9sfp

Native cytoplasmic lattices from mouse oocytes

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 297.2 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

F-box and WD-40 domain protein 12

物种未注明

UniProt Q5U467

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–468 链 B; UniProt 1–468 未记录 KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q5U467_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–468; UniProt 1–468 作者链 B; PDB构建体 1–468; UniProt 1–468

KH domain-containing protein 3

物种未注明

UniProt Q9CWU5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–440 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 KHDC3_MOUSE
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–440; UniProt 1–440

NLR family, pyrin domain containing 4F

物种未注明

UniProt L7N1W9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–937 链 F; UniProt 1–937 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 L7N1W9_MOUSE
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–937; UniProt 1–937 作者链 F; PDB构建体 1–937; UniProt 1–937

NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5

物种未注明

UniProt Q9R1M5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–1163 链 I; UniProt 1–1163 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NALP5_MOUSE
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–1163; UniProt 1–1163 作者链 I; PDB构建体 1–1163; UniProt 1–1163

NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14

物种未注明

UniProt Q6B966

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–993 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NAL14_MOUSE
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–993; UniProt 1–993

Oocyte-expressed protein homolog

物种未注明

UniProt Q9CWE6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 1–164 链 L; UniProt 1–164 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 OOEP_MOUSE
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164 作者链 L; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164

Inactive protein-arginine deiminase type-6

物种未注明

UniProt Q8K3V4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 M; UniProt 1–682 链 N; UniProt 1–682 链 O; UniProt 1–682 链 P; UniProt 1–682 链 Q; UniProt 1–682 链 R; UniProt 1–682 链 S; UniProt 1–682 链 T; UniProt 1–682 链 U; UniProt 1–682 链 V; UniProt 1–682 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PADI6_MOUSE
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 M; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 N; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 O; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 P; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 Q; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 R; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 S; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 T; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 U; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 V; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682

Transducin-like enhancer protein 6

物种未注明

UniProt Q9WVB3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 W; UniProt 1–581 链 Y; UniProt 1–581 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TLE6_MOUSE
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 W; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581 作者链 Y; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581

Tubulin alpha-1A chain

物种未注明

UniProt P68369

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 a; UniProt 1–451 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TBA1A_MOUSE
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 a; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451

Tubulin beta-4B chain

物种未注明

UniProt P68372

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 b; UniProt 1–445 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TBB4B_MOUSE
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 b; PDB构建体 1–445; UniProt 1–445

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3

物种未注明

UniProt P61079

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 c; UniProt 1–147 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UB2D3_MOUSE
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 c; PDB构建体 1–147; UniProt 1–147

E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1

物种未注明

UniProt Q8VDF2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 d; UniProt 1–782 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 2 (Q9D0L1) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UHRF1_MOUSE
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 d; PDB构建体 1–782; UniProt 1–782

Zinc finger BED domain-containing protein 3

物种未注明

UniProt Q9D0L1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 54 PDB 声明:54-meric(54) 与蛋白拷贝数一致 链 e; UniProt 1–228 未记录 F-box and WD-40 domain protein 12 × 4 (Q5U467) KH domain-containing protein 3 × 2 (Q9CWU5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 4 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 2 (Q6B966) Oocyte-expressed protein homolog × 4 (Q9CWE6) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Transducin-like enhancer protein 6 × 4 (Q9WVB3) Tubulin alpha-1A chain × 2 (P68369) Tubulin beta-4B chain × 2 (P68372) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 2 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 2 (Q8VDF2) ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE 分辨率 4.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ZBED3_MOUSE
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 e; PDB构建体 1–228; UniProt 1–228

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9sfp

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9sfp
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9sfp
沉积日期 deposition_date2025-08-20
结构标题 titleNative cytoplasmic lattices from mouse oocytes
关键词 keywordsoocyte, embryo, cytoskeleton, tubulin, ubiquitin, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron110.20
零角强度 I(0) i037012500000.00
分子量 molecular_weight1673100.0 kDa
排除体积 excluded_volume2104800 ų
包络体积 envelope_volume3584800 ų
水化壳体积 shell_volume277380 ų
包络直径 envelope_diameter406.0
壳层 Rg shell_rg97.61
包络 Rg envelope_rg107.40
形状 Rg shape_rg110.10
总 Rg total_rg110.20
总原子数 total_atoms117354
残基数 n_residues14769
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax297.2
Rg (实空间) rg_real104.60
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.07
I(0) (实空间) i0_real3.5390e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.1110e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal104.80
I(0) (倒空间) i0_reciprocal36410000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9132
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary106.1
偏度 Skewness skewness0.290
峰度 Kurtosis kurtosis-0.566
角度范围 angular_range— – 0.0700 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.9832
最高正则化参数 α highest_alpha1202000000.0000
实空间数据点数 n_real_points15
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.003; Oscil: 1.000; Stabil: 0.973; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.952; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (13)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)