8eoi

Structure of a human EMC:human Cav1.2 channel complex in GDN detergent

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 230.8 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ER membrane protein complex subunit 1

Homo sapiens

UniProt Q8N766

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 21–993 未记录 ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EMC1_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–973; UniProt 21–993

ER membrane protein complex subunit 2

Homo sapiens

UniProt Q15006

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 3–293 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 EMC2_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–291; UniProt 3–293

ER membrane protein complex subunit 3

Homo sapiens

UniProt Q9P0I2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 4–261 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 EMC3_HUMAN
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–258; UniProt 4–261

ER membrane protein complex subunit 5

Homo sapiens

UniProt Q8N4V1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 3–103 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 EMC5_HUMAN
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–101; UniProt 3–103

ER membrane protein complex subunit 6

Homo sapiens

UniProt Q9BV81

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 11–110 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 EMC6_HUMAN
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–100; UniProt 11–110

ER membrane protein complex subunit 7

Homo sapiens

UniProt Q9NPA0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 43–158 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 EMC7_HUMAN
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–116; UniProt 43–158

ER membrane protein complex subunit 8

Homo sapiens

UniProt O43402

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 3–210 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 EMC8_HUMAN
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–208; UniProt 3–210

ER membrane protein complex subunit 10

Homo sapiens

UniProt Q5UCC4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 50–206 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 9 个其他 PDB 条目、9 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EMC10_HUMAN
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–157; UniProt 50–206

Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C

Homo sapiens

UniProt Q13936

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 109–1658 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 23 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 CAC1C_HUMAN
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–1550; UniProt 109–1658

Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3

Oryctolagus cuniculus

UniProt P54286

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 38–361 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) ER membrane protein complex subunit 4 × 1 (Q5J8M3) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CACB3_RABIT
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–324; UniProt 38–361

ER membrane protein complex subunit 4

Homo sapiens

UniProt Q5J8M3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 11 其他聚合物 3 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 14–183 未记录 ER membrane protein complex subunit 1 × 1 (Q8N766) ER membrane protein complex subunit 2 × 1 (Q15006) ER membrane protein complex subunit 3 × 1 (Q9P0I2) ER membrane protein complex subunit 5 × 1 (Q8N4V1) ER membrane protein complex subunit 6 × 1 (Q9BV81) ER membrane protein complex subunit 7 × 1 (Q9NPA0) ER membrane protein complex subunit 8 × 1 (O43402) ER membrane protein complex subunit 10 × 1 (Q5UCC4) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C × 1 (Q13936) Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3 × 1 (P54286) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 9Z9 (3beta,14beta,17beta,25R)-3-[4-methoxy-3-(methoxymethyl)butoxy]spirost-5-en × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 EMC4_HUMAN
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–170; UniProt 14–183

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8eoi

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8eoi
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8eoi
沉积日期 deposition_date2022-10-03
结构标题 titleStructure of a human EMC:human Cav1.2 channel complex in GDN detergent
关键词 keywordsendoplasmic reticulum membrane protein complex, voltage-gated calcium channel, holdase, biogenesis, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier64.63
回转半径 Rg (电子) rg_electron64.02
零角强度 I(0) i02156720000.00
分子量 molecular_weight407250.0 kDa
排除体积 excluded_volume516870 ų
包络体积 envelope_volume857670 ų
水化壳体积 shell_volume116840 ų
包络直径 envelope_diameter225.5
壳层 Rg shell_rg60.73
包络 Rg envelope_rg61.17
形状 Rg shape_rg64.03
总 Rg total_rg63.93
总原子数 total_atoms28721
残基数 n_residues3562
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax230.8
Rg (实空间) rg_real64.71
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.53
I(0) (实空间) i0_real2.1570e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.6730e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal64.52
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2156000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8717
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary76.9
偏度 Skewness skewness0.295
峰度 Kurtosis kurtosis-0.437
角度范围 angular_range— – 0.1200 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0010
最高正则化参数 α highest_alpha149400000.0000
实空间数据点数 n_real_points25
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.836; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.824

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id8eoiJ01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — SH3 Domains
结构域编号 domain_id8eoiJ02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id8eoiK01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology120 — Four Helix Bundle (Hemerythrin (Met), subunit A)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily350 — Voltage-gated potassium channels. Chain C

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)