|
1F1W
SRC SH2 THREF1TRP MUTANT COMPLEXED WITH THE PHOSPHOPEPTIDE S(PTR)VNVQN
提交 2000-05-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
144–246(103 aa)
片段:SRC SH2 DOMAIN
|
突变:T215W
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;1.2 M Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.257
|
|
1F1W
SRC SH2 THREF1TRP MUTANT COMPLEXED WITH THE PHOSPHOPEPTIDE S(PTR)VNVQN
提交 2000-05-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
144–246(103 aa)
片段:SRC SH2 DOMAIN
|
突变:T215W
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;1.2 M Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.257
|
|
1F1W
SRC SH2 THREF1TRP MUTANT COMPLEXED WITH THE PHOSPHOPEPTIDE S(PTR)VNVQN
提交 2000-05-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
144–246(103 aa)
片段:SRC SH2 DOMAIN
|
突变:T215W
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.6;298 K;1.2 M Na Citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.257
|
|
1F2F
SRC SH2 THREF1TRP MUTANT
提交 2000-05-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
144–246(103 aa)
片段:SH2 DOMAIN
|
突变:T215W
|
PO4 PHOSPHATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;295 K;PEG 4000, sodium acetate,sodium cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.240
|
|
1P13
Crystal Structure of the Src SH2 Domain Complexed with Peptide (SDpYANFK)
提交 2003-04-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
144–245(102 aa)
片段:SH2 DOMAIN
|
未记录
|
CAC CACODYLATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;PEG 8000, sodium acetate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.252
|
|
1P13
Crystal Structure of the Src SH2 Domain Complexed with Peptide (SDpYANFK)
提交 2003-04-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
144–245(102 aa)
片段:SH2 DOMAIN
|
未记录
|
CAC CACODYLATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;277 K;PEG 8000, sodium acetate, cacodylate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
|
分辨率 1.63 Å
R-free 0.252
|
|
1PRL
TWO BINDING ORIENTATIONS FOR PEPTIDES TO SRC SH3 DOMAIN: DEVELOPMENT OF A GENERAL MODEL FOR SH3-LIGAND INTERACTIONS
提交 1994-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
76–139(64 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
|
|
1PRM
TWO BINDING ORIENTATIONS FOR PEPTIDES TO SRC SH3 DOMAIN: DEVELOPMENT OF A GENERAL MODEL FOR SH3-LIGAND INTERACTIONS
提交 1994-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
76–139(64 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
|
|
1RLP
TWO BINDING ORIENTATIONS FOR PEPTIDES TO SRC SH3 DOMAIN: DEVELOPMENT OF A GENERAL MODEL FOR SH3-LIGAND INTERACTIONS
提交 1994-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
76–139(64 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
|
|
1RLQ
TWO BINDING ORIENTATIONS FOR PEPTIDES TO SRC SH3 DOMAIN: DEVELOPMENT OF A GENERAL MODEL FOR SH3-LIGAND INTERACTIONS
提交 1994-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
76–139(64 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
|
|
1SRL
1H AND 15N ASSIGNMENTS AND SECONDARY STRUCTURE OF THE SRC SH3 DOMAIN
提交 1994-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
76–139(64 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
|
|
1SRM
1H AND 15N ASSIGNMENTS AND SECONDARY STRUCTURE OF THE SRC SH3 DOMAIN
提交 1994-03-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
76–139(64 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
SOLUTION NMR
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率未提供
|
|
2HWO
Crystal structure of Src kinase domain in complex with covalent inhibitor
提交 2006-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
250–532(283 aa)
|
未记录
|
RBS N-(4-PHENYLAMINO-QUINAZOLIN-6-YL)-ACRYLAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.292
|
|
2HWO
Crystal structure of Src kinase domain in complex with covalent inhibitor
提交 2006-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
250–532(283 aa)
|
未记录
|
RBS N-(4-PHENYLAMINO-QUINAZOLIN-6-YL)-ACRYLAMIDE × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.292
|
|
2HWP
Crystal structure of Src kinase domain in complex with covalent inhibitor PD168393
提交 2006-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
250–532(283 aa)
|
未记录
|
DJK N-[4-(3-BROMO-PHENYLAMINO)-QUINAZOLIN-6-YL]-ACRYLAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;323 K;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 323K
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.276
|
|
2HWP
Crystal structure of Src kinase domain in complex with covalent inhibitor PD168393
提交 2006-08-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
250–532(283 aa)
|
未记录
|
DJK N-[4-(3-BROMO-PHENYLAMINO)-QUINAZOLIN-6-YL]-ACRYLAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;323 K;VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 323K
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.276
|
|
2OIQ
Crystal Structure of chicken c-Src kinase domain in complex with the cancer drug imatinib.
提交 2007-01-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
250–532(283 aa)
片段:KINASE DOMAIN
|
未记录
|
STI 4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YLMETHYL)-N-[4-METHYL-3-(4-PYRIDIN-3-YL-PYRIMIDIN-2-YLAMINO)-PHENYL]-BENZAMIDE × 1
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;298 K;0.1M MES, 4% glycerol, 12% PEG 4000, 50 mM sodium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.263
|
|
2OIQ
Crystal Structure of chicken c-Src kinase domain in complex with the cancer drug imatinib.
提交 2007-01-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
250–532(283 aa)
片段:KINASE DOMAIN
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION;pH 6.5;298 K;0.1M MES, 4% glycerol, 12% PEG 4000, 50 mM sodium acetate, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 298K
|
分辨率 2.07 Å
R-free 0.263
|
|
2PTK
CHICKEN SRC TYROSINE KINASE
提交 1997-06-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
80–532(453 aa)
片段:SH3/SH2/KINASE/C-TERMINAL TAIL
|
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 8.2;16% PEG-2000 10% PEG-400 100MM TRIS PH=8.2 300MM NACL 1MM EDTA 1MM DTT 1MM AZIDE
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.292
|
|
2QI8
Crystal structure of drug resistant SRC kinase domain
提交 2007-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;19% Ethylene glycol, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.280
|
|
2QI8
Crystal structure of drug resistant SRC kinase domain
提交 2007-07-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;19% Ethylene glycol, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.32 Å
R-free 0.280
|
|
2QLQ
Crystal structure of SRC kinase domain with covalent inhibitor RL3
提交 2007-07-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase domain
|
突变:S345C
|
SR2 (2E)-N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)but-2-enamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;16% Ethylene glycol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.33 Å
R-free 0.267
|
|
2QLQ
Crystal structure of SRC kinase domain with covalent inhibitor RL3
提交 2007-07-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase domain
|
突变:S345C
|
SR2 (2E)-N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)but-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;16% Ethylene glycol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.33 Å
R-free 0.267
|
|
2QQ7
Crystal structure of drug resistant SRC kinase domain with irreversible inhibitor
提交 2007-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase domain
|
突变:T338M, S345C
|
SR2 (2E)-N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)but-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;16% ethylene glycol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.266
|
|
2QQ7
Crystal structure of drug resistant SRC kinase domain with irreversible inhibitor
提交 2007-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase domain
|
突变:T338M, S345C
|
SR2 (2E)-N-{4-[(3-bromophenyl)amino]quinazolin-6-yl}-4-(dimethylamino)but-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;16% ethylene glycol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.38 Å
R-free 0.266
|
|
3D7T
Structural basis for the recognition of c-Src by its inactivator Csk
提交 2008-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
258–533(276 aa)
片段:c-Src kinase domain
|
未记录
|
STU STAUROSPORINE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.278
|
|
3D7T
Structural basis for the recognition of c-Src by its inactivator Csk
提交 2008-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
258–533(276 aa)
片段:c-Src kinase domain
|
未记录
|
STU STAUROSPORINE × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP
|
分辨率 2.90 Å
R-free 0.278
|
|
3D7U
Structural basis for the recognition of c-Src by its inactivator Csk
提交 2008-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
260–523(264 aa)
片段:c-Src kinase domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 4.11 Å
R-free 0.302
|
|
3D7U
Structural basis for the recognition of c-Src by its inactivator Csk
提交 2008-05-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 D
260–523(264 aa)
片段:c-Src kinase domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
|
分辨率 4.11 Å
R-free 0.302
|
|
3DQW
c-Src kinase domain Thr338Ile mutant in complex with ATPgS
提交 2008-07-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:chicken c-Src kinase domain 251-533
|
突变:T338I
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10% PEG 4000, 50 mM Ammonium acetate, 100 mM Bis-Tris pH 5.5, 5% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.245
|
|
3DQW
c-Src kinase domain Thr338Ile mutant in complex with ATPgS
提交 2008-07-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:chicken c-Src kinase domain 251-533
|
突变:T338I
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10% PEG 4000, 50 mM Ammonium acetate, 100 mM Bis-Tris pH 5.5, 5% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.245
|
|
3DQW
c-Src kinase domain Thr338Ile mutant in complex with ATPgS
提交 2008-07-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
251–533(283 aa)
片段:chicken c-Src kinase domain 251-533
|
突变:T338I
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10% PEG 4000, 50 mM Ammonium acetate, 100 mM Bis-Tris pH 5.5, 5% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.245
|
|
3DQW
c-Src kinase domain Thr338Ile mutant in complex with ATPgS
提交 2008-07-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
251–533(283 aa)
片段:chicken c-Src kinase domain 251-533
|
突变:T338I
非标准单体:是(mmCIF未提供具体位点)
|
AGS PHOSPHOTHIOPHOSPHORIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10% PEG 4000, 50 mM Ammonium acetate, 100 mM Bis-Tris pH 5.5, 5% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.02 Å
R-free 0.245
|
|
3DQX
chicken c-Src kinase domain in complex with ATPgS
提交 2008-07-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:chicken c-Src kinase domain 251-533
|
未记录
|
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10% PEG 4000, 50 mM Ammonium acetate, 100 mM Bis-Tris pH 5.5, 5% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.241
|
|
3DQX
chicken c-Src kinase domain in complex with ATPgS
提交 2008-07-09
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:chicken c-Src kinase domain 251-533
|
未记录
|
AMP ADENOSINE MONOPHOSPHATE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;10% PEG 4000, 50 mM Ammonium acetate, 100 mM Bis-Tris pH 5.5, 5% Glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.241
|
|
3EL7
Crystal structure of c-Src in complex with pyrazolopyrimidine 3
提交 2008-09-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase domain: UNP residues 251-533
|
未记录
|
PD3 1-{3-[(4-amino-1-cyclopentyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl)methyl]phenyl}-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.8;287 K;100mM NaCl, 10mM Tris-HCl, 5% Glycerol, 2mM DTT, 4% DMSO, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.288
|
|
3EL8
Crystal structure of c-Src in complex with pyrazolopyrimidine 5
提交 2008-09-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase domain: UNP residues 251-533
|
未记录
|
PD5 1-{4-[4-amino-1-(1-methylethyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]phenyl}-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.8;287 K;100 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl, 5% Glycerol, 2 mM DTT, 4% DMSO, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.262
|
|
3EL8
Crystal structure of c-Src in complex with pyrazolopyrimidine 5
提交 2008-09-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase domain: UNP residues 251-533
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.8;287 K;100 mM NaCl, 10 mM Tris-HCl, 5% Glycerol, 2 mM DTT, 4% DMSO, pH 7.8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.262
|
|
3EN4
Targeted polypharmacology: crystal structure of the c-Src kinase domain in complex with PP121, a multitargeted kinase inhibitor
提交 2008-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
未记录
|
KS1 1-cyclopentyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;14 mg/mL kinase, 50 mM Tris-HCl, 100 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol mixed 1:1 with 20% (w/v) glycerol precipitant well solution, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.55 Å
R-free 0.255
|
|
3EN4
Targeted polypharmacology: crystal structure of the c-Src kinase domain in complex with PP121, a multitargeted kinase inhibitor
提交 2008-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
未记录
|
KS1 1-cyclopentyl-3-(1H-pyrrolo[2,3-b]pyridin-5-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;14 mg/mL kinase, 50 mM Tris-HCl, 100 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol mixed 1:1 with 20% (w/v) glycerol precipitant well solution, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.55 Å
R-free 0.255
|
|
3EN5
Targeted polypharmacology: crystal structure of the c-Src kinase domain in complex with PP494, a multitargeted kinase inhibitor
提交 2008-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
未记录
|
KS4 1-cyclobutyl-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;26 mg/mL kinase, 50 mM Tris-HCl, 100 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol mixed 1:1 with 22% (w/v) glycerol precipitant well solution, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.66 Å
R-free 0.248
|
|
3EN5
Targeted polypharmacology: crystal structure of the c-Src kinase domain in complex with PP494, a multitargeted kinase inhibitor
提交 2008-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
未记录
|
KS4 1-cyclobutyl-3-(3,4-dimethoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;26 mg/mL kinase, 50 mM Tris-HCl, 100 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol mixed 1:1 with 22% (w/v) glycerol precipitant well solution, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.66 Å
R-free 0.248
|
|
3EN6
Targeted polypharmacology: crystal structure of the c-Src kinase domain in complex with PP102, a multitargeted kinase inhibitor
提交 2008-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;14 mg/mL kinase, 50 mM Tris-HCl, 100 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol mixed 1:1 with 20% (w/v) glycerol precipitant well solution, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.259
|
|
3EN6
Targeted polypharmacology: crystal structure of the c-Src kinase domain in complex with PP102, a multitargeted kinase inhibitor
提交 2008-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
未记录
|
KS5 1-(1-methylethyl)-3-quinolin-6-yl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;14 mg/mL kinase, 50 mM Tris-HCl, 100 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol mixed 1:1 with 20% (w/v) glycerol precipitant well solution, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.39 Å
R-free 0.259
|
|
3EN7
Targeted polypharmacology: crystal structure of the c-Src kinase domain in complex with S1, a multitargeted kinase inhibitor
提交 2008-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
未记录
|
ABJ 3-[4-AMINO-1-(1-METHYLETHYL)-1H-PYRAZOLO[3,4-D]PYRIMIDIN-3-YL]PHENOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;16 mg/mL kinase, 50 mM Tris-HCl, 100 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol mixed 1:1 with 18% (w/v) glycerol precipitant well solution, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.81 Å
R-free 0.257
|
|
3EN7
Targeted polypharmacology: crystal structure of the c-Src kinase domain in complex with S1, a multitargeted kinase inhibitor
提交 2008-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;16 mg/mL kinase, 50 mM Tris-HCl, 100 mM NaCl, 5% (v/v) glycerol mixed 1:1 with 18% (w/v) glycerol precipitant well solution, pH 8.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 2.81 Å
R-free 0.257
|
|
3F3T
Kinase domain of cSrc in complex with inhibitor RL38 (Type III)
提交 2008-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
1AU 1-[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]-3-naphthalen-1-ylurea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;10% PEG 4000, 0.05M sodium acetate, 4% glycerol, 0.1M MES , pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.295
|
|
3F3T
Kinase domain of cSrc in complex with inhibitor RL38 (Type III)
提交 2008-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;10% PEG 4000, 0.05M sodium acetate, 4% glycerol, 0.1M MES , pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.295
|
|
3F3U
Kinase domain of cSrc in complex with inhibitor RL37 (Type III)
提交 2008-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
1AW 1-[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]-3-phenylurea × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;10% PEG 4000, 0.05M sodium acetate, 4% glycerol, 0.1M MES , pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.281
|
|
3F3U
Kinase domain of cSrc in complex with inhibitor RL37 (Type III)
提交 2008-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
1AW 1-[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]-3-phenylurea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.9;293 K;10% PEG 4000, 0.05M sodium acetate, 4% glycerol, 0.1M MES , pH 6.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.281
|
|
3F3V
Kinase domain of cSrc in complex with inhibitor RL45 (Type II)
提交 2008-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
1BU 1-{4-[(6-aminoquinazolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(3-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 85 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.284
|
|
3F3V
Kinase domain of cSrc in complex with inhibitor RL45 (Type II)
提交 2008-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
1BU 1-{4-[(6-aminoquinazolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(3-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 85 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.284
|
|
3F3W
Drug resistant cSrc kinase domain in complex with inhibitor RL45 (Type II)
提交 2008-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Kinase domain, UNP residues 251-533
|
突变:T338M, S345C
|
1BU 1-{4-[(6-aminoquinazolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(3-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 85mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.277
|
|
3F3W
Drug resistant cSrc kinase domain in complex with inhibitor RL45 (Type II)
提交 2008-10-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Kinase domain, UNP residues 251-533
|
突变:T338M, S345C
|
1BU 1-{4-[(6-aminoquinazolin-4-yl)amino]phenyl}-3-[3-tert-butyl-1-(3-methylphenyl)-1H-pyrazol-5-yl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 85mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.277
|
|
3F6X
c-Src kinase domain in complex with small molecule inhibitor
提交 2008-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
IHH [4-({4-[(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]quinazolin-2-yl}amino)phenyl]acetonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M MES pH 6.5, 10 % glycerol, 25 mM ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.266
|
|
3F6X
c-Src kinase domain in complex with small molecule inhibitor
提交 2008-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
IHH [4-({4-[(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]quinazolin-2-yl}amino)phenyl]acetonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M MES pH 6.5, 10 % glycerol, 25 mM ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.266
|
|
3F6X
c-Src kinase domain in complex with small molecule inhibitor
提交 2008-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
IHH [4-({4-[(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]quinazolin-2-yl}amino)phenyl]acetonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M MES pH 6.5, 10 % glycerol, 25 mM ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.266
|
|
3F6X
c-Src kinase domain in complex with small molecule inhibitor
提交 2008-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
IHH [4-({4-[(5-cyclopropyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]quinazolin-2-yl}amino)phenyl]acetonitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M MES pH 6.5, 10 % glycerol, 25 mM ammonium acetate, 50 mM sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.266
|
|
3FJ5
Crystal structure of the c-src-SH3 domain
提交 2008-12-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–140(56 aa)
片段:SH3 DOMAIN, UNP residues 85-140
链 B
85–140(56 aa)
片段:SH3 DOMAIN, UNP residues 85-140
|
未记录
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
SO4 SULFATE ION × 1
ACT ACETATE ION × 3
GOL GLYCEROL × 1
PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;288 K;1.7M Ammonium sulphate, 5% PEG300, 10% glycerol, 0.1M sodium acetate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.222
|
|
3G5D
Kinase domain of cSrc in complex with Dasatinib
提交 2009-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
1N1 N-(2-CHLORO-6-METHYLPHENYL)-2-({6-[4-(2-HYDROXYETHYL)PIPERAZIN-1-YL]-2-METHYLPYRIMIDIN-4-YL}AMINO)-1,3-THIAZOLE-5-CARBOXAMIDE × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 85 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.257
|
|
3G5D
Kinase domain of cSrc in complex with Dasatinib
提交 2009-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
1N1 N-(2-CHLORO-6-METHYLPHENYL)-2-({6-[4-(2-HYDROXYETHYL)PIPERAZIN-1-YL]-2-METHYLPYRIMIDIN-4-YL}AMINO)-1,3-THIAZOLE-5-CARBOXAMIDE × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 85 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.257
|
|
3G6G
Equally potent inhibition of c-Src and Abl by compounds that recognize inactive kinase conformations
提交 2009-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录
|
G6G N-{3-[(3-{4-[(4-methoxyphenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}pyridin-2-yl)amino]-4-methylphenyl}-4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]benzamide × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;293 K;100 mM MES pH 6.3, 5 % PEG 3350, 10 % glycerol, 30 mM sodium acetate, 3 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.277
|
|
3G6G
Equally potent inhibition of c-Src and Abl by compounds that recognize inactive kinase conformations
提交 2009-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase domain
|
未记录
|
G6G N-{3-[(3-{4-[(4-methoxyphenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}pyridin-2-yl)amino]-4-methylphenyl}-4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]benzamide × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.3;293 K;100 mM MES pH 6.3, 5 % PEG 3350, 10 % glycerol, 30 mM sodium acetate, 3 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.31 Å
R-free 0.277
|
|
3G6H
Src Thr338Ile inhibited in the DFG-Asp-Out conformation
提交 2009-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase Domain
|
突变:T338I
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES pH 6.0, 8 % PEG 3350, 3 % Glycerol, 45 mM sodium acetate, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.283
|
|
3G6H
Src Thr338Ile inhibited in the DFG-Asp-Out conformation
提交 2009-02-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Protein kinase Domain
|
突变:T338I
|
G6H N-{4-methyl-3-[(3-{4-[(3,4,5-trimethoxyphenyl)amino]-1,3,5-triazin-2-yl}pyridin-2-yl)amino]phenyl}-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;293 K;100 mM MES pH 6.0, 8 % PEG 3350, 3 % Glycerol, 45 mM sodium acetate, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.35 Å
R-free 0.283
|
|
3GEQ
Structural basis for the chemical rescue of Src kinase activity
提交 2009-02-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain (UNP residues 251-533)
|
突变:R388A
|
PP2 1-TERT-BUTYL-3-(4-CHLORO-PHENYL)-1H-PYRAZOLO[3,4-D]PYRIMIDIN-4-YLAMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;50 mM Ammoniumacetate, 100 mM Bis-Tris pH 5.5, 1 mM DTT, 50 mM imidazole, 0.5 mM PP2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.273
|
|
3GEQ
Structural basis for the chemical rescue of Src kinase activity
提交 2009-02-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain (UNP residues 251-533)
|
突变:R388A
|
PP2 1-TERT-BUTYL-3-(4-CHLORO-PHENYL)-1H-PYRAZOLO[3,4-D]PYRIMIDIN-4-YLAMINE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;298 K;50 mM Ammoniumacetate, 100 mM Bis-Tris pH 5.5, 1 mM DTT, 50 mM imidazole, 0.5 mM PP2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.273
|
|
3LOK
Drug resistant cSrc kinase domain in complex with covalent inhibitor PD168393
提交 2010-02-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Kinase domain
|
突变:T338M, S345C
|
DJK N-[4-(3-BROMO-PHENYLAMINO)-QUINAZOLIN-6-YL]-ACRYLAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;18% ethylene glycol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.286
|
|
3LOK
Drug resistant cSrc kinase domain in complex with covalent inhibitor PD168393
提交 2010-02-04
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Kinase domain
|
突变:T338M, S345C
|
DJK N-[4-(3-BROMO-PHENYLAMINO)-QUINAZOLIN-6-YL]-ACRYLAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;293 K;18% ethylene glycol, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.48 Å
R-free 0.286
|
|
3OEZ
crystal structure of the L317I mutant of the chicken c-Src tyrosine kinase domain complexed with imatinib
提交 2010-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
突变:L317I
|
STI 4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YLMETHYL)-N-[4-METHYL-3-(4-PYRIDIN-3-YL-PYRIMIDIN-2-YLAMINO)-PHENYL]-BENZAMIDE × 1
ACT ACETATE ION × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;100 mM MES, 200 mM sodium acetate, 4% glycerol, 12% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.240
|
|
3OEZ
crystal structure of the L317I mutant of the chicken c-Src tyrosine kinase domain complexed with imatinib
提交 2010-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
突变:L317I
|
STI 4-(4-METHYL-PIPERAZIN-1-YLMETHYL)-N-[4-METHYL-3-(4-PYRIDIN-3-YL-PYRIMIDIN-2-YLAMINO)-PHENYL]-BENZAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;100 mM MES, 200 mM sodium acetate, 4% glycerol, 12% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.40 Å
R-free 0.240
|
|
3OF0
crystal structure of the L317I mutant of the chicken c-Src tyrosine kinase domain
提交 2010-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
突变:L317I
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;100 mM MES, 200 mM sodium acetate, 4% glycerol, 12% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.262
|
|
3OF0
crystal structure of the L317I mutant of the chicken c-Src tyrosine kinase domain
提交 2010-08-13
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain
|
突变:L317I
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;291 K;100 mM MES, 200 mM sodium acetate, 4% glycerol, 12% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.262
|
|
3QLF
Crystal structure of the L317I mutant of the C-src tyrosine kinase domain complexed with pyrazolopyrimidine 5
提交 2011-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:L317I
|
PD5 1-{4-[4-amino-1-(1-methylethyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]phenyl}-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;287 K;7mg/ml cSRcL317I, 0.5mM pyrazolopyrimidine 5, 0.1M MES, 0.2M sodium acetate, 4% glycerol, 12% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.75 Å
R-free 0.232
|
|
3QLF
Crystal structure of the L317I mutant of the C-src tyrosine kinase domain complexed with pyrazolopyrimidine 5
提交 2011-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:L317I
|
PD5 1-{4-[4-amino-1-(1-methylethyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]phenyl}-3-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;287 K;7mg/ml cSRcL317I, 0.5mM pyrazolopyrimidine 5, 0.1M MES, 0.2M sodium acetate, 4% glycerol, 12% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.75 Å
R-free 0.232
|
|
3QLG
Crystal structure of the L317I mutant of the C-src tyrosine kinase domain complexed with dasatinib
提交 2011-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:L317I
|
1N1 N-(2-CHLORO-6-METHYLPHENYL)-2-({6-[4-(2-HYDROXYETHYL)PIPERAZIN-1-YL]-2-METHYLPYRIMIDIN-4-YL}AMINO)-1,3-THIAZOLE-5-CARBOXAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;287 K;7mg/ml protein, 0.25mM dasatinib, 0.1M MES, 0.2M sodium acetate, 4% Glycerol, 12% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.75 Å
R-free 0.269
|
|
3QLG
Crystal structure of the L317I mutant of the C-src tyrosine kinase domain complexed with dasatinib
提交 2011-02-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:L317I
|
1N1 N-(2-CHLORO-6-METHYLPHENYL)-2-({6-[4-(2-HYDROXYETHYL)PIPERAZIN-1-YL]-2-METHYLPYRIMIDIN-4-YL}AMINO)-1,3-THIAZOLE-5-CARBOXAMIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;287 K;7mg/ml protein, 0.25mM dasatinib, 0.1M MES, 0.2M sodium acetate, 4% Glycerol, 12% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.75 Å
R-free 0.269
|
|
3SVV
Crystal Structure of T338C c-Src covalently bound to vinylsulfonamide-pyrazolopyrimidine 9
提交 2011-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain, UNP residues 251-533
|
突变:T338C
|
VSP N-(3-{[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]methyl}phenyl)ethanesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100mM MES, 50mM NaOAc, 4-8% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.215
|
|
3SVV
Crystal Structure of T338C c-Src covalently bound to vinylsulfonamide-pyrazolopyrimidine 9
提交 2011-07-12
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain, UNP residues 251-533
|
突变:T338C
|
VSP N-(3-{[4-amino-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-3-yl]methyl}phenyl)ethanesulfonamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;100mM MES, 50mM NaOAc, 4-8% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.215
|
|
3TZ7
Kinase domain of cSrc in complex with RL103
提交 2011-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
AQB N-(4-{[4-({[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]carbamoyl}amino)phenyl]amino}quinazolin-6-yl)-4-(dimethylamino)butanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å
R-free 0.256
|
|
3TZ7
Kinase domain of cSrc in complex with RL103
提交 2011-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
AQB N-(4-{[4-({[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]carbamoyl}amino)phenyl]amino}quinazolin-6-yl)-4-(dimethylamino)butanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å
R-free 0.256
|
|
3TZ8
Kinase domain of cSrc in complex with RL104
提交 2011-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
AQM N-(4-{[4-({[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]carbamoyl}amino)phenyl]amino}quinazolin-6-yl)-3-(4-methylpiperazin-1-yl)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.258
|
|
3TZ8
Kinase domain of cSrc in complex with RL104
提交 2011-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
AQM N-(4-{[4-({[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]carbamoyl}amino)phenyl]amino}quinazolin-6-yl)-3-(4-methylpiperazin-1-yl)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.258
|
|
3TZ9
Kinase domain of cSrc in complex with RL130
提交 2011-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
AQU 1-[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]-3-[4-(quinazolin-4-ylamino)phenyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å
R-free 0.283
|
|
3TZ9
Kinase domain of cSrc in complex with RL130
提交 2011-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain, UNP residues 251-533
|
突变:S345C
|
AQU 1-[1-(3-aminophenyl)-3-tert-butyl-1H-pyrazol-5-yl]-3-[4-(quinazolin-4-ylamino)phenyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;10% PEG 20000, 15% glycerol, 100mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.10 Å
R-free 0.283
|
|
3U4W
Src in complex with DNA-templated macrocyclic inhibitor MC4b
提交 2011-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
259–533(275 aa)
片段:Src kinase domain (UNP residues 259-533)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 3
SO4 SULFATE ION × 5
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;3% glycerol, 200 mM ammonium sulfate, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.186
|
|
3U51
Src in complex with DNA-templated macrocyclic inhibitor MC1
提交 2011-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
259–533(275 aa)
片段:Src kinase domain (UNP residues 259-533)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 12% PEG3350, 1% Tacsimate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.24 Å
R-free 0.236
|
|
3U51
Src in complex with DNA-templated macrocyclic inhibitor MC1
提交 2011-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
259–533(275 aa)
片段:Src kinase domain (UNP residues 259-533)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;0.1 M Bis-Tris, pH 6.5, 12% PEG3350, 1% Tacsimate, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.24 Å
R-free 0.236
|
|
3UQF
c-SRC kinase domain in complex with BKI RM-1-89
提交 2011-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain (UNP residues 251-533)
|
未记录
|
BK5 3-(6-ethoxynaphthalen-2-yl)-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;9% PEG 4000, 100 mM MES pH 6.5, 5 mM Sodium Acetate, 2.0 mM RM-1-89 in 10% DMSO, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.256
|
|
3UQF
c-SRC kinase domain in complex with BKI RM-1-89
提交 2011-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain (UNP residues 251-533)
|
未记录
|
BK5 3-(6-ethoxynaphthalen-2-yl)-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;9% PEG 4000, 100 mM MES pH 6.5, 5 mM Sodium Acetate, 2.0 mM RM-1-89 in 10% DMSO, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.27 Å
R-free 0.256
|
|
3UQG
c-SRC kinase domain in complex with bumpless BKI analog UW1243
提交 2011-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain (UNP residues 251-533)
|
未记录
|
B5A 1-(piperidin-4-ylmethyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;9% PEG 2000, 100 mM MES pH 7, 2.0 mM UW1243 in 10% DMSO, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.259
|
|
3UQG
c-SRC kinase domain in complex with bumpless BKI analog UW1243
提交 2011-11-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain (UNP residues 251-533)
|
未记录
|
B5A 1-(piperidin-4-ylmethyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;9% PEG 2000, 100 mM MES pH 7, 2.0 mM UW1243 in 10% DMSO, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.259
|
|
4AGW
Discovery of a small molecule type II inhibitor of wild-type and gatekeeper mutants of BCR-ABL, PDGFRalpha, Kit, and Src kinases
提交 2012-02-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 251-533
|
未记录
|
NG7 3-{2-[(cyclopropylcarbonyl)amino][1,3]thiazolo[5,4-b]pyridin-5-yl}-N-{4-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromet hyl)phenyl}benzamide × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PROTEIN CONCENTRATION 0.3 MM INHIBITOR CONCENTRATION 0.5 MM METHOD HANGING DROP VAPOR DIFFUSION AT 298 K PROTEIN BUFFER 5 % DMSO, 20 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 5 % GLYCEROL, 1 MM DTT. MOTHER LIQUOR: 100 MM MES PH 6.5, 7.5 % PEG 3350, 10 % GLYCEROL, 1 MM DTT
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.271
|
|
4AGW
Discovery of a small molecule type II inhibitor of wild-type and gatekeeper mutants of BCR-ABL, PDGFRalpha, Kit, and Src kinases
提交 2012-02-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:KINASE DOMAIN, RESIDUES 251-533
|
未记录
|
NG7 3-{2-[(cyclopropylcarbonyl)amino][1,3]thiazolo[5,4-b]pyridin-5-yl}-N-{4-[(4-ethylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromet hyl)phenyl}benzamide × 1
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;298 K;PROTEIN CONCENTRATION 0.3 MM INHIBITOR CONCENTRATION 0.5 MM METHOD HANGING DROP VAPOR DIFFUSION AT 298 K PROTEIN BUFFER 5 % DMSO, 20 MM TRIS PH 8.0, 250 MM NACL, 5 % GLYCEROL, 1 MM DTT. MOTHER LIQUOR: 100 MM MES PH 6.5, 7.5 % PEG 3350, 10 % GLYCEROL, 1 MM DTT
|
分辨率 2.60 Å
R-free 0.271
|
|
4DGG
c-SRC kinase domain in complex with RM-1-176
提交 2012-01-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:kinase domain (UNP residues 251-533)
|
未记录
|
I76 3-{6-[(3-chlorobenzyl)oxy]naphthalen-2-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;6% PEG 20000, 100 mM MES pH 6.5, 2.0 mM RM-1-176 in 10% DMSO, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.252
|
|
4DGG
c-SRC kinase domain in complex with RM-1-176
提交 2012-01-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:kinase domain (UNP residues 251-533)
|
未记录
|
I76 3-{6-[(3-chlorobenzyl)oxy]naphthalen-2-yl}-1-(propan-2-yl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;6% PEG 20000, 100 mM MES pH 6.5, 2.0 mM RM-1-176 in 10% DMSO, vapor diffusion, sitting drop, temperature 298K
|
分辨率 2.65 Å
R-free 0.252
|
|
4FIC
Kinase domain of cSrc in complex with a hinge region-binding fragment
提交 2012-06-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain of chicken Src (UNP residues 251-533)
|
未记录
|
0UL 6-phenyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrazin-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;11% ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.244
|
|
4FIC
Kinase domain of cSrc in complex with a hinge region-binding fragment
提交 2012-06-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:Kinase Domain of chicken Src (UNP residues 251-533)
|
未记录
|
0UL 6-phenyl[1,2,4]triazolo[1,5-a]pyrazin-2-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;11% ethylene glycol, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.244
|
|
4HVU
Crystal structure of the T98D c-Src-SH3 domain mutant in complex with the high affinity peptide APP12
提交 2012-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:T98D, Q128R
|
SO4 SULFATE ION × 1
ACE ACETYL GROUP × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;1.7 M Ammonium sulphate, 10% PEG 300, 10% glycerol and 0.1 M sodium acetate, pH 5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
4HVU
Crystal structure of the T98D c-Src-SH3 domain mutant in complex with the high affinity peptide APP12
提交 2012-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:T98D, Q128R
|
SO4 SULFATE ION × 2
ACE ACETYL GROUP × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;1.7 M Ammonium sulphate, 10% PEG 300, 10% glycerol and 0.1 M sodium acetate, pH 5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.160
|
|
4HVV
Crystal structure of the T98E c-Src-SH3 domain mutant in complex with the high affinity peptide APP12
提交 2012-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–140(56 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:T98E, Q128R
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;1.7 M Ammonium sulphate, 10% PEG 300, 10% glycerol and 0.1 M sodium acetate, pH 5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.10 Å
R-free 0.156
|
|
4HVW
Crystal structure of the T98E c-Src-SH3 domain mutant in complex with the high affinity peptide VSL12
提交 2012-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:T98E, T125S, Q128R
|
ACE ACETYL GROUP × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;1.7 M Ammonium sulphate, 5% PEG 300, 10% glycerol and 0.1 M sodium acetate, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.141
|
|
4HVW
Crystal structure of the T98E c-Src-SH3 domain mutant in complex with the high affinity peptide VSL12
提交 2012-11-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain
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突变:T98E, T125S, Q128R
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ACE ACETYL GROUP × 2
SO4 SULFATE ION × 2
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;1.7 M Ammonium sulphate, 5% PEG 300, 10% glycerol and 0.1 M sodium acetate, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.141
|
|
4JZ3
Crystal structure of the chicken c-Src-SH3 domain intertwined dimer
提交 2013-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
84–140(57 aa)
片段:SH3 domain: unp residues 84-140
|
未记录
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PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;1.6 M ammonium sulphate, 10% PEG 300, 10% glycerol and 0.1 M sodium acetate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.241
|
|
4JZ3
Crystal structure of the chicken c-Src-SH3 domain intertwined dimer
提交 2013-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
84–140(57 aa)
片段:SH3 domain: unp residues 84-140
|
未记录
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;1.6 M ammonium sulphate, 10% PEG 300, 10% glycerol and 0.1 M sodium acetate, pH 5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.241
|
|
4JZ4
Crystal structure of chicken c-Src-SH3 domain: monomeric form
提交 2013-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
84–140(57 aa)
片段:SH3 domain: unp residues 84-140
|
未记录
|
NI NICKEL (II) ION × 1
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.8M Ammonium sulphate, 10% Glicerol, 5mM NiCl, 0.1 M Hepes , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.176
|
|
4JZ4
Crystal structure of chicken c-Src-SH3 domain: monomeric form
提交 2013-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
84–140(57 aa)
片段:SH3 domain: unp residues 84-140
|
未记录
|
NI NICKEL (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.8M Ammonium sulphate, 10% Glicerol, 5mM NiCl, 0.1 M Hepes , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.176
|
|
4JZ4
Crystal structure of chicken c-Src-SH3 domain: monomeric form
提交 2013-04-02
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
84–140(57 aa)
片段:SH3 domain: unp residues 84-140
链 B
84–140(57 aa)
片段:SH3 domain: unp residues 84-140
|
未记录
|
NI NICKEL (II) ION × 2
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.8M Ammonium sulphate, 10% Glicerol, 5mM NiCl, 0.1 M Hepes , pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.56 Å
R-free 0.176
|
|
4LE9
Crystal structure of a chimeric c-Src-SH3 domain
提交 2013-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:unp residues 85-141
|
突变:E93V, S94A, R95S, T96G, N112G, N113Y, T114N, E115H, Q128R
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;298 K;2.2 M ammonium sulphate, 10% Glicerol, 5% PEG 300, 0.01 M non-detergent sulphobetaine 201,0.1M Sodium Acetate, pH 4.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.34 Å
R-free 0.164
|
|
4LGG
Structure of 3MB-PP1 bound to analog-sensitive Src kinase
提交 2013-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
264–533(270 aa)
片段:Kinase Domain (UNP residues 264-533)
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突变:T338G
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VGG 1-tert-butyl-3-(3-methylbenzyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, 50 mM NaAc, 12% glycerol, 6% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.285
|
|
4LGG
Structure of 3MB-PP1 bound to analog-sensitive Src kinase
提交 2013-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
264–533(270 aa)
片段:Kinase Domain (UNP residues 264-533)
|
突变:T338G
|
VGG 1-tert-butyl-3-(3-methylbenzyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, 50 mM NaAc, 12% glycerol, 6% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.41 Å
R-free 0.285
|
|
4LGH
Crystal structure of 1NM-PP1 bound to analog-sensitive Src kinase
提交 2013-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
257–533(277 aa)
片段:Kinase Domain (UNP residues 257-533)
|
突变:T338G
|
0JN 1-tert-butyl-3-(naphthalen-1-ylmethyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, 50 mM NaAc, 12% glycerol, 6% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.84 Å
R-free 0.272
|
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4LGH
Crystal structure of 1NM-PP1 bound to analog-sensitive Src kinase
提交 2013-06-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
257–533(277 aa)
片段:Kinase Domain (UNP residues 257-533)
|
突变:T338G
|
0JN 1-tert-butyl-3-(naphthalen-1-ylmethyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;100 mM MES, 50 mM NaAc, 12% glycerol, 6% PEG 4000, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.84 Å
R-free 0.272
|
|
4MCV
Star 12 bound to analog-sensitive Src kinase
提交 2013-08-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
256–533(278 aa)
片段:Src kinase domain (UNP residues 256-533)
|
突变:T338G
|
29K (7S)-12-(4-aminobutyl)-7-(2-methylpropyl)-6,7,12,13-tetrahydro-5H-indolo[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazol-5-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;287 K;8% PEG, 50 mM NaOAc, 100 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.73 Å
R-free 0.290
|
|
4MCV
Star 12 bound to analog-sensitive Src kinase
提交 2013-08-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
256–533(278 aa)
片段:Src kinase domain (UNP residues 256-533)
|
突变:T338G
|
29K (7S)-12-(4-aminobutyl)-7-(2-methylpropyl)-6,7,12,13-tetrahydro-5H-indolo[2,3-a]pyrrolo[3,4-c]carbazol-5-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;287 K;8% PEG, 50 mM NaOAc, 100 mM MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 287K
|
分辨率 2.73 Å
R-free 0.290
|
|
4O2P
Kinase domain of cSrc in complex with a substituted pyrazolopyrimidine
提交 2013-12-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:PROTEIN KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 251-533)
|
未记录
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11V 1-[(2R)-2-chloro-2-phenylethyl]-6-{[2-(morpholin-4-yl)ethyl]sulfanyl}-N-phenyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;10% ETHYLENE GLYCOL, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.238
|
|
4O2P
Kinase domain of cSrc in complex with a substituted pyrazolopyrimidine
提交 2013-12-17
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:PROTEIN KINASE DOMAIN (UNP RESIDUES 251-533)
|
未记录
|
11V 1-[(2R)-2-chloro-2-phenylethyl]-6-{[2-(morpholin-4-yl)ethyl]sulfanyl}-N-phenyl-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;10% ETHYLENE GLYCOL, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.238
|
|
4OML
Crystal structure of the intertwined dimer of the c-Src tyrosine kinase SH3 domain mutant Q128R
提交 2014-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:Q128R
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5;298 K;0.1M sodium acetate, 1.6 M ammonium sulphate, 10%PEG 300, 10%Glicerol, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.60 Å
R-free 0.199
|
|
4OMM
Crystal structure of the intertwined dimer of the c-Src tyrosine kinase SH3 domain mutant N113S
提交 2014-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–140(56 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:N113S, Q129R
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
GOL GLYCEROL × 2
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;0.1M sodium acetate, 1.7 M ammonium sulphate, 5 %PEG 300, 10%Glicerol, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.213
|
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4OMN
Crystal structure of the intertwined dimer of the c-Src tyrosine kinase SH3 domain mutant Q128E
提交 2014-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–140(56 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:Q128E
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
SO4 SULFATE ION × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5;298 K;0.1M sodium acetate, 1.8 M ammonium sulphate, 10%PEG 200, 10%Glicerol, 10mM NDSB, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.168
|
|
4OMO
Crystal structure of the c-Src tyrosine kinase SH3 domain mutant Q128E
提交 2014-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:Q128E
|
NI NICKEL (II) ION × 1
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.1M Hepes, 2M ammonium sulphate, 5mM NiCl2, 5mM MBCD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.168
|
|
4OMO
Crystal structure of the c-Src tyrosine kinase SH3 domain mutant Q128E
提交 2014-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:Q128E
|
NI NICKEL (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.1M Hepes, 2M ammonium sulphate, 5mM NiCl2, 5mM MBCD, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 1.04 Å
R-free 0.168
|
|
4OMP
Crystal structure of the intertwined dimer of the c-Src tyrosine kinase SH3 domain mutant Q128K
提交 2014-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–139(55 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:Q128K
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5;298 K;0.1M sodium acetate, 1.8 M ammonium sulphate, 5% PEG 300, 10%Glicerol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.261
|
|
4OMQ
Crystal structure of the intertwined dimer of the c-Src tyrosine kinase SH3 domain mutant S94A
提交 2014-01-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–140(56 aa)
片段:SH3 domain
|
突变:S94A, Q128R
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
pH 5;298 K;0.1M sodium acetate, 1.7 M ammonium sulphate, 5 %PEG 300, 10%Glicerol, pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.229
|
|
4QT7
Crystal structure of the c-Src SH3 domain in complex with a peptide from the Hepatitis C virus NS5A-protein
提交 2014-07-07
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain, UNP residues 85-141
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;298 K;2M Ammonium sulphate, 0.1M sodium chloride, 0.86mM methyl-beta-cyclodextrin, 0.1M Hepes, pH 7, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.55 Å
R-free 0.195
|
|
4RTU
Crystal structure of the intertwined form of the Src tyrosine kinase SH3 domain T96G/Q128R mutant
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residues 85-141)
|
突变:T96G, Q128R
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 4
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
SO4 SULFATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;0.1M sodium acetate, 1.9M ammonium sulphate, 5% PEG 200, 10% Glycerol, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP
|
分辨率 2.45 Å
R-free 0.244
|
|
4RTV
Crystal structure of the Src tyrosine kinase SH3 domain S94A/Q128R mutant in complex with the high affinity synthetic peptide APP12
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residues 85-141)
|
突变:S94A, Q128R
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;0.1M sodium acetate, 1.5M ammonium sulphate, 5% PEG 300, 10% Glycerol, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.37 Å
R-free 0.178
|
|
4RTW
Crystal structure of the c-Src-SH3 domain E93V/Q128R mutant in complex with the high affinity peptide APP12
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residues 85-141)
|
突变:E93V, Q128R
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;1.8 M Ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate and 10% Glycerol, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.24 Å
R-free 0.158
|
|
4RTW
Crystal structure of the c-Src-SH3 domain E93V/Q128R mutant in complex with the high affinity peptide APP12
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residues 85-141)
|
突变:E93V, Q128R
|
SO4 SULFATE ION × 2
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;1.8 M Ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate and 10% Glycerol, pH 5.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.24 Å
R-free 0.158
|
|
4RTX
Crystal structure of the Src tyrosine kinase SH3 domain T96G/Q128R mutant
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residue 85-141)
|
突变:T96G, Q128R
|
NI NICKEL (II) ION × 1
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.1M Hepes, 1.4M ammonium sulphate, 5mM NiCl2, 5mM Methyl beta cyclodextrin, 5mM Glicine, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.207
|
|
4RTX
Crystal structure of the Src tyrosine kinase SH3 domain T96G/Q128R mutant
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residue 85-141)
|
突变:T96G, Q128R
|
NI NICKEL (II) ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.1M Hepes, 1.4M ammonium sulphate, 5mM NiCl2, 5mM Methyl beta cyclodextrin, 5mM Glicine, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.207
|
|
4RTX
Crystal structure of the Src tyrosine kinase SH3 domain T96G/Q128R mutant
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residue 85-141)
|
突变:T96G, Q128R
|
NI NICKEL (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.1M Hepes, 1.4M ammonium sulphate, 5mM NiCl2, 5mM Methyl beta cyclodextrin, 5mM Glicine, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.207
|
|
4RTX
Crystal structure of the Src tyrosine kinase SH3 domain T96G/Q128R mutant
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residue 85-141)
|
突变:T96G, Q128R
|
NI NICKEL (II) ION × 1
SO4 SULFATE ION × 1
EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;0.1M Hepes, 1.4M ammonium sulphate, 5mM NiCl2, 5mM Methyl beta cyclodextrin, 5mM Glicine, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.32 Å
R-free 0.207
|
|
4RTY
Crystal structure of the c-Src-SH3 domain in complex with the high affinity peptide APP12
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residues 85-141)
|
未记录
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;298 K;1.6M Ammonium sulphate, 0.1M sodium acetate and 10% Glycerol, pH 4.0, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 1.28 Å
R-free 0.137
|
|
4RTZ
Crystal structure of the c-Src-SH3 domain in complex with the high affinity peptide VSL12
提交 2014-11-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 domain (UNP residues 85-141)
|
未记录
|
NI NICKEL (II) ION × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7.5;298 K;1.7 M Ammonium sulphate, 0.1 M Hepes, 5 mM NiCl2 and 10% Glycerol, pH 7.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 298K
|
分辨率 0.98 Å
R-free 0.158
|
|
4U5J
C-Src in complex with Ruxolitinib
提交 2014-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
RXT (3R)-3-cyclopentyl-3-[4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-1H-pyrazol-1-yl]propanenitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG 4000
|
分辨率 2.26 Å
R-free 0.236
|
|
4U5J
C-Src in complex with Ruxolitinib
提交 2014-07-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
RXT (3R)-3-cyclopentyl-3-[4-(7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-4-yl)-1H-pyrazol-1-yl]propanenitrile × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG 4000
|
分辨率 2.26 Å
R-free 0.236
|
|
4YBJ
Type II Dasatinib Analog Crystallized with c-Src Kinase
提交 2015-02-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
251–533(283 aa)
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
4A9 2-({6-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]-2-methylpyrimidin-4-yl}amino)-N-(3-{[3-(trifluoromethyl)benzoyl]amino}phenyl)-1,3-thiazole-5-carboxamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES, pH 6.5, 20% PEG 3350, 370 mM NaOAc
|
分辨率 2.61 Å
R-free 0.250
|
|
4YBK
C-Helix-Out Dasatinib Analog Crystallized with c-Src Kinase
提交 2015-02-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
4B7 2-({6-[4-(2-hydroxyethyl)piperazin-1-yl]-2-methylpyrimidin-4-yl}amino)-N-(4-phenoxyphenyl)-1,3-thiazole-5-carboxamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;293 K;0.1 M MES, pH 6.5, 16% PEG 3350, 420 mM NaOAc
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.252
|
|
5BMM
Src in complex with DNA-templated macrocyclic inhibitor MC25b
提交 2015-05-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;14% PEG 5000 MME, 0.3 M NaH2PO
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.246
|
|
5BMM
Src in complex with DNA-templated macrocyclic inhibitor MC25b
提交 2015-05-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 8;298 K;14% PEG 5000 MME, 0.3 M NaH2PO
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.246
|
|
5D10
Kinase domain of cSrc in complex with RL236
提交 2015-08-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
563 N-[4-({4-(4-methylpiperazin-1-yl)-6-[(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]pyrimidin-2-yl}oxy)phenyl]prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.085-0.125 mM MES,
9-11.5 % PEG20000
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.359
|
|
5D10
Kinase domain of cSrc in complex with RL236
提交 2015-08-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
563 N-[4-({4-(4-methylpiperazin-1-yl)-6-[(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]pyrimidin-2-yl}oxy)phenyl]prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.085-0.125 mM MES,
9-11.5 % PEG20000
|
分辨率 2.70 Å
R-free 0.359
|
|
5D11
Kinase domain of cSrc in complex with RL235
提交 2015-08-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
GOL GLYCEROL × 1
56G N-[3-({4-(4-methylpiperazin-1-yl)-6-[(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]pyrimidin-2-yl}oxy)phenyl]prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.085-0.125 mM MES, 9-11.5 % PEG20000
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.269
|
|
5D11
Kinase domain of cSrc in complex with RL235
提交 2015-08-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
GOL GLYCEROL × 1
56G N-[3-({4-(4-methylpiperazin-1-yl)-6-[(5-methyl-1H-pyrazol-3-yl)amino]pyrimidin-2-yl}oxy)phenyl]prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.085-0.125 mM MES, 9-11.5 % PEG20000
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.269
|
|
5D12
Kinase domain of cSrc in complex with RL40
提交 2015-08-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
突变:T338M, S345C
|
G97 N-[2-phenyl-4-(1H-pyrazol-3-ylamino)quinazolin-7-yl]prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.085-0.125 mM MES, 9-11.5 % PEG20000
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.376
|
|
5D12
Kinase domain of cSrc in complex with RL40
提交 2015-08-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
突变:T338M, S345C
|
G97 N-[2-phenyl-4-(1H-pyrazol-3-ylamino)quinazolin-7-yl]prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;293 K;0.085-0.125 mM MES, 9-11.5 % PEG20000
|
分辨率 3.00 Å
R-free 0.376
|
|
5EC7
Crystal structure of a chimeric c-Src-SH3 domain with the sequence of the RT-loop from the Abl-SH3 domain at pH 5.0
提交 2015-10-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
85–140(56 aa)
片段:SH3 DOMAIN
|
突变:E93V; S94A; R95S; Q128R
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;2.5 M ammonium sulphate, 5% PEG 300, 2 % Glycerol, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.243
|
|
5EC7
Crystal structure of a chimeric c-Src-SH3 domain with the sequence of the RT-loop from the Abl-SH3 domain at pH 5.0
提交 2015-10-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
85–140(56 aa)
片段:SH3 DOMAIN
|
突变:E93V; S94A; R95S; Q128R
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;2.5 M ammonium sulphate, 5% PEG 300, 2 % Glycerol, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.243
|
|
5EC7
Crystal structure of a chimeric c-Src-SH3 domain with the sequence of the RT-loop from the Abl-SH3 domain at pH 5.0
提交 2015-10-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
85–140(56 aa)
片段:SH3 DOMAIN
|
突变:E93V; S94A; R95S; Q128R
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;2.5 M ammonium sulphate, 5% PEG 300, 2 % Glycerol, 0.1 M sodium acetate
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.243
|
|
5ECA
Crystal structure of a chimeric c-Src-SH3 domain with the sequence of the RT-loop from the Abl-SH3 domain at pH 6.5
提交 2015-10-20
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 DOMAIN
|
突变:E93V; S94A; R95S; Q128R
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.5;298 K;1.8 M ammonium sulphate, 0.1 M MES
|
分辨率 1.16 Å
R-free 0.182
|
|
5I11
Crystal structure of the intertwined form of the Src tyrosine kinase SH3 domain T114S-Q128R mutant
提交 2016-02-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
|
突变:T114S, Q128R
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
SO4 SULFATE ION × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
ACT ACETATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;0.1M SODIUM ACETATE, 1.9M AMMONIUM
SULPHATE, 5% PEG 400, 10% GLYCEROL, PH 5.0
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.218
|
|
5J5S
Src kinase in complex with a sulfonamide inhibitor
提交 2016-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
未记录
|
6G3 N-{4-[8-amino-3-(propan-2-yl)imidazo[1,5-a]pyrazin-1-yl]naphthalen-1-yl}-N'-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;7% PEG 5000MME, 100mM Bis-Tris pH 6, 1.5% Tacsimate pH 6
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.216
|
|
5J5S
Src kinase in complex with a sulfonamide inhibitor
提交 2016-04-03
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
6G3 N-{4-[8-amino-3-(propan-2-yl)imidazo[1,5-a]pyrazin-1-yl]naphthalen-1-yl}-N'-[3-(trifluoromethyl)phenyl]urea × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6;277 K;7% PEG 5000MME, 100mM Bis-Tris pH 6, 1.5% Tacsimate pH 6
|
分辨率 2.15 Å
R-free 0.216
|
|
5K9I
Crystal structure of c-SRC in complex with a covalent lysine probe
提交 2016-05-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:residues 251-533
|
未记录
|
O44 4-[(4-{4-[(3-cyclopropyl-1H-pyrazol-5-yl)amino]-6-[(prop-2-yn-1-yl)carbamoyl]pyrimidin-2-yl}piperazin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonyl fluoride × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293 K;100 mM MES, pH 6.1, 50 mMNaOAc, 16% glycerol and 4% PEG 4000
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.249
|
|
5K9I
Crystal structure of c-SRC in complex with a covalent lysine probe
提交 2016-05-31
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:residues 251-533
|
未记录
|
O44 4-[(4-{4-[(3-cyclopropyl-1H-pyrazol-5-yl)amino]-6-[(prop-2-yn-1-yl)carbamoyl]pyrimidin-2-yl}piperazin-1-yl)methyl]benzene-1-sulfonyl fluoride × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.1;293 K;100 mM MES, pH 6.1, 50 mMNaOAc, 16% glycerol and 4% PEG 4000
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.249
|
|
5OAV
High resolution crystal structure of the c-Src-SH3 domain mutant E93V in complex with the high affinity synthetic peptide APP12: monoclinic crystal
提交 2017-06-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 DOMAIN, UNP residues 85-141
|
突变:yes
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;1.6 M Ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate, 5 mM lithium chloride and 10% Glycerol
|
分辨率 0.95 Å
R-free 0.160
|
|
5OAV
High resolution crystal structure of the c-Src-SH3 domain mutant E93V in complex with the high affinity synthetic peptide APP12: monoclinic crystal
提交 2017-06-23
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 C
85–141(57 aa)
片段:SH3 DOMAIN, UNP residues 85-141
|
突变:yes
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5;298 K;1.6 M Ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate, 5 mM lithium chloride and 10% Glycerol
|
分辨率 0.95 Å
R-free 0.160
|
|
5OB0
Crystal structure of the c-Src-SH3 domain Q128E mutant in complex with the high affinity peptide APP12
提交 2017-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 DOMAIN
|
突变:Q128E
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;298 K;1.9 M Ammonium sulphate, 0.05 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate and 10% Glycerol
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.149
|
|
5OB1
Crystal structure of the c-Src-SH3 domain Q128R mutant in complex with the high affinity peptide APP12
提交 2017-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
85–141(57 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;298 K;1.6 M Ammonium sulphate, 0.1 M sodium chloride, 0.1 M sodium acetate and 10% Glycerol
|
分辨率 1.17 Å
R-free 0.141
|
|
5OB2
Crystal structure of the c-Src-SH3 domain E97T mutant in complex with the high affinity peptide APP12
提交 2017-06-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 4
PDB 声明:tetrameric
|
链 A
85–141(57 aa)
片段:SH3 DOMAIN
链 C
85–141(57 aa)
片段:SH3 DOMAIN
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 4;298 K;1.9 M Ammonium sulphate, 0.1 M sodium acetate and 10% PEG 400
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.220
|
|
5SWH
c-Src V281C kinase domain in complex with Rao-IV-151
提交 2016-08-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
252–533(282 aa)
|
突变:V281C
|
71D (2R)-3-[4-amino-5-(4-chlorophenyl)-7-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl]-2-cyano-N-(propan-2-yl)propanami de × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;100 mM MES pH 6, 8% PEG 3350, 3% glycerol, 10 mM DTT, 10 mM NaOAc
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.287
|
|
5SWH
c-Src V281C kinase domain in complex with Rao-IV-151
提交 2016-08-08
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
252–533(282 aa)
|
突变:V281C
|
71D (2R)-3-[4-amino-5-(4-chlorophenyl)-7-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl]-2-cyano-N-(propan-2-yl)propanami de × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;100 mM MES pH 6, 8% PEG 3350, 3% glycerol, 10 mM DTT, 10 mM NaOAc
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.287
|
|
5SYS
c-Src V281C bound to N-[3-({6-[(1E)-2-cyano-3-(methylamino)-3-oxoprop-1-en-1-yl]-7-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl}ethynyl)-4-methylphenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide inhibitor
提交 2016-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:V281C
|
72F N-[3-({6-[(2S)-2-cyano-3-(methylamino)-3-oxopropyl]-7-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl}ethynyl)-4-methylphenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;100 mM MES pH 6, 8% PEG 3350, 10 mM NaOAc, 14% glycerol, 10 mM DTT
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.334
|
|
5SYS
c-Src V281C bound to N-[3-({6-[(1E)-2-cyano-3-(methylamino)-3-oxoprop-1-en-1-yl]-7-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl}ethynyl)-4-methylphenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide inhibitor
提交 2016-08-11
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:V281C
|
72F N-[3-({6-[(2S)-2-cyano-3-(methylamino)-3-oxopropyl]-7-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl}ethynyl)-4-methylphenyl]-3-(trifluoromethyl)benzamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;100 mM MES pH 6, 8% PEG 3350, 10 mM NaOAc, 14% glycerol, 10 mM DTT
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.334
|
|
5T0P
c-Src kinase domain in complex with Rao-IV-151
提交 2016-08-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:V313C
|
73A (2E)-3-[4-amino-5-(4-chlorophenyl)-7-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl]-2-cyano-N-(propan-2-yl)prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;100 mM MES ph 6, 10% PEG 3350, 3% glycerol, 10 mM NaOAC, 10 mM DTT
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.323
|
|
5T0P
c-Src kinase domain in complex with Rao-IV-151
提交 2016-08-16
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:V313C
|
73A (2E)-3-[4-amino-5-(4-chlorophenyl)-7-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl]-2-cyano-N-(propan-2-yl)prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;298 K;100 mM MES ph 6, 10% PEG 3350, 3% glycerol, 10 mM NaOAC, 10 mM DTT
|
分辨率 2.50 Å
R-free 0.323
|
|
5TEH
c-Src V281C kinase domain in complex with Rao-IV-156
提交 2016-09-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:V281C
|
S56 (2S)-3-[4-amino-7-(2-methoxyethyl)-5-(4-phenoxyphenyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl]-2-cyano-N-(propan-2-yl)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.3;298 K;100 mM MES pH 6.3, 40 mM NaOAc, 8% PEG3350, 10% glycerol, 10 mM DTT
|
分辨率 2.99 Å
R-free 0.366
|
|
5TEH
c-Src V281C kinase domain in complex with Rao-IV-156
提交 2016-09-21
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:V281C
|
S56 (2S)-3-[4-amino-7-(2-methoxyethyl)-5-(4-phenoxyphenyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-6-yl]-2-cyano-N-(propan-2-yl)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.3;298 K;100 mM MES pH 6.3, 40 mM NaOAc, 8% PEG3350, 10% glycerol, 10 mM DTT
|
分辨率 2.99 Å
R-free 0.366
|
|
5XP5
C-Src in complex with ATP-Chf
提交 2017-06-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
8BU [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-[(S)-fluoranyl-[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]methyl]phosphinic acid × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.246
|
|
5XP5
C-Src in complex with ATP-Chf
提交 2017-06-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
8BU [(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-[(S)-fluoranyl-[oxidanyl(phosphonooxy)phosphoryl]methyl]phosphinic acid × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG 4000
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.246
|
|
5XP7
C-Src in complex with ATP-CHCl
提交 2017-06-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
8C6 [(R)-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]-chloranyl-methyl]phosphonic acid × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG4000
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.198
|
|
5XP7
C-Src in complex with ATP-CHCl
提交 2017-06-01
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
片段:UNP residues 251-533
|
未记录
|
8C6 [(R)-[[(2R,3S,4R,5R)-5-(6-aminopurin-9-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl]-chloranyl-methyl]phosphonic acid × 1
MG MAGNESIUM ION × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG4000
|
分辨率 2.01 Å
R-free 0.198
|
|
6HVE
Kinase domain of cSrc in complex with compound 9
提交 2018-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
GUW ~{N}-[3-(4-methoxy-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl)phenyl]prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;10% ethylene glycol, 10 mM sodium chloride, pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.203
|
|
6HVE
Kinase domain of cSrc in complex with compound 9
提交 2018-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
GUW ~{N}-[3-(4-methoxy-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl)phenyl]prop-2-enamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;10% ethylene glycol, 10 mM sodium chloride, pH 7.0
|
分辨率 1.90 Å
R-free 0.203
|
|
6HVF
Kinase domain of cSrc in complex with compound 29B
提交 2018-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
GUT ~{N}-[3-[3-ethyl-6-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-4-oxidanylidene-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]phenyl]prop-2-enamide × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;10% ethylene glycol, 10 mM sodium chloride, pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.245
|
|
6HVF
Kinase domain of cSrc in complex with compound 29B
提交 2018-10-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
突变:T338M, S345C
|
GUT ~{N}-[3-[3-ethyl-6-[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]-4-oxidanylidene-7~{H}-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]phenyl]prop-2-enamide × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;10% ethylene glycol, 10 mM sodium chloride, pH 7.0
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.245
|
|
6L8L
C-Src in complex with ibrutinib
提交 2019-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
未记录
|
1E8 1-{(3R)-3-[4-amino-3-(4-phenoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl}prop-2-en-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG 4000
|
分辨率 2.89 Å
R-free 0.286
|
|
6L8L
C-Src in complex with ibrutinib
提交 2019-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
1E8 1-{(3R)-3-[4-amino-3-(4-phenoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl}prop-2-en-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG 4000
|
分辨率 2.89 Å
R-free 0.286
|
|
6L8L
C-Src in complex with ibrutinib
提交 2019-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
251–533(283 aa)
|
未记录
|
1E8 1-{(3R)-3-[4-amino-3-(4-phenoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl}prop-2-en-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG 4000
|
分辨率 2.89 Å
R-free 0.286
|
|
6L8L
C-Src in complex with ibrutinib
提交 2019-11-06
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
251–533(283 aa)
|
未记录
|
1E8 1-{(3R)-3-[4-amino-3-(4-phenoxyphenyl)-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl]piperidin-1-yl}prop-2-en-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;PEG 4000
|
分辨率 2.89 Å
R-free 0.286
|
|
6WIW
c-Src Bound to ATP-Competitive Inhibitor I14
提交 2020-04-10
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
251–533(283 aa)
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
I14 N-(3-{[4-amino-7-(2-methoxyethyl)-7H-pyrrolo[2,3-d]pyrimidin-5-yl]ethynyl}-4-methylphenyl)acetamide × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 5.5;293 K;0.1 M Bis-Tris (pH 5.5), 100 mM NaOAc,
12% PEG 3350
|
分辨率 2.30 Å
R-free 0.235
|
|
6XVM
Crystal structure of c-Src SH3 domain without ATCUN motif: monomer 2
提交 2020-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
未记录
|
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;3M ammonium sulfate, 0.1 M MES
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.149
|
|
6XVM
Crystal structure of c-Src SH3 domain without ATCUN motif: monomer 2
提交 2020-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;3M ammonium sulfate, 0.1 M MES
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.149
|
|
6XVM
Crystal structure of c-Src SH3 domain without ATCUN motif: monomer 2
提交 2020-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
82–141(60 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;3M ammonium sulfate, 0.1 M MES
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.149
|
|
6XVM
Crystal structure of c-Src SH3 domain without ATCUN motif: monomer 2
提交 2020-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
82–141(60 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;3M ammonium sulfate, 0.1 M MES
|
分辨率 0.90 Å
R-free 0.149
|
|
6XVN
Crystal structure of c-Src SH3 domain without ATCUN motif: monomer 1
提交 2020-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;2.5 ammonium sulfate, 0.1 TRIS
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.181
|
|
6XVN
Crystal structure of c-Src SH3 domain without ATCUN motif: monomer 1
提交 2020-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
未记录
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;2.5 ammonium sulfate, 0.1 TRIS
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.181
|
|
6XVO
Crystal structure of the intertwined dimer of the c-Src SH3 domain without ATCUN motif
提交 2020-01-22
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
未记录
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;2.5 ammonium sulfate, 5% PEG 300, 0.1 sodium acetate
|
分辨率 1.70 Å
R-free 0.213
|
|
6XX2
Crystal structure of the c-Src SH3 domain H122R-Q128K mutant in complex with Cu(II) at pH 7.5 co-crystallized with methyl beta-cyclodextrin
提交 2020-01-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
85–141(57 aa)
|
突变:H122R Q128K
|
CU COPPER (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.9 M ammonium sulfate, 0.1 HEPES, 5 mM copper chloride, 5 mM methyl beta-cyclodextrin
|
分辨率 1.25 Å
R-free 0.207
|
|
6XX3
Crystal structure of the c-Src SH3 domain H122R-Q128E mutant in complex with Cu(II) at pH 6.5 co-crystallized with methyl beta-cyclodextrin
提交 2020-01-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
85–141(57 aa)
|
突变:H122R Q128E
|
CU COPPER (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6.5;298 K;2.5 M ammonium sulfate, 0.1 sodium cacodilate, 5 mM copper chloride, 10mM methyl beta-cyclodextrin
|
分辨率 1.36 Å
R-free 0.204
|
|
6XX4
Crystal structure of the c-Src SH3 domain H122R-Q128E mutant in complex with Ni(II) at pH 7.5 co-crystallized with methyl beta-cyclodextrin
提交 2020-01-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
85–141(57 aa)
|
突变:H122R Q128E
|
NI NICKEL (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.4 M ammonium sulfate, 0.1 HEPES, 5 mM nickel chloride, 10% glycerol, 10mM methyl beta-cyclodextrin
|
分辨率 1.05 Å
R-free 0.184
|
|
6XX5
Crystal structure of the c-Src SH3 domain H122R-Q128K mutant in complex with Ni(II) at pH 7.5 co-crystallized with methyl beta-cyclodextrin
提交 2020-01-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
其他组合
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
85–141(57 aa)
|
突变:H122R Q128K
|
NI NICKEL (II) ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7.5;298 K;1.8 M ammonium sulfate, 0.1 HEPES, 5 mM nickel chloride, 10% glycerol, 10mM methyl beta-cyclodextrin
|
分辨率 1.30 Å
R-free 0.194
|
|
7A30
Intertwined dimer of the c-Src SH3 domain mutant Q128E
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:Q128E
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;5% PEG300, 2.0 M ammomium sulfate, 0.1M sodium acetate
|
分辨率 1.67 Å
R-free 0.237
|
|
7A31
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant S94A-T98D-V111L-N113S-T114S at pH 4.5
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;298 K;1.0 M ammomium sulfate, 0.1M sodium acetate
|
分辨率 0.94 Å
R-free 0.167
|
|
7A31
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant S94A-T98D-V111L-N113S-T114S at pH 4.5
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 4.5;298 K;1.0 M ammomium sulfate, 0.1M sodium acetate
|
分辨率 0.94 Å
R-free 0.167
|
|
7A32
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant S94A-T98D-V111L-N113S-T114S at pH 7.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;1.5 M ammonium sulfate, 0.1M Hepes
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.173
|
|
7A32
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant S94A-T98D-V111L-N113S-T114S at pH 7.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;1.5 M ammonium sulfate, 0.1M Hepes
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.173
|
|
7A32
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant S94A-T98D-V111L-N113S-T114S at pH 7.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
82–141(60 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;1.5 M ammonium sulfate, 0.1M Hepes
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.173
|
|
7A32
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant S94A-T98D-V111L-N113S-T114S at pH 7.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
82–141(60 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;1.5 M ammonium sulfate, 0.1M Hepes
|
分辨率 1.15 Å
R-free 0.173
|
|
7A33
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant S94A-T98D-V111L-N113S-T114S at pH 3.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
FMT FORMIC ACID × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 3;298 K;5 mM beta-cyclodextrin, 1.5 M ammomium sulfate, 0.1M sodium citrate
|
分辨率 0.96 Å
R-free 0.134
|
|
7A33
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant S94A-T98D-V111L-N113S-T114S at pH 3.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
FMT FORMIC ACID × 1
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 3;298 K;5 mM beta-cyclodextrin, 1.5 M ammomium sulfate, 0.1M sodium citrate
|
分辨率 0.96 Å
R-free 0.134
|
|
7A34
Intertwined dimer of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;5% PEG300, 2M ammomium sulfate, 0.1M sodium acetate
|
分辨率 1.85 Å
R-free 0.227
|
|
7A35
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S at pH 7.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;5% PEG300, 2M ammomium sulfate, 0.1M sodium acetate
|
分辨率 1.31 Å
R-free 0.203
|
|
7A35
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S at pH 7.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;5% PEG300, 2M ammomium sulfate, 0.1M sodium acetate
|
分辨率 1.31 Å
R-free 0.203
|
|
7A36
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S in 7 M urea
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S
|
URE UREA × 8
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;3M ammomium sulfate, 0.1M Tris
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.177
|
|
7A36
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S in 7 M urea
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S
|
URE UREA × 5
NA SODIUM ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;3M ammomium sulfate, 0.1M Tris
|
分辨率 1.50 Å
R-free 0.177
|
|
7A37
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S in 3 M urea
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S
|
URE UREA × 6
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;2.5 M ammomium sulfate, 0.1M Tris
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.179
|
|
7A37
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S in 3 M urea
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S
|
URE UREA × 3
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;2.5 M ammomium sulfate, 0.1M Tris
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.179
|
|
7A38
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S-Q128E at pH 6.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S Q128E
|
MES 2-(N-MORPHOLINO)-ETHANESULFONIC ACID × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;1.5M ammonium sulfate, 0.1M MES, 10% glycerol
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.199
|
|
7A38
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S-Q128E at pH 6.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S Q128E
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;1.5M ammonium sulfate, 0.1M MES, 10% glycerol
|
分辨率 1.62 Å
R-free 0.199
|
|
7A39
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S-Q128E at pH 7.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S Q128E
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;2M ammomium sulfate, 0.1M Hepes
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.219
|
|
7A39
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S-Q128E at pH 7.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S Q128E
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 7;298 K;2M ammomium sulfate, 0.1M Hepes
|
分辨率 1.65 Å
R-free 0.219
|
|
7A3A
Intertwined dimer of the c-Src SH3 domain mutant V111L-N113S-T114S-Q128E at pH 6.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:V111L N113S T114S Q128E
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
SO4 SULFATE ION × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;1.5M ammonium sulfate, 0.1M MES, 5% PEG300
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.205
|
|
7A3B
Intertwined dimer of the c-Src SH3 domain mutant E106D
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
82–141(60 aa)
|
突变:E106D
|
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
GOL GLYCEROL × 4
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;5% PEG300, 10 mM Lithium chloride, 10% glycerol, 2.4 M ammomium sulfate, 0.1M MES
|
分辨率 1.91 Å
R-free 0.218
|
|
7A3C
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant L100I at pH 3.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
81–141(61 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 3;298 K;5 mM beta-cyclodextrin, 1.5 M ammomium sulfate, 0.1M sodium citrate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.228
|
|
7A3C
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant L100I at pH 3.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
81–141(61 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
GOL GLYCEROL × 1
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 3;298 K;5 mM beta-cyclodextrin, 1.5 M ammomium sulfate, 0.1M sodium citrate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.228
|
|
7A3C
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant L100I at pH 3.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 3
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 C
81–141(61 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 3;298 K;5 mM beta-cyclodextrin, 1.5 M ammomium sulfate, 0.1M sodium citrate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.228
|
|
7A3C
Crystal structure of the c-Src SH3 domain mutant L100I at pH 3.0
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 4
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 D
81–141(61 aa)
|
突变:S94A, T98D, V111L, N113S, T114S
|
SO4 SULFATE ION × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 3;298 K;5 mM beta-cyclodextrin, 1.5 M ammomium sulfate, 0.1M sodium citrate
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.228
|
|
7A3D
Intertwined dimer of the c-Src SH3 domain mutant T125S
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
82–141(60 aa)
链 B
82–141(60 aa)
|
突变:T125S
突变:T125S
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 2
SO4 SULFATE ION × 1
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 1
GOL GLYCEROL × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;5% PEG 300, 2 M ammomium sulfate, 0.1M sodium acetate
|
分辨率 2.20 Å
R-free 0.221
|
|
7A3E
Intertwined dimer of the c-Src SH3 domain mutant T126S
提交 2020-08-18
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
81–141(61 aa)
|
突变:T126S
|
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4
PGE TRIETHYLENE GLYCOL × 2
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 6;298 K;5% PEG 300, 2.5 M ammomium sulfate, 0.1M MES
|
分辨率 1.52 Å
R-free 0.228
|
|
7AH3
Kinase domain of cSrc in complex with a pyrazolopyrimidine
提交 2020-09-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
未记录
|
RCK ~{N}-[(2-fluorophenyl)methyl]-6-(morpholin-4-ylmethylsulfanyl)-1-(2-phenylethyl)pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
DMS DIMETHYL SULFOXIDE × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0 to 30 mM NaCl, pH 7.0
9 to 20 % ethylene glycol
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.226
|
|
7AH3
Kinase domain of cSrc in complex with a pyrazolopyrimidine
提交 2020-09-24
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
RCK ~{N}-[(2-fluorophenyl)methyl]-6-(morpholin-4-ylmethylsulfanyl)-1-(2-phenylethyl)pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-4-amine × 1
EDO 1,2-ETHANEDIOL × 2
GOL GLYCEROL × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 7;293 K;0 to 30 mM NaCl, pH 7.0
9 to 20 % ethylene glycol
|
分辨率 1.95 Å
R-free 0.226
|
|
7D57
C-Src in complex with FIIN-2
提交 2020-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
未记录
|
37O N-(4-{[3-(3,5-dimethoxyphenyl)-7-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-2-oxo-3,4-dihydropyrimido[4,5-d]pyrimidin-1(2H)-yl]methyl}phenyl)propanamide × 1
SO4 SULFATE ION × 2
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;291 K;2% glycerol, 8% PEG 4000, 50mM sodium acetate, 10mM MgCl2
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.222
|
|
7D57
C-Src in complex with FIIN-2
提交 2020-09-25
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
37O N-(4-{[3-(3,5-dimethoxyphenyl)-7-{[4-(4-methylpiperazin-1-yl)phenyl]amino}-2-oxo-3,4-dihydropyrimido[4,5-d]pyrimidin-1(2H)-yl]methyl}phenyl)propanamide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;291 K;2% glycerol, 8% PEG 4000, 50mM sodium acetate, 10mM MgCl2
|
分辨率 2.10 Å
R-free 0.222
|
|
7D5O
C-Src in complex with TAS-120
提交 2020-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
TZ0 1-[(3S)-3-{4-amino-3-[(3,5-dimethoxyphenyl)ethynyl]-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl}pyrrolidin-1-yl]prop-2-en-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;291 K;2% glycerol, 8% PEG 4000, 50mM sodium acetate, 10mM MgCl2
|
分辨率 2.69 Å
R-free 0.237
|
|
7D5O
C-Src in complex with TAS-120
提交 2020-09-27
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
未记录
|
TZ0 1-[(3S)-3-{4-amino-3-[(3,5-dimethoxyphenyl)ethynyl]-1H-pyrazolo[3,4-d]pyrimidin-1-yl}pyrrolidin-1-yl]prop-2-en-1-one × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;pH 6.4;291 K;2% glycerol, 8% PEG 4000, 50mM sodium acetate, 10mM MgCl2
|
分辨率 2.69 Å
R-free 0.237
|
|
7PVY
Crystal structure of the c-Src SH3 domain E93V-S94A-R95S-T96G mutant
提交 2021-10-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
81–141(61 aa)
|
突变:E93V, S94A, R95S,T96G
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 8;298 K;1.5 M ammonium sulfate, 5% PEG 4000, 0.1M Tris
|
分辨率 1.40 Å
R-free 0.225
|
|
7PVZ
Crystal structure of the intertwined dimer of the c-Src SH3 domain E93V-S94A-R95S-T96G mutant
提交 2021-10-05
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白同源多聚体
同源多聚体;蛋白 × 2
PDB 声明:dimeric
|
链 A
81–141(61 aa)
链 B
81–141(61 aa)
|
突变:E93V, S94A, R95S,T96G
突变:E93V, S94A, R95S,T96G
|
未记录非水小分子
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP;pH 5;298 K;1.5 M ammonium sulfate, 5 % PEG 300, 0.1M AcONa
|
分辨率 2.00 Å
R-free 0.256
|
|
7WF5
c-Src in complex with ponatinib
提交 2021-12-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
未记录
|
0LI 3-(imidazo[1,2-b]pyridazin-3-ylethynyl)-4-methyl-N-{4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}benzam ide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1M MES (pH 6.4), 50mM sodium acetate, 10mM MgCl2, 2% glycerol, 8% PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.183
|
|
7WF5
c-Src in complex with ponatinib
提交 2021-12-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
0LI 3-(imidazo[1,2-b]pyridazin-3-ylethynyl)-4-methyl-N-{4-[(4-methylpiperazin-1-yl)methyl]-3-(trifluoromethyl)phenyl}benzam ide × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;0.1M MES (pH 6.4), 50mM sodium acetate, 10mM MgCl2, 2% glycerol, 8% PEG 4000
|
分辨率 1.80 Å
R-free 0.183
|
|
8K79
Crystal structure of c-SRC kinase domain bound by TPX-0022
提交 2023-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 A
251–533(283 aa)
|
未记录
|
IYC Elzovantinib × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;2% glycerol, 8% PEG 4000, 50mM sodium acetate, 10mM MgCl2
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.277
|
|
8K79
Crystal structure of c-SRC kinase domain bound by TPX-0022
提交 2023-07-26
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
|
Assembly 2
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
|
链 B
251–533(283 aa)
|
未记录
|
IYC Elzovantinib × 1
|
X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP;291 K;2% glycerol, 8% PEG 4000, 50mM sodium acetate, 10mM MgCl2
|
分辨率 2.80 Å
R-free 0.277
|
|
9BT8
Structure of Src in complex with beta-arrestin 1 revealing SH3 binding sites
提交 2024-05-14
|
构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 C
83–533(451 aa)
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突变:R95C, C185S, C238S, C245S, C277S, C400S
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.34 Å
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9CX3
Structure of SH3 domain of Src in complex with beta-arrestin 1
提交 2024-07-30
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聚集状态不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物;蛋白 × 6
PDB 声明:hexameric
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链 C
83–141(59 aa)
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突变:R95C
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未记录非水小分子
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ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
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分辨率 3.47 Å
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9V4E
Crystal Structure of Gallus gallus c-Src Kinase Domain with Point mutation Y416D and Deletion of Residues N414, T417, and R419 Bound to AMP-PNP
提交 2025-05-23
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构建体不同
突变/修饰不同
聚集状态不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白单体
单体;蛋白 × 1
PDB 声明:monomeric
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链 A
251–533(283 aa)
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突变:Y416D/delN414,T417,R419
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未记录非水小分子
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X-RAY DIFFRACTION
mmCIF 未提供已读取条件
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分辨率 1.78 Å
R-free 0.241
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