8tb9

PRC2-J119-450 monomer bound to H1-nucleosome

Method: ELECTRON MICROSCOPY

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H1.0

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Protein Jumonji × 1 （Q92833） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	H10_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–197； UniProt 1–194

Protein Jumonji

Homo sapiens

UniProt Q92833

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	JARD2_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 3–334； UniProt 119–450

Polycomb protein SUZ12

Homo sapiens

UniProt Q15022

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Protein Jumonji × 1 （Q92833） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SUZ12_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 2–619； UniProt 68–685

Histone-lysine N-methyltransferase EZH2

Homo sapiens

UniProt Q15910

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Protein Jumonji × 1 （Q92833） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EZH2_HUMAN
Isoform	Q15910-2
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 4–753； UniProt 2–751

Polycomb protein EED

Homo sapiens

UniProt O75530

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Protein Jumonji × 1 （Q92833） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	EED_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–441； UniProt 1–441

Histone H3.2

Xenopus laevis

UniProt P84233

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Protein Jumonji × 1 （Q92833） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H4 × 2 （P62799） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H32_XENLA
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136 作者链 W； PDB构建体 1–136； UniProt 1–136

Histone H4

Xenopus laevis

UniProt P62799

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Protein Jumonji × 1 （Q92833） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H4_XENLA
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103 作者链 X； PDB构建体 1–103； UniProt 1–103

Histone-binding protein RBBP4

Homo sapiens

UniProt Q09028

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Protein Jumonji × 1 （Q92833） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RBBP4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–425； UniProt 1–425

Histone H2A type 1

Xenopus laevis

UniProt P06897

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Protein Jumonji × 1 （Q92833） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2A1_XENLA
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 4–133； UniProt 1–130 作者链 U； PDB构建体 4–133； UniProt 1–130

Histone H2B 1.1

Xenopus laevis

UniProt P02281

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Protein Jumonji × 1 （Q92833） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） DNA (226-MER) × 1 Zinc finger protein AEBP2 × 1 （Q6ZN18） S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	H2B11_XENLA
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 S； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126 作者链 V； PDB构建体 2–123； UniProt 5–126

Zinc finger protein AEBP2

Homo sapiens

UniProt Q6ZN18

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 15 DNA 2	Histone H1.0 × 1 （P07305） Protein Jumonji × 1 （Q92833） Polycomb protein SUZ12 × 1 （Q15022） Histone-lysine N-methyltransferase EZH2 × 1 （Q15910） Polycomb protein EED × 1 （O75530） DNA (226-MER) × 1 Histone H3.2 × 2 （P84233） Histone H4 × 2 （P62799） Histone-binding protein RBBP4 × 1 （Q09028） Histone H2A type 1 × 2 （P06897） Histone H2B 1.1 × 2 （P02281） DNA (226-MER) × 1 S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	AEBP2_HUMAN
Isoform	Q6ZN18-3
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 4–303； UniProt 2–301

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	8tb9
沉积日期 deposition_date	2023-06-28
结构标题 title	PRC2-J119-450 monomer bound to H1-nucleosome
关键词 keywords	Histone methyl transferase, gene repression, epigenetics, chromatin, GENE REGULATION; GENE REGULATION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

8tb9__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

8tb9__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

8tb9__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	67.68 Å
Rg（电子密度）	67.71 Å
总 Rg	67.77 Å
原子数	30224
残基数	3175
排除体积	511220 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`8tb9__assembly_1__model_1`	heptadecameric （17）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (14)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Histone H1.0
分子量 formula_weight	21209.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	30224

GSHMTENSTSAPAAKPKRAKASKKSTDHPKYSDMIVAAIQAEKNRAGSSRQSIQKYIKSHYKVGENADSQIKLSIKRLVTTGVLKQTKGVGASGSFRLAKSDEPKKSVAFKKTKKEIKKVATPKKASKPKKAASKAPTKKPKATPVKKAKKKLAATPKKAKKPKTVKAKPVKASKPKKAKPVKPKAKSSAKRAGKKK

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Protein Jumonji
分子量 formula_weight	36251.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MVQSQPNSPSTTPVKIVEPLLPPPATQISDLSKRKPKTEDFLTFLCLRGSPALPNSMVYFGSSQDEEEVEEEDDETEDVKTATNNASSSCQSTPRKGKTHKHVHNGHVFNGSSRSTREKEPVQKHKSKEATPAKEKHSDHRADSRREQASANHPAAAPSTGSSAKGLAATHHHPPLHRSAQDLRKQVSKVNGVTRMSSLGAGVTSAKKMREVRPSPSKTVKYTATVTKGAVTYTKAKRELVKDTKPNHHKPSSAVNHTISGKTESSNAKTRKQVLSLGGASKSTGPAVNGLKVSGRLNPKSCTKEVGGRQLREGLQLREGLRNSKRRLEEAHQA

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Polycomb protein SUZ12
分子量 formula_weight	72266.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MVLPVKKPKMEHVQADHELFLQAFEKPTQIYRFLRTRNLIAPIFLHRTLTYMSHRNSRTNIKRKTFKVDDMLSKVEKMKGEQESHSLSAHLQLTFTGFFHKNDKPSPNSENEQNSVTLEVLLVKVCHKKRKDVSCPIRQVPTGKKQVPLNPDLNQTKPGNFPSLAVSSNEFEPSNSHMVKSYSLLFRVTRPGRREFNGMINGETNENIDVNEELPARRKRNREDGEKTFVAQMTVFDKNRRLQLLDGEYEVAMQEMEECPISKKRATWETILDGKRLPPFETFSQGPTLQFTLRWTGETNDKSTAPIAKPLATRNSESLHQENKPGSVKPTQTIAVKESLTTDLQTRKEKDTPNENRQKLRIFYQFLYNNNTRQQTEARDDLHCPWCTLNCRKLYSLLKHLKLCHSRFIFNYVYHPKGARIDVSINECYDGSYAGNPQDIHRQPGFAFSRNGPVKRTPITHILVCRPKRTKASMSEFLESEDGEVEQQRTYSSGHNRLYFHSDTCLPLRPQEMEVDSEDEKDPEWLREKTITQIEEFSDVNEGEKEVMKLWNLHVMKHGFIADNQMNHACMLFVENYGQKIIKKNLCRNFMLHLVSMHDFNLISIMSIDKAVTKLREMQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	Histone-lysine N-methyltransferase EZH2
分子量 formula_weight	86175.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.1.1.356
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

SNAGQTGKKSEKGPVACRKRVKSEYMRLRQLKRFRRADEVKSMFSSNRQKILERTEILNQEWKQRRIQPVHILTSVSSLRGTRECSVTSDLDFPTQVIPLKTLNAVASVPIMYSWSPLQQNFMVEDETVLHNIPYMGDEVLDQDGTFIEELIKNYDGKVHGDRECGFINDEIFVELVNALGQYNDDDDDDDGDDPEEREEKQKDLEDHRDDKESRPPRKFPSDKIFEAISSMFPDKGTAEELKEKYKELTEQQLPGALPPECTPNIDGPNAKSVQREQSLHSFHTLFCRRCFKYDCFLHRKCNYSFHATPNTYKRKNTETALDNKPCGPQCYQHLEGAKEFAAALTAERIKTPPKRPGGRRRGRLPNNSSRPSTPTINVLESKDTDSDREAGTETGGENNDKEEEEKKDETSSSSEANSRCQTPIKMKPNIEPPENVEWSGAEASMFRVLIGTYYDNFCAIARLIGTKTCRQVYEFRVKESSIIAPAPAEDVDTPPRKKKRKHRLWAAHCRKIQLKKDGSSNHVYNYQPCDHPRQPCDSSCPCVIAQNFCEKFCQCSSECQNRFPGCRCKAQCNTKQCPCYLAVRECDPDLCLTCGAADHWDSKNVSCKNCSIQRGSKKHLLLAPSDVAGWGIFIKDPVQKNEFISEYCGEIISQDEADRRGKVYDKYMCSFLFNLNNDFVVDATRKGNKIRFANHSVNPNCYAKVMMVNGDHRIGIFAKRAIQTGEELFFDYRYSQADALKYVGIEREMEIP

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	Polycomb protein EED
分子量 formula_weight	50267.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MSEREVSTAPAGTDMPAAKKQKLSSDENSNPDLSGDENDDAVSIESGTNTERPDTPTNTPNAPGRKSWGKGKWKSKKCKYSFKCVNSLKEDHNQPLFGVQFNWHSKEGDPLVFATVGSNRVTLYECHSQGEIRLLQSYVDADADENFYTCAWTYDSNTSHPLLAVAGSRGIIRIINPITMQCIKHYVGHGNAINELKFHPRDPNLLLSVSKDHALRLWNIQTDTLVAIFGGVEGHRDEVLSADYDLLGEKIMSCGMDHSLKLWRINSKRMMNAIKESYDYNPNKTNRPFISQKIHFPDFSTRDIHRNYVDCVRWLGDLILSKSCENAIVCWKPGKMEDDIDKIKPSESNVTILGRFDYSQCDIWYMRFSMDFWQKMLALGNQVGKLYVWDLEVEDPHKAKCTTLTHHKCGAAIRQTSFSRDSSILIAVCDDASIWRWDRLR

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA (226-MER)
分子量 formula_weight	66539.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	H

ATCGGGAGCTCCGACCGAATGACATGCATGCATACAGGATGTATATACCTGACACGTGCCTGGAGACTAGGGAGTAACCCCCTTGGCGGTTAAAACGCGGGGGACAGCGCGTACGTGCGTTTAAGCGGTGCTAGAGCTGCCTACGACCAATGGAGCGGCCTCGGCACCGGGATCCCCCAGCCGCCGGCAGCGCAGCGCCTGACGGGCACACAGTC

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	Histone H3.2
分子量 formula_weight	15435.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I,W

MARTKQTARKSTGGKAPRKQLATKAARKSAPATGGVKKPHRYRPGTVALREIRRYQKSTELLIRKLPFQRLVREIAQDFKTDLRFQSSAVMALQEASEAYLVALFEDTNLCAIHAKRVTIMPKDIQLARRIRGERA

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	Histone H4
分子量 formula_weight	11625.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J,X

MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKVFLENVIRDAVTYTEHAKRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGGSSG

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	Histone-binding protein RBBP4
分子量 formula_weight	47709.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MADKEAAFDDAVEERVINEEYKIWKKNTPFLYDLVMTHALEWPSLTAQWLPDVTRPEGKDFSIHRLVLGTHTSDEQNHLVIASVQLPNDDAQFDASHYDSEKGEFGGFGSVSGKIEIEIKINHEGEVNRARYMPQNPCIIATKTPSSDVLVFDYTKHPSKPDPSGECNPDLRLRGHQKEGYGLSWNPNLSGHLLSASDDHTICLWDISAVPKEGKVVDAKTIFTGHTAVVEDVSWHLLHESLFGSVADDQKLMIWDTRSNNTSKPSHSVDAHTAEVNCLSFNPYSEFILATGSADKTVALWDLRNLKLKLHSFESHKDEIFQVQWSPHNETILASSGTDRRLNVWDLSKIGEEQSPEDAEDGPPELLFIHGGHTAKISDFSWNPNEPWVICSVSEDNIMQVWQMAENIYNDEDPEGSVDPEGQGS

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	Histone H2A type 1
分子量 formula_weight	14355.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R,U

SNAMSGRGKQGGKTRAKAKTRSSRAGLQFPVGRVHRLLRKGNYAERVGAGAPVYLAAVLEYLTAEILELAGNAARDNKKTRIIPRHLQLAVRNDEELNKLLGRVTIAQGGVLPNIQSVLLPKCTESSKSAKSK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	Histone H2B 1.1
分子量 formula_weight	13655.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S,V

MAKSAPAPKKGSKKAVTKTQKKDGKKRRKTRKESYAIYVYKVLKQVHPDTGISSKAMSIMNSFVNDVFERIAGEASRLAHYNKRSTITSREIQTAVRLLLPGELAKHAVSEGTKAVTKYTSAK

来源 Source

来源生物 organism	Xenopus laevis
通用名 common_name	African clawed frog
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	8355
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DNA (226-MER)
分子量 formula_weight	65905.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

GACTGTGTGCCCGTCAGACGCTGCGCCGCCGGCGGCCGGAGAATCCCGGTGCCGAGGCCGCCCTATTGGTCGTAGACAGCCCCAGCACCGCCTAAACGCACGTACGCGCCGTCCCCCGCGTTTTAACCGCCAAGGGGATTACCCCCCAGTCCCCAGGCACGTGCCAGATATATACATCCCGTACGCACGCACATCATTCGATCGGAGCTCCCGAT

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Zinc finger protein AEBP2
分子量 formula_weight	34183.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y

SNAYTRRYSSISSTIMDVDSTISSGRSTPAMMNGQGSTTSSSKNIAYNCCWDQCQACFNSSPDLADHIRSIHVDGQRGGVFVCLWKGCKVYNTPSTSQSWLQRHMLTHSGDKPFKCVVGGCNASFASQGGLARHVPTHFSQQNSSKVSSQPKAKEESPSKAGMNKRRKLKNKRRRSLPRPHDFFDAQTLDAIRHRAICFNLSAHIESLGKGHSVVFHSTVIAKRKEDSGKIKLLLHWMPEDILPDVWVNESERHQLKTKVVHLSKLPKDTALLLDPNIYRTMPQKRLKRTLIRKVFNLYLSKQ

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	S-ADENOSYL-L-HOMOCYSTEINE
分子量 formula_weight	384.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

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晶胞边长 a length_a	1.000 Å
晶胞边长 b length_b	1.000 Å
晶胞边长 c length_c	1.000 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	—

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.00 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	55918

PRC2-J119-450 monomer bound to H1-nucleosome

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Histone H1.0

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Protein Jumonji

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Polycomb protein SUZ12

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone-lysine N-methyltransferase EZH2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Polycomb protein EED

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H3.2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone-binding protein RBBP4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2A type 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Histone H2B 1.1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体