6dkj

human GIPR ECD and Fab complex

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 156.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fab heavy chain

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 H； UniProt 109–222	未记录	Fab light chain × 1 （V9HW34） Gastric inhibitory polypeptide receptor × 1 （P48546）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% PEG 4000 and 20% isopropanol	分辨率 1.95 Å R-free 0.238
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 109–222	未记录	Fab light chain × 1 （V9HW34） Gastric inhibitory polypeptide receptor × 1 （P48546） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% PEG 4000 and 20% isopropanol	分辨率 1.95 Å R-free 0.238

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 6DKJ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1D5B UNLIGANDED MATURE OXY-COPE CATALYTIC ANTIBODY 提交 1999-10-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 120–220（101 aa）片段：chimeric fab fragment (UNP K7T9I5 residues 1-112, P0DOX5 residues 120-220) 链 H 120–220（101 aa）片段：chimeric fab fragment (UNP K7T9I5 residues 1-112, P0DOX5 residues 120-220)	未记录	CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25%PEG 1000, 100mM sodium acetate, 300mM CdCl2, 100mM ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.285
1D5B UNLIGANDED MATURE OXY-COPE CATALYTIC ANTIBODY 提交 1999-10-06	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 120–220（101 aa）片段：chimeric fab fragment (UNP K7T9I5 residues 1-112, P0DOX5 residues 120-220)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25%PEG 1000, 100mM sodium acetate, 300mM CdCl2, 100mM ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.285
1D5B UNLIGANDED MATURE OXY-COPE CATALYTIC ANTIBODY 提交 1999-10-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 120–220（101 aa）片段：chimeric fab fragment (UNP K7T9I5 residues 1-112, P0DOX5 residues 120-220)	未记录	CD CADMIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；25%PEG 1000, 100mM sodium acetate, 300mM CdCl2, 100mM ammonium sulfate, pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.80 Å R-free 0.285
1D5I UNLIGANDED GERMLINE PRECURSOR OF AN OXY-COPE CATALYTIC ANTIBODY 提交 1999-10-07	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 120–220（101 aa）片段：chimeric fab fragment (UNP K7T9I5 residues 1-112, P0DOX5 residues 120-220)	未记录	CD CADMIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；75mM Hepes pH 7.0 9% PEG 4000 150 mM Ammonium Sulfate 20% 1,4 butanediol 100 mM Cadmium Chloride, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.00 Å R-free 0.263
1D6V CONFORMATION EFFECTS IN BIOLOGICAL CATALYSIS INTRODUCED BY OXY-COPE ANTIBODY MATURATION 提交 1999-10-15	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 120–220（101 aa）片段：chimeric fab fragment (UNP K7T9I5 residues 1-112, P0DOX5 residues 120-220)	未记录	CD CADMIUM ION × 4 HOP (1S,2S,5S)2-(4-GLUTARIDYLBENZYL)-5-PHENYL-1-CYCLOHEXANOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；9% polyethylene glycol 4000 250mM ammonium sulfate 80mM Cadmium Chloride 75mM Hepes 20% 1,4 butanediol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 19K	分辨率 2.00 Å R-free 0.264
1HZH CRYSTAL STRUCTURE OF THE INTACT HUMAN IGG B12 WITH BROAD AND POTENT ACTIVITY AGAINST PRIMARY HIV-1 ISOLATES: A TEMPLATE FOR HIV VACCINE DESIGN 提交 2001-01-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 117–449（333 aa）链 K 117–449（333 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295.5 K；NH4SO4, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 2.70 Å R-free 0.273
1N0X Crystal Structure of a Broadly Neutralizing Anti-HIV-1 Antibody in Complex with a Peptide Mimotope 提交 2002-10-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 H 117–222（106 aa）片段：UNP residues 117-222 链 K 117–222（106 aa）片段：UNP residues 117-222	未记录	GOL GLYCEROL × 8 SO4 SULFATE ION × 4 CXS 3-CYCLOHEXYL-1-PROPYLSULFONIC ACID × 1 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 10.5；295.5 K；ammonium sulfate, lithium sulfate, CAPS buffer, pH 10.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295.5K	分辨率 1.80 Å R-free 0.252
3PGF Crystal structure of maltose bound MBP with a conformationally specific synthetic antigen binder (sAB) 提交 2010-11-01	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 121–227（107 aa）	未记录	IMD IMIDAZOLE × 2 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；292 K；19% PEG 3400, 8% Tacsimate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 2.10 Å R-free 0.227
4R26 Crystal structure of human Fab PGT124, a broadly neutralizing and potent HIV-1 neutralizing antibody 提交 2014-08-08	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 115–223（109 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；20% PEG 4000, 0.2M MgCl2, 0.1M Tris-HCL, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 2.50 Å R-free 0.267
4R2G Crystal Structure of PGT124 Fab bound to HIV-1 JRCSF gp120 core and to CD4 提交 2014-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 115–223（109 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；2.4M ammonium sulphate, 0.1M Tris, 13% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.28 Å R-free 0.263
4R2G Crystal Structure of PGT124 Fab bound to HIV-1 JRCSF gp120 core and to CD4 提交 2014-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 115–223（109 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；2.4M ammonium sulphate, 0.1M Tris, 13% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.28 Å R-free 0.263
4R2G Crystal Structure of PGT124 Fab bound to HIV-1 JRCSF gp120 core and to CD4 提交 2014-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 J 115–223（109 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；2.4M ammonium sulphate, 0.1M Tris, 13% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.28 Å R-free 0.263
4R2G Crystal Structure of PGT124 Fab bound to HIV-1 JRCSF gp120 core and to CD4 提交 2014-08-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 N 115–223（109 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 CL CHLORIDE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；293 K；2.4M ammonium sulphate, 0.1M Tris, 13% glycerol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K	分辨率 3.28 Å R-free 0.263
5O4E Crystal structure of VEGF in complex with heterodimeric Fcab JanusCT6 提交 2017-05-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 227–449（223 aa）链 B 227–449（223 aa）链 C 227–448（222 aa）链 D 227–449（223 aa）	突变：T350V, T366L, K392L, T394W 突变：;T350V, L351Y, T359R, K360F, N361Y, E388D, N389I, F389a, P389b, N389c, G389d, L389e, F405A, Y407V, D413P, K414Y, S415P, R416S, Q418L, Q419M, N421T, V422R, S440H, S442E, L443Y, S444Q, P445W, G446P, K447T ; 突变：T350V, T366L, K392L, T394W 突变：;T350V, L351Y, T359R, K360F, N361Y, E388D, N389I, F389a, P389b, N389c, G389d, L389e, F405A, Y407V, D413P, K414Y, S415P, R416S, Q418L, Q419M, N421T, V422R, S440H, S442E, L443Y, S444Q, P445W, G446P, K447T ;	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 10 MRD (4R)-2-METHYLPENTANE-2,4-DIOL × 1 CAC CACODYLATE ION × 2 TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；295 K；0.1 M Sodium cacodylate, 40% (v/v) MPD, 5% (w/v) PEG 8000	分辨率 2.15 Å R-free 0.236
5VJ6 BG505 SOSIP.664 in complex with broadly neutralizing antibodies PG9 and 8ANC195 提交 2017-04-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric	链 H 117–224（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE-PROPANE	分辨率 11.50 Å
5VU0 Crystal structure of the complex between afucosylated/galactosylated human IgG1 Fc and Fc gamma receptor IIIa (CD16A) with Man5 N-glycans 提交 2017-05-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 230–446（217 aa）片段：Fc region (UNP residues 230-446) 链 B 230–446（217 aa）片段：Fc region (UNP residues 230-446)	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 5 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 NA SODIUM ION × 9 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM Bis-Tris Propane pH 7.5, 16% PEG 20k, 100 mM Potassium thiocyanate, Cryo protection - 20% Ethylene Glycol	分辨率 2.26 Å R-free 0.237
5VZX Crystal structure of crenezumab Fab 提交 2017-05-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 115–227（113 aa）链 H 115–227（113 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 11 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1M HEPES pH 7.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.230
5VZX Crystal structure of crenezumab Fab 提交 2017-05-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 115–227（113 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 6 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1M HEPES pH 7.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.230
5VZX Crystal structure of crenezumab Fab 提交 2017-05-29	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 115–227（113 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；2.4 M ammonium sulfate, 0.1M HEPES pH 7.5	分辨率 2.50 Å R-free 0.230
5VZY Crystal structure of crenezumab Fab in complex with Abeta 提交 2017-05-29	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 115–227（113 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris hydrochloride pH 8.5, 30% w/v polyethylene glycol 4000	分辨率 2.32 Å R-free 0.249
5W5L Crystal structure of human IgG1-Sigma Fc fragment 提交 2017-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 227–449（223 aa）片段：Sigma Fc fragment, UNP residues 227-449 链 B 227–449（223 aa）片段：Sigma Fc fragment, UNP residues 227-449	突变：L234A, L235A, A237G, P238S, H268A, A330S, P331S 突变：L234A, L235A, A237G, P238S, H268A, A330S, P331S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；9% PEG 20,000, 0.1 M Sodium Acetate, pH 5.5	分辨率 1.90 Å R-free 0.229
5WAV Fc AbVance: Increasing our knowledge of antibody structural space to enable faster and better decision-making in antibody drug discovery. 提交 2017-06-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 240–448（209 aa）链 B 240–448（209 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；0.1M Hepes pH7.5 10% v/v polyethylene glycol 8000 8% v/v ethylene glycol	分辨率 2.60 Å R-free 0.260
5XJE Crystal structure of fucosylated IgG1 Fc complexed with bis-glycosylated soluble form of Fc gamma receptor IIIa 提交 2017-05-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 227–449（223 aa）片段：UNP RESIDUES 227-449 链 B 227–449（223 aa）片段：UNP RESIDUES 227-449	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 20000, 0.1 M MES (pH 6.5), 4% Zwittergent 3-12	分辨率 2.40 Å R-free 0.281
5XJF Crystal structure of fucosylated IgG Fc Y296W mutant complexed with bis-glycosylated soluble form of Fc gamma receptor IIIa 提交 2017-05-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 227–449（223 aa）片段：UNP RESIDUES 227-449 链 B 227–449（223 aa）片段：UNP RESIDUES 227-449	突变：Y298W 突变：Y298W	CL CHLORIDE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；293 K；12% PEG 20000, 0.1 M MES (pH 6.5), 4% Zwittergent 3-14	分辨率 2.50 Å R-free 0.270
5XMH Crystal structure of an IgM rheumatoid factor YES8c in complex with IgG1 Fc 提交 2017-05-15	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 239–446（208 aa）片段：UNP RESIDUES 239-446	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Tris-HCl, sodium acetate, PEG 4000	分辨率 2.80 Å R-free 0.272
5XMH Crystal structure of an IgM rheumatoid factor YES8c in complex with IgG1 Fc 提交 2017-05-15	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 239–446（208 aa）片段：UNP RESIDUES 239-446	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；Tris-HCl, sodium acetate, PEG 4000	分辨率 2.80 Å R-free 0.272
5Y56 Fc mutant (K392D/K409D/D399K) 提交 2017-08-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 238–445（208 aa）片段：UNP residues 238-445 链 B 238–445（208 aa）片段：UNP residues 238-445	突变：K392D/K409D/D399K 突变：K392D/K409D/D399K	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；1.5M (NH4)2SO4, 10% Glycerol, 0.1M Tris-Hcl (pH 7.5)	分辨率 2.65 Å R-free 0.298
5YC5 Crystal structure of human IgG-Fc in complex with aglycan and optimized Fc gamma receptor IIIa 提交 2017-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 226–448（223 aa）片段：Fc fragment, UNP residues 226-448 链 B 226–448（223 aa）片段：Fc fragment, UNP residues 226-448	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；293.15 K；20mM Tris-HCl, 100mM NaCl, 14% PEG 3350	分辨率 2.71 Å R-free 0.273
6APD Crystal structure of RSV F bound by AM22 and the infant antibody ADI-19425 提交 2017-08-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric	链 J 109–223（115 aa）链 K 109–223（115 aa）链 N 109–223（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.5；293 K；10% PEG 4000 10% 2-propanol 0.1 M sodium citrate pH 5.5	分辨率 4.10 Å R-free 0.256
6ARP Structure of a mutant Cetuximab Fab fragment 提交 2017-08-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 120–222（103 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3 GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM sodium citrate, 1.6 M ammonium sulfate, 5% glycerol	分辨率 1.70 Å R-free 0.197
6ARP Structure of a mutant Cetuximab Fab fragment 提交 2017-08-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 120–222（103 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；100 mM sodium citrate, 1.6 M ammonium sulfate, 5% glycerol	分辨率 1.70 Å R-free 0.197
6ARU Structure of Cetuximab Fab mutant in complex with EGFR extracellular domain 提交 2017-08-23	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 120–222（103 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；150 mM ammonium sulfate, 16.5% PEG3350, 10 mM cadmium chloride, 100 mM imidazole, 5% glycerol	分辨率 3.20 Å R-free 0.267
6B70 Cryo-EM structure of human insulin degrading enzyme in complex with FAB H11-E heavy chain, FAB H11-E light chain and insulin 提交 2017-10-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 C 125–219（95 aa）链 E 125–219（95 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The cryo grids were made using Spotiton and homemade plunger	分辨率 3.70 Å
6B7Z Cryo-EM structure of human insulin degrading enzyme in complex with FAB H11 heavy chain and FAB H11 light chain 提交 2017-10-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 125–219（95 aa）链 E 125–219（95 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The cryo grids were made using Spotiton	分辨率 6.50 Å
6BF7 Cryo-EM structure of human insulin degrading enzyme in complex with FAB H11-E heavy chain, FAB H11-E light chain 提交 2017-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 125–219（95 aa）链 E 125–219（95 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The cryo grids were made using Spotiton	分辨率 6.50 Å
6BF9 Cryo-EM structure of human insulin degrading enzyme in complex with FAB H11-E heavy chain, FAB H11-E light chain 提交 2017-10-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 C 125–219（95 aa）链 E 125–219（95 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；The cryo grids were made using Spotiton	分辨率 7.20 Å
6BFT Structure of Bevacizumab Fab mutant in complex with VEGF 提交 2017-10-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 120–227（108 aa）链 H 120–227（108 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 2 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；293 K；100 mM MES, 6.0, 225 mM ammonium sulfate, 13% PEG4000, 10% isopropanol	分辨率 2.55 Å R-free 0.220
6BGT Structure of Trastuzumab Fab mutant in complex with Her2 extracellular domain 提交 2017-10-29	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 109–222（114 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 6.5；293 K；100 mM MES, pH 6.5, 18% PEG3350, 10% glycerol	分辨率 2.70 Å R-free 0.247
6BKB Structure of Hepatitis C Virus Envelope Glycoprotein E2 core from genotype 6a bound to broadly neutralizing antibody AR3A 提交 2017-11-08	聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 109–222（114 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；293 K；20% (w/v) PEG 3500, 0.2M sodium-citrate	分辨率 2.80 Å R-free 0.267
6BKC Structure of Hepatitis C Virus Envelope Glycoprotein E2 core from genotype 6a bound to broadly neutralizing antibody AR3B 提交 2017-11-08	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 109–222（114 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.7；293 K；20% (w/v) PEG 3500, 0.2M Li-chloride	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
6BZ4 Human IgG1 lacking complement-dependent cytotoxicity: hu3S193 Fc mutant K322A 提交 2017-12-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 239–446（208 aa）链 B 239–446（208 aa）	未记录	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；PEG 6000, 0.1 M MES, 25% V/V ETHYLENE GLYCOL	分辨率 2.40 Å R-free 0.249
6EAQ Glycosylated FCGR3B / CD16b in complex with afucosylated IgG1 Fc 提交 2018-08-03	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 227–446（220 aa）链 B 227–446（220 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；pH 6.0 50 mM MES, 8% PEG3350 and 60 mM NaCl	分辨率 2.22 Å R-free 0.244
6FCZ Model of gC1q-Fc complex based on 7A EM map 提交 2017-12-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 H 234–449（216 aa）片段：UNP residues 234-449 链 K 234–449（216 aa）片段：UNP residues 234-449	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 10.00 Å
6FGO Fc in complex with engineered calcium binding domain Z 提交 2018-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 239–448（210 aa）链 C 239–448（210 aa）	未记录	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 GOL GLYCEROL × 7 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；24 % PEG3350, 0.1 M LiCl2, 0.1 M MES pH 6.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.232
6FGO Fc in complex with engineered calcium binding domain Z 提交 2018-01-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 B 239–448（210 aa）链 D 239–448（210 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 8 CA CALCIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；291 K；24 % PEG3350, 0.1 M LiCl2, 0.1 M MES pH 6.0	分辨率 2.50 Å R-free 0.232
6G1E BEAT Fc with improved heterodimerization (Q3A-D84.4Q) 提交 2018-03-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 223–449（227 aa）	突变：L234A, L235A, Q347E, Y349A, L351F, S364T, T366V, K370T, T394D, V397L, D399E, D401Q, F405A, Y407S, K409R, T411R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293.15 K；CRYSTALS GROWN BY VAPOR DIFFUSION BY MIXING 12.0 MG/ML PROTEIN IN 10 MM HEPES PH8.0, 100 MM NACL, 1 MM EDTA, EQUALLY WITH 33.00 %(W/V) PEG 1500	分辨率 1.88 Å R-free 0.272
6IFJ Structure of bispecific Fc 提交 2018-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 218–449（232 aa）链 B 218–449（232 aa）	突变：E357K,K409R 突变：K370E	GOL GLYCEROL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；291.15 K；0.1M Hepes, pH7.5, 12%(w/v) polyethylene glycol 3350	分辨率 2.40 Å R-free 0.231
6IQG X-ray crystal structure of Fc and peptide complex 提交 2018-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 238–447（210 aa）链 B 238–447（210 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；293 K；PEG 3350, KI	分辨率 3.00 Å R-free 0.273
6IQH X-ray crystal structure of covalent-bonded complex of Fc and peptide 提交 2018-11-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 238–447（210 aa）链 B 238–447（210 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 10；293 K；0.1 M CHES pH 10.0, 0.3M NaCl, 20% (w/v) PEG 8000	分辨率 3.00 Å R-free 0.293
6KA7 The complex structure of Human IgG Fc and its binding Repebody 提交 2019-06-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 240–447（208 aa）链 D 240–447（208 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；Tris HCl, PEG 4000, Sodium chloride	分辨率 3.00 Å R-free 0.333
6MB3 Cryo-EM structure of the circumsporozoite protein of Plasmodium falciparum with a vaccine-elicited antibody reveals maturation of inter-antibody contacts 提交 2018-08-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 19 PDB 声明：nonadecameric	链 A 109–223（115 aa）链 B 109–223（115 aa）链 C 109–223（115 aa）链 D 109–223（115 aa）链 F 109–223（115 aa）链 G 109–223（115 aa）链 H 109–223（115 aa）链 I 109–223（115 aa）链 J 109–223（115 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.37 Å
6MSY Anti-HIV-1 Fab Fab 2G12 + Man4 re-refinement 提交 2018-10-18	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 120–221（102 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 8 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；295 K；27% Peg 4000, 0.05M sodium acetate	分辨率 2.00 Å R-free 0.242
6MU3 Anti-HIV-1 Fab 2G12 + Man7 re-refinement 提交 2018-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 120–221（102 aa）链 M 120–221（102 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.6；295 K；20% Peg 4000, 0.2M sodium tartrate	分辨率 2.33 Å R-free 0.234
6MUB Anti-HIV-1 Fab 2G12 + Man5 re-refinement 提交 2018-10-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 120–222（103 aa）链 M 120–222（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；295 K；1.6M sodium/potassium phosphate	分辨率 2.50 Å R-free 0.280
6N2X Anti-HIV-1 Fab 2G12 + Man9 re-refinement 提交 2018-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 120–220（101 aa）链 M 120–220（101 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；25% Peg 400, 0.2M imidazole malate	分辨率 3.00 Å R-free 0.283
6N32 Anti-HIV-1 Fab 2G12 re-refinement 提交 2018-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 120–221（102 aa）链 K 120–221（102 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；1.05M ammonium sulfate, 18% Peg 6000, 0.1M imidazole malate	分辨率 2.20 Å R-free 0.227
6N35 Anti-HIV-1 Fab 2G12 + Man1-2 re-refinement 提交 2018-11-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 120–220（101 aa）链 M 120–220（101 aa）	未记录	BEZ BENZOIC ACID × 1 GOL GLYCEROL × 1 MAN alpha-D-mannopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；2M Sodium/Potassium Phosphate	分辨率 1.75 Å R-free 0.238
6OGE Cryo-EM structure of Her2 extracellular domain-Trastuzumab Fab-Pertuzumab Fab complex 提交 2019-04-02	聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 C 109–222（114 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 5	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.36 Å
6OKQ Crystal structure of the SF12 Fab 提交 2019-04-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 109–226（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 1.8 M sodium formate	分辨率 3.20 Å R-free 0.299
6OKQ Crystal structure of the SF12 Fab 提交 2019-04-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 109–226（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 1.8 M sodium formate	分辨率 3.20 Å R-free 0.299
6OKQ Crystal structure of the SF12 Fab 提交 2019-04-14	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 F 109–226（118 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM HEPES, pH 7.5, 1.8 M sodium formate	分辨率 3.20 Å R-free 0.299
6UBI N123-VRC34.05 HIV neutralizing antibody in complex with HIV fusion peptide residue 512-519 提交 2019-09-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 117–226（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES, pH 7, 30% PEG6000	分辨率 1.90 Å R-free 0.288
6UBI N123-VRC34.05 HIV neutralizing antibody in complex with HIV fusion peptide residue 512-519 提交 2019-09-11	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 D 117–226（110 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1 M HEPES, pH 7, 30% PEG6000	分辨率 1.90 Å R-free 0.288
6UGW Crystal structure of the Fc fragment of PF06438179/GP1111 an infliximab biosimilar in a C-centered orthorhombic crystal form, Lot A 提交 2019-09-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 220–449（230 aa）片段：LotA_Fc	未记录	ZN ZINC ION × 6 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10 mg/mL protein with JCSG+ E7 (266849e7): 10% 2-propanol, 200 mM zinc acetate, 100 mM sodium cacodylate, pH 6.5, cryoprotectant: 20% ethylene glycol, puckID kux1-2	分辨率 2.00 Å R-free 0.219
6UGX Crystal structure of the Fc fragment of PF06438179/GP1111 an infliximab biosimilar in a primative orthorhombic crystal form, Lot A 提交 2019-09-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 220–449（230 aa）链 B 220–449（230 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10 mg/mL protein with 200 mM potassium nitrate, 20% PEG3350, cryoprotectant: 20% ethylene glycol, puckID sxt1-6	分辨率 2.10 Å R-free 0.256
6UGY Crystal structure of the Fc fragment of anti-TNFa antibody infliximab (Remicade) in a primative orthorhombic crystal form, Lot C 提交 2019-09-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 220–449（230 aa）片段：LotC_Fc	未记录	ZN ZINC ION × 6 ACT ACETATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；289 K；10 mg/mL protein with JCSG+ E7 Opt screen H2 (267146h2): 4% 2-propanol, 200 mM zinc acetate, 100 mM sodium cacodylate, pH 6.8, cryoprotectant: 20% ethylene glycol, puckID kux1-9	分辨率 2.10 Å R-free 0.228
6UOE 3-25 Fab germline-reversion variant bound to an HCMV gB-derived peptide 提交 2019-10-14	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 109–223（115 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	TRS 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；293 K；0.1 M magnesium chloride, 13.4% PEG3350, 16.75% PEG400, 0.1 M Tris, pH 8.5	分辨率 1.80 Å R-free 0.186
6V8Z VRC03 and 10-1074 Bound BG505 F14 HIV-1 SOSIP Envelope Trimer Structure 提交 2019-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric	链 C 117–220（104 aa）链 I 117–220（104 aa）链 O 117–220（104 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 21	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
6VSL Crystal structure of a human fucosylated IgG1 Fc expressed in tobacco plants (Nicotiana benthamiana) 提交 2020-02-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 236–446（211 aa）片段：crystallizable fragment (UNP residues 236-446) 链 B 236–446（211 aa）片段：crystallizable fragment (UNP residues 236-446)	未记录	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；15% PEG4000, 0.1 M HEPES, pH 7.0	分辨率 2.10 Å R-free 0.250
6VSZ Crystal structure of a human afucosylated IgG1 Fc expressed in tobacco plants (Nicotiana benthamiana) 提交 2020-02-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 236–446（211 aa）片段：crystallizable fragment (UNP residues 236-446) 链 B 236–446（211 aa）片段：crystallizable fragment (UNP residues 236-446)	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；15% PEG4000, 0.1 M HEPES, pH 7.0	分辨率 2.60 Å R-free 0.276
6X3I NNAS Fc mutant 提交 2020-05-21	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 227–449（223 aa）片段：Fc	未记录	BMA beta-D-mannopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；30% polyethylene glycol 1500	分辨率 2.27 Å R-free 0.221
6YSC GLYCOSYLATED KNOB-HOLE/DUMMY FC FRAGMENT 提交 2020-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 223–449（227 aa）链 B 223–449（227 aa）	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；294 K；15% (w/v) PEG4000, 0.1M HEPES	分辨率 2.05 Å R-free 0.293
6YT7 GLYCOSYLATED KNOB/DUMMY-HOLE FC FRAGMENT 提交 2020-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 223–449（227 aa）	突变：YES	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；25% (w/v) PEG2000 MME, 0.1M HEPES	分辨率 1.55 Å R-free 0.273
6YTB GLYCOSYLATED KNOB/DUMMY-HOLE/DUMMY FC FRAGMENT 提交 2020-04-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 223–449（227 aa）链 B 223–449（227 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；294 K；20% (w/v) PEG3350, 0.2M potassium formate	分辨率 1.65 Å R-free 0.249
7CZQ S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P2B-1A10 提交 2020-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 H 115–449（335 aa）链 J 115–449（335 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7CZT S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-2G9 提交 2020-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 H 109–449（341 aa）链 I 109–449（341 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.70 Å
7CZU S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-1B6_2B 提交 2020-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 H 109–449（341 aa）链 J 109–449（341 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 28	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7CZV S protein of SARS-CoV-2 in complex bound with P5A-1B6_3B 提交 2020-09-09	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 109–449（341 aa）链 I 109–449（341 aa）链 J 109–449（341 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 31	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
7T17 Zika Virus asymmetric unit bound with IgM antibody DH1017 Fab fragment 提交 2021-12-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 540 PDB 声明：540-meric	链 H 120–224（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.26 Å
7T17 Zika Virus asymmetric unit bound with IgM antibody DH1017 Fab fragment 提交 2021-12-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 120–224（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.26 Å
7T17 Zika Virus asymmetric unit bound with IgM antibody DH1017 Fab fragment 提交 2021-12-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：45-meric	链 H 120–224（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.26 Å
7T17 Zika Virus asymmetric unit bound with IgM antibody DH1017 Fab fragment 提交 2021-12-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：54-meric	链 H 120–224（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.26 Å
7T17 Zika Virus asymmetric unit bound with IgM antibody DH1017 Fab fragment 提交 2021-12-01	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 H 120–224（105 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 5.26 Å
7URU Crystal structure of the low affinity Fc gamma receptor IIIA variant in complex with the Fc of IgG1. 提交 2022-04-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 227–449（223 aa）链 B 227–449（223 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；294 K；8% PEG 8000 0.1 M HEPES pH 7.0	分辨率 2.40 Å R-free 0.262
7X13 Structure of IgG-Fc hexamer 提交 2022-02-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 223–443（221 aa）链 B 223–443（221 aa）链 C 223–443（221 aa）链 D 223–443（221 aa）链 E 223–443（221 aa）链 F 223–443（221 aa）链 G 223–443（221 aa）链 H 223–443（221 aa）链 I 223–443（221 aa）链 J 223–443（221 aa）链 K 223–443（221 aa）链 L 223–443（221 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.70 Å
8DAO Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem fusion peptide in complex with neutralizing antibody COV44-79 提交 2022-06-13	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 E 120–222（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 0.01 M nickel (II) chloride, and 20% PEG monomethyl ether 2000	分辨率 2.80 Å R-free 0.284
8DAO Crystal structure of SARS-CoV-2 spike stem fusion peptide in complex with neutralizing antibody COV44-79 提交 2022-06-13	构建体不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 G 120–222（103 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1 M Tris, pH 8.5, 0.01 M nickel (II) chloride, and 20% PEG monomethyl ether 2000	分辨率 2.80 Å R-free 0.284
8DBZ CryoEM structure of Hantavirus ANDV Gn(H) protein complex with 2Fabs ANDV-5 and ANDV-34 提交 2022-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric	链 F 120–222（103 aa）片段：UNP residues 120-222 链 H 120–222（103 aa）片段：UNP residues 120-222	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.10 Å
8DV1 SARS-CoV-2 Wuhan-hu-1-Spike-RBD bound to linker variant of affinity matured ACE2 mimetic CVD432 提交 2022-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 218–449（232 aa）	突变：K31F,N33D,H34S,E35Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
8DV2 SARS-CoV-2 Wuhan-hu-1-Spike-RBD bound to computationally engineered ACE2 mimetic CVD293 提交 2022-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 218–449（232 aa）	突变：K31F,H34I,E35Q	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 7	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8ECQ Bovine Fab 2G3 提交 2022-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 115–222（108 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	GOL GLYCEROL × 3 MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277.15 K；10% glycerol, 0.1M Mes, 5% Peg1000, 30% Peg600	分辨率 2.00 Å R-free 0.253
8ECV Bovine Fab 2F12 提交 2022-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 114–222（109 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；293.15 K；0.2M sodium chloride, 0.1M phosphate-citrate buffer, 20% Peg6000	分辨率 1.81 Å R-free 0.261
8ECV Bovine Fab 2F12 提交 2022-09-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 114–222（109 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；293.15 K；0.2M sodium chloride, 0.1M phosphate-citrate buffer, 20% Peg6000	分辨率 1.81 Å R-free 0.261
8ECZ Bovine Fab 4C1 提交 2022-09-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 114–222（109 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1M Tris, 50% MPD, 0.2M ammonium dihydrogen phosphate	分辨率 2.82 Å R-free 0.258
8ECZ Bovine Fab 4C1 提交 2022-09-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 114–222（109 aa）	未记录	PO4 PHOSPHATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293.15 K；0.1M Tris, 50% MPD, 0.2M ammonium dihydrogen phosphate	分辨率 2.82 Å R-free 0.258
8ED1 Bovine Fab 5C1 提交 2022-09-02	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 H 114–222（109 aa）	未记录	GOL GLYCEROL × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；277.15 K；0.1M Tris, 10% glycerol, 20% Peg300, 5% Peg8000	分辨率 2.31 Å R-free 0.267
8EDF Bovine Fab SKD in complex with Sars COV-2 receptor binding domain 提交 2022-09-04	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 H 114–222（109 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；293.15 K；0.4M Lithium chloride, 10% Peg6000, 0.1M sodium citrate	分辨率 3.40 Å R-free 0.299
8GHR Structure of human ENPP1 in complex with variable heavy domain VH27.2 提交 2023-03-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 218–449（232 aa）链 B 218–449（232 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 2 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 4 CA CALCIUM ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4；phosphate buffered saline cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8TTM IgG1 Fc Heterodimer combYSelect1 提交 2023-08-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 218–449（232 aa）链 B 218–449（232 aa）	突变：K409S, T411Y 突变：L368S, D399Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；0.1M BisTris pH 6.5 and 21% PEG MME 5000	分辨率 2.51 Å R-free 0.242
8TUD IgG1 Fc Heterodimer combYSelect2 提交 2023-08-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 218–449（232 aa）链 B 218–449（232 aa）	突变：D399Y, K447S 突变：K409S, T411Y	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；292 K；0.1M Bis Tris pH 6.5 and 29% PEG MME 2000	分辨率 3.00 Å R-free 0.285
8URO Crystal structure of IgG1-Fc fragment (E382S) in complex with Corynebacterial ENGase CU43 (D187A-E189A) 提交 2023-10-26	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 218–449（232 aa）链 C 218–449（232 aa）	突变：E382S 突变：E382S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium acetate 0.1 M MES 6.5 30 %v/v Glycerol ethoxylate (MIDAS 2-31)	分辨率 3.62 Å R-free 0.369
8URO Crystal structure of IgG1-Fc fragment (E382S) in complex with Corynebacterial ENGase CU43 (D187A-E189A) 提交 2023-10-26	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 E 218–449（232 aa）链 F 218–449（232 aa）	突变：E382S 突变：E382S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.2 M Ammonium acetate 0.1 M MES 6.5 30 %v/v Glycerol ethoxylate (MIDAS 2-31)	分辨率 3.62 Å R-free 0.369
8W4L Crystal structure of closed conformation of human immunoglobulin Fc in presence of EndoSz 提交 2023-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 227–449（223 aa）链 B 227–449（223 aa）	未记录	CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM MES PH 6.0 200 mM Zinc acetate 10 % PEG 8000	分辨率 3.10 Å R-free 0.257
8W4M Crystal structure of open conformation of human immunoglobulin Fc in presence of EndoSz 提交 2023-08-24	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 227–449（223 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；100 mM MES PH 6.5 200 mM Zinc acetate 10 % PEG 8000	分辨率 2.18 Å R-free 0.255
8ZCK Serial Femtosecond Crystallography Structure of Fc Fragment of Human IgG1 from Biosimilar VEGF-Trap 提交 2024-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 239–446（208 aa）片段：Fc Fragment 链 B 239–446（208 aa）片段：Fc Fragment	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 2.00 Å R-free 0.227
8ZCL Ambient Temperature Crystal Structure of Fc Fragment of Human IgG1 from Biosimilar VEGF-Trap 提交 2024-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 239–446（208 aa）片段：Fc Fragment 链 B 239–446（208 aa）片段：Fc Fragment	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 2.60 Å R-free 0.236
8ZCM Cryogenic Temperature Crystal Structure of Fc Fragment of Human IgG1 from Biosimilar VEGF-Trap 提交 2024-04-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 239–446（208 aa）片段：Fc Fragment 链 B 239–446（208 aa）片段：Fc Fragment	未记录	GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 BATCH MODE；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 2.64 Å R-free 0.409
9BEX X-ray crystallography structural model of the immunoglobulin G1 (IgG1) Fc D270C K326C variant 提交 2024-04-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 AAA 218–449（232 aa）链 BBB 218–449（232 aa）	突变：D270C,K326C 突变：D270C,K326C	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；0.1M HEPES pH 7.5, 10% PEG 3350	分辨率 2.25 Å R-free 0.302
9CRT Crystal structure of IgG1 FC at natural pH 提交 2024-07-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 238–449（212 aa）链 B 238–449（212 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；295 K；0.1 M Hepes pH 7.5 and 20% PEG 20,000	分辨率 2.19 Å R-free 0.282
9CXL Crystal structure of IgG1 FC WT at pH 5.5 提交 2024-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 238–449（212 aa）链 B 238–449（212 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；1 M Ammonium sulfate, 0.1 M Sodium citrate pH 5.5	分辨率 2.33 Å R-free 0.279
9CY6 Crystal structure of IgG1 FC M252H at pH 7.5 提交 2024-08-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 238–449（212 aa）链 B 238–449（212 aa）	突变：M252H 突变：M252H	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Bis-tris propane pH 7.5, and 8% PEG8K	分辨率 2.06 Å R-free 0.282
9D06 Crystal structure of IgG1 FC M252R at pH 5.6 提交 2024-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 238–449（212 aa）链 B 238–449（212 aa）	突变：M252R 突变：M252R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；0.1M Sodium citrate pH 5.6, 20% Propanol and 20% PEG 4K	分辨率 2.33 Å R-free 0.279
9D09 Crystal structure of IgG1 FC M252H at pH 5.6 提交 2024-08-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 238–449（212 aa）链 B 238–449（212 aa）	突变：M252H 突变：M252H	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；295 K；0.1M Sodium citrate pH 5.6, 20% Propanol and 20% PEG 4000	分辨率 2.92 Å R-free 0.283
9D9Q Crystal structure of IgG1 FC M252R at pH 8.0 提交 2024-08-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 238–449（212 aa）链 B 238–449（212 aa）	突变：M252R 突变：M252R	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M Tris pH 8.0 and 0.08M Sodium formate and 7.5% PEG20K	分辨率 2.82 Å R-free 0.367
9DAZ Molecular basis of pathogenicity of the recently emerged FCoV-23 coronavirus. Complex of fAPN with FCoV-23 RBD 提交 2024-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 218–449（232 aa）链 C 218–449（232 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 ZN ZINC ION × 2	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9IIE Cryogenic Temperature Crystal Structure of Fc Fragment of Human IgG1 from Biosimilar VEGF-Trap 提交 2024-06-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 239–446（208 aa）片段：Fc Fragment 链 B 239–446（208 aa）片段：Fc Fragment	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；0.1M Bis-Tris pH 6.5, 25% w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 3.14 Å R-free 0.309
9K2Y Human IgG1 Fc fragments, mutant (2CT1.1) 提交 2024-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 227–449（223 aa）链 B 227–449（223 aa）链 C 227–449（223 aa）链 D 227–449（223 aa）	未记录	GAL beta-D-galactopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；50mM Sodium phosphate pH 7.0, 16% PEG 3350	分辨率 3.12 Å R-free 0.281
9K34 Human IgG1 Fc fragments, mutant (2CT1.9) 提交 2024-10-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 227–449（223 aa）链 B 227–449（223 aa）链 C 227–449（223 aa）链 D 227–449（223 aa）	未记录	FUL beta-L-fucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；50mM HEPES pH 7.0, 10% PEG 3350	分辨率 3.00 Å R-free 0.279
9KHH Structure of the complex of LGR4 with Norrin (2:2) 提交 2024-11-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 E 220–449（230 aa）链 F 220–449（230 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.65 Å
9LOC Cryo-EM structure of human FcRL5 bound to IgG-Fc 提交 2025-01-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：13-meric	链 B 218–443（226 aa）链 C 218–443（226 aa）链 D 218–443（226 aa）链 E 218–443（226 aa）链 F 218–443（226 aa）链 G 218–443（226 aa）链 H 218–443（226 aa）链 I 218–443（226 aa）链 J 218–443（226 aa）链 K 218–443（226 aa）链 L 218–443（226 aa）链 M 218–443（226 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 13	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.56 Å
9LOD Local structure of human FcRL5 bound to IgG-Fc 提交 2025-01-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 B 218–443（226 aa）链 C 218–443（226 aa）链 D 218–443（226 aa）链 E 218–443（226 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.2 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.16 Å
9MCX CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN IGG1 FC FRAGMENT-FC-GAMMA RECEPTOR IIA COMPLEX H131 VARIANT 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 227–449（223 aa）链 B 227–449（223 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；294 K；25% PEG 2000 MME, 0.1 M HEPES pH 7.5	分辨率 2.38 Å R-free 0.234
9MCY CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN IGG1 FC FRAGMENT-FC-GAMMA RECEPTOR IIA COMPLEX R131 VARIANT 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 227–449（223 aa）链 B 227–449（223 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；10% PEG 5000 MME, 12% isopropanol , 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.85 Å R-free 0.236
9MCY CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN IGG1 FC FRAGMENT-FC-GAMMA RECEPTOR IIA COMPLEX R131 VARIANT 提交 2024-12-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 C 227–449（223 aa）链 D 227–449（223 aa）	未记录	NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；294 K；10% PEG 5000 MME, 12% isopropanol , 0.1 M MES pH 6.5	分辨率 2.85 Å R-free 0.236
9OUV Crystal structure of human IGG1 FC fragment-FC-gamma receptor IIB complex 提交 2025-05-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 227–449（223 aa）链 B 227–449（223 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；294 K；150 mM sodium chloride 100 mM Tris-HCl pH 8.0 8% PEG 6000	分辨率 3.07 Å R-free 0.241
9UO5 Cryo-EM structure of the human IgG-Fc hexamer 提交 2025-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 218–443（226 aa）链 B 218–443（226 aa）链 C 218–443（226 aa）链 D 218–443（226 aa）链 E 218–443（226 aa）链 F 218–443（226 aa）链 G 218–443（226 aa）链 H 218–443（226 aa）链 I 218–443（226 aa）链 J 218–443（226 aa）链 K 218–443（226 aa）链 L 218–443（226 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.75 Å
9UOK Structure of the complex of LGR4_ECD with Norrin 提交 2025-04-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 E 220–449（230 aa）链 F 220–449（230 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.05 Å

共 105 个其他 PDB 条目、127 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IGG1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 110–223； UniProt 109–222 作者链 H； PDB构建体 110–223； UniProt 109–222

Fab light chain

Homo sapiens

UniProt V9HW34

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 L； UniProt 116–235	未记录	Fab heavy chain × 1 （P0DOX5） Gastric inhibitory polypeptide receptor × 1 （P48546）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% PEG 4000 and 20% isopropanol	分辨率 1.95 Å R-free 0.238
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 116–235	未记录	Fab heavy chain × 1 （P0DOX5） Gastric inhibitory polypeptide receptor × 1 （P48546） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% PEG 4000 and 20% isopropanol	分辨率 1.95 Å R-free 0.238

数据库中的同蛋白其他状态

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据

UniProt名称	V9HW34_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 95–214； UniProt 116–235 作者链 L； PDB构建体 95–214； UniProt 116–235

Gastric inhibitory polypeptide receptor

Homo sapiens

UniProt P48546

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 C； UniProt 22–138	片段：residues 22-138	Fab heavy chain × 1 （P0DOX5） Fab light chain × 1 （V9HW34）	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% PEG 4000 and 20% isopropanol	分辨率 1.95 Å R-free 0.238
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3）与蛋白拷贝数一致	链 D； UniProt 22–138	片段：residues 22-138	Fab heavy chain × 1 （P0DOX5） Fab light chain × 1 （V9HW34） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；10% PEG 4000 and 20% isopropanol	分辨率 1.95 Å R-free 0.238

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 6DKJ	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2QKH Crystal structure of the extracellular domain of human GIP receptor in complex with the hormone GIP 提交 2007-07-11	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 其他组合异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–138（115 aa）片段：Extracellular domain, residues 29-138	未记录	TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.2；288 K；100 mM HEPES, 1 M potassium-sodium tartrate, 9% Methyl-beta-cyclodextrin, pH 7.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K	分辨率 1.90 Å R-free 0.183
4HJ0 Crystal structure of the human GIPr ECD in complex with Gipg013 Fab at 3-A resolution 提交 2012-10-12	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–138（115 aa）片段：Extra-cellular Domain, UNP residues 24-138	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；0.02 M TAPS, 30% (w/v) PEG 10,000, pH 9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.311
4HJ0 Crystal structure of the human GIPr ECD in complex with Gipg013 Fab at 3-A resolution 提交 2012-10-12	构建体不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 B 24–138（115 aa）片段：Extra-cellular Domain, UNP residues 24-138	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 9；298 K；0.02 M TAPS, 30% (w/v) PEG 10,000, pH 9, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K	分辨率 3.00 Å R-free 0.311
7FIN Cryo-EM structure of the GIPR/GLP-1R/GCGR triagonist peptide 20-bound human GIPR-Gs complex 提交 2021-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 22–421（400 aa）	突变：T345F	CLR CHOLESTEROL × 7 GGL GAMMA-L-GLUTAMIC ACID × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
7FIY Cryo-EM structure of the tirzepatide-bound human GIPR-Gs complex 提交 2021-08-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 22–421（400 aa）	突变：T345F	CLR CHOLESTEROL × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
7RA3 cryo-EM of human Gastric inhibitory polypeptide receptor GIPR bound to GIP 提交 2021-06-29	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 R 22–466（445 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.24 Å
7RBT cryo-EM structure of human Gastric inhibitory polypeptide receptor GIPR bound to tirzepatide 提交 2021-07-06	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 R 22–466（445 aa）	未记录	41Y 2-fluoro-4-[(1R)-6-methoxy-1-methyl-2-{(1S)-1-[4-(propan-2-yl)phenyl]ethyl}-1,2,3,4-tetrahydroisoquinolin-5-yl]-6-[(2-methylpropyl)amino]phenol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
7VAB Cryo-EM structure of the non-acylated tirzepatide (LY3298176)-bound human GIPR-Gs complex 提交 2021-08-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 22–421（400 aa）	突变：T345F	CLR CHOLESTEROL × 6	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
8ITL Cryo-EM structure of GIPR splice variant 1 (SV1) in complex with Gs protein 提交 2023-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 22–385（364 aa）	突变：T309F	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.23 Å
8ITM Cryo-EM structure of GIPR splice variant 2 (SV2) in complex with Gs protein 提交 2023-03-22	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 58–385（328 aa）	突变：T284F	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.13 Å
8WA3 Cryo-EM structure of peptide free and Gs-coupled GIPR 提交 2023-09-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 22–421（400 aa）	突变：T345F	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.86 Å
8YW4 Cryo-EM structure of the retatrutide-bound human GIPR-Gs complex 提交 2024-03-29	构建体不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 22–421（400 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.26 Å

共 11 个其他 PDB 条目、12 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GIPR_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–117； UniProt 22–138 作者链 D； PDB构建体 1–117； UniProt 22–138

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	6dkj
沉积日期 deposition_date	2018-05-29
结构标题 title	human GIPR ECD and Fab complex
关键词 keywords	GPCR, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	42.86 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	42.93 Å
零角强度 I(0) i0	218939000.00
分子量 molecular_weight	117320.0 kDa
排除体积 excluded_volume	145470 Å³
包络体积 envelope_volume	202760 Å³
水化壳体积 shell_volume	44124 Å³
包络直径 envelope_diameter	160.9 Å
壳层 Rg shell_rg	42.03 Å
包络 Rg envelope_rg	42.65 Å
形状 Rg shape_rg	42.96 Å
总 Rg total_rg	42.77 Å
总原子数 total_atoms	8267
残基数 n_residues	1077
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	156.0 Å
Rg (实空间) rg_real	43.39 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	2.18 Å
I(0) (实空间) i0_real	2.1890e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	4.2270e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	42.86 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	218800000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7884
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	37.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.622
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.134
角度范围 angular_range	— – 0.1850 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	16080000.0000
实空间数据点数 n_real_points	38
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.639; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.639; Smooth: 0.689

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Fab heavy chain
分子量 formula_weight	23806.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,A
原子数 atom_count	9287

QVQLVESGGGVVQPGRSLRLSCAASGFTFSNYGMHWVRQAPGEGLEWVAAIWFDASDKYYADAVKGRFTISRDNSKNTLYLQMNSLRAEDTAVYYCARDQAIFGVVPDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Fab light chain
分子量 formula_weight	23206.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,B

EIVMTQSPATLSVSPGERATLSCRASQSVSSNLAWYQQKPGQAPRLLIYGAATRATGIPARVSGSGSGTEFTLTISSLQSEDFAVYYCQQYNNWPLTFGGGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Gastric inhibitory polypeptide receptor
分子量 formula_weight	13447.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

RAETGSKGQTAGELYQRWERYRRECQETLAAAEPPSGLACNGSFDMYVCWDYAAPNATARASCPWYLPWHHHVAAGFVLRQCGSDGQWGLWRDHTQCENPEKNEAFLDQRLILERLQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Cricetulus griseus

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1003

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d6dkja_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d6dkjb1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d6dkjb2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

结构域编号 domain_id	d6dkjh_
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d6dkjl1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.1 — V set domains (antibody variable domain-like)

结构域编号 domain_id	d6dkjl2
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamily	b.1.1 — Immunoglobulin
家族 Family family	b.1.1.2 — C1 set domains (antibody constant domain-like)

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	6dkjA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	6dkjB01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	6dkjB02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	6dkjC01
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1240 — Hormone receptor fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain

结构域编号 domain_id	6dkjD01
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	1240 — Hormone receptor fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — GPCR, family 2, extracellular hormone receptor domain

结构域编号 domain_id	6dkjH02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	6dkjL01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	6dkjL02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	55.907 Å
晶胞边长 b length_b	63.649 Å
晶胞边长 c length_c	159.099 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.56 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.950 Å
最低分辨率 resolution_low	19.719 Å
R 因子 r_factor	0.2005
R_work r_work	0.1986
R_free r_free	0.2384

fit	/app/data/saxs_computation/dk/6dkj/6dkj.fit
pddf	/app/data/pr_computation/dk/6dkj/6dkj.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/dk/6dkj/6dkj.dat

human GIPR ECD and Fab complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fab heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Fab light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Gastric inhibitory polypeptide receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)