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9cnw

CryoEM structure of the APO-BAM complex in DDM detergent

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 142.0 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Outer membrane protein assembly factor BamA

Escherichia coli

UniProt P0A940

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 1–810 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （W8SZY2） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CNW Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2QCZ Structure of N-terminal domain of E. Coli YaeT 提交 2007-06-20 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–351（331 aa） 片段：residues 21-351
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；10% PEG 10K, 100mM sodium acetate, 100 mM magnesium formate, 10%glycerol, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.70 Å R-free 0.329
2QCZ Structure of N-terminal domain of E. Coli YaeT 提交 2007-06-20 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 21–351（331 aa） 片段：residues 21-351
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；10% PEG 10K, 100mM sodium acetate, 100 mM magnesium formate, 10%glycerol, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.70 Å R-free 0.329
2QDF Structure of N-terminal domain of E. Coli YaeT 提交 2007-06-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–351（331 aa） 片段：residues 21-351
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.8；295 K；10% PEG 10K, 100mM sodium acetate, 100 mM magnesium formate, 10%glycerol, pH 4.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.20 Å R-free 0.286
2V9H Solution Structure of an Escherichia coli YaeT tandem POTRA domain 提交 2007-08-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–174（154 aa） 片段：POTRA DOMAINS 1 AND 2, RESIDUES 21-174
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）86；压力 1.0
NMR样品组成 50 MM MES, 50 MM NACL
分辨率未提供
3EFC Crystal Structure of YaeT periplasmic domain 提交 2008-09-08 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–410（390 aa） 片段：periplasmic domain (UNP residues 21-410)
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289.15 K；1.3-1.6M (NH4)2SO4, 3-6% polyethylene glycol 400, 10% Dioxane, 0.1M MES pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289.15K
分辨率 3.30 Å R-free 0.295
4C4V Structure of the outer membrane protein insertase BamA with one POTRA domain. 提交 2013-09-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 347–810（464 aa） 片段：BAMA TRUNCATED BY 4 POTRA DOMAINS, RESIDUES 347-808
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.292
4C4V Structure of the outer membrane protein insertase BamA with one POTRA domain. 提交 2013-09-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 344–810（467 aa） 片段：BAMA TRUNCATED BY 4 POTRA DOMAINS, RESIDUES 344-808
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；pH 7.5
分辨率 3.00 Å R-free 0.292
4N75 Structural Basis of BamA-mediate Outer Membrane Protein Biogenesis 提交 2013-10-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 427–810（384 aa） 片段：barrel domain, UNP residues 427-810
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；0.1M MES PH 6.0, 6% Tacsimate, 25% PEG 4000, 0.6% C8E4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.253
4N75 Structural Basis of BamA-mediate Outer Membrane Protein Biogenesis 提交 2013-10-14 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 427–810（384 aa） 片段：barrel domain, UNP residues 427-810
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；289 K；0.1M MES PH 6.0, 6% Tacsimate, 25% PEG 4000, 0.6% C8E4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 2.60 Å R-free 0.253
4PK1 Structure of BamB fused to a BamA POTRA domain fragment 提交 2014-05-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 175–424（250 aa） 片段：UNP P0A940 residues 175-424,UNP P77774 residues 21-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；The BamA-BamB chimera protein was crystallized at 16 degC by sitting drop vapor diffusion method. Initial crystallizing conditions were refined in a hanging drop in the following solution: 1.4M Ammonium sulfate, 9% 2-propanol, and 0.1M Sodium acetate pH 5.5. We used 1.5 uL of the 20mg/ml protein mixed with 1.5 uL mother liquor in a reservoir filled with 500 uL precipitant solution
分辨率 3.10 Å R-free 0.281
4XGA Crystal structure of BamB and BamA P3-5 complex from E.coli 提交 2014-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 175–420（246 aa） 片段：UNP RESIDUES 175-420
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1% w/v Tryptone, 20% w/v Polyethylene glycol 3350, 0.05M HEPES sodium pH 7.0
分辨率 2.15 Å R-free 0.231
5AYW Structure of a membrane complex 提交 2015-09-14 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 22–810（789 aa） 片段：UNP residues 22-810
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；Tris-HCl, NaCl, PEG 400
分辨率 3.56 Å R-free 0.314
5D0O BamABCDE complex, outer membrane beta barrel assembly machinery entire complex 提交 2015-08-03 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH7.5, 30% PEG600, CYMAL-4
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–810（809 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5D0Q BamACDE complex, outer membrane beta-barrel assembly machinery (BAM) complex 提交 2015-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 F 2–810（809 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；297 K；0.1 M Tris, pH8.0, 0.1 M MgCl2, 24% PEG500 MME.
分辨率 3.50 Å R-free 0.340
5EKQ The structure of the BamACDE subcomplex from E. coli 提交 2015-11-04 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 21–810（790 aa） 片段：UNP residues 21-810
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；100 mM Tris-HCl, pH 8.5, 200 mM MgCl2, 10 mM MnCl2, and 8% PEG 4000
分辨率 3.39 Å R-free 0.281
6LYQ Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.293
6LYR Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.28 Å R-free 0.280
6LYS Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.05 Å R-free 0.284
6LYU Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6T1W Structure of E. coli BamA in complex with lipoprotein RcsF 提交 2019-10-07 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.03 M sodium nitrate, 0.03 M sodium phosphate dibasic, 0.03 M ammonium sulfate, 0.10 M Tris-base [pH 8.5]; BICINE, 20 % (v/v) ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000
分辨率 3.79 Å R-free 0.317
6T1W Structure of E. coli BamA in complex with lipoprotein RcsF 提交 2019-10-07 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.5；293 K；0.03 M sodium nitrate, 0.03 M sodium phosphate dibasic, 0.03 M ammonium sulfate, 0.10 M Tris-base [pH 8.5]; BICINE, 20 % (v/v) ethylene glycol; 10 % w/v PEG 8000
分辨率 3.79 Å R-free 0.317
6V05 Cryo-EM structure of a substrate-engaged Bam complex 提交 2019-11-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
链 F 1–21（21 aa）
链 F 22–171（150 aa）
链 F 422–429（8 aa）
链 F 440–810（371 aa）
突变：C690S, C700S, F804C 突变：T467C,C690S,C700S,deletion of residues 172-421,deletion of residues 430-439 突变：T467C,C690S,C700S,deletion of residues 172-421,deletion of residues 430-439 突变：T467C,C690S,C700S,deletion of residues 172-421,deletion of residues 430-439 突变：T467C,C690S,C700S,deletion of residues 172-421,deletion of residues 430-439 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7BNQ Lateral-closed conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-22 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：E435C S665C C690S C700S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7NBX Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-28 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：E435C S665C C690S C700S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NCS Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) bound by a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：E435C S665C C690S C700S 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7ND0 lateral-open conformation of the wild-type BAM complex (BamABCDE) bound to a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7NRI Structure of the darobactin-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2021-03-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–808（788 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4microL of sample applied
分辨率 3.03 Å
7R1W E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to dynobactin A 提交 2022-02-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–809（809 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.05% (w/v) n-dodecyl Beta-D-maltopyranoside (DDM)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7RI4 Structure of a BAM/EspP(beta9-12) hybrid-barrel intermediate 提交 2021-07-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7RI5 Structure of a BAM in MSP1E3D1 nanodiscs at 4 Angstrom resolution 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7RI6 Structure of BAM in MSP1E3D1 nanodiscs prepared from E. coli outer membranes 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
7RI7 The structure of BAM in MSP1D1 nanodiscs 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
7RI8 The structure of BAM in MSP2N2 nanodiscs 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.50 Å
7RI9 The structure of BAM in MSP1E3D1 at 6.9 Angstrom resolution 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
7RJ5 The structure of BAM in complex with EspP at 7 Angstrom resolution 提交 2021-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
7YE4 BAM-EspP complex structure with BamA-G431C and G781C/EspP-N1293C and A1043C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：G431C,G781C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YE6 BAM-EspP complex structure with BamA-N427C/EspP-R1297C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：N427C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ADG Cryo-EM structure of Darobactin 22 bound BAM complex 提交 2022-07-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8ADI Cryo-EM structure of Darobactin 9 bound BAM complex 提交 2022-07-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8BNZ BAM-EspP complex structure with BamA-G431C/EspP-N1293C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：G431C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BVQ E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to darobactin B 提交 2022-12-05 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PZ1 Wait Complex: Lateral open BAM bound Compact SurA 提交 2023-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：R76C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8PZ2 Wait Complex: Lateral open BAM bound Extended SurA 提交 2023-07-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：R76C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8PZU Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Compact SurA 提交 2023-07-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：R76C MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8QN4 Structure of the BAM-EspP complex in an open EspP intermediate state 提交 2023-09-25 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
突变：G431C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8QPV Handover Complex: BAM bound OmpX and extended SurA 提交 2023-10-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QPW Arrival Complex: Lateral open BAM bound extended SurA plus OmpX 提交 2023-10-03 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
9CNX CryoEM structure of BAM in complex with the PTB1 closed-state inhibitor (in DDM detergent) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9CNY CryoEM structure of the APO-BAM complex in SMA nanodisc 提交 2024-07-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9CNZ Structure of BAM complexed with PTB2 ligand in detergent 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CO0 CryoEM structure of BAM in complex with the PTB2 open-state inhibitor (in SMA nanodisc) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9H84 BAM-hinge (LVPR) 提交 2024-10-28 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 92–810（719 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9H85 BAM-hinge (GSGS) 提交 2024-10-28 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9H89 BAM-hinge (LVPR) suppressor (T434A) 提交 2024-10-28 构建体不同 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 21–810（790 aa）
突变：T434A 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9HE1 Structure of the Xenorceptide A2-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2024-11-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；25 mM NaPi, 100 mM NaCl, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3.5uL sample, blot time 3sec, Blotforce 1, Blot total 1,
分辨率 3.00 Å
9HG5 BAM-SurA complex in the swing-in state with full length BamC resolved 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HG6 BAM-SurA complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9HG7 BAM-SurA complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9HG8 BAM-SurA complex in the swing-out state with BamC resolved 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9HG9 BAM-SurA-darobactin complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9HGA BAM-SurA-darobactin complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9MGE beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an early state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 24–810（787 aa）
链 F 22–171（150 aa）
链 F 422–810（389 aa）
突变：D512C 突变：Y637C 突变：Y637C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MGF beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a middle state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 A 21–810（790 aa）
链 F 22–171（150 aa）
链 F 422–810（389 aa）
突变：D512C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MGG beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a late state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 24–810（787 aa）
链 F 22–171（150 aa）
链 F 422–810（389 aa）
突变：D512C 突变：I458C 突变：I458C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–810（810 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å

共 64 个其他 PDB 条目、69 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BAMA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–810； UniProt 1–810

Outer membrane protein assembly factor BamB

Escherichia coli

UniProt P77774

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 B； UniProt 1–392 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （P0A940） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （W8SZY2） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CNW Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2YH3 The structure of BamB from E. coli 提交 2011-04-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 22–392（371 aa） 片段：RESIDUES 22-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 4.6；3.5M NH4CL, 0.1M NA-ACETATE PH 4.6
分辨率 2.60 Å R-free 0.270
2YMS Structure and assembly of a b-propeller with nine blades and a new conserved repetitive sequence motif 提交 2012-10-10 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 62–191（130 aa） 片段：FRAGMENTS OF BAMB FROM E. COLI, RESIDUES 62-191
链 B 113–186（74 aa） 片段：FRAGMENTS OF BAMB FROM E. COLI, RESIDUES 113-186
链 C 248–322（75 aa） 片段：FRAGMENTS OF BAMB FROM E. COLI, RESIDUES 248-322
链 D 247–320（74 aa） 片段：FRAGMENTS OF BAMB FROM E. COLI, RESIDUES 249-320
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.10 Å R-free 0.239
3P1L Crystal structure of Escherichia coli BamB, a lipoprotein component of the beta-barrel assembly machinery complex, native crystals. 提交 2010-09-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa）
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4；295 K；0.1M Citric acid, 2M NaCl, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
分辨率 2.60 Å R-free 0.233
3PRW Crystal structure of the lipoprotein BamB 提交 2010-11-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP Residues 21-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.9；292 K；100 mM Tris, pH 6.9, 20% PEG 3350, 200 mM ammonium citrate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 292K
分辨率 1.80 Å R-free 0.204
3Q7M The crystal structure of BamB from the BAM complex in spacegroup I222 提交 2011-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP residues 21-392
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.18 M triammonium citrate, 20% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.65 Å R-free 0.193
3Q7N The crystal structure of BamB from the BAM complex in spacegroup P212121 提交 2011-01-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP residues 21-392
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.18 M triammonium citrate, 20% PEG3350, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.77 Å R-free 0.232
3Q7O The crystal structure of BamB from the BAM complex in spacegroup P213 提交 2011-01-05 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP residues 21-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；298 K；1.0 M lithium sulfate, 2% PEG8000, pH 7.5, temperature 298K
分辨率 2.09 Å R-free 0.263
4PK1 Structure of BamB fused to a BamA POTRA domain fragment 提交 2014-05-13 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 21–392（372 aa） 片段：UNP P0A940 residues 175-424,UNP P77774 residues 21-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；The BamA-BamB chimera protein was crystallized at 16 degC by sitting drop vapor diffusion method. Initial crystallizing conditions were refined in a hanging drop in the following solution: 1.4M Ammonium sulfate, 9% 2-propanol, and 0.1M Sodium acetate pH 5.5. We used 1.5 uL of the 20mg/ml protein mixed with 1.5 uL mother liquor in a reservoir filled with 500 uL precipitant solution
分辨率 3.10 Å R-free 0.281
4XGA Crystal structure of BamB and BamA P3-5 complex from E.coli 提交 2014-12-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 20–392（373 aa）
未记录 CA CALCIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；293 K；1% w/v Tryptone, 20% w/v Polyethylene glycol 3350, 0.05M HEPES sodium pH 7.0
分辨率 2.15 Å R-free 0.231
5AYW Structure of a membrane complex 提交 2015-09-14 构建体不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–392（373 aa） 片段：UNP residues 20-392
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；289 K；Tris-HCl, NaCl, PEG 400
分辨率 3.56 Å R-free 0.314
5D0O BamABCDE complex, outer membrane beta barrel assembly machinery entire complex 提交 2015-08-03 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1 M HEPES, pH7.5, 30% PEG600, CYMAL-4
分辨率 2.90 Å R-free 0.304
5LJO E. coli BAM complex (BamABCDE) by cryoEM 提交 2016-07-19 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 22–392（371 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Double blot. 3 ul sampel applied and blotted by hand, then additional 3 ul sample applied, blotted, and plunge frozen
分辨率 4.90 Å
6LYQ Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.19 Å R-free 0.293
6LYR Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.28 Å R-free 0.280
6LYS Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；289 K；27-30% PEG 400, 100mM NaCl
分辨率 3.05 Å R-free 0.284
6LYU Structure of the BAM complex 提交 2020-02-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
6V05 Cryo-EM structure of a substrate-engaged Bam complex 提交 2019-11-18 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7BNQ Lateral-closed conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-22 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7NBX Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) by cryoEM 提交 2021-01-28 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NCS Lateral-open conformation of the lid-locked BAM complex (BamA E435C S665C, BamBDCE) bound by a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.10 Å
7ND0 lateral-open conformation of the wild-type BAM complex (BamABCDE) bound to a bactericidal Fab fragment 提交 2021-01-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
7NRI Structure of the darobactin-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2021-03-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；4microL of sample applied
分辨率 3.03 Å
7R1W E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to dynobactin A 提交 2022-02-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.05% (w/v) n-dodecyl Beta-D-maltopyranoside (DDM)
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7TTC BamABCDE bound to substrate EspP 提交 2022-02-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 K33 2,3-dideoxy-6-O-[2-deoxy-4-O-phosphono-2-(tetradecanoylamino)-alpha-L-gulopyranosyl]-1-O-phosphono-beta-D-threo-hexopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7YE4 BAM-EspP complex structure with BamA-G431C and G781C/EspP-N1293C and A1043C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7YE6 BAM-EspP complex structure with BamA-N427C/EspP-R1297C mutations in nanodisc 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8；20 mM Tris-HCl, pH 7.8, 150 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8ADG Cryo-EM structure of Darobactin 22 bound BAM complex 提交 2022-07-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
8ADI Cryo-EM structure of Darobactin 9 bound BAM complex 提交 2022-07-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8BNZ BAM-EspP complex structure with BamA-G431C/EspP-N1293C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BO2 BAM-EspP complex structure with BamA-S425C/EspP-S1299C mutations in nanodisc 提交 2022-11-14 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8BVQ E. coli BAM complex (BamABCDE) bound to darobactin B 提交 2022-12-05 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8BWC E. coli BAM complex (BamABCDE) wild-type 提交 2022-12-06 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PZ1 Wait Complex: Lateral open BAM bound Compact SurA 提交 2023-07-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8PZ2 Wait Complex: Lateral open BAM bound Extended SurA 提交 2023-07-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8PZU Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Compact SurA 提交 2023-07-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PZV Wait Complex: BAM bound Darobactin-B and Extended SurA 提交 2023-07-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8Q0G Release Complex: BAM bound EspP and Compact SurA 提交 2023-07-28 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
8QN4 Structure of the BAM-EspP complex in an open EspP intermediate state 提交 2023-09-25 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
8QP5 Release Complex: BAM bound EspP (SurA released) 提交 2023-09-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
突变：S425C 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8QPU Release Complex: BAM bound EspP and Extended SurA 提交 2023-10-03 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.20 Å
8QPV Handover Complex: BAM bound OmpX and extended SurA 提交 2023-10-03 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QPW Arrival Complex: Lateral open BAM bound extended SurA plus OmpX 提交 2023-10-03 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8SPR The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta1-12) complex 提交 2023-05-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–392（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SQA The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex 提交 2023-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–392（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8SQB The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta7-12) complex 提交 2023-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 21–392（372 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9CNX CryoEM structure of BAM in complex with the PTB1 closed-state inhibitor (in DDM detergent) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9CNY CryoEM structure of the APO-BAM complex in SMA nanodisc 提交 2024-07-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9CNZ Structure of BAM complexed with PTB2 ligand in detergent 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CO0 CryoEM structure of BAM in complex with the PTB2 open-state inhibitor (in SMA nanodisc) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9H84 BAM-hinge (LVPR) 提交 2024-10-28 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 22–392（371 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9H85 BAM-hinge (GSGS) 提交 2024-10-28 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9H89 BAM-hinge (LVPR) suppressor (T434A) 提交 2024-10-28 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9HE1 Structure of the Xenorceptide A2-bound E. coli BAM complex (BamABCDE) 提交 2024-11-13 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7；25 mM NaPi, 100 mM NaCl, pH 7.0
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3.5uL sample, blot time 3sec, Blotforce 1, Blot total 1,
分辨率 3.00 Å
9HG5 BAM-SurA complex in the swing-in state with full length BamC resolved 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
9HG6 BAM-SurA complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.73 Å
9HG7 BAM-SurA complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.83 Å
9HG8 BAM-SurA complex in the swing-out state with BamC resolved 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9HG9 BAM-SurA-darobactin complex in the swing-in state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.88 Å
9HGA BAM-SurA-darobactin complex in the swing-out state 提交 2024-11-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris-HCl, 150mM NaCl, 0.05% DDM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
9MGE beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an early state of substrate assembly 提交 2024-12-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9MGF beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a middle state of substrate assembly 提交 2024-12-10 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 B 20–392（373 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9MGG beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in a late state of substrate assembly 提交 2024-12-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9P1U beta-barrel assembly machine from Escherichia coli in an late state of LptD assembly 提交 2025-06-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 B 1–392（392 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å

共 63 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 BAMB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–392； UniProt 1–392

Outer membrane protein assembly factor BamC

Escherichia coli

UniProt W8SZY2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 C； UniProt 1–344 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （P0A940） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CNW Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
6V05 Cryo-EM structure of a substrate-engaged Bam complex 提交 2019-11-18 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7RI4 Structure of a BAM/EspP(beta9-12) hybrid-barrel intermediate 提交 2021-07-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7RI5 Structure of a BAM in MSP1E3D1 nanodiscs at 4 Angstrom resolution 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7RI6 Structure of BAM in MSP1E3D1 nanodiscs prepared from E. coli outer membranes 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
7RI7 The structure of BAM in MSP1D1 nanodiscs 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
7RI8 The structure of BAM in MSP2N2 nanodiscs 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.50 Å
7RI9 The structure of BAM in MSP1E3D1 at 6.9 Angstrom resolution 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
7RJ5 The structure of BAM in complex with EspP at 7 Angstrom resolution 提交 2021-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
7TSZ BamABCDE bound to substrate EspP class 1 提交 2022-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7TT0 BamABCDE bound to substrate EspP class 2 提交 2022-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT1 BamABCDE bound to substrate EspP class 4 提交 2022-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT2 BamABCDE bound to substrate EspP class 3 提交 2022-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7TT3 BamABCDE bound to substrate EspP class 5 提交 2022-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT4 BamABCDE bound to substrate EspP class 6 提交 2022-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7TT5 BamABCDE bound to substrate EspP in the open-sheet EspP state 提交 2022-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT6 BamABCDE bound to substrate EspP in the intermediate-open EspP state 提交 2022-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7TT7 BamABCDE bound to substrate EspP in the barrelized EspP/continuous open BamA state 提交 2022-01-31 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7TTC BamABCDE bound to substrate EspP 提交 2022-02-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 25–344（320 aa）
未记录 K33 2,3-dideoxy-6-O-[2-deoxy-4-O-phosphono-2-(tetradecanoylamino)-alpha-L-gulopyranosyl]-1-O-phosphono-beta-D-threo-hexopyranose × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9CNX CryoEM structure of BAM in complex with the PTB1 closed-state inhibitor (in DDM detergent) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9CNY CryoEM structure of the APO-BAM complex in SMA nanodisc 提交 2024-07-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9CNZ Structure of BAM complexed with PTB2 ligand in detergent 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CO0 CryoEM structure of BAM in complex with the PTB2 open-state inhibitor (in SMA nanodisc) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 C 1–344（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å

共 22 个其他 PDB 条目、22 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 W8SZY2_ECOLX
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–344； UniProt 1–344

Outer membrane protein assembly factor BamD

Escherichia coli

UniProt C3SYV7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 D； UniProt 1–245 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （P0A940） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （W8SZY2） Outer membrane protein assembly factor BamE × 1 （A0A366UU94） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CNW Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
7RI4 Structure of a BAM/EspP(beta9-12) hybrid-barrel intermediate 提交 2021-07-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7RI5 Structure of a BAM in MSP1E3D1 nanodiscs at 4 Angstrom resolution 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7RI6 Structure of BAM in MSP1E3D1 nanodiscs prepared from E. coli outer membranes 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.90 Å
7RI7 The structure of BAM in MSP1D1 nanodiscs 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.00 Å
7RI8 The structure of BAM in MSP2N2 nanodiscs 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.50 Å
7RI9 The structure of BAM in MSP1E3D1 at 6.9 Angstrom resolution 提交 2021-07-19 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
7RJ5 The structure of BAM in complex with EspP at 7 Angstrom resolution 提交 2021-07-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.00 Å
8BWC E. coli BAM complex (BamABCDE) wild-type 提交 2022-12-06 构建体不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 20–245（226 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8SPR The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta1-12) complex 提交 2023-05-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 21–245（225 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SQA The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex 提交 2023-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 21–245（225 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8SQB The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta7-12) complex 提交 2023-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 21–245（225 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9CNX CryoEM structure of BAM in complex with the PTB1 closed-state inhibitor (in DDM detergent) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9CNY CryoEM structure of the APO-BAM complex in SMA nanodisc 提交 2024-07-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9CNZ Structure of BAM complexed with PTB2 ligand in detergent 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CO0 CryoEM structure of BAM in complex with the PTB2 open-state inhibitor (in SMA nanodisc) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 D 1–245（245 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å

共 15 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 C3SYV7_ECOLX
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–245； UniProt 1–245

Outer membrane protein assembly factor BamE

Escherichia coli

UniProt A0A366UU94

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白拷贝数一致 链 E； UniProt 1–113 未记录 Outer membrane protein assembly factor BamA × 1 （P0A940） Outer membrane protein assembly factor BamB × 1 （P77774） Outer membrane protein assembly factor BamC × 1 （W8SZY2） Outer membrane protein assembly factor BamD × 1 （C3SYV7） ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9CNW Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
8SPR The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta1-12) complex 提交 2023-05-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 21–113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8SQA The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta8-12) complex 提交 2023-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 21–113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8SQB The cryo-EM structure of the EcBAM/EspP(beta7-12) complex 提交 2023-05-04 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 21–113（93 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9CNX CryoEM structure of BAM in complex with the PTB1 closed-state inhibitor (in DDM detergent) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.55 Å
9CNY CryoEM structure of the APO-BAM complex in SMA nanodisc 提交 2024-07-15 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9CNZ Structure of BAM complexed with PTB2 ligand in detergent 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9CO0 CryoEM structure of BAM in complex with the PTB2 open-state inhibitor (in SMA nanodisc) 提交 2024-07-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 E 1–113（113 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å

共 7 个其他 PDB 条目、7 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0A366UU94_ECOLX
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–113； UniProt 1–113

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9cnw

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9cnw
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9cnw
沉积日期 deposition_date2024-07-15
最后修订 last_revision2024-12-25
结构标题 titleCryoEM structure of the APO-BAM complex in DDM detergent
关键词 keywordsmembrane protein, protein structure; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier45.45 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron44.96 Å
零角强度 I(0) i0414747000.00
分子量 molecular_weight164970.0 kDa
排除体积 excluded_volume205290 ų
包络体积 envelope_volume305520 ų
水化壳体积 shell_volume57626 ų
包络直径 envelope_diameter141.1 Å
壳层 Rg shell_rg48.97 Å
包络 Rg envelope_rg43.25 Å
形状 Rg shape_rg44.96 Å
总 Rg total_rg45.16 Å
总原子数 total_atoms11647
残基数 n_residues1493
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax142.0 Å
Rg (实空间) rg_real45.28 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.27 Å
I(0) (实空间) i0_real4.1470e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error7.6470e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal45.45 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal414800000.0000
解质量估计 total_estimate0.8958
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary69.0 Å
偏度 Skewness skewness0.047
峰度 Kurtosis kurtosis-0.728
角度范围 angular_range— – 0.1750 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha35080000.0000
实空间数据点数 n_real_points36
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.942; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.996; Smooth: 0.819
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)