1ibm

STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S RIBOSOMAL PROTEIN S4

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS4_THETH
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–209； UniProt 1–209

30S RIBOSOMAL PROTEIN S5

物种未注明

UniProt P27152

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS5_THETH
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–162； UniProt 1–162

30S RIBOSOMAL PROTEIN S6

物种未注明

UniProt P23370

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS6_THETH
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–101； UniProt 1–101

30S RIBOSOMAL PROTEIN S7

物种未注明

UniProt P17291

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS7_THETH
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

30S RIBOSOMAL PROTEIN S8

物种未注明

UniProt P24319

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS8_THETH
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–138； UniProt 1–138

30S RIBOSOMAL PROTEIN S10

物种未注明

UniProt P80375

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS10_THETH
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–105； UniProt 1–105

30S RIBOSOMAL PROTEIN S12

物种未注明

UniProt P17293

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS12_THETH
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

30S RIBOSOMAL PROTEIN S14

物种未注明

UniProt P24320

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS14_THETH
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–61； UniProt 1–61

30S RIBOSOMAL PROTEIN S15

物种未注明

UniProt P80378

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS15_THETH
Isoform	—
PDB实体	18
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–89； UniProt 1–89

30S RIBOSOMAL PROTEIN S19

物种未注明

UniProt P80381

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN THX × 1 （P32193） MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RS19_THETH
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 1–93； UniProt 1–93

30S RIBOSOMAL PROTEIN THX

物种未注明

UniProt P32193

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–RNA	异源复合物	蛋白 20 RNA 4	16S RIBOSOMAL RNA × 1 P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA × 1 A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S2 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S3 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S4 × 1 （P80373） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S5 × 1 （P27152） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S6 × 1 （P23370） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S7 × 1 （P17291） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S8 × 1 （P24319） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S9 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S10 × 1 （P80375） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S11 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S12 × 1 （P17293） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S13 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S14 × 1 （P24320） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S15 × 1 （P80378） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S16 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S17 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S18 × 1 30S RIBOSOMAL PROTEIN S19 × 1 （P80381） 30S RIBOSOMAL PROTEIN S20 × 1 MAGNESIUM ION × 120 ZINC ION × 2	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RSHX_THETH
Isoform	—
PDB实体	24
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–26； UniProt 1–26

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	1ibm
沉积日期 deposition_date	2001-03-28
结构标题 title	STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE
关键词 keywords	30S RIBOSOMAL SUBUNIT, RIBOSOME, A SITE, DECODING, TRANSFER TRNA, ANTICODON, STEM-LOOP, MESSENGER RNA, MRNA, CODON; RIBOSOME
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

1ibm__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

1ibm__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

1ibm__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	65.57 Å
Rg（电子密度）	66.10 Å
总 Rg	66.12 Å
原子数	52160
残基数	3924
排除体积	809060 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`1ibm__assembly_1__model_1`	24-meric （24）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (26)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	16S RIBOSOMAL RNA
分子量 formula_weight	493958.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	52160

UUUGUUGGAGAGUUUGAUCCUGGCUCAGGGUGAACGCUGGCGGCGUGCCUAAGACAUGCAAGUCGUGCGGGCCGCGGGGUUUUACUCCGUGGUCAGCGGCGGACGGGUGAGUAACGCGUGGGUGACCUACCCGGAAGAGGGGGACAACCCGGGGAAACUCGGGCUAAUCCCCCAUGUGGACCCGCCCCUUGGGGUGUGUCCAAAGGGCUUUGCCCGCUUCCGGAUGGGCCCGCGUCCCAUCAGCUAGUUGGUGGGGUAAUGGCCCACCAAGGCGACGACGGGUAGCCGGUCUGAGAGGAUGGCCGGCCACAGGGGCACUGAGACACGGGCCCCACUCCUACGGGAGGCAGCAGUUAGGAAUCUUCCGCAAUGGGCGCAAGCCUGACGGAGCGACGCCGCUUGGAGGAAGAAGCCCUUCGGGGUGUAAACUCCUGAACCCGGGACGAAACCCCCGACGAGGGGACUGACGGUACCGGGGUAAUAGCGCCGGCCAACUCCGUGCCAGCAGCCGCGGUAAUACGGAGGGCGCGAGCGUUACCCGGAUUCACUGGGCGUAAAGGGCGUGUAGGCGGCCUGGGGCGUCCCAUGUGAAAGACCACGGCUCAACCGUGGGGGAGCGUGGGAUACGCUCAGGCUAGACGGUGGGAGAGGGUGGUGGAAUUCCCGGAGUAGCGGUGAAAUGCGCAGAUACCGGGAGGAACGCCGAUGGCGAAGGCAGCCACCUGGUCCACCCGUGACGCUGAGGCGCGAAAGCGUGGGGAGCAAACCGGAUUAGAUACCCGGGUAGUCCACGCCCUAAACGAUGCGCGCUAGGUCUCUGGGUCUCCUGGGGGCCGAAGCUAACGCGUUAAGCGCGCCGCCUGGGGAGUACGGCCGCAAGGCUGAAACUCAAAGGAAUUGACGGGGGCCCGCACAAGCGGUGGAGCAUGUGGUUUAAUUCGAAGCAACGCGAAGAACCUUACCAGGCCUUGACAUGCUAGGGAACCCGGGUGAAAGCCUGGGGUGCCCCGCGAGGGGAGCCCUAGCACAGGUGCUGCAUGGCCGUCGUCAGCUCGUGCCGUGAGGUGUUGGGUUAAGUCCCGCAACGAGCGCAACCCCCGCCGUUAGUUGCCAGCGGUUCGGCCGGGCACUCUAACGGGACUGCCCGCGAAAGCGGGAGGAAGGAGGGGACGACGUCUGGUCAGCAUGGCCCUUACGGCCUGGGCGACACACGUGCUACAAUGCCCACUACAAAGCGAUGCCACCCGGCAACGGGGAGCUAAUCGCAAAAAGGUGGGCCCAGUUCGGAUUGGGGUCUGCAACCCGACCCCAUGAAGCCGGAAUCGCUAGUAAUCGCGGAUCAGCCAUGCCGCGGUGAAUACGUUCCCGGGCCUUGUACACACCGCCCGUCACGCCAUGGGAGCGGGCUCUACCCGAAGUCGCCGGGAGCCUACGGGCAGGCGCCGAGGGUAGGGCCCGUGACUGGGGCGAAGUCGUAACAAGGUAGCUGUACCGGAAGGUGCGGCUGGAUCACCUCCUUUCU

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	P-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT
分子量 formula_weight	1790.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	X

CUUUCU

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ANTICODON STEM-LOOP OF PHENYLALANINE TRANSFER RNA
分子量 formula_weight	4815.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Y

GGGAUUGAAAAUCCC

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	A-SITE MESSENGER RNA FRAGMENT
分子量 formula_weight	1179.7 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polyribonucleotide
链编号 strand_id	Z

UUUU

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S2
分子量 formula_weight	29317.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MPVEITVKELLEAGVHFGHERKRWNPKFARYIYAERNGIHIIDLQKTMEELERTFRFIEDLAMRGGTILFVGTKKQAQDIVRMEAERAGMPYVNQRWLGGMLTNFKTISQRVHRLEELEALFASPEIEERPKKEQVRLKHELERLQKYLSGFRLLKRLPDAIFVVDPTKEAIAVREARKLFIPVIALADTDSDPDLVDYIIPGNDDAIRSIQLILSRAVDLIIQARGGVVEPSPSYALVQEAEATETPEGESEVEA

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S3
分子量 formula_weight	26751.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MGNKIHPIGFRLGITRDWESRWYAGKKQYRHLLLEDQRIRGLLEKELYSAGLARVDIERAADNVAVTVHVAKPGVVIGRGGERIRVLREELAKLTGKNVALNVQEVQNPNLSAPLVAQRVAEQIERRFAVRRAIKQAVQRVMESGAKGAKVIVSGRIGGAEQARTEWAAQGRVPLHTLRANIDYGFALARTTYGVLGVKAYIFLGEVIGGQKPKARPELPKAEERPRRRRPAVRVKKEE

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S4
分子量 formula_weight	24373.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MGRYIGPVCRLCRREGVKLYLKGERCYSPKCAMERRPYPPGQHGQKRARRPSDYAVRLREKQKLRRIYGISERQFRNLFEEASKKKGVTGSVFLGLLESRLDNVVYRLGFAVSRRQARQLVRHGHITVNGRRVDLPSYRVRPGDEIAVAEKSRNLELIRQNLEAMKGRKVGPWLSLDVEGMKGKFLRLPDREDLALPVNEQLVIEFYSR

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S5
分子量 formula_weight	17583.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MPETDFEEKMILIRRTARMQAGGRRFRFGALVVVGDRQGRVGLGFGKAPEVPLAVQKAGYYARRNMVEVPLQNGTIPHEIEVEFGASKIVLKPAAPGTGVIAGAVPRAILELAGVTDILTKELGSRNPINIAYATMEALRQLRTKADVERLRKGEAHAQAQG

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S6
分子量 formula_weight	11988.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MRRYEVNIVLNPNLDQSQLALEKEIIQRALENYGARVEKVEELGLRRLAYPIAKDPQGYFLWYQVEMPEDRVNDLARELRIRDNVRRVMVVKSQEPFLANA

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S7
分子量 formula_weight	18051.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MARRRRAEVRQLQPDLVYGDVLVTAFINKIMRDGKKNLAARIFYDACKIIQEKTGQEPLKVFKQAVENVKPRMEVRSRRVGGANYQVPMEVSPRRQQSLALRWLVQAANQRPERRAAVRIAHELMDAAEGKGGAVKKKEDVERMAEANRAYAHYRW

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S8
分子量 formula_weight	15868.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MLTDPIADMLTRIRNATRVYKESTDVPASRFKEEILRILAREGFIKGYERVDVDGKPYLRVYLKYGPRRQGPDPRPEQVIHHIRRISKPGRRVYVGVKEIPRVRRGLGIAILSTSKGVLTDREARKLGVGGELICEVW

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S9
分子量 formula_weight	14429.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MEQYYGTGRRKEAVARVFLRPGNGKVTVNGQDFNEYFQGLVRAVAALEPLRAVDALGRFDAYITVRGGGKSGQIDAIKLGIARALVQYNPDYRAKLKPLGFLTRDARVVERKKYGKHKARRAPQYSKR

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S10
分子量 formula_weight	11955.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MPKIRIKLRGFDHKTLDASAQKIVEAARRSGAQVSGPIPLPTRVRRFTVIRGPFKHKDSREHFELRTHNRLVDIINPNRKTIEQLMTLDLPTGVEIEIKTVGGGR

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S11
分子量 formula_weight	13737.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MAKKPSKKKVKRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFRKAS

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S12
分子量 formula_weight	14920.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MVALPTINQLVRKGREKVRKKSKVPALKGAPFRRGVCTVVRTVTPKKPNSALRKVAKVRLTSGYEVTAYIPGEGHNLQEHSVVLIRGGRVKDLPGVRYHIVRGVYDAAGVKDRKKSRSKYGTKKPKEAAKTAAKK

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S13
分子量 formula_weight	14338.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MARIAGVEIPRNKRVDVALTYIYGIGKARAKEALEKTGINPATRVKDLTEAEVVRLREYVENTWKLEGELRAEVAANIKRLMDIGCYRGLRHRRGLPVRGQRTRTNARTRKGPRKTVAGKKKAPRK

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S14
分子量 formula_weight	7158.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

MARKALIEKAKRTPKFKVRAYTRCVRCGRARSVYRFFGLCRICLRELAHKGQLPGVRKASW

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S15
分子量 formula_weight	10578.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MPITKEEKQKVIQEFARFPGDTGSTEVQVALLTLRINRLSEHLKVHKKDHHSHRGLLMMVGQRRRLLRYLQREDPERYRALIEKLGIRG

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S16
分子量 formula_weight	10410.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P

MVKIRLARFGSKHNPHYRIVVTDARRKRDGKYIEKIGYYDPRKTTPDWLKVDVERARYWLSVGAQPTDTARRLLRQAGVFRQEAREGA

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S17
分子量 formula_weight	12324.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MPKKVLTGVVVSDKMQKTVTVLVERQFPHPLYGKVIKRSKKYLAHDPEEKYKLGDVVEIIESRPISKRKRFRVLRLVESGRMDLVEKYLIRRQNYQSLSKRGGKA

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S18
分子量 formula_weight	10244.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MSTKNAKPKKEAQRRPSRKAKVKATLGEFDLRDYRNVEVLKRFLSETGKILPRRRTGLSGKEQRILAKTIKRARILGLLPFTEKLVRK

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S19
分子量 formula_weight	10605.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

MPRSLKKGVFVDDHLLEKVLELNAKGEKRLIKTWSRRSTIVPEMVGHTIAVYNGKQHVPVYITENMVGHKLGEFAPTRTYRGHGKEAKATKKK

实体 23 Entity 23 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN S20
分子量 formula_weight	11736.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	T

MAQKKPKRNLSALKRHRQSLKRRLRNKAKKSAIKTLSKKAIQLAQEGKAEEALKIMRKAESLIDKAAKGSTLHKNAAARRKSRLMRKVRQLLEAAGAPLIGGGLSA

实体 24 Entity 24 polymer

描述 description	30S RIBOSOMAL PROTEIN THX
分子量 formula_weight	3218.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

GKGDRRTRRGKIWRGTYGKYRPRKKK

实体 25 Entity 25 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	120

实体 26 Entity 26 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 45 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

结构域编号 domain_id	d1ibmb_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmc_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmd_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibme_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmf_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmg_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmh_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmi_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmj_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmk_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibml_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmm_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmn_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmo_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmp_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmq_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmr_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibms_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmt_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

结构域编号 domain_id	d1ibmv_
类 Class class	i — Low resolution protein structures
折叠类型 Fold fold	i.1 — Ribosome and ribosomal fragments
超家族 Superfamily superfamily	i.1.1 — Ribosome and ribosomal fragments
家族 Family family	i.1.1.1 — Ribosome complexes

CATH v4.4 (25 domains)

结构域编号 domain_id	1ibmB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10490 — Glucose-6-phosphate isomerase like protein; domain 1

结构域编号 domain_id	1ibmB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	610 — Helix hairpin bin

结构域编号 domain_id	1ibmC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	300 — GMP Synthetase; Chain A, domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — K homology (KH) domain

结构域编号 domain_id	1ibmC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	32 — Ribosomal protein S3, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1ibmD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1050 — Ribosomal Protein S4 Delta 41; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S4/S9, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	1ibmD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	10 — Roll
拓扑 Topology topology	290 — Structural Genomics Hypothetical 15.5 Kd Protein In mrcA-pckA Intergenic Region; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA-binding S4 domain

结构域编号 domain_id	1ibmE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	1ibmE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1ibmF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Ribosomal protein S6/Translation elongation factor EF1B

结构域编号 domain_id	1ibmG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	455 — Ribosomal Protein S7
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S7/S5

结构域编号 domain_id	1ibmH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 —

结构域编号 domain_id	1ibmH02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1ibmI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	1ibmJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	600 — Ribosomal protein S10

结构域编号 domain_id	1ibmK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Ribosomal protein S11/S14

结构域编号 domain_id	1ibmL00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	1ibmM01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 —

结构域编号 domain_id	1ibmM02
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	910 — 30s ribosomal protein s13; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S13/S18, C-terminal domain

结构域编号 domain_id	1ibmN00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	830 — 30s Ribosomal Protein S14; Chain N
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal Protein S14/S29

结构域编号 domain_id	1ibmO00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — S15/NS1, RNA-binding

结构域编号 domain_id	1ibmP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1320 — S16 Ribosomal Protein; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S16

结构域编号 domain_id	1ibmQ00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	1ibmR00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	640 — 30s Ribosomal Protein S18
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S18

结构域编号 domain_id	1ibmS00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	860 — 30s Ribosomal Protein S19; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Ribosomal protein S19/S15

结构域编号 domain_id	1ibmT00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	110 — Ribosomal protein S20

▶

晶胞边长 a length_a	401.574 Å
晶胞边长 b length_b	401.574 Å
晶胞边长 c length_c	176.110 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.310 Å
最低分辨率 resolution_low	316.230 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2310
R_free r_free	0.2860

STRUCTURE OF THE THERMUS THERMOPHILUS 30S RIBOSOMAL SUBUNIT IN COMPLEX WITH A MESSENGER RNA FRAGMENT AND COGNATE TRANSFER RNA ANTICODON STEM-LOOP BOUND AT THE A SITE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

30S RIBOSOMAL PROTEIN S4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S6

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S8

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S10

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S14

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S15

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

30S RIBOSOMAL PROTEIN S19

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体