9se7

Structure of Cytochrome C6 bound Photosystem I from Chlamydomonas reinhardtii at 2.07 A resolution

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 127.3 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1

物种未注明

UniProt P12154

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 10–751 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 (A8IFG7) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Cytochrome c6, chloroplastic × 1 (P08197) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic × 1 (A8IL32) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 PSAA_CHLRE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–742; UniProt 10–751

Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2

物种未注明

UniProt P09144

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 3–735 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 (A8IFG7) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Cytochrome c6, chloroplastic × 1 (P08197) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic × 1 (A8IL32) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 PSAB_CHLRE
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–733; UniProt 3–735

Photosystem I iron-sulfur center

物种未注明

UniProt Q00914

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 2–81 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 (A8IFG7) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Cytochrome c6, chloroplastic × 1 (P08197) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic × 1 (A8IL32) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSAC_CHLRE
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–80; UniProt 2–81

Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic

物种未注明

UniProt Q39615

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 53–196 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 (A8IFG7) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Cytochrome c6, chloroplastic × 1 (P08197) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic × 1 (A8IL32) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PSAD_CHLRE
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–144; UniProt 53–196

Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic

物种未注明

UniProt P12352

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 34–97 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 (A8IFG7) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Cytochrome c6, chloroplastic × 1 (P08197) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic × 1 (A8IL32) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 PSAE_CHLRE
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–64; UniProt 34–97

Photosystem I reaction center subunit VIII

物种未注明

UniProt A8IFG7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 68–104 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Cytochrome c6, chloroplastic × 1 (P08197) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic × 1 (A8IL32) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 14 个其他 PDB 条目、14 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A8IFG7_CHLRE
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–37; UniProt 68–104

Photosystem I reaction center subunit IX

物种未注明

UniProt P59777

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–40 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 (A8IFG7) Cytochrome c6, chloroplastic × 1 (P08197) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic × 1 (A8IL32) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 PSAJ_CHLRE
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 2–41; UniProt 1–40

Cytochrome c6, chloroplastic

物种未注明

UniProt P08197

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 T; UniProt 59–147 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 (A8IFG7) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic × 1 (A8IL32) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 CYC6_CHLRE
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 T; PDB构建体 1–89; UniProt 59–147

Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic

物种未注明

UniProt P12356

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 63–227 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 (A8IFG7) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Cytochrome c6, chloroplastic × 1 (P08197) Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic × 1 (A8IL32) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 16 个其他 PDB 条目、16 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PSAF_CHLRE
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–165; UniProt 63–227

Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic

物种未注明

UniProt A8IL32

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 L; UniProt 53–190 未记录 Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A1 × 1 (P12154) Photosystem I P700 chlorophyll a apoprotein A2 × 1 (P09144) Photosystem I iron-sulfur center × 1 (Q00914) Photosystem I reaction center subunit II, chloroplastic × 1 (Q39615) Photosystem I reaction center subunit IV, chloroplastic × 1 (P12352) Photosystem I reaction center subunit VIII × 1 (A8IFG7) Photosystem I reaction center subunit IX × 1 (P59777) Cytochrome c6, chloroplastic × 1 (P08197) Photosystem I reaction center subunit III, chloroplastic × 1 (P12356) CLA CHLOROPHYLL A × 91 PQN PHYLLOQUINONE × 2 LHG 1,2-DIPALMITOYL-PHOSPHATIDYL-GLYCEROLE × 3 BCR BETA-CAROTENE × 15 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 3 LMU DODECYL-ALPHA-D-MALTOSIDE × 3 LMG 1,2-DISTEAROYL-MONOGALACTOSYL-DIGLYCERIDE × 5 DGD DIGALACTOSYL DIACYL GLYCEROL (DGDG) × 1 LUT (3R,3'R,6S)-4,5-DIDEHYDRO-5,6-DIHYDRO-BETA,BETA-CAROTENE-3,3'-DIOL × 2 HEC HEME C × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;5mM HEPES, pH 7.5, 0.02% alphaDDM cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.06 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 12 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A8IL32_CHLRE
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 L; PDB构建体 1–138; UniProt 53–190

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9se7

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9se7
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9se7
沉积日期 deposition_date2025-08-15
结构标题 titleStructure of Cytochrome C6 bound Photosystem I from Chlamydomonas reinhardtii at 2.07 A resolution
关键词 keywordsCytochrome C6, Photosystem I, Chlamydomonas reinhardtii, CryoEM, PHOTOSYNTHESIS; PHOTOSYNTHESIS
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier41.69
回转半径 Rg (电子) rg_electron40.33
零角强度 I(0) i01029650000.00
分子量 molecular_weight337820.0 kDa
排除体积 excluded_volume449560 ų
包络体积 envelope_volume499890 ų
水化壳体积 shell_volume94315 ų
包络直径 envelope_diameter139.8
壳层 Rg shell_rg51.26
包络 Rg envelope_rg40.75
形状 Rg shape_rg40.32
总 Rg total_rg40.92
总原子数 total_atoms24048
残基数 n_residues2218
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax127.3
Rg (实空间) rg_real41.44
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.72
I(0) (实空间) i0_real1.0300e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.7150e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal41.69
I(0) (倒空间) i0_reciprocal1030000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8911
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary53.6
偏度 Skewness skewness0.096
峰度 Kurtosis kurtosis-0.436
角度范围 angular_range— – 0.1900 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha94410000.0000
实空间数据点数 n_real_points39
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.912; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.954; Smooth: 0.891

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (21)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)