1b9x

STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 88.4 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (TRANSDUCIN)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–340	片段：LYS-C RESISTANT FRAGMENT, THE BETA SUBUNIT	PROTEIN (TRANSDUCIN) × 1 （P02698） PROTEIN (PHOSDUCIN) × 1 （P20942） GD GADOLINIUM ATOM × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 1B9X	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B9Y STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN BETA-GAMMA 提交 1999-02-16	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–340（340 aa）片段：LYS-C RESISTANT FRAGMENT, THE BETA SUBUNIT	未记录	GD GADOLINIUM ATOM × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.266
1GG2 G PROTEIN HETEROTRIMER MUTANT GI_ALPHA_1(G203A) BETA_1 GAMMA_2 WITH GDP BOUND 提交 1996-11-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–339（339 aa）片段：BETA 1	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.40 Å R-free 0.289
1GOT HETEROTRIMERIC COMPLEX OF A GT-ALPHA/GI-ALPHA CHIMERA AND THE GT-BETA-GAMMA SUBUNITS 提交 1996-08-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；10 MG/ML OF HETEROTRIMERIC COMPLEX WERE MIXED 1:1 WITH WELL SOLUTION CONTAINING 10% PEG-8000, 50 MM TRIS, PH 8.0, 10% GLYCEROL, 50 MM NACL, .1 MM MERCAPTOETHANOL. MIXTURE EQUILIBRATED VS WELL SOLUTION IN HANGING DROPS AT 4 DEGREES C., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.295
1GP2 G PROTEIN HETEROTRIMER GI_ALPHA_1 BETA_1 GAMMA_2 WITH GDP BOUND 提交 1996-11-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–339（339 aa）片段：BETA 1	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0	分辨率 2.30 Å R-free 0.307
1OMW Crystal Structure of the complex between G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 and Heterotrimeric G Protein beta 1 and gamma 2 subunits 提交 2003-02-26	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；277 K；PEG 3350, Sodium Chloride, CHAPS, ATP, Magnesium Chloride, Mastoparan , MES pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.50 Å R-free 0.252
1XHM The Crystal Structure of a Biologically Active Peptide (SIGK) Bound to a G Protein Beta:Gamma Heterodimer 提交 2004-09-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 4000, GLYCEROL, HEPES, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.70 Å R-free 0.287
24XZ P2Y14R-Gi complex bound to UDP 提交 2026-03-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.93 Å
2BCJ Crystal Structure of G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 in Complex with Galpha-q and Gbetagamma Subunits 提交 2005-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–340（339 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；9% PEG8000, 1M NaCl, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.06 Å R-free 0.292
2TRC PHOSDUCIN/TRANSDUCIN BETA-GAMMA COMPLEX 提交 1997-01-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）片段：LYS-C RESISTANT FRAGMENT, THE GAMMA SUBUNIT CLEAVED AFTER RESIDUE 68	未记录	GD GADOLINIUM ATOM × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；THE PROTEIN COMPLEX (10 MG/ML SOLUTION) WAS CRYSTALLIZED FROM 50 MM SODIUM CITRATE (PH 5.0), 150 MM MAGNESIUM ACETATE, 9.5% PEG 8000, BY HANGING DROP METHOD AT 4 DEGREES C., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.40 Å R-free 0.277
3AH8 Structure of heterotrimeric G protein Galpha-q beta gamma in complex with an inhibitor YM-254890 提交 2010-04-20	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.1；293 K；7% PEG 4000, 30% (v/v) glycerol, 70 mM acetate-NaOH, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K	分辨率 2.90 Å R-free 0.315
3CIK Human GRK2 in Complex with Gbetagamma subunits 提交 2008-03-11	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；277 K；200 mM NaCl, 5% ethylene glycol, 6.3% PEG 3350, pH 5.25, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP	分辨率 2.75 Å R-free 0.269
3KRW Human GRK2 in complex with Gbetgamma subunits and balanol (soak) 提交 2009-11-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	BA1 BALANOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 277 K；Well contained 100 mM MES, pH 5.6, 200 mM NaCl, 9% PEG 3350. Drops were 1 uL protein, 1 uL well, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.90 Å R-free 0.265
3KRX Human GRK2 in complex with Gbetgamma subunits and balanol (co-crystal) 提交 2009-11-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	BA1 BALANOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 277 K；Well contained 100 mM MES, pH 6.0, 200 mM NaCl, 9% PEG 3350. Drops were 1 uL protein, 1 uL well, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.10 Å R-free 0.270
3PSC Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits 提交 2010-12-01	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；9% PEG3350, 200 mM NaCl, 100 mM MES pH 6.5, 1 mM ATP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.67 Å R-free 0.257
3PVU Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and a selective kinase inhibitor (CMPD101) 提交 2010-12-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	QRW 3-({[4-methyl-5-(pyridin-4-yl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]methyl}amino)-N-[2-(trifluoromethyl)benzyl]benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；277 K；7% PEG3350, 200 mM NaCl, 100 mM MES pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.48 Å R-free 0.274
3PVW Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and a selective kinase inhibitor (CMPD103A) 提交 2010-12-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	QRX N-(2,6-difluorobenzyl)-3-({[4-propyl-5-(pyrimidin-4-yl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]methyl}amino)benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；277 K；7% PEG3350, 250 mM NaCl, 100 mM MES pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.49 Å R-free 0.285
3UZS Structure of the C13.28 RNA Aptamer Bound to the G Protein-Coupled Receptor Kinase 2-Heterotrimeric G Protein Beta 1 and Gamma 2 Subunit Complex 提交 2011-12-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris pH 8.5, 200 mM NaCl and 3% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 4.52 Å R-free 0.268
3V5W Human G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 in Complex with Soluble Gbetagamma Subunits and Paroxetine 提交 2011-12-17	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	8PR Paroxetine × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；100 mM MES pH 5.8, 200 mM NaCl, and 8% (w/v) PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.07 Å R-free 0.247
4MK0 Crystal structure of G protein-coupled receptor kinase 2 in complex with a a rationally designed paroxetine derivative 提交 2013-09-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 1 29X 5-{[(3S,4R)-4-(4-fluorophenyl)piperidin-3-yl]methoxy}-1H-isoindol-1-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；277 K；6% PEG 3350, 1M NaCl, 2 mM MgCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 2.40 Å R-free 0.238
5KDO Heterotrimeric complex of the 4 alanine insertion variant of the Gi alpha1 subunit and the Gbeta1-Ggamma1 提交 2016-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；19-24 % PEG 8000, 1-5% 2-propanolol, 1% OG, 100 mM HEPES (pH 7.0) and 100 mM NaOAc (pH 6.4)	分辨率 1.90 Å R-free 0.208
5WG3 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG258748 提交 2017-07-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	AFM 2-fluoro-5-[(3S,4R)-3-{[(1H-indazol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-N-[(1H-pyrazol-3-yl)methyl]benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6, 1.1 M NaCl, 8% PEG3350	分辨率 2.90 Å R-free 0.248
5WG4 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG257284 提交 2017-07-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	AFV 2-fluoro-5-[(3S,4R)-3-{[(1H-indazol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-N-[(pyridin-2-yl)methyl]benzamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6, 6% PEG 3350, 1 M NaCl	分辨率 2.31 Å R-free 0.279
5WG5 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG224061 提交 2017-07-13	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	ZSO 5-{[(3S,4R)-4-(4-fluorophenyl)piperidin-3-yl]methoxy}-2H-indazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6, 8-15% PEG3350, 0.8-1.2 M NaCl	分辨率 3.10 Å R-free 0.232
6B20 Crystal structure of a complex between G protein beta gamma dimer and an inhibitory Nanobody regulator 提交 2017-09-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 3–340（338 aa）	突变：V71L	UNX UNKNOWN LIGAND × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277.15 K；25-30% (w/v) PEG 3350 in 0.1-0.2 M Bis-Tris-HCl, pH 5.5-5.7, and 0.2-0.3 M MgCl2	分辨率 2.34 Å R-free 0.249
6B20 Crystal structure of a complex between G protein beta gamma dimer and an inhibitory Nanobody regulator 提交 2017-09-19	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 3–340（338 aa）	突变：V71L	UNX UNKNOWN LIGAND × 5 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277.15 K；25-30% (w/v) PEG 3350 in 0.1-0.2 M Bis-Tris-HCl, pH 5.5-5.7, and 0.2-0.3 M MgCl2	分辨率 2.34 Å R-free 0.249
6C2Y Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG257142 提交 2018-01-09	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	EJS (4R,5R,6S)-4-[4-fluoro-3-({[3-(methoxymethyl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl]methyl}carbamoyl)phenyl]-N-(2H-indazol-5-yl)-6-methyl-2-oxohexahydropyrimidine-5-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 800 mM NaCl, 8% PEG 3350	分辨率 2.74 Å R-free 0.292
6OY9 Structure of the Rhodopsin-Transducin Complex 提交 2019-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	RET RETINAL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6OYA Structure of the Rhodopsin-Transducin-Nanobody Complex 提交 2019-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	RET RETINAL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 1 second before plunging; avoid light as much as possible.	分辨率 3.30 Å
6PCV Single Particle Reconstruction of Phosphatidylinositol (3,4,5) trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 bound to G protein beta gamma subunits 提交 2019-06-18	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
6QNO Rhodopsin-Gi protein complex 提交 2019-02-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	RET RETINAL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The detergent lauryl-maltose neopentyl glycol (LMNG) was used before the last purification step by gel filtration. In the gel filtration, detergent-free buffer was used. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.38 Å
6U7C Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG258747 提交 2019-09-02	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	Q1Y 5-[(3S,4R)-3-{[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-2-fluoro-N-[(2H-indazol-3-yl)methyl]benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 1.1 M NaCl, 6% PEG 3350	分辨率 2.44 Å R-free 0.262
7BZ2 Cryo-EM structure of the formoterol-bound beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex. 提交 2020-04-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	H98 ~{N}-[5-[(1~{R})-2-[[(2~{R})-1-(4-methoxyphenyl)propan-2-yl]amino]-1-oxidanyl-ethyl]-2-oxidanyl-phenyl]methanamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.82 Å
7D68 Cryo-EM structure of the human glucagon-like peptide-2 receptor-Gs protein complex 提交 2020-09-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7DHI Cryo-EM structure of the partial agonist salbutamol-bound beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex. 提交 2020-11-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	68H SALBUTAMOL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.26 Å
7DHR Cryo-EM structure of the full agonist isoprenaline-bound beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex. 提交 2020-11-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	5FW ISOPRENALINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
7E14 Compound2_GLP-1R_OWL833_Gs complex structure 提交 2021-01-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	V6G 3-[(1S,2S)-1-(5-[(4S)-2,2-dimethyloxan-4-yl]-2-{(4S)-2-(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)-3-[3-(4-fluoro-1-methyl-1H-indazol-5-yl)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]-4-methyl-2,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carbonyl}-1H-indol-1-yl)-2-methylcyclopropyl]-1,2,4-oxadiazol-5(4H)-one × 1 CLR CHOLESTEROL × 5 HNO N-tert-butyl-6,7-bis(chloranyl)quinoxalin-2-amine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
7JJO Structural Basis of the Activation of Heterotrimeric Gs-protein by Isoproterenol-bound Beta1-Adrenergic Receptor 提交 2020-07-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	5FW ISOPRENALINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7O7F Structural basis of the activation of the CC chemokine receptor 5 by a chemokine agonist 提交 2021-04-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
7PWD Structure of an inhibited GRK2-G-beta and G-gamma complex 提交 2021-10-06	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	8DS 4-chloranyl-N-[2-(4-chlorophenyl)ethyl]thieno[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；ethylene glycol, PEG 3350, MES, NaCl	分辨率 2.60 Å R-free 0.230
7S0F Isoproterenol bound beta1 adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi protein 提交 2021-08-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	5FW ISOPRENALINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.96 Å
7S0G Isoproterenol bound beta1 adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi/s chimera protein 提交 2021-08-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	5FW ISOPRENALINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.86 Å
7SQO Structure of the orexin-2 receptor(OX2R) bound to TAK-925, Gi and scFv16 提交 2021-11-05	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	OLA OLEIC ACID × 4 A6F methyl (2R,3S)-3-[(methanesulfonyl)amino]-2-({[(1s,4S)-4-phenylcyclohexyl]oxy}methyl)piperidine-1-carboxylate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.17 Å
7TD0 Lysophosphatidic acid receptor 1-Gi complex bound to LPA 提交 2021-12-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.83 Å
7TD1 Lysophosphatidic acid receptor 1-Gi complex bound to LPA, state a 提交 2021-12-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
7TD2 Lysophosphatidic acid receptor 1-Gi complex bound to LPA, state a 提交 2021-12-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.11 Å
7TD3 Sphingosine-1-phosphate receptor 1-Gi complex bound to S1P 提交 2021-12-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
7TD4 Sphingosine-1-phosphate receptor 1-Gi complex bound to Siponimod 提交 2021-12-30	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 J8C 1-[[4-[(~{E})-~{N}-[[4-cyclohexyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]methoxy]-~{C}-methyl-carbonimidoyl]-2-ethyl-phenyl]methyl]azetidine-3-carboxylic acid × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7X1T Structure of Thyrotropin-Releasing Hormone Receptor bound with Taltirelin. 提交 2022-02-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.26 Å
7X1U Structure of Thyrotropin-Releasing Hormone Receptor bound with an Endogenous Peptide Agonist TRH. 提交 2022-02-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å
7XAT Structure of somatostatin receptor 2 bound with SST14. 提交 2022-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 2–340（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.85 Å
7XAU Structure of somatostatin receptor 2 bound with octreotide. 提交 2022-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 2–340（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.97 Å
7XAV Structure of somatostatin receptor 2 bound with lanreotide. 提交 2022-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 2–340（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.87 Å
7YJ4 Cryo-EM structure of the INSL5-bound human relaxin family peptidereceptor 4 (RXFP4)-Gi complex 提交 2022-07-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 T 2–340（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.19 Å
8DCR Cryo-EM structure of dobutamine-bound beta1-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gs-protein 提交 2022-06-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	Y00 DOBUTAMINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
8DCS Cryo-EM structure of cyanopindolol-bound beta1-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gs-protein 提交 2022-06-17	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	P32 Cyanopindolol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
8P12 Cryo-EM structure of Rhodopsin-Gi bound to antibody fragment Fab13 提交 2023-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
8P13 Cryo-EM structure of Rhodopsin-Gi bound with antibody fragments scFv16 and Fab79, conformation 1 提交 2023-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.20 Å
8P15 Cryo-EM structure of Rhodopsin-Gi bound with antibody fragments scFv16 and Fab79, conformation 2 提交 2023-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
8SOC Phosphoinositide phosphate 3 kinase gamma bound with ADP and Gbetagamma 提交 2023-04-28	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 1–340（340 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot force 2	分辨率 3.50 Å
8SOD Phosphoinositide phosphate 3 kinase gamma bound with ADP and two Gbetagamma subunits in State 1 提交 2023-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–340（340 aa）链 E 1–340（340 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot force 2	分辨率 3.40 Å
8SOE Phosphoinositide phosphate 3 kinase gamma bound with ADP and two Gbetagamma subunits in State 2 提交 2023-04-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 1–340（340 aa）链 E 1–340（340 aa）	未记录	ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot force 2	分辨率 3.60 Å
8YH0 A3R-Gi complex bound to NECA 提交 2024-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	NEC N-ETHYL-5'-CARBOXAMIDO ADENOSINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
8YH2 A3R-Gi complex bound to adenosine 提交 2024-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	ADN ADENOSINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.27 Å
8YH3 A3R-Gi complex bound to m6A 提交 2024-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	6MD N-methyladenosine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8YH5 A3R-Gi complex bound to i6A 提交 2024-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	ZIR N-(3-methylbut-2-en-1-yl)adenosine × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.66 Å
8YH6 A3R-Gi complex bound to namodenoson 提交 2024-02-27	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	XS0 namodenoson × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.62 Å
8YKD Cryo-EM structure of ADGRG2-Gs complex with NTF nanobody 提交 2024-03-04	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	AND 3-BETA-HYDROXY-5-ANDROSTEN-17-ONE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9CBL Cryo-EM structure of epinephrine-bound alpha-2A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi-protein 提交 2024-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	ALE L-EPINEPHRINE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9CBM Cryo-EM structure of dexmedetomidine-bound alpha-2A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi-protein 提交 2024-06-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	CZX 4-[(1~{S})-1-(2,3-dimethylphenyl)ethyl]-1~{H}-imidazole × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9EPR Cryo-EM Structure of Jumping Spider Rhodopsin-1 bound to a Gi heterotrimer 提交 2024-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 1–340（340 aa）	未记录	RET RETINAL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å
9Y7H Gb1g2 crosslinked to PLCb3 提交 2025-09-10	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 8–339（332 aa）	未记录	ME7 1,1'-ethane-1,2-diylbis(1H-pyrrole-2,5-dione) × 1 CA CALCIUM ION × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA and 0.1 mM EGTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
9YAO Gbg crosslinked to PLCb3 - second conformation 提交 2025-09-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 8–339（332 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA and 0.1 mM EGTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 7.00 Å
9YAP Gbg crosslinked to PLCb3 - second conformation 提交 2025-09-16	构建体不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 2–340（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA and 0.1 mM EGTA cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.50 Å

共 72 个其他 PDB 条目、73 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GBB1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–340； UniProt 1–340

PROTEIN (TRANSDUCIN)

物种未注明

UniProt P02698

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 1–67	片段：LYS-C RESISTANT FRAGMENT, THE GAMMA SUBUNIT CLEAVED AFTER RESIDUE 68	PROTEIN (TRANSDUCIN) × 1 （P62871） PROTEIN (PHOSDUCIN) × 1 （P20942） GD GADOLINIUM ATOM × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1B9X	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1A0R HETEROTRIMERIC COMPLEX OF PHOSDUCIN/TRANSDUCIN BETA-GAMMA 提交 1997-12-05	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–65（65 aa）	未记录	FAR FARNESYL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 MICROBATCH；pH 6.8；277 K；THE PROTEIN COMPLEX (10 MG/ML SOLUTION) WAS CRYSTALLIZED FROM 400 MM SODIUM CACODYLATE (PH 6.8), 1 MM ZINC CHLORIDE, 25 % ETHYLENE GLYCOL, 12 % PEG 8000, BY MICROBATCH CRYSTALLIZATION AT 4 DEGREES C., microbatch, temperature 277K	分辨率 2.80 Å R-free 0.264
1B9Y STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN BETA-GAMMA 提交 1999-02-16	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 1–67（67 aa）片段：LYS-C RESISTANT FRAGMENT, THE GAMMA SUBUNIT CLEAVED AFTER RESIDUE 68	未记录	GD GADOLINIUM ATOM × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.266
1GOT HETEROTRIMERIC COMPLEX OF A GT-ALPHA/GI-ALPHA CHIMERA AND THE GT-BETA-GAMMA SUBUNITS 提交 1996-08-07	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–65（65 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；10 MG/ML OF HETEROTRIMERIC COMPLEX WERE MIXED 1:1 WITH WELL SOLUTION CONTAINING 10% PEG-8000, 50 MM TRIS, PH 8.0, 10% GLYCEROL, 50 MM NACL, .1 MM MERCAPTOETHANOL. MIXTURE EQUILIBRATED VS WELL SOLUTION IN HANGING DROPS AT 4 DEGREES C., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.00 Å R-free 0.295
1MF6 Transducin gamma subunit, C-terminal domain 60-71, rhodopsin-bound state: Ensemble of 15 models determined by TrNOE spectroscopy 提交 2002-08-09	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 60–71（12 aa）片段：Residues 60-71	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；277 K NMR样品组成 0.1 mM Rhodopsin, 2 mM peptide DKNPFKELKGGC-farnesyl. \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
1TBG BETA-GAMMA DIMER OF THE HETEROTRIMERIC G-PROTEIN TRANSDUCIN 提交 1996-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 E 1–67（67 aa）片段：GAMMA-1 SUBUNIT 链 F 1–67（67 aa）片段：GAMMA-1 SUBUNIT 链 G 1–67（67 aa）片段：GAMMA-1 SUBUNIT 链 H 1–67（67 aa）片段：GAMMA-1 SUBUNIT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；15-20 MG/ML PROTEIN MIXED 1:1 WITH WELL SOLUTION (10MM FUMARATE, PH 4.2, 10MM MGSO4, 2MM GDCL3, 5% W/V GLYCEROL, 5% W/V PEG 4000, 15MM BETA-MERCAPTOETHANOL. MIXTURE EQUILIBRATED VS. WELL SOLUTION IN HANGING DROPS AT 4 DEGREES CELSIUS., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.306
1TBG BETA-GAMMA DIMER OF THE HETEROTRIMERIC G-PROTEIN TRANSDUCIN 提交 1996-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 1–67（67 aa）片段：GAMMA-1 SUBUNIT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；15-20 MG/ML PROTEIN MIXED 1:1 WITH WELL SOLUTION (10MM FUMARATE, PH 4.2, 10MM MGSO4, 2MM GDCL3, 5% W/V GLYCEROL, 5% W/V PEG 4000, 15MM BETA-MERCAPTOETHANOL. MIXTURE EQUILIBRATED VS. WELL SOLUTION IN HANGING DROPS AT 4 DEGREES CELSIUS., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.306
1TBG BETA-GAMMA DIMER OF THE HETEROTRIMERIC G-PROTEIN TRANSDUCIN 提交 1996-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 1–67（67 aa）片段：GAMMA-1 SUBUNIT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；15-20 MG/ML PROTEIN MIXED 1:1 WITH WELL SOLUTION (10MM FUMARATE, PH 4.2, 10MM MGSO4, 2MM GDCL3, 5% W/V GLYCEROL, 5% W/V PEG 4000, 15MM BETA-MERCAPTOETHANOL. MIXTURE EQUILIBRATED VS. WELL SOLUTION IN HANGING DROPS AT 4 DEGREES CELSIUS., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.306
1TBG BETA-GAMMA DIMER OF THE HETEROTRIMERIC G-PROTEIN TRANSDUCIN 提交 1996-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 1–67（67 aa）片段：GAMMA-1 SUBUNIT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；15-20 MG/ML PROTEIN MIXED 1:1 WITH WELL SOLUTION (10MM FUMARATE, PH 4.2, 10MM MGSO4, 2MM GDCL3, 5% W/V GLYCEROL, 5% W/V PEG 4000, 15MM BETA-MERCAPTOETHANOL. MIXTURE EQUILIBRATED VS. WELL SOLUTION IN HANGING DROPS AT 4 DEGREES CELSIUS., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.306
1TBG BETA-GAMMA DIMER OF THE HETEROTRIMERIC G-PROTEIN TRANSDUCIN 提交 1996-06-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 1–67（67 aa）片段：GAMMA-1 SUBUNIT	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；15-20 MG/ML PROTEIN MIXED 1:1 WITH WELL SOLUTION (10MM FUMARATE, PH 4.2, 10MM MGSO4, 2MM GDCL3, 5% W/V GLYCEROL, 5% W/V PEG 4000, 15MM BETA-MERCAPTOETHANOL. MIXTURE EQUILIBRATED VS. WELL SOLUTION IN HANGING DROPS AT 4 DEGREES CELSIUS., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.10 Å R-free 0.306
2TRC PHOSDUCIN/TRANSDUCIN BETA-GAMMA COMPLEX 提交 1997-01-06	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–67（67 aa）片段：LYS-C RESISTANT FRAGMENT, THE GAMMA SUBUNIT CLEAVED AFTER RESIDUE 68	未记录	GD GADOLINIUM ATOM × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；THE PROTEIN COMPLEX (10 MG/ML SOLUTION) WAS CRYSTALLIZED FROM 50 MM SODIUM CITRATE (PH 5.0), 150 MM MAGNESIUM ACETATE, 9.5% PEG 8000, BY HANGING DROP METHOD AT 4 DEGREES C., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.40 Å R-free 0.277
5KDO Heterotrimeric complex of the 4 alanine insertion variant of the Gi alpha1 subunit and the Gbeta1-Ggamma1 提交 2016-06-08	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 G 1–74（74 aa）	未记录	GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；19-24 % PEG 8000, 1-5% 2-propanolol, 1% OG, 100 mM HEPES (pH 7.0) and 100 mM NaOAc (pH 6.4)	分辨率 1.90 Å R-free 0.208
6B20 Crystal structure of a complex between G protein beta gamma dimer and an inhibitory Nanobody regulator 提交 2017-09-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 7–66（60 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277.15 K；25-30% (w/v) PEG 3350 in 0.1-0.2 M Bis-Tris-HCl, pH 5.5-5.7, and 0.2-0.3 M MgCl2	分辨率 2.34 Å R-free 0.249
6B20 Crystal structure of a complex between G protein beta gamma dimer and an inhibitory Nanobody regulator 提交 2017-09-19	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 7–66（60 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 5 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277.15 K；25-30% (w/v) PEG 3350 in 0.1-0.2 M Bis-Tris-HCl, pH 5.5-5.7, and 0.2-0.3 M MgCl2	分辨率 2.34 Å R-free 0.249
6OY9 Structure of the Rhodopsin-Transducin Complex 提交 2019-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 2–74（73 aa）	未记录	RET RETINAL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.90 Å
6OYA Structure of the Rhodopsin-Transducin-Nanobody Complex 提交 2019-05-14	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 2–74（73 aa）	未记录	RET RETINAL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blot for 1 second before plunging; avoid light as much as possible.	分辨率 3.30 Å
6QNO Rhodopsin-Gi protein complex 提交 2019-02-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–74（74 aa）	未记录	RET RETINAL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The detergent lauryl-maltose neopentyl glycol (LMNG) was used before the last purification step by gel filtration. In the gel filtration, detergent-free buffer was used. cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.38 Å
7O7F Structural basis of the activation of the CC chemokine receptor 5 by a chemokine agonist 提交 2021-04-13	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 G 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.15 Å
8P12 Cryo-EM structure of Rhodopsin-Gi bound to antibody fragment Fab13 提交 2023-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 G 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.21 Å
8P13 Cryo-EM structure of Rhodopsin-Gi bound with antibody fragments scFv16 and Fab79, conformation 1 提交 2023-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 G 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.20 Å
8P15 Cryo-EM structure of Rhodopsin-Gi bound with antibody fragments scFv16 and Fab79, conformation 2 提交 2023-05-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 G 1–74（74 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM NaCl cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.90 Å
9EPR Cryo-EM Structure of Jumping Spider Rhodopsin-1 bound to a Gi heterotrimer 提交 2024-03-19	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 G 1–74（74 aa）	未记录	RET RETINAL × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.90 Å

共 16 个其他 PDB 条目、21 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GBG1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–68； UniProt 1–67

PROTEIN (PHOSDUCIN)

Rattus norvegicus

UniProt P20942

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 1–246	突变：S73E	PROTEIN (TRANSDUCIN) × 1 （P62871） PROTEIN (TRANSDUCIN) × 1 （P02698） GD GADOLINIUM ATOM × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.261

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 1B9X	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1B9Y STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN BETA-GAMMA 提交 1999-02-16	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 1–246（246 aa）	未记录	GD GADOLINIUM ATOM × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 3.00 Å R-free 0.266
2TRC PHOSDUCIN/TRANSDUCIN BETA-GAMMA COMPLEX 提交 1997-01-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 P 14–230（217 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GD GADOLINIUM ATOM × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；THE PROTEIN COMPLEX (10 MG/ML SOLUTION) WAS CRYSTALLIZED FROM 50 MM SODIUM CITRATE (PH 5.0), 150 MM MAGNESIUM ACETATE, 9.5% PEG 8000, BY HANGING DROP METHOD AT 4 DEGREES C., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K	分辨率 2.40 Å R-free 0.277

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PHOS_RAT
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1b9x
沉积日期 deposition_date	1999-02-16
结构标题 title	STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN
关键词 keywords	;PHOSDUCIN, TRANSDUCIN, BETA-GAMMA, SIGNAL TRANSDUCTION, REGULATION, PHOSPHORYLATION, G PROTEINS, THIOREDOXIN, VISION, MEKA, COMPLEX (TRANSDUCER- TRANSDUCTION), SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	26.29 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	25.43 Å
零角强度 I(0) i0	77886600.00
分子量 molecular_weight	65383.0 kDa
排除体积 excluded_volume	79970 Å³
包络体积 envelope_volume	97876 Å³
水化壳体积 shell_volume	31870 Å³
包络直径 envelope_diameter	95.8 Å
壳层 Rg shell_rg	33.08 Å
包络 Rg envelope_rg	25.79 Å
形状 Rg shape_rg	25.40 Å
总 Rg total_rg	26.25 Å
总原子数 total_atoms	4520
残基数 n_residues	577
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	88.4 Å
Rg (实空间) rg_real	26.25 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.68 Å
I(0) (实空间) i0_real	7.7890e+07
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.1800e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	26.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	77890000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7996
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	3
主峰位置 r_peak_primary	32.4 Å
偏度 Skewness skewness	0.352
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.222
角度范围 angular_range	— – 0.3000 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	15200000.0000
实空间数据点数 n_real_points	61
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.799; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.992; Smooth: 0.000

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PROTEIN (TRANSDUCIN)
分子量 formula_weight	37431.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4538

MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLLSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PROTEIN (TRANSDUCIN)
分子量 formula_weight	8040.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MPVINIEDLTEKDKLKMEVDQLKKEVTLERMLVSKCCEEFRDYVEERSGEDPLVKGIPEDKNPFKELK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOSDUCIN)
分子量 formula_weight	28204.3 kDa
突变 mutation	S73E
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MEEAASQSLEEDFEGQATHTGPKGVINDWRKFKLESEDGDSIPPSKKEILRQMSSPQSRDDKDSKERMSRKMEIQEYELIHQDKEDEGCLRKYRRQCMQDMHQKLSFGPRYGFVYELETGEQFLETIEKEQKVTTIVVNIYEDGVRGCDALNSSLECLAAEYPMVKFCKIRASNTGAGDRFSSDVLPTLLVYKGGELISNFISVAEQFAEDFFAADVESFLNEYGLLPEREIHDLGQTNTEDEDIE

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GADOLINIUM ATOM
分子量 formula_weight	157.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1b9xa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.4 — WD40 repeat-like
家族 Family family	b.69.4.1 — WD40-repeat

结构域编号 domain_id	d1b9xb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.137 — Non-globular all-alpha subunits of globular proteins
超家族 Superfamily superfamily	a.137.3 — Transducin (heterotrimeric G protein), gamma chain
家族 Family family	a.137.3.1 — Transducin (heterotrimeric G protein), gamma chain

结构域编号 domain_id	d1b9xc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamily	c.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family family	c.47.1.6 — Phosducin

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1b9xA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	1b9xB00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	260 — G Protein Gi Gamma 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transducin (heterotrimeric G protein), gamma chain

结构域编号 domain_id	1b9xC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

结构域编号 domain_id	1b9xC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	168 — Phosducin; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Phosducin, domain 2

▶

8. 引用文献 (2)

▶

晶胞边长 a length_a	76.040 Å
晶胞边长 b length_b	89.330 Å
晶胞边长 c length_c	100.150 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2170
R_free r_free	0.2610

fit	/app/data/saxs_computation/b9/1b9x/1b9x.fit
pddf	/app/data/pr_computation/b9/1b9x/1b9x.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/b9/1b9x/1b9x.dat

STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (TRANSDUCIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN (TRANSDUCIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN (PHOSDUCIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)