9w2t

Cryo-EM structure of Fo domain of FoF1-ATPase monomer state on the bovine heart submitochondrial particles

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase F(0) complex subunit 8

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase F(0) complex subunit a × 1 （P00847） ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP8_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 8； PDB构建体 1–41； UniProt 1–41

ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial

物种未注明

UniProt P32876

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit a × 1 （P00847） ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	AT5G1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 L； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 M； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 N； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 O； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 P； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 Q； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136 作者链 R； PDB构建体 1–75； UniProt 62–136

ATP synthase F(0) complex subunit a

物种未注明

UniProt P00847

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP6_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–224； UniProt 3–226

ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial

物种未注明

UniProt P13619

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase F(0) complex subunit a × 1 （P00847） ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	AT5F1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 b； PDB构建体 1–112； UniProt 43–154

ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial

物种未注明

UniProt P13620

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase F(0) complex subunit a × 1 （P00847） ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP5H_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 d； PDB构建体 1–51； UniProt 110–160

ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q00361

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase F(0) complex subunit a × 1 （P00847） ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP5I_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 e； PDB构建体 1–69； UniProt 3–71

ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q28851

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase F(0) complex subunit a × 1 （P00847） ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPK_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 f； PDB构建体 1–83； UniProt 6–88

ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q28852

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase F(0) complex subunit a × 1 （P00847） ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial × 1 （P14790） ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP5L_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 g； PDB构建体 1–79； UniProt 21–99

ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial

物种未注明

UniProt P14790

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase F(0) complex subunit a × 1 （P00847） ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial × 1 （Q3ZBI7）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATP68_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 j； PDB构建体 1–48； UniProt 2–49

ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q3ZBI7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 17	ATP synthase F(0) complex subunit 8 × 1 （P03929） ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial × 8 （P32876） ATP synthase F(0) complex subunit a × 1 （P00847） ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial × 1 （P13619） ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial × 1 （P13620） ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial × 1 （Q00361） ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial × 1 （Q28851） ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial × 1 （Q28852） ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial × 1 （P14790）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	ATPMK_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 k； PDB构建体 1–36； UniProt 13–48

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	9w2t
沉积日期 deposition_date	2025-07-28
结构标题 title	Cryo-EM structure of Fo domain of FoF1-ATPase monomer state on the bovine heart submitochondrial particles
关键词 keywords	ATP synthase, FoF1-ATPase, submitochondrial particles, MOTOR PROTEIN; MOTOR PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

9w2t__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

9w2t__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

9w2t__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	37.28 Å
Rg（电子密度）	36.67 Å
总 Rg	37.18 Å
原子数	10026
残基数	1307
排除体积	184080 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`9w2t__assembly_1__model_1`	heptadecameric （17）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit 8
分子量 formula_weight	4901.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	8
原子数 atom_count	10026

MPQLDTSTWLTMILSMFLTLFIIFQLKVSKHNFYHNPELTP

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial
分子量 formula_weight	7653.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,L,M,N,O,P,Q,R

DIDTAAKFIGAGAATVGVAGSGAGIGTVFGSLIIGYARNPSLKQQLFSYAILGFALSEAMGLFCLMVAFLILFAM

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit a
分子量 formula_weight	24556.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

ENLFTSFITPVILGLPLVTLIVLFPSLLFPTSNRLVSNRFVTLQQWMLQLVSKQMMSIHNSKGQTWTLMLMSLILFIGSTNLLGLLPHSFTPTTQLSMNLGMAIPLWAGAVITGFRNKTKASLAHFLPQGTPTPLIPMLVIIETISLFIQPMALAVRLTANITAGHLLIHLIGGATLALMSISTTTALITFTILILLTILEFAVAMIQAYVFTLLVSLYLHDNT

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial
分子量 formula_weight	12462.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

PVPPLPEHGGKVRFGLIPEEFFQFLYPKTGVTGPYVLGTGLILYLLSKEIYVITPETFSAISTIGFLVYIVKKYGASVGEFADKLNEQKIAQLEEVKQASIKQIQDAIDMEK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial
分子量 formula_weight	6392.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

TRIQEYEKELEKMRNIIPFDQMTIEDLNEVFPETKLDKKKYPYWPHRPIET

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial
分子量 formula_weight	8106.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	e

PPVQVSPLIKLGRYSALFLGMAYGAKRYNYLKPRAEEERRLAAEEKKKRDEQKRIERELAEAQEDTILK

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial
分子量 formula_weight	9827.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	f

PLKEKKLLEVKLGELPSWILMRDFTPSGIAGAFQRGYYRYYNKYVNVKKGSIAGLSMVLAAYVFLNYCRSYKELKHERLRKYH

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial
分子量 formula_weight	8896.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	g

TYSKPRLATFWYYAKVELVPPTPAEIPTAIQSLKKIINSAKTGSFKQLTVKEALLNGLVATEVWMWFYVGEIIGKRGII

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial
分子量 formula_weight	5687.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	j

LQSLIKKVWIPMKPYYTQAYQEIWVGTGLMAYIVYKIRSADKRSKALK

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial
分子量 formula_weight	4124.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	k

TGIKKYFNSYTLTGRMNCVLATYGSIALIVLYFKLR

▶

晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.100 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	4.10 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	111365

Cryo-EM structure of Fo domain of FoF1-ATPase monomer state on the bovine heart submitochondrial particles

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase F(0) complex subunit 8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit C1, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit a

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase peripheral stalk subunit b, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase peripheral stalk subunit d, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit e, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit f, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit g, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit j, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ATP synthase F(0) complex subunit k, mitochondrial

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体