7u4w

The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at traditional protein concentration

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 68.0 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription factor ETV6,Non-receptor tyrosine-protein kinase TNK1

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 47–121	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；1.2 uL of 15 mg/mL protein combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-Tris, pH 6.50, 750 mM Mg-Formate	分辨率 2.10 Å R-free 0.276

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 7U4W	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
1JI7 Crystal Structure of TEL SAM Polymer 提交 2001-06-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 47–123（77 aa）片段：TEL SAM domain 链 B 47–123（77 aa）片段：TEL SAM domain 链 C 47–123（77 aa）片段：TEL SAM domain	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；Li2SO4, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.45 Å R-free 0.195
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
1LKY Structure of the wild-type TEL-SAM polymer 提交 2002-04-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 B 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 C 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 D 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 E 47–123（77 aa）片段：Pointed domain 链 F 47–123（77 aa）片段：Pointed domain	突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D 突变：V80R 突变：A61D	SO4 SULFATE ION × 11	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；298 K；5% PEG 4000 2.0 M ammonium sulfate, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 2.30 Å R-free 0.283
2DAO Solution structure of ETS domain Transcriptional factor ETV6 protein 提交 2005-12-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 338–442（105 aa）片段：ETS domain	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；296 K；离子强度（mmCIF原始值）120；压力 ambient NMR样品组成 1.19mM ETS domain U-15N, 13C; 20mM d-Tris-HCl(pH 7.0); 100mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 90%H2O, 10%D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2QB0 Structure of the 2TEL crystallization module fused to T4 lysozyme with an Ala-Gly-Pro linker. 提交 2007-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 47–123（77 aa）链 D 47–123（77 aa）	突变：E80V	MN MANGANESE (II) ION × 2	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.56 Å R-free 0.252
2QB0 Structure of the 2TEL crystallization module fused to T4 lysozyme with an Ala-Gly-Pro linker. 提交 2007-06-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 47–123（77 aa）链 C 47–123（77 aa）	突变：E80V	MN MANGANESE (II) ION × 3	X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件	分辨率 2.56 Å R-free 0.252
5L0P Symmetry-based assembly of a two-dimensional protein lattice 提交 2016-07-27	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 47–124（78 aa）片段：3 x TelSAM (UNP residues 47-124) + FUR (UNP residues 3-83) with connecting linkers	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；290 K；100 mM Tris, pH 8.0, 3.5 M sodium chloride	分辨率 2.30 Å R-free 0.236
7JU2 Crystal structure of the monomeric ETV6 PNT domain 提交 2020-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 43–125（83 aa）片段：PNT domain	突变：A93D,V112E	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298.15 K；2.8 M Sodium Acetate	分辨率 1.85 Å R-free 0.234
7JU2 Crystal structure of the monomeric ETV6 PNT domain 提交 2020-08-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 43–125（83 aa）片段：PNT domain	突变：A93D,V112E	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298.15 K；2.8 M Sodium Acetate	分辨率 1.85 Å R-free 0.234
7N1O The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2021-05-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 46–123（78 aa）	突变：1TEL: R41A,D46G,V112E,K122A,vWa: R49A,C175A,V112A,K112A	MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.7；298 K；100 mM BisTris, 3.0 M NaCl	分辨率 2.77 Å R-free 0.228
7N2B A DARPin semi-rigidly fused to the 3TEL crystallization chaperone 提交 2021-05-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）链 A 47–124（78 aa）	突变：V67E 突变：V67E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；200 mM L-Proline, 100 mM HEPES, 10 % w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 3.22 Å R-free 0.242
7N2B A DARPin semi-rigidly fused to the 3TEL crystallization chaperone 提交 2021-05-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–121（75 aa）链 B 47–124（78 aa）	突变：V67E 突变：V67E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.4；298 K；200 mM L-Proline, 100 mM HEPES, 10 % w/v Polyethylene glycol 3350	分辨率 3.22 Å R-free 0.242
7T8J The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a GSGG linker 提交 2021-12-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.2 uL of 1 mg/mL protein in 50 mM Tris pH 8.8, 200 mM KCl combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-tris-propane, 2.5 M Ammonium Nitrate	分辨率 1.89 Å R-free 0.235
7TDY The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase 1, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at low protein concentration 提交 2022-01-03	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–120（74 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	FMT FORMIC ACID × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.2 uL of 2 mg/mL protein combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-Tris, pH 7.00, 250 mM Mg-Formate.	分辨率 1.53 Å R-free 0.217
7TW7 Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SAM 提交 2022-02-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R, E67V, A77K	ZN ZINC ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate, and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.62 Å R-free 0.218
7TW8 Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SAH 提交 2022-02-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R, E67V, A77K	SAH S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.55 Å R-free 0.206
7TW9 Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to Sinefungin 提交 2022-02-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R, E67V, A77K	SFG SINEFUNGIN × 1 ZN ZINC ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 EOH ETHANOL × 1 MOH METHANOL × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate, and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.41 Å R-free 0.232
7U4Z The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at very low protein concentration 提交 2022-03-01	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；1.2 uL of 0.5 mg/mL protein combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-Tris, pH 6.00, 630-750 mM Mg-Formate.	分辨率 2.03 Å R-free 0.232
8BWU Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase domain in complex with the SS148 inhibitor 提交 2022-12-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	未记录	6NR (2~{S})-2-azanyl-4-[[(2~{S},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanyl-5-cyano-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methylsulfanyl]butanoic acid × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；100 mM bicine/Trizma pH 8.5; 10% w/v PEG 20.000, 20% v/v PEG MME 550; 20 mM D-glucose, 20 mM D-mannose, 20 mM D-galactose, 20 mM L-fucose, 20 mM D-xylose, 20 mM N-acetyl-D-glucosamine	分辨率 2.36 Å R-free 0.264
8E1F Sterile Alpha Motif Domain of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）片段：Sterile Alpha Motif Domain, residues 47-126	突变：R35S, V67E	CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；298 K；200mM MgSO4 Heptahydrate, 20% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 2.16 Å R-free 0.229
8E1F Sterile Alpha Motif Domain of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–124（78 aa）片段：Sterile Alpha Motif Domain, residues 47-126	突变：R35S, V67E	CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；298 K；200mM MgSO4 Heptahydrate, 20% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 2.16 Å R-free 0.229
8E1F Sterile Alpha Motif Domain of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–124（78 aa）片段：Sterile Alpha Motif Domain, residues 47-126	突变：R35S, V67E	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；298 K；200mM MgSO4 Heptahydrate, 20% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 2.16 Å R-free 0.229
8E1F Sterile Alpha Motif Domain of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2022-08-10	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 47–124（78 aa）片段：Sterile Alpha Motif Domain, residues 47-126	突变：R35S, V67E	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.9；298 K；200mM MgSO4 Heptahydrate, 20% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 2.16 Å R-free 0.229
8FRJ Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SGC0946 提交 2023-01-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R, E67V, A77K	ZN ZINC ION × 1 AW2 5-bromo-7-{5-[(3-{[(4-tert-butylphenyl)carbamoyl]amino}propyl)(propan-2-yl)amino]-5-deoxy-beta-D-ribofuranosyl}-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-amine × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.57 Å R-free 0.204
8FRK Structure of nsp14 N7-MethylTransferase domain fused with TELSAM bound to SGC8158 提交 2023-01-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：A4R,E67V,A77K	ZN ZINC ION × 1 EOH ETHANOL × 1 MJ7 5'-S-(4-{[(4'-chloro[1,1'-biphenyl]-3-yl)methyl]amino}butyl)-5'-thioadenosine × 1 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293.15 K；11-17% Reagent Alcohol, 0.1-0.3M Lithium Sulfate and 0.1M Sodium Citrate pH 5.5	分辨率 1.61 Å R-free 0.251
8FT6 The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, SUMO tag-free preparation. 提交 2023-01-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）	突变：R14A,V77E,K87A,R89A,R91A,A225V	CIT CITRIC ACID × 1 IOD IODIDE ION × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Ammonium citrate tribasic, 20% w/v PEG 3350	分辨率 2.62 Å R-free 0.234
8FT8 The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, SUMO tag-free preparation 提交 2023-01-11	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）	突变：R14A,V77E,K87A,R89A,R91T,A92V,A225V	GOL GLYCEROL × 1 CL CHLORIDE ION × 3 K POTASSIUM ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES, 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.60 Å R-free 0.204
8FZ3 Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：R45S, V77E	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic pH 8.2	分辨率 2.78 Å R-free 0.267
8FZ3 Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–123（77 aa）	突变：R45S, V77E	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic pH 8.2	分辨率 2.78 Å R-free 0.267
8FZ3 Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–123（77 aa）	突变：R45S, V77E	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic pH 8.2	分辨率 2.78 Å R-free 0.267
8FZ3 Sterile Alpha Motif of Human Translocation ETS Leukemia, Non-Polymer Crystal Form 提交 2023-01-27	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 47–123（77 aa）	突变：R45S, V77E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.2；298 K；1.4 M Sodium phosphate monobasic monohydrate/Potassium phosphate dibasic pH 8.2	分辨率 2.78 Å R-free 0.267
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–111（65 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–111（65 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZU The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, Expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–111（65 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES 2.0M ammonium sulfate	分辨率 1.90 Å R-free 0.266
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–111（65 aa）	未记录	MG MAGNESIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–111（65 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 32	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8FZV The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Ala linker variant, expressed with SUMO tag 提交 2023-01-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–111（65 aa）	未记录	UNX UNKNOWN LIGAND × 58	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.6；298 K；100 mM sodium acetate, pH 4.6, 2.0 M sodium formate	分辨率 3.29 Å R-free 0.314
8THA 1TEL, non-compressed, double-helical crystal form 提交 2023-07-14	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）	突变：V112E,R80S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.5 M Bis-Tris, 0.35 M Mg-Formate, 5 mg/mL protein	分辨率 1.68 Å R-free 0.215
9CPL The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase 1, fused to the 2TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker 提交 2024-07-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）链 A 47–121（75 aa）	突变：First TELSAM:R80S,V112E,Second TELSAM: R80S,UBA Domain: C610A,C644A 突变：First TELSAM:R80S,V112E,Second TELSAM: R80S,UBA Domain: C610A,C644A	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；100mM BisTris, pH 6.0, 960mM Mg-formate	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
9DB5 A DARPin fused to the 1TEL crystallization chaperone via a proline-alanine linker 提交 2024-08-23	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）片段：residues 47-121 (Uniprot numbering) of Transcription factor ETV6	未记录	ACY ACETIC ACID × 13 NA SODIUM ION × 8 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；294 K；4.0 M Ammonium acetate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate	分辨率 1.57 Å R-free 0.196
9DOC The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone, Thr-Val linker variant, at 1.2 Angstrom resolution 提交 2024-09-18	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）片段：von Willebrand factor A domain of CMG2	突变：TELSAM: R80S,V112E (Uniprot numbering),vWA: C175A (Uniprot numbering)	GOL GLYCEROL × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 7 NA SODIUM ION × 5	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.25；298 K；100 mM Bis-Tris, pH 7.25, 1350 mM Sodium Potassium Phosphate	分辨率 1.19 Å R-free 0.197
9DP8 A DARPin fused to the 1TEL crystallization chaperone via a helical Lys-Gln-Arg linker 提交 2024-09-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.5；298 K；0.1 M BIS-TRIS pH 5.5, 0.3 M Magnesium formate dihydrate	分辨率 3.47 Å R-free 0.298
9DVG Crystal Structure of a DARPin Fused to the 1TEL Crystallization Chaperone via a Direct Helical Fusion in a 2-Fold Crystal Form 提交 2024-10-07	突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：V112E in ETV6 (Uniprot numbering)	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；298 K；1.5 M Ammonium Phosphate Dibasic, 0.1 M Tris	分辨率 3.54 Å R-free 0.301
9E4Q A DARPin fused to the 3TEL crystallization chaperone via a gly-gly-gly fusion 提交 2024-10-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–124（78 aa）链 A 47–121（75 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；0.05 M Ammonium sulfate, 0.05 M BIS-TRIS pH 6.5, Polyethylene glycol 600	分辨率 3.58 Å R-free 0.324
9FEH Crystal structure of SARS-CoV-2 nsp14 methyltransferase domain in complex with the STM957 inhibitor 提交 2024-05-20	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	未记录	A1IB6 ~{N}-[[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-[4-azanyl-5-(2-pyridin-3-ylethynyl)pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-7-yl]-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methyl]-3-cyano-~{N}-ethyl-4-methoxy-benzenesulfonamide × 1 ZN ZINC ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；291 K；12.5% w/v PEG 4000, 20% w/v 1,2,6-hexanetriol; 100mM Gly-Gly/AMPD pH 8.5; 10mM spermine, 10mM spermidine, 10mM 1,4-diaminobutane, 10mM DL-ornithine	分辨率 1.99 Å R-free 0.230
9NGE The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-02-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–122（76 aa）	突变：R80S,L96E,V112E in ETV6, and L591V,C610A,C644A in TNK1 (Uniprot numbering)	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 K POTASSIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 20% w/v Polyethylene Glycol 3350	分辨率 2.02 Å R-free 0.230
9NGE The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-02-22	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–122（76 aa）	突变：R80S,L96E,V112E in ETV6, and L591V,C610A,C644A in TNK1 (Uniprot numbering)	K POTASSIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 20% w/v Polyethylene Glycol 3350	分辨率 2.02 Å R-free 0.230
9O0H The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase 1, fused to the 3TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker 提交 2025-04-02	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–124（78 aa）片段：TNK1 portion is the ubiquitin-associated domain 链 B 47–121（75 aa）片段：TNK1 portion is the ubiquitin-associated domain	突变：V112E (Uniprot numbering) in the first ETV6 repeat, C610A,C644A (Uniprot numbering) in TNK1 突变：V112E (Uniprot numbering) in the first ETV6 repeat, C610A,C644A (Uniprot numbering) in TNK1	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.5M Ammonium Chloride, 0.1M BIS-TRISpropane pH 7	分辨率 2.24 Å R-free 0.249
9Q4D A DARPin fused to the double trigger 1TEL variant crystallization chaperone via a direct helical fusion 提交 2025-08-20	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：L96E, V112E in ETV6 (Uniprot numbering)	EDO 1,2-ETHANEDIOL × 7 CL CHLORIDE ION × 4 K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；0.07M Citric acid, 0.05M BIS-TRIS propane, 16% w/v Polyethylene Glycol 3,350	分辨率 1.30 Å R-free 0.185
9Q9E Crystal structure of a TELSAM-SUMO1 fusion protein 提交 2025-02-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：V73E	1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na-phosphate/citric acid pH4.2, PEG600	分辨率 2.05 Å R-free 0.231
9Q9E Crystal structure of a TELSAM-SUMO1 fusion protein 提交 2025-02-26	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–123（77 aa）	突变：V73E	PO4 PHOSPHATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na-phosphate/citric acid pH4.2, PEG600	分辨率 2.05 Å R-free 0.231
9Q9E Crystal structure of a TELSAM-SUMO1 fusion protein 提交 2025-02-26	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–123（77 aa）	突变：V73E	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Na-phosphate/citric acid pH4.2, PEG600	分辨率 2.05 Å R-free 0.231
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–123（77 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 47–123（77 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9YKB The von Willebrand factor A domain of human capillary morphogenesis gene II, fused to the 1TEL crystallization chaperone, Ala-Val linker variant, expressed with SUMO tag. 提交 2025-10-06	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–123（77 aa）	突变：R4A,V67E,K77A,R81A,A82V,C215A	MG MAGNESIUM ION × 2 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M BisTrisPropane, 1.5M Ammonium Sulfate	分辨率 2.50 Å R-free 0.194
9Z2L The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-11-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–122（76 aa）	突变：R46S,V78E,L90V,C109A,C143A	SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；0.6 M Magnesium Sulfate, 0.1 Sodium Acetate	分辨率 2.02 Å R-free 0.274
9Z2L The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-11-05	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–122（76 aa）	突变：R46S,V78E,L90V,C109A,C143A	CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；0.6 M Magnesium Sulfate, 0.1 Sodium Acetate	分辨率 2.02 Å R-free 0.274
9ZB7 A DARPin fused to the 1TEL crystallization chaperone via a direct helical fusion 提交 2025-11-20	突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）	突变：V112E	AKG 2-OXOGLUTARIC ACID × 1 NH4 AMMONIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 EOH ETHANOL × 2 K POTASSIUM ION × 5 CL CHLORIDE ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.2；298 K；0.4 M Ammonium phosphate monobasic	分辨率 1.24 Å R-free 0.170
9ZNB Crystal Structure of a DARPin Fused to the 1TEL Crystallization Chaperone via a Direct Helical Fusion in a 3-Fold Crystal Form 提交 2025-12-12	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–121（75 aa）片段：residues 47-121 (Uniprot numbering) of the ETV6 portion	突变：V112E in ETV6 (Uniprot numbering)	ACY ACETIC ACID × 1 CL CHLORIDE ION × 4 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；294 K；1.0 M Magnesium sulfate hydrate, 0.1 M Sodium acetate trihydrate pH 4.6	分辨率 1.77 Å R-free 0.220
9ZVU The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone, alternate crystal form 提交 2025-12-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 47–122（76 aa）片段：TNK1 UBA domain,TNK1 UBA domain	突变：R80S,L96E,V112E,L591V,C610A,C644A	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Sodium Tartrate, 16% PEG 3350 Monodisperse	分辨率 1.96 Å R-free 0.247
9ZVU The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone, alternate crystal form 提交 2025-12-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 47–122（76 aa）片段：TNK1 UBA domain,TNK1 UBA domain	突变：R80S,L96E,V112E,L591V,C610A,C644A	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 3 NA SODIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Sodium Tartrate, 16% PEG 3350 Monodisperse	分辨率 1.96 Å R-free 0.247

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查看构建体与数据证据

UniProt名称	ETV6_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–76； UniProt 47–121

Transcription factor ETV6,Non-receptor tyrosine-protein kinase TNK1

Homo sapiens

UniProt Q13470

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	信息不足单体蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 590–666	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	无其他共同聚合物	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；298 K；1.2 uL of 15 mg/mL protein combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-Tris, pH 6.50, 750 mM Mg-Formate	分辨率 2.10 Å R-free 0.276

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 7U4W	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
7T8J The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a GSGG linker 提交 2021-12-16	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 590–666（77 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.2 uL of 1 mg/mL protein in 50 mM Tris pH 8.8, 200 mM KCl combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-tris-propane, 2.5 M Ammonium Nitrate	分辨率 1.89 Å R-free 0.235
7TCY The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase I 提交 2021-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 589–666（78 aa）片段：UBA domain (UNP residues 589-666)	突变：P589G, C610A, C644A	FMT FORMIC ACID × 3 PO4 PHOSPHATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 CL CHLORIDE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；298 K；100 mM Bis-Tris, pH 6.8, 100 mM magnesium formate	分辨率 1.54 Å R-free 0.214
7TCY The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase I 提交 2021-12-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 589–666（78 aa）片段：UBA domain (UNP residues 589-666)	突变：P589G, C610A, C644A	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.8；298 K；100 mM Bis-Tris, pH 6.8, 100 mM magnesium formate	分辨率 1.54 Å R-free 0.214
7TDY The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase 1, flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at low protein concentration 提交 2022-01-03	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 590–666（77 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	FMT FORMIC ACID × 6	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；1.2 uL of 2 mg/mL protein combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-Tris, pH 7.00, 250 mM Mg-Formate.	分辨率 1.53 Å R-free 0.217
7U4Z The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at very low protein concentration 提交 2022-03-01	配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 590–666（77 aa）	突变：R80S,V112E,C610A,C644A	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；1.2 uL of 0.5 mg/mL protein combined with 1.2 uL of 100 mM Bis-Tris, pH 6.00, 630-750 mM Mg-Formate.	分辨率 2.03 Å R-free 0.232
9CPL The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase 1, fused to the 2TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker 提交 2024-07-18	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 590–666（77 aa）	突变：First TELSAM:R80S,V112E,Second TELSAM: R80S,UBA Domain: C610A,C644A	FMT FORMIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；298 K；100mM BisTris, pH 6.0, 960mM Mg-formate	分辨率 2.40 Å R-free 0.263
9NGE The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-02-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 590–666（77 aa）	突变：R80S,L96E,V112E in ETV6, and L591V,C610A,C644A in TNK1 (Uniprot numbering)	PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 K POTASSIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 20% w/v Polyethylene Glycol 3350	分辨率 2.02 Å R-free 0.230
9NGE The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-02-22	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 590–666（77 aa）	突变：R80S,L96E,V112E in ETV6, and L591V,C610A,C644A in TNK1 (Uniprot numbering)	K POTASSIUM ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；0.2M Ammonium citrate tribasic pH 7.0, 20% w/v Polyethylene Glycol 3350	分辨率 2.02 Å R-free 0.230
9O0H The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase 1, fused to the 3TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker 提交 2025-04-02	构建体不同突变/修饰不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 590–666（77 aa）片段：TNK1 portion is the ubiquitin-associated domain	突变：V112E (Uniprot numbering) in the first ETV6 repeat, C610A,C644A (Uniprot numbering) in TNK1	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；1.5M Ammonium Chloride, 0.1M BIS-TRISpropane pH 7	分辨率 2.24 Å R-free 0.249
9Z2L The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-11-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 590–666（77 aa）	突变：R46S,V78E,L90V,C109A,C143A	SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；0.6 M Magnesium Sulfate, 0.1 Sodium Acetate	分辨率 2.02 Å R-free 0.274
9Z2L The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to the 1TEL crystallization chaperone 提交 2025-11-05	突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 590–666（77 aa）	突变：R46S,V78E,L90V,C109A,C143A	CL CHLORIDE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；298 K；0.6 M Magnesium Sulfate, 0.1 Sodium Acetate	分辨率 2.02 Å R-free 0.274
9ZVU The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone, alternate crystal form 提交 2025-12-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 590–666（77 aa）片段：TNK1 UBA domain,TNK1 UBA domain	突变：R80S,L96E,V112E,L591V,C610A,C644A	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 4 NA SODIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Sodium Tartrate, 16% PEG 3350 Monodisperse	分辨率 1.96 Å R-free 0.247
9ZVU The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 rigidly fused to a double trigger variant of the 1TEL crystallization chaperone, alternate crystal form 提交 2025-12-30	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 590–666（77 aa）片段：TNK1 UBA domain,TNK1 UBA domain	突变：R80S,L96E,V112E,L591V,C610A,C644A	TLA L(+)-TARTARIC ACID × 3 NA SODIUM ION × 4 SO4 SULFATE ION × 2 TAR D(-)-TARTARIC ACID × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；298 K；0.2M Sodium Tartrate, 16% PEG 3350 Monodisperse	分辨率 1.96 Å R-free 0.247

共 9 个其他 PDB 条目、13 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TNK1_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 79–155； UniProt 590–666

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	7u4w
沉积日期 deposition_date	2022-03-01
结构标题 title	The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at traditional protein concentration
关键词 keywords	Protein polymer, Ubiquitin-associated domain, Helix bundle, Chimera, SIGNALING PROTEIN; SIGNALING PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.73 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	19.12 Å
零角强度 I(0) i0	4100970.00
分子量 molecular_weight	14366.0 kDa
排除体积 excluded_volume	17806 Å³
包络体积 envelope_volume	22775 Å³
水化壳体积 shell_volume	11252 Å³
包络直径 envelope_diameter	65.2 Å
壳层 Rg shell_rg	22.80 Å
包络 Rg envelope_rg	19.36 Å
形状 Rg shape_rg	19.17 Å
总 Rg total_rg	19.63 Å
总原子数 total_atoms	1023
残基数 n_residues	144
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	68.0 Å
Rg (实空间) rg_real	19.98 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.70 Å
I(0) (实空间) i0_real	4.1010e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	5.7950e+04
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.94 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	4101000.0000
解质量估计 total_estimate	0.7919
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	2
主峰位置 r_peak_primary	17.2 Å
偏度 Skewness skewness	0.511
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.496
角度范围 angular_range	— – 0.4050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	812400.0000
实空间数据点数 n_real_points	72
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.609; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.476; Smooth: 0.989

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	7u4wA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	50 — Transcription Factor, Ets-1

▶

8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	67.971 Å
晶胞边长 b length_b	67.971 Å
晶胞边长 c length_c	55.749 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 65
空间群编号 int_tables_number	170
晶系 crystal_system	hexagonal

分辨率 resolution	2.100 Å
最低分辨率 resolution_low	40.480 Å
R 因子 r_factor	0.2469
R_work r_work	0.2452
R_free r_free	0.2756

描述 description	Transcription factor ETV6,Non-receptor tyrosine-protein kinase TNK1
分子量 formula_weight	17775.1 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.10.2
突变 mutation	R80S,V112E,C610A,C644A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	1068

The ubiquitin-associated domain of human thirty-eight negative kinase-1 flexibly fused to the 1TEL crystallization chaperone via a 2-glycine linker and crystallized at traditional protein concentration

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription factor ETV6,Non-receptor tyrosine-protein kinase TNK1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Transcription factor ETV6,Non-receptor tyrosine-protein kinase TNK1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	9

fit	/app/data/saxs_computation/u4/7u4w/7u4w.fit
pddf	/app/data/pr_computation/u4/7u4w/7u4w.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/u4/7u4w/7u4w.dat