6cp6

Monomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc.

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 241.8 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit 9, mitochondrial

物种未注明

UniProt P61829

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 1–76 链 L; UniProt 1–76 链 M; UniProt 1–76 链 N; UniProt 1–76 链 O; UniProt 1–76 链 P; UniProt 1–76 链 Q; UniProt 1–76 链 R; UniProt 1–76 链 S; UniProt 1–76 链 T; UniProt 1–76 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 48 个其他 PDB 条目、53 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP9_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 L; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 M; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 N; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 O; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 P; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 Q; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 R; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 S; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 T; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76

ATP synthase subunit 5, mitochondrial

物种未注明

UniProt P09457

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 Y; UniProt 18–212 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 35 个其他 PDB 条目、35 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPO_YEAST
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 Y; PDB构建体 1–195; UniProt 18–212

ATP synthase subunit alpha, mitochondrial

物种未注明

UniProt P07251

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 36–545 链 B; UniProt 36–545 链 C; UniProt 36–545 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 51 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPA_YEAST
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–510; UniProt 36–545 作者链 B; PDB构建体 1–510; UniProt 36–545 作者链 C; PDB构建体 1–510; UniProt 36–545

ATP synthase subunit beta, mitochondrial

物种未注明

UniProt P00830

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 34–511 链 E; UniProt 34–511 链 F; UniProt 34–511 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 51 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPB_YEAST
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–478; UniProt 34–511 作者链 E; PDB构建体 1–478; UniProt 34–511 作者链 F; PDB构建体 1–478; UniProt 34–511

ATP synthase subunit gamma, mitochondrial

物种未注明

UniProt P38077

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 34–311 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 52 个其他 PDB 条目、65 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPG_YEAST
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–278; UniProt 34–311

ATP synthase subunit delta, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q12165

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 23–160 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 48 个其他 PDB 条目、60 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPD_YEAST
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–138; UniProt 23–160

ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial

物种未注明

UniProt P21306

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 2–62 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 47 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATP5E_YEAST
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–61; UniProt 2–62

ATP synthase subunit 4, mitochondrial

物种未注明

UniProt P05626

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 Z; UniProt 36–244 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 40 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPF_YEAST
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 Z; PDB构建体 1–209; UniProt 36–244

ATP synthase subunit d, mitochondrial

物种未注明

UniProt P30902

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 7; UniProt 2–174 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 41 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP7_YEAST
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 7; PDB构建体 1–173; UniProt 2–174

ATP synthase subunit H, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q12349

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 6; UniProt 33–124 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 36 个其他 PDB 条目、36 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP14_YEAST
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 6; PDB构建体 1–92; UniProt 33–124

ATP synthase subunit f, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q06405

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 U; UniProt 7–101 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 41 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPK_YEAST
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–95; UniProt 7–101

ATP synthase protein 8

物种未注明

UniProt P00856

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 8; UniProt 1–48 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 39 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP8_YEAST
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 8; PDB构建体 1–48; UniProt 1–48

ATP synthase subunit a

物种未注明

UniProt P00854

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 X; UniProt 11–259 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 40 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP6_YEAST
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 1–249; UniProt 11–259

ATP synthase subunit J, mitochondrial

物种未注明

UniProt P81450

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–37 未记录 ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 39 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP18_YEAST
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–37; UniProt 1–37

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6cp6

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6cp6
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6cp6
沉积日期 deposition_date2018-03-13
结构标题 titleMonomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc.
关键词 keywordsATP synthase, BIOSYNTHETIC PROTEIN; BIOSYNTHETIC PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier62.83
回转半径 Rg (电子) rg_electron64.60
零角强度 I(0) i03955540000.00
分子量 molecular_weight551380.0 kDa
排除体积 excluded_volume699480 ų
包络体积 envelope_volume1017400 ų
水化壳体积 shell_volume133690 ų
包络直径 envelope_diameter234.5
壳层 Rg shell_rg64.01
包络 Rg envelope_rg63.43
形状 Rg shape_rg64.59
总 Rg total_rg64.62
总原子数 total_atoms38853
残基数 n_residues5118
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax241.8
Rg (实空间) rg_real67.30
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.73
I(0) (实空间) i0_real4.0000e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.3350e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal62.40
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3949000000.0000
解质量估计 total_estimate0.6053
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary58.0
偏度 Skewness skewness0.677
峰度 Kurtosis kurtosis0.019
角度范围 angular_range— – 0.1250 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.9967
最高正则化参数 α highest_alpha497900000.0000
实空间数据点数 n_real_points26
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.547; Stabil: 0.852; Sysdev: 0.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.966; Smooth: 0.753

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

CATH v4.4 (32 domains)

结构域编号 domain_id6cp6A01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20
结构域编号 domain_id6cp6A02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6cp6A03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain
结构域编号 domain_id6cp6B01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20
结构域编号 domain_id6cp6B02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6cp6B03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain
结构域编号 domain_id6cp6C01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology30 — Elongation Factor Tu (Ef-tu); domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20
结构域编号 domain_id6cp6C02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6cp6C03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology150 — Lysin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — ATP synthase alpha/beta chain, C-terminal domain
结构域编号 domain_id6cp6D01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170
结构域编号 domain_id6cp6D02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6cp6D03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3
结构域编号 domain_id6cp6E01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170
结构域编号 domain_id6cp6E02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6cp6E03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3
结构域编号 domain_id6cp6F01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170
结构域编号 domain_id6cp6F02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id6cp6F03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1140 — Bovine Mitochondrial F1-ATPase, ATP Synthase Beta Chain; Chain D, domain3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Bovine Mitochondrial F1-atpase; Atp Synthase Beta Chain; Chain D, domain 3
结构域编号 domain_id6cp6G01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — ATP synthase, gamma subunit, helix hairpin domain
结构域编号 domain_id6cp6G02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1380 — Pyruvate Kinase; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — ATP synthase, F1 complex, gamma subunit
结构域编号 domain_id6cp6I00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology1620 — Atp Synthase Epsilon Chain; Chain: I;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — ATP synthase, F1 complex, epsilon subunit superfamily, mitochondrial
结构域编号 domain_id6cp6K00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6L00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6M00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6N00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6O00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6P00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6Q00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6R00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6S00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6T00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology20 — F1FO ATP Synthase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — F1F0 ATP synthase subunit C
结构域编号 domain_id6cp6Y01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology520 — Peroxidase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — N-terminal domain of the delta subunit of the F1F0-ATP synthase

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)