8qz0

SWR1-hexasome-dimer complex

Method: ELECTRON MICROSCOPY
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H3

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P61830

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 H3_YEAST
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–136; UniProt 1–136 作者链 B; PDB构建体 1–136; UniProt 1–136

Histone H4

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P02309

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 H4_YEAST
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103 作者链 D; PDB构建体 1–103; UniProt 1–103

Histone H2A.1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P04911

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 H2A1_YEAST
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–132; UniProt 1–132

Histone H2B.1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P02293

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 H2B1_YEAST
Isoform —
PDB实体 4, 5
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–131; UniProt 1–131 作者链 H; PDB构建体 1–131; UniProt 1–131

Histone H2A.Z

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q12692

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 H2AZ_YEAST
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–134; UniProt 1–134

SWR1-complex protein 5

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P38326

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

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UniProt名称 SWC5_YEAST
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–303; UniProt 1–303

Actin-like protein ARP6

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q12509

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

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UniProt名称 ARP6_YEAST
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 R; PDB构建体 1–438; UniProt 1–438

Vacuolar protein sorting-associated protein 71

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q03433

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

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UniProt名称 VPS71_YEAST
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 S; PDB构建体 1–280; UniProt 1–280

RuvB-like protein 2

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q12464

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RUVB2_YEAST
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–471; UniProt 1–471 作者链 W; PDB构建体 1–471; UniProt 1–471 作者链 Y; PDB构建体 1–471; UniProt 1–471

RuvB-like protein 1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q03940

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 RUVB1_YEAST
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 1–463; UniProt 1–463 作者链 V; PDB构建体 1–463; UniProt 1–463 作者链 X; PDB构建体 1–463; UniProt 1–463

Vacuolar protein sorting-associated protein 72

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q03388

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 VPS72_YEAST
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 Z; PDB构建体 1–795; UniProt 1–795

Helicase SWR1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt Q05471

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1 × 1 (P40019) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 SWR1_YEAST
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–1514; UniProt 1–1514

Histone H2A.Z-specific chaperone CHZ1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P40019

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 20 DNA 2 Histone H3 × 2 (P61830) Histone H4 × 2 (P02309) Histone H2A.1 × 1 (P04911) Histone H2B.1 × 1 (P02293) Histone H2B.1 × 1 (P02293) DNA (113-MER) × 1 DNA (113-MER) × 1 Histone H2A.Z × 1 (Q12692) SWR1-complex protein 5 × 1 (P38326) Actin-like protein ARP6 × 1 (Q12509) Vacuolar protein sorting-associated protein 71 × 1 (Q03433) RuvB-like protein 2 × 3 (Q12464) RuvB-like protein 1 × 3 (Q03940) Vacuolar protein sorting-associated protein 72 × 1 (Q03388) Helicase SWR1 × 1 (Q05471) ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 2 MAGNESIUM ION × 8 ZINC ION × 2 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 CHZ1_YEAST
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–153; UniProt 1–153

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8qz0
沉积日期 deposition_date2023-10-26
结构标题 titleSWR1-hexasome-dimer complex
关键词 keywordsChromatin remodelling complex, hexasome-dimer complex, DNA BINDING PROTEIN; DNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8qz0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8qz0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

8qz0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)64.24 Å
Rg(电子密度)63.02 Å
总 Rg63.22 Å
原子数44167
残基数5318
排除体积772670 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 8qz0__assembly_1__model_1 22-meric (22) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

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7. 引用文献 (1)