7nac

State E2 nucleolar 60S ribosomal biogenesis intermediate - Composite model

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1

OrganismNot specified

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	LOC1_YEAST
Isoform	—
PDB entities	3
Chains and sequence ranges	Author chain 7； PDBConstruct 1–204； UniProt 1–204

Ribosome biogenesis protein BRX1

OrganismNot specified

UniProt Q08235

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	BRX1_YEAST
Isoform	—
PDB entities	4
Chains and sequence ranges	Author chain A； PDBConstruct 1–291； UniProt 1–291

60S ribosomal protein L3

OrganismNot specified

UniProt P14126

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL3_YEAST
Isoform	—
PDB entities	5
Chains and sequence ranges	Author chain B； PDBConstruct 1–387； UniProt 1–387

60S ribosomal protein L4-A

OrganismNot specified

UniProt P10664

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL4A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	6
Chains and sequence ranges	Author chain C； PDBConstruct 1–362； UniProt 1–362

60S ribosomal protein L6-A

OrganismNot specified

UniProt Q02326

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL6A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	7
Chains and sequence ranges	Author chain E； PDBConstruct 1–176； UniProt 1–176

60S ribosomal protein L7-A

OrganismNot specified

UniProt P05737

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL7A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	8
Chains and sequence ranges	Author chain F； PDBConstruct 1–244； UniProt 1–244

60S ribosomal protein L9-A

OrganismNot specified

UniProt P05738

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL9A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	9
Chains and sequence ranges	Author chain H； PDBConstruct 1–191； UniProt 1–191

rRNA-processing protein EBP2

OrganismNot specified

UniProt P36049

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	EBP2_YEAST
Isoform	—
PDB entities	10
Chains and sequence ranges	Author chain J； PDBConstruct 1–427； UniProt 1–427

60S ribosomal protein L13-A

OrganismNot specified

UniProt Q12690

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL13A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	11
Chains and sequence ranges	Author chain L； PDBConstruct 1–199； UniProt 1–199

60S ribosomal protein L14-A

OrganismNot specified

UniProt P36105

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL14A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	12
Chains and sequence ranges	Author chain M； PDBConstruct 1–138； UniProt 1–138

60S ribosomal protein L15-A

OrganismNot specified

UniProt P05748

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL15A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	13
Chains and sequence ranges	Author chain N； PDBConstruct 1–204； UniProt 1–204

60S ribosomal protein L16-A

OrganismNot specified

UniProt P26784

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL16A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	14
Chains and sequence ranges	Author chain O； PDBConstruct 1–199； UniProt 1–199

60S ribosomal protein L17-A

OrganismNot specified

UniProt P05740

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL17A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	15
Chains and sequence ranges	Author chain P； PDBConstruct 1–184； UniProt 1–184

60S ribosomal protein L18-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX49

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL18A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	16
Chains and sequence ranges	Author chain Q； PDBConstruct 1–186； UniProt 1–186

60S ribosomal protein L20-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX23

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL20A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	17
Chains and sequence ranges	Author chain S； PDBConstruct 1–172； UniProt 1–172

60S ribosomal protein L21-A

OrganismNot specified

UniProt Q02753

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL21A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	18
Chains and sequence ranges	Author chain T； PDBConstruct 1–160； UniProt 1–160

Ribosome assembly factor MRT4

OrganismNot specified

UniProt P33201

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	MRT4_YEAST
Isoform	—
PDB entities	19
Chains and sequence ranges	Author chain W； PDBConstruct 1–236； UniProt 1–236

60S ribosomal protein L25

OrganismNot specified

UniProt P04456

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL25_YEAST
Isoform	—
PDB entities	20
Chains and sequence ranges	Author chain X； PDBConstruct 1–142； UniProt 1–142

60S ribosomal protein L26-A

OrganismNot specified

UniProt P05743

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL26A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	21
Chains and sequence ranges	Author chain Y； PDBConstruct 1–127； UniProt 1–127

Nucleolar GTP-binding protein 1

OrganismNot specified

UniProt Q02892

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NOG1_YEAST
Isoform	—
PDB entities	22
Chains and sequence ranges	Author chain b； PDBConstruct 1–647； UniProt 1–647

60S ribosomal protein L31-A

OrganismNot specified

UniProt P0C2H8

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL31A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	23
Chains and sequence ranges	Author chain d； PDBConstruct 1–113； UniProt 1–113

60S ribosomal protein L32

OrganismNot specified

UniProt P38061

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL32_YEAST
Isoform	—
PDB entities	24
Chains and sequence ranges	Author chain e； PDBConstruct 1–130； UniProt 1–130

60S ribosomal protein L33-A

OrganismNot specified

UniProt P05744

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL33A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	25
Chains and sequence ranges	Author chain f； PDBConstruct 1–107； UniProt 1–107

60S ribosomal protein L35-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX84

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL35A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	26
Chains and sequence ranges	Author chain h； PDBConstruct 1–120； UniProt 1–120

60S ribosomal protein L36-A

OrganismNot specified

UniProt P05745

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL36A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	27
Chains and sequence ranges	Author chain i； PDBConstruct 1–100； UniProt 1–100

60S ribosomal protein L37-A

OrganismNot specified

UniProt P49166

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL37A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	28
Chains and sequence ranges	Author chain j； PDBConstruct 1–88； UniProt 1–88

60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7

OrganismNot specified

UniProt Q08962

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NIP7_YEAST
Isoform	—
PDB entities	29
Chains and sequence ranges	Author chain l； PDBConstruct 1–181； UniProt 1–181

Ribosome biogenesis protein ERB1

OrganismNot specified

UniProt Q04660

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	ERB1_YEAST
Isoform	—
PDB entities	30
Chains and sequence ranges	Author chain m； PDBConstruct 1–807； UniProt 1–807

25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase

OrganismNot specified

UniProt P40991

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NOP2_YEAST
Isoform	—
PDB entities	31
Chains and sequence ranges	Author chain q； PDBConstruct 1–618； UniProt 1–618

Ribosome biogenesis protein NSA2

OrganismNot specified

UniProt A6ZR80

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NSA2_YEAS7
Isoform	—
PDB entities	32
Chains and sequence ranges	Author chain r； PDBConstruct 1–261； UniProt 1–261

Nuclear GTP-binding protein NUG1

OrganismNot specified

UniProt P40010

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NUG1_YEAST
Isoform	—
PDB entities	33
Chains and sequence ranges	Author chain s； PDBConstruct 1–520； UniProt 1–520

Ribosome biogenesis protein RLP24

OrganismNot specified

UniProt Q07915

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RLP24_YEAST
Isoform	—
PDB entities	34
Chains and sequence ranges	Author chain u； PDBConstruct 1–199； UniProt 1–199

Nucleolar protein 16

OrganismNot specified

UniProt P40007

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NOP16_YEAST
Isoform	—
PDB entities	35
Chains and sequence ranges	Author chain v； PDBConstruct 1–231； UniProt 1–231

Eukaryotic translation initiation factor 6

OrganismNot specified

UniProt Q12522

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	IF6_YEAST
Isoform	—
PDB entities	36
Chains and sequence ranges	Author chain y； PDBConstruct 1–245； UniProt 1–245

UPF0642 protein YBL028C

OrganismNot specified

UniProt P38202

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	YBC8_YEAST
Isoform	—
PDB entities	37
Chains and sequence ranges	Author chain z； PDBConstruct 1–106； UniProt 1–106

NOC2 isoform 1

OrganismNot specified

UniProt A0A8H4BX61

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A8H4BX61_YEASX
Isoform	—
PDB entities	38
Chains and sequence ranges	Author chain 8； PDBConstruct 1–710； UniProt 1–710

Nucleolar complex-associated protein 3

OrganismNot specified

UniProt Q07896

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NOC3_YEAST
Isoform	—
PDB entities	39
Chains and sequence ranges	Author chain I； PDBConstruct 1–663； UniProt 1–663

Proteasome-interacting protein CIC1

OrganismNot specified

UniProt P38779

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	CIC1_YEAST
Isoform	—
PDB entities	40
Chains and sequence ranges	Author chain K； PDBConstruct 1–376； UniProt 1–376

60S ribosomal protein L23-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX41

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL23A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	41
Chains and sequence ranges	Author chain V； PDBConstruct 1–137； UniProt 1–137

60S ribosomal protein L19-A

OrganismNot specified

UniProt P0CX82

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL19A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	42
Chains and sequence ranges	Author chain R； PDBConstruct 1–189； UniProt 1–189

60S ribosomal protein L8-A

OrganismNot specified

UniProt P17076

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL8A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	43
Chains and sequence ranges	Author chain G； PDBConstruct 1–256； UniProt 1–256

60S ribosomal protein L27-A

OrganismNot specified

UniProt P0C2H6

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL27A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	44
Chains and sequence ranges	Author chain Z； PDBConstruct 1–136； UniProt 1–136

60S ribosomal protein L22-A

OrganismNot specified

UniProt P05749

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL22A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	45
Chains and sequence ranges	Author chain U； PDBConstruct 1–121； UniProt 1–121

60S ribosomal protein L30

OrganismNot specified

UniProt P14120

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL30_YEAST
Isoform	—
PDB entities	46
Chains and sequence ranges	Author chain c； PDBConstruct 1–105； UniProt 1–105

60S ribosomal protein L34-A

OrganismNot specified

UniProt P87262

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL34A_YEAST
Isoform	—
PDB entities	47
Chains and sequence ranges	Author chain g； PDBConstruct 1–121； UniProt 1–121

60S ribosomal protein L38

OrganismNot specified

UniProt P49167

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RL38_YEAST
Isoform	—
PDB entities	48
Chains and sequence ranges	Author chain k； PDBConstruct 1–78； UniProt 1–78

Pescadillo homolog

OrganismNot specified

UniProt P53261

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	PESC_YEAST
Isoform	—
PDB entities	49
Chains and sequence ranges	Author chain n； PDBConstruct 1–605； UniProt 1–605

YTM1 isoform 1

OrganismNot specified

UniProt A0A8H4BV53

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A8H4BV53_YEASX
Isoform	—
PDB entities	50
Chains and sequence ranges	Author chain p； PDBConstruct 1–460； UniProt 1–460

Ribosome biogenesis protein RLP7

OrganismNot specified

UniProt P40693

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	RLP7_YEAST
Isoform	—
PDB entities	51
Chains and sequence ranges	Author chain t； PDBConstruct 1–322； UniProt 1–322

ATP-dependent RNA helicase HAS1

OrganismNot specified

UniProt Q03532

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	HAS1_YEAST
Isoform	—
PDB entities	53
Chains and sequence ranges	Author chain D； PDBConstruct 1–505； UniProt 1–505

Ribosome biogenesis protein 15

OrganismNot specified

UniProt P53927

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	NOP15_YEAST
Isoform	—
PDB entities	54
Chains and sequence ranges	Author chain o； PDBConstruct 1–220； UniProt 1–220

;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ;

OrganismNot specified

UniProt P25582

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	SPB1_YEAST
Isoform	—
PDB entities	55
Chains and sequence ranges	Author chain w； PDBConstruct 1–841； UniProt 1–841

Ribosomal protein

OrganismNot specified

UniProt A0A6A5Q2N7

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A6A5Q2N7_YEASX
Isoform	—
PDB entities	56
Chains and sequence ranges	Author chain a； PDBConstruct 1–217； UniProt 1–217

RRP17 isoform 1

OrganismNot specified

UniProt A0A6A5Q2X9

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） ATP-dependent rRNA helicase SPB4 × 1 （A7A237） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	A0A6A5Q2X9_YEASX
Isoform	—
PDB entities	57
Chains and sequence ranges	Author chain 5； PDBConstruct 1–235； UniProt 1–235

ATP-dependent rRNA helicase SPB4

OrganismNot specified

UniProt A7A237

State in the Current Structure

Assembly	Physical composition	Protein state	Molecular copy count	Associated components	Data consistency
1	Protein–RNA	Heteromer	Protein 55 RNA 3	25S rRNA × 1 5.8S rRNA × 1 60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1 × 1 （P43586） Ribosome biogenesis protein BRX1 × 1 （Q08235） 60S ribosomal protein L3 × 1 （P14126） 60S ribosomal protein L4-A × 1 （P10664） 60S ribosomal protein L6-A × 1 （Q02326） 60S ribosomal protein L7-A × 1 （P05737） 60S ribosomal protein L9-A × 1 （P05738） rRNA-processing protein EBP2 × 1 （P36049） 60S ribosomal protein L13-A × 1 （Q12690） 60S ribosomal protein L14-A × 1 （P36105） 60S ribosomal protein L15-A × 1 （P05748） 60S ribosomal protein L16-A × 1 （P26784） 60S ribosomal protein L17-A × 1 （P05740） 60S ribosomal protein L18-A × 1 （P0CX49） 60S ribosomal protein L20-A × 1 （P0CX23） 60S ribosomal protein L21-A × 1 （Q02753） Ribosome assembly factor MRT4 × 1 （P33201） 60S ribosomal protein L25 × 1 （P04456） 60S ribosomal protein L26-A × 1 （P05743） Nucleolar GTP-binding protein 1 × 1 （Q02892） 60S ribosomal protein L31-A × 1 （P0C2H8） 60S ribosomal protein L32 × 1 （P38061） 60S ribosomal protein L33-A × 1 （P05744） 60S ribosomal protein L35-A × 1 （P0CX84） 60S ribosomal protein L36-A × 1 （P05745） 60S ribosomal protein L37-A × 1 （P49166） 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 × 1 （Q08962） Ribosome biogenesis protein ERB1 × 1 （Q04660） 25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase × 1 （P40991） Ribosome biogenesis protein NSA2 × 1 （A6ZR80） Nuclear GTP-binding protein NUG1 × 1 （P40010） Ribosome biogenesis protein RLP24 × 1 （Q07915） Nucleolar protein 16 × 1 （P40007） Eukaryotic translation initiation factor 6 × 1 （Q12522） UPF0642 protein YBL028C × 1 （P38202） NOC2 isoform 1 × 1 （A0A8H4BX61） Nucleolar complex-associated protein 3 × 1 （Q07896） Proteasome-interacting protein CIC1 × 1 （P38779） 60S ribosomal protein L23-A × 1 （P0CX41） 60S ribosomal protein L19-A × 1 （P0CX82） 60S ribosomal protein L8-A × 1 （P17076） 60S ribosomal protein L27-A × 1 （P0C2H6） 60S ribosomal protein L22-A × 1 （P05749） 60S ribosomal protein L30 × 1 （P14120） 60S ribosomal protein L34-A × 1 （P87262） 60S ribosomal protein L38 × 1 （P49167） Pescadillo homolog × 1 （P53261） YTM1 isoform 1 × 1 （A0A8H4BV53） Ribosome biogenesis protein RLP7 × 1 （P40693） 5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2 × 1 ATP-dependent RNA helicase HAS1 × 1 （Q03532） Ribosome biogenesis protein 15 × 1 （P53927） ;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ; × 1 （P25582） Ribosomal protein × 1 （A0A6A5Q2N7） RRP17 isoform 1 × 1 （A0A6A5Q2X9） ZINC ION × 2 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	Consistent with all polymers

Other States of the Same Protein in the Database

View Construct and Data Evidence

UniProt name	SPB4_YEAS7
Isoform	—
PDB entities	58
Chains and sequence ranges	Author chain x； PDBConstruct 1–606； UniProt 1–606

The page prioritizes protein identity, the current assembly, associated components, oligomeric state and cross-PDB links. Chain mapping and sequence ranges are retained as data evidence. Internal IDs, import timestamps and assembly operation expressions are maintenance fields and are not shown here.

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2. Structure Basics 2. Structure Basics

Entry ID entry_id	7nac
Deposition date deposition_date	2021-06-21
Structure title title	State E2 nucleolar 60S ribosomal biogenesis intermediate - Composite model
Keywords keywords	ribosome biogenesis, DEAD-box ATPases, methyltransferase, nucleolus, RIBOSOME; RIBOSOME
Experimental Method method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model SAXS Official SAXS Profiles

This page reads only the latest assembly calculations. Every curve maps to an explicit PDB entry, official biological assembly and coordinate model.

7nac__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

Download this curve (.dat)

7nac__assembly_1__model_1 | I(q)

100 plotted points; both axes use logarithmic scales.

7nac__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) will be calculated and displayed separately for the same assembly/model.

Rg（Guinier）	90.78 Å
Rg (electron density)	93.01 Å
Total Rg	92.76 Å
Atom count	158246
Residues	14916
Excluded volume	2602000 Å³
Maximum q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	Structure unit	Oligomeric description	Status	CRYSOL	Actions
1	1	`7nac__assembly_1__model_1`	58-meric （58）	Success	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	View Download

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4. Crystallography and Experiment 4. Crystallography & Experiment

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5. Entities and Polymers Entities & Polymers (60)

Entity 1 Entity 1 polymer

Description description	25S rRNA
Molecular weight formula_weight	1097574.9 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polyribonucleotide
Chain IDs strand_id	1
Atom count atom_count	158246

GUUUGACCUCAAAUCAGGUAGGAGUACCCGCUGAACUUAAGCAUAUCAAUAAGCGGAGGAAAAGAAACCAACCGGGAUUGCCUUAGUAACGGCGAGUGAAGCGGCAAAAGCUCAAAUUUGAAAUCUGGUACCUUCGGUGCCCGAGUUGUAAUUUGGAGAGGGCAACUUUGGGGCCGUUCCUUGUCUAUGUUCCUUGGAACAGGACGUCAUAGAGGGUGAGAAUCCCGUGUGGCGAGGAGUGCGGUUCUUUGUAAAGUGCCUUCGAAGAGUCGAGUUGUUUGGGAAUGCAGCUCUAAGUGGGUGGUAAAUUCCAUCUAAAGCUAAAUAUUGGCGAGAGACCGAUAGCGAACAAGUACAGUGAUGGAAAGAUGAAAAGAACUUUGAAAAGAGAGUGAAAAAGUACGUGAAAUUGUUGAAAGGGAAGGGCAUUUGAUCAGACAUGGUGUUUUGUGCCCUCUGCUCCUUGUGGGUAGGGGAAUCUCGCAUUUCACUGGGCCAGCAUCAGUUUUGGUGGCAGGAUAAAUCCAUAGGAAUGUAGCUUGCCUCGGUAAGUAUUAUAGCCUGUGGGAAUACUGCCAGCUGGGACUGAGGACUGCGACGUAAGUCAAGGAUGCUGGCAUAAUGGUUAUAUGCCGCCCGUCUUGAAACACGGACCAAGGAGUCUAACGUCUAUGCGAGUGUUUGGGUGUAAAACCCAUACGCGUAAUGAAAGUGAACGUAGGUUGGGGCCUCGCAAGAGGUGCACAAUCGACCGAUCCUGAUGUCUUCGGAUGGAUUUGAGUAAGAGCAUAGCUGUUGGGACCCGAAAGAUGGUGAACUAUGCCUGAAUAGGGUGAAGCCAGAGGAAACUCUGGUGGAGGCUCGUAGCGCGGUUGACGUGCAAAUCGAUCGUCGAAUUUGGGUAUAGGGGCGAAAGACUAAUCGAACCAUCUAGUAGCUGGUUCCUGCCGAAGUUUCCCUCAGGAUAGCAGAAGCUCGUAUCAGUUUUAUGAGGUAAAGCGAAUGAUUAGAGGUUCCGGGGUCGAAAUGACCUUGACCUAUUCUCAAACUUUAAAUAUGUAAGAAGUCCUUGUUACUUAAUUGAACGUGGACAUUUGAAUGAAGAGCUUUUAGUGGGCCAUUUUUGGUAAGCAGAACUGGCGAUGCGGGAUGAACCGAACGUAGAGUUAAGGUGCCGGAAUACACGCUCAUCAGACACCACAAAAGGUGUUAGUUCAUCUAGACAGCCGGACGGUGGCCAUGGAAGUCGGAAUCCGCUAAGGAGUGUGUAACAACUCACCGGCCGAAUGAACUAGCCCUGAAAAUGGAUGGCGCUCAAGCGUGUUACCUAUACUCUACCGUCAGGGUUGAUAUGAUGCCCUGACGAGUAGGCAGGCGUGGAGGUCAGUGACGAAGCCUAGACCGUAAGGUCGGGUCGAACGGCCUCUAGUGCAGAUCUUGGUGGUAGUAGCAAAUAUUCAAAUGAGAACUUUGAAGACUGAAGUGGGGAAAGGUUCCACGUCAACAGCAGUUGGACGUGGGUUAGUCGAUCCUAAGAGAUGGGGAAGCUCCGUUUCAAAGGCCUGAUUUUAUGCAGGCCACCAUCGAAAGGGAAUCCGGUUAAGAUUCCGGAACCUGGAUAUGGAUUCUUCACGGUAACGUAACUGAAUGUGGAGACGUCGGCGCGAGCCCUGGGAGGAGUUAUCUUUUCUUCUUAACAGCUUAUCACCCCGGAAUUGGUUUAUCCGGAGAUGGGGUCUUAUGGCUGGAAGAGGCCAGCACCUUUGCUGGCUCCGGUGCGCUUGUGACGGCCCGUGAAAAUCCACAGGAAGGAAUAGUUUUCAUGCCAGGUCGUACUGAUAACCGCAGCAGGUCUCCAAGGUGAACAGCCUCUAGUUGAUAGAAUAAUGUAGAUAAGGGAAGUCGGCAAAAUAGAUCCGUAACUUCGGGAUAAGGAUUGGCUCUAAGGGUCGGGUAGUGAGGGCCUUGGUCAGACGCAGCGGGCGUGCUUGUGGACUGCUUGGUGGGGCUUGCUCUGCUAGGCGGACUACUUGCGUGCCUUGUUGUAGACGGCCUUGGUAGGUCUCUUGUAGACCGUCGCUUGCUACAAUUAACGAUCAACUUAGAACUGGUACGGACAAGGGGAAUCUGACUGUCUAAUUAAAACAUAGCAUUGCGAUGGUCAGAAAGUGAUGUUGACGCAAUGUGAUUUCUGCCCAGUGCUCUGAAUGUCAAAGUGAAGAAAUUCAACCAAGCGCGGGUAAACGGCGGGAGUAACUAUGACUCUCUUAAGGUAGCCAAAUGCCUCGUCAUCUAAUUAGUGACGCGCAUGAAUGGAUUAACGAGAUUCCCACUGUCCCUAUCUACUAUCUAGCGAAACCACAGCCAAGGGAACGGGCUUGGCAGAAUCAGCGGGGAAAGAAGACCCUGUUGAGCUUGACUCUAGUUUGACAUUGUGAAGAGACAUAGAGGGUGUAGAAUAAGUGGGAGCUUCGGCGCCAGUGAAAUACCACUACCUUUAUAGUUUCUUUACUUAUUCAAUGAAGCGGAGCUGGAAUUCAUUUUCCACGUUCUAGCAUUCAAGGUCCCAUUCGGGGCUGAUCCGGGUUGAAGACAUUGUCAGGUGGGGAGUUUGGCUGGGGCGGCACAUCUGUUAAACGAUAACGCAGAUGUCCUAAGGGGGGCUCAUGGAGAACAGAAAUCUCCAGUAGAACAAAAGGGUAAAAGCCCCCUUGAUUUUGAUUUUCAGUGUGAAUACAAACCAUGAAAGUGUGGCCUAUCGAUCCUUUAGUCCCUCGGAAUUUGAGGCUAGAGGUGCCAGAAAAGUUACCACAGGGAUAACUGGCUUGUGGCAGUCAAGCGUUCAUAGCGACAUUGCUUUUUGAUUCUUCGAUGUCGGCUCUUCCUAUCAUACCGAAGCAGAAUUCGGUAAGCGUUGGAUUGUUCACCCACUAAUAGGGAACGUGAGCUGGGUUUAGACCGUCGUGAGACAGGUUAGUUUUACCCUACUGAUGAAUGUUACCGCAAUAGUAAUUGAACUUAGUACGAGAGGAACAGUUCAUUCGGAUAAUUGGUUUUUGCGGCUGUCUGAUCAGGCAUUGCCGCGAAGCUACCAUCCGCUGGAUUAUGGCUGAACGCCUCUAAGUCAGAAUCCAUGCUAGAACGCGGUGAUUUCUUUGCUCCACACAAUAUAGAUGGAUACGAAUAAGGCGUCCUUGUGGCGUCGCUGAACCAUAGCAGGCUAGCAACGGUGCACUUGGCGGAAAGGCCUUGGGUGCUUGCUGGCGAAUUGCAAUGUCAUUUUGCGUGGGGAUAAAUCAUUUGUAUACGACUUAGAUGUACAACGGGGUAUUGUAAGCAGUAGAGUAGCCUUGUUGUUACGAUCUGCUGAGAUUAAGCCUUUGUUGUCUGAUUUGU

Entity 2 Entity 2 polymer

Description description	5.8S rRNA
Molecular weight formula_weight	50682.9 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polyribonucleotide
Chain IDs strand_id	2

AAACUUUCAACAACGGAUCUCUUGGUUCUCGCAUCGAUGAAGAACGCAGCGAAAUGCGAUACGUAAUGUGAAUUGCAGAAUUCCGUGAAUCAUCGAAUCUUUGAACGCACAUUGCGCCCCUUGGUAUUCCAGGGGGCAUGCCUGUUUGAGCGUCAUUU

Entity 3 Entity 3 polymer

Description description	60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1
Molecular weight formula_weight	23652.6 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	7

MAPKKPSKRQNLRREVAPEVFQDSQARNQLANVPHLTEKSAQRKPSKTKVKKEQSLARLYGAKKDKKGKYSEKDLNIPTLNRAIVPGVKIRRGKKGKKFIADNDTLTLNRLITTIGDKYDDIAESKLEKARRLEEIRELKRKEIERKEALKQDKLEEKKDEIKKKSSVARTIRRKNKRDMLKSEAKASESKTEGRKVKKVSFAQ

Entity 4 Entity 4 polymer

Description description	Ribosome biogenesis protein BRX1
Molecular weight formula_weight	33585.4 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	A

MSSIYKALAGKSKDNKSEKKQGNVKQFMNKQRTLLISSRGVNYRHRHLIQDLSGLLPHSRKEPKLDTKKDLQQLNEIAELYNCNNVLFFEARKHQDLYLWLSKPPNGPTIKFYIQNLHTMDELNFTGNCLKGSRPVLSFDQRFESSPHYQLIKELLVHNFGVPPNARKSKPFIDHVMSFSIVDDKIWVRTYEISHSTKNKEEYEDGEEDISLVEIGPRFVMTVILILEGSFGGPKIYENKQYVSPNVVRAQIKQQAAEEAKSRAEAAVERKIKRRENVLAADPLSNDALFK

Entity 5 Entity 5 polymer

Description description	60S ribosomal protein L3
Molecular weight formula_weight	43850.8 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	B

MSHRKYEAPRHGHLGFLPRKRAASIRARVKAFPKDDRSKPVALTSFLGYKAGMTTIVRDLDRPGSKFHKREVVEAVTVVDTPPVVVVGVVGYVETPRGLRSLTTVWAEHLSDEVKRRFYKNWYKSKKKAFTKYSAKYAQDGAGIERELARIKKYASVVRVLVHTQIRKTPLAQKKAHLAEIQLNGGSISEKVDWAREHFEKTVAVDSVFEQNEMIDAIAVTKGHGFEGVTHRWGTKKLPRKTHRGLRKVACIGAWHPAHVMWSVARAGQRGYHSRTSINHKIYRVGKGDDEANGATSFDRTKKTITPMGGFVHYGEIKNDFIMVKGCIPGNRKRIVTLRKSLYTNTSRKALEEVSLKWIDTASKFGKGRFQTPAEKHAFMGTLKKDL

Entity 6 Entity 6 polymer

Description description	60S ribosomal protein L4-A
Molecular weight formula_weight	39159.1 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	C

MSRPQVTVHSLTGEATANALPLPAVFSAPIRPDIVHTVFTSVNKNKRQAYAVSEKAGHQTSAESWGTGRAVARIPRVGGGGTGRSGQGAFGNMCRGGRMFAPTKTWRKWNVKVNHNEKRYATASAIAATAVASLVLARGHRVEKIPEIPLVVSTDLESIQKTKEAVAALKAVGAHSDLLKVLKSKKLRAGKGKYRNRRWTQRRGPLVVYAEDNGIVKALRNVPGVETANVASLNLLQLAPGAHLGRFVIWTEAAFTKLDQVWGSETVASSKVGYTLPSHIISTSDVTRIINSSEIQSAIRPAGQATQKRTHVLKKNPLKNKQVLLRLNPYAKVFAAEKLGSKKAEKTGTKPAAVFTETLKHD

Entity 7 Entity 7 polymer

Description description	60S ribosomal protein L6-A
Molecular weight formula_weight	20000.6 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	E

MSAQKAPKWYPSEDVAALKKTRKAARPQKLRASLVPGTVLILLAGRFRGKRVVYLKHLEDNTLLISGPFKVNGVPLRRVNARYVIATSTKVSVEGVNVEKFNVEYFAKEKLTKKEKKEANLFPEQQNKEIKAERVEDQKVVDKALIAEIKKTPLLKQYLSASFSLKNGDKPHMLKF

Entity 8 Entity 8 polymer

Description description	60S ribosomal protein L7-A
Molecular weight formula_weight	27686.3 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	F

MAAEKILTPESQLKKSKAQQKTAEQVAAERAARKAANKEKRAIILERNAAYQKEYETAERNIIQAKRDAKAAGSYYVEAQHKLVFVVRIKGINKIPPKPRKVLQLLRLTRINSGTFVKVTKATLELLKLIEPYVAYGYPSYSTIRQLVYKRGFGKINKQRVPLSDNAIIEANLGKYGILSIDDLIHEIITVGPHFKQANNFLWPFKLSNPSGGWGVPRKFKHFIQGGSFGNREEFINKLVKSMN

Entity 9 Entity 9 polymer

Description description	60S ribosomal protein L9-A
Molecular weight formula_weight	21605.1 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	H

MKYIQTEQQIEVPEGVTVSIKSRIVKVVGPRGTLTKNLKHIDVTFTKVNNQLIKVAVHNGGRKHVAALRTVKSLVDNMITGVTKGYKYKMRYVYAHFPINVNIVEKDGAKFIEVRNFLGDKKIRNVPVRDGVTIEFSTNVKDEIVLSGNSVEDVSQNAADLQQICRVRNKDIRKFLDGIYVSHKGFITEDL

Entity 10 Entity 10 polymer

Description description	rRNA-processing protein EBP2
Molecular weight formula_weight	49842.6 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	J

MAKGFKLKELLSHQKEIEKAEKLENDLKKKKSQELKKEEPTIVTASNLKKLEKKEKKADVKKEVAADTEEYQSQALSKKEKRKLKKELKKMQEQDATEAQKHMSGDEDESGDDREEEEEEEEEEEGRLDLEKLAKSDSESEDDSESENDSEEDEDVVAKEESEEKEEQEEEQDVPLSDVEFDSDADVVPHHKLTVNNTKAMKHALERVQLPWKKHSFQEHQSVTSETNTDEHIKDIYDDTERELAFYKQSLDAVLVARDELKRLKVPFKRPLDYFAEMVKSDEHMDKIKGKLIEEASDKKAREEARRQRQLKKFGKQVQNATLQKRQLEKRETLEKIKSLKNKRKHNEIDHSEFNVGVEEEVEGKRFDRGRPNGKRAAKNAKYGQGGMKRFKRKNDATSSADVSGFSSRKMKGKTNRPGKSRRARRF

Entity 11 Entity 11 polymer

Description description	60S ribosomal protein L13-A
Molecular weight formula_weight	22604.2 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	L

MAISKNLPILKNHFRKHWQERVKVHFDQAGKKVSRRNARATRAAKIAPRPLDLLRPVVRAPTVKYNRKVRAGRGFTLAEVKAAGLTAAYARTIGIAVDHRRQNRNQEIFDANVQRLKEYQSKIIVFPRNGKAPEAEQVLSAAATFPIAQPATDVEARAVQDNGESAFRTLRLARSEKKFRGIREKRAREKAEAEAEKKK

Entity 12 Entity 12 polymer

Description description	60S ribosomal protein L14-A
Molecular weight formula_weight	15195.1 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	M

MSTDSIVKASNWRLVEVGRVVLIKKGQSAGKLAAIVEIIDQKKVLIDGPKAGVPRQAINLGQVVLTPLTFALPRGARTATVSKKWAAAAVCEKWAASSWAKKIAQRERRAALTDFERFQVMVLRKQKRYTVKKALAKA

Entity 13 Entity 13 polymer

Description description	60S ribosomal protein L15-A
Molecular weight formula_weight	24482.4 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	N

MGAYKYLEELQRKKQSDVLRFLQRVRVWEYRQKNVIHRAARPTRPDKARRLGYKAKQGFVIYRVRVRRGNRKRPVPKGATYGKPTNQGVNELKYQRSLRATAEERVGRRAANLRVLNSYWVNQDSTYKYFEVILVDPQHKAIRRDARYNWICDPVHKHREARGLTATGKKSRGINKGHKFNNTKAGRRKTWKRQNTLSLWRYRK

Entity 14 Entity 14 polymer

Description description	60S ribosomal protein L16-A
Molecular weight formula_weight	22247.2 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	O

MSVEPVVVIDGKGHLVGRLASVVAKQLLNGQKIVVVRAEELNISGEFFRNKLKYHDFLRKATAFNKTRGPFHFRAPSRIFYKALRGMVSHKTARGKAALERLKVFEGIPPPYDKKKRVVVPQALRVLRLKPGRKYTTLGKLSTSVGWKYEDVVAKLEAKRKVSSAEYYAKKRAFTKKVASANATAAESDVAKQLAALGY

Entity 15 Entity 15 polymer

Description description	60S ribosomal protein L17-A
Molecular weight formula_weight	20589.5 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	P

MARYGATSTNPAKSASARGSYLRVSFKNTRETAQAINGWELTKAQKYLEQVLDHQRAIPFRRFNSSIGRTAQGKEFGVTKARWPAKSVKFVQGLLQNAAANAEAKGLDATKLYVSHIQVNQAPKQRRRTYRAHGRINKYESSPSHIELVVTEKEEAVAKAAEKKVVRLTSRQRGRIAAQKRIAA

Entity 16 Entity 16 polymer

Description description	60S ribosomal protein L18-A
Molecular weight formula_weight	20609.3 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Q

MGIDHTSKQHKRSGHRTAPKSDNVYLKLLVKLYTFLARRTDAPFNKVVLKALFLSKINRPPVSVSRIARALKQEGAANKTVVVVGTVTDDARIFEFPKTTVAALRFTAGARAKIVKAGGECITLDQLAVRAPKGQNTLILRGPRNSREAVRHFGMGPHKGKAPRILSTGRKFERARGRRRSKGFKV

Entity 17 Entity 17 polymer

Description description	60S ribosomal protein L20-A
Molecular weight formula_weight	20478.9 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	S

MAHFKEYQVIGRRLPTESVPEPKLFRMRIFASNEVIAKSRYWYFLQKLHKVKKASGEIVSINQINEAHPTKVKNFGVWVRYDSRSGTHNMYKEIRDVSRVAAVETLYQDMAARHRARFRSIHILKVAEIEKTADVKRQYVKQFLTKDLKFPLPHRVQKSTKTFSYKRPSTFY

Entity 18 Entity 18 polymer

Description description	60S ribosomal protein L21-A
Molecular weight formula_weight	18279.3 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	T

MGKSHGYRSRTRYMFQRDFRKHGAVHLSTYLKVYKVGDIVDIKANGSIQKGMPHKFYQGKTGVVYNVTKSSVGVIINKMVGNRYLEKRLNLRVEHIKHSKCRQEFLERVKANAAKRAEAKAQGVAVQLKRQPAQPRESRIVSTEGNVPQTLAPVPYETFI

Entity 19 Entity 19 polymer

Description description	Ribosome assembly factor MRT4
Molecular weight formula_weight	27098.0 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	W

MPRSKRSKLVTLAQTDKKGRENKERIFDEVREALDTYRYVWVLHLDDVRTPVLQEIRTSWAGSKLIMGKRKVLQKALGEKREEEYKENLYQLSKLCSGVTGLLFTDEDVNTVKEYFKSYVRSDYSRPNTKAPLTFTIPEGIVYSRGGQIPAEEDVPMIHSLEPTMRNKFEIPTKIKAGKITIDSPYLVCTEGEKLDVRQALILKQFGIAASEFKVKVSAYYDNDSSTVESTNINME

Entity 20 Entity 20 polymer

Description description	60S ribosomal protein L25
Molecular weight formula_weight	15787.6 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	X

MAPSAKATAAKKAVVKGTNGKKALKVRTSATFRLPKTLKLARAPKYASKAVPHYNRLDSYKVIEQPITSETAMKKVEDGNILVFQVSMKANKYQIKKAVKELYEVDVLKVNTLVRPNGTKKAYVRLTADYDALDIANRIGYI

Entity 21 Entity 21 polymer

Description description	60S ribosomal protein L26-A
Molecular weight formula_weight	14265.8 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Y

MAKQSLDVSSDRRKARKAYFTAPSSQRRVLLSAPLSKELRAQYGIKALPIRRDDEVLVVRGSKKGQEGKISSVYRLKFAVQVDKVTKEKVNGASVPINLHPSKLVITKLHLDKDRKALIQRKGGKLE

Entity 22 Entity 22 polymer

Description description	Nucleolar GTP-binding protein 1
Molecular weight formula_weight	74531.2 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	b

MQLSWKDIPTVAPANDLLDIVLNRTQRKTPTVIRPGFKITRIRAFYMRKVKYTGEGFVEKFEDILKGFPNINDVHPFHRDLMDTLYEKNHYKISLAAISRAKSLVEQVARDYVRLLKFGQSLFQCKQLKRAALGRMATIVKKLRDPLAYLEQVRQHIGRLPSIDPNTRTLLICGYPNVGKSSFLRCITKSDVDVQPYAFTTKSLYVGHFDYKYLRFQAIDTPGILDRPTEEMNNIEMQSIYAIAHLRSCVLYFMDLSEQCGFTIEAQVKLFHSIKPLFANKSVMVVINKTDIIRPEDLDEERAQLLESVKEVPGVEIMTSSCQLEENVMEVRNKACEKLLASRIENKLKSQSRINNVLNKIHVAQPQARDDVKRTPFIPESVKNLKKYDPEDPNRRKLARDIEAENGGAGVFNVNLKDKYLLEDDEWKNDIMPEILDGKNVYDFLDPEIAAKLQALEEEEEKLENEGFYNSDDEEEIYDGFEASEVDDIKEKAAWIRNRQKTMIAEARNRKSLKNKAIMPRSKLTKSFGKMEEHMSTLGHDMSALQDKQNRAARKNRYVERGSDVVFGDQDALTASTENGVKLRQTDRLLDGVADGSMRSKADRMAKMERRERNRHAKQGESDRHNAVSLSKHLFSGKRGVGKTDFR

Entity 23 Entity 23 polymer

Description description	60S ribosomal protein L31-A
Molecular weight formula_weight	12980.2 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	d

MAGLKDVVTREYTINLHKRLHGVSFKKRAPRAVKEIKKFAKLHMGTDDVRLAPELNQAIWKRGVKGVEYRLRLRISRKRNEEEDAKNPLFSYVEPVLVASAKGLQTVVVEEDA

Entity 24 Entity 24 polymer

Description description	60S ribosomal protein L32
Molecular weight formula_weight	14809.4 kDa
Source method src_method	nat
Copy count entity_count	1

Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	e

MASLPHPKIVKKHTKKFKRHHSDRYHRVAENWRKQKGIDSVVRRRFRGNISQPKIGYGSNKKTKFLSPSGHKTFLVANVKDLETLTMHTKTYAAEIAHNISAKNRVVILARAKALGIKVTNPKGRLALEA

Entity 25 Entity 25 polymer

Description description	60S ribosomal protein L33-A
Molecular weight formula_weight	12177.1 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	f

MAESHRLYVKGKHLSYQRSKRVNNPNVSLIKIEGVATPQDAQFYLGKRIAYVYRASKEVRGSKIRVMWGKVTRTHGNSGVVRATFRNNLPAKTFGASVRIFLYPSNI

Entity 26 Entity 26 polymer

Description description	60S ribosomal protein L35-A
Molecular weight formula_weight	13942.6 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	h

MAGVKAYELRTKSKEQLASQLVDLKKELAELKVQKLSRPSLPKIKTVRKSIACVLTVINEQQREAVRQLYKGKKYQPKDLRAKKTRALRRALTKFEASQVTEKQRKKQIAFPQRKYAIKA

Entity 27 Entity 27 polymer

Description description	60S ribosomal protein L36-A
Molecular weight formula_weight	11151.3 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	i

MTVKTGIAIGLNKGKKVTSMTPAPKISYKKGAASNRTKFVRSLVREIAGLSPYERRLIDLIRNSGEKRARKVAKKRLGSFTRAKAKVEEMNNIIAASRRH

Entity 28 Entity 28 polymer

Description description	60S ribosomal protein L37-A
Molecular weight formula_weight	9877.4 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	j

MGKGTPSFGKRHNKSHTLCNRCGRRSFHVQKKTCSSCGYPAAKTRSYNWGAKAKRRHTTGTGRMRYLKHVSRRFKNGFQTGSASKASA

Entity 29 Entity 29 polymer

Description description	60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7
Molecular weight formula_weight	20411.7 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	l

MRQLTEEETKVVFEKLAGYIGRNISFLVDNKELPHVFRLQKDRVYYVPDHVAKLATSVARPNLMSLGICLGKFTKTGKFRLHITSLTVLAKHAKYKIWIKPNGEMPFLYGNHVLKAHVGKMSDDIPEHAGVIVFAMNDVPLGFGVSAKSTSESRNMQPTGIVAFRQADIGEYLRDEDTLFT

Entity 30 Entity 30 polymer

Description description	Ribosome biogenesis protein ERB1
Molecular weight formula_weight	91772.6 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	m

MMAKNNKTTEAKMSKKRAASEESDVEEDEDKLLSVDGLIDAEASESDEDDDEYESAVEEKESSSDKEAQDDSDDDSDAELNKLLAEEEGDGEEDYDSSEFSDDTTSLTDRLSGVKLQTIVDPNIYSKYADGSDRIIKPEINPVYDSDDSDAETQNTIGNIPLSAYDEMPHIGYDINGKRIMRPAKGSALDQLLDSIELPEGWTGLLDKNSGSSLNLTKEELELISKIQRNEQTDDSINPYEPLIDWFTRHEEVMPLTAVPEPKRRFVPSKNEAKRVMKIVRAIREGRIIPPKKLKEMKEKEKIENYQYDLWGDSTETNDHVMHLRAPKLPPPTNEESYNPPEEYLLSPEEKEAWENTEYSERERNFIPQKYSALRKVPGYGESIRERFERSLDLYLAPRVRKNKLNIDPNSLIPELPSPKDLRPFPIRCSTIYAGHKGKVRTLSIDPSGLWLATGSDDGTVRVWEILTGREVYRTTLIDDEENPDYHIECIEWNPDANNGILAVAVGENIHLIVPPIFGYDIENNGKTKIEDGFGYDTFGTVKKSNLEVNANGDGDEDGENESAKNAVKKQVAQWNKPSQKQLEKDICITISCKKTVKKLSWHRKGDYFVTVQPDSGNTSVLIHQVSKHLTQSPFKKSKGIIMDAKFHPFKPQLFVCSQRYVRIYDLSQQILVKKLLPGARWLSKIDIHPRGDNLIASSFDKRVLWHDLDLASTPYKTLRYHEKAVRSVNFHKKLPLFSSAADDGTIHVFHATVYDDMMKNPMIVPLKKLTGHKVINSLGVLDAIWHPREAWLFSAGADNTARLWTT

Entity 31 Entity 31 polymer

Description description	25S rRNA (cytosine(2870)-C(5))-methyltransferase
Molecular weight formula_weight	69912.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.310
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	q

MGSRRHKNKQAAPPTLEEFQARKEKKANRKLEKGKRPSTTQGDEVSDRKKKKSKPFKKSRKEEEEVVEEDKDLPEVDLEELSKARKSLFDDEEDDDEAGLVDEELKDEFDLEQEYDYDEDEDNDAHPIFSDDDDEADLEELNAQNMEALSKKLDEEEAEEAEEAEMELVEAENMQPRADILPTEEQEEMMAQETPNLTSTRTRMIEIVKVLENFKTLGAEGRSRGEYVDRLLKDICEYFGYTPFLAEKLFNLFSPAEAMEFFEANEIARPITIRTNTLKTRRRDLAQTLVNRGVNLQPIGSWTKVGLQIFDSQVPIGATPEYLAGHYILQAASSFLPVIALDPHENERILDMAAAPGGKTTYISAMMKNTGCVFANDANKSRTKSLIANIHRLGCTNTIVCNYDAREFPKVIGGFDRILLDAPCSGTGVIGKDQSVKVSRTEKDFIQIPHLQKQLLLSAIDSVDCNSKHGGVIVYSTCSVAVEEDEAVIDYALRKRPNVKLVDTGLAIGKEAFTSYRGKKFHPSVKLARRYYPHTYNVDGFFVAKFQKIGPSSFDDNQASAKEKETAARKEALEEGIIHSDFATFEDEEDDKYIEKSVKNNLLKKGVNPKAKRPSNEK

Entity 32 Entity 32 polymer

Description description	Ribosome biogenesis protein NSA2
Molecular weight formula_weight	29786.8 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	r

MPQNDYIERHIKQHGKRLDHEERKRKREARESHKISERAQKLTGWKGKQFAKKRYAEKVSMRKKIKAHEQSKVKGSSKPLDTDGDALPTYLLDREQNNTAKAISSSIKQKRLEKADKFSVPLPKVRGISEEEMFKVIKTGKSRSKSWKRMITKHTFVGEGFTRRPVKMERIIRPSALRQKKANVTHPELGVTVFLPILAVKKNPQSPMYTQLGVLTKGTIIEVNVSELGMVTAGGKVVWGKYAQVTNEPDRDGCVNAVLLV

Entity 33 Entity 33 polymer

Description description	Nuclear GTP-binding protein NUG1
Molecular weight formula_weight	57798.7 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	s

MRVRKRQSRRTSTKLKEGIKKKASAHRKKEKKMAKKDVTWRSRSKKDPGIPSNFPYKAKILEEIEAKKMKDLEERELAKQQRLEARKAAKEQGVDAMDEDMIEDDENGLAALVESAQQAAAEYEGTPSNDADVRDDELDVIDYNIDFYGEDVEGESELEKSRKAYDKIFKSVIDASDVILYVLDARDPESTRSRKVEEAVLQSQGKRLILILNKVDLIPPHVLEQWLNYLKSSFPTIPLRASSGAVNGTSFNRKLSQTTTASALLESLKTYSNNSNLKRSIVVGVIGYPNVGKSSVINALLARRGGQSKACPVGNEAGVTTSLREIKIDNKLKILDSPGICFPSENKKRSKVEHEAELALLNALPAKHIVDPYPAVLMLVKRLAKSDEMTESFKKLYEIPPIPANDADTFTKHFLIHVARKRGRLGKGGIPNLASAGLSVLNDWRDGKILGWVLPNTSAAASQQDKQNLSTINTGTKQAPIAANESTIVSEWSKEFDLDGLFSSLDKAIDASKDQDTMME

Entity 34 Entity 34 polymer

Description description	Ribosome biogenesis protein RLP24
Molecular weight formula_weight	24027.7 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	u

MRIYQCHFCSSPCYPGHGIMFVRNDAKEFRFCRSKCHKAFKQRRNPRKLKWTKAFRKAAGKELAVDSTLTFAQRRNVPVRYNRELVATTLKAMARIEEIRQKRERAFYKNRMRGNKEKDFLRDKKLVESNPELLRIREVEIARKLAKEQERAESVSEQEESEEEEEDMEIDSDEEEEEQLEKQKILLKNRRRNTKKIAF

Entity 35 Entity 35 polymer

Description description	Nucleolar protein 16
Molecular weight formula_weight	26954.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	v

MTSVRKRKMNRSSVGKATRRNKDKQRKINIQSNPIIAANWDYSLTMAQNYKKLGLRAKLQTPAGGKEADLSKVVKRIPLTKPVLDEDEDEDEGEDEQNDYNAATVELDENEIPEGGARIQRDKNGDVVRVVYGKKKNFDADEDVNEIKARDTTEETEVVKKLEELASRPVIRKERSQSEREEEWLEKLYKKHGDDYKKMFFDKKLNIYQQSEGDLKRRLLRWKKRNGIASK

Entity 36 Entity 36 polymer

Description description	Eukaryotic translation initiation factor 6
Molecular weight formula_weight	26476.6 kDa
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	y

MATRTQFENSNEIGVFSKLTNTYCLVAVGGSENFYSAFEAELGDAIPIVHTTIAGTRIIGRMTAGNRRGLLVPTQTTDQELQHLRNSLPDSVKIQRVEERLSALGNVICCNDYVALVHPDIDRETEELISDVLGVEVFRQTISGNILVGSYCSLSNQGGLVHPQTSVQDQEELSSLLQVPLVAGTVNRGSSVVGAGMVVNDYLAVTGLDTTAPELSVIESIFRLQDAQPESISGNLRDTLIETYS

Entity 37 Entity 37 polymer

Description description	UPF0642 protein YBL028C
Molecular weight formula_weight	12435.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	z

MAKSLRASSHLNAKSVKRRGVFQKAVDAREQRISDKLKEDLLKQKLEDLKKKEEQGIDMDVDEKKSNEEAPRKKISTSGWRDGRHHTYKKAKLMKQSKKKTSFTRF

Entity 38 Entity 38 polymer

Description description	NOC2 isoform 1
Molecular weight formula_weight	81719.3 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	8

MGKVSKSTKKFQSKHLKHTLDQRRKEKIQKKRIQGRRGNKTDQEKADAAGTREQQQLKKSAKEEVFKDMSVETFFEKGIEIPKENKKLKKKTTKEQSDEDSSSSEEEEDMGQSMAKLAEKDPEFYKYLEENDKDLLDFAGTNPLDGIDSQDEGEDAERNSNIEEKSEQMELEKEKIELSLKLVRKWKKQLHDSPSLKLLRNIISAFKVAVNLNKEENIEDYKYAITDEKAFHELMFMVLKDVPQAIQKMAPYKIVKGARTLPNGGNVSRVSSIVKSHAGSLLILLNDITNTETAALVLHSVNELMPYLLSYRRILKELIKSIVGVWSTTRELETQIASFAFLINTTKEFKKSMLETTLKTTYSTFIKSCRKTNMRSMPLINFQKNSAAELFGIDEVLGYQVGFEYIRQLAIHLRNTMNATTKKSSKINSAEAYKIVYNWQFCHSLDFWSRVLSFACQPEKENGSESPLRQLIYPLVQVTLGVIRLIPTPQFFPLRFYLIKSLIRLSQNSGVFIPIYPLLSEILTSTAFTKAPKKSPNLAAFDFEHNIKCTQAYLNTKIYQEGLSEQFVDLLGDYFALYCKNIAFPELVTPVIISLRRYIKTSTNVKLNKRLSTVVEKLNQNSTFIQEKRSDVEFGPTNKSEVSRFLNDVAWNKTPLGSYVAVQREVKEEKARLMRESMEEQDKERETEEAKLLNSLESDDDNEDVEMSDA

Entity 39 Entity 39 polymer

Description description	Nucleolar complex-associated protein 3
Molecular weight formula_weight	75689.0 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	I

MAKRNRSQFRIQERTAKKRKHEDSLLEGNVFQNAPEDMDENTIYSAKGSSWDEEEQDYEMVPRKNRSDTSNLVEGLPIKVNGKVERKLHKAQEKPKDDDEEDEDSNDSSEDDEGPNEEQEAEAKEDEPDTEEKILQLKEDIADLVTKVMEEPEENTAALGRLCKMVESKNPNTCKFSMLALVPVFKSIIPGYRIRPLTETEKKEKVSKEVSKLRNFEQALVYNYKNYVGRLQSLSKTPSNAAPIQVSLGILATQAAKELISTASHFNFRTDIFTLLLRRICKPRISTDPTSIQIIQTFETLLNEDEEGSISFEILRIFNKILKTRNFNIEESVLNMLLSLDVLHDYDPNTKLKGNVSAPKLKKKDRVHLSKKQRKARKEMQQIEEEMRNAEQAVSAEERERNQSEILKIVFTIYLNILKNNAKTLIGSVLEGLTKFGNMANFDLLGDFLEVMKELISDTEFDNLSSAEVRKALLCIVSAFSLISNTQYMKVNVDLSKFVDGLYALLPYICLDADIELSYRSLRLADPLNNEIIKPSVNVSTKAELLLKALDHVFFRSKSGTKERATAFTKRLYMCISHTPEKTSIAILKFIDKLMNRYPEISGLYSSEDRIGNGHFIMEADNPSRSNPEAATLWDNALLEKHYCPVVTKGLRSLSSRSKECSK

Entity 40 Entity 40 polymer

Description description	Proteasome-interacting protein CIC1
Molecular weight formula_weight	42596.7 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	K

MAKKSNSKKSTPVSTPSKEKKKVIEKKSSTAIPRERVIKAVNELIKFTSKPQDENNEEGNNGKKNLLEDDEEELKKDLQLIVVNNKSFTGTSKSFKLKLLNVKHSFYKPWKEASATAVKDFKVLLILKDSDIKKVSEDDLFDQLDSEGIKVDEIICGKDLKTVYKAYEARNAFISQFSLILADDSIVTSLPKLMGGKAYNKVETTPISIRTHANKEFSLTTLTNNIKKVYMNQLPVKLPRGTTLNVHLGNLEWLRPEEFVDNVELISEQLIKAYQIRSIFIKTNRSPVLPLYYNQDVLDELEAKKDKIEETHEDDMVTIDGVQVHLSTFNKGLMEIANPSELGSIFSKQINNAKKRSSSELEKESSESEAVKKAKS

Entity 41 Entity 41 polymer

Description description	60S ribosomal protein L23-A
Molecular weight formula_weight	14494.0 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	V

MSGNGAQGTKFRISLGLPVGAIMNCADNSGARNLYIIAVKGSGSRLNRLPAASLGDMVMATVKKGKPELRKKVMPAIVVRQAKSWRRRDGVFLYFEDNAGVIANPKGEMKGSAITGPVGKECADLWPRVASNSGVVV

Entity 42 Entity 42 polymer

Description description	60S ribosomal protein L19-A
Molecular weight formula_weight	21762.3 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	R

MANLRTQKRLAASVVGVGKRKVWLDPNETSEIAQANSRNAIRKLVKNGTIVKKAVTVHSKSRTRAHAQSKREGRHSGYGKRKGTREARLPSQVVWIRRLRVLRRLLAKYRDAGKIDKHLYHVLYKESKGNAFKHKRALVEHIIQAKADAQREKALNEEAEARRLKNRAARDRRAQRVAEKRDALLKEDA

Entity 43 Entity 43 polymer

Description description	60S ribosomal protein L8-A
Molecular weight formula_weight	28175.8 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	G

MAPGKKVAPAPFGAKSTKSNKTRNPLTHSTPKNFGIGQAVQPKRNLSRYVKWPEYVRVQRQKKILSIRLKVPPTIAQFQYTLDRNTAAETFKLFNKYRPETAAEKKERLTKEAAAVAEGKSKQDASPKPYAVKYGLNHVVALIENKKAKLVLIANDVDPIELVVFLPALCKKMGVPYAIVKGKARLGTLVNQKTSAVAALTEVRAEDEAALAKLVSTIDANFADKYDEVKKHWGGGILGNKAQAKMDKRAKNSDSA

Entity 44 Entity 44 polymer

Description description	60S ribosomal protein L27-A
Molecular weight formula_weight	15568.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	Z

MAKFLKAGKVAVVVRGRYAGKKVVIVKPHDEGSKSHPFGHALVAGIERYPLKVTKKHGAKKVAKRTKIKPFIKVVNYNHLLPTRYTLDVEAFKSVVSTETFEQPSQREEAKKVVKKAFEERHQAGKNQWFFSKLRF

Entity 45 Entity 45 polymer

Description description	60S ribosomal protein L22-A
Molecular weight formula_weight	13711.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	U

MAPNTSRKQKIAKTFTVDVSSPTENGVFDPASYAKYLIDHIKVEGAVGNLGNAVTVTEDGTVVTVVSTAKFSGKYLKYLTKKYLKKNQLRDWIRFVSTKTNEYRLAFYQVTPEEDEEEDEE

Entity 46 Entity 46 polymer

Description description	60S ribosomal protein L30
Molecular weight formula_weight	11430.4 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	c

MAPVKSQESINQKLALVIKSGKYTLGYKSTVKSLRQGKSKLIIIAANTPVLRKSELEYYAMLSKTKVYYFQGGNNELGTAVGKLFRVGVVSILEAGDSDILTTLA

Entity 47 Entity 47 polymer

Description description	60S ribosomal protein L34-A
Molecular weight formula_weight	13673.2 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	g

MAQRVTFRRRNPYNTRSNKIKVVKTPGGILRAQHVKKLATRPKCGDCGSALQGISTLRPRQYATVSKTHKTVSRAYGGSRCANCVKERIIRAFLIEEQKIVKKVVKEQTEAAKKSEKKAKK

Entity 48 Entity 48 polymer

Description description	60S ribosomal protein L38
Molecular weight formula_weight	8845.6 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	k

MAREITDIKQFLELTRRADVKTATVKINKKLNKAGKPFRQTKFKVRGSSSLYTLVINDAGKAKKLIQSLPPTLKVNRL

Entity 49 Entity 49 polymer

Description description	Pescadillo homolog
Molecular weight formula_weight	69984.1 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	n

MRIKKKNTRGNARNFITRSQAVRKLQVSLADFRRLCIFKGIYPREPRNKKKANKGSTAPTTFYYAKDIQYLMHEPVLAKFREHKTFARKLTRALGRGEVSSAKRLEENRDSYTLDHIIKERYPSFPDAIRDIDDALNMLFLFSNLPSTNQVSSKIINDAQKICNQWLAYVAKERLVRKVFVSIKGVYYQANIKGEEVRWLVPFKFPENIPSDVDFRIMLTFLEFYSTLLHFVLYKLYTDSGLIYPPKLDLKKDKIISGLSSYILESRQEDSLLKLDPTEIEEDVKVESLDASTLKSALNADEANTDETEKEEEQEKKQEKEQEKEQNEETELDTFEDNNKNKGDILIQPSKYDSPVASLFSAFVFYVSREVPIDILEFLILSCGGNVISEAAMDQIENKKDIDMSKVTHQIVDRPVLKNKVAGRTYIQPQWIFDCINKGELVPANKYLPGEALPPHLSPWGDAIGYDPTAPVEEGEEEESESESESEDQVEEEDQEVVAGEEDDDDDEELQAQKELELEAQGIKYSETSEADKDVNKSKNKKRKVDEEEEEKKLKMIMMSNKQKKLYKKMKYSNAKKEEQAENLKKKKKQIAKQKAKLNKLDSKK

Entity 50 Entity 50 polymer

Description description	YTM1 isoform 1
Molecular weight formula_weight	51426.6 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	p

MTEDKSQVKIRFFTREKDELLHVQDTPMYAPISLKRYGLSEIVNHLLGSEKPVPFDFLIEGELLRTSLHDYLTKKGLSSEASLNVEYTRAILPPSYLNSFSNEDWVSSLDVGDGSKHIISGSYDGIVRTWDLSGNVQKQYSGHSGPIRAVKYISNTRLVSAGNDRTLRLWKTKNDDLKLTSQQQAQEDDDDEVNIEDGKTLAILEGHKAPVVSIDVSDNSRILSASYDNSIGFWSTIYKEMTVVDPLEDINNPNNKISTAARKRRKLTMKDGTIRRRAPLSLLESHTAPVEQVIFDSTDNTVGYSVSQDHTIKTWDLVTARCIDTRTTSYSLLSIAQLSTLNLLACGSSARHITLHDPRVGASSKVTQQQLIGHKNFVSSLDTCPENEYILCSGSHDGTVKVWDVRSTSPMYTITREDKSVQKGVNDKVFAVKWAEKVGIISAGQDKKIQINKGDNIFKN

Entity 51 Entity 51 polymer

Description description	Ribosome biogenesis protein RLP7
Molecular weight formula_weight	36621.1 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	t

MSSTQDSKAQTLNSNPEILLRKRRNADRTRIERQELAKKKREEQIKKKRSNKNKFVRAESIVAKTLATSREKERIKRVSILEDKKAKNETQHIASGKDFILKITEKANGAEENSVDLEETEEEEDDGLIREKTTYDGKPALLFIVRVRGPLAVNIPNKAFKILSLLRLVETNTGVFVKLTKNVYPLLKVIAPYVVIGKPSLSSIRSLIQKRGRIIYKGENEAEPHEIVLNDNNIVEEQLGDHGIICVEDIIHEIATMGESFSVCNFFLQPFKLNREVSGFGSLNRLRKIKQREAESRTRQFSNAATAPVIEVDIDSLLAKLN

Entity 52 Entity 52 polymer

Description description	5.8S ribosomal RNA gene and internal transcribed spacer 2
Molecular weight formula_weight	27786.3 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polyribonucleotide
Chain IDs strand_id	6

CCUUCUCAAACAUUCUGUUUGGUAGUGAGUGAUACUCUUUGGAGUUAACUUGAAAUUGCUGGCCUUUAGGCGAACAAUGUUCUUAAA

Entity 53 Entity 53 polymer

Description description	ATP-dependent RNA helicase HAS1
Molecular weight formula_weight	56798.3 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.13
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	D

MATPSNKRSRDSESTEEPVVDEKSTSKQNNAAPEGEQTTCVEKFEELKLSQPTLKAIEKMGFTTMTSVQARTIPPLLAGRDVLGAAKTGSGKTLAFLIPAIELLHSLKFKPRNGTGIIVITPTRELALQIFGVARELMEFHSQTFGIVIGGANRRQEAEKLMKGVNMLIATPGRLLDHLQNTKGFVFKNLKALIIDEADRILEIGFEDEMRQIIKILPNEDRQSMLFSATQTTKVEDLARISLRPGPLFINVVPETDNSTADGLEQGYVVCDSDKRFLLLFSFLKRNQKKKIIVFLSSCNSVKYYAELLNYIDLPVLELHGKQKQQKRTNTFFEFCNAERGILICTDVAARGLDIPAVDWIIQFDPPDDPRDYIHRVGRTARGTKGKGKSLMFLTPNELGFLRYLKASKVPLNEYEFPENKIANVQSQLEKLIKSNYYLHQTAKDGYRSYLQAYASHSLKTVYQIDKLDLAKVAKSYGFPVPPKVNITIGASGKTPNTKRRKTHK

Entity 54 Entity 54 polymer

Description description	Ribosome biogenesis protein 15
Molecular weight formula_weight	25499.2 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	o

MVKSTSKTSTKETVTKQPTEEKPIQEKEELALETSSSSSDEEDEKDEDEIEGLAASDDEQSGTHKIKRLNPKKQANEKKSKDKKTLEEYSGIIYVSRLPHGFHEKELSKYFAQFGDLKEVRLARNKKTGNSRHYGFLEFVNKEDAMIAQESMNNYLLMGHLLQVRVLPKGAKIEKLYKYKKRVLVEKGITKPVKQLKDNMKQKHEERIKKLAKSGIEFKW

Entity 55 Entity 55 polymer

Description description	;27S pre-rRNA (guanosine(2922)-2'-O)-methyltransferase ;
Molecular weight formula_weight	96656.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.167
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	w

MGKTQKKNSKGRLDRYYYLAKEKGYRARSSFKIIQINEKYGHFLEKSKVVIDLCAAPGSWCQVASKLCPVNSLIIGVDIVPMKPMPNVITFQSDITTEDCRSKLRGYMKTWKADTVLHDGAPNVGLGWVQDAFTQSQLTLQALKLAVENLVVNGTFVTKIFRSKDYNKLIWVFQQLFEKVEATKPPASRNVSAEIFVVCKGFKAPKRLDPRLLDPKEVFEELPDGQQNMESKIYNPEKKVRKRQGYEEGDNLLYHETSILDFVRTEDPISMLGEMNKFTIDENDHEWKILKKLKQTTDEFRSCIEDLKVLGKKDFKMILRWRKIAREILGIEVKDDAKTEIEVVPLTEEEQIEKDLQGLQEKQRLNVKRERRRKNEMKQKELQRMQMNMITPTDIGIEAASLGKESLFNLKTAEKTGILNDLAKGKKRMIFTDDELAKDNDIYIDENIMIKDKDSAADADDLESELNAMYSDYKTRRSERDAKFRAKQARGGDNEEEWTGFNEGSLEKKEEEGKDYIEDNDDEGVEGDSDDDEAITNLISKLKGQEGDHKLSSKARMIFNDPIFNNVEPDLPVNTVNDGIMSSESVGDISKLNKKRKHEEMHQKQDEADSSDESSSDDSDFEIVANDNASEEFDSDYDSEEEKNQTKKEKHSRDIDIATVEAMTLAHQLALGQKNKHDLVDEGFNRYTFRDTENLPDWFLEDEKEHSKINKPITKEAAMAIKEKIKAMNARPIKKVAEAKARKRMRAVARLEKIKKKAGLINDDSDKTEKDKAEEISRLMRKVTKKPKTKPKVTLVVASGRNKGLAGRPKGVKGKYKMVDGVMKNEQRALRRIAKKHHKKK

Entity 56 Entity 56 polymer

Description description	Ribosomal protein
Molecular weight formula_weight	24524.8 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	a

MSKITSSQVREHVKELLKYSNETKKRNFLETVELQVGLKNYDPQRDKRFSGSLKLPNCPRPNMSICIFGDAFDVDRAKSCGVDAMSVDDLKKLNKNKKLIKKLSKKYNAFIASEVLIKQVPRLLGPQLSKAGKFPTPVSHNDDLYGKVTDVRSTIKFQLKKVLCLAVAVGNVEMEEDVLVNQILMSVNFFVSLLKKNWQNVGSLVVKSSMGPAFRLY

Entity 57 Entity 57 polymer

Description description	RRP17 isoform 1
Molecular weight formula_weight	28032.6 kDa
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	5

MAVHTNRQILTRGKNYATKQSKKFGTDEVTFDKDSRLDYLTGFHKRKLQRQKKAQEFIKEQERLRKIEERQKIRQERKEVMEEQLKTFKESLNLEAEIEDAKNDKTEDLQVESDESWHGFDSDKDDGDNDNNESSVKPILKKGAITEIYDDSTTVELETLEPNDNFEYLAQLNNVKLEKAEKVLKQSINRATKYAKFLGVDEKQKKKPRVKKFRYLTKNERRINQRKANDNKRRR

Entity 58 Entity 58 polymer

Description description	ATP-dependent rRNA helicase SPB4
Molecular weight formula_weight	69492.2 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.13
Source method src_method	nat
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Polymer Polymer

Polymer type type	polypeptide(L)
Chain IDs strand_id	x

MSKSLEWDNLGFSLLPWIRTGLDVMGFETMTPVQASTIPMLAGNKDVVVDSVTGSGKTAAFVIPVLEKVVKEEANTSKFKKAHFHSLIIAPTRELSRQIESVVLSFLEHYPSDLFPIKCQLLVGTNEATVRDDVSNFLRNRPQILIGTPGRVLDFLQMPAVKTSACSMVVMDEADRLLDMSFIKDTEKILRLLPKQRRTGLFSATMRSAGSDIFKTGLRNPVRITVNSKNQAPSSLKLNYCVVNPAEKLQLLVSILNNYKFKKCIVYFPTCVSVSYFYSFIQYLGKRNILVNEVEIFSLHGKLQTSARTKTLTAFTDSLSNSVLFTTDVAARGIDIPDVDLVIQLDPPTNTDMFMHRCGRTGRANRVGKAITFLNEGREEDFIPFMQVKNVELEELDLEVKGITANFYEDFRNWILEDRDRFDKGVKAYVAFIKYYSNHSATSIFRLQSLDYVGIAKLYGLFRLPRMPEITKYLATEKQEGIFPGNWLVDPPVNMDEYKYKDKKREKERQETLKNISLINDKKKLKSELKKKNLAWSDKTLTKERKLERKEKMSLKRKAIEEELKAEELDENAEEERIKEDWKEIVLQNKRKKVSSKAIQGNFDDL

Entity 59 Entity 59 non-polymer

Description description	ZINC ION
Molecular weight formula_weight	65.4 kDa
Source method src_method	syn
Copy count entity_count	2

Entity 60 Entity 60 non-polymer

Description description	S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
Molecular weight formula_weight	384.4 kDa
Source method src_method	syn
Copy count entity_count	1

▶

Unit-cell length a length_a	1.000 Å
Unit-cell length b length_b	1.000 Å
Unit-cell length c length_c	1.000 Å
Unit-cell angle α angle_alpha	90.00 °
Unit-cell angle β angle_beta	90.00 °
Unit-cell angle γ angle_gamma	90.00 °
Molecules per unit cell Z z_pdb	—

Space group space_group	P 1
Space-group number int_tables_number	1
Crystal system crystal_system	triclinic

Resolution resolution	3.04 Å
Resolution测定Method resolution_method	—
颗粒数 num_particles	198000

State E2 nucleolar 60S ribosomal biogenesis intermediate - Composite model

1. Protein Identity and Related Structures Protein Identity & Related Structures

60S ribosomal subunit assembly/export protein LOC1

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

Ribosome biogenesis protein BRX1

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L3

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L4-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L6-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L7-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L9-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

rRNA-processing protein EBP2

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L13-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer

Other homooligomers

Heteromeric or nucleic-acid complex

60S ribosomal protein L14-A

State in the Current Structure

Other States of the Same Protein in the Database

Monomer

Homodimer

Homotetramer