ATP synthase subunit 9
物种未注明
当前结构中的状态
| Assembly | 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与共同组分 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 | 链 0; UniProt 1–76 链 1; UniProt 1–76 链 2; UniProt 1–76 链 3; UniProt 1–76 链 4; UniProt 1–76 链 5; UniProt 1–76 链 6; UniProt 1–76 链 7; UniProt 1–76 链 8; UniProt 1–76 链 9; UniProt 1–76 | 未记录 | ATP synthase subunit alpha × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta × 3 (P00830) ATP synthase subunit gamma × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon × 1 (P21306) ATP synthase subunit 5 × 1 (P09457) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit 4 × 1 (P05626) ATP synthase subunit d × 1 (P30902) ATP synthase subunit f × 1 (Q06405) ATP synthase subunit H × 1 (Q12349) ATP synthase subunit J × 1 (P81450) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) | ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE-PROPANE | 分辨率 4.60 Å |
数据库中的同蛋白其他状态
以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。
| 其他 PDB | 相对当前条目 7TKP | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法与环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2WPD The Mg.ADP inhibited state of the yeast F1c10 ATP synthase 提交 2009-08-05 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric |
链 J
1–76(76 aa)
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
链 P
1–76(76 aa)
链 Q
1–76(76 aa)
链 R
1–76(76 aa)
链 S
1–76(76 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 7.5;0.1 M HEPES/HCL PH 7.5, 12% PEG MME 5000, 100 MM SODIUM CHLORIDE MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION CONTAINING 0.64 MM DDM, 25 MM TRIS/HCL PH 8.0, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 25 MM TREHALOSE, 0.5 MM EDTA, 0.02% SODIUM AZIDE, 2 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 0.66 MM ADP, 0.1 MM DCCD, 2.5 MM DTT, 0.5 MM PMSF
|
分辨率 3.43 Å R-free 0.297 |
| 2XOK Refined structure of yeast F1c10 ATPase complex to 3 A resolution 提交 2010-08-18 | 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:nonadecameric |
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
链 P
1–76(76 aa)
链 Q
1–76(76 aa)
链 R
1–76(76 aa)
链 S
1–76(76 aa)
链 T
1–76(76 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
MICROBATCH;pH 8;0.1 M TRIS/CL PH8.0, 12% PEG 6000, 150 MM NACL, 1 MM AMP-PNP, 40 MICROM ADP, 1 MM DTT, 0.02% NAN3. MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION UNDER PARAFFIN OIL IN MICROBATCH PLATE.
|
分辨率 3.01 Å R-free 0.253 |
| 3U2F ATP synthase c10 ring in proton-unlocked conformation at PH 8.3 提交 2011-10-03 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8.3;294 K;68% MPD, 8% PROPYLENE GLYCOL, 0.3M NACL, 0.1M MALONATE PH 7.0, 2MM MGSO4, 50MM BICINE, PH 8.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, TEMPERATURE 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.216 |
| 3U2Y ATP synthase c10 ring in proton-unlocked conformation at pH 6.1 提交 2011-10-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.1;294 K;68% MPD, 8% propolyene glycol, 0.3M NaCl, 0.1M malonate pH 7.0, 2mM MgSO4, 50 mM MES pH 6.1, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.227 |
| 3U32 ATP synthase c10 ring reacted with DCCD at pH 5.5 提交 2011-10-04 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | DCW DICYCLOHEXYLUREA × 10 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.1;294 K;68% MPD, 8% propolyene glycol, 0.3M NaCl, 2mM MgSO4, 50 mM MES pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.254 |
| 3UD0 ATP synthase C10 ring in proton-unlocked conformation at PH 5.5 提交 2011-10-27 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;294 K;68% MPD, 8% PROPOLYENE GLYCOL, 0.3M NACL, 0.1M MALONATE PH 7.0, 2MM MGSO4, 50 MM MES PH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 294K. SOAKING: 68% MPD, 8% PROPYLENE GLYCOL, 0.4M NACL, 2MM MGCL2, 50MM MES PH 5.5, FOR 12 HOURS AT 294K.
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.221 |
| 3ZRY Rotor architecture in the F(1)-c(10)-ring complex of the yeast F-ATP synthase 提交 2011-06-21 | 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 J
1–76(76 aa)
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
链 P
1–76(76 aa)
链 Q
1–76(76 aa)
链 R
1–76(76 aa)
链 S
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 6.5;10% PEG 4000, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 100 MM HEPES PH 6.5 MIXED 1:1 WITH PROTEIN SOLUTION (10 MG/ML) CONTAINING 0.64 MM DDM, 25 MM TRIS PH 8.0, 100 MM SODIUM CHLORIDE, 25 MM TREHALOSE, 0.5 MM EDTA, 3 MM SODIUM AZIDE, 2 MM MAGNESIUM CHLORIDE, 0.04 MM ADP, 1 MM AMP-PNP, 0.1 MM DCCD, 2.5 MM DTT, 0.5 MM PMSF.
|
分辨率 6.50 Å R-free 0.339 |
| 4B2Q Model of the yeast F1Fo-ATP synthase dimer based on subtomogram average 提交 2012-07-17 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 46 PDB 声明:46-meric |
链 J
1–76(76 aa)
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
链 P
1–76(76 aa)
链 Q
1–76(76 aa)
链 R
1–76(76 aa)
链 S
1–76(76 aa)
链 j
1–76(76 aa)
链 k
1–76(76 aa)
链 l
1–76(76 aa)
链 m
1–76(76 aa)
链 n
1–76(76 aa)
链 o
1–76(76 aa)
链 p
1–76(76 aa)
链 q
1–76(76 aa)
链 r
1–76(76 aa)
链 s
1–76(76 aa)
|
未记录 | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 10 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4;pH 7.4;250MM TREHALOSE 10NM TRIS- HCL PH7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;VITRIFICATION 1 -- CRYOGEN- ETHANE, TEMPERATURE- 100, INSTRUMENT- HOMEMADE PLUNGER, METHOD- SINGLE SIDE MANUAL BLOTTING FOR 5 SECONDS.,
|
分辨率 37.00 Å |
| 4F4S Structure of the yeast F1Fo ATPase c10 ring with bound oligomycin 提交 2012-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
1–76(76 aa)
链 B
1–76(76 aa)
链 C
1–76(76 aa)
链 D
1–76(76 aa)
链 E
1–76(76 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EFO Oligomycin A × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298 K;68% MPD, 8% PROPYLENE GLYCOL, 0.3M NACL, 2MM MGSO4, 50MM MES PH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 4F4S Structure of the yeast F1Fo ATPase c10 ring with bound oligomycin 提交 2012-05-11 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EFO Oligomycin A × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5.5;298 K;68% MPD, 8% PROPYLENE GLYCOL, 0.3M NACL, 2MM MGSO4, 50MM MES PH 5.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.228 |
| 5BPS Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin A 提交 2015-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
2–76(75 aa)
链 B
2–76(75 aa)
链 C
2–76(75 aa)
链 D
2–76(75 aa)
链 E
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EFO Oligomycin A × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 5BPS Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin A 提交 2015-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
2–76(75 aa)
链 L
2–76(75 aa)
链 M
2–76(75 aa)
链 N
2–76(75 aa)
链 O
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EFO Oligomycin A × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.239 |
| 5BQ6 Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin B 提交 2015-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
2–76(75 aa)
链 B
2–76(75 aa)
链 C
2–76(75 aa)
链 D
2–76(75 aa)
链 E
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EFB oligomycin B × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;278 K;68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.247 |
| 5BQ6 Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin B 提交 2015-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
2–76(75 aa)
链 L
2–76(75 aa)
链 M
2–76(75 aa)
链 N
2–76(75 aa)
链 O
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EFB oligomycin B × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;278 K;68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.247 |
| 5BQA Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin C 提交 2015-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
2–76(75 aa)
链 B
2–76(75 aa)
链 C
2–76(75 aa)
链 D
2–76(75 aa)
链 E
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EF4 oligomycin C × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.250 |
| 5BQA Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with oligomycin C 提交 2015-05-28 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
2–76(75 aa)
链 L
2–76(75 aa)
链 M
2–76(75 aa)
链 N
2–76(75 aa)
链 O
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EF4 oligomycin C × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.250 |
| 5BQJ Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with 21-hydroxy-oligomycin 提交 2015-05-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 A
2–76(75 aa)
链 B
2–76(75 aa)
链 C
2–76(75 aa)
链 D
2–76(75 aa)
链 E
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | E21 21-hydroxy-oligomycin × 6 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |
| 5BQJ Structure of the yeast F1FO ATPase C10 ring with 21-hydroxy-oligomycin 提交 2015-05-29 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric |
链 K
2–76(75 aa)
链 L
2–76(75 aa)
链 M
2–76(75 aa)
链 N
2–76(75 aa)
链 O
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | E21 21-hydroxy-oligomycin × 8 |
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;68% MPD, 8% propylene glycol, 0.3 M sodium chloride, 2 mM magnesium sulfate, 50 mM MES, pH 5.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.237 |
| 6B2Z Cryo-EM structure of the dimeric FO region of yeast mitochondrial ATP synthase 提交 2017-09-20 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 38 PDB 声明:38-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
链 B
1–76(76 aa)
链 C
1–76(76 aa)
链 D
1–76(76 aa)
链 E
1–76(76 aa)
链 F
1–76(76 aa)
链 G
1–76(76 aa)
链 H
1–76(76 aa)
链 I
1–76(76 aa)
链 J
1–76(76 aa)
链 K
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE;blot for 26 seconds before plunging
|
分辨率 3.60 Å |
| 6B8H Mosaic model of yeast mitochondrial ATP synthase monomer 提交 2017-10-07 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 60 PDB 声明:60-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
链 J
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 P
1–76(76 aa)
链 Q
1–76(76 aa)
链 R
1–76(76 aa)
链 S
1–76(76 aa)
链 T
1–76(76 aa)
链 U
1–76(76 aa)
|
未记录 | ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 10 MG MAGNESIUM ION × 10 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.60 Å |
| 6CP3 Monomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc with inhibitor of oligomycin bound. 提交 2018-03-13 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
链 P
1–76(76 aa)
链 Q
1–76(76 aa)
链 R
1–76(76 aa)
链 S
1–76(76 aa)
链 T
1–76(76 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 6CP5 Monomer yeast ATP synthase Fo reconstituted in nanodisc with inhibitor of oligomycin bound generated from focused refinement. 提交 2018-03-13 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric |
链 K
2–76(75 aa)
链 L
2–76(75 aa)
链 M
2–76(75 aa)
链 N
2–76(75 aa)
链 O
2–76(75 aa)
链 P
2–76(75 aa)
链 Q
2–76(75 aa)
链 R
2–76(75 aa)
链 S
2–76(75 aa)
链 T
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | EFO Oligomycin A × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 6CP6 Monomer yeast ATP synthase (F1Fo) reconstituted in nanodisc. 提交 2018-03-13 | 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
链 P
1–76(76 aa)
链 Q
1–76(76 aa)
链 R
1–76(76 aa)
链 S
1–76(76 aa)
链 T
1–76(76 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 2 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 6CP7 Monomer yeast ATP synthase Fo reconstituted in nanodisc generated from masked refinement. 提交 2018-03-13 | 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric |
链 K
1–76(76 aa)
链 L
1–76(76 aa)
链 M
1–76(76 aa)
链 N
1–76(76 aa)
链 O
1–76(76 aa)
链 P
1–76(76 aa)
链 Q
1–76(76 aa)
链 R
1–76(76 aa)
链 S
1–76(76 aa)
链 T
1–76(76 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.10 Å |
| 6WTD Monomer yeast ATP synthase Fo reconstituted in nanodisc with inhibitor of Bedaquiline bound 提交 2020-05-02 | 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:hexadecameric |
链 K
2–76(75 aa)
链 L
2–76(75 aa)
链 M
2–76(75 aa)
链 N
2–76(75 aa)
链 O
2–76(75 aa)
链 P
2–76(75 aa)
链 Q
2–76(75 aa)
链 R
2–76(75 aa)
链 S
2–76(75 aa)
链 T
2–76(75 aa)
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) 非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点) | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 8;20 mM Tris-HCl, 150 mM NaCl, pH 8.0
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 7TK2 Yeast ATP synthase State 1binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7TK3 Yeast ATP synthase State 1binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 7TK4 Yeast ATP synthase State 1binding(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.00 Å |
| 7TK5 Yeast ATP synthase State 1binding(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.80 Å |
| 7TK6 Yeast ATP synthase State 1catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7TK7 Yeast ATP synthase State 1catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 7TK8 Yeast ATP synthase State 1catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.70 Å |
| 7TK9 Yeast ATP synthase State 1catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.00 Å |
| 7TKA Yeast ATP synthase State 1catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKB Yeast ATP synthase State 1catalytic(f) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.30 Å |
| 7TKC Yeast ATP synthase State 1catalytic(g) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 5.80 Å |
| 7TKD Yeast ATP synthase State 1catalytic(h) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.70 Å |
| 7TKE Yeast ATP synthase State 2binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKF Yeast ATP synthase State 2binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKG Yeast ATP synthase State 2catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TKH Yeast ATP synthase State 2catalytic(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 7TKI Yeast ATP synthase State 2catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKJ Yeast ATP synthase State 2catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 7TKK Yeast ATP synthase State 2catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.30 Å |
| 7TKL Yeast ATP synthase State 3binding(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.40 Å |
| 7TKM Yeast ATP synthase State 3binding(b) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TKN Yeast ATP synthase State 3binding(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.10 Å |
| 7TKO Yeast ATP synthase State 3catalytic(a) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.80 Å |
| 7TKQ Yeast ATP synthase State 3catalytic(c) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 7TKR Yeast ATP synthase State 3catalytic(d) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.50 Å |
| 7TKS Yeast ATP synthase State 3catalytic(e) with 10 mM ATP backbone model 提交 2022-01-17 | 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 0
1–76(76 aa)
链 1
1–76(76 aa)
链 2
1–76(76 aa)
链 3
1–76(76 aa)
链 4
1–76(76 aa)
链 5
1–76(76 aa)
链 6
1–76(76 aa)
链 7
1–76(76 aa)
链 8
1–76(76 aa)
链 9
1–76(76 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 7.50 Å |
| 8F29 Yeast ATP synthase in conformation-1 at pH 6 提交 2022-11-07 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 K
1–75(75 aa)
链 L
1–75(75 aa)
链 M
1–75(75 aa)
链 N
1–75(75 aa)
链 O
1–75(75 aa)
链 P
1–75(75 aa)
链 Q
1–75(75 aa)
链 R
1–75(75 aa)
链 S
1–75(75 aa)
链 T
1–75(75 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8F39 Yeast ATP synthase in conformation-2, at pH 6 提交 2022-11-09 | 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric |
链 K
1–75(75 aa)
链 L
1–75(75 aa)
链 M
1–75(75 aa)
链 N
1–75(75 aa)
链 O
1–75(75 aa)
链 P
1–75(75 aa)
链 Q
1–75(75 aa)
链 R
1–75(75 aa)
链 S
1–75(75 aa)
链 T
1–75(75 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 4 |
ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
共 48 个其他 PDB 条目、53 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态
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| UniProt名称 | ATP9_YEAST |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 0; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 1; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 2; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 3; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 4; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 5; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 6; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 7; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 8; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 作者链 9; PDB构建体 1–76; UniProt 1–76 |