9q4d

A DARPin fused to the double trigger 1TEL variant crystallization chaperone via a direct helical fusion

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 75.1 Å Quality: REASONABLE

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription factor ETV6,DARPin

synthetic construct

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白单体单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 47–121	突变：L96E, V112E in ETV6 (Uniprot numbering)	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 CL CHLORIDE ION × 4 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.07M Citric acid, 0.05M BIS-TRIS propane, 16% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 1.30 Å R-free 0.185

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 9Q4D	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1JI7 Crystal Structure of TEL SAM Polymer 提交 2001-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 47–123（77 aa）片段：TEL SAM domain 链 B 47–123（77 aa）片段：TEL SAM domain 链 C 47–123（77 aa）片段：TEL SAM domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；Li2SO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.45 Å R-free 0.195
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
2DAO Solution structure of ETS domain Transcriptional factor ETV6 protein 提交 2005-12-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 338–442（105 aa）片段：ETS domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient NMR样品组成 1.19mM ETS domain U-15N, 13C; 20mM d-Tris-HCl(pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90%H2O, 10%D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2QB0 Structure of the 2TEL crystallization module fused to T4 lysozyme with an Ala-Gly-Pro linker. 提交 2007-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 47–123（77 aa）链 D 47–123（77 aa）	突变：E80V	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.56 Å R-free 0.252
2QB0 Structure of the 2TEL crystallization module fused to T4 lysozyme with an Ala-Gly-Pro linker. 提交 2007-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 47–123（77 aa）链 C 47–123（77 aa）	突变：E80V	MN MANGANESE (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.56 Å R-free 0.252
5L0P Symmetry-based assembly of a two-dimensional protein lattice 提交 2016-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 47–124（78 aa）片段：3 x TelSAM (UNP residues 47-124) + FUR (UNP residues 3-83) with connecting linkers	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；100 mM Tris, pH 8.0, 3.5 M sodium chloride	分辨率 2.30 Å R-free 0.236
7JU2 Crystal structure of the monomeric ETV6 PNT domain 提交 2020-08-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 43–125（83 aa）片段：PNT domain	突变：A93D,V112E	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298.15 K；2.8 M Sodium Acetate	分辨率 1.85 Å R-free 0.234
7JU2 Crystal structure of the monomeric ETV6 PNT domain 提交 2020-08-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 43–125（83 aa）片段：PNT domain	突变：A93D,V112E	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298.15 K；2.8 M Sodium Acetate	分辨率 1.85 Å R-free 0.234
7N1O The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2021-05-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 46–123（78 aa）	突变：1TEL: R41A,D46G,V112E,K122A,vWa: R49A,C175A,V112A,K112A	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；298 K；100 mM BisTris, 3.0 M NaCl	分辨率 2.77 Å R-free 0.228
7N2B A DARPin semi-rigidly fused to the 3TEL crystallization chaperone 提交 2021-05-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）链 A 47–124（78 aa）	突变：V67E 突变：V67E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；200 mM L-Proline, 100 mM HEPES, 10 % w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 3.22 Å R-free 0.242
7N2B A DARPin semi-rigidly fused to the 3TEL crystallization chaperone 提交 2021-05-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–121（75 aa）链 B 47–124（78 aa）	突变：V67E 突变：V67E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；200 mM L-Proline, 100 mM HEPES, 10 % w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 3.22 Å R-free 0.242
7T8J The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a GSGG linker 提交 2021-12-16	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.2 uL of 1 mg/mL protein in 50 mM Tris pH 8.8, 200 mM KCl combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-tris-propane, 2.5 M Ammonium Nitrate	分辨率 1.89 Å R-free 0.235
7TDY The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase 1, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at low protein concentration 提交 2022-01-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–120（74 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	FMT FORMIC ACID × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.2 uL of 2 mg/mL protein combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-Tris, pH 7.00, 250 mM Mg-Formate.	分辨率 1.53 Å R-free 0.217
7TW7 Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SAM 提交 2022-02-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R, E67V, A77K	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate, and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.62 Å R-free 0.218
7TW8 Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SAH 提交 2022-02-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R, E67V, A77K	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.55 Å R-free 0.206
7TW9 Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to Sinefungin 提交 2022-02-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R, E67V, A77K	SFG SINEFUNGIN × 1 ZN ZINC ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EOH ETHANOL × 1 MOH METHANOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate, and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.41 Å R-free 0.232
7U4W The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at traditional protein concentration 提交 2022-03-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；1.2 uL of 15 mg/mL protein combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-Tris, pH 6.50, 750 mM Mg-Formate	分辨率 2.10 Å R-free 0.276
7U4Z The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at very low protein concentration 提交 2022-03-01	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；1.2 uL of 0.5 mg/mL protein combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-Tris, pH 6.00, 630-750 mM Mg-Formate.	分辨率 2.03 Å R-free 0.232
8BWU Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase domain in complex with the SS148 inhibitor 提交 2022-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	未记录	6NR (2~{S})-2-azanyl-4-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanyl-5-cyano-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]butanoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM bicine/Trizma pH 8.5; 10% w/v PEG 20.000, 20% v/v PEG MME 550; 20 mM D-glucose, 20 mM D-mannose, 20 mM D-galactose, 20 mM L-fucose, 20 mM D-xylose, 20 mM N-acetyl-D-glucosamine	分辨率 2.36 Å R-free 0.264
8E1F Sterile Alpha Motif Domain of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）片段：Sterile Alpha Motif Domain, residues 47-126	突变：R35S, V67E	CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；298 K；200mM MgSO4 Heptahydrate, 20% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 2.16 Å R-free 0.229
8E1F Sterile Alpha Motif Domain of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–124（78 aa）片段：Sterile Alpha Motif Domain, residues 47-126	突变：R35S, V67E	CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；298 K；200mM MgSO4 Heptahydrate, 20% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 2.16 Å R-free 0.229
8E1F Sterile Alpha Motif Domain of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–124（78 aa）片段：Sterile Alpha Motif Domain, residues 47-126	突变：R35S, V67E	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；298 K；200mM MgSO4 Heptahydrate, 20% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 2.16 Å R-free 0.229
8E1F Sterile Alpha Motif Domain of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 47–124（78 aa）片段：Sterile Alpha Motif Domain, residues 47-126	突变：R35S, V67E	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；298 K；200mM MgSO4 Heptahydrate, 20% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 2.16 Å R-free 0.229
8FRJ Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SGC0946 提交 2023-01-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R, E67V, A77K	ZN ZINC ION × 1 AW2 5-bromo-7-{5-[(3-{[(4-tert-butylphenyl)carbamoyl]amino}propyl)(propan-2-yl)amino]-5-deoxy-beta-D-ribofuranosyl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.57 Å R-free 0.204
8FRK Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SGC8158 提交 2023-01-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R,E67V,A77K	ZN ZINC ION × 1 EOH ETHANOL × 1 MJ7 5'-S-(4-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}butyl)-5'-thioadenosine × 1 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.61 Å R-free 0.251
8FT6 The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, SUMO tag-free preparation. 提交 2023-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）	突变：R14A,V77E,K87A,R89A,R91A,A225V	CIT CITRIC ACID × 1 IOD IODIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Ammonium citrate tribasic, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.62 Å R-free 0.234
8FT8 The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, SUMO tag-free preparation 提交 2023-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）	突变：R14A,V77E,K87A,R89A,R91T,A92V,A225V	GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES, 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.60 Å R-free 0.204
8FZ3 Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：R45S, V77E	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic pH 8.2	分辨率 2.78 Å R-free 0.267
8FZ3 Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–123（77 aa）	突变：R45S, V77E	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic pH 8.2	分辨率 2.78 Å R-free 0.267
8FZ3 Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–123（77 aa）	突变：R45S, V77E	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic pH 8.2	分辨率 2.78 Å R-free 0.267
8FZ3 Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 47–123（77 aa）	突变：R45S, V77E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic pH 8.2	分辨率 2.78 Å R-free 0.267
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–111（65 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–111（65 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–111（65 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–111（65 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–111（65 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 32	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–111（65 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 58	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8THA 1TEL, non-compressed, double-helical crystal form 提交 2023-07-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）	突变：V112E,R80S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.5 M Bis-Tris, 0.35 M Mg-Formate, 5 mg/mL protein	分辨率 1.68 Å R-free 0.215
9CPL The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase 1, fused to the 2TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）链 A 47–121（75 aa）	突变：First TELSAM:R80S,V112E,Second TELSAM: R80S,UBA Domain: C610A,C644A 突变：First TELSAM:R80S,V112E,Second TELSAM: R80S,UBA Domain: C610A,C644A	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；100mM BisTris, pH 6.0, 960mM Mg-formate	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
9DB5 A DARPin fused to the 1TEL crystallization chaperone via a proline-alanine linker 提交 2024-08-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）片段：residues 47-121 (Uniprot numbering) of Transcription factor ETV6	未记录	ACY ACETIC ACID × 13 NA SODIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；294 K；4.0 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate	分辨率 1.57 Å R-free 0.196
9DOC The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, at 1.2 Angstrom resolution 提交 2024-09-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）片段：von Willebrand factor A domain of CMG2	突变：TELSAM: R80S,V112E (Uniprot numbering),vWA: C175A (Uniprot numbering)	GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；298 K；100 mM Bis-Tris, pH 7.25, 1350 mM Sodium Potassium Phosphate	分辨率 1.19 Å R-free 0.197
9DP8 A DARPin fused to the 1TEL crystallization chaperone via a helical Lys-Gln-Arg linker 提交 2024-09-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 0.3 M Magnesium formate dihydrate	分辨率 3.47 Å R-free 0.298
9DVG Crystal Structure of a DARPin Fused to the 1TEL Crystallization Chaperone via a Direct Helical Fusion in a 2-Fold Crystal Form 提交 2024-10-07	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：V112E in ETV6 (Uniprot numbering)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；1.5 M Ammonium Phosphate Dibasic, 0.1 M Tris	分辨率 3.54 Å R-free 0.301
9E4Q A DARPin fused to the 3TEL crystallization chaperone via a gly-gly-gly fusion 提交 2024-10-25	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）链 A 47–121（75 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.05 M Ammonium sulfate, 0.05 M BIS-TRIS pH 6.5, Polyethylene glycol 600	分辨率 3.58 Å R-free 0.324
9FEH Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase domain in complex with the STM957 inhibitor 提交 2024-05-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	未记录	A1IB6 ~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[4-azanyl-5-(2-pyridin-3-ylethynyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]-3-cyano-~{N}-ethyl-4-methoxy-benzenesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% w/v PEG 4000, 20% w/v 1,2,6-hexanetriol; 100mM Gly-Gly/AMPD pH 8.5; 10mM spermine, 10mM spermidine, 10mM 1,4-diaminobutane, 10mM DL-ornithine	分辨率 1.99 Å R-free 0.230
9NGE The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–122（76 aa）	突变：R80S,L96E,V112E in ETV6, and L591V,C610A,C644A in TNK1 (Uniprot numbering)	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 K POTASSIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 20% w/v Polyethylene Glycol 3350	分辨率 2.02 Å R-free 0.230
9NGE The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-02-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–122（76 aa）	突变：R80S,L96E,V112E in ETV6, and L591V,C610A,C644A in TNK1 (Uniprot numbering)	K POTASSIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 20% w/v Polyethylene Glycol 3350	分辨率 2.02 Å R-free 0.230
9O0H The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase 1, fused to the 3TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker 提交 2025-04-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–124（78 aa）片段：TNK1 portion is the ubiquitin-associated domain 链 B 47–121（75 aa）片段：TNK1 portion is the ubiquitin-associated domain	突变：V112E (Uniprot numbering) in the first ETV6 repeat, C610A,C644A (Uniprot numbering) in TNK1 突变：V112E (Uniprot numbering) in the first ETV6 repeat, C610A,C644A (Uniprot numbering) in TNK1	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.5M Ammonium Chloride, 0.1M BIS-TRISpropane pH 7	分辨率 2.24 Å R-free 0.249
9Q9E Crystal structure of a TELSAM-SUMO1 fusion protein 提交 2025-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：V73E	1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na-phosphate/citric acid pH4.2, PEG600	分辨率 2.05 Å R-free 0.231
9Q9E Crystal structure of a TELSAM-SUMO1 fusion protein 提交 2025-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–123（77 aa）	突变：V73E	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na-phosphate/citric acid pH4.2, PEG600	分辨率 2.05 Å R-free 0.231
9Q9E Crystal structure of a TELSAM-SUMO1 fusion protein 提交 2025-02-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–123（77 aa）	突变：V73E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na-phosphate/citric acid pH4.2, PEG600	分辨率 2.05 Å R-free 0.231
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–123（77 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–123（77 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9Z2L The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–122（76 aa）	突变：R46S,V78E,L90V,C109A,C143A	SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；0.6 M Magnesium Sulfate, 0.1 Sodium Acetate	分辨率 2.02 Å R-free 0.274
9Z2L The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–122（76 aa）	突变：R46S,V78E,L90V,C109A,C143A	CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；0.6 M Magnesium Sulfate, 0.1 Sodium Acetate	分辨率 2.02 Å R-free 0.274
9ZB7 A DARPin fused to the 1TEL crystallization chaperone via a direct helical fusion 提交 2025-11-20	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：V112E	AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 EOH ETHANOL × 2 K POTASSIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；298 K；0.4 M Ammonium phosphate monobasic	分辨率 1.24 Å R-free 0.170
9ZNB Crystal Structure of a DARPin Fused to the 1TEL Crystallization Chaperone via a Direct Helical Fusion in a 3-Fold Crystal Form 提交 2025-12-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）片段：residues 47-121 (Uniprot numbering) of the ETV6 portion	突变：V112E in ETV6 (Uniprot numbering)	ACY ACETIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；294 K；1.0 M Magnesium sulfate hydrate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6	分辨率 1.77 Å R-free 0.220
9ZVU The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone, alternate crystal form 提交 2025-12-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–122（76 aa）片段：TNK1 UBA domain,TNK1 UBA domain	突变：R80S,L96E,V112E,L591V,C610A,C644A	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Sodium Tartrate, 16% PEG 3350 Monodisperse	分辨率 1.96 Å R-free 0.247
9ZVU The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone, alternate crystal form 提交 2025-12-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–122（76 aa）片段：TNK1 UBA domain,TNK1 UBA domain	突变：R80S,L96E,V112E,L591V,C610A,C644A	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 3 NA SODIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Sodium Tartrate, 16% PEG 3350 Monodisperse	分辨率 1.96 Å R-free 0.247

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	ETV6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 13–87； UniProt 47–121

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9q4d
沉积日期 deposition_date	2025-08-20
最后修订 last_revision	2025-10-01
结构标题 title	A DARPin fused to the double trigger 1TEL variant crystallization chaperone via a direct helical fusion
关键词 keywords	TELSAM, DARPin, ETV6, Designed Ankyrin, Repeat Protein, Double Trigger, Protein Crystallization Chaperone, BIOSYNTHETIC PROTEIN; BIOSYNTHETIC PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	22.09 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	21.55 Å
零角强度 I(0) i0	11187400.00
分子量 molecular_weight	24758.0 kDa
排除体积 excluded_volume	30811 Å³
包络体积 envelope_volume	37134 Å³
水化壳体积 shell_volume	15720 Å³
包络直径 envelope_diameter	78.6 Å
壳层 Rg shell_rg	26.40 Å
包络 Rg envelope_rg	21.69 Å
形状 Rg shape_rg	21.57 Å
总 Rg total_rg	22.20 Å
总原子数 total_atoms	3402
残基数 n_residues	226
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	75.1 Å
Rg (实空间) rg_real	22.30 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.74 Å
I(0) (实空间) i0_real	1.1190e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.6420e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	22.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	11190000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7486
解质量评级 solution_quality	REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	19.1 Å
偏度 Skewness skewness	0.481
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.412
角度范围 angular_range	— – 0.3600 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	3444000.0000
实空间数据点数 n_real_points	68
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.706; Stabil: 0.992; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.634; Smooth: 0.000

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Transcription factor ETV6,DARPin
分子量 formula_weight	27095.3 kDa
突变 mutation	L96E, V112E in ETV6 (Uniprot numbering)
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3622

MGHHHHHHHHHHSIRLPAHLRLQPIYWSRDDVAQWLKWAENEFSLRPIDSNTFEMNGKALLELTKEDFRYRSPHSGDELYELLQHILLGKKLLEAARAGQDDEVRILMANGADVNATDNDGYTPLHLAASNGHLEIVEVLLKNGADVNASDLTGITPLHAAAATGHLEIVEVLLKHGADVNAYDNDGHTPLHLAAKYGHLEIVEVLLKHGADVNAQDKFGKTAFDISIDNGNEDLAEILQKLN

来源 Source

来源生物 organism	synthetic construct
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	32630
宿主生物 host_organism	Escherichia coli B

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	POTASSIUM ION
分子量 formula_weight	39.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	187

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	83.021 Å
晶胞边长 b length_b	83.021 Å
晶胞边长 c length_c	56.840 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 65
空间群编号 int_tables_number	170
晶系 crystal_system	hexagonal

分辨率 resolution	1.302 Å
最低分辨率 resolution_low	35.950 Å
R 因子 r_factor	0.1580
R_work r_work	0.1562
R_free r_free	0.1854

fit	/app/data/saxs_computation/q4/9q4d/9q4d.fit
pddf	/app/data/pr_computation/q4/9q4d/9q4d.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/q4/9q4d/9q4d.dat