8yio

Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex in azoxystrobin-bound state

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COR1 isoform 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	Cytochrome b × 2 （A0A0G3F5W7） Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 （A0A6A5Q625） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 （A0A5B9RH60） Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 （A0A8H8ULJ0） QCR6 isoform 1 × 2 （A0A8H8ULB7） Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 （A0A6A5Q2H4） Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 （A0A6A5PU80） Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial × 2 （P22289） Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial × 2 （P37299） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5Q3X1_YEASX
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–431； UniProt 27–457 作者链 L； PDB构建体 1–431； UniProt 27–457

Cytochrome b

物种未注明

UniProt A0A0G3F5W7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	COR1 isoform 1 × 2 （A0A6A5Q3X1） Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 （A0A6A5Q625） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 （A0A5B9RH60） Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 （A0A8H8ULJ0） QCR6 isoform 1 × 2 （A0A8H8ULB7） Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 （A0A6A5Q2H4） Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 （A0A6A5PU80） Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial × 2 （P22289） Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial × 2 （P37299） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A0G3F5W7_YEASX
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–385； UniProt 1–385 作者链 N； PDB构建体 1–385； UniProt 1–385

Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial

物种未注明

UniProt A0A6A5Q625

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	COR1 isoform 1 × 2 （A0A6A5Q3X1） Cytochrome b × 2 （A0A0G3F5W7） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 （A0A5B9RH60） Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 （A0A8H8ULJ0） QCR6 isoform 1 × 2 （A0A8H8ULB7） Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 （A0A6A5Q2H4） Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 （A0A6A5PU80） Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial × 2 （P22289） Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial × 2 （P37299） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5Q625_YEASX
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–352； UniProt 17–368 作者链 M； PDB构建体 1–352； UniProt 17–368

Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial

物种未注明

UniProt A0A5B9RH60

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	COR1 isoform 1 × 2 （A0A6A5Q3X1） Cytochrome b × 2 （A0A0G3F5W7） Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 （A0A6A5Q625） Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 （A0A8H8ULJ0） QCR6 isoform 1 × 2 （A0A8H8ULB7） Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 （A0A6A5Q2H4） Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 （A0A6A5PU80） Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial × 2 （P22289） Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial × 2 （P37299） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A5B9RH60_YEASX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–248； UniProt 62–309 作者链 O； PDB构建体 1–248； UniProt 62–309

Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial

物种未注明

UniProt A0A8H8ULJ0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	COR1 isoform 1 × 2 （A0A6A5Q3X1） Cytochrome b × 2 （A0A0G3F5W7） Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 （A0A6A5Q625） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 （A0A5B9RH60） QCR6 isoform 1 × 2 （A0A8H8ULB7） Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 （A0A6A5Q2H4） Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 （A0A6A5PU80） Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial × 2 （P22289） Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial × 2 （P37299） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8H8ULJ0_YEASX
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–185； UniProt 31–215 作者链 P； PDB构建体 1–185； UniProt 31–215

QCR6 isoform 1

物种未注明

UniProt A0A8H8ULB7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	COR1 isoform 1 × 2 （A0A6A5Q3X1） Cytochrome b × 2 （A0A0G3F5W7） Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 （A0A6A5Q625） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 （A0A5B9RH60） Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 （A0A8H8ULJ0） Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 （A0A6A5Q2H4） Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 （A0A6A5PU80） Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial × 2 （P22289） Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial × 2 （P37299） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A8H8ULB7_YEASX
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–75； UniProt 73–147 作者链 Q； PDB构建体 1–75； UniProt 73–147

Cytochrome b-c1 complex subunit 7

物种未注明

UniProt A0A6A5Q2H4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	COR1 isoform 1 × 2 （A0A6A5Q3X1） Cytochrome b × 2 （A0A0G3F5W7） Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 （A0A6A5Q625） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 （A0A5B9RH60） Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 （A0A8H8ULJ0） QCR6 isoform 1 × 2 （A0A8H8ULB7） Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 （A0A6A5PU80） Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial × 2 （P22289） Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial × 2 （P37299） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5Q2H4_YEASX
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–126； UniProt 2–127 作者链 R； PDB构建体 1–126； UniProt 2–127

Cytochrome b-c1 complex subunit 8

物种未注明

UniProt A0A6A5PU80

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	COR1 isoform 1 × 2 （A0A6A5Q3X1） Cytochrome b × 2 （A0A0G3F5W7） Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 （A0A6A5Q625） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 （A0A5B9RH60） Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 （A0A8H8ULJ0） QCR6 isoform 1 × 2 （A0A8H8ULB7） Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 （A0A6A5Q2H4） Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial × 2 （P22289） Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial × 2 （P37299） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0A6A5PU80_YEASX
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–93； UniProt 2–94 作者链 S； PDB构建体 1–93； UniProt 2–94

Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial

物种未注明

UniProt P22289

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	COR1 isoform 1 × 2 （A0A6A5Q3X1） Cytochrome b × 2 （A0A0G3F5W7） Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 （A0A6A5Q625） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 （A0A5B9RH60） Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 （A0A8H8ULJ0） QCR6 isoform 1 × 2 （A0A8H8ULB7） Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 （A0A6A5Q2H4） Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 （A0A6A5PU80） Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial × 2 （P37299） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	QCR9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–55； UniProt 4–58 作者链 T； PDB构建体 1–55； UniProt 4–58

Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial

物种未注明

UniProt P37299

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 20	COR1 isoform 1 × 2 （A0A6A5Q3X1） Cytochrome b × 2 （A0A0G3F5W7） Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial × 2 （A0A6A5Q625） Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial × 2 （A0A5B9RH60） Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial × 2 （A0A8H8ULJ0） QCR6 isoform 1 × 2 （A0A8H8ULB7） Cytochrome b-c1 complex subunit 7 × 2 （A0A6A5Q2H4） Cytochrome b-c1 complex subunit 8 × 2 （A0A6A5PU80） Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial × 2 （P22289） METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE × 2 5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL × 2 (2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate × 2 (1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate × 2 PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 6 (5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate × 1 ;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ; × 2 (1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	QCR10_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–52； UniProt 10–61 作者链 V； PDB构建体 1–52； UniProt 10–61

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8yio
沉积日期 deposition_date	2024-02-29
结构标题 title	Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex in azoxystrobin-bound state
关键词 keywords	Complex, mitochondria, ELECTRON TRANSPORT, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8yio__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8yio__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8yio__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	55.56 Å
Rg（电子密度）	54.48 Å
总 Rg	54.60 Å
原子数	32370
残基数	3992
排除体积	581910 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8yio__assembly_1__model_1`	eicosameric （20）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	COR1 isoform 1
分子量 formula_weight	47459.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,L
原子数 atom_count	32370

AEVTQLSNGIVVATEHNPSAHTASVGVVFGSGAANENPYNNGVSNLWKNIFLSKENSAVAAKEGLALSSNISRDFQSYIVSSLPGSTDKSLDFLNQSFIQQKANLLSSSNFEATKKSVLKQVQDFEENDHPNRVLEHLHSTAFQNTPLSLPTRGTLESLENLVVADLESFANNHFLNSNAVVVGTGNIKHEDLVNSIESKNLSLQTGTKPVLKKKAAFLGSEVRLRDDTLPKAWISLAVEGEPVNSPNYFVAKLAAQIFGSYNAFEPASRLQGIKLLDNIQEYQLCDNFNHFSLSYKDSGLWGFSTATRNVTMIDDLIHFTLKQWNRLTISVTDTEVERAKSLLKLQLGQLYESGNPVNDANLLGAEVLIKGSKLSLGEAFKKIDAITVKDVKAWAGKRLWDQDIAIAGTGQIEGLLDYMRIRSDMSMMRW

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Cytochrome b
分子量 formula_weight	43686.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,N

MAFRKSNVYLSLVNSYIIDSPQPSSINYWWNMGSLLGLCLVIQIVTGIFMAMHYSSNIELAFSSVEHIMRDVHNGYILRYLHANGASFFFMVMFMHMAKGLYYGSYRSPRVTLWNVGVIIFILTIATAFLGYCCVYGQMSHWGATVITNLFSAIPFVGNDIVSWLWGGFSVSNPTIQRFFALHYLVPFIIAAMVIMHLMALHIHGSSNPLGITGNLDRIPMHSYFIFKDLVTVFLFMLILALFVFYSPNTLGHPDNYIPGNPLVTPASIVPEWYLLPFYAILRSIPDKLLGVITMFAAILVLLVLPFTDRSVVRGNTFKVLSKFFFFIFVFNFVLLGQIGACHVEVPYVLMGQIATFIYFAYFLIIVPVISTIENVLFYIGRVNK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial
分子量 formula_weight	38751.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,M

LTVSARDAPTKISTLAVKVHGGSRYATKDGVAHLLNRFNFQNTNTRSALKLVRESELLGGTFKSTLDREYITLKATFLKDDLPYYVNALADVLYKTAFKPHELTESVLPAARYDYAVAEQCPVKSAEDQLYAITFRKGLGNPLLYDGVERVSLQDIKDFADKVYTKENLEVSGENVVEADLKRFVDESLLSTLPAGKSLVSKSEPKFFLGEENRVRFIGDSVAAIGIPVNKASLAQYEVLANYLTSALSELSGLISSAKLDKFTDGGLFTLFVRDQDSAVVSSNIKKIVADLKKGKDLSPAINYTKLKNAVQNESVSSPIELNFDAVKDFKLGKFNYVAVGDVSNLPYLDEL

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial
分子量 formula_weight	27807.4 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,O

MTAAEHGLHAPAYAWSHNGPFETFDHASIRRGYQVYREVCAACHSLDRVAWRTLVGVSHTNEEVRNMAEEFEYDDEPDEQGNPKKRPGKLSDYIPGPYPNEQAARAANQGALPPDLSLIVKARHGGCDYIFSLLTGYPDEPPAGVALPPGSNYNPYFPGGSIAMARVLFDDMVEYEDGTPATTSQMAKDVTTFLNWCAEPEHDERKRLGLKTVIILSSLYLLSIWVKKFKWAGIKTRKFVFNPPKPRK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial
分子量 formula_weight	20123.0 kDa
EC 编号 ec_number	7.1.1.8
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,P

KSTYRTPNFDDVLKENNDADKGRSYAYFMVGAMGLLSSAGAKSTVETFISSMTATADVLAMAKVEVNLAAIPLGKNVVVKWQGKPVFIRHRTPHEIQEANSVDMSALKDPQTDADRVKDPQWLIMLGICTHLGCVPIGEAGDFGGWFCPCHGSHYDISGRIRKGPAPLNLEIPAYEFDGDKVIVG

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	QCR6 isoform 1
分子量 formula_weight	8983.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,Q

EVTDQLEDLREHFKNTEEGKALVHHYEECAERVKIQQQQPGYADLEHKEDCVEEFFHLQHYLDTATAPRLFDKLK

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Cytochrome b-c1 complex subunit 7
分子量 formula_weight	14452.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,R

PQSFTSIARIGDYILKSPVLSKLCVPVANQFINLAGYKKLGLKFDDLIAEENPIMQTALRRLPEDESYARAYRIIRAHQTELTHHLLPRNEWIKAQEDVPYLLPYILEAEAAAKEKDELDNIEVSK

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Cytochrome b-c1 complex subunit 8
分子量 formula_weight	10856.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,S

GPPSGKTYMGWWGHMGGPKQKGITSYAVSPYAQKPLQGIFHNAVFNSFRRFKSQFLYVLIPAGIYWYWWKNGNEYNEFLYSKAGREELERVNV

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial
分子量 formula_weight	6301.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,T

SSLYKTFFKRNAVFVGTIFAGAFVFQTVFDTAITSWYENHNKGKLWKDVKARIAA

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial
分子量 formula_weight	5880.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U,V

KTGLHFGRLSLRSLTAYAPNLMLWGGASMLGLFVFTEGWPKFQDTLYKKIPL

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	METHYL (2Z)-2-(2-{[6-(2-CYANOPHENOXY)PYRIMIDIN-4-YL]OXY}PHENYL)-3-METHOXYACRYLATE
分子量 formula_weight	403.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	5-(3,7,11,15,19,23-HEXAMETHYL-TETRACOSA-2,6,10,14,18,22-HEXAENYL)-2,3-DIMETHOXY-6-METHYL-BENZENE-1,4-DIOL
分子量 formula_weight	592.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	(2R)-3-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-2-(tetradecanoyloxy)propyl octadecanoate
分子量 formula_weight	692.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	(1R)-2-{[(S)-(2-aminoethoxy)(hydroxy)phosphoryl]oxy}-1-[(heptanoyloxy)methyl]ethyl octadecanoate
分子量 formula_weight	593.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	(5S,11R)-5,8,11-trihydroxy-5,11-dioxido-17-oxo-4,6,10,12,16-pentaoxa-5,11-diphosphaoctadec-1-yl pentadecanoate
分子量 formula_weight	634.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 17 Entity 17 non-polymer

描述 description	;(2R,5S,11R,14R)-5,8,11-trihydroxy-2-(nonanoyloxy)-5,11-dioxido-16-oxo-14-[(propanoyloxy)methyl]-4,6,10,12,15-pentaoxa-5,11-diphosphanonadec-1-yl undecanoate ;
分子量 formula_weight	834.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 18 Entity 18 non-polymer

描述 description	(1R)-2-(phosphonooxy)-1-[(tridecanoyloxy)methyl]ethyl pentadecanoate
分子量 formula_weight	592.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.35 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	433970

Cryo-EM structure of Saccharomyces cerevisiae bc1 complex in azoxystrobin-bound state

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

COR1 isoform 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b-c1 complex subunit 2, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome c1, heme protein, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b-c1 complex subunit Rieske, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

QCR6 isoform 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b-c1 complex subunit 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b-c1 complex subunit 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b-c1 complex subunit 9, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Cytochrome b-c1 complex subunit 10, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体