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9ehz

Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 157.4 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

物种未注明

UniProt O15514

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–142 未记录 DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 l 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 21 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

物种未注明

UniProt P19388

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–210 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–210（210 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 4 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 56 个其他 PDB 条目、56 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

物种未注明

UniProt P61218

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–127 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–127（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DTH Solution structure of RPB6, common subunit of RNA polymerases I, II, and III 提交 2021-01-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–127（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR样品组成 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7DTI Solution structure of the complex between RNA polymerase subunit RPB6 and TFIIH p62 PH domain 提交 2021-01-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–127（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR样品组成 0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 0.38 mM TFIIH p62, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 0.38 mM TFIIH p62, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH p62, 0.38 mM RPB6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH p62, 0.38 mM RPB6, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 5 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

物种未注明

UniProt P62487

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 1–172 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 k 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 21 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB7_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt P52434

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 1–150 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2F3I Solution Structure of a Subunit of RNA Polymerase II 提交 2005-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–150（150 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM；压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM RNA Polymerase II Subunit U-15N,13C | 20mM potassium phosphate buffer, 10mM DTT; 90% H2O, 10% D2O
分辨率未提供
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–150（150 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 6 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 57 个其他 PDB 条目、57 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P36954

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–125 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 7 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB9_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

物种未注明

UniProt P62875

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–67 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–67（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 8 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 54 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a

物种未注明

UniProt P52435

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–117 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 9 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RPB11_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4

物种未注明

UniProt P53803

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 1–58 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–58（58 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 a 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 56 个其他 PDB 条目、56 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1

物种未注明

UniProt P24928

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–1970 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2GHQ CTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide C-terminal domain of RNA polymerase II 提交 2006-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1795–1803（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；(1)0.5M Ammonium sulfate, 0.2M Lithium sulfate, 100mM HEPES 7.5 (2) 1M sodium tartrate, 100mM Tris pH 8.5 , pH 7.5 - 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.05 Å R-free 0.248
2GHQ CTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide C-terminal domain of RNA polymerase II 提交 2006-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1795–1803（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；(1)0.5M Ammonium sulfate, 0.2M Lithium sulfate, 100mM HEPES 7.5 (2) 1M sodium tartrate, 100mM Tris pH 8.5 , pH 7.5 - 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.05 Å R-free 0.248
2GHT CTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide from C-terminal domain of RNA polymerase II 提交 2006-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1796–1803（8 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；(1) 0.5M Ammonium sulfate, 0.2M Lithium sulfate, 100mM HEPES 7.5 (2) 2M sodium tartrate, 100mM Tris pH 8.5, pH 7.5 - 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
2GHT CTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide from C-terminal domain of RNA polymerase II 提交 2006-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1796–1803（8 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；(1) 0.5M Ammonium sulfate, 0.2M Lithium sulfate, 100mM HEPES 7.5 (2) 2M sodium tartrate, 100mM Tris pH 8.5, pH 7.5 - 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
2LTO TDRD3 complex 提交 2012-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1804–1816（13 aa） 片段：UNP residues 1804-1816
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；293.15 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient
NMR样品组成 1.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_1, 50 mM sodium phosphate, 10 mM beta-mercaptoethanol, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
4JXT CID of human RPRD1A in complex with a phosphorylated peptide from RPB1-CTD 提交 2013-03-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1612–1630（19 aa） 片段：UNP residues 1612-1630
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；20% PEG-4000, 10% isopropanol, 0.1M HEPES., pH 7.5, vapor diffusion, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.237
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6G0R Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an acetylated POLR2A peptide (K775ac/K778ac) 提交 2018-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 772–782（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20.0 % PEG 6K 10.0 % EtGly 0.1 M HEPES pH 7.0 0.1 M MgCl2
分辨率 1.25 Å R-free 0.175
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 o 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 o 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 1 1–1699（1699 aa）
链 1 1704–1856（153 aa）
链 1 1865–1970（106 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9B9L RPRD1B C-terminal interacting domain bound to a pThr4 CTD peptide 提交 2024-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1616–1630（15 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Co-crystallization of CID with CTD peptide occurred in a reservoir solution of 20-32% PEG3350 and 0.1M lithium sulfate. 1:3 molar ratio of protein to peptide was used
分辨率 2.50 Å R-free 0.347
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI2 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to an apo RECQL5 helicase (RECQL5 IRI Module focused-classified) 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9HM8 NMR solution structure of RPRD2 CTD-interacting domain and pS2,7 RNAPII CTD peptide. 提交 2024-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1612–1622（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；293.15 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPRD2 CID, 1 mM pS2pS7 CTD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
9IA7 NMR solution structure of RPRD2 CTD-interacting domain and pT4 RNAPII CTD peptide. 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1612–1623（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；293.15 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPRD2 CID, 1.5 mM pT4 CTD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
9QPX BRCA1 BRCT tandem repeat with RNA polymerase II pSer5-CTD peptide 提交 2025-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1615–1628（14 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M PCB buffer (sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane in the molar ratios 2:1:2) pH 6, 25%PEG 1500
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
9QPX BRCA1 BRCT tandem repeat with RNA polymerase II pSer5-CTD peptide 提交 2025-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1615–1628（14 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M PCB buffer (sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane in the molar ratios 2:1:2) pH 6, 25%PEG 1500
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
9QPX BRCA1 BRCT tandem repeat with RNA polymerase II pSer5-CTD peptide 提交 2025-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1615–1628（14 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M PCB buffer (sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane in the molar ratios 2:1:2) pH 6, 25%PEG 1500
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 1 1–1970（1970 aa）
链 m 1618–1631（14 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 33 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–1970； UniProt 1–1970

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

物种未注明

UniProt P30876

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 1–1174 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 2 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–1174； UniProt 1–1174

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

物种未注明

UniProt P19387

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：pentadecameric（15） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–275 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P53803） Non-template DNA, nucleic acid scaffold × 1 RNA, nucleic acid scaffold × 1 Template DNA, nucleic acid scaffold × 1 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 8 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.60 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 9EHZ Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYC Human core-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 3 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9ehz

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9ehz
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9ehz
沉积日期 deposition_date2024-11-25
结构标题 titleCryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State
关键词 keywordstranslocation, Human RNA polymerase II, TRANSCRIPTION, TRANSFERASE-DNA-RNA complex; TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA/RNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier49.92 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron49.74 Å
零角强度 I(0) i03149710000.00
分子量 molecular_weight458900.0 kDa
排除体积 excluded_volume569950 ų
包络体积 envelope_volume768700 ų
水化壳体积 shell_volume121450 ų
包络直径 envelope_diameter167.0 Å
壳层 Rg shell_rg58.49 Å
包络 Rg envelope_rg49.74 Å
形状 Rg shape_rg49.77 Å
总 Rg total_rg49.88 Å
总原子数 total_atoms32125
残基数 n_residues3952
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax157.4 Å
Rg (实空间) rg_real49.76 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.92 Å
I(0) (实空间) i0_real3.1500e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.5260e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal50.04 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal3151000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8702
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary63.9 Å
偏度 Skewness skewness0.223
峰度 Kurtosis kurtosis-0.378
角度范围 angular_range— – 0.1600 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha564200000.0000
实空间数据点数 n_real_points33
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.898; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.968; Smooth: 0.648
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (17)

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8. 引用文献 (2)

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9. 文件与曲线 (10)