SAXSdb — 1b9x

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (TRANSDUCIN)

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PROTEIN (TRANSDUCIN) × 1 （P02698） PROTEIN (PHOSDUCIN) × 1 （P20942） GADOLINIUM ATOM × 6 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GBB1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–340； UniProt 1–340

PROTEIN (TRANSDUCIN)

物种未注明

UniProt P02698

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PROTEIN (TRANSDUCIN) × 1 （P62871） PROTEIN (PHOSDUCIN) × 1 （P20942） GADOLINIUM ATOM × 6 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GBG1_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–68； UniProt 1–67

PROTEIN (PHOSDUCIN)

Rattus norvegicus

UniProt P20942

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	PROTEIN (TRANSDUCIN) × 1 （P62871） PROTEIN (TRANSDUCIN) × 1 （P02698） GADOLINIUM ATOM × 6 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	PHOS_RAT
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–246； UniProt 1–246

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1b9x
沉积日期 deposition_date	1999-02-16
结构标题 title	STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN
关键词 keywords	;PHOSDUCIN, TRANSDUCIN, BETA-GAMMA, SIGNAL TRANSDUCTION, REGULATION, PHOSPHORYLATION, G PROTEINS, THIOREDOXIN, VISION, MEKA, COMPLEX (TRANSDUCER- TRANSDUCTION), SIGNALING PROTEIN ;; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1b9x__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1b9x__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1b9x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	26.29 Å
Rg（电子密度）	25.43 Å
总 Rg	26.25 Å
原子数	4520
残基数	577
排除体积	79970 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1b9x__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	PROTEIN (TRANSDUCIN)
分子量 formula_weight	37431.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4538

MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLLSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	PROTEIN (TRANSDUCIN)
分子量 formula_weight	8040.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MPVINIEDLTEKDKLKMEVDQLKKEVTLERMLVSKCCEEFRDYVEERSGEDPLVKGIPEDKNPFKELK

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	PROTEIN (PHOSDUCIN)
分子量 formula_weight	28204.3 kDa
突变 mutation	S73E
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MEEAASQSLEEDFEGQATHTGPKGVINDWRKFKLESEDGDSIPPSKKEILRQMSSPQSRDDKDSKERMSRKMEIQEYELIHQDKEDEGCLRKYRRQCMQDMHQKLSFGPRYGFVYELETGEQFLETIEKEQKVTTIVVNIYEDGVRGCDALNSSLECLAAEYPMVKFCKIRASNTGAGDRFSSDVLPTLLVYKGGELISNFISVAEQFAEDFFAADVESFLNEYGLLPEREIHDLGQTNTEDEDIE

来源 Source

来源生物 organism	Rattus norvegicus
通用名 common_name	Norway rat
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10116
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	GADOLINIUM ATOM
分子量 formula_weight	157.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	18

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d1b9xa_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamily	b.69.4 — WD40 repeat-like
家族 Family family	b.69.4.1 — WD40-repeat

结构域编号 domain_id	d1b9xb_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.137 — Non-globular all-alpha subunits of globular proteins
超家族 Superfamily superfamily	a.137.3 — Transducin (heterotrimeric G protein), gamma chain
家族 Family family	a.137.3.1 — Transducin (heterotrimeric G protein), gamma chain

结构域编号 domain_id	d1b9xc_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.47 — Thioredoxin fold
超家族 Superfamily superfamily	c.47.1 — Thioredoxin-like
家族 Family family	c.47.1.6 — Phosducin

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id	1b9xA00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology	10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase

结构域编号 domain_id	1b9xB00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	260 — G Protein Gi Gamma 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transducin (heterotrimeric G protein), gamma chain

结构域编号 domain_id	1b9xC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	30 — Glutaredoxin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Glutaredoxin

结构域编号 domain_id	1b9xC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	168 — Phosducin; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Phosducin, domain 2

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晶胞边长 a length_a	76.040 Å
晶胞边长 b length_b	89.330 Å
晶胞边长 c length_c	100.150 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2170
R_free r_free	0.2610

STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (TRANSDUCIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN (TRANSDUCIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

PROTEIN (PHOSDUCIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1b9x__assembly_1__model_1

1b9x__assembly_1__model_1 | I(q)

1b9x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (2)

STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

PROTEIN (TRANSDUCIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PROTEIN (TRANSDUCIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

PROTEIN (PHOSDUCIN)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

1b9x__assembly_1__model_1

1b9x__assembly_1__model_1 | I(q)

1b9x__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (4 domains)

7. 引用文献 (2)