SAXSdb — 8ib2

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dematin actin binding protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Actin, cytoplasmic 1 × 5 （Q6QAQ1） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A8D1E7W3_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 5； PDB构建体 1–405； UniProt 1–405

Actin, cytoplasmic 1

物种未注明

UniProt Q6QAQ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Dematin actin binding protein × 1 （A0A8D1E7W3） ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTB_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 C； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 D； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 E； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375 作者链 F； PDB构建体 1–375； UniProt 1–375

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ib2
沉积日期 deposition_date	2023-02-09
结构标题 title	Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, Pointed-end segment, headpiece domain of dematin optimized
关键词 keywords	Macrocomplex, membrane skeleton, spectrin-actin junction, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ib2__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ib2__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ib2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	47.58 Å
Rg（电子密度）	48.01 Å
总 Rg	47.97 Å
原子数	15229
残基数	1931
排除体积	271030 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8ib2__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Dematin actin binding protein
分子量 formula_weight	45569.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5
原子数 atom_count	15229

MERLQKQPLTSPGSVSSSRGSSVPGSPSSIVAKMDNQVLGYKDLAAIPKDKAILDIERPDLMIYEPHFTYSLLEHVELPRSRERSLSPKSTSPPPSPEVWAESRSPGTFPQASAPRTTGTPRTSLPHFHHPETTRPDSNIYKKPPIYKQREPTGGSPQSKHLIEDLIIESSKFPAAQPPDPNQPAKIETDYWPCPPSLAVVETEWRKRKASRRGAEEEEEEEDDDSGEEMKALRERQREELSKVTSNLGKMILKEEMEKSLPIRRKTRSLPDRTPFHTSLQAGTSKSSSLPAYGRTTLSRLQSTDFSPSGSETESPGLQNGEGQRGRMDRGTSLPCVLEQKIYPYEMLVVTNKGRTKLPPGVDRMRLERHLSAEDFSRVFSMSPEEFGKLALWKRNELKKKASLF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Actin, cytoplasmic 1
分子量 formula_weight	41782.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,C,D,E,F

MDDDIAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	427.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	8ib2B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	8ib2C01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	8ib2D01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	8ib2E01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

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分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	60200

Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, Pointed-end segment, headpiece domain of dematin optimized

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dematin actin binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Actin, cytoplasmic 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ib2__assembly_1__model_1

8ib2__assembly_1__model_1 | I(q)

8ib2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of mammalian spectrin-actin junctional complex of membrane skeleton, Pointed-end segment, headpiece domain of dematin optimized

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Dematin actin binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Actin, cytoplasmic 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ib2__assembly_1__model_1

8ib2__assembly_1__model_1 | I(q)

8ib2__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (1)