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7nri

Structure of the darobactin-bound E. coli BAM complex (BamABCDE)

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 134.7 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Outer membrane protein assembly factor BamA

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P0A940

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 21–808 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （P0A903） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （P0AC02） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （P0A937） 3-PYRIDIN-4-YL-2,4-DIHYDRO-INDENO[1,2-.C.]PYRAZOLE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；4microL of sample applied 分辨率 3.03 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7NRI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2QCZ Structure of N-terminal domain of E. Coli YaeT 提交 2007-06-20 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–351（331 aa） 片段：residues 21-351
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；10% PEG 10K, 100mM sodium acetate, 100 mM magnesium formate, 10%glycerol, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.70 Å R-free 0.329
2QCZ Structure of N-terminal domain of E. Coli YaeT 提交 2007-06-20 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–351（331 aa） 片段：residues 21-351
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；10% PEG 10K, 100mM sodium acetate, 100 mM magnesium formate, 10%glycerol, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.70 Å R-free 0.329
2QDF Structure of N-terminal domain of E. Coli YaeT 提交 2007-06-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–351（331 aa） 片段：residues 21-351
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；10% PEG 10K, 100mM sodium acetate, 100 mM magnesium formate, 10%glycerol, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.286
2V9H Solution Structure of an Escherichia coli YaeT tandem POTRA domain 提交 2007-08-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–174（154 aa） 片段：POTRA DOMAINS 1 AND 2, RESIDUES 21-174
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）86；压力 1.0
NMR样品组成 50 MM MES, 50 MM NACL
分辨率未提供
3EFC Crystal Structure of YaeT periplasmic domain 提交 2008-09-08 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–410（390 aa） 片段：periplasmic domain (UNP residues 21-410)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289.15 K；1.3-1.6M (NH4)2SO4, 3-6% polyethylene glycol 400, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289.15K
分辨率 3.30 Å R-free 0.295
4C4V Structure of the outer membrane protein insertase BamA with one POTRA domain. 提交 2013-09-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 347–810（464 aa） 片段：BAMA TRUNCATED BY 4 POTRA DOMAINS, RESIDUES 347-808
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.292
4C4V Structure of the outer membrane protein insertase BamA with one POTRA domain. 提交 2013-09-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 344–810（467 aa） 片段：BAMA TRUNCATED BY 4 POTRA DOMAINS, RESIDUES 344-808
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.292
4N75 Structural Basis of BamA-mediate Outer Membrane Protein Biogenesis 提交 2013-10-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 427–810（384 aa） 片段：barrel domain, UNP residues 427-810
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；0.1M MES PH 6.0, 6% Tacsimate, 25% PEG 4000, 0.6% C8E4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.253
4N75 Structural Basis of BamA-mediate Outer Membrane Protein Biogenesis 提交 2013-10-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 427–810（384 aa） 片段：barrel domain, UNP residues 427-810
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；0.1M MES PH 6.0, 6% Tacsimate, 25% PEG 4000, 0.6% C8E4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.253
4PK1 Structure of BamB fused to a BamA POTRA domain fragment 提交 2014-05-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 175–424（250 aa） 片段：UNP P0A940 residues 175-424,UNP P77774 residues 21-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；The BamA-BamB chimera protein was crystallized at 16 degC by sitting drop vapor diffusion method. Initial crystallizing conditions were refined in a hanging drop in the following solution: 1.4M Ammonium sulfate, 9% 2-propanol, and 0.1M Sodium acetate pH 5.5. We used 1.5 uL of the 20mg/ml protein mixed with 1.5 uL mother liquor in a reservoir filled with 500 uL precipitant solution
分辨率 3.10 Å R-free 0.281
4XGA Crystal structure of BamB and BamA P3-5 complex from E.coli 提交 2014-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 175–420（246 aa） 片段：UNP RESIDUES 175-420
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1% w/v Tryptone, 20% w/v Polyethylene glycol 3350, 0.05M HEPES sodium pH 7.0
分辨率 2.15 Å R-free 0.231
5AYW Structure of a membrane complex 提交 2015-09-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 22–810（789 aa） 片段：UNP residues 22-810
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；Tris-HCl, NaCl, PEG 400
分辨率 3.56 Å R-free 0.314
5D0O BamABCDE complex, outer membrane beta barrel assembly machinery entire complex 提交 2015-08-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH7.5, 30% PEG600, CYMAL-4
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–810（809 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 2–810（809 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5EKQ The structure of the BamACDE subcomplex from E. coli 提交 2015-11-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–810（790 aa） 片段：UNP residues 21-810
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；100 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM MgCl2, 10 mM MnCl2, and 8% PEG 4000
分辨率 3.39 Å R-free 0.281
6LYQ Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.293
6LYR Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.28 Å R-free 0.280
6LYS Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.05 Å R-free 0.284
6LYU Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6T1W Structure of E. coli BamA in complex with lipoprotein RcsF 提交 2019-10-07 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.03 M sodium nitrate, 0.03 M sodium phosphate dibasic, 0.03 M ammonium sulfate, 0.10 M Tris-base [pH 8.5]; BICINE, 20 % (v/v) ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000
分辨率 3.79 Å R-free 0.317
6T1W Structure of E. coli BamA in complex with lipoprotein RcsF 提交 2019-10-07 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.03 M sodium nitrate, 0.03 M sodium phosphate dibasic, 0.03 M ammonium sulfate, 0.10 M Tris-base [pH 8.5]; BICINE, 20 % (v/v) ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000
分辨率 3.79 Å R-free 0.317
6V05 Cryo-EM structure of a substrate-engaged Bam complex 提交 2019-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
链 F 1–21（21 aa）
链 F 22–171（150 aa）
链 F 422–429（8 aa）
链 F 440–810（371 aa）
突变：C690S, C700S, F804C 突变：T467C,C690S,C700S,deletion of residues 172-421,deletion of residues 430-439 突变：T467C,C690S,C700S,deletion of residues 172-421,deletion of residues 430-439 突变：T467C,C690S,C700S,deletion of residues 172-421,deletion of residues 430-439 突变：T467C,C690S,C700S,deletion of residues 172-421,deletion of residues 430-439 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7BNQ Lateral-closed conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-22 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：E435C S665C C690S C700S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7NBX Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：E435C S665C C690S C700S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NCS Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) bound by a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：E435C S665C C690S C700S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7ND0 lateral-open conformation of the wild-type BAM complex (BamABCDE) bound to a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7R1W E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to dynobactin A 提交 2022-02-03 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–809（809 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.05% (w/v) n-dodecyl Beta-D-maltopyranoside (DDM)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7RI4 Structure of a BAM/EspP(beta9-12) hybrid-barrel intermediate 提交 2021-07-19 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7RI5 Structure of a BAM in MSP1E3D1 nanodiscs at 4 Angstrom resolution 提交 2021-07-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7RI6 Structure of BAM in MSP1E3D1 nanodiscs prepared from E. coli outer membranes 提交 2021-07-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
7RI7 The structure of BAM in MSP1D1 nanodiscs 提交 2021-07-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
7RI8 The structure of BAM in MSP2N2 nanodiscs 提交 2021-07-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.50 Å
7RI9 The structure of BAM in MSP1E3D1 at 6.9 Angstrom resolution 提交 2021-07-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
7RJ5 The structure of BAM in complex with EspP at 7 Angstrom resolution 提交 2021-07-20 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
7YE4 BAM-EspP complex structure with BamA-G431C and G781C/EspP-N1293C and A1043C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：G431C,G781C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YE6 BAM-EspP complex structure with BamA-N427C/EspP-R1297C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：N427C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ADG Cryo-EM structure of Darobactin 22 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8ADI Cryo-EM structure of Darobactin 9 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8BNZ BAM-EspP complex structure with BamA-G431C/EspP-N1293C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：G431C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BVQ E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to darobactin B 提交 2022-12-05 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PZ1 Wait Complex: Lateral open BAM bound Compact SurA 提交 2023-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：R76C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8PZ2 Wait Complex: Lateral open BAM bound Extended SurA 提交 2023-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：R76C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8PZU Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Compact SurA 提交 2023-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：R76C MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8QN4 Structure of the BAM-EspP complex in an open EspP intermediate state 提交 2023-09-25 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：G431C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8QPV Handover Complex: BAM bound OmpX and extended SurA 提交 2023-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QPW Arrival Complex: Lateral open BAM bound extended SurA plus OmpX 提交 2023-10-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
9CNW CryoEM structure of the APO-BAM complex in DDM detergent 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9CNX CryoEM structure of BAM in complex with the PTB1 closed-state inhibitor (in DDM detergent) 提交 2024-07-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9CNY CryoEM structure of the APO-BAM complex in SMA nanodisc 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9CNZ Structure of BAM complexed with PTB2 ligand in detergent 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CO0 CryoEM structure of BAM in complex with the PTB2 open-state inhibitor (in SMA nanodisc) 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9H84 BAM-hinge (LVPR) 提交 2024-10-28 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 92–810（719 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9H85 BAM-hinge (GSGS) 提交 2024-10-28 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9H89 BAM-hinge (LVPR) suppressor (T434A) 提交 2024-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：T434A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9HE1 Structure of the Xenorceptide A2-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2024-11-13 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；25 mM NaPi, 100 mM NaCl, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3.5uL sample, blot time 3sec, Blotforce 1, Blot total 1,
分辨率 3.00 Å
9HG5 BAM-SurA complex in the swing-in state with full length BamC resolved 提交 2024-11-19 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HG6 BAM-SurA complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9HG7 BAM-SurA complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9HG8 BAM-SurA complex in the swing-out state with BamC resolved 提交 2024-11-19 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9HG9 BAM-SurA-darobactin complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9HGA BAM-SurA-darobactin complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9MGE beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an early state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 24–810（787 aa）
链 F 22–171（150 aa）
链 F 422–810（389 aa）
突变：D512C 突变：Y637C 突变：Y637C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MGF beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a middle state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
链 F 22–171（150 aa）
链 F 422–810（389 aa）
突变：D512C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MGG beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a late state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 24–810（787 aa）
链 F 22–171（150 aa）
链 F 422–810（389 aa）
突变：D512C 突变：I458C 突变：I458C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å

共 64 个其他 PDB 条目、69 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BAMA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–788； UniProt 21–808

Outer membrane protein assembly factor BamB

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P77774

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 20–392 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （P0A940） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （P0A903） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （P0AC02） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （P0A937） 3-PYRIDIN-4-YL-2,4-DIHYDRO-INDENO[1,2-.C.]PYRAZOLE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；4microL of sample applied 分辨率 3.03 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7NRI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2YH3 The structure of BamB from E. coli 提交 2011-04-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–392（371 aa） 片段：RESIDUES 22-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；3.5M NH4CL, 0.1M NA-ACETATE PH 4.6
分辨率 2.60 Å R-free 0.270
2YMS Structure and assembly of a b-propeller with nine blades and a new conserved repetitive sequence motif 提交 2012-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 62–191（130 aa） 片段：FRAGMENTS OF BAMB FROM E. COLI, RESIDUES 62-191
链 B 113–186（74 aa） 片段：FRAGMENTS OF BAMB FROM E. COLI, RESIDUES 113-186
链 C 248–322（75 aa） 片段：FRAGMENTS OF BAMB FROM E. COLI, RESIDUES 248-322
链 D 247–320（74 aa） 片段：FRAGMENTS OF BAMB FROM E. COLI, RESIDUES 249-320
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.239
3P1L Crystal structure of Escherichia coli BamB, a lipoprotein component of the beta-barrel assembly machinery complex, native crystals. 提交 2010-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；0.1M Citric acid, 2M NaCl, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.60 Å R-free 0.233
3PRW Crystal structure of the lipoprotein BamB 提交 2010-11-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP Residues 21-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；292 K；100 mM Tris, pH 6.9, 20% PEG 3350, 200 mM ammonium citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
3Q7M The crystal structure of BamB from the BAM complex in spacegroup I222 提交 2011-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP residues 21-392
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.18 M triammonium citrate, 20% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.193
3Q7N The crystal structure of BamB from the BAM complex in spacegroup P212121 提交 2011-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP residues 21-392
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.18 M triammonium citrate, 20% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.77 Å R-free 0.232
3Q7O The crystal structure of BamB from the BAM complex in spacegroup P213 提交 2011-01-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP residues 21-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；298 K；1.0 M lithium sulfate, 2% PEG8000, pH 7.5, temperature 298K
分辨率 2.09 Å R-free 0.263
4PK1 Structure of BamB fused to a BamA POTRA domain fragment 提交 2014-05-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP P0A940 residues 175-424,UNP P77774 residues 21-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；The BamA-BamB chimera protein was crystallized at 16 degC by sitting drop vapor diffusion method. Initial crystallizing conditions were refined in a hanging drop in the following solution: 1.4M Ammonium sulfate, 9% 2-propanol, and 0.1M Sodium acetate pH 5.5. We used 1.5 uL of the 20mg/ml protein mixed with 1.5 uL mother liquor in a reservoir filled with 500 uL precipitant solution
分辨率 3.10 Å R-free 0.281
4XGA Crystal structure of BamB and BamA P3-5 complex from E.coli 提交 2014-12-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–392（373 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1% w/v Tryptone, 20% w/v Polyethylene glycol 3350, 0.05M HEPES sodium pH 7.0
分辨率 2.15 Å R-free 0.231
5AYW Structure of a membrane complex 提交 2015-09-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–392（373 aa） 片段：UNP residues 20-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；Tris-HCl, NaCl, PEG 400
分辨率 3.56 Å R-free 0.314
5D0O BamABCDE complex, outer membrane beta barrel assembly machinery entire complex 提交 2015-08-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH7.5, 30% PEG600, CYMAL-4
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
5LJO E. coli BAM complex (BamABCDE) by cryoEM 提交 2016-07-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 22–392（371 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Double blot. 3 ul sampel applied and blotted by hand, then additional 3 ul sample applied, blotted, and plunge frozen
分辨率 4.90 Å
6LYQ Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.293
6LYR Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.28 Å R-free 0.280
6LYS Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.05 Å R-free 0.284
6LYU Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6V05 Cryo-EM structure of a substrate-engaged Bam complex 提交 2019-11-18 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7BNQ Lateral-closed conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-22 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7NBX Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-28 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NCS Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) bound by a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7ND0 lateral-open conformation of the wild-type BAM complex (BamABCDE) bound to a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7R1W E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to dynobactin A 提交 2022-02-03 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.05% (w/v) n-dodecyl Beta-D-maltopyranoside (DDM)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7TTC BamABCDE bound to substrate EspP 提交 2022-02-01 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 K33 2,3-dideoxy-6-O-[2-deoxy-4-O-phosphono-2-(tetradecanoylamino)-alpha-L-gulopyranosyl]-1-O-phosphono-beta-D-threo-hexopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7YE4 BAM-EspP complex structure with BamA-G431C and G781C/EspP-N1293C and A1043C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YE6 BAM-EspP complex structure with BamA-N427C/EspP-R1297C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ADG Cryo-EM structure of Darobactin 22 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8ADI Cryo-EM structure of Darobactin 9 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8BNZ BAM-EspP complex structure with BamA-G431C/EspP-N1293C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BO2 BAM-EspP complex structure with BamA-S425C/EspP-S1299C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BVQ E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to darobactin B 提交 2022-12-05 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8BWC E. coli BAM complex (BamABCDE) wild-type 提交 2022-12-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PZ1 Wait Complex: Lateral open BAM bound Compact SurA 提交 2023-07-26 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8PZ2 Wait Complex: Lateral open BAM bound Extended SurA 提交 2023-07-26 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8PZU Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Compact SurA 提交 2023-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PZV Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Extended SurA 提交 2023-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8QN4 Structure of the BAM-EspP complex in an open EspP intermediate state 提交 2023-09-25 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8QPV Handover Complex: BAM bound OmpX and extended SurA 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QPW Arrival Complex: Lateral open BAM bound extended SurA plus OmpX 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8SPR The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta1-12) complex 提交 2023-05-03 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–392（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SQA The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex 提交 2023-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–392（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8SQB The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta7-12) complex 提交 2023-05-04 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–392（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9CNW CryoEM structure of the APO-BAM complex in DDM detergent 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9CNX CryoEM structure of BAM in complex with the PTB1 closed-state inhibitor (in DDM detergent) 提交 2024-07-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9CNY CryoEM structure of the APO-BAM complex in SMA nanodisc 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9CNZ Structure of BAM complexed with PTB2 ligand in detergent 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CO0 CryoEM structure of BAM in complex with the PTB2 open-state inhibitor (in SMA nanodisc) 提交 2024-07-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9H84 BAM-hinge (LVPR) 提交 2024-10-28 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 22–392（371 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9H85 BAM-hinge (GSGS) 提交 2024-10-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9H89 BAM-hinge (LVPR) suppressor (T434A) 提交 2024-10-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9HE1 Structure of the Xenorceptide A2-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2024-11-13 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；25 mM NaPi, 100 mM NaCl, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3.5uL sample, blot time 3sec, Blotforce 1, Blot total 1,
分辨率 3.00 Å
9HG5 BAM-SurA complex in the swing-in state with full length BamC resolved 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HG6 BAM-SurA complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9HG7 BAM-SurA complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9HG8 BAM-SurA complex in the swing-out state with BamC resolved 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9HG9 BAM-SurA-darobactin complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9HGA BAM-SurA-darobactin complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9MGE beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an early state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MGF beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a middle state of substrate assembly 提交 2024-12-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MGG beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a late state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å

共 63 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BAMB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–373； UniProt 20–392

Outer membrane protein assembly factor BamC

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P0A903

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 25–344 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （P0A940） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （P0AC02） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （P0A937） 3-PYRIDIN-4-YL-2,4-DIHYDRO-INDENO[1,2-.C.]PYRAZOLE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；4microL of sample applied 分辨率 3.03 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7NRI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2LAE NMR solution structure of the C-terminal domain of the E. coli lipoprotein BamC 提交 2011-03-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 101–344（244 aa） 片段：sequence database residues 229-344
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.1 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 1 X HALT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.1 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 1 X HALT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.1 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 1 X HALT, 21 mg/ml Pf1 phage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2LAF NMR solution structure of the N-terminal domain of the E. coli lipoprotein BamC 提交 2011-03-11 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 101–344（244 aa） 片段：sequence database residues 101-212
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.6；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.1 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 1 X HALT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.1 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 1 X HALT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 0.1 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 1 X HALT, 21 mg/ml Pf1 phage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2YH6 Structure of the N-terminal domain of BamC from E. coli 提交 2011-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 101–212（112 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 101-212
链 D 101–212（112 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 101-212
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 3.5；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M CITRIC ACID PH 3.5
分辨率 1.55 Å R-free 0.234
2YH6 Structure of the N-terminal domain of BamC from E. coli 提交 2011-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 101–212（112 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 101-212
链 B 101–212（112 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN, RESIDUES 101-212
未记录 SO4 SULFATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 3.5；2 M (NH4)2SO4, 0.1 M CITRIC ACID PH 3.5
分辨率 1.55 Å R-free 0.234
3SNS Crystal structure of the C-terminal domain of Escherichia coli lipoprotein BamC 提交 2011-06-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 224–343（120 aa） 片段：C-terminal domain (UNP residues 224-343)
未记录 CL CHLORIDE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；0.1 M sodium chloride, 0.1 M HEPES, pH 6.5, 1.6 M ammonium sulfate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 1.50 Å R-free 0.183
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 26–344（319 aa） 片段：UNP residues 26-344
未记录 K POTASSIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2；295 K；0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 26–344（319 aa） 片段：UNP residues 26-344
未记录 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2；295 K；0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 26–344（319 aa） 片段：UNP residues 26-344
链 D 26–344（319 aa） 片段：UNP residues 26-344
未记录 K POTASSIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2；295 K；0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 26–344（319 aa） 片段：UNP residues 26-344
链 D 26–344（319 aa） 片段：UNP residues 26-344
未记录 K POTASSIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2；295 K；0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
5AYW Structure of a membrane complex 提交 2015-09-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 33–88（56 aa） 片段：UNP residues 33-88
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；Tris-HCl, NaCl, PEG 400
分辨率 3.56 Å R-free 0.314
5D0O BamABCDE complex, outer membrane beta barrel assembly machinery entire complex 提交 2015-08-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH7.5, 30% PEG600, CYMAL-4
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 2–344（343 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 G 2–344（343 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5EKQ The structure of the BamACDE subcomplex from E. coli 提交 2015-11-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 25–344（320 aa） 片段：UNP residues 25-344
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；100 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM MgCl2, 10 mM MnCl2, and 8% PEG 4000
分辨率 3.39 Å R-free 0.281
5LJO E. coli BAM complex (BamABCDE) by cryoEM 提交 2016-07-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 25–189（165 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Double blot. 3 ul sampel applied and blotted by hand, then additional 3 ul sample applied, blotted, and plunge frozen
分辨率 4.90 Å
6LYQ Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.293
6LYR Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.28 Å R-free 0.280
6LYS Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.05 Å R-free 0.284
6LYU Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7BNQ Lateral-closed conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-22 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7NBX Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-28 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NCS Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) bound by a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7ND0 lateral-open conformation of the wild-type BAM complex (BamABCDE) bound to a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7R1W E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to dynobactin A 提交 2022-02-03 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.05% (w/v) n-dodecyl Beta-D-maltopyranoside (DDM)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7YE4 BAM-EspP complex structure with BamA-G431C and G781C/EspP-N1293C and A1043C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YE6 BAM-EspP complex structure with BamA-N427C/EspP-R1297C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ADG Cryo-EM structure of Darobactin 22 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8ADI Cryo-EM structure of Darobactin 9 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8BNZ BAM-EspP complex structure with BamA-G431C/EspP-N1293C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BO2 BAM-EspP complex structure with BamA-S425C/EspP-S1299C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BVQ E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to darobactin B 提交 2022-12-05 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PZ1 Wait Complex: Lateral open BAM bound Compact SurA 提交 2023-07-26 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8PZ2 Wait Complex: Lateral open BAM bound Extended SurA 提交 2023-07-26 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8PZU Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Compact SurA 提交 2023-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PZV Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Extended SurA 提交 2023-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8QN4 Structure of the BAM-EspP complex in an open EspP intermediate state 提交 2023-09-25 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8QPV Handover Complex: BAM bound OmpX and extended SurA 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QPW Arrival Complex: Lateral open BAM bound extended SurA plus OmpX 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8SPR The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta1-12) complex 提交 2023-05-03 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 26–344（319 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9H84 BAM-hinge (LVPR) 提交 2024-10-28 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 25–91（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9H85 BAM-hinge (GSGS) 提交 2024-10-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9H89 BAM-hinge (LVPR) suppressor (T434A) 提交 2024-10-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9HE1 Structure of the Xenorceptide A2-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2024-11-13 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；25 mM NaPi, 100 mM NaCl, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3.5uL sample, blot time 3sec, Blotforce 1, Blot total 1,
分辨率 3.00 Å
9HG5 BAM-SurA complex in the swing-in state with full length BamC resolved 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HG6 BAM-SurA complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9HG7 BAM-SurA complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9HG8 BAM-SurA complex in the swing-out state with BamC resolved 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9HG9 BAM-SurA-darobactin complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9HGA BAM-SurA-darobactin complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9MGE beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an early state of substrate assembly 提交 2024-12-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MGF beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a middle state of substrate assembly 提交 2024-12-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MGG beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a late state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å

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UniProt名称 BAMC_ECOLI
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–320； UniProt 25–344

Outer membrane protein assembly factor BamD

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P0AC02

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 20–245 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （P0A940） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （P0A903） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （P0A937） 3-PYRIDIN-4-YL-2,4-DIHYDRO-INDENO[1,2-.C.]PYRAZOLE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；4microL of sample applied 分辨率 3.03 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 7NRI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2YHC Structure of BamD from E. coli 提交 2011-04-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 29–245（217 aa） 片段：RESIDUES 29-245
未记录 URE UREA × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；30% PEG 4000, 10% I-PROH, 0.1 M HEPES PH 7.5 .
分辨率 1.80 Å R-free 0.233
3Q5M Crystal structure of Escherichia coli BamD 提交 2010-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 23–245（223 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.14M KI, 26%-27% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3Q5M Crystal structure of Escherichia coli BamD 提交 2010-12-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 23–245（223 aa）
未记录 IOD IODIDE ION × 14 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；0.14M KI, 26%-27% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.60 Å R-free 0.261
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 21–245（225 aa） 片段：UNP residues 21-245
未记录 K POTASSIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2；295 K；0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 21–245（225 aa） 片段：UNP residues 21-245
未记录 GOL GLYCEROL × 3 CL CHLORIDE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2；295 K；0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–245（225 aa） 片段：UNP residues 21-245
链 B 21–245（225 aa） 片段：UNP residues 21-245
未记录 K POTASSIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 4 CL CHLORIDE ION × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2；295 K；0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
3TGO Crystal structure of the E. coli BamCD complex 提交 2011-08-17 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 21–245（225 aa） 片段：UNP residues 21-245
链 B 21–245（225 aa） 片段：UNP residues 21-245
未记录 K POTASSIUM ION × 2 GOL GLYCEROL × 8 CL CHLORIDE ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 9.2；295 K；0.2 M K2HPO4 and 20% PEG3350, pH 9.2, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.90 Å R-free 0.243
5AYW Structure of a membrane complex 提交 2015-09-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 20–245（226 aa） 片段：UNP residues 20-245
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；Tris-HCl, NaCl, PEG 400
分辨率 3.56 Å R-free 0.314
5D0O BamABCDE complex, outer membrane beta barrel assembly machinery entire complex 提交 2015-08-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH7.5, 30% PEG600, CYMAL-4
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 2–245（244 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 H 2–245（244 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5EKQ The structure of the BamACDE subcomplex from E. coli 提交 2015-11-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 D 20–245（226 aa） 片段：UNP residues 20-245
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；100 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM MgCl2, 10 mM MnCl2, and 8% PEG 4000
分辨率 3.39 Å R-free 0.281
6LYQ Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.293
6LYR Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.28 Å R-free 0.280
6LYS Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.05 Å R-free 0.284
6LYU Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7BNQ Lateral-closed conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-22 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7NBX Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-28 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NCS Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) bound by a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7ND0 lateral-open conformation of the wild-type BAM complex (BamABCDE) bound to a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7R1W E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to dynobactin A 提交 2022-02-03 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.05% (w/v) n-dodecyl Beta-D-maltopyranoside (DDM)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7YE4 BAM-EspP complex structure with BamA-G431C and G781C/EspP-N1293C and A1043C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YE6 BAM-EspP complex structure with BamA-N427C/EspP-R1297C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ADG Cryo-EM structure of Darobactin 22 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8ADI Cryo-EM structure of Darobactin 9 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8BNZ BAM-EspP complex structure with BamA-G431C/EspP-N1293C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BO2 BAM-EspP complex structure with BamA-S425C/EspP-S1299C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BVQ E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to darobactin B 提交 2022-12-05 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PZ1 Wait Complex: Lateral open BAM bound Compact SurA 提交 2023-07-26 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8PZ2 Wait Complex: Lateral open BAM bound Extended SurA 提交 2023-07-26 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8PZU Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Compact SurA 提交 2023-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PZV Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Extended SurA 提交 2023-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8QN4 Structure of the BAM-EspP complex in an open EspP intermediate state 提交 2023-09-25 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8QPV Handover Complex: BAM bound OmpX and extended SurA 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QPW Arrival Complex: Lateral open BAM bound extended SurA plus OmpX 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
9H85 BAM-hinge (GSGS) 提交 2024-10-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9H89 BAM-hinge (LVPR) suppressor (T434A) 提交 2024-10-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9HE1 Structure of the Xenorceptide A2-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2024-11-13 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；25 mM NaPi, 100 mM NaCl, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3.5uL sample, blot time 3sec, Blotforce 1, Blot total 1,
分辨率 3.00 Å
9HG5 BAM-SurA complex in the swing-in state with full length BamC resolved 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HG6 BAM-SurA complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9HG7 BAM-SurA complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9HG8 BAM-SurA complex in the swing-out state with BamC resolved 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9HG9 BAM-SurA-darobactin complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9HGA BAM-SurA-darobactin complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9MGE beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an early state of substrate assembly 提交 2024-12-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MGF beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a middle state of substrate assembly 提交 2024-12-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MGG beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a late state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å

共 46 个其他 PDB 条目、51 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BAMD_ECOLI
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–226； UniProt 20–245

Outer membrane protein assembly factor BamE

Escherichia coli (strain K12)

UniProt P0A937

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 20–113 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （P0A940） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （P0A903） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （P0AC02） 3-PYRIDIN-4-YL-2,4-DIHYDRO-INDENO[1,2-.C.]PYRAZOLE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；4microL of sample applied 分辨率 3.03 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 7NRI Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2KM7 Solution Structure of BamE, a component of the outer membrane protein assembly machinery in Escherichia coli 提交 2009-07-24 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–114（94 aa）
突变：C20S 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；303 K；压力 ambient
NMR样品组成 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] BamE, 50 mM sodium phosphate, 50 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KXX NMR Structure of Escherichia coli BamE, a Lipoprotein Component of the beta-Barrel Assembly Machinery Complex 提交 2010-05-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.6；288 K；离子强度（mmCIF原始值）0.02；压力 ambient
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] E. coli protein, 15 % D2O, 85 % H2O, 20 mM Na2HPO4/NaH2PO4, 85% H2O/15% D2O | 85% H2O/15% D2O
分辨率未提供
2YH9 Crystal structure of the dimeric BamE from E. coli 提交 2011-04-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 34–113（80 aa） 片段：RESIDUES 34-113
链 B 34–113（80 aa） 片段：RESIDUES 34-113
链 C 34–113（80 aa） 片段：RESIDUES 34-113
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；30% PEG 4000, 10% I-PROH, 0.1 M HEPES PH 7.5
分辨率 1.80 Å R-free 0.229
5AYW Structure of a membrane complex 提交 2015-09-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 20–113（94 aa） 片段：UNP residues 20-113
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；Tris-HCl, NaCl, PEG 400
分辨率 3.56 Å R-free 0.314
5D0O BamABCDE complex, outer membrane beta barrel assembly machinery entire complex 提交 2015-08-03 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH7.5, 30% PEG600, CYMAL-4
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 2–113（112 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 I 2–113（112 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5EKQ The structure of the BamACDE subcomplex from E. coli 提交 2015-11-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 E 20–113（94 aa） 片段：UNP residues 20-113
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；100 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM MgCl2, 10 mM MnCl2, and 8% PEG 4000
分辨率 3.39 Å R-free 0.281
6LYQ Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.293
6LYR Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.28 Å R-free 0.280
6LYS Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.05 Å R-free 0.284
6LYU Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7BNQ Lateral-closed conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-22 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7NBX Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-28 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NCS Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) bound by a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7ND0 lateral-open conformation of the wild-type BAM complex (BamABCDE) bound to a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7R1W E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to dynobactin A 提交 2022-02-03 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.05% (w/v) n-dodecyl Beta-D-maltopyranoside (DDM)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7YE4 BAM-EspP complex structure with BamA-G431C and G781C/EspP-N1293C and A1043C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YE6 BAM-EspP complex structure with BamA-N427C/EspP-R1297C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ADG Cryo-EM structure of Darobactin 22 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8ADI Cryo-EM structure of Darobactin 9 bound BAM complex 提交 2022-07-08 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8BNZ BAM-EspP complex structure with BamA-G431C/EspP-N1293C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BO2 BAM-EspP complex structure with BamA-S425C/EspP-S1299C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BVQ E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to darobactin B 提交 2022-12-05 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PZ1 Wait Complex: Lateral open BAM bound Compact SurA 提交 2023-07-26 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8PZ2 Wait Complex: Lateral open BAM bound Extended SurA 提交 2023-07-26 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8PZU Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Compact SurA 提交 2023-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PZV Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Extended SurA 提交 2023-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8QN4 Structure of the BAM-EspP complex in an open EspP intermediate state 提交 2023-09-25 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8QPV Handover Complex: BAM bound OmpX and extended SurA 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QPW Arrival Complex: Lateral open BAM bound extended SurA plus OmpX 提交 2023-10-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
9H85 BAM-hinge (GSGS) 提交 2024-10-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9H89 BAM-hinge (LVPR) suppressor (T434A) 提交 2024-10-28 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9HE1 Structure of the Xenorceptide A2-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2024-11-13 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；25 mM NaPi, 100 mM NaCl, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3.5uL sample, blot time 3sec, Blotforce 1, Blot total 1,
分辨率 3.00 Å
9HG5 BAM-SurA complex in the swing-in state with full length BamC resolved 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HG6 BAM-SurA complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9HG7 BAM-SurA complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9HG8 BAM-SurA complex in the swing-out state with BamC resolved 提交 2024-11-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9HG9 BAM-SurA-darobactin complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9HGA BAM-SurA-darobactin complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9MGE beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an early state of substrate assembly 提交 2024-12-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MGF beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a middle state of substrate assembly 提交 2024-12-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 E 20–113（94 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MGG beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a late state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å

共 46 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BAME_ECOLI
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–94； UniProt 20–113

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 7nri

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 7nri
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id7nri
沉积日期 deposition_date2021-03-03
结构标题 titleStructure of the darobactin-bound E. coli BAM complex (BamABCDE)
关键词 keywords;Beta-Barrel, outer membrane, protein insertion, protein folding, protein maturation, antibiotic, natural product, cyclized peptide, MEMBRANE PROTEIN ;; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier43.42 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron42.92 Å
零角强度 I(0) i0428451000.00
分子量 molecular_weight167000.0 kDa
排除体积 excluded_volume207730 ų
包络体积 envelope_volume308580 ų
水化壳体积 shell_volume60715 ų
包络直径 envelope_diameter143.8 Å
壳层 Rg shell_rg47.96 Å
包络 Rg envelope_rg41.21 Å
形状 Rg shape_rg42.92 Å
总 Rg total_rg43.18 Å
总原子数 total_atoms23151
残基数 n_residues1504
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax134.7 Å
Rg (实空间) rg_real43.21 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.97 Å
I(0) (实空间) i0_real4.2850e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error6.8050e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal43.42 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal428600000.0000
解质量估计 total_estimate0.8955
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary67.3 Å
偏度 Skewness skewness0.013
峰度 Kurtosis kurtosis-0.658
角度范围 angular_range— – 0.1800 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha47490000.0000
实空间数据点数 n_real_points37
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.916; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.997; Smooth: 0.892
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id7nriA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily310 — membrane protein fhac
结构域编号 domain_id7nriA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily310 — membrane protein fhac
结构域编号 domain_id7nriA03
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily310 — membrane protein fhac
结构域编号 domain_id7nriA04
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily310 — membrane protein fhac
结构域编号 domain_id7nriA05
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily310 — membrane protein fhac
结构域编号 domain_id7nriA06
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology160 — Porin
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily50 — membrane protein fhac: a member of the omp85/tpsb transporter family
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)