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Respiratory Syncytial Virus Fusion protein in the postfusion conformation in complex with monoclonal antibody 131-2a Fab

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 112.5 Å Quality: REASONABLE

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fusion glycoprotein F0

human respiratory syncytial virus

UniProt P03420

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 26–105 链 B; UniProt 26–105 链 C; UniProt 26–105 链 D; UniProt 137–515 链 E; UniProt 137–515 链 F; UniProt 137–515 未记录 131-2a heavy chain × 1 131-2a light chain × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 52 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 FUS_HRSVA
Isoform
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–80; UniProt 26–105 作者链 B; PDB构建体 1–80; UniProt 26–105 作者链 C; PDB构建体 1–80; UniProt 26–105 作者链 D; PDB构建体 1–379; UniProt 137–515 作者链 E; PDB构建体 1–379; UniProt 137–515 作者链 F; PDB构建体 1–379; UniProt 137–515

Fusion glycoprotein F1,Probable N-acetylmuramidase

human respiratory syncytial virus

UniProt A2RHZ5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 8 PDB 声明:octameric(8) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 220–320 链 E; UniProt 220–320 链 F; UniProt 220–320 未记录 Fusion glycoprotein F0 × 3 (P03420) 131-2a heavy chain × 1 131-2a light chain × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.4 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.10 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

数据库中没有找到同一 UniProt 蛋白的其他 PDB 条目。

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ACMA_LACLM
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 411–511; UniProt 220–320 作者链 E; PDB构建体 411–511; UniProt 220–320 作者链 F; PDB构建体 411–511; UniProt 220–320

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9hvw

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9hvw
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9hvw
沉积日期 deposition_date2025-01-02
结构标题 titleRespiratory Syncytial Virus Fusion protein in the postfusion conformation in complex with monoclonal antibody 131-2a Fab
关键词 keywordsantigenic site I, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier33.34
回转半径 Rg (电子) rg_electron33.07
零角强度 I(0) i0253266000.00
分子量 molecular_weight127810.0 kDa
排除体积 excluded_volume160020 ų
包络体积 envelope_volume199210 ų
水化壳体积 shell_volume49930 ų
包络直径 envelope_diameter121.5
壳层 Rg shell_rg39.96
包络 Rg envelope_rg33.13
形状 Rg shape_rg33.06
总 Rg total_rg33.60
总原子数 total_atoms8950
残基数 n_residues1149
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax112.5
Rg (实空间) rg_real33.33
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.84
I(0) (实空间) i0_real2.5330e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.0420e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal33.34
I(0) (倒空间) i0_reciprocal253300000.0000
解质量估计 total_estimate0.6529
解质量评级 solution_quality REASONABLE a REASONABLE solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary40.7
偏度 Skewness skewness0.412
峰度 Kurtosis kurtosis-0.044
角度范围 angular_range— – 0.2350 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha47140000.0000
实空间数据点数 n_real_points48
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.777; Stabil: 1.000; Sysdev: 0.078; Positv: 1.000; Valcen: 0.995; Smooth: 0.922

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)