1i97

CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUS THERMOPHILUS IN COMPLEX WITH TETRACYCLINE

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S RIBOSOMAL PROTEIN S4

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS4_THETH
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–208； UniProt 1–208

30S RIBOSOMAL PROTEIN S5

物种未注明

UniProt P27152

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS5_THETH
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–161； UniProt 1–161

30S RIBOSOMAL PROTEIN S6

物种未注明

UniProt P23370

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS6_THETH
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101

30S RIBOSOMAL PROTEIN S7

物种未注明

UniProt P17291

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	P17291
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

30S RIBOSOMAL PROTEIN S8

物种未注明

UniProt P24319

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS8_THETH
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–138； UniProt 1–138

30S RIBOSOMAL PROTEIN S10

物种未注明

UniProt P80375

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS10_THETH
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104

30S RIBOSOMAL PROTEIN S12

物种未注明

UniProt P17293

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS12_THETH
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–131； UniProt 5–135

30S RIBOSOMAL PROTEIN S14

物种未注明

UniProt P24320

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS14_THETH
Isoform	—
PDB实体	14
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–60； UniProt 1–60

30S RIBOSOMAL PROTEIN S15

物种未注明

UniProt P80378

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS15_THETH
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–88； UniProt 1–88

30S RIBOSOMAL PROTEIN S17

物种未注明

UniProt P24321

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RS17_THETH
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104

30S RIBOSOMAL PROTEIN S19

物种未注明

UniProt P80381

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 1	16S RRNA × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 （P24321） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 MAGNESIUM ION × 75 OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE × 14 TETRACYCLINE × 6 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS19_THETH
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1i97
沉积日期 deposition_date	2001-03-18
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUS THERMOPHILUS IN COMPLEX WITH TETRACYCLINE
关键词 keywords	30S ribosome, antibiotics, tetracycline, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1i97__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1i97__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1i97__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	66.17 Å
Rg（电子密度）	66.91 Å
总 Rg	68.37 Å
原子数	33951
残基数	1514
排除体积	821910 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1i97__assembly_1__model_1`	21-meric （21）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (25)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	16S RRNA
分子量 formula_weight	491510.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	36361

UGUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUC

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S2
分子量 formula_weight	29186.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

PVEITVKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDIVRMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPDAIFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQEAEATETPEGESEVEA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S3
分子量 formula_weight	26619.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

GNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRGGERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGAEQARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S4
分子量 formula_weight	24242.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

GRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFEEASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQNLEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S5
分子量 formula_weight	17452.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

PETDFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEIEVEFGASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKGEAHAQAQG

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S6
分子量 formula_weight	11988.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELRIRDNVRRVMVVKSQEPFLANA

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S7
分子量 formula_weight	17919.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

ARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRVGGANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S8
分子量 formula_weight	15886.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTEVPASRFKEEILKILAREGFIKGYERVEVDGKPYLRIHLKYGPRRQGPDPRPEQVIKHIRRISRPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTPKGVLTDREARKLGVGGELICEVW

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S9
分子量 formula_weight	14429.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MEQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGRFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLGIARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S10
分子量 formula_weight	11823.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

PKIRIKLRGFDHKTLDASAQKIVEAARRSGAQVSGPIPLPTRVRRFTVIRGPFKHKDSREHFELRTHNRLVDIINPNRKTIEQLMTLDLPTGVEIEIKTVGGGR

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S11
分子量 formula_weight	13606.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

AKKPSKKKVKRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S12
分子量 formula_weight	14506.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

PTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEHSVVLIRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAAKTAAKK

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S13
分子量 formula_weight	14207.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

ARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRLMDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S14
分子量 formula_weight	7027.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

ARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S15
分子量 formula_weight	10447.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

PITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRALIEKLGIRG

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S16
分子量 formula_weight	10410.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVFRQEAREGA

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S17
分子量 formula_weight	12144.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

PKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEERYKVGDVVEIIEARPISKRKRFRVLRLVEEGRLDLVEKYLVRRQNYASLSKRGGKA

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S18
分子量 formula_weight	10113.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

STKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSGKEQRILAKTIKRARILGLLPFTEKLVRK

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S19
分子量 formula_weight	10474.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

PRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYRGHGKEAKATKKK

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S20
分子量 formula_weight	11604.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

AQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAIQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARRKSRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN THX
分子量 formula_weight	3218.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

GKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK

实体 22 Entity 22 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	75

实体 23 Entity 23 non-polymer

描述 description	OCTADECATUNGSTENYL DIPHOSPHATE
分子量 formula_weight	4363.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	14

实体 24 Entity 24 non-polymer

描述 description	TETRACYCLINE
分子量 formula_weight	444.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	6

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 22 domains

SCOP 2.08 (22 domains)

结构域编号 domain_id	d1i97b_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.23 — Flavodoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.23.15 — Ribosomal protein S2
家族 Family family	c.23.15.1 — Ribosomal protein S2

结构域编号 domain_id	d1i97c1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.52 — Alpha-lytic protease prodomain-like
超家族 Superfamily superfamily	d.52.3 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)
家族 Family family	d.52.3.1 — Prokaryotic type KH domain (KH-domain type II)

结构域编号 domain_id	d1i97c2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.53 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
超家族 Superfamily superfamily	d.53.1 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
家族 Family family	d.53.1.1 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1i97d_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.66 — Alpha-L RNA-binding motif
超家族 Superfamily superfamily	d.66.1 — Alpha-L RNA-binding motif
家族 Family family	d.66.1.2 — Ribosomal protein S4 (bacteria)

结构域编号 domain_id	d1i97e1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.14 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.14.1 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
家族 Family family	d.14.1.1 — Translational machinery components

结构域编号 domain_id	d1i97e2
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.50 — dsRBD-like
超家族 Superfamily superfamily	d.50.1 — dsRNA-binding domain-like
家族 Family family	d.50.1.2 — Ribosomal S5 protein, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	d1i97f_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.14 — Ribosomal protein S6
家族 Family family	d.58.14.1 — Ribosomal protein S6

结构域编号 domain_id	d1i97g_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.75 — Ribosomal protein S7
超家族 Superfamily superfamily	a.75.1 — Ribosomal protein S7
家族 Family family	a.75.1.1 — Ribosomal protein S7

结构域编号 domain_id	d1i97h_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.140 — Ribosomal protein S8
超家族 Superfamily superfamily	d.140.1 — Ribosomal protein S8
家族 Family family	d.140.1.1 — Ribosomal protein S8

结构域编号 domain_id	d1i97i_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.14 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
超家族 Superfamily superfamily	d.14.1 — Ribosomal protein S5 domain 2-like
家族 Family family	d.14.1.1 — Translational machinery components

结构域编号 domain_id	d1i97j_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.15 — Ribosomal protein S10
家族 Family family	d.58.15.1 — Ribosomal protein S10

结构域编号 domain_id	d1i97k_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamily	c.55.4 — Translational machinery components
家族 Family family	c.55.4.1 — Ribosomal protein L18 and S11

结构域编号 domain_id	d1i97l_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family family	b.40.4.5 — Cold shock DNA-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d1i97m_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.156 — S13-like H2TH domain
超家族 Superfamily superfamily	a.156.1 — S13-like H2TH domain
家族 Family family	a.156.1.1 — Ribosomal protein S13

结构域编号 domain_id	d1i97n_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.39 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
超家族 Superfamily superfamily	g.39.1 — Glucocorticoid receptor-like (DNA-binding domain)
家族 Family family	g.39.1.7 — Ribosomal protein S14

结构域编号 domain_id	d1i97o_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.16 — S15/NS1 RNA-binding domain
超家族 Superfamily superfamily	a.16.1 — S15/NS1 RNA-binding domain
家族 Family family	a.16.1.2 — Ribosomal protein S15

结构域编号 domain_id	d1i97p_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.27 — Ribosomal protein S16
超家族 Superfamily superfamily	d.27.1 — Ribosomal protein S16
家族 Family family	d.27.1.1 — Ribosomal protein S16

结构域编号 domain_id	d1i97q_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.4 — Nucleic acid-binding proteins
家族 Family family	b.40.4.5 — Cold shock DNA-binding domain-like

结构域编号 domain_id	d1i97r_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.4 — DNA/RNA-binding 3-helical bundle
超家族 Superfamily superfamily	a.4.8 — Ribosomal protein S18
家族 Family family	a.4.8.1 — Ribosomal protein S18

结构域编号 domain_id	d1i97s_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.28 — Ribosomal protein S19
超家族 Superfamily superfamily	d.28.1 — Ribosomal protein S19
家族 Family family	d.28.1.1 — Ribosomal protein S19

结构域编号 domain_id	d1i97t_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.7 — Spectrin repeat-like
超家族 Superfamily superfamily	a.7.6 — Ribosomal protein S20
家族 Family family	a.7.6.1 — Ribosomal protein S20

结构域编号 domain_id	d1i97u_
类 Class class	j — Peptides
折叠类型 Fold fold	j.9 — Arg-rich RNA binding peptides
超家族 Superfamily superfamily	j.9.1 — 30S ribosomal protein THX
家族 Family family	j.9.1.1 — 30S ribosomal protein THX

▶

晶胞边长 a length_a	406.900 Å
晶胞边长 b length_b	406.900 Å
晶胞边长 c length_c	175.200 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.500 Å
最低分辨率 resolution_low	35.000 Å
R 因子 r_factor	0.2260
R_work r_work	0.2230
R_free r_free	0.2540

CRYSTAL STRUCTURE OF THE 30S RIBOSOMAL SUBUNIT FROM THERMUS THERMOPHILUS IN COMPLEX WITH TETRACYCLINE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S RIBOSOMAL PROTEIN S4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S17

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体