9i3i

Cryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication.

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 232.6 Å Quality: GOOD

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Origin recognition complex subunit 1

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P54784

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 A; UniProt 1–914 未记录 Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 25 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC1_YEAST
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 36–949; UniProt 1–914

Origin recognition complex subunit 2

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P32833

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 B; UniProt 1–620 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC2_YEAST
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–620; UniProt 1–620

Origin recognition complex subunit 3

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P54790

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 C; UniProt 1–616 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ORC3_YEAST
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–616; UniProt 1–616

Origin recognition complex subunit 4

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P54791

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 D; UniProt 1–529 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ORC4_YEAST
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–529; UniProt 1–529

Origin recognition complex subunit 5

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P50874

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 E; UniProt 1–479 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 19 个其他 PDB 条目、19 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ORC5_YEAST
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–479; UniProt 1–479

Origin recognition complex subunit 6

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P38826

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 F; UniProt 1–435 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 18 个其他 PDB 条目、18 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 ORC6_YEAST
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–435; UniProt 1–435

DNA replication licensing factor MCM2

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P29469

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 2; UniProt 1–868 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 51 个其他 PDB 条目、51 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM2_YEAST
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 2; PDB构建体 1–868; UniProt 1–868

DNA replication licensing factor MCM3

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P24279

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 3; UniProt 1–971 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 59 个其他 PDB 条目、59 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM3_YEAST
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 3; PDB构建体 36–1006; UniProt 1–971

DNA replication licensing factor MCM4

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P30665

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 4; UniProt 1–933 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM4_YEAST
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 4; PDB构建体 1–933; UniProt 1–933

Minichromosome maintenance protein 5

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P29496

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 5; UniProt 1–775 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 54 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM5_YEAST
Isoform
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 5; PDB构建体 1–775; UniProt 1–775

DNA replication licensing factor MCM6

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P53091

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 6; UniProt 1–1017 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM7 × 1 (P38132) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM6_YEAST
Isoform
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 6; PDB构建体 1–1017; UniProt 1–1017

DNA replication licensing factor MCM7

Saccharomyces cerevisiae S288C

UniProt P38132

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 12 DNA 2 PDB 声明:14-meric(14) 与全部聚合物数一致 链 7; UniProt 1–845 未记录 Origin recognition complex subunit 1 × 1 (P54784) Origin recognition complex subunit 2 × 1 (P32833) Origin recognition complex subunit 3 × 1 (P54790) Origin recognition complex subunit 4 × 1 (P54791) Origin recognition complex subunit 5 × 1 (P50874) Origin recognition complex subunit 6 × 1 (P38826) DNA replication licensing factor MCM2 × 1 (P29469) DNA replication licensing factor MCM3 × 1 (P24279) DNA replication licensing factor MCM4 × 1 (P30665) Minichromosome maintenance protein 5 × 1 (P29496) DNA replication licensing factor MCM6 × 1 (P53091) DNA (88-MER) × 1 DNA (88-MER) × 1 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 3 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 4 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.6 cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE;10 second incubation, 3.5 seconds single side blotting. 分辨率 4.40 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 55 个其他 PDB 条目、55 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MCM7_YEAST
Isoform
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 7; PDB构建体 1–845; UniProt 1–845

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 9i3i

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 9i3i
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id9i3i
沉积日期 deposition_date2025-01-23
结构标题 titleCryo-EM structure of the MCM-ORC (MO) complex featuring an ORC2 regulatory domain involved in cell cycle regulation of MCM-DH loading for DNA replication.
关键词 keywordsDNA Replication, Origin licensing, MCM2-7 helicase, Origin Recognition Complex, CDK, cell cycle, REPLICATION; REPLICATION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier83.85
回转半径 Rg (电子) rg_electron85.25
零角强度 I(0) i08737340000.00
分子量 molecular_weight765710.0 kDa
排除体积 excluded_volume947110 ų
包络体积 envelope_volume1590000 ų
水化壳体积 shell_volume161880 ų
包络直径 envelope_diameter290.4
壳层 Rg shell_rg74.77
包络 Rg envelope_rg83.17
形状 Rg shape_rg85.27
总 Rg total_rg85.07
总原子数 total_atoms105645
残基数 n_residues6392
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax232.6
Rg (实空间) rg_real80.47
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.02
I(0) (实空间) i0_real8.4160e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.6070e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal80.07
I(0) (倒空间) i0_reciprocal8643000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8785
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary61.2
偏度 Skewness skewness0.476
峰度 Kurtosis kurtosis-0.711
角度范围 angular_range— – 0.0950 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.8562
最高正则化参数 α highest_alpha1625000000.0000
实空间数据点数 n_real_points20
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.827; Stabil: 0.980; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.016

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (18)

8. 引用文献 (2)

9. 文件与曲线 (10)