8i10

Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human Vasopressin V2 receptor, V2R (Local refine)

Method: ELECTRON MICROSCOPY D_max: 142.4 Å Quality: GOOD

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-arrestin-2

Bos taurus

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 1–420 链 B； UniProt 1–420 链 C； UniProt 1–420	突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A	Fab30 Heavy Chain × 3 Fab30 Light Chain × 3 Vasopressin V2 receptor × 3 （P30518）	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 3.96 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 8I10	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
5TV1 active arrestin-3 with inositol hexakisphosphate 提交 2016-11-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 8–393（386 aa）片段：UNP residues 8-393	未记录	IHP INOSITOL HEXAKISPHOSPHATE × 6 GOL GLYCEROL × 9	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293.15 K；100 mM Succinate/Phosphate/Glycine pH 8.5 and 25% PEG 1500	分辨率 2.40 Å R-free 0.245
8GO9 Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human Atypical chemokine receptor 2, ACKR2 (D6R) 提交 2022-08-24	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–420（420 aa）链 F 1–420（420 aa）	突变：C17G,C66V,L69C,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C66V,L69C,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 3.35 Å
8GOC Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human Vasopressin V2 receptor, V2R 提交 2022-08-24	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–420（420 aa）链 B 1–420（420 aa）链 C 1–420（420 aa）	突变：C17G,C66V,L69C,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C66V,L69C,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C66V,L69C,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 4.18 Å
8GOO Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C5a anaphylatoxin chemotactic receptor 1, C5aR1 提交 2022-08-25	突变/修饰不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–420（420 aa）链 B 1–420（420 aa）链 C 1–420（420 aa）	突变：C17G,C66V,L69C,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C66V,L69C,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C66V,L69C,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 4.40 Å
8I0Z Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human C5a anaphylatoxin chemotactic receptor 1, C5aR1 (Local refine) 提交 2023-01-12	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–420（420 aa）链 B 1–420（420 aa）链 C 1–420（420 aa）	突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 4.33 Å
8J8R Structure of beta-arrestin2 in complex with M2Rpp 提交 2023-05-02	实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 1–420（420 aa）链 B 1–420（420 aa）链 C 1–420（420 aa）	突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
8J8V Structure of beta-arrestin2 in complex with D6Rpp (Local Refine) 提交 2023-05-02	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–420（420 aa）链 F 1–420（420 aa）	突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 3.22 Å
8TIL Human ACKR3 phosphorylated by GRK5 in complex with Arrestin3 reconstructed without receptor/micelle 提交 2023-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–392（392 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.80 Å
8TIN Human ACKR3 phosphorylated by GRK2 in complex with Arrestin3 reconstructed without receptor/micelle 提交 2023-07-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–392（392 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
8VJ9 CryoEM structure of human ACKR3 phosphorylated by GRK5 in complex with Arrestin3 variant with the C edge loop from Arrestin2 inserted 提交 2024-01-06	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 1–392（392 aa）片段：Arrestin3 variant with the C edge loop from Arrestin2 inserted	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 8 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9KY2 Structure of beta-arrestin2 in complex with mouse C5aR1pp 提交 2024-12-07	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric	链 A 1–420（420 aa）链 F 1–420（420 aa）	突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A 突变：C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.78 Å

共 11 个其他 PDB 条目、11 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	ARRB2_BOVIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–420； UniProt 1–420 作者链 B； PDB构建体 1–420； UniProt 1–420 作者链 C； PDB构建体 1–420； UniProt 1–420

Vasopressin V2 receptor

物种未注明

UniProt P30518

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12）与蛋白拷贝数一致	链 G； UniProt 343–371 链 U； UniProt 343–371 链 V； UniProt 343–371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Beta-arrestin-2 × 3 （P32120） Fab30 Heavy Chain × 3 Fab30 Light Chain × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 3.96 Å

数据库中的同蛋白其他状态

其他 PDB	相对当前条目 8I10	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
4JQI Structure of active beta-arrestin1 bound to a G protein-coupled receptor phosphopeptide 提交 2013-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 V 343–371（29 aa）片段：unp residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 1 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；17% PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.2 M L-proline , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
4JQI Structure of active beta-arrestin1 bound to a G protein-coupled receptor phosphopeptide 提交 2013-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 V 343–371（29 aa）片段：unp residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	CL CHLORIDE ION × 2 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 6 PRO PROLINE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；17% PEG 3350, 0.1 M HEPES, 0.2 M L-proline , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K	分辨率 2.60 Å R-free 0.247
6NI2 Stabilized beta-arrestin 1-V2T subcomplex of a GPCR-G protein-beta-arrestin mega-complex 提交 2018-12-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 V 343–368（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
6U1N GPCR-Beta arrestin structure in lipid bilayer 提交 2019-08-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 343–371（29 aa）片段：M2 UNP residues 2-466 + V2 UNP residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	2CU 3-amino-5-chloro-N-cyclopropyl-4-methyl-6-[2-(4-methylpiperazin-1-yl)-2-oxoethoxy]thieno[2,3-b]pyridine-2-carboxamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.00 Å
7BB6 AVP-V2R-Galphas-beta1-gamma2-Nb35 (L state) 提交 2020-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 3–371（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.20 Å
7BB7 AVP-V2R-Galphas-beta1-gamma2-Nb35(T state) 提交 2020-12-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 A 3–371（369 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.40 Å
7DW9 Cryo-EM structure of human V2 vasopressin receptor in complex with an Gs protein 提交 2021-01-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 R 1–371（371 aa）	未记录	CLR CHOLESTEROL × 3	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.60 Å
7KH0 Cryo-EM structure of the human arginine vasopressin AVP-vasopressin receptor V2R-Gs signaling complex 提交 2020-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric	链 R 1–371（371 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
7R0C Structure of the AVP-V2R-arrestin2-ScFv30 complex 提交 2022-02-01	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 4–371（368 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 4.73 Å
8GOC Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human Vasopressin V2 receptor, V2R 提交 2022-08-24	结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 G 343–371（29 aa）链 U 343–371（29 aa）链 V 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE；Blotted for 3 seconds before plunging.	分辨率 4.18 Å
8JRU Cryo-EM structure of the glucagon receptor bound to beta-arrestin 1 in ligand-free state 提交 2023-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
8JRV Cryo-EM structure of the glucagon receptor bound to glucagon and beta-arrestin 1 提交 2023-06-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PIO [(2R)-2-octanoyloxy-3-[oxidanyl-[(1R,2R,3S,4R,5R,6S)-2,3,6-tris(oxidanyl)-4,5-diphosphonooxy-cyclohexyl]oxy-phosphoryl]oxy-propyl] octanoate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
8WRZ Cry-EM structure of cannabinoid receptor-beta-arrestin-1 complex 提交 2023-10-16	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 V 343–367（25 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	8D0 (6~{a}~{R},9~{R},10~{a}~{R})-9-(hydroxymethyl)-3-(8-isothiocyanato-2-methyl-octan-2-yl)-6,6-dimethyl-6~{a},7,8,9,10,10~{a}-hexahydrobenzo[c]chromen-1-ol × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.60 Å
8WU1 Cryo-EM structure of CB1-beta-arrestin1 complex 提交 2023-10-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 342–371（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	KCA methyl N-{1-[(4-fluorophenyl)methyl]-1H-indazole-3-carbonyl}-3-methyl-L-valinate × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9BT8 Structure of Src in complex with beta-arrestin 1 revealing SH3 binding sites 提交 2024-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 V 343–371（29 aa）片段：UNP residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9CX3 Structure of SH3 domain of Src in complex with beta-arrestin 1 提交 2024-07-30	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric	链 V 343–371（29 aa）片段：UNP residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.47 Å
9CX9 Structure of SH3 domain of Src in complex with beta-arrestin 1 提交 2024-07-31	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 V 343–371（29 aa）片段：UNP residues 343-371	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.34 Å
9HAP Cryo-EM structure of inactive human arginine-vasopressin (AVP) V2 receptor (V2R) with tolvaptan 提交 2024-11-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 4–371（368 aa）	未记录	A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9HB3 cryo-EM structure of inactive human arginine-vasopressin (AVP) V2 receptor (V2R) with Mambaquaretin1 K39A (MQK39A) 提交 2024-11-05	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 4–342（339 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.50 Å
9LY2 A Cryo-EM structure of LA-PTH-PTH1R-V2RT-Beta-arrestin1 complex (state 1 conformation) 提交 2025-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.04 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.10 Å
9LY3 A Cryo-EM structure of LA-PTH-PTH1R-V2RT-Beta-arrestin1 complex (state 2 conformation) 提交 2025-02-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.04 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.40 Å
9LZ2 Cryo-EM structure of PTH1R(V2RC)-beta-arrestin1 complex 提交 2025-02-21	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–368（26 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.00 Å
9U80 Cryo-EM structure of conivaptan-bound human vasopressin V2 receptor complex with Fab 提交 2025-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 35–234（200 aa）链 R 264–371（108 aa）	未记录	A1ECE Conivaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.94 Å
9U81 Cryo-EM structure of tolvaptan-bound human vasopressin V2 receptor complex with Fab 提交 2025-03-25	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 R 33–234（202 aa）链 R 264–371（108 aa）	未记录	A1ECF Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.08 Å
9UVV Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with tolvaptan 提交 2025-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 1–236（236 aa）链 A 265–371（107 aa）	突变：M243W/H338I/R342L 突变：M243W/H338I/R342L	A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5	分辨率 3.02 Å
9UVW Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with tolvaptan, focused on receptor 提交 2025-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–236（236 aa）链 A 265–371（107 aa）	突变：M243W/H338I/R342L 突变：M243W/H338I/R342L	A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5	分辨率 2.89 Å
9UVX Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-BRIL/anti BRIL SRP2070 Fab antibody complex with OPC51803, focused on receptor 提交 2025-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–236（236 aa）链 A 265–371（107 aa）	突变：M243W/H338I/R342L 突变：M243W/H338I/R342L	A1L9O 2-[(5~{R})-1-(2-chloranyl-4-pyrrolidin-1-yl-phenyl)carbonyl-2,3,4,5-tetrahydro-1-benzazepin-5-yl]-~{N}-propan-2-yl-ethanamide × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5	分辨率 3.31 Å
9UVY Cryo-EM structure of Vasopressin receptor 2 (V2R)-ARK1 with tolvaptan 提交 2025-05-11	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 1–235（235 aa）链 A 266–371（106 aa）	未记录	A1IT8 (R)-Tolvaptan × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5	分辨率 2.98 Å
9UYH Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 1 (Conformation 1) 提交 2025-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9UYI Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 1 (Conformation 2) 提交 2025-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.20 Å
9UYJ Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 1 (Conformation 3) 提交 2025-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9UYL Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 1 (Conformation 4) 提交 2025-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.30 Å
9UYM Composite map of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to chemerin and beta-arrestin 2 提交 2025-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 343–371（29 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	Y01 CHOLESTEROL HEMISUCCINATE × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 3.50 Å
9UYN Cryo-EM structure of the G protein-coupled receptor 1 (GPR1) bound to beta-arrestin 1 in ligand-free state 提交 2025-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 R 343–371（29 aa）	突变：V143C 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	PAM PALMITOLEIC ACID × 1	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.90 Å
9WSV Cryo-EM structure of DAMGO-muOR-arrestin-1-Fab30 complex 提交 2025-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 342–371（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9WSW Cryo-EM structure of endomorphin-1-muOR-Gz-scFv16 complex 提交 2025-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 342–371（30 aa）	未记录	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å
9WSX Cryo-EM structure of endomorphin-1-muOR-arrestin2-Fab30 complex 提交 2025-09-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric	链 R 342–371（30 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液 pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件冷冻剂 ETHANE	分辨率 2.80 Å

共 36 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	V2R_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–29； UniProt 343–371 作者链 U； PDB构建体 1–29； UniProt 343–371 作者链 V； PDB构建体 1–29； UniProt 343–371

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8i10
沉积日期 deposition_date	2023-01-12
结构标题 title	Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human Vasopressin V2 receptor, V2R (Local refine)
关键词 keywords	GPCR, Arrestin, SIGNALING PROTEIN, SIGNALING PROTEIN-IMMUNE SYSTEM complex; SIGNALING PROTEIN/IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	44.79 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	44.21 Å
零角强度 I(0) i0	515773000.00
分子量 molecular_weight	186960.0 kDa
排除体积 excluded_volume	234150 Å³
包络体积 envelope_volume	344240 Å³
水化壳体积 shell_volume	65263 Å³
包络直径 envelope_diameter	142.1 Å
壳层 Rg shell_rg	49.22 Å
包络 Rg envelope_rg	42.79 Å
形状 Rg shape_rg	44.18 Å
总 Rg total_rg	44.54 Å
总原子数 total_atoms	13196
残基数 n_residues	1714
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	142.4 Å
Rg (实空间) rg_real	44.65 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	1.15 Å
I(0) (实空间) i0_real	5.1580e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	9.1970e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal	44.79 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	515900000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8361
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	52.9 Å
偏度 Skewness skewness	0.138
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.700
角度范围 angular_range	— – 0.1750 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	44820000.0000
实空间数据点数 n_real_points	36
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.955; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 1.000; Smooth: 0.000

▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

▶

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Beta-arrestin-2
分子量 formula_weight	47217.7 kDa
突变 mutation	C17G,C60V,L69V,C126S,C141L,C151V,C243V,C252V,C270S,L278F,S280A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C
原子数 atom_count	13196

MGEKPGTRVFKKSSPNGKLTVYLGKRDFVDHLDKVDPVDGVVLVDPDYLKDRKVFVTLTVAFRYGREDCDVLGLSFRKDLFIANYQAFPPTPNPPRPPTRLQERLLRKLGQHAHPFFFTIPQNLPSSVTLQPGPEDTGKALGVDFEIRAFVAKSLEEKSHKRNSVRLVIRKVQFAPEKPGPQPSAETTRHFLMSDRSLHLEASLDKELYYHGEPLNVNVHVTNNSTKTVKKIKVSVRQYADIVLFSTAQYKVPVAQVEQDDQVSPSSTFSKVYTITPFLANNREKRGLALDGKLKHEDTNLASSTIVKEGANKEVLGILVSYRVKVKLVVSRGGDVSVELPFVLMHPKPHDHIALPRPQSAATHPPTLLPSAVPETDAPVDTNLIEFETNYATDDDIVFEDFARLRLKGLKDEDYDDQFC

来源 Source

来源生物 organism	Bos taurus
通用名 common_name	cattle
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9913
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Fab30 Heavy Chain
分子量 formula_weight	25512.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,H,M

EISEVQLVESGGGLVQPGGSLRLSCAASGFNVYSSSIHWVRQAPGKGLEWVASISSYYGYTYYADSVKGRFTISADTSKNTAYLQMNSLRAEDTAVYYCARSRQFWYSGLDYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKKVEPKSCDKTHHHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Fab30 Light Chain
分子量 formula_weight	23435.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,L,N

SDIQMTQSPSSLSASVGDRVTITCRASQSVSSAVAWYQQKPGKAPKLLIYSASSLYSGVPSRFSGSRSGTDFTLTISSLQPEDFATYYCQQYKYVPVTFGQGTKVEIKRTVAAPSVFIFPPSDSQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Vasopressin V2 receptor
分子量 formula_weight	3550.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,U,V

ARGRTPPSLGPQDESCTTASSSLAKDTSS

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	8i10A01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	840 —

结构域编号 domain_id	8i10A02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	640 —

结构域编号 domain_id	8i10B01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	840 —

结构域编号 domain_id	8i10B02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	640 —

结构域编号 domain_id	8i10C01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	840 —

结构域编号 domain_id	8i10C02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	640 —

结构域编号 domain_id	8i10D01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i10E01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i10H01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i10L01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i10M01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	8i10N01
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

▶

8. 引用文献 (2)

▶

分辨率 resolution	3.96 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	92018

fit	/app/data/saxs_computation/i1/8i10/8i10.fit
pddf	/app/data/pr_computation/i1/8i10/8i10.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/i1/8i10/8i10.dat

Structure of beta-arrestin2 in complex with a phosphopeptide corresponding to the human Vasopressin V2 receptor, V2R (Local refine)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Beta-arrestin-2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Vasopressin V2 receptor

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

冷冻电镜 EM 3D

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)