当前蛋白身份：Q99613
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 28ZX human 48S PIC with mRNA (Kozak_1) 提交 2026-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 c
1–913（913 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.80 Å |
| 28ZY human 48S PIC with mRNA (Kozak_2) 提交 2026-03-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 c
1–913（913 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 3.00 Å |
| 6YBD Structure of a human 48S translational initiation complex - eIF3 提交 2020-03-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric（19） 与蛋白数一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6YBW Structure of a human 48S translational initiation complex - 40S body 提交 2020-03-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：26-meric（26） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 60 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 6ZMW Structure of a human 48S translational initiation complex 提交 2020-07-04 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 6ZON SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 1 提交 2020-07-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 6ZP4 SARS-CoV-2 Nsp1 bound to a human 43S preinitiation ribosome complex - state 2 提交 2020-07-08 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 7A09 Structure of a human ABCE1-bound 43S pre-initiation complex - State III 提交 2020-08-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 C
1–306（306 aa）
链 C
307–913（607 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MET METHIONINE × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 7QP6 Structure of the human 48S initiation complex in open state (h48S AUG open) 提交 2022-01-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5,
95 mM KOAc, 3.75 mM Mg(OAc)2, 1 mM ATP, 0.5 mM GTP, 0.25 mM spermidine, 2 mM DTT,
0.4 U/uL RiboLock RNase inhibitor
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Cryo-EM grids were prepared by
floating home-made continuous carbon on 40 ul sample in the wells of teflon block (custom-made). The sample-covered carbon was then adsorbed to an EM grid.
|
分辨率 4.70 Å |
| 7QP7 Structure of the human 48S initiation complex in closed state (h48S AUG closed) 提交 2022-01-03 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；20 mM Hepes, pH 7.5,
95 mM KOAc, 3.75 mM Mg(OAc)2, 1 mM ATP, 0.5 mM GTP, 0.25 mM spermidine, 2 mM DTT,
0.4 U/uL RiboLock RNase inhibitor
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Cryo-EM grids were prepared by
floating home-made continuous carbon on 40 ul sample in the wells of teflon block (custom-made). The sample-covered carbon was then adsorbed to an EM grid.
|
分辨率 3.70 Å |
| 8OZ0 Structure of a human 48S translation initiation complex with eIF4F and eIF4A 提交 2023-05-06 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：57-meric（57） 与全部聚合物一致 |
链 J
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 89 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8PJ1 Structure of human 48S translation initiation complex in open codon scanning state (48S-1) 提交 2023-06-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 90 ZN ZINC ION × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MET METHIONINE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.40 Å |
| 8PJ2 Structure of human 48S translation initiation complex in AUG recognition state after eIF5-induced GTP hydrolysis by eIF2 (48S-2) 提交 2023-06-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric（49） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 87 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.40 Å |
| 8PJ3 Structure of human 48S translation initiation complex upon transfer of initiator tRNA to eIF5B (48S-3) 提交 2023-06-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：54-meric（54） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 89 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.70 Å |
| 8PJ4 Structure of human 48S translation initiation complex after eIF5 release (48S-4) 提交 2023-06-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：53-meric（53） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 NA SODIUM ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 89 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.20 Å |
| 8PJ5 Structure of human 48S translation initiation complex after eIF2 release prior 60S subunit joining (48S-5) 提交 2023-06-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric（51） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 91 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 2.90 Å |
| 8PJ6 Structure of human 48S translation initiation complex with initiator tRNA, eIF1A and eIF3 (off-pathway) 提交 2023-06-22 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 87 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 2.90 Å |
| 8PPL MERS-CoV Nsp1 bound to the human 43S pre-initiation complex 提交 2023-07-07 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：52-meric（52） 与全部聚合物一致 |
链 Iy
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 4 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 116 MET METHIONINE × 1 UNX UNKNOWN LIGAND × 129 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.65 Å |
| 8RG0 Structure of human eIF3 core from closed 48S translation initiation complex 提交 2023-12-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：19-meric（19） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Manual blotting & plunge-freezing
|
分辨率 3.40 Å |
| 8XXN Cryo-EM structure of the human 43S ribosome with PDCD4 提交 2024-01-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 3C
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 23 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9BLN The structure of human Pdcd4 bound to the 40S-eIF4A-eIF3-eIF1 complex 提交 2024-04-30 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：50-meric（50） 与全部聚合物一致 |
链 y
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 88 K POTASSIUM ION × 19 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 3 ACY ACETIC ACID × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9KKF Structure of the human 40S ribosome complexed with HCV IRES and eIF3 提交 2024-11-13 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 43 PDB 声明：45-meric（45） 与全部聚合物一致 |
链 3c
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9KN5 Structure of the human 40S ribosome complexed with HCV IRES, eIF1A and eIF3 提交 2024-11-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：46-meric（46） 与全部聚合物一致 |
链 3c
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9KN6 Structure of the HCV IRES-dependent pre-48S translation initiation complex with eIF1A, eIF5B, and eIF3 提交 2024-11-18 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric（48） 与全部聚合物一致 |
链 3c
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9KRP Structure of the HCV IRES-dependent 48S translation initiation complex with eIF5B and eIF3 提交 2024-11-28 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric（47） 与全部聚合物一致 |
链 3c
1–913（913 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 9 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9KZU Cryo-EM structure of the HCV IRES-dependently initiated CMV-stalled 80S ribosome (non-rotated state) in complexed with eIF3 提交 2024-12-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：92-meric（92） 与全部聚合物一致 |
链 3c
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 81 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9KZX Cryo-EM structure of the HCV IRES-dependently initiated CMV-stalled 80S ribosome (rotated state) in complexed with eIF3 提交 2024-12-11 | Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：93-meric（93） 与全部聚合物一致 |
链 3c
1–913（913 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 66 ZN ZINC ION × 7 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |