9sfp

Native cytoplasmic lattices from mouse oocytes

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-box and WD-40 domain protein 12

物种未注明

UniProt Q5U467

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 Q5U467_MOUSE
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–468; UniProt 1–468 作者链 B; PDB构建体 1–468; UniProt 1–468

KH domain-containing protein 3

物种未注明

UniProt Q9CWU5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 KHDC3_MOUSE
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–440; UniProt 1–440

NLR family, pyrin domain containing 4F

物种未注明

UniProt L7N1W9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 L7N1W9_MOUSE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–937; UniProt 1–937 作者链 F; PDB构建体 1–937; UniProt 1–937

NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5

物种未注明

UniProt Q9R1M5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 NALP5_MOUSE
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–1163; UniProt 1–1163 作者链 I; PDB构建体 1–1163; UniProt 1–1163

NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14

物种未注明

UniProt Q6B966

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 NAL14_MOUSE
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–993; UniProt 1–993

Oocyte-expressed protein homolog

物种未注明

UniProt Q9CWE6

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 OOEP_MOUSE
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164 作者链 L; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164

Inactive protein-arginine deiminase type-6

物种未注明

UniProt Q8K3V4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 PADI6_MOUSE
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 N; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 O; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 P; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 Q; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 R; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 S; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 T; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 U; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 V; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682

Transducin-like enhancer protein 6

物种未注明

UniProt Q9WVB3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TLE6_MOUSE
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 W; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581 作者链 Y; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581

Tubulin alpha-1A chain

物种未注明

UniProt P68369

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TBA1A_MOUSE
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451

Tubulin beta-4B chain

物种未注明

UniProt P68372

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 TBB4B_MOUSE
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 b; PDB构建体 1–445; UniProt 1–445

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3

物种未注明

UniProt P61079

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 UB2D3_MOUSE
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–147; UniProt 1–147

E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1

物种未注明

UniProt Q8VDF2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UHRF1_MOUSE
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–782; UniProt 1–782

Zinc finger BED domain-containing protein 3

物种未注明

UniProt Q9D0L1

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 54 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 ZBED3_MOUSE
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 e; PDB构建体 1–228; UniProt 1–228

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9sfp
沉积日期 deposition_date2025-08-20
结构标题 titleNative cytoplasmic lattices from mouse oocytes
关键词 keywordsoocyte, embryo, cytoskeleton, tubulin, ubiquitin, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9sfp__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9sfp__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 1010 1011 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

9sfp__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)0.00 Å
Rg(电子密度)136.20 Å
总 Rg136.30 Å
原子数234708
残基数29538
排除体积4209500 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 9sfp__assembly_1__model_1 54-meric (54) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

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7. 引用文献 (1)