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6p4g

Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 266.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

uS2

物种未注明

UniProt G1TWL4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 1–295 未记录 18S rRNA × 1 eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 B 1–295（295 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 B 1–295（295 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 B 1–295（295 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å

共 3 个其他 PDB 条目、3 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TWL4_RABIT
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–295； UniProt 1–295

eS1

物种未注明

UniProt G1SS70

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–264 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 B 1–264（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 CC 1–264（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 CC 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BB 22–233（212 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 C1 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 C2 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 C1 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 C2 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 BB 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 BB 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 BB 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 BB 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 u 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 u 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 u 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 u 21–233（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 C1 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 V3 21–233（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 V3 21–233（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 C2 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS01 21–233（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS01 21–233（213 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 BB 23–233（211 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 BB 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SM 1–264（264 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 SM 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 C3 21–233（213 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS01 21–233（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS01 21–233（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS01 21–233（213 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 B 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 u 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 u 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 C 1–264（264 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 u 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Aa 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 M1 1–264（264 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 BB 1–264（264 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 107 个其他 PDB 条目、107 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SS70_RABIT
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–264； UniProt 1–264

uS5

物种未注明

UniProt G1SWM1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–254 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 DD 1–254（254 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 D 1–254（254 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 D 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 D 1–254（254 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 v 1–292（292 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 CC 1–292（292 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 CC 1–292（292 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 CC 1–292（292 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 CC 1–292（292 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 CC 1–292（292 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 CC 1–292（292 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SWM1_RABIT
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–255； UniProt 1–254

uS3

物种未注明

UniProt G1TNM3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–281 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 DD 39–265（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 DD 39–265（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 DD 39–265（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 D 1–243（243 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 D 1–243（243 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 D 1–243（243 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 EE 1–281（281 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 EE 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 E1 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 E2 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 E1 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 E2 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 w 39–266（228 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 w 39–266（228 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 DD 39–266（228 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 w 39–266（228 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 E1 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 F 39–281（243 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 F 39–265（227 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 F 39–265（227 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Y3 39–265（227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Y3 39–265（227 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 E 39–281（243 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 E 39–281（243 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 E2 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 DD 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 DD 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS03 39–266（228 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS03 39–266（228 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 DD 40–266（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 DD 39–266（228 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SO 1–281（281 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 SO 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 E3 39–266（228 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 F 39–265（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 F 39–265（227 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DB 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DB 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DB 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DB 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 DB 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 DB 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 DD 39–266（228 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS03 39–266（228 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS03 39–266（228 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS03 39–266（228 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 F 39–281（243 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 F 39–281（243 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 F 39–281（243 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 w 39–281（243 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 w 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 E 1–281（281 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 w 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ac 1–281（281 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 O1 39–281（243 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 F 1–243（243 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 F 1–243（243 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 F 1–243（243 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 DD 39–281（243 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 116 个其他 PDB 条目、116 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1TNM3_RABIT
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–281； UniProt 1–281

eS4

物种未注明

UniProt G1TK17

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–263 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 EE 2–263（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 EE 2–263（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 EE 2–263（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 E 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 E 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 E 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 I 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 FF 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 x 2–263（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 x 2–263（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 x 2–263（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 x 2–263（262 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 F1 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 j3 2–263（262 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 j3 2–130（129 aa）
链 j3 131–263（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 M 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 M 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 F 2–263（262 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 F3 2–263（262 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ad 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ad 1–263（263 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EB 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EB 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EB 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EB 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 EB 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 EB 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ad 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ad 1–263（263 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ad 1–263（263 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 x 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 x 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 F 1–263（263 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ad 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ad 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 P1 1–263（263 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 G 1–263（263 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 EE 1–263（263 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 87 个其他 PDB 条目、87 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1TK17_RABIT
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–263； UniProt 1–263

uS7

物种未注明

UniProt G1TFM5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 1–204 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 FF 14–204（191 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 FF 14–204（191 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 FF 14–204（191 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 F 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 F 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 F 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 F 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 U 14–204（191 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 GG 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 GG 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BF 15–204（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 G1 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 G2 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 G1 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 G2 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 y 14–204（191 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 y 14–204（191 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 BB 14–204（191 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 y 14–204（191 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 G1 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 H 14–204（191 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 G2 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS05 14–204（191 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS05 14–204（191 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 FF 14–204（191 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 FF 14–204（191 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 G3 14–204（191 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8Q7Z Structure of the G. gallus 80S non-rotated ribosome 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 494 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8Q87 Structure of the G. gallus 80S rotated ribosome in complex with eEF2 and SERBP1 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 492 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FB 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FB 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FB 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FB 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 FB 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 FB 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS05 14–204（191 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS05 14–204（191 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS05 14–204（191 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 F 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 H 1–204（204 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 H 1–204（204 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 y 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 y 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 G 1–204（204 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 y 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ae 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Q1 1–204（204 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 H 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 H 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 H 1–204（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 FF 1–204（204 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 117 个其他 PDB 条目、117 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1TFM5_RABIT
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–204； UniProt 1–204

eS6

物种未注明

UniProt G1TM55

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 1–249 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 G 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 G 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 G 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 G 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 q 1–237（237 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 HH 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 HH 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BG 1–232（232 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 H1 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 H2 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 H1 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 H2 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 z 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 z 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 z 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 z 1–237（237 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 H1 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 I 1–237（237 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 I 1–237（237 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 I 1–237（237 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 b3 1–237（237 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 b3 1–237（237 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS06 1–237（237 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS06 1–237（237 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 H3 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GB 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GB 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GB 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GB 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 GB 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 GB 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 GG 1–237（237 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS06 1–237（237 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS06 1–237（237 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS06 1–237（237 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 G 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 I 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 I 1–249（249 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 I 1–249（249 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 z 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 z 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 H 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 z 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Af 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 R1 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 I 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 I 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 I 1–249（249 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 GG 1–249（249 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 117 个其他 PDB 条目、117 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1TM55_RABIT
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249

eS7

物种未注明

UniProt G1SVB0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–194 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 HH 5–193（189 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 HH 5–193（189 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 HH 5–193（189 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 H 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 H 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 H 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 H 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 X 5–194（190 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 II 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 II 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BH 12–194（183 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 I1 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 I2 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 I1 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 I2 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 I 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 I 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 I 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 I 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 BB 6–194（189 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 BB 6–194（189 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 y 6–194（189 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 BB 6–194（189 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 I1 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 I 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 I 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 J 241–432（192 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 J 5–194（190 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 J 5–194（190 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 I 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 I 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 I2 5–194（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 HH 5–194（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ag 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 HH 1–432（432 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SS 1–432（432 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 SS 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 J 5–194（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 J 5–194（190 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 HB 1–432（432 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 HB 1–432（432 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 HB 1–432（432 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 HB 1–432（432 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 HB 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 HB 1–432（432 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS07 6–194（189 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS07 6–194（189 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS07 6–194（189 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 H 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 BB 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 BB 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 I 1–432（432 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 BB 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ag 1–432（432 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 S1 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 HH 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 116 个其他 PDB 条目、116 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SVB0_RABIT
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–194； UniProt 1–194

eS8

物种未注明

UniProt G1TJW1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–208 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 II 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 II 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 II 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 I 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 I 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 I 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 o 2–207（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 JJ 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 JJ 2–207（206 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–207（207 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 CC 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 CC 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 CC 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 CC 2–207（206 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 J1 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 K 2–207（206 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 K 2–207（206 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 K 2–207（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 c3 2–207（206 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 c3 2–207（206 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 J2 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 II 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS08 2–207（206 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS08 2–207（206 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 II 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 II 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 J3 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 K 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 K 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 IB 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 IB 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 IB 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 IB 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 IB 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 IB 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 II 2–207（206 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS08 2–207（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS08 2–207（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS08 2–207（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 I 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 K 1–208（208 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 K 1–208（208 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 K 1–208（208 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 CC 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 J 1–208（208 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ah 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 T1 1–208（208 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 K 2–207（206 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 II 1–208（208 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 101 个其他 PDB 条目、101 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TJW1_RABIT
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–208； UniProt 1–208

uS4

物种未注明

UniProt B7NZS8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–194 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 K 7–188（182 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 KK 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 KK 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BJ 2–180（179 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 K1 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 K2 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 K1 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 K2 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 DD 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 DD 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 XX 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 DD 2–186（185 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 K1 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 L 7–188（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 L 7–188（182 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 L 7–188（182 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 d3 2–186（185 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 d3 2–186（185 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS09 2–186（185 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS09 2–186（185 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SU 1–194（194 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 SU 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 K3 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 L 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 L 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8Q7Z Structure of the G. gallus 80S non-rotated ribosome 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 494 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8Q87 Structure of the G. gallus 80S rotated ribosome in complex with eEF2 and SERBP1 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 492 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 JB 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 JB 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 JB 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 JB 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 JB 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 JB 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 JJ 2–186（185 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS09 2–186（185 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS09 2–186（185 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS09 2–186（185 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 J 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 L 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 L 1–194（194 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 L 1–194（194 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 DD 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 DD 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 K 1–194（194 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 DD 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ai 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 U1 1–194（194 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 L 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 L 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 L 1–194（194 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 JJ 1–194（194 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 123 个其他 PDB 条目、123 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 B7NZS8_RABIT
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–194； UniProt 1–194

eS10

物种未注明

UniProt G1TPV3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 1–149 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–98（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–98（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–98（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 K 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 t 1–98（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BK 1–98（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 L1 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 L2 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 L1 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 L2 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 KK 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 KK 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 KK 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 KK 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 SS 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 SS 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 SS 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 SS 1–96（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 L1 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 M 1–98（98 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 M 1–98（98 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 L 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 L 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS10 1–96（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS10 1–96（96 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 KK 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 KK 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SV 1–165（165 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 SV 1–165（165 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 L3 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 M 1–98（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 M 1–98（98 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 L 1–149（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 KB 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 KB 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 KB 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 KB 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 KB 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 KB 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 KK 1–96（96 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS10 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS10 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS10 1–96（96 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 K 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 M 1–165（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 SS 1–165（165 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 SS 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 SS 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Aj 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 KK 1–165（165 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1TPV3_RABIT
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–149； UniProt 1–149

uS17

物种未注明

UniProt G1TRM4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 M； UniProt 1–158 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 LL 2–153（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 LL 2–153（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 LL 2–153（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 L 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 L 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 L 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 L 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 G 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 MM 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 MM 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BL 6–158（153 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 M1 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 M2 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 M1 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 M2 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 EE 3–153（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 EE 3–153（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 EE 3–153（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 EE 3–153（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 M1 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 G3 2–154（153 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 G3 2–154（153 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 O 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 O 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 M2 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS11 3–153（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS11 3–153（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 LL 3–153（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 LL 3–153（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SW 1–158（158 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 SW 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 M3 3–153（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 LB 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 LB 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 LB 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 LB 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 LB 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 LB 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS11 3–153（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS11 3–153（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS11 3–153（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 L 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 EE 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 EE 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 M 1–158（158 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 EE 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ak 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 W1 1–158（158 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 N 1–158（158 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 LL 1–158（158 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1TRM4_RABIT
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–158； UniProt 1–158

eS12

物种未注明

UniProt G1SFR8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 N； UniProt 1–132 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 MM 9–132（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 MM 9–132（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 MM 9–132（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 M 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 M 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 M 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 M 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 r 9–132（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 NN 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 NN 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BM 11–130（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 N1 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 N2 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 N1 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 N2 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 MM 14–130（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 MM 14–130（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 MM 14–130（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 MM 14–130（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 RR 14–130（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 RR 14–130（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 RR 14–130（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 RR 14–130（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 N1 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 O 9–132（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 e3 9–132（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 e3 9–132（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 N2 10–132（123 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 MM 10–132（123 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 MM 9–132（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS12 14–130（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS12 14–130（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SX 1–132（132 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 SX 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 N3 14–130（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MB 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MB 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MB 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MB 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 MB 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 MB 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 MM 14–130（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS12 14–130（117 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS12 14–130（117 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS12 14–130（117 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 M 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 RR 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 N 1–132（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 RR 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Al 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 X1 1–132（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 O 1–132（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 MM 1–132（132 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 121 个其他 PDB 条目、121 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1SFR8_RABIT
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

uS15

物种未注明

UniProt G1SP51

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 O； UniProt 1–151 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 NN 2–151（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 NN 2–151（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 NN 2–151（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Z 2–151（150 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 OO 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 OO 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BN 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 O1 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 O2 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 O1 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 O2 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 NN 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 NN 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 NN 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 NN 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 QQ 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 QQ 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 QQ 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 QQ 2–150（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 O1 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 P 2–151（150 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 P 2–151（150 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 P 2–151（150 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 F3 2–151（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 F3 2–151（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 O2 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 NN 2–151（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS13 2–150（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS13 2–150（149 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 NN 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 NN 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 O3 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 P 2–151（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 P 2–151（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 NB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 NB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 NB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 NB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 NB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 NB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 NN 2–150（149 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS13 2–150（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS13 2–150（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS13 2–150（149 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 N 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 QQ 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 QQ 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 QQ 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Am 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Y1 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 NN 1–151（151 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 121 个其他 PDB 条目、121 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SP51_RABIT
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151

uS11

物种未注明

UniProt G1U472

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 P； UniProt 1–151 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 O 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 P 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 X 1–168（168 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 X 1–168（168 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 OO 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 P 1–168（168 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS14 33–168（136 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS14 33–167（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 OO 33–168（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 OO 33–168（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 An 18–168（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 An 18–168（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 OO 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 OO 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 OB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 OB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 OB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 OB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 OB 1–168（168 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 OB 1–151（151 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 OO 33–168（136 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 46 个其他 PDB 条目、46 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1U472_RABIT
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 1–151； UniProt 1–151

uS19

物种未注明

UniProt G1U0Q2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 1–145 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 PP 4–130（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 PP 4–130（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 PP 4–130（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 P 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 P 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 P 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 n 4–130（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 QQ 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 QQ 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 Q1 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Q2 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 Q1 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 Q2 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 PP 12–131（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 PP 12–131（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 PP 12–131（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 PP 12–136（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 WW 12–131（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 WW 12–131（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 9 12–131（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 WW 12–131（120 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Q1 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 R 4–138（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 A3 4–130（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 A3 4–130（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Q2 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS15 12–131（120 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS15 12–131（120 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 PP 12–131（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 PP 12–131（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Sa 1–145（145 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Sa 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 Q3 12–140（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 PB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 PB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 PB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 PB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 PB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 PB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 PP 12–131（120 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS15 12–131（120 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS15 12–131（120 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS15 12–131（120 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 WW 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 WW 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Q 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 WW 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ao 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 a1 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 R 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 121 个其他 PDB 条目、121 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1U0Q2_RABIT
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

uS9

物种未注明

UniProt G1SGX4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 R； UniProt 1–172 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 QQ 32–172（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 QQ 32–172（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 QQ 32–172（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 Q 27–172（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 Q 27–172（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 Q 27–172（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Q 27–172（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 H 32–172（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 RR 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 RR 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 R1 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 R2 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 R1 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 R2 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 UU 31–172（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 UU 31–172（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 UU 31–172（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 UU 31–172（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 R1 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 S 32–172（141 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 S 32–172（141 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 S 32–172（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 B3 32–172（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 B3 32–172（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 R 27–172（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 R 27–172（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 R2 16–172（157 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ap 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Sb 1–172（172 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Sb 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 R3 31–172（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 S 32–172（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 S 32–172（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 QB 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 QB 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 QB 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 QB 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 QB 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 QB 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 QQ 31–172（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS16 31–172（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS16 31–172（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS16 31–172（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 Q 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 S 27–172（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 S 27–172（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S 27–172（146 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 UU 27–172（146 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 UU 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 R 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 UU 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ap 1–172（172 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 b1 27–172（146 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 S 1–146（146 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 QQ 27–172（146 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1SGX4_RABIT
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

eS17

物种未注明

UniProt G1TU13

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 S； UniProt 1–135 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 R 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 R 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 R 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 e 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 SS 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 SS 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BR 2–126（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 S1 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 S2 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 S1 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 S2 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 RR 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 RR 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 RR 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 RR 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 KK 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 KK 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 YY 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 KK 2–133（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 S1 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 T 1–126（126 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 C3 1–129（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 C3 1–129（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 RR 1–129（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS17 2–133（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS17 2–133（132 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 RR 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 RR 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Sc 1–135（135 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Sc 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 S3 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 RB 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 RB 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 RB 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 RB 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 RB 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 RB 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 RR 2–133（132 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS17 2–133（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS17 2–133（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS17 2–133（132 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 R 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 KK 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 KK 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 S 1–135（135 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 KK 2–135（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Aq 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 c1 1–135（135 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 T 1–135（135 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 RR 1–135（135 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TU13_RABIT
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 S； PDB构建体 1–135； UniProt 1–135

uS13

物种未注明

UniProt G1TPG3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 T； UniProt 1–152 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 S 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 S 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 S 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 S 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 L 6–142（137 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 TT 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 TT 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BS 4–142（139 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 T1 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 T2 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 T1 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 T2 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 SS 2–145（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 SS 2–145（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 SS 2–145（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 SS 2–145（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 T1 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 U 6–147（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 G5 6–142（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 G5 6–142（137 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 T2 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 SS 6–142（137 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ar 1–152（152 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ar 1–152（152 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ar 1–152（152 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ar 1–152（152 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS18 2–145（144 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS18 2–145（144 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 SS 2–145（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 SS 2–145（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ar 1–152（152 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ar 1–152（152 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8Q7Z Structure of the G. gallus 80S non-rotated ribosome 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 Ar 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 494 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8Q87 Structure of the G. gallus 80S rotated ribosome in complex with eEF2 and SERBP1 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Ar 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 492 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 SB 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 SB 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 SB 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 SB 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 SB 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 SB 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 SS 2–145（144 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS18 2–145（144 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS18 2–145（144 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS18 2–145（144 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 S 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ar 2–152（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ar 2–152（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ar 2–152（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 II 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 II 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 T 1–152（152 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 II 1–152（152 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ar 2–152（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ar 2–152（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 d1 2–152（151 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 U 1–152（152 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 SS 1–152（152 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 116 个其他 PDB 条目、116 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TPG3_RABIT
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 T； PDB构建体 1–152； UniProt 1–152

eS19

物种未注明

UniProt G1TN62

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 U； UniProt 1–145 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 TT 4–144（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 TT 4–144（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 TT 4–144（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 T 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 T 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 T 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 R 4–144（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 UU 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 UU 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 PP 3–143（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 PP 3–143（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 PP 3–143（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 PP 3–143（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 U1 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 V 4–144（141 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 V 1–145（145 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 V 4–144（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 H5 4–144（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 H5 4–144（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 U2 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 U3 3–143（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 As 1–145（145 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 V 4–144（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 V 4–144（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 As 1–145（145 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 TB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 TB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 TB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 TB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 TB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 TB 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 TT 3–143（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS19 3–143（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS19 3–143（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS19 3–143（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 V 1–145（145 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 As 1–145（145 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 As 1–145（145 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 As 1–145（145 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 V 1–145（145 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 1–145（145 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 U 1–145（145 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 PP 1–145（145 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 As 1–145（145 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 As 1–145（145 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 V 4–144（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 V 4–144（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 V 4–144（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 TT 1–145（145 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 100 个其他 PDB 条目、100 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1TN62_RABIT
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–145； UniProt 1–145

uS10

物种未注明

UniProt G1SIZ2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 V； UniProt 1–119 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 UU 16–119（104 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 UU 16–119（104 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 UU 16–119（104 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 U 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 U 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 U 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 U 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 VV 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 VV 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 V1 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 V2 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 V1 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 V2 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 V1 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS20 18–117（100 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS20 18–117（100 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 UU 18–117（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 UU 18–117（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Sf 1–119（119 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Sf 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 UB 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 UB 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 UB 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 UB 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 UB 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 UB 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 UU 18–117（100 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS20 18–117（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS20 18–117（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS20 18–117（100 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 U 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 GG 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 GG 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 V 1–119（119 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 GG 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 At 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 f1 1–119（119 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 W 1–119（119 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 UU 1–119（119 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 107 个其他 PDB 条目、107 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1SIZ2_RABIT
Isoform —
PDB实体 22
链与序列区间 作者链 V； PDB构建体 1–119； UniProt 1–119

eS21

物种未注明

UniProt G1TM82

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 W； UniProt 1–83 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 V 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 V 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 V 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 b 1–82（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 WW 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 X 1–82（82 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 X 1–82（82 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 X 1–82（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS21 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS21 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Au 24–80（57 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 VB 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 VB 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 VB 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 VB 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 VB 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 VB 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS21 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS21 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS21 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 V 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 X 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Au 1–83（83 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Au 1–83（83 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Au 1–83（83 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 HH 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 W 1–83（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 HH 1–83（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Au 1–83（83 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Au 1–83（83 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 g1 1–83（83 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 X 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 X 1–82（82 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 X 1–83（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 VV 1–83（83 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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UniProt名称 G1TM82_RABIT
Isoform —
PDB实体 23
链与序列区间 作者链 W； PDB构建体 1–83； UniProt 1–83

uS8

物种未注明

UniProt G1TG89

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 X； UniProt 1–130 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 a 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 XX 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 XX 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 X1 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 X2 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 X1 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 X2 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 TT 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 TT 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 TT 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 TT 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 X1 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Y 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 J5 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 J5 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS22 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS22 2–130（129 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Sh 1–130（130 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Sh 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 X3 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 WB 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 WB 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 WB 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 WB 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 WB 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 WB 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 WW 2–130（129 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS22 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS22 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS22 2–130（129 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 W 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 TT 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 TT 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 X 1–130（130 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 TT 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Av 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 h1 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 Y 1–130（130 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 WW 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 121 个其他 PDB 条目、121 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TG89_RABIT
Isoform —
PDB实体 24
链与序列区间 作者链 X； PDB构建体 1–130； UniProt 1–130

uS12

物种未注明

UniProt G1SZ47

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Y； UniProt 1–143 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 XX 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 XX 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 XX 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 X 2–143（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 X 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 X 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 X 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 YY 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 YY 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BX 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 VV 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 VV 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 VV 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 VV 2–142（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 Z 1–143（143 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 Z 1–142（142 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Z 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 T3 2–142（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 T3 2–142（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 c 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 c 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Y2 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 XX 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 XX 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS23 2–142（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS23 2–142（141 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 XX 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 XX 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Si 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Si 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 Y3 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 Z 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 Z 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 XB 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 XB 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 XB 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 XB 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 XB 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 XB 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 XX 2–142（141 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS23 2–142（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS23 2–142（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS23 2–142（141 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 X 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 Z 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Z 1–143（143 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Z 1–143（143 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 VV 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 VV 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Y 1–143（143 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 VV 1–143（143 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Aw 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 i1 1–143（143 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Z 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Z 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 Z 1–143（143 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 XX 1–143（143 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 106 个其他 PDB 条目、106 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SZ47_RABIT
Isoform —
PDB实体 25
链与序列区间 作者链 Y； PDB构建体 1–143； UniProt 1–143

eS24

物种未注明

UniProt G1T3D8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 Z； UniProt 1–134 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 YY 3–128（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 YY 3–128（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 YY 3–128（126 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 ZZ 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 ZZ 1–134（134 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Z 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Z 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Z 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 Z 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 Z 1–134（134 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 Z 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 Z 1–134（134 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS24 4–127（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS24 4–127（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 YY 4–127（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 YY 4–127（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 Z3 4–127（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 YB 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 YB 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 YB 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 YB 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 YB 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 YB 1–131（131 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 YY 4–127（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS24 4–127（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS24 4–127（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS24 4–127（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 Z 1–131（131 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ax 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 YY 1–130（130 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 60 个其他 PDB 条目、60 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 G1T3D8_RABIT
Isoform —
PDB实体 26
链与序列区间 作者链 Z； PDB构建体 1–134； UniProt 1–134

eS25

物种未注明

UniProt G1TDB3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 a； UniProt 1–125 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 Z 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 Z 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 Z 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 Z 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 W 41–115（75 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 aa 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 aa 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 BZ 28–113（86 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 a1 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 a2 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 a1 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 a2 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 a 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 a 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 a 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 a 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 a 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 OO 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 OO 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 OO 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 OO 41–115（75 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 a1 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 a 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 i 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 n 1–124（124 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 n 41–115（75 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 h 41–115（75 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 M3 41–115（75 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 M3 41–115（75 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 a 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 a 1–125（125 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 ZZ 3–124（122 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 ZZ 3–124（122 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 ZZ 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS25 41–115（75 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS25 41–115（75 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 a3 40–114（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 n 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 n 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 ZB 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 ZB 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 ZB 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 ZB 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 ZB 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 ZB 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 ZZ 41–115（75 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS25 41–115（75 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS25 41–115（75 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 Z 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 n 1–124（124 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 n 1–124（124 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 n 1–124（124 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 OO 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 OO 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 a 1–124（124 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 OO 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Ay 1–124（124 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 k1 1–124（124 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ZZ 1–125（125 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 113 个其他 PDB 条目、113 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TDB3_RABIT
Isoform —
PDB实体 27
链与序列区间 作者链 a； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

eS26

物种未注明

UniProt G1TFE8

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 b； UniProt 1–115 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 a 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 a 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 a 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 k 2–100（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 bb 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 b 2–100（99 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS26 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS26 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Aa 2–102（101 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Aa 2–102（101 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 AC 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 AC 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 AC 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 AC 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 AC 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AC 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 aa 2–102（101 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS26 2–102（101 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS26 2–102（101 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS26 2–102（101 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 a 1–115（115 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 LL 1–115（115 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 b 2–102（101 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 b 1–115（115 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 aa 1–115（115 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 65 个其他 PDB 条目、65 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TFE8_RABIT
Isoform —
PDB实体 28
链与序列区间 作者链 b； PDB构建体 1–115； UniProt 1–115

eS27

物种未注明

UniProt G1TZ76

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 c； UniProt 1–84 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 bb 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 bb 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 bb 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 b 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 b 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 b 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 b 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 Y 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 cc 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 cc 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 c1 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 c2 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 c1 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 c2 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 JJ 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 JJ 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 JJ 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 JJ 2–84（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 c1 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 L3 2–84（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 L3 2–84（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 e 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 e 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 c2 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS27 2–84（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS27 2–84（83 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Bb 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Bb 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 c3 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BC 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BC 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BC 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 BC 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 BC 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 BC 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 bb 2–84（83 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS27 2–84（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS27 2–84（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS27 2–84（83 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 b 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 JJ 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 JJ 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 JJ 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 AA 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 B1 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 c 1–84（84 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 bb 1–84（84 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 116 个其他 PDB 条目、116 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TZ76_RABIT
Isoform —
PDB实体 29
链与序列区间 作者链 c； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

eS28

物种未注明

UniProt G1TIB4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 d； UniProt 1–69 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 cc 8–68（61 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 cc 8–68（61 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 cc 8–68（61 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 c 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 c 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 c 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 c 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 l 5–68（64 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 dd 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 dd 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bc 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 d1 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 d2 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 d1 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 d2 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 cc 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 cc 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 cc 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 cc 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 FF 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 FF 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 FF 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 FF 7–68（62 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 d1 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 d 5–68（64 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 f3 5–68（64 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 f3 5–68（64 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 d2 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS28 7–68（62 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS28 7–68（62 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Cc 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Cc 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 d3 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 CC 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 CC 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 CC 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 CC 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 CC 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 CC 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 cc 7–68（62 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS28 7–68（62 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS28 7–68（62 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS28 7–68（62 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 c 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 FF 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 FF 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 d 1–69（69 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 FF 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 AB 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 C1 1–69（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 d 5–68（64 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 d 5–68（64 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 d 5–68（64 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 cc 1–69（69 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 122 个其他 PDB 条目、122 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1TIB4_RABIT
Isoform —
PDB实体 30
链与序列区间 作者链 d； PDB构建体 1–69； UniProt 1–69

eS29

物种未注明

UniProt G1U7M4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 e； UniProt 1–56 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 dd 4–56（53 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 dd 4–56（53 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 dd 4–56（53 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 J 4–56（53 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 ee 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bd 5–55（51 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 e1 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 e2 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 e1 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 e2 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 dd 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 dd 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 dd 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 dd 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 9 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 9 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 w 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 9 2–56（55 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 e1 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 e 4–56（53 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 e 4–56（53 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 H3 4–56（53 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 H3 4–56（53 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 e2 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 dd 4–56（53 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS29 2–56（55 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS29 2–56（55 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Dd 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Dd 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SH 1–56（56 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 SH 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 e3 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DC 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DC 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DC 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 DC 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 DC 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 DC 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 dd 2–56（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS29 2–56（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS29 2–56（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS29 2–56（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 d 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 9 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 9 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 9 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 AG 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 H1 1–56（56 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 e 1–56（56 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 dd 1–56（56 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 120 个其他 PDB 条目、120 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1U7M4_RABIT
Isoform —
PDB实体 31
链与序列区间 作者链 e； PDB构建体 1–56； UniProt 1–56

eS30

物种未注明

UniProt G1T8A2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 f； UniProt 1–133 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ee 77–133（57 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ee 77–133（57 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ee 77–133（57 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 e 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 e 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 e 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 V 75–133（59 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 ff 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 ff 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 f1 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 f2 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 f1 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 f2 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 ee 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 ee 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 ee 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 ee 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 AA 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 AA 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 AA 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 AA 79–133（55 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 f1 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 i 1–133（133 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 i 75–133（59 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 i 75–133（59 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 f2 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS30 79–133（55 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS30 79–133（55 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Ee 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Ee 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 SE 1–133（133 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 SE 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 i 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 i 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EC 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EC 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EC 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 EC 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 EC 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 EC 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 ee 79–133（55 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AS30 79–133（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AS30 79–133（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AS30 79–133（55 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 i 1–133（133 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 i 1–133（133 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 i 1–133（133 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AA 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 AA 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 f 1–133（133 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 AA 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 AD 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 E1 75–133（59 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 i 75–133（59 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 i 75–133（59 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 i 75–133（59 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ee 1–133（133 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 118 个其他 PDB 条目、118 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1T8A2_RABIT
Isoform —
PDB实体 32
链与序列区间 作者链 f； PDB构建体 1–133； UniProt 1–133

eS31

物种未注明

UniProt G1SK22

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 g； UniProt 1–156 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） RACK1 × 1 （G1SJB4） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ff 83–151（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ff 83–151（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ff 83–151（69 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 p 82–152（71 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 gg 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 gg 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bf 79–151（73 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 g1 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 g2 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 g1 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 g2 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 ff 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 ff 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 ff 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 ff 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 g 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 g 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 g 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 g 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 0 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 0 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 0 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 0 83–150（68 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 g1 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 g 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 g 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 f 114–184（71 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 f 82–152（71 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 f 82–152（71 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Q3 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 g 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 g 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 g2 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 AS31 83–150（68 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AS31 83–150（68 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 g3 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 f 82–152（71 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 f 82–152（71 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FC 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FC 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FC 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 FC 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 FC 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 FC 1–188（188 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 ff 83–150（68 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 0 1–156（156 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 0 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 g 1–188（188 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 0 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 AC 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 D1 77–156（80 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 f 1–156（156 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ff 1–156（156 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 113 个其他 PDB 条目、113 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SK22_RABIT
Isoform —
PDB实体 33
链与序列区间 作者链 g； PDB构建体 1–156； UniProt 1–156

RACK1

物种未注明

UniProt G1SJB4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 h； UniProt 1–317 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） eL41 × 1 （A0A087WNH4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
4D5L Cryo-EM structures of ribosomal 80S complexes with termination factors and cricket paralysis virus IRES reveal the IRES in the translocated state 提交 2014-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP；pH 7.5；20 MM TRIS PH 7.5, 100 MM KCL, 1 MM DTT, 2.5 MM MGCL2, 0.5 MM GTP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 9.00 Å
4KZX Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.81 Å R-free 0.347
4KZY Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with eIF1 and eIF1A. 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：36-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.01 Å R-free 0.348
4KZZ Rabbit 40S ribosomal subunit in complex with mRNA, initiator tRNA and eIF1A 提交 2013-05-30 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；292 K；0.1M Ammonium acetate, 0.05M Tris-HCl pH 8.5, 2.5% PEG-20K, 4-6% MPD, 5.0mM Mg acetate, 2.0mM TCEP, vapor diffusion, temperature 292K
分辨率 7.03 Å R-free 0.359
5K0Y m48S late-stage initiation complex, purified from rabbit reticulocytes lysates, displaying eIF2 ternary complex and eIF3 i and g subunits relocated to the intersubunit face 提交 2016-05-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 m 2–314（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5LZS Structure of the mammalian ribosomal elongation complex with aminoacyl-tRNA, eEF1A, and didemnin B 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 7C4 (2~{S})-~{N}-[(2~{R})-1-[[(3~{S},6~{S},8~{S},12~{S},13~{R},16~{S},17~{R},20~{S},23~{S})-13-[(2~{S})-butan-2-yl]-20-[(4-methoxyphenyl)methyl]-6,17,21-trimethyl-3-(2-methylpropyl)-12-oxidanyl-2,5,7,10,15,19,22-heptakis(oxidanylidene)-8-propan-2-yl-9,18-dioxa-1,4,14,21-tetrazabicyclo[21.3.0]hexacosan-16-yl]amino]-4-methyl-1-oxidanylidene-pentan-2-yl]-~{N}-methyl-1-[(2~{S})-2-oxidanylpropanoyl]pyrrolidine-2-carboxamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.31 Å
5LZT Structure of the mammalian ribosomal termination complex with eRF1 and eRF3. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 282 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
5LZV Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1(AAQ) and ABCE1. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.35 Å
5LZW Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a truncated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 281 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.53 Å
5LZX Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a UGA stop codon. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.67 Å
5LZY Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l assembled on a polyadenylated mRNA. 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.99 Å
5LZZ Structure of the mammalian rescue complex with Pelota and Hbs1l (combined) 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 264 ZN ZINC ION × 8 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.47 Å
6D90 Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-site tRNA and eRF1. 提交 2018-04-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 hh 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6D9J Mammalian 80S ribosome with a double translocated CrPV-IRES, P-sitetRNA and eRF1. 提交 2018-04-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：85-meric
链 hh 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6GZ3 tRNA translocation by the eukaryotic 80S ribosome and the impact of GTP hydrolysis, Translocation-intermediate-POST-1 (TI-POST-1) 提交 2018-07-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Bg 2–315（314 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 327 ZN ZINC ION × 5 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6HCF Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on globin mRNA at the stop codon 提交 2018-08-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 h1 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6HCJ Structure of the rabbit 80S ribosome on globin mRNA in the rotated state with A/P and P/E tRNAs 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 h2 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6HCM Structure of the rabbit collided di-ribosome (stalled monosome) 提交 2018-08-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 h1 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
6HCQ Structure of the rabbit collided di-ribosome (collided monosome) 提交 2018-08-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 h2 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 300 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
6MTB Rabbit 80S ribosome with P- and Z-site tRNAs (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：83-meric
链 gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6MTC Rabbit 80S ribosome with Z-site tRNA and IFRD2 (unrotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6MTD Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (unrotated state with 40S head swivel) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6MTE Rabbit 80S ribosome with eEF2 and SERBP1 (rotated state) 提交 2018-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 298 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 6 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 6 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 6 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 6 2–314（313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 h1 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6W2S Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the open state (Class 1) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 41 PDB 声明：43-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.47 Å
6W2T Structure of the Cricket Paralysis Virus 5-UTR IRES (CrPV 5-UTR-IRES) bound to the small ribosomal subunit in the closed state (Class 2) 提交 2020-03-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 42 PDB 声明：44-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were blotted for 2.5s and flash cooled in liquid ethane
分辨率 3.36 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 g 2–314（313 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 g 2–314（313 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 g 2–314（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 a3 2–314（313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 a3 2–314（313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7JQB SARS-CoV-2 Nsp1 and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：34-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7JQC SARS-CoV-2 Nsp1, CrPV IRES and rabbit 40S ribosome complex 提交 2020-08-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 h2 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 Gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TOQ Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein poly-PR 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 ARAC 2–314（313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 ARAC 2–314（313 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 Gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 h3 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 g 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 g 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GC 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GC 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GC 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 GC 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 GC 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 GC 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 gg 2–314（313 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 ARAC 2–314（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 ARAC 2–314（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 ARAC 2–314（313 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9C8K Rabbit Hemorrhagic Disease Virus reinitiation stimulating TURBS RNA bound to rabbit ribosome 提交 2024-06-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 33 PDB 声明：35-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 74 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 6 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 6 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 h 1–317（317 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 6 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 AF 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 G1 1–317（317 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 g 1–317（317 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 gg 1–317（317 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

共 121 个其他 PDB 条目、121 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 G1SJB4_RABIT
Isoform —
PDB实体 34
链与序列区间 作者链 h； PDB构建体 1–317； UniProt 1–317

eL41

物种未注明

UniProt A0A087WNH4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–RNA 异源复合物 蛋白 × 34 RNA 2 PDB 声明：36-meric（36） 与全部聚合物数一致 链 n； UniProt 1–25 未记录 18S rRNA × 1 uS2 × 1 （G1TWL4） eS1 × 1 （G1SS70） uS5 × 1 （G1SWM1） uS3 × 1 （G1TNM3） eS4 × 1 （G1TK17） uS7 × 1 （G1TFM5） eS6 × 1 （G1TM55） eS7 × 1 （G1SVB0） eS8 × 1 （G1TJW1） uS4 × 1 （B7NZS8） eS10 × 1 （G1TPV3） uS17 × 1 （G1TRM4） eS12 × 1 （G1SFR8） uS15 × 1 （G1SP51） uS11 × 1 （G1U472） uS19 × 1 （G1U0Q2） uS9 × 1 （G1SGX4） eS17 × 1 （G1TU13） uS13 × 1 （G1TPG3） eS19 × 1 （G1TN62） uS10 × 1 （G1SIZ2） eS21 × 1 （G1TM82） uS8 × 1 （G1TG89） uS12 × 1 （G1SZ47） eS24 × 1 （G1T3D8） eS25 × 1 （G1TDB3） eS26 × 1 （G1TFE8） eS27 × 1 （G1TZ76） eS28 × 1 （G1TIB4） eS29 × 1 （G1U7M4） eS30 × 1 （G1T8A2） eS31 × 1 （G1SK22） RACK1 × 1 （G1SJB4） IAPV-IRES × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 6P4G Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
3JAG Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
3JAH Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UAG stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.45 Å
3JAI Structure of a mammalian ribosomal termination complex with ABCE1, eRF1(AAQ), and the UGA stop codon 提交 2015-06-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 195 ZN ZINC ION × 8 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT；pH 7.4；50 mM HEPES, 100 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging；冷冻剂 ETHANE；After 30 second wait time, blot for 3 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK III).
分辨率 3.65 Å
5LZU Structure of the mammalian ribosomal termination complex with accommodated eRF1 提交 2016-10-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 258 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 ul aliquots were applied to the grid and incubated for 30 s, before blotting for 3s to remove excess solution.
分辨率 3.75 Å
6FTG Subtomogram average of OST-containing ribosome-translocon complexes from canine rough microsomal membranes 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Blot 3 seconds before plunging.
分辨率 9.10 Å
6FTI Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：60-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6FTJ Cryo-EM Structure of the Mammalian Oligosaccharyltransferase Bound to Sec61 and the Non-programmed 80S Ribosome 提交 2018-02-22 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 55 PDB 声明：58-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 9UB [(2~{S},3~{R},4~{R},5~{S},6~{R})-3-acetamido-6-(hydroxymethyl)-4,5-bis(oxidanyl)oxan-2-yl]methyl-[oxidanyl-[(2~{Z},6~{Z},10~{Z})-3,7,11,15-tetramethylhexadeca-2,6,10,14-tetraenoxy]phosphoryl]oxy-phosphinic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.70 Å
6P4H Structure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-27 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6P5I Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5J Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 2) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5K Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 3) 提交 2019-05-30 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：81-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5 to 3 s
分辨率 3.10 Å
6P5N Structure of a mammalian 80S ribosome in complex with a single translocated Israeli Acute Paralysis Virus IRES and eRF1 提交 2019-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：82-meric
链 An 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force = 3s Wait time = 15s Drain time = 0s Blot time = 2.5s
分辨率 3.20 Å
6R5Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (post-state) 提交 2019-03-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6R6G Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with SRP. 提交 2019-03-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：92-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R6P Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex (rotated state) 提交 2019-03-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 159 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
6R7Q Structure of XBP1u-paused ribosome nascent chain complex with Sec61. 提交 2019-03-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 299 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6SGC Rabbit 80S ribosome stalled on a poly(A) tail 提交 2019-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 n2 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
6T59 Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 and nascent chain-associated complex 提交 2019-10-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 n3 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
6YAL Mammalian 48S late-stage initiation complex with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：41-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6YAM Mammalian 48S late-stage translation initiation complex (LS48S+eIF3 IC) with beta-globin mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：50-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6YAN Mammalian 48S late-stage translation initiation complex with histone 4 mRNA 提交 2020-03-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
6ZVK The Halastavi arva virus (HalV) intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-07-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 X3 2–24（23 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.49 Å
7A01 The Halastavi arva virus intergenic region IRES promotes translation by the simplest possible initiation mechanism 提交 2020-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 X3 2–24（23 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7MDZ 80S rabbit ribosome stalled with benzamide-CHX 提交 2021-04-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：81-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 277 ZN ZINC ION × 8 Z2V N-[(1R,3S,4R,5S)-3-{(1R)-2-[(2R,4r,6S)-2,6-dihydroxypiperidin-4-yl]-1-hydroxyethyl}-4-hydroxy-1,5-dimethylcyclohexyl]benzamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 sec blot
分辨率 3.20 Å
7NFX Mammalian ribosome nascent chain complex with SRP and SRP receptor in early state A 提交 2021-02-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 51 PDB 声明：55-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 GNP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.20 Å
7NWG Mammalian pre-termination 80S ribosome with Hybrid P/E- and A/P-site tRNA's bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 n3 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 299 BLS BLASTICIDIN S × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.80 Å
7NWH Mammalian pre-termination 80S ribosome with eRF1 and eRF3 bound by Blasticidin S. 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 281 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 4.10 Å
7NWI Mammalian pre-termination 80S ribosome with Empty-A site bound by Blasticidin S 提交 2021-03-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 n 2–24（23 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 210 ZN ZINC ION × 5 BLS BLASTICIDIN S × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；50 mM HEPES pH 7.4 100 mM KOAc 5 mM Mg(Oac)2 1mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；30s sample incubation on grid followed by 1.1s blotting time.
分辨率 3.13 Å
7O7Y Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (high resolution) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 330 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.20 Å
7O7Z Rabbit 80S ribosome stalled close to the mutated SARS-CoV-2 slippery site by a pseudoknot (classified for pseudoknot) 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 329 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.40 Å
7O80 Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1 and ABCE1 stalled at the STOP codon in the mutated SARS-CoV-2 slippery site 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 355 UNX UNKNOWN LIGAND × 374 ZN ZINC ION × 8 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7O81 Rabbit 80S ribosome colliding in another ribosome stalled by the SARS-CoV-2 pseudoknot 提交 2021-04-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 349 UNX UNKNOWN LIGAND × 266 ZN ZINC ION × 8 SPD SPERMIDINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
7OBR RNC-SRP early complex 提交 2021-04-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：53-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
7OYD Cryo-EM structure of a rabbit 80S ribosome with zebrafish Dap1b 提交 2021-06-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 201 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.30 Å
7QWQ Ternary complex of ribosome nascent chain with SRP and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：52-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 97 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.83 Å
7QWR Structure of the ribosome-nascent chain containing an ER signal sequence in complex with NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 45 PDB 声明：48-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
7QWS Structure of ribosome translating beta-tubulin in complex with TTC5 and NAC 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 46 PDB 声明：49-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 97 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
7SYG Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 1(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.30 Å
7SYH Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 2(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYI Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 3(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYJ Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 4(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYK Structure of the HCV IRES binding to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 5(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.20 Å
7SYL Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, closed conformation. Structure 6(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.50 Å
7SYM Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 7(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.80 Å
7SYN Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head opening. Structure 8(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYO Structure of the HCV IRES bound to the 40S ribosomal subunit, head open. Structure 9(delta dII) 提交 2021-11-25 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYP Structure of the wt IRES and 40S ribosome binary complex, open conformation. Structure 10(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.00 Å
7SYQ Structure of the wt IRES and 40S ribosome ternary complex, open conformation. Structure 11(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：37-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.80 Å
7SYR Structure of the wt IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(wt). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.60 Å
7SYS Structure of the delta dII IRES eIF2-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 12(delta dII). 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.50 Å
7SYT Structure of the wt IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.40 Å
7SYU Structure of the delta dII IRES w/o eIF2 48S initiation complex, closed conformation. Structure 13(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 4.60 Å
7SYV Structure of the wt IRES eIF5B-containing pre-48S initiation complex, open conformation. Structure 14(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.90 Å
7SYW Structure of the wt IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(wt) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7SYX Structure of the delta dII IRES eIF5B-containing 48S initiation complex, closed conformation. Structure 15(delta dII) 提交 2021-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；4 second blot time, force 3
分辨率 3.70 Å
7TM3 Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 50 PDB 声明：54-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM KOAc, 5 mM Mg(OAc)2, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 4 sec with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging
分辨率 3.25 Å
7TOR Mammalian 80S ribosome bound with the ALS/FTD-associated dipeptide repeat protein GR20 提交 2022-01-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7TUT Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 4-TMD Rhodopsin intermediate in complex with the multipass translocon 提交 2022-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 220 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 200 mM potassium acetate, 5 mM magnesium acetate, 0.25% digitonin, 50 mM biotin
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds with Whatman filter papers at a blot force of -15 before plunging.
分辨率 3.88 Å
7UCJ Mammalian 80S translation initiation complex with mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7UCK 80S translation initiation complex with ac4c(-1) mRNA and Harringtonine 提交 2022-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 73 PDB 声明：79-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 297 MQ6 Harringtonine × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJW Rabbit 80S ribosome as it decodes the Sec-UGA codon 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：86-meric
链 Sl 1–25（25 aa）
未记录 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 SER SERINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 225 K POTASSIUM ION × 18 ZN ZINC ION × 9 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7ZJX Rabbit 80S ribosome programmed with SECIS and SBP2 提交 2022-04-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：83-meric
链 Sl 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8B5L Cryo-EM structure of ribosome-Sec61-TRAP (TRanslocon Associated Protein) translocon complex 提交 2022-09-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8B6C Cryo-EM structure of ribosome-Sec61 in complex with cyclotriazadisulfonamide derivative CK147 提交 2022-09-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ZN ZINC ION × 5 OWI 4-[[9-(cyclohexylmethyl)-3-methylidene-5-(4-methylphenyl)sulfonyl-1,5,9-triazacyclododec-1-yl]sulfonyl]-~{N},~{N}-dimethyl-aniline × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8BHF Cryo-EM structure of stalled rabbit 80S ribosomes in complex with human CCR4-NOT and CNOT4 提交 2022-10-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 a1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 275 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BPO Structure of rabbit 80S ribosome translating beta-tubulin in complex with tetratricopeptide protein 5 (TTC5) and S-phase Cyclin A Associated Protein residing in the ER (SCAPER) 提交 2022-11-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 m2 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 214 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8BTK Structure of the TRAP complex with the Sec translocon and a translating ribosome 提交 2022-11-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 86 PDB 声明：92-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 750 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；3.5 uL of sample was incubated on the grid for 60 seconds at 4*C and 100% humidity before being blotted and plunged into liquid ethane/propane mix cooled to liquid nitrogen temperature
分辨率 3.50 Å
8P03 48S late-stage initiation complex with m6A mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 178 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8P09 48S late-stage initiation complex with non methylated mRNA 提交 2023-05-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：40-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 230 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8P2K Ternary complex of translating ribosome, NAC and METAP1 提交 2023-05-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 82 PDB 声明：88-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 N ANY 5'-MONOPHOSPHATE NUCLEOTIDE × 73 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 420 UNX UNKNOWN LIGAND × 312 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 AAC ACETYLAMINO-ACETIC ACID × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
8Q7Z Structure of the G. gallus 80S non-rotated ribosome 提交 2023-08-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：80-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 494 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8Q87 Structure of the G. gallus 80S rotated ribosome in complex with eEF2 and SERBP1 提交 2023-08-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：85-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 492 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
8RJB Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-RAMP4 提交 2023-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 47 PDB 声明：51-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.69 Å
8RJC Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 1 提交 2023-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8RJD Structure of the rabbit 80S ribosome stalled on a 2-TMD rhodopsin intermediate in complex with Sec61-TRAP, open conformation 2 提交 2023-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：56-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 218 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.79 Å
8SCB Terminating ribosome with SRI-41315 提交 2023-04-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：87-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 312 ZN ZINC ION × 8 ZVM (2S,4aS)-2-cyclobutyl-10-methyl-3-phenyl-2,10-dihydropyrimido[4,5-b]quinoline-4,5(3H,4aH)-dione × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8SUP Structure of the 48S translation initiation complex assembled on the encephalomyocarditis virus IRES 提交 2023-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 44 PDB 声明：47-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VFT Translating 80S rabbit ribosome stalled by emetine with eEF2 提交 2023-12-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：85-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 276 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 34G emetine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8VVP Codon sampling state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 260 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 6 SPM SPERMINE × 2 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVQ Codon sampling state of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes obtained from merged datasets 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 290 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8VVR Post-decoding/Post-hydrolysis state obtained from Anisomycin-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 204 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 3 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVS Post-decoding post-hydrolysis state obtained from merged datasets of elongation inhibitor-treated mammalian ribosomes 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：88-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 236 ZN ZINC ION × 8 5GP GUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 4 K POTASSIUM ION × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VVT Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the rotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：84-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 144 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8VVU Anisomycin-bound mammalian ribosome with partially accommodated A-site tRNA 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 MA 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 102 ZN ZINC ION × 8 ANM ANISOMYCIN × 1 SPD SPERMIDINE × 1 SER SERINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8VVV Mammalian ribosomes bound to Anisomycin in the nonrotated conformation 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 79 PDB 声明：83-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 294 ZN ZINC ION × 8 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES-KOH, pH 7.5, 100 mM KCl, 1.5 mM MgCl2, 0.5 mM Spermidine, 0.04 mM Spermine, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDL 80S ribosome with angiogenin 提交 2024-04-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9BDN 80S ribosome with angiogenin and tRNAAla 提交 2024-04-12 聚集状态不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 77 PDB 声明：85-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9BDP 80S ribosome bound with angiogenin and complex of eEF1A and Ala-tRNAAla 提交 2024-04-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：86-meric
链 AL41 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9CPA Structure of a Mammalian DHX29-bound 43S Pre-initiation Complex 提交 2024-07-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 6.00 Å
9F1B Mammalian ternary complex of a translating 80S ribosome, NAC and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：89-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 420 ZN ZINC ION × 8 UNX UNKNOWN LIGAND × 306 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.01 Å
9F1C Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：90-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 277 MG MAGNESIUM ION × 420 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.78 Å
9F1D Mammalian quaternary complex of a translating 80S ribosome, NAC, MetAP1 and NatA/E-HYPK 提交 2024-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 85 PDB 声明：91-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 UNX UNKNOWN LIGAND × 295 SPD SPERMIDINE × 30 MG MAGNESIUM ION × 420 SPM SPERMINE × 3 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.26 Å
9H6Y Late-stage 48S Initiation Complex (LS48S IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：42-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9H74 Late-stage 48S Initiation Complex with eIF3 (LS48S-eIF3 IC) guided by the trans-RNA 提交 2024-10-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；10 mM HEPES-KOH pH 7.4, 5 mM Mg(OAc)2, 50 mM KOAc, 10 mM NH4Cl, 2 mM DTT and Roche cOmplete protease inhibitor cocktail
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The sample was incubated on the grid for 30 s and then blotted with filter paper from both sides for 1.5 s with the blot force 5
分辨率 2.90 Å
9MR4 NAC: Ribosome nascent chain complex(Oxa1L) 提交 2025-01-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 78 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 285 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9NDP Structure of stalled ribosome and nascent chain in complex with NMT2 and NAC 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：87-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 296 ZN ZINC ION × 6 COA COENZYME A × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9OGY Megrivirus E 3' internal ribosome entry site (IRES) RNA core region bound to rabbit ribosome 提交 2025-05-02 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：36-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM Tris-HCl pH 7.5, 2 mM MgOAc2, 150 mM KCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9Q7Q ABCE1-eRF1-RNC-AMD1C 提交 2025-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 80 PDB 声明：86-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 291 ZN ZINC ION × 6 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
9QQA Ternary complex of translating ribosome, NAC and NMT1 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：86-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 407 UNX UNKNOWN LIGAND × 187 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9QQB Quaternary complex of a translating ribosome, NAC, NMT1, and NatA 提交 2025-03-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 84 PDB 声明：89-meric
链 Az 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 30 SPM SPERMINE × 3 MG MAGNESIUM ION × 412 UNX UNKNOWN LIGAND × 168 ZN ZINC ION × 8 IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.43 Å
9RHU Rabbit 80S ribosome in complex with eRF1-AAQ, stalled at the Stop codon in mutated F2A sequence 提交 2025-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 81 PDB 声明：88-meric
链 l1 1–25（25 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 367 ZN ZINC ION × 8 K POTASSIUM ION × 37 SPD SPERMIDINE × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
9UZK EMCV IRES captured on mammalian 40S with initiator tRNA 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：37-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.60 Å
9UZL EMCV IRES captured on mammalian 40S ribosome with initiator tRNA and eIF2 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 36 PDB 声明：39-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 5.01 Å
9UZM 40S ribosome without initiation factors 提交 2025-05-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 34 PDB 声明：35-meric
链 l 1–25（25 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20mM HEPES, 150mM KOAc, 2mM MgCl2, 1mM DTT, 0.5mM Spermidine, 6mM GMP-PnP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.50 Å
9YPG GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the GTPase activation-like state, Structure III 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPO GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIa 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPS GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIb 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPT GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IIc 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 K POTASSIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YPV GTPBP1*GCP*Phe-tRNA*ribosome in the open state, Structure IId 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPW GTPBP1*GDP*Phe-tRNA*ribosome in the post-GTP hydrolysis state, Structure IV 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 76 PDB 声明：84-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 K POTASSIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YPY Ribosome with accommodated A-site tRNA, Structure V 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：83-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 PHE PHENYLALANINE × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
9YPZ Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 1, Structure Ia 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ0 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 2, Structure Ib 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YQ1 Vacant ribosome with P-site tRNA, substate 3, Structure Ic 提交 2025-10-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 75 PDB 声明：82-meric
链 n 1–25（25 aa）
未记录 SPD SPERMIDINE × 1 ZN ZINC ION × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MET METHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å

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查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A087WNH4_RABIT
Isoform —
PDB实体 35
链与序列区间 作者链 n； PDB构建体 1–25； UniProt 1–25

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 6p4g

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 6p4g
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id6p4g
沉积日期 deposition_date2019-05-27
结构标题 titleStructure of a mammalian small ribosomal subunit in complex with the Israeli Acute Paralysis Virus IRES (Class 1)
关键词 keywordsIsraeli Acute Paralysis Virus IRES, IAPV, 40S, small ribosomal subunit, RIBOSOME; RIBOSOME
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier74.74 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron75.75 Å
零角强度 I(0) i036797000000.00
分子量 molecular_weight1167700.0 kDa
排除体积 excluded_volume1270600 ų
包络体积 envelope_volume2066300 ų
水化壳体积 shell_volume219750 ų
包络直径 envelope_diameter266.1 Å
壳层 Rg shell_rg77.68 Å
包络 Rg envelope_rg75.83 Å
形状 Rg shape_rg75.77 Å
总 Rg total_rg75.72 Å
总原子数 total_atoms79374
残基数 n_residues6762
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax266.2 Å
Rg (实空间) rg_real78.35 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.63 Å
I(0) (实空间) i0_real3.6920e+10
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.4780e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal74.17 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal36740000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8672
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary76.1 Å
偏度 Skewness skewness0.566
峰度 Kurtosis kurtosis-0.076
角度范围 angular_range— – 0.1050 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha1.1430
最高正则化参数 α highest_alpha3068000000.0000
实空间数据点数 n_real_points22
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.790; Stabil: 0.870; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.989; Smooth: 0.330
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (36)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 27 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd6p4gh_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.69 — 7-bladed beta-propeller
超家族 Superfamily superfamilyb.69.4 — WD40 repeat-like
家族 Family familyb.69.4.1 — WD40-repeat

CATH v4.4 (26 domains)

结构域编号 domain_id6p4gB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10490 — Glucose-6-phosphate isomerase like protein; domain 1
结构域编号 domain_id6p4gD01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology160 — Double Stranded RNA Binding Domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 —
结构域编号 domain_id6p4gD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id6p4gF01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology290 — Structural Genomics Hypothetical 15.5 Kd Protein In mrcA-pckA Intergenic Region; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA-binding S4 domain
结构域编号 domain_id6p4gF02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily740 — Ribosomal protein S4, central domain
结构域编号 domain_id6p4gF03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id6p4gG00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology455 — Ribosomal Protein S7
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal protein S7/S5
结构域编号 domain_id6p4gJ03
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology168 — Phosducin; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosomal protein S8e, subdomain
结构域编号 domain_id6p4gL00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id6p4gM00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1000 —
结构域编号 domain_id6p4gN00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1330 — 60s Ribosomal Protein L30; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Ribosomal protein L30/S12
结构域编号 domain_id6p4gO02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — S15/NS1, RNA-binding
结构域编号 domain_id6p4gP00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily80 — Ribosomal protein S11/S14
结构域编号 domain_id6p4gR00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology230 — Ribosomal Protein S5; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id6p4gS01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology60 — Diphtheria Toxin Repressor; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosomal protein S17
结构域编号 domain_id6p4gV00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily600 — Ribosomal protein S10
结构域编号 domain_id6p4gW00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1230 — Hypothetical Cytosolic Protein; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosomal protein S21
结构域编号 domain_id6p4gX01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1370 — Ribosomal Protein S8; Chain: A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 —
结构域编号 domain_id6p4gX02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id6p4gZ00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily3370 —
结构域编号 domain_id6p4ga00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id6p4gb00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1740 — first zn-finger domain of poly(adp-ribose) polymerase-1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Ribosomal protein S26
结构域编号 domain_id6p4gc00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — Ribosomal protein S27
结构域编号 domain_id6p4gd00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id6p4ge00
类 Class class4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture10 — Irregular
拓扑 Topology topology830 — 30s Ribosomal Protein S14; Chain N
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Ribosomal Protein S14/S29
结构域编号 domain_id6p4gh01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture130 — 7 Propeller
拓扑 Topology topology10 — Methylamine Dehydrogenase; Chain H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — YVTN repeat-like/Quinoprotein amine dehydrogenase
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)