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8ykd

Cryo-EM structure of ADGRG2-Gs complex with NTF nanobody

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 118.6 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha

Spodoptera

UniProt P63091

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 204–394 突变：G236A,A259D,S262D,L272D,A366S,I372A,V375I Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 （P62871） Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma × 1 （A0A7J7XNR4） Nanobody-35 × 1 Adhesion G-protein coupled receptor G2 × 1 （Q8CJ12） ScFv-16 × 1 AND 3-BETA-HYDROXY-5-ANDROSTEN-17-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称 GNAS_CANLF
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 181–361； UniProt 204–394

Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1

Spodoptera

UniProt P62871

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 2–340 未记录 Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha × 1 （P63091） Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma × 1 （A0A7J7XNR4） Nanobody-35 × 1 Adhesion G-protein coupled receptor G2 × 1 （Q8CJ12） ScFv-16 × 1 AND 3-BETA-HYDROXY-5-ANDROSTEN-17-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

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其他 PDB 相对当前条目 8YKD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1B9X STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN 提交 1999-02-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–340（340 aa） 片段：LYS-C RESISTANT FRAGMENT, THE BETA SUBUNIT
未记录 GD GADOLINIUM ATOM × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.261
1B9Y STRUCTURAL ANALYSIS OF PHOSDUCIN AND ITS PHOSPHORYLATION-REGULATED INTERACTION WITH TRANSDUCIN BETA-GAMMA 提交 1999-02-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–340（340 aa） 片段：LYS-C RESISTANT FRAGMENT, THE BETA SUBUNIT
未记录 GD GADOLINIUM ATOM × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.00 Å R-free 0.266
1GG2 G PROTEIN HETEROTRIMER MUTANT GI_ALPHA_1(G203A) BETA_1 GAMMA_2 WITH GDP BOUND 提交 1996-11-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–339（339 aa） 片段：BETA 1
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 2.40 Å R-free 0.289
1GOT HETEROTRIMERIC COMPLEX OF A GT-ALPHA/GI-ALPHA CHIMERA AND THE GT-BETA-GAMMA SUBUNITS 提交 1996-08-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；277 K；10 MG/ML OF HETEROTRIMERIC COMPLEX WERE MIXED 1:1 WITH WELL SOLUTION CONTAINING 10% PEG-8000, 50 MM TRIS, PH 8.0, 10% GLYCEROL, 50 MM NACL, .1 MM MERCAPTOETHANOL. MIXTURE EQUILIBRATED VS WELL SOLUTION IN HANGING DROPS AT 4 DEGREES C., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.00 Å R-free 0.295
1GP2 G PROTEIN HETEROTRIMER GI_ALPHA_1 BETA_1 GAMMA_2 WITH GDP BOUND 提交 1996-11-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–339（339 aa） 片段：BETA 1
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；pH 7.0
分辨率 2.30 Å R-free 0.307
1OMW Crystal Structure of the complex between G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 and Heterotrimeric G Protein beta 1 and gamma 2 subunits 提交 2003-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.75；277 K；PEG 3350, Sodium Chloride, CHAPS, ATP, Magnesium Chloride, Mastoparan , MES pH 5.75, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.50 Å R-free 0.252
1XHM The Crystal Structure of a Biologically Active Peptide (SIGK) Bound to a G Protein Beta:Gamma Heterodimer 提交 2004-09-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；PEG 4000, GLYCEROL, HEPES, PH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.287
24XZ P2Y14R-Gi complex bound to UDP 提交 2026-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.93 Å
2BCJ Crystal Structure of G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 in Complex with Galpha-q and Gbetagamma Subunits 提交 2005-10-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–340（339 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 ALF TETRAFLUOROALUMINATE ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；9% PEG8000, 1M NaCl, 0.1M MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.06 Å R-free 0.292
2TRC PHOSDUCIN/TRANSDUCIN BETA-GAMMA COMPLEX 提交 1997-01-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa） 片段：LYS-C RESISTANT FRAGMENT, THE GAMMA SUBUNIT CLEAVED AFTER RESIDUE 68
未记录 GD GADOLINIUM ATOM × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；277 K；THE PROTEIN COMPLEX (10 MG/ML SOLUTION) WAS CRYSTALLIZED FROM 50 MM SODIUM CITRATE (PH 5.0), 150 MM MAGNESIUM ACETATE, 9.5% PEG 8000, BY HANGING DROP METHOD AT 4 DEGREES C., vapor diffusion - hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.277
3AH8 Structure of heterotrimeric G protein Galpha-q beta gamma in complex with an inhibitor YM-254890 提交 2010-04-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 5.1；293 K；7% PEG 4000, 30% (v/v) glycerol, 70 mM acetate-NaOH, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
分辨率 2.90 Å R-free 0.315
3CIK Human GRK2 in Complex with Gbetagamma subunits 提交 2008-03-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；277 K；200 mM NaCl, 5% ethylene glycol, 6.3% PEG 3350, pH 5.25, vapor diffusion, hanging drop, temperature 277K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
分辨率 2.75 Å R-free 0.269
3KRW Human GRK2 in complex with Gbetgamma subunits and balanol (soak) 提交 2009-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 BA1 BALANOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 277 K；Well contained 100 mM MES, pH 5.6, 200 mM NaCl, 9% PEG 3350. Drops were 1 uL protein, 1 uL well, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.90 Å R-free 0.265
3KRX Human GRK2 in complex with Gbetgamma subunits and balanol (co-crystal) 提交 2009-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 BA1 BALANOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 277 K；Well contained 100 mM MES, pH 6.0, 200 mM NaCl, 9% PEG 3350. Drops were 1 uL protein, 1 uL well, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 3.10 Å R-free 0.270
3PSC Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits 提交 2010-12-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；9% PEG3350, 200 mM NaCl, 100 mM MES pH 6.5, 1 mM ATP, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.67 Å R-free 0.257
3PVU Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and a selective kinase inhibitor (CMPD101) 提交 2010-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 QRW 3-({[4-methyl-5-(pyridin-4-yl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]methyl}amino)-N-[2-(trifluoromethyl)benzyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；277 K；7% PEG3350, 200 mM NaCl, 100 mM MES pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.48 Å R-free 0.274
3PVW Bovine GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and a selective kinase inhibitor (CMPD103A) 提交 2010-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 QRX N-(2,6-difluorobenzyl)-3-({[4-propyl-5-(pyrimidin-4-yl)-4H-1,2,4-triazol-3-yl]methyl}amino)benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.25；277 K；7% PEG3350, 250 mM NaCl, 100 mM MES pH 6.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.49 Å R-free 0.285
3UZS Structure of the C13.28 RNA Aptamer Bound to the G Protein-Coupled Receptor Kinase 2-Heterotrimeric G Protein Beta 1 and Gamma 2 Subunit Complex 提交 2011-12-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；277 K；100 mM Tris pH 8.5, 200 mM NaCl and 3% PEG 8000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 4.52 Å R-free 0.268
3V5W Human G Protein-Coupled Receptor Kinase 2 in Complex with Soluble Gbetagamma Subunits and Paroxetine 提交 2011-12-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 8PR Paroxetine × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.8；277 K；100 mM MES pH 5.8, 200 mM NaCl, and 8% (w/v) PEG3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.07 Å R-free 0.247
4MK0 Crystal structure of G protein-coupled receptor kinase 2 in complex with a a rationally designed paroxetine derivative 提交 2013-09-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 29X 5-{[(3S,4R)-4-(4-fluorophenyl)piperidin-3-yl]methoxy}-1H-isoindol-1-one × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7；277 K；6% PEG 3350, 1M NaCl, 2 mM MgCl2, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.40 Å R-free 0.238
5KDO Heterotrimeric complex of the 4 alanine insertion variant of the Gi alpha1 subunit and the Gbeta1-Ggamma1 提交 2016-06-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；294 K；19-24 % PEG 8000, 1-5% 2-propanolol, 1% OG, 100 mM HEPES (pH 7.0) and 100 mM NaOAc (pH 6.4)
分辨率 1.90 Å R-free 0.208
5WG3 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG258748 提交 2017-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 AFM 2-fluoro-5-[(3S,4R)-3-{[(1H-indazol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-N-[(1H-pyrazol-3-yl)methyl]benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6, 1.1 M NaCl, 8% PEG3350
分辨率 2.90 Å R-free 0.248
5WG4 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG257284 提交 2017-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 AFV 2-fluoro-5-[(3S,4R)-3-{[(1H-indazol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-N-[(pyridin-2-yl)methyl]benzamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6, 6% PEG 3350, 1 M NaCl
分辨率 2.31 Å R-free 0.279
5WG5 Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG224061 提交 2017-07-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 ZSO 5-{[(3S,4R)-4-(4-fluorophenyl)piperidin-3-yl]methoxy}-2H-indazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6, 8-15% PEG3350, 0.8-1.2 M NaCl
分辨率 3.10 Å R-free 0.232
6B20 Crystal structure of a complex between G protein beta gamma dimer and an inhibitory Nanobody regulator 提交 2017-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 A 3–340（338 aa）
突变：V71L UNX UNKNOWN LIGAND × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277.15 K；25-30% (w/v) PEG 3350 in 0.1-0.2 M Bis-Tris-HCl, pH 5.5-5.7, and 0.2-0.3 M MgCl2
分辨率 2.34 Å R-free 0.249
6B20 Crystal structure of a complex between G protein beta gamma dimer and an inhibitory Nanobody regulator 提交 2017-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 3–340（338 aa）
突变：V71L UNX UNKNOWN LIGAND × 5 CL CHLORIDE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；277.15 K；25-30% (w/v) PEG 3350 in 0.1-0.2 M Bis-Tris-HCl, pH 5.5-5.7, and 0.2-0.3 M MgCl2
分辨率 2.34 Å R-free 0.249
6C2Y Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG257142 提交 2018-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 EJS (4R,5R,6S)-4-[4-fluoro-3-({[3-(methoxymethyl)-1,2,4-oxadiazol-5-yl]methyl}carbamoyl)phenyl]-N-(2H-indazol-5-yl)-6-methyl-2-oxohexahydropyrimidine-5-carboxamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 800 mM NaCl, 8% PEG 3350
分辨率 2.74 Å R-free 0.292
6OY9 Structure of the Rhodopsin-Transducin Complex 提交 2019-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 RET RETINAL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6OYA Structure of the Rhodopsin-Transducin-Nanobody Complex 提交 2019-05-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 RET RETINAL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 1 second before plunging; avoid light as much as possible.
分辨率 3.30 Å
6PCV Single Particle Reconstruction of Phosphatidylinositol (3,4,5) trisphosphate-dependent Rac exchanger 1 bound to G protein beta gamma subunits 提交 2019-06-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
6QNO Rhodopsin-Gi protein complex 提交 2019-02-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 RET RETINAL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；The detergent lauryl-maltose neopentyl glycol (LMNG) was used before the last purification step by gel filtration. In the gel filtration, detergent-free buffer was used.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.38 Å
6U7C Human GRK2 in complex with Gbetagamma subunits and CCG258747 提交 2019-09-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 Q1Y 5-[(3S,4R)-3-{[(2H-1,3-benzodioxol-5-yl)oxy]methyl}piperidin-4-yl]-2-fluoro-N-[(2H-indazol-3-yl)methyl]benzamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；50 mM MES pH 6.0, 1.1 M NaCl, 6% PEG 3350
分辨率 2.44 Å R-free 0.262
7BZ2 Cryo-EM structure of the formoterol-bound beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex. 提交 2020-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 H98 ~{N}-[5-[(1~{R})-2-[[(2~{R})-1-(4-methoxyphenyl)propan-2-yl]amino]-1-oxidanyl-ethyl]-2-oxidanyl-phenyl]methanamide × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.82 Å
7D68 Cryo-EM structure of the human glucagon-like peptide-2 receptor-Gs protein complex 提交 2020-09-29 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7DHI Cryo-EM structure of the partial agonist salbutamol-bound beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex. 提交 2020-11-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 68H SALBUTAMOL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
7DHR Cryo-EM structure of the full agonist isoprenaline-bound beta2 adrenergic receptor-Gs protein complex. 提交 2020-11-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 5FW ISOPRENALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7E14 Compound2_GLP-1R_OWL833_Gs complex structure 提交 2021-01-30 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 V6G 3-[(1S,2S)-1-(5-[(4S)-2,2-dimethyloxan-4-yl]-2-{(4S)-2-(4-fluoro-3,5-dimethylphenyl)-3-[3-(4-fluoro-1-methyl-1H-indazol-5-yl)-2-oxo-2,3-dihydro-1H-imidazol-1-yl]-4-methyl-2,4,6,7-tetrahydro-5H-pyrazolo[4,3-c]pyridine-5-carbonyl}-1H-indol-1-yl)-2-methylcyclopropyl]-1,2,4-oxadiazol-5(4H)-one × 1 CLR CHOLESTEROL × 5 HNO N-tert-butyl-6,7-bis(chloranyl)quinoxalin-2-amine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7JJO Structural Basis of the Activation of Heterotrimeric Gs-protein by Isoproterenol-bound Beta1-Adrenergic Receptor 提交 2020-07-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 5FW ISOPRENALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7O7F Structural basis of the activation of the CC chemokine receptor 5 by a chemokine agonist 提交 2021-04-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
7PWD Structure of an inhibited GRK2-G-beta and G-gamma complex 提交 2021-10-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 8DS 4-chloranyl-N-[2-(4-chlorophenyl)ethyl]thieno[2,3-c]pyridine-2-carboxamide × 1 CL CHLORIDE ION × 2 1PE PENTAETHYLENE GLYCOL × 1 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；277 K；ethylene glycol, PEG 3350, MES, NaCl
分辨率 2.60 Å R-free 0.230
7S0F Isoproterenol bound beta1 adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi protein 提交 2021-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 5FW ISOPRENALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.96 Å
7S0G Isoproterenol bound beta1 adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi/s chimera protein 提交 2021-08-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 5FW ISOPRENALINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.86 Å
7SQO Structure of the orexin-2 receptor(OX2R) bound to TAK-925, Gi and scFv16 提交 2021-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 OLA OLEIC ACID × 4 A6F methyl (2R,3S)-3-[(methanesulfonyl)amino]-2-({[(1s,4S)-4-phenylcyclohexyl]oxy}methyl)piperidine-1-carboxylate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.17 Å
7TD0 Lysophosphatidic acid receptor 1-Gi complex bound to LPA 提交 2021-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
7TD1 Lysophosphatidic acid receptor 1-Gi complex bound to LPA, state a 提交 2021-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.08 Å
7TD2 Lysophosphatidic acid receptor 1-Gi complex bound to LPA, state a 提交 2021-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 NKP (2R)-2-hydroxy-3-(phosphonooxy)propyl (9E)-octadec-9-enoate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7TD3 Sphingosine-1-phosphate receptor 1-Gi complex bound to S1P 提交 2021-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 S1P (2S,3R,4E)-2-amino-3-hydroxyoctadec-4-en-1-yl dihydrogen phosphate × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7TD4 Sphingosine-1-phosphate receptor 1-Gi complex bound to Siponimod 提交 2021-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 J8C 1-[[4-[(~{E})-~{N}-[[4-cyclohexyl-3-(trifluoromethyl)phenyl]methoxy]-~{C}-methyl-carbonimidoyl]-2-ethyl-phenyl]methyl]azetidine-3-carboxylic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
7X1T Structure of Thyrotropin-Releasing Hormone Receptor bound with Taltirelin. 提交 2022-02-24 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
7X1U Structure of Thyrotropin-Releasing Hormone Receptor bound with an Endogenous Peptide Agonist TRH. 提交 2022-02-24 构建体不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
7XAT Structure of somatostatin receptor 2 bound with SST14. 提交 2022-03-19 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 2–340（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
7XAU Structure of somatostatin receptor 2 bound with octreotide. 提交 2022-03-19 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 2–340（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.97 Å
7XAV Structure of somatostatin receptor 2 bound with lanreotide. 提交 2022-03-19 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 2–340（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
7YJ4 Cryo-EM structure of the INSL5-bound human relaxin family peptidereceptor 4 (RXFP4)-Gi complex 提交 2022-07-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 T 2–340（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.19 Å
8DCR Cryo-EM structure of dobutamine-bound beta1-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gs-protein 提交 2022-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 Y00 DOBUTAMINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8DCS Cryo-EM structure of cyanopindolol-bound beta1-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gs-protein 提交 2022-06-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 P32 Cyanopindolol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8P12 Cryo-EM structure of Rhodopsin-Gi bound to antibody fragment Fab13 提交 2023-05-11 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.21 Å
8P13 Cryo-EM structure of Rhodopsin-Gi bound with antibody fragments scFv16 and Fab79, conformation 1 提交 2023-05-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8P15 Cryo-EM structure of Rhodopsin-Gi bound with antibody fragments scFv16 and Fab79, conformation 2 提交 2023-05-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES (pH 7.5), 100 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
8SOC Phosphoinositide phosphate 3 kinase gamma bound with ADP and Gbetagamma 提交 2023-04-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 1–340（340 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force 2
分辨率 3.50 Å
8SOD Phosphoinositide phosphate 3 kinase gamma bound with ADP and two Gbetagamma subunits in State 1 提交 2023-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–340（340 aa）
链 E 1–340（340 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force 2
分辨率 3.40 Å
8SOE Phosphoinositide phosphate 3 kinase gamma bound with ADP and two Gbetagamma subunits in State 2 提交 2023-04-28 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–340（340 aa）
链 E 1–340（340 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot force 2
分辨率 3.60 Å
8YH0 A3R-Gi complex bound to NECA 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 NEC N-ETHYL-5'-CARBOXAMIDO ADENOSINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8YH2 A3R-Gi complex bound to adenosine 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 ADN ADENOSINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.27 Å
8YH3 A3R-Gi complex bound to m6A 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 6MD N-methyladenosine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8YH5 A3R-Gi complex bound to i6A 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 ZIR N-(3-methylbut-2-en-1-yl)adenosine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.66 Å
8YH6 A3R-Gi complex bound to namodenoson 提交 2024-02-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 XS0 namodenoson × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9CBL Cryo-EM structure of epinephrine-bound alpha-2A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi-protein 提交 2024-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 ALE L-EPINEPHRINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9CBM Cryo-EM structure of dexmedetomidine-bound alpha-2A-adrenergic receptor in complex with heterotrimeric Gi-protein 提交 2024-06-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 CZX 4-[(1~{S})-1-(2,3-dimethylphenyl)ethyl]-1~{H}-imidazole × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EPR Cryo-EM Structure of Jumping Spider Rhodopsin-1 bound to a Gi heterotrimer 提交 2024-03-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 B 1–340（340 aa）
未记录 RET RETINAL × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
9Y7H Gb1g2 crosslinked to PLCb3 提交 2025-09-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 8–339（332 aa）
未记录 ME7 1,1'-ethane-1,2-diylbis(1H-pyrrole-2,5-dione) × 1 CA CALCIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA and 0.1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
9YAO Gbg crosslinked to PLCb3 - second conformation 提交 2025-09-16 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 8–339（332 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA and 0.1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
9YAP Gbg crosslinked to PLCb3 - second conformation 提交 2025-09-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 2–340（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4；20 mM HEPES pH 7.4, 100 mM NaCl, 0.1 mM EDTA and 0.1 mM EGTA
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å

共 72 个其他 PDB 条目、73 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GBB1_BOVIN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 20–358； UniProt 2–340

Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma

Spodoptera

UniProt A0A7J7XNR4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 G； UniProt 19–99 未记录 Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha × 1 （P63091） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 （P62871） Nanobody-35 × 1 Adhesion G-protein coupled receptor G2 × 1 （Q8CJ12） ScFv-16 × 1 AND 3-BETA-HYDROXY-5-ANDROSTEN-17-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8YKD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8GCP Cryo-EM Structure of the Prostaglandin E2 Receptor 4 Coupled to G Protein 提交 2023-03-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 19–99（81 aa）
未记录 P2E (Z)-7-[(1R,2R,3R)-3-hydroxy-2-[(E,3S)-3-hydroxyoct-1-enyl]-5-oxo-cyclopentyl]hept-5-enoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8GD9 Cryo-EM Structure of the Prostaglandin E2 Receptor 4 Coupled to G Protein 提交 2023-03-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 19–99（81 aa）
未记录 Z2C 4-({2-[(1R,2R,3R,5S)-3,5-dihydroxy-2-{(3S)-3-hydroxy-4-[3-(methoxymethyl)phenyl]butyl}cyclopentyl]ethyl}sulfanyl)butanoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8GDA Cryo-EM Structure of the Prostaglandin E2 Receptor 4 Coupled to G Protein 提交 2023-03-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 19–99（81 aa）
未记录 YZV (2S,5R)-5-[(1E,3S)-4,4-difluoro-3-hydroxy-4-phenylbut-1-en-1-yl]-1-[6-(1H-tetrazol-5-yl)hexyl]pyrrolidin-2-ol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8GDB Cryo-EM Structure of the Prostaglandin E2 Receptor 4 Coupled to G Protein 提交 2023-03-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 G 19–99（81 aa）
未记录 P2E (Z)-7-[(1R,2R,3R)-3-hydroxy-2-[(E,3S)-3-hydroxyoct-1-enyl]-5-oxo-cyclopentyl]hept-5-enoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8GDC Cryo-EM Structure of the Prostaglandin E2 Receptor 3 Coupled to G Protein 提交 2023-03-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 C 19–99（81 aa）
未记录 P2E (Z)-7-[(1R,2R,3R)-3-hydroxy-2-[(E,3S)-3-hydroxyoct-1-enyl]-5-oxo-cyclopentyl]hept-5-enoic acid × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å

共 5 个其他 PDB 条目、5 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A7J7XNR4_RHIFE
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 28–108； UniProt 19–99

Adhesion G-protein coupled receptor G2

Spodoptera

UniProt Q8CJ12

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白拷贝数一致 链 R； UniProt 38–891 未记录 Guanine nucleotide-binding protein G(s) subunit alpha × 1 （P63091） Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1 × 1 （P62871） Guanine nucleotide-binding protein subunit gamma × 1 （A0A7J7XNR4） Nanobody-35 × 1 ScFv-16 × 1 AND 3-BETA-HYDROXY-5-ANDROSTEN-17-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8YKD Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7WUI Tethered peptide activation mechanism of adhesion GPCRs ADGRG2 and ADGRG4 提交 2022-02-08 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 R 38–891（854 aa）
突变：H597A,T599A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7WUQ Tethered peptide activation mechanism of adhesion GPCRs ADGRG2 and ADGRG4 提交 2022-02-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 597–1009（413 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7XKD Cryo-EM structure of DHEA-ADGRG2-BT-Gs complex 提交 2022-04-19 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 614–891（278 aa）
未记录 AND 3-BETA-HYDROXY-5-ANDROSTEN-17-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
7XKE Cryo-EM structure of DHEA-ADGRG2-FL-Gs complex 提交 2022-04-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 38–891（854 aa）
突变：H597A, T599A AND 3-BETA-HYDROXY-5-ANDROSTEN-17-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7XKF Cryo-EM structure of DHEA-ADGRG2-BT-Gs complex at lower state 提交 2022-04-19 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 614–891（278 aa）
未记录 AND 3-BETA-HYDROXY-5-ANDROSTEN-17-ONE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
7YP7 apo-ADGRG2 coupled to Gs 提交 2022-08-02 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 R 38–891（854 aa）
突变：H597A, T599A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å

共 6 个其他 PDB 条目、6 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 AGRG2_MOUSE
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 25–878； UniProt 38–891

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8ykd

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8ykd
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8ykd
沉积日期 deposition_date2024-03-04
结构标题 titleCryo-EM structure of ADGRG2-Gs complex with NTF nanobody
关键词 keywordsGPCR, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier36.23 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron36.11 Å
零角强度 I(0) i0266071000.00
分子量 molecular_weight133660.0 kDa
排除体积 excluded_volume167710 ų
包络体积 envelope_volume212240 ų
水化壳体积 shell_volume49552 ų
包络直径 envelope_diameter124.0 Å
壳层 Rg shell_rg41.88 Å
包络 Rg envelope_rg36.16 Å
形状 Rg shape_rg36.10 Å
总 Rg total_rg36.51 Å
总原子数 total_atoms9410
残基数 n_residues1225
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax118.6 Å
Rg (实空间) rg_real36.19 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.22 Å
I(0) (实空间) i0_real2.6610e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.7590e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal36.22 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal266100000.0000
解质量估计 total_estimate0.8996
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary43.1 Å
偏度 Skewness skewness0.256
峰度 Kurtosis kurtosis-0.524
角度范围 angular_range— – 0.2200 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha59340000.0000
实空间数据点数 n_real_points45
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.918; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.990; Smooth: 0.948
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)