8oeu

Structure of the mammalian Pol II-SPT6 complex (composite structure, Structure 4)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 198.4 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8oeu

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8oeu
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8oeu
沉积日期 deposition_date2023-03-13
结构标题 titleStructure of the mammalian Pol II-SPT6 complex (composite structure, Structure 4)
关键词 keywordsTranscription elongation, Elongin, RNA polymerase II, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier57.87
回转半径 Rg (电子) rg_electron58.05
零角强度 I(0) i04697640000.00
分子量 molecular_weight559680.0 kDa
排除体积 excluded_volume693610 ų
包络体积 envelope_volume1007600 ų
水化壳体积 shell_volume140920 ų
包络直径 envelope_diameter196.1
壳层 Rg shell_rg62.95
包络 Rg envelope_rg57.48
形状 Rg shape_rg58.11
总 Rg total_rg57.92
总原子数 total_atoms39178
残基数 n_residues4759
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax198.4
Rg (实空间) rg_real57.83
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.68
I(0) (实空间) i0_real4.6980e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.8670e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal57.89
I(0) (倒空间) i0_reciprocal4698000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8623
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary66.1
偏度 Skewness skewness0.346
峰度 Kurtosis kurtosis-0.360
角度范围 angular_range— – 0.1350 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha615400000.0000
实空间数据点数 n_real_points28
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.795; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.822

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (18)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)