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11gj

Human Argonaute2 R315V/H316A - guide10U RNA in complex with a complementary target to position 19

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 97.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Argonaute2 R315V/H316A

Homo sapiens

UniProt Q9UKV8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 单体 蛋白 × 1 RNA 2 PDB 声明：trimeric（3） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–859 突变：R315V, H316A, S387D, S824A, S828D, S831D, S834A guide RNA (g10U) × 1 target RNA (t10A) × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.30 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 11GJ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
10BE Human AGO2 bound to a miR-20a guide and a position 10-11 mismatched target 提交 2026-01-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.02 Å
11GI Human Argonaute2 WT - guide(3 prime-amino) RNA in complex with a fully complementary target 提交 2026-02-23 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D, S824A, S828D, S831D, S834A MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
11GK Human Argonaute2 R315V/H316A - guide RNA in complex with a fully complementary target (conformation 2) 提交 2026-02-23 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：R315V, H316A, S387D, S824A, S828D, S831D, S834A MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
3LUC Crystal structure of MID domain from hAGO2 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.69 Å R-free 0.209
3LUC Crystal structure of MID domain from hAGO2 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.69 Å R-free 0.209
3LUC Crystal structure of MID domain from hAGO2 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.69 Å R-free 0.209
3LUD Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with AMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.223
3LUD Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with AMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.223
3LUD Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with AMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.223
3LUG Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with CMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 C5P CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.85 Å R-free 0.225
3LUG Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with CMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 C5P CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.85 Å R-free 0.225
3LUG Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with CMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 2 C5P CYTIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 1.85 Å R-free 0.225
3LUH Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with GMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.233
3LUH Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with GMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.233
3LUH Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with GMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.233
3LUJ Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with UMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
3LUJ Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with UMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
3LUJ Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with UMP 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–575（137 aa） 片段：MID domain
未记录 U5P URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.80 Å R-free 0.234
3LUK Crystal structure of MID domain from hAGO2 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–575（137 aa） 片段：MID domain
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PO4 PHOSPHATE ION × 2 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
3LUK Crystal structure of MID domain from hAGO2 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–575（137 aa） 片段：MID domain
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
3LUK Crystal structure of MID domain from hAGO2 提交 2010-02-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–575（137 aa） 片段：MID domain
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） PO4 PHOSPHATE ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4. Protein: 15 mg/mL, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 1.70 Å R-free 0.232
3QX8 Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with m7GpppG 提交 2011-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–575（137 aa） 片段：unp residues 439-575
未记录 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
3QX8 Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with m7GpppG 提交 2011-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–575（137 aa） 片段：unp residues 439-575
未记录 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
3QX8 Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with m7GpppG 提交 2011-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–575（137 aa） 片段：unp residues 439-575
未记录 GTG 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-GUANOSINE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.30 Å R-free 0.279
3QX9 Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with ATP 提交 2011-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 439–575（137 aa） 片段：unp residues 439-575
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
3QX9 Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with ATP 提交 2011-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 439–575（137 aa） 片段：unp residues 439-575
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
3QX9 Crystal structure of MID domain from hAGO2 in complex with ATP 提交 2011-03-01 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 439–575（137 aa） 片段：unp residues 439-575
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；0.1 M imidazole, 0.2 M NaCl, 0.46 M NaH2PO4, 1.84 M K2HPO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.250
4F3T Human Argonaute-2 - miR-20a complex 提交 2012-05-09 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 IPH PHENOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；290 K；microseeding in 100 mM Tris pH=9.0, 10% PEG 3350 (w/v), 8% 2-propanol (v/v), 0.12 M phenol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
分辨率 2.25 Å R-free 0.254
4OLA Crystal Structure of Human Argonaute2 提交 2014-01-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D IPH PHENOL × 1 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；16% PEG3350, 12% isopropanol, 0.1 M phenol, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.0K
分辨率 2.30 Å R-free 0.253
4OLB Crystal Structure of Human Argonaute2 Bound to Tryptophan 提交 2014-01-23 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D TRP TRYPTOPHAN × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；16% PEG3350, 12% isopropanol, saturated L-tryptophan, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.249
4W5N The Crystal Structure of Human Argonaute2 Bound to a Defined Guide RNA 提交 2014-08-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D IPH PHENOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG, Tris, Isopropanol, Phenol, Magnesium
分辨率 2.90 Å R-free 0.253
4W5O The Crystal Structure of Human Argonaute2 Bound to a Guide and Target RNA Containing Seed Pairing from 2-9 提交 2014-08-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 IPH PHENOL × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG 3350, Tris, Isopropanol, Phenol, Magnesium
分辨率 1.80 Å R-free 0.197
4W5Q The Crystal Structure of Human Argonaute2 Bound to a Guide and Target RNA Containing Seed Pairing from 2-8 提交 2014-08-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D MG MAGNESIUM ION × 3 IPH PHENOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；PEG 3350, Isopropanol, Phenol, Tris, Magnesium
分辨率 3.10 Å R-free 0.233
4W5R The Crystal Structure of Human Argonaute2 Bound to a Guide and Target RNA Containing Seed Pairing from 2-8 (Long Target) 提交 2014-08-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 IPH PHENOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Isopropanol, Tris, Phenol, Magnesium
分辨率 2.50 Å R-free 0.234
4W5T The Crystal Structure of Human Argonaute2 Bound to a Guide and Target RNA Containing Seed Pairing from 2-7 提交 2014-08-18 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D MG MAGNESIUM ION × 2 IPH PHENOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Isopropanol, Phenol, Tris, Magnesium
分辨率 2.50 Å R-free 0.215
4Z4C Human Argonaute2 Bound to t1-C Target RNA 提交 2015-04-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D MG MAGNESIUM ION × 3 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 1 IPH PHENOL × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Tris, Isopropanol, Phenol, Magnesium
分辨率 2.30 Å R-free 0.219
4Z4D Human Argonaute2 Bound to t1-G Target RNA 提交 2015-04-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D MG MAGNESIUM ION × 3 IPH PHENOL × 4 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Tris, Isopropanol, Phenol, Magnesium
分辨率 1.60 Å R-free 0.189
4Z4E Human Argonaute2 Bound to t1-U Target RNA 提交 2015-04-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D MG MAGNESIUM ION × 3 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 IPH PHENOL × 4 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Tris, Isopropanol, Phenol, Magnesium
分辨率 1.80 Å R-free 0.185
4Z4F Human Argonaute2 Bound to t1-DAP Target RNA 提交 2015-04-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D MG MAGNESIUM ION × 3 IPH PHENOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Tris, Isopropanol, Phenol, Magnesium
分辨率 2.80 Å R-free 0.233
4Z4G Human Argonaute2 Bound to t1-Inosine Target RNA 提交 2015-04-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D MG MAGNESIUM ION × 3 IPH PHENOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Tris, Isopropanol, Phenol, Magnesium
分辨率 2.70 Å R-free 0.224
4Z4H Human Argonaute2 A481T Mutant Bound to t1-A Target RNA 提交 2015-04-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D A481T MG MAGNESIUM ION × 3 IPH PHENOL × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Tris, Isopropanol, Phenol, Magnesium
分辨率 2.50 Å R-free 0.211
4Z4I Human Argonaute2 A481T Mutant Bound to t1-G Target RNA 提交 2015-04-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D A481T MG MAGNESIUM ION × 3 IPH PHENOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；PEG 3350, Tris, Isopropanol, Phenol, Magnesium
分辨率 2.80 Å R-free 0.233
5JS1 Human Argonaute2 Bound to an siRNA 提交 2016-05-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D IPH PHENOL × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；16% PEG 3350, 50mM Phenol, 10% Isopropanol, 5mM Magnesium Chloride, 100mM Tris
分辨率 2.50 Å R-free 0.247
5JS2 Human Argonaute-2 Bound to a Modified siRNA 提交 2016-05-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D IPH PHENOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；12% PEG 3350, 75mM Phenol, 12% Isopropanol, 100mM Tris
分辨率 2.95 Å R-free 0.261
5KI6 Human Argonaute-2 bound to a guide RNA with a nucleobase modification at position 1 提交 2016-06-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 IPH PHENOL × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；293 K；PEG 3350, Phenol, Tris, Spermine, Isopropanol
分辨率 2.15 Å R-free 0.270
5T7B Argonaute-2 - 5'-(E)-vinylphosphonate 2'-O-methyl-uridine modified mrTTR guide RNA complex 提交 2016-09-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 IPH PHENOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；290 K；100 mM Tris pH=9.0, 10% PEG 3350 (w/v), 8% 2-propanol (v/v), 0.12 M phenol
分辨率 2.53 Å R-free 0.238
5WEA Human Argonaute2 Helix-7 Mutant 提交 2017-07-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：M364A, I365A, S387D IPH PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；12% PEG 3350, 0.1 M phenol, 12% isopropanol, 0.1 M tris, pH 9.0
分辨率 3.12 Å R-free 0.282
6CBD Crystal Structure of Human Argonaute2 Bound to Three Tryptophans 提交 2018-02-02 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D TRP TRYPTOPHAN × 3 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；293 K；14% PEG 3350, 0.1 M Tris pH 8.2, 12% Isopropanol, 10 mM MgCl2, L-tryptophan to saturation
分辨率 2.20 Å R-free 0.215
6MDZ Human Argonaute2-miR-122 bound to a target RNA with two central mismatches (bu2) 提交 2018-09-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D, D669A, D824A, S828D, S831D, S834A IPH PHENOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；10% PEG3350, 50mM Tris pH8, 20mM MgCl2, 75mM Phenol
分辨率 3.40 Å R-free 0.264
6MDZ Human Argonaute2-miR-122 bound to a target RNA with two central mismatches (bu2) 提交 2018-09-05 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–859（859 aa）
突变：S387D, D669A, D824A, S828D, S831D, S834A IPH PHENOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；10% PEG3350, 50mM Tris pH8, 20mM MgCl2, 75mM Phenol
分辨率 3.40 Å R-free 0.264
6MFN Human Argonaute2-miR-27a bound to HSUR1 target RNA 提交 2018-09-11 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：D669A, S387D, S824A, S828D, S831D, S834A IPH PHENOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；10% PEG3350, 50 mM Tris, pH 8.0, 20 mM magnesium chloride, 75 mM phenol
分辨率 2.50 Å R-free 0.247
6MFR Human Argonaute2-miR-122 bound to a target RNA with three central mismatches (bu3) 提交 2018-09-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：D669A, S387D, S824A, S828D, s831D, S834A IPH PHENOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；10% PEG3350, 50mM Tris pH8, 20mM MgCl2, 75mM Phenol
分辨率 3.60 Å R-free 0.283
6MFR Human Argonaute2-miR-122 bound to a target RNA with three central mismatches (bu3) 提交 2018-09-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–859（859 aa）
突变：D669A, S387D, S824A, S828D, s831D, S834A IPH PHENOL × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；10% PEG3350, 50mM Tris pH8, 20mM MgCl2, 75mM Phenol
分辨率 3.60 Å R-free 0.283
6N4O Human Argonaute2-miR-122 bound to a seed and supplementary paired target 提交 2018-11-19 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：D669A, S387D, S824A, S828D, S831D, S834A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；26% MPD, 5% PEG 3350, 50 mM imidazole pH 8
分辨率 2.90 Å R-free 0.257
6NIT Human Argonaute2-miR-122 bound to a target RNA with four central mismatches (bu4) 提交 2018-12-31 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：D669A, S387D, S824A, S828D, S831D, S834A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；10% PEG3350, 50mM Tris pH8, 20mM MgCl2, 75mM Phenol
分辨率 3.80 Å R-free 0.294
6NIT Human Argonaute2-miR-122 bound to a target RNA with four central mismatches (bu4) 提交 2018-12-31 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 B 1–859（859 aa）
突变：D669A, S387D, S824A, S828D, S831D, S834A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；10% PEG3350, 50mM Tris pH8, 20mM MgCl2, 75mM Phenol
分辨率 3.80 Å R-free 0.294
6RA4 Human ARGONAUTE-2 PAZ DOMAIN (214-347) IN COMPLEX WITH CGUGACUCU 提交 2019-04-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 222–355（134 aa）
链 B 222–355（134 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.6；292 K；Drop was a 1:1 mix of protein stock (9.4MG/ML HAGO2 PAZ [214 TO 347] IN 100MM POTASSIUM CHLORIDE, 10MM DTT, 5MM HEPES/KOH PH 7.6, WITH A 1.1-FOLD EXCESS OF OLIGONUCLEOTIDE ADDED FROM A 1.75MM STOCK SOLUTION IN 100MM POTASSIUM CHLORIDE, 10MM DTT, 5MM HEPES) and reservoir solution (0.2M sodium CHLORIDE 20% PEG 3,350)
分辨率 1.90 Å R-free 0.268
7C6B Crystal structure of Ago2 MID domain in complex with 6-(3-(2-carboxyethyl)phenyl)purine riboside monophosphate 提交 2020-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 440–578（139 aa）
未记录 K2R 3-[3-[9-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-bis(oxidanyl)-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]phenyl]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277.15 K；0.1M imidazole pH8.0, 0.2M NaCl, 0.46M NaH2PO4, 1.84M K2HPO4
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
7C6B Crystal structure of Ago2 MID domain in complex with 6-(3-(2-carboxyethyl)phenyl)purine riboside monophosphate 提交 2020-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 440–578（139 aa）
未记录 K2R 3-[3-[9-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-bis(oxidanyl)-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]phenyl]propanoic acid × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277.15 K；0.1M imidazole pH8.0, 0.2M NaCl, 0.46M NaH2PO4, 1.84M K2HPO4
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
7C6B Crystal structure of Ago2 MID domain in complex with 6-(3-(2-carboxyethyl)phenyl)purine riboside monophosphate 提交 2020-05-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 440–578（139 aa）
未记录 K2R 3-[3-[9-[(2R,3R,4S,5R)-3,4-bis(oxidanyl)-5-(phosphonooxymethyl)oxolan-2-yl]purin-6-yl]phenyl]propanoic acid × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277.15 K；0.1M imidazole pH8.0, 0.2M NaCl, 0.46M NaH2PO4, 1.84M K2HPO4
分辨率 1.70 Å R-free 0.229
7D7U Crystal structure of Ago2 MID domain in complex with 8-Br-adenosin-5'-monophosphate 提交 2020-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 440–578（139 aa） 片段：MID domain
未记录 8BR 8-BROMO-ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277.15 K；0.1M imidazole pH8.0, 0.2M NaCl, 0.46M NaH2PO4, 1.84M K2HPO4
分辨率 2.00 Å R-free 0.247
7D7U Crystal structure of Ago2 MID domain in complex with 8-Br-adenosin-5'-monophosphate 提交 2020-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 440–578（139 aa） 片段：MID domain
未记录 8BR 8-BROMO-ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277.15 K；0.1M imidazole pH8.0, 0.2M NaCl, 0.46M NaH2PO4, 1.84M K2HPO4
分辨率 2.00 Å R-free 0.247
7D7U Crystal structure of Ago2 MID domain in complex with 8-Br-adenosin-5'-monophosphate 提交 2020-10-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 440–578（139 aa） 片段：MID domain
未记录 8BR 8-BROMO-ADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277.15 K；0.1M imidazole pH8.0, 0.2M NaCl, 0.46M NaH2PO4, 1.84M K2HPO4
分辨率 2.00 Å R-free 0.247
7KI3 Human Argonaute2:miR-122 bound to the HCV genotype 1a site-1 RNA 提交 2020-10-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D, S824A, S828D, S831D, S834A BA BARIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG8000, barium chloride, Tris-HCl
分辨率 3.00 Å R-free 0.276
7KI3 Human Argonaute2:miR-122 bound to the HCV genotype 1a site-1 RNA 提交 2020-10-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 D 1–859（859 aa）
突变：S387D, S824A, S828D, S831D, S834A BA BARIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG8000, barium chloride, Tris-HCl
分辨率 3.00 Å R-free 0.276
8D6J Human Ago2 bound to miR122(21nt) with PIWI loop swapped to AtAgo10 sequence 提交 2022-06-06 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Tris 8, 0.01 MgCl2, 0.1M Phenol,15% PEG 3350, 10% Isoproponal.
分辨率 2.50 Å R-free 0.284
8D71 Human Ago2 bound to miR122(21nt) 提交 2022-06-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；0.1M Tris 8, 0.01 MgCl2, 0.1M Phenol,15% PEG 3350, 10% Isoproponal
分辨率 2.50 Å R-free 0.280
8THQ Nonamer RNA bound to hAgo2-PAZ 提交 2023-07-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 227–352（126 aa） 片段：PAZ domain
链 B 227–352（126 aa） 片段：PAZ domain
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；291 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 30% v/v Jeffamine ED-2001
分辨率 2.41 Å R-free 0.284
9BEZ MID domain of human Argo2 bound to RNA 提交 2024-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 440–575（136 aa）
链 B 440–575（136 aa）
链 C 440–575（136 aa）
未记录 A1ANT [(3~{S},4~{R},5~{R})-5-[5-methyl-2,4-bis(oxidanylidene)pyrimidin-1-yl]-4-oxidanyl-oxolan-3-yl] [oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl] hydrogen phosphate × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；Drops were equal volumes of 15 mg/ml protein and 2.1M DL-Malic acid. The reservoir was 2.1M DL-Malic acid. Using MRC drop plates.
分辨率 1.90 Å R-free 0.288
9BF0 MID domain of human Argo2 bound to UTP 提交 2024-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 442–575（134 aa）
链 B 442–575（134 aa）
链 C 442–575（134 aa）
未记录 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；drop was 1:1 15 mg/ml protein with RNA: 1.4 M Sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1 M HEPES pH 7.5
分辨率 1.78 Å R-free 0.234
9BF2 MID domain of Ago2 bound to UMP 提交 2024-04-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 440–575（136 aa）
链 B 440–575（136 aa）
链 C 440–575（136 aa）
未记录 U URIDINE-5'-MONOPHOSPHATE × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291.15 K；Drop was 1:1 15 mg/ml MID-UMP and 1.4M sodium citrate tribasic dihydrate, 0.1M HEPES pH7.5
分辨率 1.59 Å R-free 0.187
9CMP Structure of human Argonaute2-guide-target complex in a fully paired, slicing-competent conformation 提交 2024-07-15 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 2–859（858 aa）
突变：D669A MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9DHX human Argonaute2 R315V/H316A - guide RNA in complex with a fully complementary target 提交 2024-09-04 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：R315V, H316A, S387D, S824A, S828D, S831D, S834A MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9K6P Cryo-EM Structure of hAGO2D669A-siRNA-target (12-nt) 提交 2024-10-22 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：D669A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9K6Q "Cryo-EM Structure of hAGO2D669A-siRNA-target (14-nt, sesqui-lobed) 提交 2024-10-22 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：D669A MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9K6R Cryo-EM Structure of hAGO2D669A-siRNA-target (14-nt, uni-lobed) 提交 2024-10-22 构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 20–859（840 aa）
突变：D669A MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9K6S Cryo-EM Structure of hAGO2D669A-siRNA-target (19-nt) 提交 2024-10-22 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：D669A MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9K6T Cryo-EM Structure of hAGO2D669A-siRNA-target (21-nt) 提交 2024-10-22 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9LMZ hAGO2-MID in complex with a chemical modified uridine monophosphate 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 440–574（135 aa）
未记录 A1EY1 [(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)thieno[2,3-d]pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.25M Ammonium sulfate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 1.80 Å R-free 0.206
9LMZ hAGO2-MID in complex with a chemical modified uridine monophosphate 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 440–574（135 aa）
未记录 A1EY1 [(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)thieno[2,3-d]pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 ECC (4S)-4-amino-5-hydroxypentanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.25M Ammonium sulfate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 1.80 Å R-free 0.206
9LMZ hAGO2-MID in complex with a chemical modified uridine monophosphate 提交 2025-01-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 440–574（135 aa）
未记录 A1EY1 [(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)thieno[2,3-d]pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.25M Ammonium sulfate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 1.80 Å R-free 0.206
9LSN hAGO2-MID in complex with a chemical modified uridine monophosphate 提交 2025-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 440–574（135 aa）
未记录 A1EL7 [(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)thieno[3,2-d]pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.25M Ammonium sulfate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 1.75 Å R-free 0.218
9LSN hAGO2-MID in complex with a chemical modified uridine monophosphate 提交 2025-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 440–574（135 aa）
未记录 A1EL7 [(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)thieno[3,2-d]pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.25M Ammonium sulfate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 1.75 Å R-free 0.218
9LSN hAGO2-MID in complex with a chemical modified uridine monophosphate 提交 2025-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 440–574（135 aa）
未记录 A1EL7 [(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)thieno[3,2-d]pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.25M Ammonium sulfate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 1.75 Å R-free 0.218
9LSO hAGO2-MID in complex with a chemical modified uridine monophosphate 提交 2025-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 440–574（135 aa）
未记录 A1EL8 [(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)thieno[3,4-d]pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.25M Ammonium sulfate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 2.13 Å R-free 0.241
9LSO hAGO2-MID in complex with a chemical modified uridine monophosphate 提交 2025-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 440–574（135 aa）
未记录 A1EL8 [(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)thieno[3,4-d]pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.25M Ammonium sulfate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 2.13 Å R-free 0.241
9LSO hAGO2-MID in complex with a chemical modified uridine monophosphate 提交 2025-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 440–574（135 aa）
未记录 A1EL8 [(2R,3S,4R,5R)-5-[2,4-bis(oxidanylidene)thieno[3,4-d]pyrimidin-1-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl dihydrogen phosphate × 1 ECC (4S)-4-amino-5-hydroxypentanamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；290 K；0.25M Ammonium sulfate 0.1M Sodium cacodylate trihydrate pH 6.5 30% w/v Polyethylene glycol 8,000
分辨率 2.13 Å R-free 0.241
9OBD Crystal structure of human Argonaute2 in complex with a fully modified siRNA with a 5'-phenylpropargyl phosphate 提交 2025-04-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
突变：S387D S824A S828D S831D S834A MG MAGNESIUM ION × 1 IPH PHENOL × 3 IPA ISOPROPYL ALCOHOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, Tris-HCl pH8, 2-propanol, phenol
分辨率 2.02 Å R-free 0.267
9OBE Crystal structure of human Argonaute2 in complex with a fully modified siRNA with a 5'-phenylpropyl phosphate 提交 2025-04-22 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 IPH PHENOL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；PEG3350, Tris-HCl pH8, 2-propanol, phenol
分辨率 2.30 Å R-free 0.252
9RWZ ZSWIM8-CUL3 complex bound to AGO2-miR-7-CYRANO 提交 2025-07-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 A 2–859（858 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；25 mM HEPES, 50 mM NaCl, 1 mM TCEP, pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9W5I AGO maturation complex (AMC): AGO2-miRNA duplex in complex with Hsp90 beta and co-chaperone p23 提交 2025-08-01 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 D 1–859（859 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.63 Å
9YM9 Structure of AGO2 primary RISC (pri-RISC) 提交 2025-10-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.79 Å
9YMA Structure of AGO2 vise-RISC 提交 2025-10-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.87 Å
9YMB Structure of AGO2 wedging RISC (wedg-RISC) 提交 2025-10-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.77 Å
9YMC Structure of AGO2 passenger-ejecting RISC (ej-RISC) 提交 2025-10-09 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.28 Å
9YMD Structure of AGO2 mature RISC (mat-RISC) 提交 2025-10-09 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–859（859 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.45 Å

共 66 个其他 PDB 条目、96 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AGO2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–859； UniProt 1–859

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 11gj

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 11gj
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id11gj
沉积日期 deposition_date2026-02-23
结构标题 titleHuman Argonaute2 R315V/H316A - guide10U RNA in complex with a complementary target to position 19
关键词 keywordsRNA binding protein, RNP, RNA, Argonaute2, Ago2, RNA BINDING PROTEIN-RNA complex; RNA BINDING PROTEIN/RNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier28.33 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron28.40 Å
零角强度 I(0) i0147979000.00
分子量 molecular_weight87751.0 kDa
排除体积 excluded_volume106050 ų
包络体积 envelope_volume134570 ų
水化壳体积 shell_volume39267 ų
包络直径 envelope_diameter102.4 Å
壳层 Rg shell_rg36.00 Å
包络 Rg envelope_rg28.58 Å
形状 Rg shape_rg28.40 Å
总 Rg total_rg29.03 Å
总原子数 total_atoms6116
残基数 n_residues700
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax97.1 Å
Rg (实空间) rg_real28.36 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.84 Å
I(0) (实空间) i0_real1.4800e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error2.4410e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal28.35 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal148000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8571
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary34.7 Å
偏度 Skewness skewness0.473
峰度 Kurtosis kurtosis-0.003
角度范围 angular_range— – 0.2800 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha39030000.0000
实空间数据点数 n_real_points57
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.727; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.985; Smooth: 0.974
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)