8f29

Yeast ATP synthase in conformation-1 at pH 6

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 218.5 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATP synthase subunit 5, mitochondrial

物种未注明

UniProt P09457

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 Y; UniProt 24–210 未记录 ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 35 个其他 PDB 条目、35 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPO_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 Y; PDB构建体 1–187; UniProt 24–210

ATP synthase subunit gamma, mitochondrial

物种未注明

UniProt P38077

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 38–307 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 52 个其他 PDB 条目、65 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPG_YEAST
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–261; UniProt 38–307

ATP synthase subunit delta, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q12165

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 H; UniProt 29–160 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 48 个其他 PDB 条目、60 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPD_YEAST
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 H; PDB构建体 1–132; UniProt 29–160

ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial

物种未注明

UniProt P21306

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 2–60 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 47 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATP5E_YEAST
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–59; UniProt 2–60

ATP synthase subunit 4, mitochondrial

物种未注明

UniProt P05626

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 Z; UniProt 88–242 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 40 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ATPF_YEAST
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 Z; PDB构建体 1–155; UniProt 88–242

ATP synthase subunit d, mitochondrial

物种未注明

UniProt P30902

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 7; UniProt 4–174 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 41 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP7_YEAST
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 7; PDB构建体 1–171; UniProt 4–174

ATP synthase subunit H, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q12349

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 6; UniProt 36–124 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 36 个其他 PDB 条目、36 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP14_YEAST
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 6; PDB构建体 1–89; UniProt 36–124

ATP synthase subunit f, mitochondrial

物种未注明

UniProt Q06405

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 U; UniProt 7–91 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 41 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPK_YEAST
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 U; PDB构建体 1–85; UniProt 7–91

ATP synthase subunit 9, mitochondrial

物种未注明

UniProt P61829

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 K; UniProt 1–75 链 L; UniProt 1–75 链 M; UniProt 1–75 链 N; UniProt 1–75 链 O; UniProt 1–75 链 P; UniProt 1–75 链 Q; UniProt 1–75 链 R; UniProt 1–75 链 S; UniProt 1–75 链 T; UniProt 1–75 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 48 个其他 PDB 条目、53 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP9_YEAST
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 K; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 L; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 M; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 N; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 O; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 P; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 Q; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 R; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 S; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75 作者链 T; PDB构建体 1–75; UniProt 1–75

ATP synthase protein 8

物种未注明

UniProt P00856

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 8; UniProt 7–47 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 39 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP8_YEAST
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 8; PDB构建体 1–41; UniProt 7–47

ATP synthase subunit a

物种未注明

UniProt P00854

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 X; UniProt 36–259 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 40 个其他 PDB 条目、40 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP6_YEAST
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 1–224; UniProt 36–259

ATP synthase subunit J, mitochondrial

物种未注明

UniProt P81450

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–37 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 39 个其他 PDB 条目、39 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATP18_YEAST
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–37; UniProt 1–37

ATP synthase subunit alpha, mitochondrial

物种未注明

UniProt P07251

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 39–545 链 B; UniProt 39–545 链 C; UniProt 39–545 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit beta, mitochondrial × 3 (P00830) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 51 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPA_YEAST
Isoform
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–507; UniProt 39–545 作者链 B; PDB构建体 1–507; UniProt 39–545 作者链 C; PDB构建体 1–507; UniProt 39–545

ATP synthase subunit beta, mitochondrial

物种未注明

UniProt P00830

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 27 PDB 声明:27-meric(27) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 39–511 链 E; UniProt 39–511 链 F; UniProt 39–511 未记录 ATP synthase subunit 5, mitochondrial × 1 (P09457) ATP synthase subunit gamma, mitochondrial × 1 (P38077) ATP synthase subunit delta, mitochondrial × 1 (Q12165) ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial × 1 (P21306) ATP synthase subunit 4, mitochondrial × 1 (P05626) ATP synthase subunit d, mitochondrial × 1 (P30902) ATP synthase subunit H, mitochondrial × 1 (Q12349) ATP synthase subunit f, mitochondrial × 1 (Q06405) ATP synthase subunit 9, mitochondrial × 10 (P61829) ATP synthase protein 8 × 1 (P00856) ATP synthase subunit a × 1 (P00854) ATP synthase subunit J, mitochondrial × 1 (P81450) ATP synthase subunit alpha, mitochondrial × 3 (P07251) ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 4.00 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 51 个其他 PDB 条目、64 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ATPB_YEAST
Isoform
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–473; UniProt 39–511 作者链 E; PDB构建体 1–473; UniProt 39–511 作者链 F; PDB构建体 1–473; UniProt 39–511

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SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8f29

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8f29
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8f29
沉积日期 deposition_date2022-11-07
结构标题 titleYeast ATP synthase in conformation-1 at pH 6
关键词 keywordsF-type ATP synthase, yeast, mitochondrial, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier62.16
回转半径 Rg (电子) rg_electron63.93
零角强度 I(0) i03949350000.00
分子量 molecular_weight552320.0 kDa
排除体积 excluded_volume701100 ų
包络体积 envelope_volume976950 ų
水化壳体积 shell_volume129310 ų
包络直径 envelope_diameter227.3
壳层 Rg shell_rg64.14
包络 Rg envelope_rg62.63
形状 Rg shape_rg63.89
总 Rg total_rg64.08
总原子数 total_atoms38906
残基数 n_residues5116
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax218.5
Rg (实空间) rg_real62.59
Rg 误差 (实空间) rg_real_error2.57
I(0) (实空间) i0_real3.9490e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error8.7220e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal61.76
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3944000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8245
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary61.2
偏度 Skewness skewness0.518
峰度 Kurtosis kurtosis-0.294
角度范围 angular_range— – 0.1250 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha406400000.0000
实空间数据点数 n_real_points26
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.704; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.999; Smooth: 0.604

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)