9e86

De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 5-mer RNA and open Beta' clamp (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

Mycobacterium tuberculosis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A675） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A045H2R3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （P0A603） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2,Q12306） DNA (52-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPGPCPGP*A)-3') ; × 1 DNA (48-MER) × 1 PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPOA_MYCTA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347 作者链 B； PDB构建体 1–347； UniProt 1–347

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

Mycobacterium tuberculosis

UniProt A5U052

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A675） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A045H2R3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （P0A603） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2,Q12306） DNA (52-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPGPCPGP*A)-3') ; × 1 DNA (48-MER) × 1 PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPOB_MYCTA
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–1177； UniProt 1–1177

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P0A675

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A045H2R3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （P0A603） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2,Q12306） DNA (52-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPGPCPGP*A)-3') ; × 1 DNA (48-MER) × 1 PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPOC_MYCBO
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 10–1325； UniProt 1–1316

DNA-directed RNA polymerase subunit omega

Mycobacterium tuberculosis

UniProt A0A045H2R3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A675） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （P0A603） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2,Q12306） DNA (52-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPGPCPGP*A)-3') ; × 1 DNA (48-MER) × 1 PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	A0A045H2R3_MYCTX
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–110； UniProt 1–110

RNA polymerase sigma factor SigA

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P0A603

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A675） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A045H2R3） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2,Q12306） DNA (52-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPGPCPGP*A)-3') ; × 1 DNA (48-MER) × 1 PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SIGA_MYCBO
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 23–550； UniProt 1–528

RNA polymerase-binding protein RbpA

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P9WHJ4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A675） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A045H2R3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （P0A603） Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD × 1 （P9WJG2,Q12306） DNA (52-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPGPCPGP*A)-3') ; × 1 DNA (48-MER) × 1 PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RBPA_MYCTO
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–111； UniProt 1–111

Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P9WJG2

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A675） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A045H2R3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （P0A603） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） DNA (52-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPGPCPGP*A)-3') ; × 1 DNA (48-MER) × 1 PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CARD_MYCTO
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 124–285； UniProt 1–162

Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD

Mycobacterium tuberculosis

UniProt Q12306

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	信息不足	异源复合物	蛋白 8 DNA 2 RNA 1	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （A5U8D3） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （A5U052） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A675） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （A0A045H2R3） RNA polymerase sigma factor SigA × 1 （P0A603） RNA polymerase-binding protein RbpA × 1 （P9WHJ4） DNA (52-MER) × 1 ;RNA (5'-R(PAPGPCPGP*A)-3') ; × 1 DNA (48-MER) × 1 PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZINC ION × 2 MAGNESIUM ION × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SMT3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 25–122； UniProt 1–98

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9e86
沉积日期 deposition_date	2024-11-05
结构标题 title	De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 5-mer RNA and open Beta' clamp (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA)
关键词 keywords	Promoter escape, transcription, De novo, RNA polymerase, Transcription-DNA-RNA complex; Transcription/DNA/RNA
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9e86__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9e86__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9e86__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	51.28 Å
Rg（电子密度）	50.69 Å
总 Rg	50.87 Å
原子数	29207
残基数	3593
排除体积	511830 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9e86__assembly_1__model_1`	11-meric （11）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit alpha
分子量 formula_weight	37745.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	29207

MLISQRPTLSEDVLTDNRSQFVIEPLEPGFGYTLGNSLRRTLLSSIPGAAVTSIRIDGVLHEFTTVPGVKEDVTEIILNLKSLVVSSEEDEPVTMYLRKQGPGEVTAGDIVPPAGVTVHNPGMHIATLNDKGKLEVELVVERGRGYVPAVQNRASGAEIGRIPVDSIYSPVLKVTYKVDATRVEQRTDFDKLILDVETKNSISPRDALASAGKTLVELFGLARELNVEAEGIEIGPSPAEADHIASFALPIDDLDLTVRSYNCLKREGVHTVGELVARTESDLLDIRNFGQKSIDEVKIKLHQLGLSLKDSPPSFDPSEVAGYDVATGTWSTEGAYDEQDYAETEQL

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit beta
分子量 formula_weight	129905.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MEGCILADSRQSKTAASPSPSRPQSSSNNSVPGAPNRVSFAKLREPLEVPGLLDVQTDSFEWLIGSPRWRESAAERGDVNPVGGLEEVLYELSPIEDFSGSMSLSFSDPRFDDVKAPVDECKDKDMTYAAPLFVTAEFINNNTGEIKSQTVFMGDFPMMTEKGTFIINGTERVVVSQLVRSPGVYFDETIDKSTDKTLHSVKVIPSRGAWLEFDVDKRDTVGVRIDRKRRQPVTVLLKALGWTSEQIVERFGFSEIMRSTLEKDNTVGTDEALLDIYRKLRPGEPPTKESAQTLLENLFFKEKRYDLARVGRYKVNKKLGLHVGEPITSSTLTEEDVVATIEYLVRLHEGQTTMTVPGGVEVPVETDDIDHFGNRRLRTVGELIQNQIRVGMSRMERVVRERMTTQDVEAITPQTLINIRPVVAAIKEFFGTSQLSQFMDQNNPLSGLTHKRRLSALGPGGLSRERAGLEVRDVHPSHYGRMCPIETPEGPNIGLIGSLSVYARVNPFGFIETPYRKVVDGVVSDEIVYLTADEEDRHVVAQANSPIDADGRFVEPRVLVRRKAGEVEYVPSSEVDYMDVSPRQMVSVATAMIPFLEHDDANRALMGANMQRQAVPLVRSEAPLVGTGMELRAAIDAGDVVVAEESGVIEEVSADYITVMHDNGTRRTYRMRKFARSNHGTCANQCPIVDAGDRVEAGQVIADGPCTDDGEMALGKNLLVAIMPWEGHNYEDAIILSNRLVEEDVLTSIHIEEHEIDARDTKLGAEEITRDIPNISDEVLADLDERGIVRIGAEVRDGDILVGKVTPKGETELTPEERLLRAIFGEKAREVRDTSLKVPHGESGKVIGIRVFSREDEDELPAGVNELVRVYVAQKRKISDGDKLAGRHGNKGVIGKILPVEDMPFLADGTPVDIILNTHGVPRRMNIGQILETHLGWCAHSGWKVDAAKGVPDWAARLPDELLEAQPNAIVSTPVFDGAQEAELQGLLSCTLPNRDGDVLVDADGKAMLFDGRSGEPFPYPVTVGYMYIMKLHHLVDDKIHARSTGPYSMITQQPLGGKAQFGGQRFGEMECWAMQAYGAAYTLQELLTIKSDDTVGRVKVYEAIVKGENIPEPGIPESFKVLLKELQSLCLNVEVLSSDGAAIELREGEDEDLERAAANLGINLSRNESASVEDLA

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;
分子量 formula_weight	148883.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

LARHGGSGAMLDVNFFDELRIGLATAEDIRQWSYGEVKKPETINYRTLKPEKDGLFCEKIFGPTRDWECYCGKYKRVRFKGIICERCGVEVTRAKVRRERMGHIELAAPVTHIWYFKGVPSRLGYLLDLAPKDLEKIIYFAAYVITSVDEEMRHNELSTLEAEMAVERKAVEDQRDGELEARAQKLEADLAELEAEGAKADARRKVRDGGEREMRQIRDRAQRELDRLEDIWSTFTKLAPKQLIVDENLYRELVDRYGEYFTGAMGAESIQKLIENFDIDAEAESLRDVIRNGKGQKKLRALKRLKVVAAFQQSGNSPMGMVLDAVPVIPPELRPMVQLDGGRFATSDLNDLYRRVINRNNRLKRLIDLGAPEIIVNNEKRMLQESVDALFDNGRRGRPVTGPGNRPLKSLSDLLKGKQGRFRQNLLGKRVDYSGRSVIVVGPQLKLHQCGLPKLMALELFKPFVMKRLVDLNHAQNIKSAKRMVERQRPQVWDVLEEVIAEHPVLLNRAPTLHRLGIQAFEPMLVEGKAIQLHPLVCEAFNADFDGDQMAVHLPLSAEAQAEARILMLSSNNILSPASGRPLAMPRLDMVTGLYYLTTEVPGDTGEYQPASGDHPETGVYSSPAEAIMAADRGVLSVRAKIKVRLTQLRPPVEIEAELFGHSGWQPGDAWMAETTLGRVMFNELLPLGYPFVNKQMHKKVQAAIINDLAERYPMIVVAQTVDKLKDAGFYWATRSGVTVSMADVLVPPRKKEILDHYEERADKVEKQFQRGALNHDERNEALVEIWKEATDEVGQALREHYPDDNPIITIVDSGATGNFTQTRTLAGMKGLVTNPKGEFIPRPVKSSFREGLTVLEYFINTHGARKGLADTALRTADSGYLTRRLVDVSQDVIVREHDCQTERGIVVELAERAPDGTLIRDPYIETSAYARTLGTDAVDEAGNVIVERGQDLGDPEIDALLAAGITQVKVRSVLTCATSTGVCATCYGRSMATGKLVDIGEAVGIVAAQSIGEPGTQLTMRTFHQGGVGEDITGGLPRVQELFEARVPRGKAPIADVTGRVRLEDGERFYKITIVPDDGGEEVVYDKISKRQRLRVFKHEDGSERVLSDGDHVEVGQQLMEGSADPHEVLRVQGPREVQIHLVREVQEVYRAQGVSIHDKHIEVIVRQMLRRVTIIDSGSTEFLPGSLIDRAEFEAENRRVVAEGGEPAAGRPVLMGITKASLATDSWLSAASFQETTRVLTDAAINCRSDKLNGLKENVIIGKLIPAGTGINRYRNIAVQPTEEARAAAYTIPSYEDQYYSPDFGAATGAAVPLDDYGYSDYRHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit omega
分子量 formula_weight	11851.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MSISQSDASLAAVPAVDQFDPSSGASGGYDTPLGITNPPIDELLDRVSSKYALVIYAAKRARQINDYYNQLGEGILEYVGPLVEPGLQEKPLSIALREIHADLLEHTEGE

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	RNA polymerase sigma factor SigA
分子量 formula_weight	60512.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

HHHHHHHHHHSSGLEVLFQGPHMAATKASTATDEPVKRTATKSPAASASGAKTGAKRTAAKSASGSPPAKRATKPAARSVKPASAPQDTTTSTIPKRKTRAAAKSAAAKAPSARGHATKPRAPKDAQHEAATDPEDALDSVEELDAEPDLDVEPGEDLDLDAADLNLDDLEDDVAPDADDDLDSGDDEDHEDLEAEAAVAPGQTADDDEEIAEPTEKDKASGDFVWDEDESEALRQARKDAELTASADSVRAYLKQIGKVALLNAEEEVELAKRIEAGLYATQLMTELSERGEKLPAAQRRDMMWICRDGDRAKNHLLEANLRLVVSLAKRYTGRGMAFLDLIQEGNLGLIRAVEKFDYTKGYKFSTYATWWIRQAITRAMADQARTIRIPVHMVEVINKLGRIQRELLQDLGREPTPEELAKEMDITPEKVLEIQQYAREPISLDQTIGDEGDSQLGDFIEDSEAVVAVDAVSFTLLQDQLQSVLDTLSEREAGVVRLRFGLTDGQPRTLDEIGQVYGVTRERIRQIESKTMSKLRHPSRSQVLRDYLD

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	RNA polymerase-binding protein RbpA
分子量 formula_weight	12993.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MADRVLRGSRLGAVSYETDRNHDLAPRQIARYRTDNGEEFEVPFADDAEIPGTWLCRNGMEGTLIEGDLPEPKKVKPPRTHWDMLLERRSIEELEELLKERLELIRSRRRG

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD
分子量 formula_weight	32104.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MGHHHHHHHHHHSSGHIEGRHMASMSDSEVNQEAKPEVKPEVKPETHINLKVSDGSSEIFFKIKKTTPLRRLMEAFAKRQGKEMDSLRFLYDGIRIQADQTPEDLDMEDNDIIEAHREQIGGSMIFKVGDTVVYPHHGAALVEAIETRTIKGEQKEYLVLKVAQGDLTVRVPAENAEYVGVRDVVGQEGLDKVFQVLRAPHTEEPTNWSRRYKANLEKLASGDVNKVAEVVRDLWRRDQERGLSAGEKRMLAKARQILVGELALAESTDDAKAETILDEVLAAAS

来源 Source

来源生物 organism	Mycobacterium tuberculosis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1773
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA (52-MER)
分子量 formula_weight	39318.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

CTTAAAAGATTAATTTAAAATTTATCAAAAAGAGTATTGACTTAAAGTCTAACCTATAGGATACTTACAGCCAGCGAGAGGGACACGGCGAATAGCCATCCCAATCGACACCGGGGTCGGGATCTGG

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	;RNA (5'-R(PAPGPCPGP*A)-3') ;
分子量 formula_weight	6893.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	R

AGCGAGAGGGACACGGCGAAU

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA (48-MER)
分子量 formula_weight	39053.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

CCAGATCCCGACCCCGGTGTCGATTGGGATGGCTATTCGCCGTGTCCCTCTCGCTGGCTGTAAGTATCCTATAGGTTAGACTTTAAGTCAATACTCTTTTTGATAAATTTTAAATTAATCTTTTAAG

实体 11 Entity 11 non-polymer

描述 description	PYROPHOSPHATE 2-
分子量 formula_weight	176.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 12 Entity 12 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 13 Entity 13 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

分辨率 resolution	3.80 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	10964

De Novo Mycobacterium tuberculosis transcription initiation promoter complex with 5-mer RNA and open Beta' clamp (RNA Polymerase with Sigma-A, CarD, and RbpA)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit omega

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase sigma factor SigA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

RNA polymerase-binding protein RbpA

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Ubiquitin-like protein SMT3,RNA polymerase-binding transcription factor CarD

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

9e86__assembly_1__model_1

9e86__assembly_1__model_1 | I(q)

9e86__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source