5adx

CryoEM structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACTIN RELATED PROTEIN 1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	ACTIN, CYTOPLASMIC 1 × 1 （Q6QAQ1） ACTIN RELATED PROTEIN 11 × 1 （I3LHK5） CAPPING PROTEIN (ACTIN FILAMENT) MUSCLE Z-LINE, ALPHA 1 × 1 （A0PFK5） F-ACTIN CAPPING PROTEIN BETA SUBUNIT VARIANT II × 1 （D2JYW4） DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 3 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN 5 × 1 （D0G6S1） DYNACTIN SUBUNIT 6 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	F2Z5G5_PIG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–370； UniProt 7–376 作者链 B； PDB构建体 1–370； UniProt 7–376 作者链 C； PDB构建体 1–370； UniProt 7–376 作者链 D； PDB构建体 1–370； UniProt 7–376 作者链 E； PDB构建体 1–370； UniProt 7–376 作者链 F； PDB构建体 1–370； UniProt 7–376 作者链 G； PDB构建体 1–370； UniProt 7–376 作者链 I； PDB构建体 1–370； UniProt 7–376

ACTIN, CYTOPLASMIC 1

物种未注明

UniProt Q6QAQ1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	ACTIN RELATED PROTEIN 1 × 8 （F2Z5G5） ACTIN RELATED PROTEIN 11 × 1 （I3LHK5） CAPPING PROTEIN (ACTIN FILAMENT) MUSCLE Z-LINE, ALPHA 1 × 1 （A0PFK5） F-ACTIN CAPPING PROTEIN BETA SUBUNIT VARIANT II × 1 （D2JYW4） DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 3 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN 5 × 1 （D0G6S1） DYNACTIN SUBUNIT 6 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ACTB_PIG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–370； UniProt 6–375

ACTIN RELATED PROTEIN 11

物种未注明

UniProt I3LHK5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	ACTIN RELATED PROTEIN 1 × 8 （F2Z5G5） ACTIN, CYTOPLASMIC 1 × 1 （Q6QAQ1） CAPPING PROTEIN (ACTIN FILAMENT) MUSCLE Z-LINE, ALPHA 1 × 1 （A0PFK5） F-ACTIN CAPPING PROTEIN BETA SUBUNIT VARIANT II × 1 （D2JYW4） DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 3 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN 5 × 1 （D0G6S1） DYNACTIN SUBUNIT 6 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	I3LHK5_PIG
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–417； UniProt 1–417

CAPPING PROTEIN (ACTIN FILAMENT) MUSCLE Z-LINE, ALPHA 1

物种未注明

UniProt A0PFK5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	ACTIN RELATED PROTEIN 1 × 8 （F2Z5G5） ACTIN, CYTOPLASMIC 1 × 1 （Q6QAQ1） ACTIN RELATED PROTEIN 11 × 1 （I3LHK5） F-ACTIN CAPPING PROTEIN BETA SUBUNIT VARIANT II × 1 （D2JYW4） DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 3 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN 5 × 1 （D0G6S1） DYNACTIN SUBUNIT 6 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	A0PFK5_PIG
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–275； UniProt 7–281

F-ACTIN CAPPING PROTEIN BETA SUBUNIT VARIANT II

物种未注明

UniProt D2JYW4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	ACTIN RELATED PROTEIN 1 × 8 （F2Z5G5） ACTIN, CYTOPLASMIC 1 × 1 （Q6QAQ1） ACTIN RELATED PROTEIN 11 × 1 （I3LHK5） CAPPING PROTEIN (ACTIN FILAMENT) MUSCLE Z-LINE, ALPHA 1 × 1 （A0PFK5） DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 3 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN 5 × 1 （D0G6S1） DYNACTIN SUBUNIT 6 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	D2JYW4_PIG
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–270； UniProt 2–271

DYNACTIN 5

物种未注明

UniProt D0G6S1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 27	ACTIN RELATED PROTEIN 1 × 8 （F2Z5G5） ACTIN, CYTOPLASMIC 1 × 1 （Q6QAQ1） ACTIN RELATED PROTEIN 11 × 1 （I3LHK5） CAPPING PROTEIN (ACTIN FILAMENT) MUSCLE Z-LINE, ALPHA 1 × 1 （A0PFK5） F-ACTIN CAPPING PROTEIN BETA SUBUNIT VARIANT II × 1 （D2JYW4） DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 3 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 6 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 2 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1 DYNACTIN SUBUNIT 2 × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	D0G6S1_PIG
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–189； UniProt 1–190

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5adx
沉积日期 deposition_date	2015-08-24
结构标题 title	CryoEM structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution
关键词 keywords	STRUCTURAL PROTEIN, DYNEIN CO-FACTOR, ACTIN-LIKE FILAMENT, CELLULAR CARGO TRANSPORT; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5adx__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5adx__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5adx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	98.41 Å
Rg（电子密度）	99.99 Å
总 Rg	99.28 Å
原子数	49392
残基数	7306
排除体积	858580 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5adx__assembly_1__model_1`	27-meric （27）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ACTIN RELATED PROTEIN 1
分子量 formula_weight	41959.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	8

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,I
原子数 atom_count	49392

IANQPVVIDNGSGVIKAGFAGDQIPKYCFPNYVGRPKHVRVMAGALEGDIFIGPKAEEHRGLLSIRYPMEHGIVKDWNDMERIWQYVYSKEQLQTFSEEHPVLLTEAPLNPRKNRERAAEVFFETFNVPALFISMQAVLSLYATGRTTGVVLDSGDGVTHAVPIYEGFAMPHSIMRIDIAGRDVSRFLRLYLRKEGYDFHSSSEFEIVKAIKERACYLSINPQKDETLETEKAQYYLPDGSTIEIGPSRFRAPELLFRPDLIGEESEGIHEVLVFAIQKSDMDLRRTLFSNIVLSGGSTLFKGFGDRLLSEVKKLAPKDVKIRISAPQERLYSTWIGGSILASLDTFKKMWVSKKEYEEDGARSIHRKTF

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	ACTIN, CYTOPLASMIC 1
分子量 formula_weight	41193.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

AALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRHQGVMVGMGQKDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYANTVLSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	ACTIN RELATED PROTEIN 11
分子量 formula_weight	46250.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MPLYEGLGSGGEKTAVVIDLGEAFTKCGFAGETGPRCIIPSVIKKAGMPKPIKVVQYNINTEELYSYLKEFIHILYFRHLLVNPRDRRVVVIESVLCPSHFRETLTRVLFKYFEVPSVLLAPSHLMALLTLGINSAMVLDCGYRESLVLPIYEGIPVLNCWGALPLGGKALHKELETQLLEQCTVDTGAAKEQSLPSVMGSIPEGVLEDIKVRTCFVSDLTRGLKIQAAKFNIDGNTERPSPPPNVDYPLDGEKILHVLGSIRDSVVEILFEQDNEEKSVATLILDSLMQCPIDTRKQLAENLVIIGGTSMLPGFLHRLLAEIRYLVEKPKYKKTLGTKTFRIHTPPAKANCVAWLGGAIFGALQDILGSRSVSKEYYNQTGRIPDWCSLNNPPLEMVFDVGKSQPPLMKRAFSTEK

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	CAPPING PROTEIN (ACTIN FILAMENT) MUSCLE Z-LINE, ALPHA 1
分子量 formula_weight	31777.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

RVSDEEKVRIAAKFITHAPPGEFNEVFNDVRLLLNNDNLLREGAAHAFAQYNMDQFTPVKIEGYEDQVLITEHGDLGNSRFLDPRNKISFKFDHLRKEASDPQPEEVDGSLKSWRESCDSALRAYVKDHYSNGFCTVYAKNIDGQQTIIACIESHQFQPKNFWNGRWRSEWKFTITPPTAQVVGVLKIQVHYYEDGNVQLVSHKDVQDSVTVSNEAQTAKEFIKIIEHAENEYQTAISENYQTMSDTTFKALRRQLPVTRTKIDWNKILSYKIGK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	F-ACTIN CAPPING PROTEIN BETA SUBUNIT VARIANT II
分子量 formula_weight	30509.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

SDQQLDCALDLMRRLPPQQIEKNLSDLIDLVPSLCEDLLSSVDQPLKIARDKVVGKDYLLCDYNRDGDSYRSPWSNKYDPPLEDGAMPSARLRKLEVEANNAFDQYRDLYFEGGVSSVYLWDLDHGFAGVILIKKAGDGSKKIKGCWDSIHVVEVQEKSSGRTAHYKLTSTVMLWLQTNKSGSGTMNLGGSLTRQMEKDETVSDCSPHIANIGRLVEDMENKIRSTLNEIYFGKTKDIVNGLRSVDVIPDNPKFQQLQRELSQVLTQRQI

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	70144.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	69633.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 3
分子量 formula_weight	7507.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O,P

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	7762.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q,R

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DYNACTIN 5
分子量 formula_weight	20703.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MAEKTQKSVKIAPGAVVCVESEIRGDVTIGPRTVIHPKARIIAEAGPIVIGEGNLIEEQALIINAHPDNITPDAEDSEPKPMIIGTNNVFEVGCYSQAMKMGDNNVIESKAYVGRNVILTSGCIIGACCNLNTFEVIPENTVIYGADCLRRVQTERPQPQTLQLDFLMKILPNYHHLKKTMKGSSTPVKN

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 6
分子量 formula_weight	18164.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

SGNKVSRQSVLCGSQNIVLNGKTIVMNDCIIRGDLANVRVGRHCVVKSRSVIRPPFKKFSKGVAFFPLHIGDHVFIEEDCVVNAAQIGSYVHVGKNCVIGRRCVLKDCCKILDNTVLPPETVVPPFTVFSGCPGLFSGELPECTQELMIDVTKSYYQKFLPLTQV

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	20698.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	35676.9 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z,z

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	5400.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a

MADPKYADLPGIARNEPDVYLEELTSTSVEHAIVNPNAAYDKFKDKRV

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	7931.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	b

MADPKYADLPGIARNEPDVYLEELTSTSVEHIIVNPNAAYDKFKDKRVGTKGLDFSDRIGKTKRTGYESGE

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	3173.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	c

MADPKYADLPGIARNEPDVYXXXXXXXXXXX

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	DYNACTIN SUBUNIT 2
分子量 formula_weight	2237.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	d

MADPKYADLPGIARNEPDVY

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 34 domains

CATH v4.4 (34 domains)

结构域编号 domain_id	5adxA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxB03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxC03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxD03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxE03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxF03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxG02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxG03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxH02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxH03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxI02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 — ATPase, nucleotide binding domain

结构域编号 domain_id	5adxI03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxJ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	640 — Actin; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — ATPase, substrate binding domain, subdomain 4

结构域编号 domain_id	5adxK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1140 — Ribosomal protein S3 C-terminal domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — F-actin capping protein, alpha subunit

结构域编号 domain_id	5adxK02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	5adxL01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	58 — Methane Monooxygenase Hydroxylase; Chain G, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	570 — F-actin capping protein, alpha/beta subunit, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	5adxL02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1150 — Aspartate Aminotransferase, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	210 — F-actin capping protein, beta subunit

结构域编号 domain_id	5adxU00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology	10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hexapeptide repeat proteins

结构域编号 domain_id	5adxV00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	160 — 3 Solenoid
拓扑 Topology topology	10 — UDP N-Acetylglucosamine Acyltransferase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hexapeptide repeat proteins

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	1

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.000 Å
最低分辨率 resolution_low	— Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	—
R_free r_free	—

分辨率 resolution	4.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	115044

CryoEM structure of dynactin complex at 4.0 angstrom resolution

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ACTIN RELATED PROTEIN 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ACTIN, CYTOPLASMIC 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

ACTIN RELATED PROTEIN 11

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CAPPING PROTEIN (ACTIN FILAMENT) MUSCLE Z-LINE, ALPHA 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

F-ACTIN CAPPING PROTEIN BETA SUBUNIT VARIANT II

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DYNACTIN 5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

5adx__assembly_1__model_1

5adx__assembly_1__model_1 | I(q)

5adx__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

冷冻电镜 EM 3D

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

实体 5 Entity 5 polymer

聚合物 Polymer

实体 6 Entity 6 polymer

聚合物 Polymer

实体 7 Entity 7 polymer

聚合物 Polymer

实体 8 Entity 8 polymer

聚合物 Polymer

实体 9 Entity 9 polymer

聚合物 Polymer

实体 10 Entity 10 polymer