当前蛋白身份：P62942
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1A7X FKBP12-FK1012 COMPLEX 提交 1998-03-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | FKA BENZYL-CARBAMIC ACID [8-DEETHYL-ASCOMYCIN-8-YL]ETHYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；A 10MG/ML SOLUTION OF FK1012A IN MEOH WAS ADDED IN A 1:2 MOLAR RATIO TO A 10MG/ML SOLUTION OF FKBP12 IN 10MM TRIS PH 8.2. THE SAMPLE WAS GENTLY MIXED AND ALLOWED TO INCUBATE OVERNIGHT TO ENSURE COMPLETE BINDING. CRYSTALS WERE GROWN USING THE HANGING DROP METHOD WITH 0.5ML RESERVOIR CONSISTING OF 5.1M SODIUM FORMATE AND 0.1M SODIUM ACETATE PH 4.6. THE DROPS CONSISTED OF 3UL OF PROTEIN AND 3UL OF RESERVOIR SOLUTION., vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 2.00 Å |
| 1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.269 |
| 1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.269 |
| 1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.269 |
| 1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.269 |
| 1B6C CRYSTAL STRUCTURE OF THE CYTOPLASMIC DOMAIN OF THE TYPE I TGF-BETA RECEPTOR IN COMPLEX WITH FKBP12 提交 1999-01-13 | Assembly 5 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 C
1–107（107 aa）
链 E
1–107（107 aa）
链 G
1–107（107 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.269 |
| 1BKF FK506 BINDING PROTEIN FKBP MUTANT R42K/H87V COMPLEX WITH IMMUNOSUPPRESSANT FK506 提交 1995-10-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
突变：R42K, H87V | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.60 Å |
| 1BL4 FKBP MUTANT F36V COMPLEXED WITH REMODELED SYNTHETIC LIGAND 提交 1998-07-23 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 未唯一映射
参考区间未声明
链 A
1–107（107 aa）
|
突变：F36V 突变：F36V | AP1 {3-[3-(3,4-DIMETHOXY-PHENYL)-1-(1-{1-[2-(3,4,5-TRIMETHOXY-PHENYL)-BUTYRYL]-PIPERIDIN-2YL}-VINYLOXY)-PROPYL]-PHENOXY}-ACETIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；VAPOR DIFFUSION IN HANGING DROPS WITH 40 MG/ML COMPLEX AND 1.2M AMMONIUM SULFATE, 0.1M SODIUM PHOSPHATE, PH 6.0 OVER RESERVOIRS OF 2.4 M AMMONIUM SULFATE, vapor diffusion - hanging drop
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.230 |
| 1D6O NATIVE FKBP 提交 1999-10-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；297 K；56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % DMSO 100 MM TRIS (PH 8.0), EVAPORATION, temperature 297K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.237 |
| 1D6O NATIVE FKBP 提交 1999-10-15 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；297 K；56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % DMSO 100 MM TRIS (PH 8.0), EVAPORATION, temperature 297K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.237 |
| 1D6O NATIVE FKBP 提交 1999-10-15 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；297 K；56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % DMSO 100 MM TRIS (PH 8.0), EVAPORATION, temperature 297K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.237 |
| 1D6O NATIVE FKBP 提交 1999-10-15 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 8；297 K；56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % DMSO 100 MM TRIS (PH 8.0), EVAPORATION, temperature 297K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.237 |
| 1D7H FKBP COMPLEXED WITH DMSO 提交 1999-10-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % DMSO, 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.273 |
| 1D7H FKBP COMPLEXED WITH DMSO 提交 1999-10-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % DMSO, 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.273 |
| 1D7H FKBP COMPLEXED WITH DMSO 提交 1999-10-18 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % DMSO, 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.273 |
| 1D7H FKBP COMPLEXED WITH DMSO 提交 1999-10-18 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % DMSO, 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.273 |
| 1D7I FKBP COMPLEXED WITH METHYL METHYLSULFINYLMETHYL SULFIDE (DSS) 提交 1999-10-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 DSS METHYL METHYLSULFINYLMETHYL SULFIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % METHYL SULFINYL-
METHYL SULFOXIDE, 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.283 |
| 1D7I FKBP COMPLEXED WITH METHYL METHYLSULFINYLMETHYL SULFIDE (DSS) 提交 1999-10-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 DSS METHYL METHYLSULFINYLMETHYL SULFIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % METHYL SULFINYL-
METHYL SULFOXIDE, 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.283 |
| 1D7I FKBP COMPLEXED WITH METHYL METHYLSULFINYLMETHYL SULFIDE (DSS) 提交 1999-10-18 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 DSS METHYL METHYLSULFINYLMETHYL SULFIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % METHYL SULFINYL-
METHYL SULFOXIDE, 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.283 |
| 1D7I FKBP COMPLEXED WITH METHYL METHYLSULFINYLMETHYL SULFIDE (DSS) 提交 1999-10-18 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 DSS METHYL METHYLSULFINYLMETHYL SULFIDE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % METHYL SULFINYL-
METHYL SULFOXIDE, 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.283 |
| 1D7J FKBP COMPLEXED WITH 4-HYDROXY-2-BUTANONE 提交 1999-10-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 BUQ 4-HYDROXY-2-BUTANONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % 4-HYDROXY-2-
BUTANONE 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.254 |
| 1D7J FKBP COMPLEXED WITH 4-HYDROXY-2-BUTANONE 提交 1999-10-18 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 BUQ 4-HYDROXY-2-BUTANONE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % 4-HYDROXY-2-
BUTANONE 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.254 |
| 1D7J FKBP COMPLEXED WITH 4-HYDROXY-2-BUTANONE 提交 1999-10-18 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 BUQ 4-HYDROXY-2-BUTANONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % 4-HYDROXY-2-
BUTANONE 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.254 |
| 1D7J FKBP COMPLEXED WITH 4-HYDROXY-2-BUTANONE 提交 1999-10-18 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | NH4 AMMONIUM ION × 2 SO4 SULFATE ION × 2 BUQ 4-HYDROXY-2-BUTANONE × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；297 K；CRYSTALLIZATION CONDITIONS: 56 % SAT. AMMONIUM SULFATE 5 % 4-HYDROXY-2-
BUTANONE 100 MM TRIS (PH 8.0), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 297K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.254 |
| 1EYM FK506 BINDING PROTEIN MUTANT, HOMODIMERIC COMPLEX 提交 2000-05-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
链 B
2–108（107 aa）
|
突变：YES 突变：YES | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；200 mM NaCl, 2mM EDTA, 5mM DTT, 0.02% NaN3, concentrate to ~0.75 mg/ml, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP,
temperature 4K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.290 |
| 1F40 SOLUTION STRUCTURE OF FKBP12 COMPLEXED WITH GPI-1046, A NEUROTROPHIC LIGAND 提交 2000-06-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | GPI (2S)-[3-PYRIDYL-1-PROPYL]-1-[3,3-DIMETHYL-1,2-DIOXOPENTYL]-2-PYRROLIDINECARBOXYLATE × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）100mM；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM FKBP12 U-15N; 100 mM phosphate buffer; 0.01% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM FKBP12 U-15N; 1mM GPI-1046; 100 mM phosphate buffer; 0.01% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2mM FKBP12 U-15N,13C; 2mM GPI-1046; 100 mM phosphate buffer; 0.01% NaN3 | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1FAP THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMAN FRAP 提交 1996-03-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.70 Å R-free 0.299 |
| 1FKB ATOMIC STRUCTURE OF THE RAPAMYCIN HUMAN IMMUNOPHILIN FKBP-12 COMPLEX 提交 1992-07-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1FKD FK-506 BINDING PROTEIN: THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE COMPLEX WITH THE ANTAGONIST L-685,818 提交 1992-12-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | 818 18-HYDROXYASCOMYCIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.72 Å |
| 1FKD FK-506 BINDING PROTEIN: THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE COMPLEX WITH THE ANTAGONIST L-685,818 提交 1992-12-02 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | 818 18-HYDROXYASCOMYCIN × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.72 Å |
| 1FKF ATOMIC STRUCTURE OF FKBP-FK506, AN IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT COMPLEX 提交 1991-05-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1FKG DESIGN, SYNTHESIS, AND KINETIC EVALUATION OF HIGH-AFFINITY FKBP LIGANDS, AND THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURES OF THEIR COMPLEXES WITH FKBP12 提交 1993-08-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | SB3 1,3-DIPHENYL-1-PROPYL-1-(3,3-DIMETHYL-1,2-DIOXYPENTYL)-2-PIPERIDINE CARBOXYLATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å |
| 1FKH DESIGN, SYNTHESIS, AND KINETIC EVALUATION OF HIGH-AFFINITY FKBP LIGANDS, AND THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURES OF THEIR COMPLEXES WITH FKBP12 提交 1993-08-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | SBX 1-CYCLOHEXYL-3-PHENYL-1-PROPYL-1-(3,3-DIMETHYL-1,2-DIOXYPENTYL)-2-PIPERIDINE CARBOXYLATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.95 Å |
| 1FKI DESIGN, SYNTHESIS, AND KINETIC EVALUATION OF HIGH-AFFINITY FKBP LIGANDS, AND THE X-RAY CRYSTAL STRUCTURES OF THEIR COMPLEXES WITH FKBP12 提交 1993-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | SB1 (21S)-1AZA-4,4-DIMETHYL-6,19-DIOXA-2,3,7,20-TETRAOXOBICYCLO[19.4.0] PENTACOSANE × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å |
| 1FKJ ATOMIC STRUCTURE OF FKBP12-FK506, AN IMMUNOPHILIN IMMUNOSUPPRESSANT COMPLEX 提交 1995-08-18 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1FKJ ATOMIC STRUCTURE OF FKBP12-FK506, AN IMMUNOPHILIN IMMUNOSUPPRESSANT COMPLEX 提交 1995-08-18 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.70 Å |
| 1FKR SOLUTION STRUCTURE OF FKBP, A ROTAMASE ENZYME AND RECEPTOR FOR FK506 AND RAPAMYCIN 提交 1992-03-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1FKS SOLUTION STRUCTURE OF FKBP, A ROTAMASE ENZYME AND RECEPTOR FOR FK506 AND RAPAMYCIN 提交 1992-03-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1FKT SOLUTION STRUCTURE OF FKBP, A ROTAMASE ENZYME AND RECEPTOR FOR FK506 AND RAPAMYCIN 提交 1992-03-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1J4H crystal structure analysis of the FKBP12 complexed with 000107 small molecule 提交 2001-09-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | SUB 3-PHENYL-2-{[4-(TOLUENE-4-SULFONYL)-THIOMORPHOLINE-3-CARBONYL]-AMINO}-PROPIONIC ACID ETHYL ESTER × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；291 K；PEG10000, HEPES, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.250 |
| 1J4I crystal structure analysis of the FKBP12 complexed with 000308 small molecule 提交 2001-09-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | TST 4-METHYL-2-{[4-(TOLUENE-4-SULFONYL)-THIOMORPHOLINE-3-CARBONYL]-AMINO}-PENTANOIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
EVAPORATION；pH 6.5；291 K；PEG10000, HEPES, pH 6.5, EVAPORATION, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.209 |
| 1J4R FK506 BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH FKB-001 提交 2001-10-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | 001 1-[2,2-DIFLUORO-2-(3,4,5-TRIMETHOXY-PHENYL)-ACETYL]-PIPERIDINE-2-CARBOXYLIC ACID 4-PHENYL-1-(3-PYRIDIN-3-YL-PROPYL)-BUTYL ESTER × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；2.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M HEPES, PH 7.5, CRYOPROTECTANT 20% (V/V) GLYCEROL
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.249 |
| 1J4R FK506 BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH FKB-001 提交 2001-10-29 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–107（107 aa）
|
未记录 | 001 1-[2,2-DIFLUORO-2-(3,4,5-TRIMETHOXY-PHENYL)-ACETYL]-PIPERIDINE-2-CARBOXYLIC ACID 4-PHENYL-1-(3-PYRIDIN-3-YL-PROPYL)-BUTYL ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；2.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M HEPES, PH 7.5, CRYOPROTECTANT 20% (V/V) GLYCEROL
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.249 |
| 1J4R FK506 BINDING PROTEIN COMPLEXED WITH FKB-001 提交 2001-10-29 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–107（107 aa）
|
未记录 | 001 1-[2,2-DIFLUORO-2-(3,4,5-TRIMETHOXY-PHENYL)-ACETYL]-PIPERIDINE-2-CARBOXYLIC ACID 4-PHENYL-1-(3-PYRIDIN-3-YL-PROPYL)-BUTYL ESTER × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；2.5 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M HEPES, PH 7.5, CRYOPROTECTANT 20% (V/V) GLYCEROL
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.249 |
| 1NSG THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMAN FRAP 提交 1997-07-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | RAD C49-METHYL RAPAMYCIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.20 Å R-free 0.265 |
| 1QPF FK506 BINDING PROTEIN (12 KDA, HUMAN) COMPLEX WITH L-709,858 提交 1999-05-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 D
1–107（107 aa）
|
未记录 | 858 C32-O-(1-ETHYL-INDOL-5-YL)ASCOMYCIN × 2 B7G heptyl beta-D-glucopyranoside × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；AMMOMIUM SULFATE, BETA-HEPTYL- D-GLUCOPYRANOSIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, pH 5.6
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.310 |
| 1QPF FK506 BINDING PROTEIN (12 KDA, HUMAN) COMPLEX WITH L-709,858 提交 1999-05-24 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 D
1–107（107 aa）
|
未记录 | 858 C32-O-(1-ETHYL-INDOL-5-YL)ASCOMYCIN × 4 B7G heptyl beta-D-glucopyranoside × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；AMMOMIUM SULFATE, BETA-HEPTYL- D-GLUCOPYRANOSIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, pH 5.6
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.310 |
| 1QPF FK506 BINDING PROTEIN (12 KDA, HUMAN) COMPLEX WITH L-709,858 提交 1999-05-24 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | 858 C32-O-(1-ETHYL-INDOL-5-YL)ASCOMYCIN × 2 B7G heptyl beta-D-glucopyranoside × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；AMMOMIUM SULFATE, BETA-HEPTYL- D-GLUCOPYRANOSIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, pH 5.6
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.310 |
| 1QPF FK506 BINDING PROTEIN (12 KDA, HUMAN) COMPLEX WITH L-709,858 提交 1999-05-24 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–107（107 aa）
|
未记录 | 858 C32-O-(1-ETHYL-INDOL-5-YL)ASCOMYCIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；AMMOMIUM SULFATE, BETA-HEPTYL- D-GLUCOPYRANOSIDE, POTASSIUM PHOSPHATE, pH 5.6
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.310 |
| 1QPL FK506 BINDING PROTEIN (12 KDA, HUMAN) COMPLEX WITH L-707,587 提交 1999-05-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
链 C
1–107（107 aa）
|
未记录 | 587 C32-O-(1-METHYL-INDOL-5-YL) 18-HYDROXY-ASCOMYCIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.1；AMMONIUM SULFATE, POTASSIUM PHOSPHATE, pH 6.1
|
分辨率 2.90 Å R-free 0.342 |
| 1TCO TERNARY COMPLEX OF A CALCINEURIN A FRAGMENT, CALCINEURIN B, FKBP12 AND THE IMMUNOSUPPRESSANT DRUG FK506 (TACROLIMUS) 提交 1996-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–107（107 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 FE FE (III) ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 MYR MYRISTIC ACID × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.282 |
| 21KR A Wnt3a/Fzd8-CRD/LRP6-E3E4 complex with FKBP 提交 2025-12-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 C
2–108（107 aa）
链 D
2–108（107 aa）
链 G
2–108（107 aa）
链 H
2–108（107 aa）
链 I
2–108（107 aa）
|
突变：C178S 突变：C178S 突变：C178S 突变：C178S 突变：C178S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.90 Å |
| 21KS A Wnt3a/Fzd8-CRD/LRP6-E3E4-LA complex with FKBP 提交 2025-12-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 C
2–108（107 aa）
链 D
2–108（107 aa）
链 G
2–108（107 aa）
链 H
2–108（107 aa）
链 I
2–108（107 aa）
|
突变：C178S 突变：C178S 突变：C178S 突变：C178S 突变：C178S | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.01 Å |
| 21KT Wnt3a signalosome extracellular complex 提交 2025-12-17 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
2–108（107 aa）
链 D
2–108（107 aa）
链 G
2–108（107 aa）
链 H
2–108（107 aa）
|
突变：Q159A,E161A,C178S,Q221A 突变：Q159A,E161A,C178S,Q221A 突变：Q159A,E161A,C178S,Q221A 突变：Q159A,E161A,C178S,Q221A | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.33 Å |
| 2DG3 Wildtype FK506-binding protein complexed with Rapamycin 提交 2006-03-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；30% PEG MME 2000, 0.2M Ammonium sulphate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.228 |
| 2DG4 FK506-binding protein mutant WF59 complexed with Rapamycin 提交 2006-03-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；298 K；30% PEG MME 2000, 0.2M Ammonium Sulphate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.213 |
| 2DG9 FK506-binding protein mutant WL59 complexed with Rapamycin 提交 2006-03-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：W59L | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；30% PEG MME 2000, 0.2M Ammonium Sulphate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.239 |
| 2FAP THE STRUCTURE OF THE IMMUNOPHILIN-IMMUNOSUPPRESSANT FKBP12-(C16)-ETHOXY RAPAMYCIN COMPLEX INTERACTING WITH HUMA 提交 1998-09-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | RAD C49-METHYL RAPAMYCIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；pH 8.5
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.266 |
| 2FKE FK-506-BINDING PROTEIN: THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE COMPLEX WITH THE ANTAGONIST L-685,818 提交 1993-01-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 2 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.72 Å |
| 2FKE FK-506-BINDING PROTEIN: THREE-DIMENSIONAL STRUCTURE OF THE COMPLEX WITH THE ANTAGONIST L-685,818 提交 1993-01-27 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 4 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.72 Å |
| 2ND5 Lysine dimethylated FKBP12 提交 2016-05-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；303 K
NMR样品组成
1.2 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] entity-1, 30 mM sodium chloride-2, 3 mM DTT-3, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2PPN Crystal structure of FKBP12 提交 2007-04-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
片段：fkbp12
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.9-2.1 M Sodium Maleonate
50 mM DMSO
Slow buffer exchange into 2.5 M
Sodium Maleoneate no DMSO,
in 10 minute steps for freezing, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 0.92 Å R-free 0.199 |
| 2PPO Crystal structure of E60A mutant of FKBP12 提交 2007-04-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：E61A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.9-2.1 M Sodium Maleonate, 50 mM DMSO, Slow buffer exchange into 2.5 M Sodium Maleoneate no DMSO, in 10 minute steps for freezing, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.182 |
| 2PPP Crystal structure of E60Q mutant of FKBP12 提交 2007-04-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：E61Q | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.9-2.1 M Sodium Maleonate, 50 mM DMSO, Slow buffer exchange into 2.5 M Sodium Maleoneate no DMSO, in 10 minute steps for freezing, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 0.94 Å R-free 0.220 |
| 2RSE NMR structure of FKBP12-mTOR FRB domain-rapamycin complex structure determined based on PCS 提交 2012-01-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | TB TERBIUM(III) ION × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 ambient
NMR样品组成
0.3 mM FKBP12-1, 0.3 mM [U-98% 15N] FRB-2, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 3FAP ATOMIC STRUCTURES OF THE RAPAMYCIN ANALOGS IN COMPLEX WITH BOTH HUMAN FKBP12 AND FRB DOMAIN OF FRAP 提交 1999-05-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | ARD C15-(R)-METHYLTHIENYL RAPAMYCIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；20% PEG8000, 10% MPD, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, pH 8.00
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.273 |
| 3H9R Crystal structure of the kinase domain of type I activin receptor (ACVR1) in complex with FKBP12 and dorsomorphin 提交 2009-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
片段：FKBP12
|
未记录 | TAK 6-[4-(2-piperidin-1-ylethoxy)phenyl]-3-pyridin-4-ylpyrazolo[1,5-a]pyrimidine × 1 SO4 SULFATE ION × 5 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277.15 K；30% PEG 3350; 0.25M Ammonium sulphate; 0.1M Bis-Tris, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.35 Å R-free 0.256 |
| 3MDY Crystal structure of the cytoplasmic domain of the bone morphogenetic protein receptor type-1B (BMPR1B) in complex with FKBP12 and LDN-193189 提交 2010-03-31 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
片段：FKBP12
|
未记录 | LDN 4-[6-(4-piperazin-1-ylphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]quinoline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277.15 K；20% PEG 3350, 0.2M Na Malonate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.255 |
| 3MDY Crystal structure of the cytoplasmic domain of the bone morphogenetic protein receptor type-1B (BMPR1B) in complex with FKBP12 and LDN-193189 提交 2010-03-31 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
1–108（108 aa）
片段：FKBP12
|
未记录 | LDN 4-[6-(4-piperazin-1-ylphenyl)pyrazolo[1,5-a]pyrimidin-3-yl]quinoline × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277.15 K；20% PEG 3350, 0.2M Na Malonate, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277.15K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.255 |
| 4DH0 X-ray Crystal Structure of 28-O-Methylrapamycin complexed with FKBP12: Is the Cyclohexyl Moiety Part of the Effector Domain of Rapamycin? 提交 2012-01-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | MR8 28-O-Methylrapamycin × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.7；298 K；35% ammonium sulphate, 0.1M Na/K phosphate, pH 7.7, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.257 |
| 4FAP ATOMIC STRUCTURES OF THE RAPAMYCIN ANALOGS IN COMPLEX WITH BOTH HUMAN FKBP12 AND FRB DOMAIN OF FRAP 提交 1999-05-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–107（107 aa）
|
未记录 | ARD C15-(R)-METHYLTHIENYL RAPAMYCIN × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8；20% PEG8000, 10% MPD, 0.1 M TRIS-HCL PH 8.5, pH 8.0
|
分辨率 2.80 Å R-free 0.266 |
| 4IPX Analyzing the visible conformational substates of the FK506 binding protein FKBP12 提交 2013-01-10 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：C22V, H87V | MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；298 K；1.7 M sodium malonate, pH 7.0, 0.1 M HEPES, pH 7.4, 5% MPD, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.217 |
| 4N19 Structural basis of conformational transitions in the active site and 80 s loop in the FK506 binding protein FKBP12 提交 2013-10-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：C22V, G89P | SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.20 Å R-free 0.180 |
| 4ODP Structure of SlyD delta-IF from Thermus thermophilus in complex with S2-W23A peptide 提交 2014-01-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
85–97（13 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；28% PEG400, 0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.2 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.202 |
| 4ODQ Structure of SlyD delta-IF from Thermus thermophilus in complex with S3 peptide 提交 2014-01-10 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
85–97（13 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | CL CHLORIDE ION × 1 CA CALCIUM ION × 4 NI NICKEL (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；25% PEG6000, 0.1 M Tris-HCl, pH 8.0, 0.2 M calcium chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.213 |
| 4ODR Structure of SlyD delta-IF from Thermus thermophilus in complex with FK506 提交 2014-01-10 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
85–97（13 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；20% PEG6000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.2 M zinc chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.170 |
| 4ODR Structure of SlyD delta-IF from Thermus thermophilus in complex with FK506 提交 2014-01-10 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
85–97（13 aa）
片段：SEE REMARK 999
|
未记录 | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；277 K；20% PEG6000, 0.1 M sodium acetate, pH 5.0, 0.2 M zinc chloride, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.93 Å R-free 0.170 |
| 5I7P Crystal structure of Fkbp12-IF(SlyD), a chimeric protein of human Fkbp12 and the insert in flap domain of Ecoli SlyD 提交 2016-02-18 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–84（83 aa）
链 A
98–108（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20 % PEG3350, 0.1 M MgCl2, 0.1 M Hepes pH 7.5
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.248 |
| 5I7Q Crystal structure of Fkbp12-IF(SlpA), a chimeric protein of human Fkbp12 and the insert in flap domain of Ecoli SlpA 提交 2016-02-18 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–84（83 aa）
链 A
97–108（12 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；25 % PEG1500, 10 % isopropanol, 0.1 M CaCl2, 0.1 M Mes pH 6.5
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.238 |
| 6I1S Crystal structure of the ACVR1 (ALK2) kinase in complex with FKBP12 and the inhibitor E6201 提交 2018-10-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | E26 (4~{S},5~{R},6~{Z},9~{S},10~{S},12~{E})-16-(ethylamino)-4,5-dimethyl-9,10,18-tris(oxidanyl)-3-oxabicyclo[12.4.0]octadeca-1(14),6,12,15,17-pentaene-2,8-dione × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；0.05M ammonium sulfate, 30% pentaerythritol ethoxylate 15/4, 0.1M bis-tris pH 6.5
|
分辨率 1.52 Å R-free 0.193 |
| 6M4U Crystal structure of FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 ZN ZINC ION × 8 CL CHLORIDE ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM cacodylic acid buffer (pH 6.5), 350 mM zinc acetate and 8% (w/v) isopropanol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.258 |
| 6M4U Crystal structure of FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
1–108（108 aa）
|
未记录 | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 ZN ZINC ION × 6 CL CHLORIDE ION × 3 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM cacodylic acid buffer (pH 6.5), 350 mM zinc acetate and 8% (w/v) isopropanol
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.258 |
| 6M4V Crystal structure of MBP fused split FKBP in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–32（32 aa）
链 B
33–108（76 aa）
|
突变：K-131A, N-197A, E-198A, K-287A, D-288A | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Na-HEPES buffer (pH 7.5), 20% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.298 |
| 6M4V Crystal structure of MBP fused split FKBP in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
1–32（32 aa）
链 D
33–108（76 aa）
|
突变：K-131A, N-197A, E-198A, K-287A, D-288A | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Na-HEPES buffer (pH 7.5), 20% (w/v) PEG 8000
|
分辨率 2.92 Å R-free 0.298 |
| 6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
1–32（32 aa）
链 D
33–108（76 aa）
|
突变：D-288A, K-287A, E-198A, N-197A, K-131A | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.278 |
| 6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 | Assembly 2 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
1–32（32 aa）
链 E
33–108（76 aa）
|
突变：D-288A, K-287A, E-198A, N-197A, K-131A | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.278 |
| 6M4W Crystal structure of MBP fused split FKBP-FRB T2098L mutant in complex with rapamycin 提交 2020-03-09 | Assembly 3 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–32（32 aa）
链 F
33–108（76 aa）
|
突变：D-288A, K-287A, E-198A, N-197A, K-131A | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；100 mM Tris-HCl buffer (pH 7.0), 200 mM calcium acetate and 20% (w/v) PEG 3000
|
分辨率 3.11 Å R-free 0.278 |
| 6OQA Crystal structure of CEP250 bound to FKBP12 in the presence of FK506-like novel natural product 提交 2019-04-26 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 60Z (3R,4E,7E,10R,11S,12R,13S,16R,17R,24aS)-11,17-dihydroxy-10,12,16-trimethyl-3-[(2R)-1-phenylbutan-2-yl]-6,9,10,11,12,13,14,15,16,17,22,23,24,24a-tetradecahydro-3H-13,17-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohenicosine-1,18,19(21H)-trione × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 13 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 7 PE8 3,6,9,12,15,18,21-HEPTAOXATRICOSANE-1,23-DIOL × 2 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 3 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES, pH 7.0, 0.2 M sodium malonate, 21% PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.256 |
| 6OQA Crystal structure of CEP250 bound to FKBP12 in the presence of FK506-like novel natural product 提交 2019-04-26 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
1–108（108 aa）
链 F
1–108（108 aa）
|
未记录 | 60Z (3R,4E,7E,10R,11S,12R,13S,16R,17R,24aS)-11,17-dihydroxy-10,12,16-trimethyl-3-[(2R)-1-phenylbutan-2-yl]-6,9,10,11,12,13,14,15,16,17,22,23,24,24a-tetradecahydro-3H-13,17-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohenicosine-1,18,19(21H)-trione × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 3 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 MLA MALONIC ACID × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES, pH 7.0, 0.2 M sodium malonate, 21% PEG3350
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.256 |
| 6VCU Homo sapiens FKBP12 protein bound with APX879 in P32 space group 提交 2019-12-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 R27 N'-[(3S,4R,5S,8R,9E,12S,14S,15R,16S,18R,19R,26aS)-5,19-dihydroxy-3-{(1E)-1-[(1R,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]prop-1-en-2-yl}-14,16-dimethoxy-4,10,12,18-tetramethyl-1,20,21-trioxo-8-(prop-2-en-1-yl)-1,3,4,5,6,8,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,23,24,25,26,26a-docosahydro-7H-15,19-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclotricosin-7-ylidene]acetohydrazide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；2.5M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium acetate trihydrate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.196 |
| 6VCU Homo sapiens FKBP12 protein bound with APX879 in P32 space group 提交 2019-12-23 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 R27 N'-[(3S,4R,5S,8R,9E,12S,14S,15R,16S,18R,19R,26aS)-5,19-dihydroxy-3-{(1E)-1-[(1R,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]prop-1-en-2-yl}-14,16-dimethoxy-4,10,12,18-tetramethyl-1,20,21-trioxo-8-(prop-2-en-1-yl)-1,3,4,5,6,8,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,23,24,25,26,26a-docosahydro-7H-15,19-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclotricosin-7-ylidene]acetohydrazide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；2.5M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium acetate trihydrate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.196 |
| 6VCU Homo sapiens FKBP12 protein bound with APX879 in P32 space group 提交 2019-12-23 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
1–108（108 aa）
|
未记录 | R27 N'-[(3S,4R,5S,8R,9E,12S,14S,15R,16S,18R,19R,26aS)-5,19-dihydroxy-3-{(1E)-1-[(1R,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]prop-1-en-2-yl}-14,16-dimethoxy-4,10,12,18-tetramethyl-1,20,21-trioxo-8-(prop-2-en-1-yl)-1,3,4,5,6,8,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,23,24,25,26,26a-docosahydro-7H-15,19-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclotricosin-7-ylidene]acetohydrazide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；2.5M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium acetate trihydrate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.196 |
| 6VCU Homo sapiens FKBP12 protein bound with APX879 in P32 space group 提交 2019-12-23 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
1–108（108 aa）
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 R27 N'-[(3S,4R,5S,8R,9E,12S,14S,15R,16S,18R,19R,26aS)-5,19-dihydroxy-3-{(1E)-1-[(1R,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]prop-1-en-2-yl}-14,16-dimethoxy-4,10,12,18-tetramethyl-1,20,21-trioxo-8-(prop-2-en-1-yl)-1,3,4,5,6,8,11,12,13,14,15,16,17,18,19,20,21,23,24,25,26,26a-docosahydro-7H-15,19-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclotricosin-7-ylidene]acetohydrazide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；293 K；2.5M Ammonium sulfate, 0.1M Sodium acetate trihydrate
|
分辨率 1.69 Å R-free 0.196 |
| 6YF0 FKBP12 in complex with the BMP potentiator compound 9 at 1.55 A resolution 提交 2020-03-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | 818 18-HYDROXYASCOMYCIN × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；298 K；2.2 M AmSO4, 0.2 M NaThiocyanate
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.257 |
| 6YF1 FKBP12 in complex with the BMP potentiator compound 8 at 1.12A resolution 提交 2020-03-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | OP8 (1aR,3R,5S,6R,7S,9R,10R,17aS,20S,21R,22S,25R,25aR)-25-Ethyl-10,22-dihydroxy-20-{(1E)-1-[(1R,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]prop-1-en-2-yl}-5,7-dimethoxy-1a,3,9,21-tetramethyloctadecahydro-2H-6,10-epoxyoxireno[p]pyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclotricosine-11,12,18,24(1aH,14H)-tetrone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.2 M AmSO4, 0.2 M CdCl2
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.163 |
| 6YF2 FKBP12 in complex with the BMP potentiator compound 6 at 1.03A resolution 提交 2020-03-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | OP5 (1~{R},9~{S},12~{S},13~{R},14~{S},17~{R},18~{E},21~{S},23~{S},24~{R},25~{S},27~{R})-23,25-dimethoxy-12-[(~{E})-1-[(1~{R},3~{R},4~{R})-3-methoxy-4-oxidanyl-cyclohexyl]prop-1-en-2-yl]-13,19,21,27-tetramethyl-1,14-bis(oxidanyl)-17-(2-oxidanylidenepropyl)-11,28-dioxa-4-azatricyclo[22.3.1.0^{4,9}]octacos-18-ene-2,3,10,16-tetrone × 1 CD CADMIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；1.9 M AmSO4, 0.15 M CdCl2
|
分辨率 1.03 Å R-free 0.149 |
| 6YF3 FKBP12 in complex with the BMP potentiator compound 10 at 1.00A resolution 提交 2020-03-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | OOZ (1~{R},9~{S},12~{S},13~{R},14~{S},17~{R},18~{E},21~{S},23~{S},24~{R},25~{S},27~{R})-17-ethyl-25-methoxy-12-[(~{E})-1-[(1~{R},3~{R},4~{R})-3-methoxy-4-oxidanyl-cyclohexyl]prop-1-en-2-yl]-13,19,21,27-tetramethyl-1,14,23-tris(oxidanyl)-11,28-dioxa-4-azatricyclo[22.3.1.0^{4,9}]octacos-18-ene-2,3,10,16-tetrone × 1 CD CADMIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；2.2 M AmSO4, 0.2 M CdCl2
|
分辨率 1.00 Å R-free 0.158 |
| 7U8D FKBP12 mutant V55G bound to Rapa*-3Z 提交 2022-03-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：V55G | LWR (3S,5Z,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5-(ethoxyimino)-9,27-dihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；sodium tartrate, PEG 3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.172 |
| 7U8D FKBP12 mutant V55G bound to Rapa*-3Z 提交 2022-03-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–108（107 aa）
|
突变：V55G | LWR (3S,5Z,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5-(ethoxyimino)-9,27-dihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296 K；sodium tartrate, PEG 3350
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.172 |
| 8CHI Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((S)-3,5-dichloro-N-methylphenylsulfonimidoyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UMR (1S,5S,6R)-10-[S-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]-N-methyl-sulfonimidoyl]-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4M Na/K tartrate, 0.2 M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.214 |
| 8CHI Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((S)-3,5-dichloro-N-methylphenylsulfonimidoyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UMR (1S,5S,6R)-10-[S-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]-N-methyl-sulfonimidoyl]-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.4M Na/K tartrate, 0.2 M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.214 |
| 8CHJ Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((R)-(3,5-dichlorophenyl)sulfonimidoyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UQI (1S,5S,6R)-10-[[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonimidoyl]-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.32M Na-K tartrate, 0.2 M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.205 |
| 8CHJ Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((R)-(3,5-dichlorophenyl)sulfonimidoyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UQI (1S,5S,6R)-10-[[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonimidoyl]-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.32M Na-K tartrate, 0.2 M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.205 |
| 8CHJ Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((R)-(3,5-dichlorophenyl)sulfonimidoyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UQI (1S,5S,6R)-10-[[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonimidoyl]-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.32M Na-K tartrate, 0.2 M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.205 |
| 8CHJ Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((R)-(3,5-dichlorophenyl)sulfonimidoyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UQI (1S,5S,6R)-10-[[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonimidoyl]-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.32M Na-K tartrate, 0.2 M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.205 |
| 8CHK Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((S)-(3,5-dichlorophenyl)sulfonimidoyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UUI (1S,5S,6R)-10-[[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonimidoyl]-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.32M Na-K tartrate, 0.2 M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.233 |
| 8CHK Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((S)-(3,5-dichlorophenyl)sulfonimidoyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UUI (1S,5S,6R)-10-[[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonimidoyl]-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.32M Na-K tartrate, 0.2 M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.233 |
| 8CHK Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((S)-(3,5-dichlorophenyl)sulfonimidoyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UUI (1S,5S,6R)-10-[[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonimidoyl]-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.32M Na-K tartrate, 0.2 M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.233 |
| 8CHL Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-9-((3,5-dichlorophenyl)sulfonyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,9-diazabicyclo[4.2.1]nonan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | USV (1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 GOL GLYCEROL × 3 CD CADMIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.2 M cadmium sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.213 |
| 8CHL Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-9-((3,5-dichlorophenyl)sulfonyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,9-diazabicyclo[4.2.1]nonan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | USV (1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 GOL GLYCEROL × 1 CD CADMIUM ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.2 M ammonium sulfate, 0.2 M cadmium sulfate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.213 |
| 8CHM Human FKBP12 in complex with (1S,5S,6R)-10-((S)-(3,5-dichlorophenyl)sulfinyl)-3-(pyridin-2-ylmethyl)-5-vinyl-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one 提交 2023-02-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | UT6 (1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfinyl-5-ethenyl-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1 CD CADMIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 6 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；2.1 M ammonium sulfate, 0.2 M cadmium chloride, 0.1M HEPES-NaOH pH 7.5
|
分辨率 1.12 Å R-free 0.145 |
| 8ER6 FKBP12-FRB in Complex with Compound 11 提交 2022-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.0-3.3 M sodium formate and 0.1 M HEPES pH 7.0-7.5
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.224 |
| 8ER6 FKBP12-FRB in Complex with Compound 11 提交 2022-10-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–108（107 aa）
|
未记录 | XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.0-3.3 M sodium formate and 0.1 M HEPES pH 7.0-7.5
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.224 |
| 8ER6 FKBP12-FRB in Complex with Compound 11 提交 2022-10-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
2–108（107 aa）
|
未记录 | XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.0-3.3 M sodium formate and 0.1 M HEPES pH 7.0-7.5
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.224 |
| 8ER7 FKBP12-FRB in Complex with Compound 12 提交 2022-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | XZ3 (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-9,27-dihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-5,10,21-trimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.0-3.3 M sodium formate and 0.1 M HEPES pH 7.0-7.5
|
分辨率 3.07 Å R-free 0.279 |
| 8ER7 FKBP12-FRB in Complex with Compound 12 提交 2022-10-11 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–108（107 aa）
|
未记录 | XZ3 (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-9,27-dihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-5,10,21-trimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.0-3.3 M sodium formate and 0.1 M HEPES pH 7.0-7.5
|
分辨率 3.07 Å R-free 0.279 |
| 8ER7 FKBP12-FRB in Complex with Compound 12 提交 2022-10-11 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
2–108（107 aa）
|
未记录 | XZ3 (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-9,27-dihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-5,10,21-trimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；3.0-3.3 M sodium formate and 0.1 M HEPES pH 7.0-7.5
|
分辨率 3.07 Å R-free 0.279 |
| 8ERA RMC-5552 in complex with mTORC1 and FKBP12 提交 2022-10-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
2–108（107 aa）
|
未记录 | XZ9 1-[6-{[(3M)-4-amino-3-(2-amino-1,3-benzoxazol-5-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]methyl}-3,4-dihydroisoquinolin-2(1H)-yl]-3-hydroxypropan-1-one × 1 XYU (3S,5R,6R,7E,9R,10R,12R,14S,15E,17E,19E,21S,23S,26R,27R,30R,34aS)-5,9,27-trihydroxy-3-{(2R)-1-[(1S,3R,4R)-4-hydroxy-3-methoxycyclohexyl]propan-2-yl}-10,21-dimethoxy-6,8,12,14,20,26-hexamethyl-5,6,9,10,12,13,14,21,22,23,24,25,26,27,32,33,34,34a-octadecahydro-3H-23,27-epoxypyrido[2,1-c][1,4]oxazacyclohentriacontine-1,11,28,29(4H,31H)-tetrone × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.86 Å |
| 8JCU Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495 (dimerization mode I) 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
2–108（107 aa）
|
未记录 | Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8JCV Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495 (dimerization mode II) 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
18–108（91 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8JCW Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495 and NAM563 (dimerization mode I) 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
2–108（107 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8JCX Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495 and NAM563 (dimerization mode II) 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
2–108（107 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8JCY Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495, NAM563, and LY2389575 (dimerization mode I) 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
2–108（107 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 CLR CHOLESTEROL × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8JCZ Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of LY341495, NAM563, and LY2389575 (dimerization mode III) 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
2–108（107 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 Z99 2-[(1S,2S)-2-carboxycyclopropyl]-3-(9H-xanthen-9-yl)-D-alanine × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8JD0 Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in presence of NAM563 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
2–108（107 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 J9R 4-(1-methylpyrazol-4-yl)-7-[[(2~{S})-2-(trifluoromethyl)morpholin-4-yl]methyl]quinoline-2-carboxamide × 1 CLR CHOLESTEROL × 9 GLU GLUTAMIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8JD1 Cryo-EM structure of mGlu2-mGlu3 heterodimer in Rco state 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
2–108（107 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 CLR CHOLESTEROL × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8JD2 Cryo-EM structure of G protein-free mGlu2-mGlu3 heterodimer in Acc state 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
2–108（107 aa）
|
未记录 | GLU GLUTAMIC ACID × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8JD4 Cryo-EM structure of G protein-free mGlu2-mGlu4 heterodimer in Acc state 提交 2023-05-12 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 2
2–108（107 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3 GLU GLUTAMIC ACID × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8JGA Cryo-EM structure of Mi3 fused with FKBP 提交 2023-05-20 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.68 Å |
| 8PDF FKBP12 in complex with PROTAC 6a2 提交 2023-06-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：C23V | Y5Q (2~{S},4~{R})-1-[(2~{S})-2-[2-[2-[2-[4-[(1~{S})-1-[(1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-5-ethenyl-2-oxidanylidene-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-3-yl]ethyl]-1,2,3-triazol-1-yl]ethoxy]ethoxy]ethanoylamino]-3,3-dimethyl-butanoyl]-~{N}-[[4-(4-methyl-1,3-thiazol-5-yl)phenyl]methyl]-4-oxidanyl-pyrrolidine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；1.36 Na/K tartrate, 0.2M ammonium citrate, 0.1M MES pH 6.5
|
分辨率 1.20 Å R-free 0.176 |
| 8POD Crystal structure of the kinase domain of ACVR1 (ALK2) in complex with FKBP12 and MU1700 提交 2023-07-04 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 7IO 6-(4-piperazin-1-ylphenyl)-3-quinolin-4-yl-furo[3,2-b]pyridine × 1 F FLUORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；20% PEG3350, 10% ethylene glycol, 0.1M bis-tris-propane pH 7.5, 0.2M sodium fluoride
|
分辨率 2.59 Å R-free 0.255 |
| 8PPZ Co-crystal structure of FKBP12, compound 7 and the FRB fragment of mTOR 提交 2023-07-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | 0AN (1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-5-[(~{E})-2-(2-chlorophenyl)ethenyl]-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-2-one × 1 CA CALCIUM ION × 4 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；10% PEG8000, 0.1 M HEPES pH 7.5, 0.2 M calcium actetate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.238 |
| 8X6P Isomerase Protein 提交 2023-11-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；300 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.224 |
| 8X6P Isomerase Protein 提交 2023-11-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | SO4 SULFATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；300 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.224 |
| 8XI9 Crystal structure of FRB-FKBP fusion protein in complex with rapamycin 提交 2023-12-19 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | RAP RAPAMYCIN IMMUNOSUPPRESSANT DRUG × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；293 K；4.4M Sodium Acetate
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.218 |
| 9CHU Cryo-EM structure of calcineurin fused beta2 adrenergic receptor in norepinephrine bound inactive state 提交 2024-07-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–108（108 aa）
|
未记录 | E5E Noradrenaline × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.49 Å |
| 9CHV cryo-EM structure of calcineurin-fused beta2 adrenergic receptor in apo state 提交 2024-07-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–108（108 aa）
|
未记录 | FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.95 Å |
| 9CHX cryo-EM structure of calcineurin-fused beta2 adrenergic receptor in carazolol bound inactive state 提交 2024-07-02 | Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
1–108（108 aa）
|
未记录 | CAU (2S)-1-(9H-Carbazol-4-yloxy)-3-(isopropylamino)propan-2-ol × 1 FK5 8-DEETHYL-8-[BUT-3-ENYL]-ASCOMYCIN × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9CO5 Crystal Structure of Macrocycle mediated complex of FKBP12 and MAPRE1 提交 2024-07-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | A1AZI (5S,14R,16aS,21R,28S,30aR)-14-[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl]-24,24,28-trimethyl-2-methylidene-1,3,4,17,18,19,20,24,25,28,29,30a-dodecahydro-2H,14H-9,13-(metheno)dipyrido[1,2-d:1',2'-o][1,10,18,4,7,15]trioxatriazacyclotetracosine-6,16,22,23,27,30(7H,16aH)-hexone × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；1.5 M LiSO4, 0.1 M CH3COONa pH 4.6
|
分辨率 2.77 Å R-free 0.225 |
| 9DCW FKBP1a (FKBP12) co-crystal structure with macrocycle molecular glue 提交 2024-08-27 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | A1AZI (5S,14R,16aS,21R,28S,30aR)-14-[2-(3,4-dimethoxyphenyl)ethyl]-24,24,28-trimethyl-2-methylidene-1,3,4,17,18,19,20,24,25,28,29,30a-dodecahydro-2H,14H-9,13-(metheno)dipyrido[1,2-d:1',2'-o][1,10,18,4,7,15]trioxatriazacyclotetracosine-6,16,22,23,27,30(7H,16aH)-hexone × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277.15 K；0.1 M CHES, 30% PEG3K (pH 9.5)
|
分辨率 1.72 Å R-free 0.252 |
| 9DTW Co-crystal structure of the ternary complex of human FKBP12, QDPR and Compound 4 提交 2024-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 1 A1BB9 (2S)-N-[(2R)-1-({[(1R)-6-(4-[(4S)-5,6-dihydro[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrazin-7(8H)-yl]-6-{[(1S)-3-methyl-1-(1H-1,2,4-triazol-3-yl)butyl]amino}-1,3,5-triazin-2-yl)-6-azaspiro[2.5]octan-1-yl]methyl}amino)-4-(4-methoxyphenyl)-1-oxobutan-2-yl]-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carboxamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.1 M TRIS-HCL PH 7, 0.2 M CALCIUM ACETATE
HYDRATE, 20 % (W/V) PEG 3000 (MCSG SCREEN 1, CONDITION C11); 1:1:1 FKBP12:QDPR:MOTHER LIQUOR PLUS EQUIMOLAR COMPOUND IN 200-NL DROP. COMPLEX CONCENTRATED TO 10 MG/ML
|
分辨率 1.39 Å R-free 0.214 |
| 9DU1 Co-crystal structure of the ternary complex of human FKBP12, BRD9 bromo domain and Compound 1 提交 2024-10-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
链 B
1–108（108 aa）
链 C
1–108（108 aa）
链 D
1–108（108 aa）
|
未记录 | A1BB8 4-[4-{cyclopropyl[(1-methyl-1H-pyrazol-4-yl)methyl]amino}-6-({1-[(2R)-2-{[(2S)-1-(3,3-dimethyl-2-oxopentanoyl)piperidine-2-carbonyl]amino}-4-(4-methoxyphenyl)butanoyl]piperidin-4-yl}amino)-1,3,5-triazin-2-yl]-N-ethylpiperazine-1-carboxamide × 4 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1 M HEPES PH 7.5, 20% PEG 8000 (MCSG SCREEN 1, CONDITION A1); 1:1:1 FKBP12:BRD9:MOTHER LIQUOR PLUS
EQUIMOLAR COMPOUND IN 200-NL DROP. COMPLEX CONCENTRATED TO 10 MG/ML
|
分辨率 2.01 Å R-free 0.259 |
| 9LYG Crystal structure of FKBP12 complexed with Small Molecule Anchor for Protein-201 提交 2025-02-20 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | A1L7S 5-[(2~{S})-1-cyclohexylsulfonylpiperidin-2-yl]-3-[3-(3,4-dimethoxyphenyl)propyl]-1,2,4-oxadiazole × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；0.1 M Tris-HCl (pH8.0), 3.0 M Ammonium sulfate
|
分辨率 1.26 Å R-free 0.188 |
| 9QW8 FKBP12 in complex with bifunctional ligand 1ad and the first bromodomain of BRD4 提交 2025-04-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | A1JAZ ~{N}-[2-[2-[4-[[(1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-2-oxidanylidene-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-5-yl]methoxymethyl]-1,2,3-triazol-1-yl]ethoxy]ethyl]-2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22% PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.243 |
| 9QW8 FKBP12 in complex with bifunctional ligand 1ad and the first bromodomain of BRD4 提交 2025-04-14 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–108（107 aa）
|
突变：C22V | A1JAZ ~{N}-[2-[2-[4-[[(1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-2-oxidanylidene-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-5-yl]methoxymethyl]-1,2,3-triazol-1-yl]ethoxy]ethyl]-2-[(9~{S})-7-(4-chlorophenyl)-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanamide × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；22% PEG3350, 0.2 M NaCl, 0.1 M Tris-HCl pH 8.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.243 |
| 9R5N FKBP12 in complex with binfunctional ligand b3c and the first bromodomain of BRD4 提交 2025-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
2–108（107 aa）
|
突变：C23V | A1JCU ~{tert}-butyl 2-[(9~{S})-7-[4-[3-[2-[2-[4-[(1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-2-oxidanylidene-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-5-yl]-1,2,3-triazol-1-yl]ethoxy]ethanoylamino]prop-1-ynyl]phenyl]-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.2M ammonium thiocyanate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.8
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 9R5N FKBP12 in complex with binfunctional ligand b3c and the first bromodomain of BRD4 提交 2025-05-09 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
2–108（107 aa）
|
突变：C23V | A1JCU ~{tert}-butyl 2-[(9~{S})-7-[4-[3-[2-[2-[4-[(1~{S},5~{S},6~{R})-10-[3,5-bis(chloranyl)phenyl]sulfonyl-2-oxidanylidene-3-(pyridin-2-ylmethyl)-3,10-diazabicyclo[4.3.1]decan-5-yl]-1,2,3-triazol-1-yl]ethoxy]ethanoylamino]prop-1-ynyl]phenyl]-4,5,13-trimethyl-3-thia-1,8,11,12-tetrazatricyclo[8.3.0.0^{2,6}]trideca-2(6),4,7,10,12-pentaen-9-yl]ethanoate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25% PEG3350, 0.2M ammonium thiocyanate, 0.1 M Tris-HCl pH 8.8
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.312 |
| 9RDA Cocrystal structure of Zilurgisertib bound to the ALK2-FKBP12 complex 提交 2025-06-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
2–108（107 aa）
|
未记录 | A1JFB Zilurgisertib × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 14 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；293 K；protein: reservoir 2:1
Crystallization Reservoir Solution = 0.24M Ammonium Sulphate, 0.1M Hepes pH 7.0, 28% PEG3350
Crystallization Protein Solution = Alk2-FKBP12 at 7.0 mg/ml in 50 mM Tris, 150 mM NaCl, 2 mM TCEP, pH 7.0 concentrated in the presence of 2.5 mM AMPPNP and 20 mM MgCl2
cryo condition: 10% ethyleneglycol for 2 min
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.224 |
| 9W8H Isomerase Structure at 140K 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.275 |
| 9W8H Isomerase Structure at 140K 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.275 |
| 9W8I Isomerase at 160K 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.280 |
| 9W8I Isomerase at 160K 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.280 |
| 9W8K Isomerase at 180K 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 9W8K Isomerase at 180K 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.279 |
| 9W8L Isomerase at 200K 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.311 |
| 9W8L Isomerase at 200K 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.311 |
| 9W8M Isomerase at 240K 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |
| 9W8M Isomerase at 240K 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.270 |
| 9W8N Isomerase at 290K 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.262 |
| 9W8N Isomerase at 290K 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.262 |
| 9W8O Isomerase at 285K 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.261 |
| 9W8O Isomerase at 285K 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.261 |
| 9W8P Isomerase at 260K 提交 2025-08-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 9W8P Isomerase at 260K 提交 2025-08-07 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.246 |
| 9WH0 Isomerase at 100K 提交 2025-08-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Ammonium Sulfate, Sodium Chloride, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 9WH0 Isomerase at 100K 提交 2025-08-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Ammonium Sulfate, Sodium Chloride, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 9WH2 Isomerase Structure at 280K 提交 2025-08-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 9WH2 Isomerase Structure at 280K 提交 2025-08-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；NaCl, Ammonium Sulfate, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.234 |
| 9WH5 Isomerase at 120K 提交 2025-08-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Ammonium Sulfate, Sodium Chloride, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 9WH5 Isomerase at 120K 提交 2025-08-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Ammonium Sulfate, Sodium Chloride, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.252 |
| 9WH6 Isomerase at 300K 提交 2025-08-25 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Ammonium Sulfate, Sodium Chloride, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.282 |
| 9WH6 Isomerase at 300K 提交 2025-08-25 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
1–108（108 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；Ammonium Sulfate, Sodium Chloride, TRIS
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.282 |