当前蛋白身份：Q9Y265
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2C9O 3D Structure of the human RuvB-like helicase RuvBL1 提交 2005-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING THE VAPOR DIFFUSION METHOD (SITTING DROP). THE WELLS CONTAINED 500 MICROLITERS OF PRECIPITANT SOLUTION AND THE DROPS WERE COMPOSED OF 1.5 MICROLITERS OF PROTEIN SOLUTION (15 MG/ML) AND 1.5 MICROLITERS OF RESERVOIR SOLUTION. THE BEST CRYSTALS WERE OBTAINED FROM A SOLUTION CONTAINING 1.6 M SODIUM MALONATE PH 6 AT 293 K.
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.257 |
| 2C9O 3D Structure of the human RuvB-like helicase RuvBL1 提交 2005-12-14 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；293 K；PROTEIN WAS CRYSTALLISED USING THE VAPOR DIFFUSION METHOD (SITTING DROP). THE WELLS CONTAINED 500 MICROLITERS OF PRECIPITANT SOLUTION AND THE DROPS WERE COMPOSED OF 1.5 MICROLITERS OF PROTEIN SOLUTION (15 MG/ML) AND 1.5 MICROLITERS OF RESERVOIR SOLUTION. THE BEST CRYSTALS WERE OBTAINED FROM A SOLUTION CONTAINING 1.6 M SODIUM MALONATE PH 6 AT 293 K.
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.257 |
| 2XSZ The dodecameric human RuvBL1:RuvBL2 complex with truncated domains II 提交 2010-10-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–126（125 aa）
链 A
234–456（223 aa）
链 B
2–126（125 aa）
链 B
234–456（223 aa）
链 C
2–126（125 aa）
链 C
234–456（223 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；CRYSTALLIZATION DROPS WERE MIXED FROM EQUAL VOLUMES OF PROTEIN SOLUTION (12 MG/ML, 20MM TRIS-HCL PH 8.0, 200MM NACL, 10% GLYCEROL, 4MM MGCL2, 4MM ADP, 0.5MM TCEP) AND CRYSTALLIZATION SOLUTION (0.2M MGCL2, 30% PEG 400, 0.1M HEPES PH 7.5).
|
分辨率 3.00 Å R-free 0.205 |
| 5OAF Human Rvb1/Rvb2 heterohexamer in INO80 complex 提交 2017-06-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
链 E
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.06 Å |
| 6FO1 Human R2TP subcomplex containing 1 RUVBL1-RUVBL2 hexamer bound to 1 RBD domain from RPAP3. 提交 2018-02-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.57 Å |
| 6HTS Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to nucleosome 提交 2018-10-04 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：nonadecameric（19） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
链 E
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 6IGM Cryo-EM Structure of Human SRCAP Complex 提交 2018-09-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
链 E
1–456（456 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 6K0R Ruvbl1-Ruvbl2 with truncated domain II in complex with phosphorylated Cordycepin 提交 2019-05-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
2–126（125 aa）
链 A
234–456（223 aa）
链 B
2–126（125 aa）
链 B
234–456（223 aa）
链 C
2–126（125 aa）
链 C
234–456（223 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 CUU [(2~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.5-7.6, 0.2 M MgCl2, 20-21 % PEG400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 6K0R Ruvbl1-Ruvbl2 with truncated domain II in complex with phosphorylated Cordycepin 提交 2019-05-07 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 G
2–126（125 aa）
链 G
234–456（223 aa）
链 H
2–126（125 aa）
链 H
234–456（223 aa）
链 I
2–126（125 aa）
链 I
234–456（223 aa）
|
未记录 | CUU [(2~{S},4~{R},5~{R})-5-(6-aminopurin-9-yl)-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 CU0 [(2~{R},3~{S},4~{S})-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl phosphono hydrogen phosphate × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；0.1 M HEPES-Na pH 7.5-7.6, 0.2 M MgCl2, 20-21 % PEG400
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.269 |
| 6QI8 Truncated human R2TP complex, structure 3 (ADP-filled) 提交 2019-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.75 Å |
| 6QI9 Truncated human R2TP complex, structure 4 (ADP-empty) 提交 2019-01-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.63 Å |
| 7AHO RUVBL1-RUVBL2 heterohexameric ring after binding of RNA helicase DHX34 提交 2020-09-25 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；50 mM Tris-HCl pH 7.4, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.18 Å |
| 7OLE Cryo-EM structure of the TELO2-TTI1-TTI2-RUVBL1-RUVBL2 complex 提交 2021-05-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
链 E
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5；Solutions were made fresh for protein purification
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3sec
|
分辨率 3.41 Å |
| 7P6X Cryo-Em structure of the hexameric RUVBL1-RUVBL2 in complex with ZNHIT2 提交 2021-07-18 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 7ZI4 Cryo-EM structure of the human INO80 complex bound to a WT nucleosome 提交 2022-04-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：eicosameric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
链 E
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；4uL of sample applied to Quantifoil R2/2 Cu 300 mesh grids. blot parameters were wait time 30 sec, blot time 0.5 sec, blot force -8
|
分辨率 3.20 Å |
| 8QR1 Cryo-EM structure of the human Tip60 complex 提交 2023-10-06 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13） 与蛋白数一致 |
链 E
1–456（456 aa）
链 I
1–456（456 aa）
链 L
1–456（456 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 8X15 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the apo state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–456（456 aa）
链 O
1–456（456 aa）
链 Q
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X19 Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-BeFx-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–456（456 aa）
链 O
1–456（456 aa）
链 Q
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8X1C Structure of nucleosome-bound SRCAP-C in the ADP-bound state 提交 2023-11-06 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric（25） 与全部聚合物一致 |
链 M
1–456（456 aa）
链 O
1–456（456 aa）
链 Q
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 8XVG Structure of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric（14） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
链 E
1–456（456 aa）
|
未记录 | IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.40 Å |
| 8XVT The core subcomplex of human NuA4/TIP60 complex 提交 2024-01-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
链 E
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.20 Å |
| 9C57 Reconstituted P400 Subcomplex of the human TIP60 complex 提交 2024-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric（13） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
链 E
1–456（456 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 9C62 P400 subcomplex of the native human TIP60 complex 提交 2024-06-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
链 E
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.28 Å |
| 9CA7 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the fully-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–456（456 aa）
链 G
1–456（456 aa）
链 I
1–456（456 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9CA8 Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the partially-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–456（456 aa）
链 G
1–456（456 aa）
链 I
1–456（456 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.92 Å |
| 9CA9 Cryo-EM structure of the human SRCAP complex in the unbound state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 E
1–456（456 aa）
链 G
1–456（456 aa）
链 I
1–456（456 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9CAA Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the pre-engaged state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–456（456 aa）
链 G
1–456（456 aa）
链 I
1–456（456 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 4 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.04 Å |
| 9CAB Cryo-EM structure of human SRCAP-nucleosome complex in the encounter state (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 E
1–456（456 aa）
链 G
1–456（456 aa）
链 I
1–456（456 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.94 Å |
| 9CAC Cryo-EM structure of the RuvBL lobe of the native human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric（13） 与蛋白数一致 |
链 E
1–456（456 aa）
链 G
1–456（456 aa）
链 I
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 MG MAGNESIUM ION × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9CAE Cryo-EM structure of the reconstituted RuvBL lobe of the human TIP60 complex (composite structure) 提交 2024-06-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 E
1–456（456 aa）
链 G
1–456（456 aa）
链 I
1–456（456 aa）
|
未记录 | AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 MG MAGNESIUM ION × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.07 Å |
| 9EMA RUVBL1/2 in complex with ATP and CB-6644 inhibitor 提交 2024-03-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 A1H5V 5-chloranyl-2-ethoxy-4-fluoranyl-~{N}-[4-[[3-(methoxymethyl)-1-oxidanylidene-6,7-dihydro-5~{H}-pyrazolo[1,2-a][1,2]benzodiazepin-2-yl]amino]-2,2-dimethyl-4-oxidanylidene-butyl]benzamide × 3 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 2.40 Å |
| 9EMC RUVBL1/2 in complex with ATP 提交 2024-03-11 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 3.26 Å |
| 9GCG CryoEM structure of the human INO80 core- H2A.Z nucleosome complex 提交 2024-08-01 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.43 Å |
| 9GE5 CryoEM structure of the human INO80-Hexasome complex 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：18-meric（18） 与全部聚合物一致 |
链 A
2–454（453 aa）
链 B
2–454（453 aa）
链 C
2–454（453 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 7 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.35 Å |
| 9GEV CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-6 提交 2024-08-07 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.47 Å |
| 9GFB CryoEM structure of the human INO80 core-nucleosome complex state N-7 提交 2024-08-08 | Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：20-meric（20） 与全部聚合物一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.55 Å |
| 9HB4 Hexameric RuvBL1/RuvBL2 bound to SPAG1 C-ter 提交 2024-11-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
1–456（456 aa）
链 B
1–456（456 aa）
链 C
1–456（456 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM HEPES, 170 mM NaCL, 2mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.56 Å |
| 9HPO Docedameric RuvBL1/RuvBL2 提交 2024-12-13 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–451（451 aa）
链 B
1–451（451 aa）
链 C
1–451（451 aa）
链 G
1–451（451 aa）
链 H
1–451（451 aa）
链 I
1–451（451 aa）
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 12 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；20 mM HEPES, 170 mM NaCL, 2mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.50 Å |