当前蛋白身份:A0A4X1VYD0 重新检索
本组结构的主要差异维度
组装状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量指标不同

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相关结构差异明细

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PDB 条目 Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法 实验环境 结构质量
7B0Y Structure of a transcribing RNA polymerase II-U1 snRNP complex 提交 2020-11-23 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:25-meric(25) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 56 PDB 声明:58-meric(58) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 30 PDB 声明:32-meric(32) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7OKX Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF (SPT5-KOW5)-ELL2-EAF1 (composite structure) 提交 2021-05-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7OKY Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF-ELL2-EAF1(composite structure) 提交 2021-05-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 9 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
7OL0 Structure of active transcription elongation complex Pol II-DSIF (SPT5-KOW5) 提交 2021-05-18 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7OO3 Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA (Structure1) 提交 2021-05-26 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:eicosameric(20) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7OOB Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-ADPBeF3 (Structure2) 提交 2021-05-27 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
7OOP Pol II-CSB-CSA-DDB1-UVSSA-PAF-SPT6 (Structure 3) 提交 2021-05-28 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 23 PDB 声明:26-meric(26) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7OPC Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 4) 提交 2021-05-31 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7OPD Pol II-CSB-CRL4CSA-UVSSA-SPT6-PAF (Structure 5) 提交 2021-05-31 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 25 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:24-meric(24) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:24-meric(24) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:24-meric(24) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8A3Y Structure of mammalian Pol II-DSIF-SPT6-PAF1-TFIIS-hexasome elongation complex 提交 2022-06-09 Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 27 PDB 声明:30-meric(30) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 40 PDB 声明:42-meric(42) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 38 PDB 声明:40-meric(40) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物;蛋白 × 26 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8OEU Structure of the mammalian Pol II-SPT6 complex (composite structure, Structure 4) 提交 2023-03-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.04 Å
8OEV Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, lacking ELOA latch (composite structure, structure 3) 提交 2023-03-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.86 Å
8OEW Structure of the mammalian Pol II-Elongin complex, lacking the ELOA latch (composite structure, structure 2) 提交 2023-03-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8OF0 Structure of the mammalian Pol II-SPT6-Elongin complex, Structure 1 提交 2023-03-13 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:nonadecameric(19) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
8P4A Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 1 提交 2023-05-20 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8P4B Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 2 提交 2023-05-20 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:hexadecameric(16) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8P4C Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 3 提交 2023-05-20 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8P4D Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 4 提交 2023-05-20 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8P4E Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 5 提交 2023-05-20 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8P4F Structural insights into human co-transcriptional capping - structure 6 提交 2023-05-20 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:octadecameric(18) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 MGT 7N-METHYL-8-HYDROGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SAM S-ADENOSYLMETHIONINE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8QEP RNA polymerase II bound to Alu RNA right arm 提交 2023-09-01 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:11-meric(11) 与蛋白数一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.25
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
8QEQ RNA polymerase II bound to minimal Alu RNA right arm in the alternative conformation 提交 2023-09-01 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:11-meric(11) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.25
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8RBX Structure of Integrator-PP2A bound to a paused RNA polymerase II-DSIF-NELF-nucleosome complex 提交 2023-12-05 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:46-meric(46) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 MN MANGANESE (II) ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 15 PDB 声明:18-meric(18) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:19-meric(19) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 20 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9ER2 PolII-TCR-STK19 structure. 提交 2024-03-22 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9FD2 Structure of Pol II-TC-NER-STK19 complex 提交 2024-05-16 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 19 PDB 声明:22-meric(22) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9FYX Influenza A/H7N9 polymerase pre-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-04 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 PO4 PHOSPHATE ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 0.1 mM MgCl2 4% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9G0A Influenza A/H7N9 polymerase post-cleavage cap-snatching complex 提交 2024-07-07 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:23-meric(23) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 2 G1G 7-METHYL-GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE-5'-(2'-O-METHYL)-GUANOSINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8;20 mM BICINE pH 8.0 150 mM NaCl 3 mM MgCl2 4% glycerol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9HVO Structure of the transcribing Pol II-RECQL5 complex 提交 2024-12-31 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:16-meric(16) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9HVQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-PAF-SPT6-RECQL5 complex 提交 2024-12-31 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 21 PDB 声明:24-meric(24) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.00 Å
9HWG Structure of the transcribing Pol II-TCR-RECQL5 complex 提交 2025-01-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:21-meric(21) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM HEPES pH 7.5, 50 mM KCl, 4 mM MgCl2, 1 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9QEQ Structure of the transcribing Pol II-DSIF-SPT6-U1 snRNP complex 提交 2025-03-10 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 24 PDB 声明:28-meric(28) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5;20 mM Hepes, 100 mM NaCl, 3 mM MgCl2, 0.5 mM TCEP
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9RTT Activated Elongation Complex with IWS1 and ELOF1 提交 2025-07-03 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 22 PDB 声明:25-meric(25) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.01 Å
9RZE State 2 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to proximal upstream H3 提交 2025-07-15 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:34-meric(34) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.53 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 32 PDB 声明:35-meric(35) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24 Assembly 1 其他组合 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:34-meric(34) 与全部聚合物一致
链 J 1–67(67 aa)
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å