9xrl

Structure of mouse cytoplasmic lattice (CPL) repeating unit

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 377.7 Å Quality: EXCELLENT

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Zinc finger BED domain-containing protein 3

物种未注明

UniProt Q9D0L1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 1; UniProt 1–228 链 3; UniProt 1–228 链 9; UniProt 1–228 未记录 KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ZBED3_MOUSE
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 1; PDB构建体 1–228; UniProt 1–228 作者链 3; PDB构建体 1–228; UniProt 1–228 作者链 9; PDB构建体 1–228; UniProt 1–228

KH domain-containing protein 3

物种未注明

UniProt Q9CWU5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 4; UniProt 1–440 链 6; UniProt 1–440 链 AA; UniProt 1–440 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 KHDC3_MOUSE
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–440; UniProt 1–440 作者链 6; PDB构建体 1–440; UniProt 1–440 作者链 AA; PDB构建体 1–440; UniProt 1–440

F-box and WD-40 domain protein 21

物种未注明

UniProt Q8BI38

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–468 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

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UniProt名称 Q8BI38_MOUSE
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–468; UniProt 1–468

S-phase kinase-associated protein 1

物种未注明

UniProt Q9WTX5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–163 链 F; UniProt 1–163 链 O; UniProt 1–163 链 p; UniProt 1–163 链 q; UniProt 1–163 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 SKP1_MOUSE
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 F; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 O; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 p; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163 作者链 q; PDB构建体 1–163; UniProt 1–163

Transducin-like enhancer protein 6

物种未注明

UniProt Q9WVB3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 8; UniProt 1–581 链 AC; UniProt 1–581 链 E; UniProt 1–581 链 I; UniProt 1–581 链 P; UniProt 1–581 链 z; UniProt 1–581 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TLE6_MOUSE
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 8; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581 作者链 AC; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581 作者链 E; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581 作者链 I; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581 作者链 P; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581 作者链 z; PDB构建体 1–581; UniProt 1–581

NLR family, pyrin domain containing 4F

物种未注明

UniProt L7N1W9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 1–937 链 Q; UniProt 1–937 链 h; UniProt 1–937 链 i; UniProt 1–937 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 L7N1W9_MOUSE
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–937; UniProt 1–937 作者链 Q; PDB构建体 1–937; UniProt 1–937 作者链 h; PDB构建体 1–937; UniProt 1–937 作者链 i; PDB构建体 1–937; UniProt 1–937

Inactive protein-arginine deiminase type-6

物种未注明

UniProt Q8K3V4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–682 链 K; UniProt 1–682 链 S; UniProt 1–682 链 T; UniProt 1–682 链 U; UniProt 1–682 链 V; UniProt 1–682 链 W; UniProt 1–682 链 X; UniProt 1–682 链 Y; UniProt 1–682 链 Z; UniProt 1–682 链 b; UniProt 1–682 链 c; UniProt 1–682 链 d; UniProt 1–682 链 f; UniProt 1–682 链 j; UniProt 1–682 链 m; UniProt 1–682 链 n; UniProt 1–682 链 o; UniProt 1–682 链 r; UniProt 1–682 链 s; UniProt 1–682 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PADI6_MOUSE
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 K; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 S; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 T; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 U; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 V; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 W; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 X; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 Y; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 Z; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 b; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 c; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 d; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 f; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 j; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 m; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 n; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 o; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 r; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682 作者链 s; PDB构建体 1–682; UniProt 1–682

Oocyte-expressed protein homolog

物种未注明

UniProt Q9CWE6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 AH; UniProt 1–164 链 AI; UniProt 1–164 链 AJ; UniProt 1–164 链 AT; UniProt 1–164 链 e; UniProt 1–164 链 g; UniProt 1–164 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 OOEP_MOUSE
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 AH; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164 作者链 AI; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164 作者链 AJ; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164 作者链 AT; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164 作者链 e; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164 作者链 g; PDB构建体 1–164; UniProt 1–164

Expressed sequence C85627

物种未注明

UniProt Q3TSA9

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 k; UniProt 1–469 链 l; UniProt 1–469 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q3TSA9_MOUSE
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 k; PDB构建体 1–469; UniProt 1–469 作者链 l; PDB构建体 1–469; UniProt 1–469

Tubulin beta-4B chain

物种未注明

UniProt P68372

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 AE; UniProt 1–445 链 AN; UniProt 1–445 链 t; UniProt 1–445 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 8 个其他 PDB 条目、8 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TBB4B_MOUSE
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 AE; PDB构建体 1–445; UniProt 1–445 作者链 AN; PDB构建体 1–445; UniProt 1–445 作者链 t; PDB构建体 1–445; UniProt 1–445

NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5

物种未注明

UniProt Q9R1M5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 0; UniProt 105–1163 链 2; UniProt 105–1163 链 5; UniProt 105–1163 链 7; UniProt 105–1163 链 AB; UniProt 105–1163 链 y; UniProt 105–1163 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 10 个其他 PDB 条目、10 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NALP5_MOUSE
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 0; PDB构建体 1–1059; UniProt 105–1163 作者链 2; PDB构建体 1–1059; UniProt 105–1163 作者链 5; PDB构建体 1–1059; UniProt 105–1163 作者链 7; PDB构建体 1–1059; UniProt 105–1163 作者链 AB; PDB构建体 1–1059; UniProt 105–1163 作者链 y; PDB构建体 1–1059; UniProt 105–1163

Tubulin alpha-1A chain

物种未注明

UniProt P68369

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 AF; UniProt 1–451 链 AO; UniProt 1–451 链 u; UniProt 1–451 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 TBA1A_MOUSE
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 AF; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 AO; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451 作者链 u; PDB构建体 1–451; UniProt 1–451

NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14

物种未注明

UniProt Q6B966

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 AK; UniProt 1–993 链 AQ; UniProt 1–993 链 w; UniProt 1–993 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 NAL14_MOUSE
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 AK; PDB构建体 1–993; UniProt 1–993 作者链 AQ; PDB构建体 1–993; UniProt 1–993 作者链 w; PDB构建体 1–993; UniProt 1–993

Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3

物种未注明

UniProt P61079

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 AD; UniProt 1–147 链 AM; UniProt 1–147 链 AS; UniProt 1–147 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 4 个其他 PDB 条目、4 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 UB2D3_MOUSE
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 AD; PDB构建体 1–147; UniProt 1–147 作者链 AM; PDB构建体 1–147; UniProt 1–147 作者链 AS; PDB构建体 1–147; UniProt 1–147

E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1

物种未注明

UniProt Q8VDF2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 AL; UniProt 1–782 链 AR; UniProt 1–782 链 x; UniProt 1–782 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) F-box and WD-40 domain protein 19 × 2 (Q8C2W8) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、28 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 UHRF1_MOUSE
Isoform
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 AL; PDB构建体 1–782; UniProt 1–782 作者链 AR; PDB构建体 1–782; UniProt 1–782 作者链 x; PDB构建体 1–782; UniProt 1–782

F-box and WD-40 domain protein 19

物种未注明

UniProt Q8C2W8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 73 PDB 声明:73-meric(73) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–466 链 L; UniProt 1–466 未记录 Zinc finger BED domain-containing protein 3 × 3 (Q9D0L1) KH domain-containing protein 3 × 3 (Q9CWU5) F-box and WD-40 domain protein 21 × 1 (Q8BI38) S-phase kinase-associated protein 1 × 5 (Q9WTX5) Transducin-like enhancer protein 6 × 6 (Q9WVB3) NLR family, pyrin domain containing 4F × 4 (L7N1W9) Inactive protein-arginine deiminase type-6 × 20 (Q8K3V4) Oocyte-expressed protein homolog × 6 (Q9CWE6) Expressed sequence C85627 × 2 (Q3TSA9) Tubulin beta-4B chain × 3 (P68372) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 5 × 6 (Q9R1M5) Tubulin alpha-1A chain × 3 (P68369) NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 14 × 3 (Q6B966) Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D3 × 3 (P61079) E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1 × 3 (Q8VDF2) ZN ZINC ION × 13 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6.7 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.74 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q8C2W8_MOUSE
Isoform
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–466; UniProt 1–466 作者链 L; PDB构建体 1–466; UniProt 1–466

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9xrl

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9xrl
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9xrl
沉积日期 deposition_date2025-11-19
结构标题 titleStructure of mouse cytoplasmic lattice (CPL) repeating unit
关键词 keywordscytoplasmic lattice, maternal effect protein, proteostasis, protein storage, CYTOSOLIC PROTEIN; CYTOSOLIC PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron142.50
零角强度 I(0) i0211774000000.00
分子量 molecular_weight4006100.0 kDa
排除体积 excluded_volume5035900 ų
包络体积 envelope_volume10392000 ų
水化壳体积 shell_volume612100 ų
包络直径 envelope_diameter530.6
壳层 Rg shell_rg135.30
包络 Rg envelope_rg135.90
形状 Rg shape_rg142.50
总 Rg total_rg142.60
总原子数 total_atoms281032
残基数 n_residues35602
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax377.7
Rg (实空间) rg_real135.50
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.98
I(0) (实空间) i0_real2.0170e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.6370e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal140.40
I(0) (倒空间) i0_reciprocal209600000000.0000
解质量估计 total_estimate0.9064
解质量评级 solution_quality EXCELLENT a EXCELLENT solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary171.7
偏度 Skewness skewness0.147
峰度 Kurtosis kurtosis-0.518
角度范围 angular_range— – 0.0550 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.7688
最高正则化参数 α highest_alpha6998000000.0000
实空间数据点数 n_real_points12
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.015; Oscil: 0.999; Stabil: 0.961; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.903; Smooth: 0.000

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (20)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)