SAXSdb — 6zik

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit gamma, mitochondrial

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 （P05630） ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 （P05632） ATP synthase F(0) complex subunit C2, mitochondrial × 8 （P07926）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPG_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–273； UniProt 26–298

ATP synthase subunit delta, mitochondrial

物种未注明

UniProt P05630

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 （P05631） ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 （P05632） ATP synthase F(0) complex subunit C2, mitochondrial × 8 （P07926）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATPD_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–146； UniProt 23–168

ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial

物种未注明

UniProt P05632

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 （P05631） ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 （P05630） ATP synthase F(0) complex subunit C2, mitochondrial × 8 （P07926）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ATP5E_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–50； UniProt 2–51

ATP synthase F(0) complex subunit C2, mitochondrial

物种未注明

UniProt P07926

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 11	ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 （P05631） ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 （P05630） ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 （P05632）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AT5G2_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–75； UniProt 69–143 作者链 L； PDB构建体 1–75； UniProt 69–143 作者链 M； PDB构建体 1–75； UniProt 69–143 作者链 N； PDB构建体 1–75； UniProt 69–143 作者链 O； PDB构建体 1–75； UniProt 69–143 作者链 P； PDB构建体 1–75； UniProt 69–143 作者链 Q； PDB构建体 1–75； UniProt 69–143 作者链 R； PDB构建体 1–75； UniProt 69–143

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6zik
沉积日期 deposition_date	2020-06-26
结构标题 title	bovine ATP synthase rotor domain, state 3
关键词 keywords	ATP synthase, mitochondria, mammalian, complex, SYNTHASE, HYDROLASE; HYDROLASE
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6zik__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6zik__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6zik__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	37.60 Å
Rg（电子密度）	38.93 Å
总 Rg	39.28 Å
原子数	7735
残基数	1040
排除体积	140730 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`6zik__assembly_1__model_1`	undecameric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP synthase subunit gamma, mitochondrial
分子量 formula_weight	30300.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G
原子数 atom_count	7735

ATLKDITRRLKSIKNIQKITKSMKMVAAAKYARAERELKPARVYGVGSLALYEKADIKTPEDKKKHLIIGVSSDRGLCGAIHSSVAKQMKSEAANLAAAGKEVKIIGVGDKIRSILHRTHSDQFLVTFKEVGRRPPTFGDASVIALELLNSGYEFDEGSIIFNRFRSVISYKTEEKPIFSLDTISSAESMSIYDDIDADVLRNYQEYSLANIIYYSLKESTTSEQSARMTAMDNASKNASEMIDKLTLTFNRTRQAVITKELIEIISGAAALD

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP synthase subunit delta, mitochondrial
分子量 formula_weight	15074.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

AEAAAAQAPAAGPGQMSFTFASPTQVFFNSANVRQVDVPTQTGAFGILAAHVPTLQVLRPGLVVVHAEDGTTSKYFVSSGSVTVNADSSVQLLAEEAVTLDMLDLGAAKANLEKAQSELLGAADEATRAEIQIRIEANEALVKALE

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial
分子量 formula_weight	5662.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

VAYWRQAGLSYIRYSQICAKAVRDALKTEFKANAMKTSGSTIKIVKVKKE

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit C2, mitochondrial
分子量 formula_weight	7653.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,L,M,N,P,Q,R,O

DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	6zikQ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — F1F0 ATP synthase subunit C

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	triclinic

分辨率 resolution	3.66 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	61485

bovine ATP synthase rotor domain, state 3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit gamma, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP synthase subunit delta, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

ATP synthase F(0) complex subunit C2, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6zik__assembly_1__model_1

6zik__assembly_1__model_1 | I(q)

6zik__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

bovine ATP synthase rotor domain, state 3

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit gamma, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase subunit delta, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit C2, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

6zik__assembly_1__model_1

6zik__assembly_1__model_1 | I(q)

6zik__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)