当前蛋白身份：Q9Y230
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2CQA Solution structure of RSGI RUH-039, a fragment of C-terminal domain of RuvB-like 2 from human cDNA 提交 2005-05-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
131–212（82 aa）
片段：C-terminal domain (Residues 132-213)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient
NMR样品组成
1.3mM RSGI RUH-039 U-15,13C; 20mM d-Tris-HCl; 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 10% D2O | 90% D2O, 10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2XSZ The dodecameric human RuvBL1:RuvBL2 complex with truncated domains II 提交 2010-10-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
2–133（132 aa）
链 D
238–463（226 aa）
链 E
2–133（132 aa）
链 E
238–463（226 aa）
链 F
2–133（132 aa）
链 F
238–463（226 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；CRYSTALLIZATION DROPS WERE MIXED FROM EQUAL VOLUMES OF PROTEIN SOLUTION (12 MG/ML, 20MM TRIS-HCL PH 8.0, 200MM NACL, 10% GLYCEROL, 4MM MGCL2, 4MM ADP, 0.5MM TCEP) AND CRYSTALLIZATION SOLUTION (0.2M MGCL2, 30% PEG 400, 0.1M HEPES PH 7.5).
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.205 |
| 3UK6 Crystal Structure of the Tip48 (Tip49b) hexamer 提交 2011-11-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 A
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 B
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 B
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 C
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 C
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 D
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 D
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 I
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 I
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 J
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 J
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCL, pH 8.0, 20% PEG 3000, 5% glucose, galactose or trehalose, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.264 |
| 3UK6 Crystal Structure of the Tip48 (Tip49b) hexamer 提交 2011-11-09 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 E
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 E
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 F
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 F
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 G
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 G
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 H
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 H
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 K
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 K
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 L
1–132（132 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
链 L
239–463（225 aa）
片段：UNP residues 1-132, 239-463
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；0.1M Tris-HCL, pH 8.0, 20% PEG 3000, 5% glucose, galactose or trehalose, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.264 |
| 5OAF Human Rvb1/Rvb2 heterohexamer in INO80 complex 提交 2017-06-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–463（463 aa）
链 D
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.06 Å |
| 6FO1 Human R2TP subcomplex containing 1 RUVBL1-RUVBL2 hexamer bound to 1 RBD domain from RPAP3. 提交 2018-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 6H7X First X-ray structure of full-length human RuvB-Like 2. 提交 2018-07-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–463（463 aa）
|
未记录 | MG MAGNESIUM ION × 18 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 42 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；303.15 K；PEG 3350, Magnesium Chloride
|
分辨率 2.89 Å R-free 0.237 |
| 6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric（19） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–463（463 aa）
链 D
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6IGM Cryo-EM Structure of Human SRCAP Complex 提交 2018-09-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 B
1–463（463 aa）
链 D
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6K0R Ruvbl1-Ruvbl2 with truncated domain II in complex with phosphorylated Cordycepin 提交 2019-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–133（133 aa）
链 D
238–463（226 aa）
链 E
1–133（133 aa）
链 E
238–463（226 aa）
链 F
1–133（133 aa）
链 F
238–463（226 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CUU [(2~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.5-7.6, 0.2 M MgCl2, 20-21 % PEG400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 6K0R Ruvbl1-Ruvbl2 with truncated domain II in complex with phosphorylated Cordycepin 提交 2019-05-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 J
1–133（133 aa）
链 J
238–463（226 aa）
链 K
1–133（133 aa）
链 K
238–463（226 aa）
链 L
1–133（133 aa）
链 L
238–463（226 aa）
|
未记录 | CUU [(2~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CU0 [(2~{R},3~{S},4~{S})-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.5-7.6, 0.2 M MgCl2, 20-21 % PEG400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 6QI8 Truncated human R2TP complex, structure 3 (ADP-filled) 提交 2019-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.75 Å |
| 6QI9 Truncated human R2TP complex, structure 4 (ADP-empty) 提交 2019-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.63 Å |
| 7AHO RUVBL1-RUVBL2 heterohexameric ring after binding of RNA helicase DHX34 提交 2020-09-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；50 mM Tris-HCl pH 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.18 Å |
| 7OLE Cryo-EM structure of the TELO2-TTI1-TTI2-RUVBL1-RUVBL2 complex 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 B
1–463（463 aa）
链 D
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；Solutions were made fresh for protein purification
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3sec
|
分辨率 3.41 Å |
| 7P6X Cryo-Em structure of the hexameric RUVBL1-RUVBL2 in complex with ZNHIT2 提交 2021-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 B
1–463（463 aa）
链 D
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8
|
分辨率 3.20 Å |
| 8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 H
1–463（463 aa）
链 J
1–463（463 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–463（463 aa）
链 P
1–463（463 aa）
链 R
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–463（463 aa）
链 P
1–463（463 aa）
链 R
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 N
1–463（463 aa）
链 P
1–463（463 aa）
链 R
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8XVG Structure of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 B
1–463（463 aa）
链 D
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.40 Å |
| 8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 B
1–463（463 aa）
链 D
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 B
1–463（463 aa）
链 D
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9C62 P400 subcomplex of the native human TIP60 complex 提交 2024-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 B
1–463（463 aa）
链 D
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.28 Å |
| 9CA7 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the fully-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–463（463 aa）
链 H
1–463（463 aa）
链 J
1–463（463 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9CA8 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the partially-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–463（463 aa）
链 H
1–463（463 aa）
链 J
1–463（463 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 9CA9 Cryo-EM structure of the human SRCAP complex in the unbound state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 F
1–463（463 aa）
链 H
1–463（463 aa）
链 J
1–463（463 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9CAA Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the pre-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–463（463 aa）
链 H
1–463（463 aa）
链 J
1–463（463 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.04 Å |
| 9CAB Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the encounter state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 F
1–463（463 aa）
链 H
1–463（463 aa）
链 J
1–463（463 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.94 Å |
| 9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13） 与蛋白数一致 |
链 F
1–463（463 aa）
链 H
1–463（463 aa）
链 J
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 F
1–463（463 aa）
链 H
1–463（463 aa）
链 J
1–463（463 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 9EMA RUVBL1/2 in complex with ATP and CB-6644 inhibitor 提交 2024-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 A1H5V 5-chloranyl-2-ethoxy-4-fluoranyl-~{N}-[4-[[3-(methoxymethyl)-1-oxidanylidene-6,7-dihydro-5~{H}-pyrazolo[1,2-a][1,2]benzodiazepin-2-yl]amino]-2,2-dimethyl-4-oxidanylidene-butyl]benzamide × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 9EMC RUVBL1/2 in complex with ATP 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric（18） 与全部聚合物一致 |
链 D
15–453（439 aa）
链 E
15–453（439 aa）
链 F
15–453（439 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 9HB4 Hexameric RuvBL1/RuvBL2 bound to SPAG1 C-ter 提交 2024-11-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM HEPES, 170 mM NaCL, 2mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9HPO Docedameric RuvBL1/RuvBL2 提交 2024-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 D
1–463（463 aa）
链 E
1–463（463 aa）
链 F
1–463（463 aa）
链 J
1–463（463 aa）
链 K
1–463（463 aa）
链 L
1–463（463 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM HEPES, 170 mM NaCL, 2mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |