPA COMPLEXED WITH HAGPIA (PSEUDO-SYMMETRIC MONOMER) 提交 1997-10-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：SELENO-METHIONINE SUBSTITUTED 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.55 Å R-free 0.337
1AWT SECYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：SELENO-METHIONINE SUBSTITUTED 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.55 Å R-free 0.465
1AWT SECYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–164（164 aa）
突变：SELENO-METHIONINE SUBSTITUTED 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.55 Å R-free 0.465
1AWT SECYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–164（164 aa）
突变：SELENO-METHIONINE SUBSTITUTED 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.55 Å R-free 0.465
1AWT SECYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–164（164 aa）
突变：SELENO-METHIONINE SUBSTITUTED 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.55 Å R-free 0.465
1AWT SECYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
突变：SELENO-METHIONINE SUBSTITUTED 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.55 Å R-free 0.465
1AWT SECYPA COMPLEXED WITH HAGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–164（164 aa）
突变：SELENO-METHIONINE SUBSTITUTED 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.55 Å R-free 0.465
1AWU CYPA COMPLEXED WITH HVGPIA (PSEUDO-SYMMETRIC MONOMER) 提交 1997-10-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.34 Å R-free 0.351
1AWV CYPA COMPLEXED WITH HVGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.34 Å R-free 0.460
1AWV CYPA COMPLEXED WITH HVGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.34 Å R-free 0.460
1AWV CYPA COMPLEXED WITH HVGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.34 Å R-free 0.460
1AWV CYPA COMPLEXED WITH HVGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.34 Å R-free 0.460
1AWV CYPA COMPLEXED WITH HVGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.34 Å R-free 0.460
1AWV CYPA COMPLEXED WITH HVGPIA 提交 1997-10-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.4；pH 8.4
分辨率 2.34 Å R-free 0.460
1BCK HUMAN CYCLOPHILIN A COMPLEXED WITH 2-THR CYCLOSPORIN 提交 1998-04-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；PH 8.0
分辨率 1.80 Å
1CWF HUMAN CYCLOPHILIN A COMPLEXED WITH 2-VAL CYCLOSPORIN 提交 1998-04-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.86 Å
1CWH HUMAN CYCLOPHILIN A COMPLEXED WITH 3-D-SER CYCLOSPORIN 提交 1998-05-07 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；PH 8.0
分辨率 1.86 Å
1CWI HUMAN CYCLOPHILIN A COMPLEXED WITH 2-VAL 3-(N-METHYL)-D-ALANINE CYCLOSPORIN 提交 1998-05-25 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；PH 8.0
分辨率 1.90 Å
1CWM HUMAN CYCLOPHILIN A COMPLEXED WITH 4 MEILE CYCLOSPORIN 提交 1998-05-26 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；PH 8.0
分辨率 2.00 Å
1CWO HUMAN CYCLOPHILIN A COMPLEXED WITH THR2, LEU5, D-HIV8, LEU10 CYCLOSPORIN 提交 1998-06-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.2；PH 8.2
分辨率 1.86 Å
1FGL Cyclophilin A complexed with a fragment of HIV-1 GAG protein 提交 1996-11-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.80 Å R-free 0.256
1M63 Crystal structure of calcineurin-cyclophilin-cyclosporin shows common but distinct recognition of immunophilin-drug complexes 提交 2002-07-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 0–164（165 aa）
链 G 0–164（165 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 FE FE (III) ION × 2 CA CALCIUM ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 6.5；0.1 M NA CACODYLATE, 0.2 M MGCL2, 13% PEG8000, 2.5% ETHANOL, PH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 295K
分辨率 2.80 Å R-free 0.322
1M9C X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type Complex. 提交 2002-07-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 2.00 Å R-free 0.259
1M9C X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type Complex. 提交 2002-07-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 2.00 Å R-free 0.259
1M9D X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) O-type chimera Complex. 提交 2002-07-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
1M9D X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) O-type chimera Complex. 提交 2002-07-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
1M9E X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A Complex. 提交 2002-07-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–163（163 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.72 Å R-free 0.226
1M9E X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A Complex. 提交 2002-07-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–163（163 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.72 Å R-free 0.226
1M9F X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,A88M Complex. 提交 2002-07-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.73 Å R-free 0.220
1M9F X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,A88M Complex. 提交 2002-07-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.73 Å R-free 0.220
1M9X X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,A88M,G89A Complex. 提交 2002-07-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.70 Å R-free 0.230
1M9X X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,A88M,G89A Complex. 提交 2002-07-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.70 Å R-free 0.230
1M9X X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,A88M,G89A Complex. 提交 2002-07-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.70 Å R-free 0.230
1M9X X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,A88M,G89A Complex. 提交 2002-07-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.70 Å R-free 0.230
1M9Y X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,G89A Complex. 提交 2002-07-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.90 Å R-free 0.234
1M9Y X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,G89A Complex. 提交 2002-07-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.90 Å R-free 0.234
1M9Y X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,G89A Complex. 提交 2002-07-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.90 Å R-free 0.234
1M9Y X-ray crystal structure of Cyclophilin A/HIV-1 CA N-terminal domain (1-146) M-type H87A,G89A Complex. 提交 2002-07-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；294 K；PEG 8K, Bicine, LiCl, Tris, Beta-mercaptoethanol, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
分辨率 1.90 Å R-free 0.234
1MF8 Crystal Structure of human calcineurin complexed with cyclosporin A and human cyclophilin 提交 2002-08-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 0–164（165 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；12% PEG 4000, 5MM POTASSIUM PHOSPHATE, 75MM SODIUM CITRATE, 15% GLYCEROL, 5MM TRIS, PH 4.6, MICROBATCH, TEMPERATURE 292K
分辨率 3.10 Å R-free 0.300
1NMK The Sanglifehrin-Cyclophilin Interaction: Degradation Work, Synthetic Macrocyclic Analogues, X-ray Crystal Structure and Binding Data 提交 2003-01-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 0–164（165 aa）
未记录 SFM (13E,15E)-(3S,6S,9R,10R,11S,12S,18S,21S)-10,12-DIHYDROXY-3-(3-HYDROXYBEN-ZYL)-18-((E)-3-HYDROXY-1-METHYLPROPENYL)-6-ISOPROPYL-11-METHYL-9-(3-OXO-BUTYL)-19-OXA-1,4,7,25-TETRAAZA-BICYCLO[19.3.1]PENTACOSA-13,15-DIENE-2,5,8,20-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 6000, tris-HCl, NaCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.189
1NMK The Sanglifehrin-Cyclophilin Interaction: Degradation Work, Synthetic Macrocyclic Analogues, X-ray Crystal Structure and Binding Data 提交 2003-01-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 0–164（165 aa）
未记录 SFM (13E,15E)-(3S,6S,9R,10R,11S,12S,18S,21S)-10,12-DIHYDROXY-3-(3-HYDROXYBEN-ZYL)-18-((E)-3-HYDROXY-1-METHYLPROPENYL)-6-ISOPROPYL-11-METHYL-9-(3-OXO-BUTYL)-19-OXA-1,4,7,25-TETRAAZA-BICYCLO[19.3.1]PENTACOSA-13,15-DIENE-2,5,8,20-TETRAONE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；PEG 6000, tris-HCl, NaCl, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.10 Å R-free 0.189
1OCA HUMAN CYCLOPHILIN A, UNLIGATED, NMR, 20 STRUCTURES 提交 1997-07-07 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；299 K
分辨率未提供
1W8L Enzymatic and structural characterization of non peptide ligand cyclophilin complexes 提交 2004-09-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 1P3 (3R)-1-ACETYL-3-METHYLPIPERIDINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；100MM TRIS.HCL (PH 8.0), 22% (W/V) PEG 8000, 5% (V/V) DMSO, 0.02% NAN3.
分辨率 1.80 Å R-free 0.230
1W8M Enzymatic and Structural Characterisation of Non Peptide Ligand Cyclophilin Complexes 提交 2004-09-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 E1P ETHYL OXO(PIPERIDIN-1-YL)ACETATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；100MM TRIS.HCL (PH 8.0), 22% (W/V) PEG 8000, 5% (V/V) DMSO, 0.02% NAN3.
分辨率 1.65 Å R-free 0.186
1W8V Enzymatic and structural characterization of non peptide ligand cyclophilin complexes 提交 2004-09-28 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；14 MG/ML IN HEPES 20MM, NACL 100 MM AND NAN3 0.02 % (W/V). CRYSTALS OF HCYPA WERE GROWN BY VAPOUR DIFFUSION AT 17C BY THE HANGING DROP METHOD IN 100MM TRIS.HCL (PH 8.0), 22% (W/V) PEG 8000, 5% (V/V) DMSO, 0.02% NAN3.
分辨率 1.70 Å R-free 0.219
1YND Structure of human cyclophilin A in complex with the novel immunosuppressant sanglifehrin A at 1.6A resolution 提交 2005-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 0–164（165 aa）
未记录 SFA SANGLIFEHRIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Mg acetate, Na cacodylate, PEG4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.185
1YND Structure of human cyclophilin A in complex with the novel immunosuppressant sanglifehrin A at 1.6A resolution 提交 2005-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 0–164（165 aa）
未记录 SFA SANGLIFEHRIN A × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；Mg acetate, Na cacodylate, PEG4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.60 Å R-free 0.185
1ZKF Cyrstal Structure of Human Cyclophilin-A in Complex with suc-AGPF-pNA 提交 2005-05-02 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；298 K；Ammonium Sulfate, Tris-HCL, Sodium Azide, Dimethyl Sulfoxide, Glycerol, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.210
1ZKF Cyrstal Structure of Human Cyclophilin-A in Complex with suc-AGPF-pNA 提交 2005-05-02 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.2；298 K；Ammonium Sulfate, Tris-HCL, Sodium Azide, Dimethyl Sulfoxide, Glycerol, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
分辨率 2.55 Å R-free 0.210
2ALF crystal structure of human CypA mutant K131A 提交 2005-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
突变：K131A MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 EVAPORATION；pH 8.5；277 K；Tris Hydrochloride, Polyethylene Glycol 8000, magnesium chloride, pH 8.5, EVAPORATION, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.226
2CPL SIMILARITIES AND DIFFERENCES BETWEEN HUMAN CYCLOPHILIN A AND OTHER BETA-BARREL STRUCTURES. STRUCTURAL REFINEMENT AT 1.63 ANGSTROMS RESOLUTION 提交 1992-06-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.63 Å
2MS4 Cyclophilin a complexed with a fragment of crk-ii 提交 2014-07-22 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成 0.8 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2MZU Extending the eNOE data set of large proteins by evaluation of NOEs with unresolved diagonals 提交 2015-02-24 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；299 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成 1.5mm mM [U-100% 13C; U-100% 15N] sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2N0T Structural ensemble of the enzyme cyclophilin reveals an orchestrated mode of action at atomic resolution 提交 2015-03-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；26 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient
NMR样品组成 1.8 mM [U-100% 15N] sodium phosphate, 97% H2O/3% D2O | 97% H2O/3% D2O
分辨率未提供
2RMA Crystal structures of cyclophilin A complexed with cyclosporin A and N-methyl-4-[(E)-2-butenyl]-4,4-dimethylthreonine cyclosporin A 提交 1994-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–164（164 aa）
链 C 1–164（164 aa）
链 E 1–164（164 aa）
链 G 1–164（164 aa）
链 I 1–164（164 aa）
链 K 1–164（164 aa）
链 M 1–164（164 aa）
链 O 1–164（164 aa）
链 Q 1–164（164 aa）
链 S 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å
2RMB Crystal structures of cyclophilin A complexed with cyclosporin A and N-methyl-4-[(E)-2-butenyl]-4,4-dimethylthreonine cyclosporin A 提交 1994-01-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 A 1–164（164 aa）
链 C 1–164（164 aa）
链 E 1–164（164 aa）
链 G 1–164（164 aa）
链 I 1–164（164 aa）
链 K 1–164（164 aa）
链 M 1–164（164 aa）
链 O 1–164（164 aa）
链 Q 1–164（164 aa）
链 S 1–164（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å
2X25 Free acetyl-CypA orthorhombic form 提交 2010-01-11 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 2–165（164 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.20 Å R-free 0.156
2X2A Free acetyl-CypA trigonal form 提交 2010-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–165（165 aa）
链 B 1–165（165 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GOL GLYCEROL × 1 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.40 Å R-free 0.161
2X2C acetyl-CypA:cyclosporine complex 提交 2010-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 K 1–165（165 aa）
链 M 1–165（165 aa）
链 O 1–165（165 aa）
链 Q 1–165（165 aa）
链 S 1–165（165 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.41 Å R-free 0.264
2X2D acetyl-CypA:HIV-1 N-term capsid domain complex 提交 2010-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.95 Å R-free 0.257
2X2D acetyl-CypA:HIV-1 N-term capsid domain complex 提交 2010-01-12 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–165（165 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.95 Å R-free 0.257
2XGY Complex of Rabbit Endogenous Lentivirus (RELIK)Capsid with Cyclophilin A 提交 2010-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–165（165 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；16-26% PEG3350, 0.1M HEPES PH 7.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.187
3K0M Cryogenic structure of CypA 提交 2009-09-24 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；100 mM HEPES pH 7.5, 22% PEG 3350, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.25 Å R-free 0.149
3K0N Room temperature structure of CypA 提交 2009-09-24 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；100 mM HEPES pH 7.5, 22% PEG 3350, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.39 Å R-free 0.160
3K0O Room temperature structure of CypA mutant Ser99Thr 提交 2009-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
突变：S99T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.8 M DL-malic acid, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.55 Å R-free 0.148
3K0P Cryogenic structure of CypA mutant Ser99Thr 提交 2009-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
突变：S99T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.8 M DL-malic acid, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.65 Å R-free 0.176
3K0Q Cryogenic structure of CypA mutant Ser99Thr (2) 提交 2009-09-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
突变：S99T 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；100 mM HEPES pH 7.5, 22% PEG 3350, 5 mM TCEP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.32 Å R-free 0.247
3K0R Cryogenic structure of CypA mutant Arg55Lys 提交 2009-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
突变：R55K 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；291 K；1.8 M DL-malic acid, pH 7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.42 Å R-free 0.236
3RDD Human Cyclophilin A Complexed with an Inhibitor 提交 2011-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 EA4 ethyl N-[(4-aminobenzyl)carbamoyl]glycinate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；100 mM HEPES, 20% PEG10000, 5% ethanol, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 2.14 Å R-free 0.272
4IPZ SmBz bound to Cyclophilin A 提交 2013-01-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；290 K；1M LiCl, 0.1M MES, 30% (w/v) PEG6000, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K
分辨率 1.67 Å R-free 0.218
4N1M Structure of Cyclophilin A in complex with GlyPro. 提交 2013-10-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 GLY GLYCINE × 1 PRO PROLINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；Tris, PEG8000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.15 Å R-free 0.163
4N1N Structure of Cyclophilin A in complex with Benzamide. 提交 2013-10-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 UNU BENZAMIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；Tris, PEG8000, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.50 Å R-free 0.213
4N1O Structure of Cyclophilin A in complex with Saccharin. 提交 2013-10-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 LSA 1,2-BENZISOTHIAZOL-3(2H)-ONE 1,1-DIOXIDE × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；Tris, PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.75 Å R-free 0.221
4N1P Structure of Cyclophilin A in complex with Picolinamide. 提交 2013-10-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 WM1 pyridine-2-carboxamide × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；Tris, PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.90 Å R-free 0.258
4N1Q Structure of Cyclophilin A in complex with cyclohexanecarboxamide. 提交 2013-10-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 WM2 cyclohexanecarboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；Tris, PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.65 Å R-free 0.220
4N1R Structure of Cyclophilin A in complex with benzenesulfonohydrazide. 提交 2013-10-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 WM3 benzenesulfonohydrazide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；Tris, PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.223
4N1S Structure of Cyclophilin A in complex with benzohydrazide. 提交 2013-10-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 WM4 benzohydrazide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；Tris, PEG8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.47 Å R-free 0.224
4YUG Multiconformer synchrotron model of CypA at 100 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.48 Å R-free 0.183
4YUH Multiconformer synchrotron model of CypA at 150 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.34 Å R-free 0.156
4YUI Multiconformer synchrotron model of CypA at 180 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.38 Å R-free 0.175
4YUJ Multiconformer synchrotron model of CypA at 240 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.42 Å R-free 0.156
4YUK Multiconformer synchrotron model of CypA at 260 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.48 Å R-free 0.168
4YUL Multiconformer synchrotron model of CypA at 280 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.42 Å R-free 0.143
4YUM Multiconformer synchrotron model of CypA at 300 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.50 Å R-free 0.144
4YUN Multiconformer synchrotron model of CypA at 310 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.58 Å R-free 0.150
4YUO High-resolution multiconformer synchrotron model of CypA at 273 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.20 Å R-free 0.146
4YUP Multiconformer fixed-target X-ray free electron (XFEL) model of CypA at 273 K 提交 2015-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；Crystals were grown by mixing equal volumes of well solution (100 mM HEPES pH 7.5, 23% PEG 3350, 5 mM TCEP) and protein (60 mg/mL in 20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 0.5 mM TCEP) in the hanging-drop format.
分辨率 1.75 Å R-free 0.249
5F66 High-resolution isotropic multiconformer synchrotron model of CypA at 273 K 提交 2015-12-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.15 Å R-free 0.195
5FJB Cyclophilin A Stabilize HIV-1 Capsid through a Novel Non- canonical Binding Site 提交 2015-10-07 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 C 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.00 Å
5KUL Human cyclophilin A at 100K, Data set 1 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.219
5KUN Human cyclophilin A at 100K, Data set 2 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.208
5KUO Human cyclophilin A at 100K, Data set 3 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.214
5KUQ Human cyclophilin A at 100K, Data set 4 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.211
5KUR Human cyclophilin A at 100K, Data set 5 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.207
5KUS Human cyclophilin A at 100K, Data set 6 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.213
5KUU Human cyclophilin A at 100K, Data set 7 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.208
5KUV Human cyclophilin A at 100K, Data set 8 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.194
5KUW Human cyclophilin A at 100K, Data set 9 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.213
5KUZ Human cyclophilin A at 278K, Data set 1 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.184
5KV0 Human cyclophilin A at 278K, Data set 2 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.193
5KV1 Human cyclophilin A at 278K, Data set 3 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.198
5KV2 Human cyclophilin A at 278K, Data set 4 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
5KV3 Human cyclophilin A at 278K, Data set 5 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.201
5KV4 Human cyclophilin A at 278K, Data set 6 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.200
5KV5 Human cyclophilin A at 278K, Data set 7 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.210
5KV6 Human cyclophilin A at 278K, Data set 8 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.224
5KV7 Human cyclophilin A at 278K, Data set 9 提交 2016-07-13 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；CRYSTALS WERE GROWN BY MIXING EQUAL VOLUMES OF WELL SOLUTION (100 MM HEPES PH 7.5, 23% PEG 3350, 5 MM TCEP) AND PROTEIN (60 MG/ML IN 20 MM HEPES PH 7.5, 100 MM NACL, 0.5 MM TCEP) IN THE HANGING-DROP FORMAT.
分辨率 1.70 Å R-free 0.223
5NOQ Structure of cyclophilin A in complex with 3-chloropyridin-2-amine 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 93E 3-chloranylpyridin-2-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.60 Å R-free 0.196
5NOR Structure of cyclophilin A in complex with 3-methylpyridin-2-amine 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 93Q 3-methylpyridin-2-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.80 Å R-free 0.203
5NOS Structure of cyclophilin A in complex with 3-amino-1H-pyridin-2-one 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 92Z 5-azanyl-3~{H}-pyridin-6-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.35 Å R-free 0.165
5NOT Structure of cyclophilin A in complex with 4-chloropyrimidin-5-amine 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 938 4-chloranylpyrimidin-5-amine × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.45 Å R-free 0.183
5NOU Structure of cyclophilin A in complex with hexahydropyrimidin-2-one 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 L60 1,3-diazinan-2-one × 3 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.30 Å R-free 0.163
5NOV Structure of cyclophilin A in complex with hexahydropyrimidine-2-thione 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 93B 1,3-diazinane-2-thione × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 2.00 Å R-free 0.265
5NOW Structure of cyclophilin A in complex with pyridine-3,4-diamine 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 L89 pyridine-3,4-diamine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.48 Å R-free 0.219
5NOX Structure of cyclophilin A in complex with 2-chloropyridin-3-amine 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 L97 2-chloranylpyridin-3-amine × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.49 Å R-free 0.199
5NOY Structure of cyclophilin A in complex with 3,4-diaminobenzamide 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 93K 3,4-bis(azanyl)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.43 Å R-free 0.182
5NOZ Structure of cyclophilin A in complex with 3,4-diaminobenzohydrazide 提交 2017-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 L99 3,4-bis(azanyl)benzohydrazide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.61 Å R-free 0.216
5T9U Discovery of a Potent Cyclophilin Inhibitor (Compound 3) based on Structural Simplification of Sanglifehrin A 提交 2016-09-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–164（164 aa）
未记录 7HG 3-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-10,12-dimethoxy-9,11-dimethyl-6-(propan-2-yl)-19-oxa-1,4,7,25-tetraazabicyclo[19.3.1]pentacosa-13,15-diene-2,5,8,20-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5 0.1 M potassium chloride 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.193
5T9U Discovery of a Potent Cyclophilin Inhibitor (Compound 3) based on Structural Simplification of Sanglifehrin A 提交 2016-09-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–164（164 aa）
未记录 7HG 3-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-10,12-dimethoxy-9,11-dimethyl-6-(propan-2-yl)-19-oxa-1,4,7,25-tetraazabicyclo[19.3.1]pentacosa-13,15-diene-2,5,8,20-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5 0.1 M potassium chloride 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.193
5T9U Discovery of a Potent Cyclophilin Inhibitor (Compound 3) based on Structural Simplification of Sanglifehrin A 提交 2016-09-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–164（164 aa）
未记录 7HG 3-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-10,12-dimethoxy-9,11-dimethyl-6-(propan-2-yl)-19-oxa-1,4,7,25-tetraazabicyclo[19.3.1]pentacosa-13,15-diene-2,5,8,20-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5 0.1 M potassium chloride 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.193
5T9U Discovery of a Potent Cyclophilin Inhibitor (Compound 3) based on Structural Simplification of Sanglifehrin A 提交 2016-09-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–164（164 aa）
未记录 7HG 3-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-10,12-dimethoxy-9,11-dimethyl-6-(propan-2-yl)-19-oxa-1,4,7,25-tetraazabicyclo[19.3.1]pentacosa-13,15-diene-2,5,8,20-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5 0.1 M potassium chloride 2.2 M ammonium sulfate
分辨率 2.30 Å R-free 0.193
5T9W Discovery of a Potent Cyclophilin Inhibitor (Compound 5) based on Structural Simplification of Sanglifehrin A 提交 2016-09-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 78E 3-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-6-(propan-2-yl)-19-oxa-1,4,7,25-tetraazabicyclo[19.3.1]pentacosa-13,15-diene-2,5,8,20-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；0.05 M monobasic potassium phosphate 20% (w/v) PEG 8000
分辨率 2.00 Å R-free 0.184
5T9Z Discovery of a Potent Cyclophilin Inhibitor (Compound 6) based on Structural Simplification of Sanglifehrin A 提交 2016-09-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–164（163 aa）
未记录 78R 11-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-18-methoxy-17-methyl-14-(propan-2-yl)-3-oxa-9,12,15,28-tetraazatricyclo[21.3.1.1~5,9~]octacosa-1(27),21,23,25-tetraene-4,10,13,16-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.2；293 K；sodium citrate, pH 4.2 25% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.40 Å R-free 0.190
5TA2 Discovery of a Potent Cyclophilin Inhibitor (Compound 7) based on Structural Simplification of Sanglifehrin A 提交 2016-09-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–164（163 aa）
未记录 78X 11-[(3-hydroxyphenyl)methyl]-18-methoxy-2,17-dimethyl-14-(propan-2-yl)-3-oxa-9,12,15,28-tetraazatricyclo[21.3.1.1~5,9~]octacosa-1(27),21,23,25-tetraene-4,10,13,16-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；sodium citrate, pH 4.2 25% (w/v) PEG 3350
分辨率 1.48 Å R-free 0.183
5TA4 Discovery of a Potent Cyclophilin Inhibitor (Compound 8) based on Structural Simplification of Sanglifehrin A 提交 2016-09-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 838 18-methoxy-2,11,17-trimethyl-14-(propan-2-yl)-3-oxa-9,12,15,28-tetraazatricyclo[21.3.1.1~5,9~]octacosa-1(27),21,23,25-tetraene-4,10,13,16-tetrone × 1 SO4 SULFATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；293 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5 0.2 M potassium chloride 2.0 M ammonium sulfate
分辨率 1.50 Å R-free 0.206
5WC7 CypA Mutant - I97V S99T C115S 提交 2017-06-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
突变：I97V, S99T, C115S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；100 MM HEPES PH 7.5, 22% PEG 3350
分辨率 1.43 Å R-free 0.127
6BTA CypA Mutant - S99T C115S 提交 2017-12-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
突变：S99T, C115S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；100 MM HEPES PH 7.5, 22% PEG 3350
分辨率 1.50 Å R-free 0.146
6GJI Cyclophilin A complexed with the tri-vector ligand 8. 提交 2018-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 F1E ethyl 2-[[(4-aminophenyl)methyl-[(1-methyl-1,2,3-triazol-4-yl)methyl]carbamoyl]amino]ethanoate × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.60 Å R-free 0.191
6GJJ Cyclophilin A complexed with tri-vector ligand 2. 提交 2018-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 L36 ethyl 2-[[(4-aminophenyl)methyl-propyl-carbamoyl]amino]ethanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.38 Å R-free 0.185
6GJL Cyclophilin A complexed with tri-vector ligand 10. 提交 2018-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 F1Q ethyl 2-[[(4-aminophenyl)methyl-(1~{H}-1,2,3,4-tetrazol-5-ylmethyl)carbamoyl]amino]ethanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.16 Å R-free 0.192
6GJM Cyclophilin A complexed with tri-vector ligand 4. 提交 2018-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 L36 ethyl 2-[[(4-aminophenyl)methyl-propyl-carbamoyl]amino]ethanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.35 Å R-free 0.178
6GJN Cyclophilin A complexed with tri-vector ligand 15. 提交 2018-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 F0Q 1-[(4-aminophenyl)methyl]-3-[2-[(2~{R})-2-(2-bromophenyl)pyrrolidin-1-yl]-2-oxidanylidene-ethyl]-1-[(2-methyl-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)methyl]urea × 1 FMT FORMIC ACID × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.70 Å R-free 0.203
6GJP Cyclophilin A complexed with tri-vector ligand 7. 提交 2018-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 F0T ethyl 2-[[(4-aminophenyl)methyl-(cyclopropylmethyl)carbamoyl]amino]ethanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.94 Å R-free 0.237
6GJR Cyclophilin A complexed with tri-vector ligand 9. 提交 2018-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 F0W ethyl 2-[[(4-aminophenyl)methyl-[(2-methyl-1,2,3,4-tetrazol-5-yl)methyl]carbamoyl]amino]ethanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.69 Å R-free 0.262
6GJY Cyclophilin A complexed with tri-vector ligand 5. 提交 2018-05-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 F1Z ethyl 2-[[(4-aminophenyl)methyl-prop-2-ynyl-carbamoyl]amino]ethanoate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；279.15 K；PEG 8000, Tris-HCl
分辨率 1.29 Å R-free 0.188
6GS6 Cyclophilin A single mutant D66A in complex with an inhibitor. 提交 2018-06-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
突变：D66A EA4 ethyl N-[(4-aminobenzyl)carbamoyl]glycinate × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289.15 K；2.2 M Ammonium Sulfate
分辨率 1.16 Å R-free 0.170
6I42 Structure of the alpha-Synuclein PreNAC/Cyclophilin A-complex 提交 2018-11-08 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7；293 K；1.93 M tri-ammonium citrate, pH 7.0
分辨率 1.38 Å R-free 0.178
6U5C RT XFEL structure of CypA solved using MESH injection system 提交 2019-08-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.5；291 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 5 mM TCEP, 20% PEG3350
分辨率 1.62 Å R-free 0.157
6U5D RT XFEL structure of CypA solved using LCP injection system 提交 2019-08-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.5；291 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 5 mM TCEP, 20% PEG3350
分辨率 1.65 Å R-free 0.167
6U5E RT XFEL structure of CypA solved using celloluse carrier media 提交 2019-08-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 BATCH MODE；pH 7.5；291 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 5 mM TCEP, 20% PEG3350
分辨率 1.56 Å R-free 0.151
6U5G MicroED structure of a FIB-milled CypA Crystal 提交 2019-08-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å R-free 0.224
6X3R Human cyclophilin A bound to a series of acylcic and macrocyclic inhibitors 提交 2020-05-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 ZXX methyl (3~{S})-1-[(2~{S})-2-[[(2~{S})-2-acetamido-3-methyl-butanoyl]amino]-3-(3-hydroxyphenyl)propanoyl]-1,2-diazinane-3-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20 mM Tris-HCl, pH 8.5, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 20-35% PEG3350, 5% ethanol
分辨率 1.80 Å R-free 0.197
6X3Y Human cyclophilin A bound to a series of acylcic and macrocyclic inhibitors 提交 2020-05-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 UMM tert-butyl [(2S)-1-{[(3S,17S)-2,16-dioxo-10,15-dioxa-1,21-diazatricyclo[15.3.1.1~5,9~]docosa-5(22),6,8-trien-3-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20 mM Tris-HCl, pH 8.5, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 20-35% PEG3350, 5% ethanol
分辨率 1.40 Å R-free 0.171
6X4M Human cyclophilin A bound to a series of acylcic and macrocyclic inhibitors: tert-butyl [(2S)-1-{[(3S,17S)-2,16-dioxo-10,15-dioxa-1,21-diazatricyclo[15.3.1.1~5,9~]docosa-5(22),6,8-trien-3-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate (compound 3) 提交 2020-05-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 UMM tert-butyl [(2S)-1-{[(3S,17S)-2,16-dioxo-10,15-dioxa-1,21-diazatricyclo[15.3.1.1~5,9~]docosa-5(22),6,8-trien-3-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]carbamate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20 mM Tris-HCl, pH 8.5, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 20-35% PEG3350, 5% ethanol
分辨率 1.50 Å R-free 0.171
6X4N Human cyclophilin A bound to a series of acylcic and macrocyclic inhibitors: (2R,5S,11S,14S,18E)-2,11,17,17-tetramethyl-14-(propan-2-yl)-3-oxa-9,12,15,26,29-pentaazatetracyclo[18.5.3.1~5,9~.0~23,27~]nonacosa-1(25),18,20(28),21,23,26-hexaene-4,10,13,16-tetrone (compound 24) 提交 2020-05-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 UOD (2R,5S,11S,14S,18E)-2,11,17,17-tetramethyl-14-(propan-2-yl)-3-oxa-9,12,15,26,29-pentaazatetracyclo[18.5.3.1~5,9~.0~23,27~]nonacosa-1(25),18,20(28),21,23,26-hexaene-4,10,13,16-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20 mM Tris-HCl, pH 8.5, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 20-35% PEG3350, 5% ethanol
分辨率 1.51 Å R-free 0.180
6X4O Human cyclophilin A bound to a series of acylcic and macrocyclic inhibitors: (2R,5S,11S,14S,18E)-2,11-dimethyl-14-(propan-2-yl)-3-oxa-9,12,15,21,29-pentaazatetracyclo[18.5.3.1~5,9~.0~23,27~]nonacosa-1(26),18,20,22,24,27-hexaene-4,10,13,16-tetrone (compound 21) 提交 2020-05-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 UO7 (2R,5S,11S,14S,18E)-2,11-dimethyl-14-(propan-2-yl)-3-oxa-9,12,15,21,29-pentaazatetracyclo[18.5.3.1~5,9~.0~23,27~]nonacosa-1(26),18,20,22,24,27-hexaene-4,10,13,16-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20 mM Tris-HCl, pH 8.5, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 20-35% PEG3350, 5% ethanol
分辨率 1.50 Å R-free 0.198
6X4P Human cyclophilin A bound to a series of acylcic and macrocyclic inhibitors: (2R,5S,11S,14S,18E)-2,11,17,17-tetramethyl-14-(propan-2-yl)-15-oxa-3,9,12,26,29-pentaazatetracyclo[18.5.3.1~5,9~.0~23,27~]nonacosa-1(25),18,20(28),21,23,26-hexaene-4,10,13,16-tetrone (compound 28) 提交 2020-05-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 UOG (2R,5S,11S,14S,18E)-2,11,17,17-tetramethyl-14-(propan-2-yl)-15-oxa-3,9,12,26,29-pentaazatetracyclo[18.5.3.1~5,9~.0~23,27~]nonacosa-1(25),18,20(28),21,23,26-hexaene-4,10,13,16-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；20 mM Tris-HCl, pH 8.5, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 20-35% PEG3350, 5% ethanol
分辨率 1.50 Å R-free 0.177
6X4Q Human cyclophilin A bound to a series of acylcic and macrocyclic inhibitors: (2R,5S,11S,14S,18E)-14-cyclobutyl-2,11,17,17-tetramethyl-15-oxa-3,9,12,26,29-pentaazatetracyclo[18.5.3.1~5,9~.0~23,27~]nonacosa-1(25),18,20(28),21,23,26-hexaene-4,10,13,16-tetrone (compound 33) 提交 2020-05-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 UOJ (2R,5S,11S,14S,18E)-14-cyclobutyl-2,11,17,17-tetramethyl-15-oxa-3,9,12,26,29-pentaazatetracyclo[18.5.3.1~5,9~.0~23,27~]nonacosa-1(25),18,20(28),21,23,26-hexaene-4,10,13,16-tetrone × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；20 mM Tris-HCl, pH 8.5, 2 mM DTT, 2 mM EDTA, 20-35% PEG 3350, 5% ethanol
分辨率 1.80 Å R-free 0.191
6Y9V Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-8,13) 提交 2020-03-10 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
6Y9W Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-13,8) 提交 2020-03-10 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6Y9X Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-13,7) 提交 2020-03-10 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6Y9Y Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-7,13) 提交 2020-03-10 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.10 Å
6ZDJ Structure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-13,10) 提交 2020-06-14 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
7ABT Structure of PPIA in complex with PR dipeptide repeat 提交 2020-09-08 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–164（163 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, 25% PEG1000
分辨率 1.31 Å R-free 0.166
7N9X CA-targeting nanobody is a tool for studying HIV-1 capsid lattice interactions 提交 2021-06-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric
链 GGG 1–165（165 aa）
链 HHH 1–165（165 aa）
链 III 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 MICROBATCH；295 K；100 mM Bis-Tris propane, pH 6.8, 15% PEG3350, 200 mM sodium
分辨率 3.51 Å R-free 0.270
7PCJ X-ray structure of CypA-C52AK125C/CsA/aromatic foldamer complex 提交 2021-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–165（165 aa）
突变：K125C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；Tris 0.1M, PEG 3350 15%, NaN3 3mM
分辨率 1.91 Å R-free 0.219
7PCJ X-ray structure of CypA-C52AK125C/CsA/aromatic foldamer complex 提交 2021-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 D 1–165（165 aa）
突变：K125C 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.4；293 K；Tris 0.1M, PEG 3350 15%, NaN3 3mM
分辨率 1.91 Å R-free 0.219
7QBW Human Cyclophilin A double mutant C52AK125C 提交 2021-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；HEPES 60mM, NaCl 50mM, TCEP 5mM, 10% PEG 3350, NaN3 1.5mM
分辨率 1.59 Å R-free 0.191
7TA8 NMR structure of crosslinked cyclophilin A 提交 2021-12-20 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR样品组成 390 uM [U-13C; U-15N] cyclophilin A, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
分辨率未提供
7UPN Maedi visna virus Vif in complex with CypA and E3 ubiquitin ligase 提交 2022-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–165（165 aa）
链 B 1–165（165 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7UXJ Structure of PPIA in complex with FP29102, a Helicon Polypeptide 提交 2022-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 NH2 AMINO GROUP × 1 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15 M Potassium bromide, 30% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 2.07 Å R-free 0.262
7UXJ Structure of PPIA in complex with FP29102, a Helicon Polypeptide 提交 2022-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–165（165 aa）
未记录 NH2 AMINO GROUP × 1 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15 M Potassium bromide, 30% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 2.07 Å R-free 0.262
7UXJ Structure of PPIA in complex with FP29102, a Helicon Polypeptide 提交 2022-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 NH2 AMINO GROUP × 1 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15 M Potassium bromide, 30% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 2.07 Å R-free 0.262
7UXJ Structure of PPIA in complex with FP29102, a Helicon Polypeptide 提交 2022-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 NH2 AMINO GROUP × 1 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15 M Potassium bromide, 30% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 2.07 Å R-free 0.262
7UXM Structure of PPIA in complex with FP29092, a Helicon Polypeptide 提交 2022-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 NH2 AMINO GROUP × 1 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15 M Potassium bromide, 30% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 1.20 Å R-free 0.190
7UXM Structure of PPIA in complex with FP29092, a Helicon Polypeptide 提交 2022-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–165（165 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 NH2 AMINO GROUP × 1 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15 M Potassium bromide, 30% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 1.20 Å R-free 0.190
7UXM Structure of PPIA in complex with FP29092, a Helicon Polypeptide 提交 2022-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 NH2 AMINO GROUP × 1 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.15 M Potassium bromide, 30% w/v Polyethylene glycol monomethyl ether 2,000
分辨率 1.20 Å R-free 0.190
7UXN Structure of PPIA in complex with FP29103, a Helicon Polypeptide 提交 2022-05-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 WHL N,N'-(1,4-phenylene)diacetamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；0.2 M Sodium acetate, 0.1 M Sodium cacodylate pH 6.5, 30% w/v PEG 8000.
分辨率 1.36 Å R-free 0.217
8G9P Tricomplex of RMC-4998, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 YV2 (2S)-2-{(5S)-7-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；22% PEG 3350, 100 mM NaCl
分辨率 1.50 Å R-free 0.188
8G9P Tricomplex of RMC-4998, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 YV2 (2S)-2-{(5S)-7-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；22% PEG 3350, 100 mM NaCl
分辨率 1.50 Å R-free 0.188
8G9Q Tricomplex of Compound-1, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-02-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 YV6 methyl (3S)-1-[N-(4-sulfanylbutanoyl)-L-valyl-3-hydroxy-L-phenylalanyl]-1,2-diazinane-3-carboxylate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22% PEG 3350, 100 mM NaCl, 100 mM Bis-Tris pH 5.5
分辨率 1.40 Å R-free 0.214
8HZ8 Structure of PPIA in complex with the peptide of NRF2 提交 2023-01-08 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–165（164 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG 3350, Hepes, TCEP
分辨率 1.81 Å R-free 0.248
8TBF Tricomplex of RMC-7977, KRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；24% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
8TBF Tricomplex of RMC-7977, KRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；24% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.210
8TBG Tricomplex of RMC-7977, HRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；28% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.20 Å R-free 0.192
8TBG Tricomplex of RMC-7977, HRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；28% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.20 Å R-free 0.192
8TBH Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12R, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；17% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.225
8TBH Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12R, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；17% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 8.0
分辨率 1.50 Å R-free 0.225
8TBI Tricomplex of RMC-7977, NRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；27% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.59 Å R-free 0.208
8TBI Tricomplex of RMC-7977, NRAS WT, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；27% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.59 Å R-free 0.208
8TBJ Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12A, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；24% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.45 Å R-free 0.215
8TBJ Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12A, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；24% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.45 Å R-free 0.215
8TBK Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；27% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 7.0
分辨率 1.26 Å R-free 0.184
8TBK Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12C, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；27% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 7.0
分辨率 1.26 Å R-free 0.184
8TBL Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12D, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；25% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.227
8TBL Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12D, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；25% PEG4000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0
分辨率 1.88 Å R-free 0.227
8TBM Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12V, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；24% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.57 Å R-free 0.211
8TBM Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12V, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；24% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.57 Å R-free 0.211
8TBN Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12S, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；22% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.46 Å R-free 0.197
8TBN Tricomplex of RMC-7977, KRAS G12S, and CypA 提交 2023-06-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；22% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.46 Å R-free 0.197
9AX6 Tricomplex of RMC-6236, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 25% PEG4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.227
9AX6 Tricomplex of RMC-6236, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-03-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M Tris, pH 8.0, 25% PEG4000
分辨率 1.65 Å R-free 0.227
9BFV Tri-complex of Compound-23, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1AOV (3R)-1-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-N-[(2S)-1-{[(1P,8R,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.20 Å R-free 0.189
9BFV Tri-complex of Compound-23, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1AOV (3R)-1-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-N-[(2S)-1-{[(1P,8R,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.20 Å R-free 0.189
9BFW Tri-complex of Compound-4, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 A1AOM 1-acetyl-N-[(2S)-1-{[(1M,8S,10R,14S,20S)-22-cyano-4-hydroxy-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,20,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,21,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylazetidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5
分辨率 1.20 Å R-free 0.147
9BFX Tri-complex of Elironrasib (RMC-6291), KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOD 1-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-N-[(2R)-1-{[(2S,6S,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-5,16-dioxa-2,10,22,28-tetraazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),20,23,26-tetraen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-4-fluoro-N-methylpiperidine-4-carboxamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM sodium chloride
分辨率 1.40 Å R-free 0.209
9BFX Tri-complex of Elironrasib (RMC-6291), KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOD 1-[(2E)-4-(dimethylamino)-4-methylpent-2-enoyl]-N-[(2R)-1-{[(2S,6S,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-5,16-dioxa-2,10,22,28-tetraazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),20,23,26-tetraen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-4-fluoro-N-methylpiperidine-4-carboxamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM sodium chloride
分辨率 1.40 Å R-free 0.209
9BFY Tri-complex of Compound-14, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1AOL (3R)-N-[(2S)-1-{[(1M,8R,10R,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methyl-1-propanoylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.26 Å R-free 0.189
9BFY Tri-complex of Compound-14, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1AOL (3R)-N-[(2S)-1-{[(1M,8R,10R,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methyl-1-propanoylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.26 Å R-free 0.189
9BFZ Tri-complex of Compound-5, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOK (3R)-N-[(2S)-1-{[(1M,8R,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-[2-(2-methoxyethyl)phenyl]-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methyl-1-propanoylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
9BFZ Tri-complex of Compound-5, KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOK (3R)-N-[(2S)-1-{[(1M,8R,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-[2-(2-methoxyethyl)phenyl]-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methyl-1-propanoylpyrrolidine-3-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；25% PEG 3350, 0.1M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.80 Å R-free 0.222
9BG0 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), NRAS WT, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；29% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.64 Å R-free 0.236
9BG0 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), NRAS WT, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；29% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.64 Å R-free 0.236
9BG1 Tri-complex of Compound-3, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOH (2R)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methyl-2-(N-methylacetamido)butanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.51 Å R-free 0.226
9BG1 Tri-complex of Compound-3, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOH (2R)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methyl-2-(N-methylacetamido)butanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.51 Å R-free 0.226
9BG2 Tri-complex of Compound-10, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOJ (1S,2R)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.64 Å R-free 0.228
9BG2 Tri-complex of Compound-10, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOJ (1S,2R)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.64 Å R-free 0.228
9BG3 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), NRAS Q61K, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；25.5% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.33 Å R-free 0.198
9BG3 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), NRAS Q61K, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；25.5% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.33 Å R-free 0.198
9BG4 Tri-complex of Compound-2, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 A1AOG (2R)-N-[(1P,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-3-methyl-2-(N-methylacetamido)butanamide (non-preferred name) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 nM NaCl
分辨率 1.14 Å R-free 0.177
9BG4 Tri-complex of Compound-2, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 2 A1AOG (2R)-N-[(1P,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-3-methyl-2-(N-methylacetamido)butanamide (non-preferred name) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 nM NaCl
分辨率 1.14 Å R-free 0.177
9BG5 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G13D, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；24% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.67 Å R-free 0.266
9BG5 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G13D, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；24% PEG4000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.67 Å R-free 0.266
9BG6 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.66 Å R-free 0.240
9BG6 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.66 Å R-free 0.240
9BG7 Tri-complex of Compound-6, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOI N-[(2R)-1-{[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-3-methoxy-N-methylazetidine-1-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.60 Å R-free 0.203
9BG7 Tri-complex of Compound-6, KRAS G12V, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AOI N-[(2R)-1-{[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-3-methoxy-N-methylazetidine-1-carboxamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；28% PEG 3350, 0.1M Bis Tris, pH 5.5, 150 mM NaCl
分辨率 1.60 Å R-free 0.203
9BG8 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), NRAS Q61R, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM sodium chloride
分辨率 1.20 Å R-free 0.186
9BG8 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), NRAS Q61R, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BTB 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；25% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 150 mM sodium chloride
分辨率 1.20 Å R-free 0.186
9BG9 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS WT, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.58 Å R-free 0.231
9BG9 Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS WT, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；25% PEG6000, 0.1 M imidazole, pH 7
分辨率 1.58 Å R-free 0.231
9BGA Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；28% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.41 Å R-free 0.229
9BGA Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12C, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；28% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.41 Å R-free 0.229
9BGB Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS Q61H, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；29% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.68 Å R-free 0.230
9BGB Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS Q61H, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；291 K；29% PEG4000, 0.1 M Tris, pH 8
分辨率 1.68 Å R-free 0.230
9BGC Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12R, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22% PEG2000 MME, 0.10 M Tris, pH 8
分辨率 1.87 Å R-free 0.272
9BGC Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), KRAS G12R, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22% PEG2000 MME, 0.10 M Tris, pH 8
分辨率 1.87 Å R-free 0.272
9BGD Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), NRAS Q61L, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 133 mM sodium chloride
分辨率 1.76 Å R-free 0.237
9BGD Tri-complex of Daraxonrasib (RMC-6236), NRAS Q61L, and CypA 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AHB (1R,2S)-N-[(1P,7S,9S,13R,20M)-21-ethyl-20-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]-5-(4-methylpiperazin-1-yl)pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-2-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；291 K；21% PEG3350, 0.1 M Bis-Tris, pH 5.5, 133 mM sodium chloride
分辨率 1.76 Å R-free 0.237
9BHO Crystal structure of KRAS G12S in a transition state mimetic complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–165（165 aa）
链 D 1–165（165 aa）
未记录 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris pH 8.5, 15% PEG 20000
分辨率 1.89 Å R-free 0.218
9BHP Crystal structure of KRAS G12C in a transition state mimetic complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–165（165 aa）
链 D 1–165（165 aa）
未记录 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5, 20% PEG 10000
分辨率 2.10 Å R-free 0.253
9BHQ Crystal structure of KRAS G12A in a transition state mimetic complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–165（165 aa）
链 D 1–165（165 aa）
未记录 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris pH 8.5, 15% PEG 10000
分辨率 1.90 Å R-free 0.232
9BI1 Crystal structure of GMPPNP bound KRAS G12D in complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–165（165 aa）
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5, 24% PEG 10000
分辨率 1.65 Å R-free 0.260
9BI2 Crystal structure of GMPPNP bound KRAS G12C in complex with CYPA and RMC-7977 提交 2024-04-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–165（165 aa）
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 ZNI (1R,5S,6r)-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-21-ethyl-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-oxabicyclo[3.1.0]hexane-6-carboxamide × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；100 mM Tris-HCl pH 8.5, 24% PEG 10000
分辨率 2.15 Å R-free 0.236
9CT7 Tricomplex of Compound 1, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZV (2R)-2-cyclopentyl-N-[(1M,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-2-(N-methylacetamido)acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；18-23% PEG3350 + 0.11-0.2M NaCl + 0.10M Bis Tris pH 5.5
分辨率 1.42 Å R-free 0.204
9CT7 Tricomplex of Compound 1, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZV (2R)-2-cyclopentyl-N-[(1M,8S,10R,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]-2-(N-methylacetamido)acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；18-23% PEG3350 + 0.11-0.2M NaCl + 0.10M Bis Tris pH 5.5
分辨率 1.42 Å R-free 0.204
9CT8 Tricomplex of Compound 2, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AZX (2R)-2-amino-N-(2-{[(1R)-1-cyclopentyl-2-{[(1M,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-2-oxoethyl](methyl)amino}-2-oxoethyl)-N-methylpropanamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22-27% PEG3350 + 0.11-0.20M NaCl + 0.10M MES pH 5.5
分辨率 1.28 Å R-free 0.190
9CT8 Tricomplex of Compound 2, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AZX (2R)-2-amino-N-(2-{[(1R)-1-cyclopentyl-2-{[(1M,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-2-oxoethyl](methyl)amino}-2-oxoethyl)-N-methylpropanamide (non-preferred name) × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；22-27% PEG3350 + 0.11-0.20M NaCl + 0.10M MES pH 5.5
分辨率 1.28 Å R-free 0.190
9CT9 Tricomplex of Compound 3, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZY (2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-2-aminopropanoyl]-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-2-cyclopentyl-N-[(1M,8S,10S,14R,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350 + 0.20M Sodium chloride + 0.10M MES pH 5.5 + 1.25% Glycerol
分辨率 1.35 Å R-free 0.185
9CT9 Tricomplex of Compound 3, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZY (2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-2-aminopropanoyl]-1-oxo-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-2-cyclopentyl-N-[(1M,8S,10S,14R,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；20% PEG 3350 + 0.20M Sodium chloride + 0.10M MES pH 5.5 + 1.25% Glycerol
分辨率 1.35 Å R-free 0.185
9CTA Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AZW (2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-3-cyclopropyl-2-(methylamino)propanoyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-21-(2,2,2-trifluoroethyl)-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；MES 5.5, NaCl, PEG3350
分辨率 1.29 Å R-free 0.194
9CTA Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 A1AZW (2R)-2-{(5S)-7-[(2R)-3-cyclopropyl-2-(methylamino)propanoyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-21-(2,2,2-trifluoroethyl)-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；MES 5.5, NaCl, PEG3350
分辨率 1.29 Å R-free 0.194
9CTB Tri-complex of zoldonrasib (RMC-9805), KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZZ (2R)-2-cyclopentyl-2-{(5S)-7-[(2R)-3-cyclopropyl-2-(methylamino)propanoyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(2S,6R,8S,10R,14S,21M)-21-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-22-(2,2,2-trifluoroethyl)-5,16-dioxa-2,10,22,28-tetraazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),20,23,26-tetraen-8-yl]acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES 5.5, 20% PEG3350, 0.1 M NaCl
分辨率 1.29 Å R-free 0.194
9CTB Tri-complex of zoldonrasib (RMC-9805), KRAS G12D, and CypA 提交 2024-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1AZZ (2R)-2-cyclopentyl-2-{(5S)-7-[(2R)-3-cyclopropyl-2-(methylamino)propanoyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(2S,6R,8S,10R,14S,21M)-21-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-22-(2,2,2-trifluoroethyl)-5,16-dioxa-2,10,22,28-tetraazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),20,23,26-tetraen-8-yl]acetamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES 5.5, 20% PEG3350, 0.1 M NaCl
分辨率 1.29 Å R-free 0.194
9E3S Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12N, and CypA 提交 2024-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1BEA (2R)-2-{(5S)-7-[(2R,3R)-3-cyclopropyl-1-methylaziridine-2-carbonyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-21-(2,2,2-trifluoroethyl)-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES 6 pH, 0.1-0.2 M NaCl, 21-26 %w/v PEG 3350
分辨率 1.08 Å R-free 0.178
9E3S Tricomplex of RMC-9945, KRAS G12N, and CypA 提交 2024-10-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–165（165 aa）
未记录 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1BEA (2R)-2-{(5S)-7-[(2R,3R)-3-cyclopropyl-1-methylaziridine-2-carbonyl]-2,7-diazaspiro[4.4]nonan-2-yl}-N-[(1P,7S,9S,13S,20M)-20-{5-(4-cyclopropylpiperazin-1-yl)-2-[(1R)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-17,17-dimethyl-8,14-dioxo-21-(2,2,2-trifluoroethyl)-15-oxa-4-thia-9,21,27,28-tetraazapentacyclo[17.5.2.1~2,5~.1~9,13~.0~22,26~]octacosa-1(24),2,5(28),19,22,25-hexaen-7-yl]-3-methylbutanamide (non-preferred name) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；0.1 M MES 6 pH, 0.1-0.2 M NaCl, 21-26 %w/v PEG 3350
分辨率 1.08 Å R-free 0.178
9GHY Cyclophilin A in complex with Sanglifehrin A analogue (2R,3S,7S,10S,E)-10-(3-aminopropyl)-2,7-dimethylspiro[3,8,11-triaza-1(2,7)-quinolina-5(3,1)-pyridazinacyclopentadecaphanene-13,5'-[1,3]dioxan]-14-ene-4,6,9,12-tetraone 提交 2024-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–165（165 aa）
未记录 A1ILH (2R,3S,7S,10S,E)-10-(3-aminopropyl)-2,7-dimethylspiro[3,8,11-triaza-1(2,7)-quinolina-5(3,1)-pyridazinacyclopentadecaphanene-13,5'-[1,3]dioxan]-14-ene-4,6,9,12-tetraone × 1 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；28% PEG-3350, 0.1 M Tris-HCl pH 8.8
分辨率 1.15 Å R-free 0.149
9YOW Crystal structure of GMPPNP bound KRAS G12C in complex with CYPA and RMC-4791 提交 2025-10-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1CYT 1-cyano-N-[(2S)-1-{[(1M,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M Tris pH 8.0, 0.2 M NaCl, 20% PEG 6000
分辨率 1.57 Å R-free 0.245
9YOW Crystal structure of GMPPNP bound KRAS G12C in complex with CYPA and RMC-4791 提交 2025-10-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 A1CYT 1-cyano-N-[(2S)-1-{[(1M,8S,10S,14S,21M)-22-ethyl-4-hydroxy-21-{2-[(1S)-1-methoxyethyl]pyridin-3-yl}-18,18-dimethyl-9,15-dioxo-16-oxa-10,22,28-triazapentacyclo[18.5.2.1~2,6~.1~10,14~.0~23,27~]nonacosa-1(25),2(29),3,5,20,23,26-heptaen-8-yl]amino}-3-methyl-1-oxobutan-2-yl]-N-methylcyclopropane-1-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298.15 K；0.1 M Tris pH 8.0, 0.2 M NaCl, 20% PEG 6000
分辨率 1.57 Å R-free 0.245

共 183 个其他 PDB 条目、258 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PPIA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–164； UniProt 2–165

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6y9z

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6y9z
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6y9z
沉积日期 deposition_date2020-03-10
结构标题 titleStructure of the native full-length HIV-1 capsid protein in complex with Cyclophilin A from helical assembly (-13,9)
关键词 keywordsHIV, capsid, hexamer, helical assembly, curvature, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier48.72 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron48.25 Å
零角强度 I(0) i01026590000.00
分子量 molecular_weight262750.0 kDa
排除体积 excluded_volume328100 ų
包络体积 envelope_volume521540 ų
水化壳体积 shell_volume89528 ų
包络直径 envelope_diameter173.2 Å
壳层 Rg shell_rg53.04 Å
包络 Rg envelope_rg46.95 Å
形状 Rg shape_rg48.24 Å
总 Rg total_rg48.48 Å
总原子数 total_atoms18418
残基数 n_residues2364
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax159.5 Å
Rg (实空间) rg_real48.50 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.33 Å
I(0) (实空间) i0_real1.0270e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.8910e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal48.72 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1027000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8836
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary59.8 Å
偏度 Skewness skewness0.211
峰度 Kurtosis kurtosis-0.408
角度范围 angular_range— – 0.1600 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha82650000.0000
实空间数据点数 n_real_points33
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.868; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.896
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)