9kxy

Structure of human B0AT1-ACE2 complex with compound1

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 195.2 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT1

Homo sapiens

UniProt Q695T7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 4 其他聚合物 12 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 2–634 链 C; UniProt 2–634 未记录 Angiotensin-converting enzyme 2 × 2 (Q9BYF1) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 A1L6U 3-(3-bromophenyl)-~{N}-ethyl-propanamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.82 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 S6A19_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 22–654; UniProt 2–634 作者链 C; PDB构建体 22–654; UniProt 2–634

Angiotensin-converting enzyme 2

Homo sapiens

UniProt Q9BYF1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 4 其他聚合物 12 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 2–805 链 D; UniProt 2–805 未记录 Sodium-dependent neutral amino acid transporter B(0)AT1 × 2 (Q695T7) 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose-(1-4)-2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12 A1L6U 3-(3-bromophenyl)-~{N}-ethyl-propanamide × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.82 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 338 个其他 PDB 条目、388 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACE2_HUMAN
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 3–806; UniProt 2–805 作者链 D; PDB构建体 3–806; UniProt 2–805

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9kxy

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9kxy
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9kxy
沉积日期 deposition_date2024-12-07
结构标题 titleStructure of human B0AT1-ACE2 complex with compound1
关键词 keywordsInhibitor, amino acid transporter, SLC6, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier58.75
回转半径 Rg (电子) rg_electron58.88
零角强度 I(0) i02520670000.00
分子量 molecular_weight286780.0 kDa
排除体积 excluded_volume281440 ų
包络体积 envelope_volume546510 ų
水化壳体积 shell_volume80317 ų
包络直径 envelope_diameter188.1
壳层 Rg shell_rg56.53
包络 Rg envelope_rg57.33
形状 Rg shape_rg58.87
总 Rg total_rg58.86
总原子数 total_atoms21722
残基数 n_residues2652
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax195.2
Rg (实空间) rg_real58.86
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.25
I(0) (实空间) i0_real2.5210e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.4700e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal58.61
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2520000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8579
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary72.3
偏度 Skewness skewness0.248
峰度 Kurtosis kurtosis-0.689
角度范围 angular_range— – 0.1350 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha59360000.0000
实空间数据点数 n_real_points28
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.901; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.942; Smooth: 0.505

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)