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6exv

Structure of mammalian RNA polymerase II elongation complex inhibited by Alpha-amanitin

Method: ELECTRON MICROSCOPY
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1

物种未注明

UniProt I3LJR4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 7b7u 7pks 8rbz 9fyx 9g0a

共 6 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LJR4_PIG
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–1970； UniProt 1–1959

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2

物种未注明

UniProt I3LGP4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7nvr 7nvs 7nvt 7nvu 7nvy 7nvz 7nw0 7okx

共 51 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LGP4_PIG
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–1167； UniProt 85–1251

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3

物种未注明

UniProt I3LCH3

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7b0y 7b7u 7edx 7eg7 7eg8 7eg9 7egb 7egc

共 86 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LCH3_PIG
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3

物种未注明

UniProt A0A287ADR4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7b0y 7nvr 7nvs 7nvt 7nvu 7nvy 7nvz 7nw0

共 59 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A287ADR4_PIG
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1

物种未注明

UniProt I3LSI7

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7b0y 7b7u 7eg7 7eg8 7eg9 7nvr 7nvs 7nvt

共 67 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LSI7_PIG
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1

物种未注明

UniProt F1SKN8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7b0y 7b7u 7nvr 7nvs 7nvt 7nvu 7nvy 7nvz

共 43 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1SKN8_PIG
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7

物种未注明

UniProt I3LJZ9

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7b0y 7nvr 7nvs 7nvt 7nvu 7nvy 7nvz 7nw0

共 28 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LJZ9_PIG
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3

物种未注明

UniProt I3LCB2

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7b0y 8a3y 8a40 8bvw 8byq 8bz1 8oeu 8oev

共 62 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LCB2_PIG
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P60899

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7b0y 7b7u 7edx 7eg7 7eg8 7eg9 7ega 7egb

共 112 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB9_PIG
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4

物种未注明

UniProt F1RKE4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7b0y 8a3y 8a40 8bvw 8byq 8bz1 8oeu 8oev

共 64 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 F1RKE4_PIG
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4

物种未注明

UniProt I3LN51

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） AMATOXIN × 1 （P85421） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
6exv 6gmh 6gml 6ted 7b0y 7b7u 7nvr 7nvs 7nvt 7nvu 7nvy 7nvz

共 43 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I3LN51_PIG
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58

AMATOXIN

物种未注明

UniProt P85421

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 其他组合 异源复合物 蛋白 13 DNA 2 RNA 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB1 × 1 （I3LJR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB2 × 1 （I3LGP4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （I3LCH3） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB3 × 1 （A0A287ADR4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （I3LSI7） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC1 × 1 （F1SKN8） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASE II SUBUNIT RPB7 × 1 （I3LJZ9） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC3 × 1 （I3LCB2） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P60899） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （F1RKE4） DNA-DIRECTED RNA POLYMERASES I, II, AND III SUBUNIT RPABC4 × 1 （I3LN51） DNA (25-MER) × 1 ;RNA (5'-R(P*CP*AP*UP*AP*AP*AP*GP*AP*CP*CP*AP*GP*GP*C)-3') ; × 1 DNA (36-MER) × 1 ZINC ION × 8 MAGNESIUM ION × 1 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
1k83 2vum 3cqz 6exv 8wak 8wal 8wan 8wao 8wap 8waq 8war 8was

共 20 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AAMAT_AMAPH
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–8； UniProt 1–8

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6exv
沉积日期 deposition_date2017-11-09
结构标题 titleStructure of mammalian RNA polymerase II elongation complex inhibited by Alpha-amanitin
关键词 keywordsInhibitor, elongation, active site, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

6exv__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

6exv__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 109 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

6exv__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）51.67 Å
Rg（电子密度）51.41 Å
总 Rg51.55 Å
原子数32717
残基数3976
排除体积578540 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 6exv__assembly_1__model_1 hexadecameric （16） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

CATH v4.4 (16 domains)

结构域编号 domain_id6exvA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology274 — Enzyme I; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase Rpb1, domain 3
结构域编号 domain_id6exvA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id6exvB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2
结构域编号 domain_id6exvC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit
结构域编号 domain_id6exvC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain
结构域编号 domain_id6exvD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — RNA Polymerase II, Rpb4 subunit
结构域编号 domain_id6exvE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1340 — Dna-directed Rna Polymerases I, Ii, And Iii 27 Kd Polypeptide; Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, Rpb5, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6exvE02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — RPB5-like RNA polymerase subunit
结构域编号 domain_id6exvF00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase subunit, RPB6/omega
结构域编号 domain_id6exvG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 — RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_id6exvG02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id6exvH01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id6exvI02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id6exvJ00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
结构域编号 domain_id6exvK00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit
结构域编号 domain_id6exvL00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — RNA polymerase ii, chain L
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7. 引用文献 (1)