6ymy

Cytochrome c oxidase from Saccharomyces cerevisiae

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c oxidase subunit 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–530； UniProt 5–534

Cytochrome c oxidase subunit 2

物种未注明

UniProt P00410

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–236； UniProt 16–251

Cytochrome c oxidase subunit 3

物种未注明

UniProt P00420

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 c； PDB构建体 1–268； UniProt 2–269

Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial

物种未注明

UniProt P04037

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–117； UniProt 30–146

Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial

物种未注明

UniProt P00424

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX5A_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–128； UniProt 25–152

Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial

物种未注明

UniProt P00427

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX6_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 f； PDB构建体 1–99； UniProt 47–145

Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial

物种未注明

UniProt P10174

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 g； PDB构建体 1–55； UniProt 3–57

Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial

物种未注明

UniProt P04039

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	COX8_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 h； PDB构建体 1–51； UniProt 28–78

Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial

物种未注明

UniProt P07255

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COX9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 i； PDB构建体 1–52； UniProt 2–53

Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q01519

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COX12_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 j； PDB构建体 1–78； UniProt 6–83

Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial

物种未注明

UniProt P32799

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial × 1 （Q2V2P9） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COX13_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 k； PDB构建体 1–114； UniProt 16–129

Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q2V2P9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Cytochrome c oxidase subunit 1 × 1 （P00401） Cytochrome c oxidase subunit 2 × 1 （P00410） Cytochrome c oxidase subunit 3 × 1 （P00420） Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial × 1 （P04037） Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial × 1 （P00424） Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial × 1 （P00427） Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial × 1 （P10174） Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial × 1 （P04039） Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial × 1 （P07255） Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial × 1 （Q01519） Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial × 1 （P32799） COPPER (II) ION × 1 HEME-A × 2 PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE × 7 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 1 DINUCLEAR COPPER ION × 1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE × 3 ZINC ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	COX26_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 m； PDB构建体 1–38； UniProt 26–63

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6ymy
沉积日期 deposition_date	2020-04-10
结构标题 title	Cytochrome c oxidase from Saccharomyces cerevisiae
关键词 keywords	CIV, CytcO, ELECTRON TRANSPORT; ELECTRON TRANSPORT
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6ymy__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6ymy__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6ymy__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	39.68 Å
Rg（电子密度）	38.37 Å
总 Rg	38.86 Å
原子数	14612
残基数	1766
排除体积	265470 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6ymy__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (19)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 1
分子量 formula_weight	58316.9 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a
原子数 atom_count	14612

WLYSTNAKDIAVLYFMLAIFSGMAGTAMSLIIRLELAAPGSQYLHGNSQLFNVLVVGHAVLMIFFLVMPALIGGFGNYLLPLMIGATDTAFPRINNIAFWVLPMGLVCLVTSTLVESGAGTGWTVYPPLSSIQAHSGPSVDLAIFALHLTSISSLLGAINFIVTTLNMRTNGMTMHKLPLFVWSIFITAFLLLLSLPVLSAGITMLLLDRNFNTSFFEVSGGGDPILYEHLFWFFGHPEVYILIIPGFGIISHVVSTYSKKPVFGEISMVYAMASIGLLGFLVWSHHMYIVGLDADTRAYFTSATMIIAIPTGIKIFSWLATIHGGSIRLATPMLYAIAFLFLFTMGGLTGVALANASLDVAFHDTYYVVGHFHYVLSMGAIFSLFAGYYYWSPQILGLNYNEKLAQIQFWLIFIGANVIFFPMHFLGINGMPRRIPDYPDAFAGWNYVASIGSFIATLSLFLFIYILYDQLVNGLNNKVNNKSVIYNKAPDFVESNTIFNLNTVKSSSIEFLLTSPPAVHSFNTPAVQS

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 2
分子量 formula_weight	26779.8 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

DVPTPYACYFQDSATPNQEGILELHDNIMFYLLVILGLVSWMLYTIVMTYSKNPIAYKYIKHGQTIEVIWTIFPAVILLIIAFPSFILLYLCDEVISPAMTIKAIGYQWYWKYEYSDFINDSGETVEFESYVIPDELLEEGQLRLLDTDTSMVVPVDTHIRFVVTAADVIHDFAIPSLGIKVDATPGRLNQVSALIQREGVFYGACSELCGTGHANMPIKIEAVSLPKFLEWLNEQ

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 3
分子量 formula_weight	30252.4 kDa
EC 编号 ec_number	1.9.3.1
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

THLERSRHQQHPFHMVMPSPWPIVVSFALLSLALSTALTMHGYIGNMNMVYLALFVLLTSSILWFRDIVAEATYLGDHTMAVRKGINLGFLMFVLSEVLIFAGLFWAYFHSAMSPDVTLGACWPPVGIEAVQPTELPLLNTIILLSSGATVTYSHHALIAGNRNKALSGLLITFWLIVIFVTCQYIEYTNAAFTISDGVYGSVFYAGTGLHFLHMVMLAAMLGVNYWRMRNYHLTAGHHVGYETTIIYTHVLDVIWLFLYVVFYWWGV

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial
分子量 formula_weight	12694.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

VVKTAQNLAEVNGPETLIGPGAKEGTVPTDLDQETGLARLELLGKLEGIDVFDTKPLDSSRKGTMKDPIIIESYDDYRYVGCTGSPAGSHTIMWLKPTVNEVARCWECGSVYKLNPV

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial
分子量 formula_weight	14324.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

ALSNAAVMDLQSRWENMPSTEQQDIVSKLSERQKLPWAQLTEPEKQAVWYISYGEWGPRRPVLNKGDSSFIAKGVAAGLLFSVGLFAVVRMAGGQDAKTMNKEWQLKSDEYLKSKNANPWGGYSQVQS

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial
分子量 formula_weight	11725.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

ETFEEFTARYEKEFDEAYDLFEVQRVLNNCFSYDLVPAPAVIEKALRAARRVNDLPTAIRVFEALKYKVENEDQYKAYLDELKDVRQELGVPLKEELFP

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial
分子量 formula_weight	6410.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g

NKVIQLQKIFQSSTKPLWWRHPRSALYLYPFYAIFAVAVVTPLLYIPNAIRGIKA

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial
分子量 formula_weight	5737.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	h

VHFKDGVYENIPFKVKGRKTPYALSHFGFFAIGFAVPFVACYVQLKKSGAF

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial
分子量 formula_weight	6056.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	i

TIAPITGTIKRRVIMDIVLGFSLGGVMASYWWWGFHMDKINKREKFYAELAE

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial
分子量 formula_weight	9225.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

NSPLHTVGFDARFPQQNQTKHCWQSYVDYHKCVNMKGEDFAPCKVFWKTYNALCPLDWIEKWDDQREKGIFAGDINSD

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 13, mitochondrial
分子量 formula_weight	13306.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

NALKPAFGPPDKVAAQKFKESLMATEKHAKDTSNMWVKISVWVALPAIALTAVNTYFVEKEHAEHREHLKHVPDSEWPRDYEFMNIRSKPFFWGDGDKTLFWNPVVNRHIEHDD

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	Cytochrome c oxidase subunit 26, mitochondrial
分子量 formula_weight	4347.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	m

ESWVITEGRRLIPEIFQWSAVLSVCLGWPGAVYFFSKA

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	COPPER (II) ION
分子量 formula_weight	63.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	HEME-A
分子量 formula_weight	852.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	PHOSPHATIDYLETHANOLAMINE
分子量 formula_weight	734.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ;
分子量 formula_weight	834.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	DINUCLEAR COPPER ION
分子量 formula_weight	127.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSHOCHOLINE
分子量 formula_weight	734.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 19 Entity 19 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	6ymya01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	210 — Cytochrome C Oxidase; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome c oxidase-like, subunit I domain

结构域编号 domain_id	6ymyb01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	420 — Cupredoxins - blue copper proteins

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.41 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	201223

Cytochrome c oxidase from Saccharomyces cerevisiae

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cytochrome c oxidase subunit 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 4, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 5A, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 6, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 7, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 8, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 9, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c oxidase subunit 12, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体