SAXSdb — 8ulk

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fusion glycoprotein F2

Human respiratory syncytial virus A2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 12	1G12 Fab heavy chain × 3 1G12 Fab light chain × 3 Fusion glycoprotein F0,Fibritin × 3 （A0A088S9A7,P10104）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	FUS_HRSVA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–72； UniProt 26–97 作者链 B； PDB构建体 1–72； UniProt 26–97 作者链 C； PDB构建体 1–72； UniProt 26–97

Fusion glycoprotein F0,Fibritin

Respiratory syncytial virus A2

UniProt A0A088S9A7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 12	Fusion glycoprotein F2 × 3 （P03420） 1G12 Fab heavy chain × 3 1G12 Fab light chain × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A088S9A7_HRSV
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–377； UniProt 137–513 作者链 J； PDB构建体 1–377； UniProt 137–513 作者链 K； PDB构建体 1–377； UniProt 137–513

Fusion glycoprotein F0,Fibritin

Respiratory syncytial virus A2

UniProt P10104

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 12	Fusion glycoprotein F2 × 3 （P03420） 1G12 Fab heavy chain × 3 1G12 Fab light chain × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	WAC_BPT4
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 382–408； UniProt 458–484 作者链 J； PDB构建体 382–408； UniProt 458–484 作者链 K； PDB构建体 382–408； UniProt 458–484

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8ulk
沉积日期 deposition_date	2023-10-16
最后修订 last_revision	2024-11-06
结构标题 title	Prefusion RSV F bound by neutralizing antibody 1G12
关键词 keywords	RSV, antibody, neutralizing, pre-fusion, glycoprotein, antiviral, VIRAL PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex; VIRAL PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8ulk__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8ulk__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8ulk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	53.29 Å
Rg（电子密度）	53.25 Å
总 Rg	53.05 Å
原子数	20187
残基数	2631
排除体积	360410 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8ulk__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fusion glycoprotein F2
分子量 formula_weight	8173.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	20187

QNITEEFYQSTCSAVSKGYLSALRTGWYTSVITIELSNIKENKCNGTDAKVKLIKQELDKYKNAVTELQLLM

来源 Source

来源生物 organism	Human respiratory syncytial virus A2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	11259
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	1G12 Fab heavy chain
分子量 formula_weight	25313.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,H,F

QVQLVQSGAEVKKSGASVQVSCKASGYPFGNYGITWVRQAPGQGLEWMGWISAYNGQTYYAEKFQGRVTMTTDTSTSTGYMELRSLRSDDTAVYFCARDVPVVAAVLRDYWGQGVTVSSSSASTKGPSVFPLAPGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKGSENLYFQGSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	1G12 Fab light chain
分子量 formula_weight	23316.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,L,G

VKGMTQSPLFLPVTLGQPASISCRSSQSLVHSDGNIYLSWFQQRPGQSPRRLIYKVFDRDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVAHYYCMQATHWPGTFGGGTKLTVLRTVAAPSVFLFPPSSEELQANKATLVCLISDFYPGAVTVAWKADSSPSKAGVETTTPSKQSNNKYSLSSVLSLTPEQWKSHRSYSCQVTHEGSTVEKTFAPT

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Fusion glycoprotein F0,Fibritin
分子量 formula_weight	45609.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,J,K

FLGFLLGVGSAIASGVAVCKVLHLEGEVNKIKSALLSTNKAVVSLSNGVSVLTFKVLDLKNYIDKQLLPILNKQSCSISNIETVIEFQQKNNRLLEITREFSVNAGVTTPVSTYMLTNSELLSLINDMPITNDQKKLMSNNVQIVRQQSYSIMCIIKEEVLAYVVQLPLYGVIDTPCWKLHTSPLCTTNTKEGSNICLTRTDRGWYCDNAGSVSFFPQAETCKVQSNRVFCDTMNSLTLPSEVNLCNVDIFNPKYDCKIMTSKTDVSSSVITSLGAIVSCYGKTKCTASNKNRGIIKTFSNGCDYVSNKGVDTVSVGNTLYYVNKQEGKSLYVKGEPIINFYDPLVFPSDEFDASISQVNEKINQSLAFIRKSDELLSAIGGYIPEAPRDGQAYVRKDGEWVLLSTFLGGLVPR

来源 Source

来源生物 organism	Respiratory syncytial virus A2
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1972429
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

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晶胞边长 a length_a	143.982 Å
晶胞边长 b length_b	174.605 Å
晶胞边长 c length_c	226.286 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.280 Å
最低分辨率 resolution_low	46.950 Å
R 因子 r_factor	0.2460
R_work r_work	0.2436
R_free r_free	0.2786

Prefusion RSV F bound by neutralizing antibody 1G12

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fusion glycoprotein F2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Fusion glycoprotein F0,Fibritin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Fusion glycoprotein F0,Fibritin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ulk__assembly_1__model_1

8ulk__assembly_1__model_1 | I(q)

8ulk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Prefusion RSV F bound by neutralizing antibody 1G12

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fusion glycoprotein F2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Fusion glycoprotein F0,Fibritin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Fusion glycoprotein F0,Fibritin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

8ulk__assembly_1__model_1

8ulk__assembly_1__model_1 | I(q)

8ulk__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)