当前蛋白身份：P05067
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一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly；同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11EN Structure of Rapidly twisting Amyloid-beta 40 fibril , RT-Ab40(2_1) 提交 2026-02-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 11EO Structure of Rapidly twisting Amyloid-beta 40 fibril , RT-Ab40(C2) 提交 2026-02-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.73 Å |
| 11EP Structure of Rapidly twisting Amyloid-beta 40 fibril , RT-Ab40(C1) 提交 2026-02-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.75 Å |
| 12GB High Resolution Structure of Monomorphic AB1-40 Fibrils 提交 2026-04-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
链 S
672–711（40 aa）
链 T
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；277 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
350 uM [U-13C; U-15N] Amyloid-beta 1-40 fibrils, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1AAP X-RAY CRYSTAL STRUCTURE OF THE PROTEASE INHIBITOR DOMAIN OF ALZHEIMER'S AMYLOID BETA-PROTEIN PRECURSOR 提交 1990-09-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
287–344（58 aa）
片段：INHIBITOR DOMAIN
链 B
287–344（58 aa）
片段：INHIBITOR DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 1.50 Å |
| 1AMB SOLUTION STRUCTURE OF RESIDUES 1-28 OF THE AMYLOID BETA-PEPTIDE 提交 1994-10-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–699（28 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1AMC SOLUTION STRUCTURE OF RESIDUES 1-28 OF THE AMYLOID BETA-PEPTIDE 提交 1994-11-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–699（28 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1AML THE ALZHEIMER`S DISEASE AMYLOID A4 PEPTIDE (RESIDUES 1-40) 提交 1995-02-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1BA4 THE SOLUTION STRUCTURE OF AMYLOID BETA-PEPTIDE (1-40) IN A WATER-MICELLE ENVIRONMENT. IS THE MEMBRANE-SPANNING DOMAIN WHERE WE THINK IT IS? NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-04-07 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
片段：ABETA
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.1；298 K
|
分辨率未提供 |
| 1BA6 SOLUTION STRUCTURE OF THE METHIONINE-OXIDIZED AMYLOID BETA-PEPTIDE (1-40). DOES OXIDATION AFFECT CONFORMATIONAL SWITCHING? NMR, 10 STRUCTURES 提交 1998-04-22 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
片段：ABETA
|
突变：INS(MO) 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.3；298 K
|
分辨率未提供 |
| 1BJB SOLUTION NMR STRUCTURE OF AMYLOID BETA[E16], RESIDUES 1-28, 14 STRUCTURES 提交 1998-06-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–699（28 aa）
片段：ABETA [F16], RESIDUES 1-28
|
突变：K16E | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.6；296 K；压力 1
NMR样品组成
SDS MICELLES (100MM)/D2O, H2O
|
分辨率未提供 |
| 1BJC SOLUTION NMR STRUCTURE OF AMYLOID BETA[F16], RESIDUES 1-28, 15 STRUCTURES 提交 1998-06-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–699（28 aa）
片段：ABETA [F16], RESIDUES 1-28
|
突变：K16F | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.8；296 K；压力 1
NMR样品组成
SDS MICELLES (100MM)/D2O, H2O
|
分辨率未提供 |
| 1BRC RELOCATING A NEGATIVE CHARGE IN THE BINDING POCKET OF TRYPSIN 提交 1992-12-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 I
287–342（56 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å |
| 1CA0 BOVINE CHYMOTRYPSIN COMPLEXED TO APPI 提交 1997-01-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 D
289–342（54 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.323 |
| 1CA0 BOVINE CHYMOTRYPSIN COMPLEXED TO APPI 提交 1997-01-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
289–342（54 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 4.5；pH 4.5
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.323 |
| 1HZ3 ALZHEIMER'S DISEASE AMYLOID-BETA PEPTIDE (RESIDUES 10-35) 提交 2001-01-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
681–706（26 aa）
片段：RESIDUES 10-35
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.6；283 K；离子强度（mmCIF原始值）<1mM；压力 ambient
NMR样品组成
300uM A-Beta(10-35); 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
300uM A-Beta(1-40) U-15N; 90% H2O, 10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
300 uM A-Beta(10-35) 2H-Val12, -Leu17, -Val18, -Phe19, -Ile32 and -Leu34; 15N-Phe19, -Val24, -Gly25 and -Gly29; 13C-Val24; 13C-Ala21 Beta Methyl; 13C-Ala30 Beta Methyl; 13C-Met35 Delta Methyl | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
300 uM A-Beta(10-35) 2H-Val12, -Leu17, -Phe19, -Val24, -Ile31 and -Leu34; 15N-Val 18, -Phe20, -Gly25, -Gly29 and -Gly33; 13C-Val24; 13C-Ala21 Beta Methyl; 13C-Ala30 Beta Methyl; 13C-Met35 Delta Methyl | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1IYT Solution structure of the Alzheimer's disease amyloid beta-peptide (1-42) 提交 2002-09-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：beta-peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM amyloid beta-peptide (TFA pretreated); 20% H2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 | 20% H2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 (v/v)
NMR样品组成
2.5mM amyloid beta-peptide (TFA pretreated); 20% D2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 | 20% D2O, 80% hexafluoroisopropanol-d2 (v/v)
|
分辨率未提供 |
| 1MWP N-TERMINAL DOMAIN OF THE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN 提交 1999-03-09 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
28–123（96 aa）
片段：HEPARIN BINDING DOMAIN
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.242 |
| 1OWT Structure of the Alzheimer's disease amyloid precursor protein copper binding domain 提交 2003-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
124–189（66 aa）
片段：Copper binding domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 1
NMR样品组成
0.5mM CuBD U-15N,13C; 20mM phosphate buffer | 90% H2O, 10% D20
|
分辨率未提供 |
| 1QCM AMYLOID BETA PEPTIDE (25-35), NMR, 20 STRUCTURES 提交 1996-07-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
696–706（11 aa）
片段：RESIDUES 25 - 35
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 1QWP NMR analysis of 25-35 fragment of beta amyloid peptide 提交 2003-09-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
696–706（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.5；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM abeta(25-35) peptide | hexafluoroisopropanol/water mixture 80/20 v:v
|
分辨率未提供 |
| 1QXC NMR structure of the fragment 25-35 of beta amyloid peptide in 20/80 v:v hexafluoroisopropanol/water mixture 提交 2003-09-05 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
696–706（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.5；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM abeta(25-35) peptide | hexafluoroisopropanol/water 20/80 v:v mixture
|
分辨率未提供 |
| 1QYT Solution structure of fragment (25-35) of beta amyloid peptide in SDS micellar solution 提交 2003-09-12 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
696–706（11 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.15；300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM abeta(25-35) peptide | 100mM SDS solution
|
分辨率未提供 |
| 1TAW BOVINE TRYPSIN COMPLEXED TO APPI 提交 1996-12-19 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
287–344（58 aa）
片段：;RESIDUES 289 - 342 OF ALZHEIMER'S AMYLOID BETA-PROTEIN PRECURSOR
;
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 6.5；pH 6.5
|
分辨率 1.80 Å |
| 1TKN Solution structure of CAPPD*, an independently folded extracellular domain of human Amyloid-beta Precursor Protein 提交 2004-06-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
460–569（110 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride；压力 1
NMR样品组成
0.85 mM U-15N CAPPD*, 50mM sodium phosphate, 250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.85 mM U-15N,13C CAPPD*, 50mM sodium phosphate, 250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.8 mM 10% 13C CAPPD*, 50mM sodium phosphate, 250 mM NaCl, 300 mM guanidinium chloride | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1X11 X11 PTB DOMAIN 提交 1997-07-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
754–766（13 aa）
链 D
754–766（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.304 |
| 1X11 X11 PTB DOMAIN 提交 1997-07-28 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 C
754–766（13 aa）
链 D
754–766（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.304 |
| 1X11 X11 PTB DOMAIN 提交 1997-07-28 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 C
754–766（13 aa）
链 D
754–766（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；pH 7.5
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.304 |
| 1Z0Q Aqueous Solution Structure of the Alzheimer's Disease Abeta Peptide (1-42) 提交 2005-03-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：Beta-peptide
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
300 K；压力 ambient
NMR样品组成
2mM beta peptide (TFA pretreated); 70% H2O, 30% hexafluoroisopropanol-d2 | 70% H2O, 30% hexafluoroisopropanol-d2
|
分辨率未提供 |
| 1ZE7 Zinc-binding domain of Alzheimer's disease amyloid beta-peptide in water solution at pH 6.5 提交 2005-04-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–687（16 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
2.8mM in 50mM sodium phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1ZE9 Zinc-binding domain of Alzheimer's disease amyloid beta-peptide complexed with a zinc (II) cation 提交 2005-04-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–687（16 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR样品组成
2.8mM in 50mM sodium phosphate buffer | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 1ZJD Crystal Structure of the Catalytic Domain of Coagulation Factor XI in Complex with Kunitz Protease Inhibitor Domain of Protease Nexin II 提交 2005-04-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
289–345（57 aa）
片段：Inhibitory Domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；283 K；Sodium Formate, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 283K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.255 |
| 21FB Structure of minor species of Abeta fibrils from AppNL-FPsen1P117L mice 提交 2025-12-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
链 K
672–713（42 aa）
链 L
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 2BEG 3D Structure of Alzheimer's Abeta(1-42) fibrils 提交 2005-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
链 B
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
链 C
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
链 D
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
链 E
672–713（42 aa）
片段：Beta-amyloid protein 42
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率未提供 |
| 2BP4 Zinc-binding domain of Alzheimer's disease amyloid beta-peptide in TFE-water (80-20) solution 提交 2005-04-18 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–687（16 aa）
片段：;16-MER FRAGMENT BETWEEN THE BETA AND ALPHA SECRETASES CLEAVAGE SITES OF ALZHEIMER'S DISEASE AMYLOID A4 PROTEIN, RESIDUES 672-687
;
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 3；298 K；压力 1.0
NMR样品组成
80 % TFE-D2OH / 20 % H2O
|
分辨率未提供 |
| 2FJZ Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) copper binding domain (residues 133 to 189) in 'small unit cell' form, metal-free 提交 2006-01-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；28 - 32 % (w/v) PEG 10000, 0.1 M HEPES pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.61 Å R-free 0.209 |
| 2FK1 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'small unit cell' form, Cu(II)-bound 提交 2006-01-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M HEPES pH 8.0, 28 - 32 % (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.232 |
| 2FK2 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'small unit cell' form, Cu(I)-bound 提交 2006-01-03 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU1 COPPER (I) ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1 M HEPES pH 8.0, 28 - 32 % (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.65 Å R-free 0.249 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FK3 Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'large unit cell' form 提交 2006-01-04 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
133–189（57 aa）
片段：Residues 133 to 189
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.4；295 K；0.1 M MES pH 5.4 - 5.6, 0.4 M NaCOOH, 10 - 15 % (w/v) PEG 4000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.248 |
| 2FKL Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain (Residues 126- 189 of APP) 提交 2006-01-04 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
124–189（66 aa）
片段：Residues 124 to 189
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.05；295 K；1.5 M (NH4)H2PO4, pH 4.05, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.263 |
| 2FKL Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain (Residues 126- 189 of APP) 提交 2006-01-04 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
124–189（66 aa）
片段：Residues 124 to 189
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.05；295 K；1.5 M (NH4)H2PO4, pH 4.05, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.263 |
| 2FMA Structure of the Alzheimer's Amyloid Precursor Protein (APP) Copper Binding Domain in 'small unit cell' form, atomic resolution 提交 2006-01-08 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
133–189（57 aa）
片段：Copper Binding Domain(residues 133-189)
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；295 K；0.1M HEPES pH 8.0, 28-32% (w/v) PEG 10000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 0.85 Å R-free 0.150 |
| 2LFM A partially folded structure of amyloid-beta(1 40) in an aqueous environment 提交 2011-07-06 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.3；15 K；离子强度（mmCIF原始值）0.07；压力 ambient
NMR样品组成
20 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 93% H2O/7% D2O | 93% H2O/7% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LLM Structure of amyloid precursor protein's transmembrane domain 提交 2011-11-15 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
686–726（41 aa）
片段：UNP residues 686-726
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 4.6；318 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
0.3-1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] APPjmtm, 21-70 mM [U-100% 2H] DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.3-1 mM [U-100% 15N] APPjmtm, 21-70 mM DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LMN Structural Model for a 40-Residue Beta-Amyloid Fibril with Two-Fold Symmetry, Positive Stagger 提交 2011-12-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
|
分辨率未提供 |
| 2LMO Structural Model for a 40-Residue Beta-Amyloid Fibril with Two-Fold Symmetry, Negative Stagger 提交 2011-12-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
|
分辨率未提供 |
| 2LMP Structural Model for a 40-residue Beta-Amyloid Fibril with Three-Fold Symmetry, Positive Stagger 提交 2011-12-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
|
分辨率未提供 |
| 2LMQ Structural Model for a 40-residue Beta-Amyloid Fibril with Three-Fold Symmetry, Negative Stagger 提交 2011-12-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
selective 13C and 15N beta-amyloid, 10 mM phosphate buffer | 10 mM phosphate buffer
|
分辨率未提供 |
| 2LNQ 40-residue D23N beta amyloid fibril 提交 2012-01-03 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
|
突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N 突变：D23N | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；279 K；压力 ambient
NMR样品组成
25 uM [U-13C] protein, H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 2LOH Dimeric structure of transmembrane domain of amyloid precursor protein in micellar environment 提交 2012-01-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
686–726（41 aa）
片段：UNP residues 686-726
链 B
686–726（41 aa）
片段：UNP residues 686-726
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.2；318 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 ambient
NMR样品组成
0.9 mM [U-100% 15N] APPjmtm, 36 mM DPC, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成
0.75 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] APPjmtm, 0.75 mM APPjmtm, 60 mM [U-98% 2H] DPC, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LP1 The solution NMR structure of the transmembrane C-terminal domain of the amyloid precursor protein (C99) 提交 2012-01-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
671–770（100 aa）
片段：UNP residues 683-728
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.5；318 K；压力 ambient
NMR样品组成
10 % lyso myristoyl phosphatidylglycerol, 10 % [U-2H] D2O, 100 mM imidazole, 250 uM [U-100% 15N] APP_C99, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LZ3 Solution NMR structure of transmembrane domain of amyloid precursor protein WT 提交 2012-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
699–726（28 aa）
链 B
699–726（28 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；313 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium phosphate, 10% D2O | 10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 15N] peptide, sodium phosphate, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2LZ4 Solution NMR structure of transmembrane domain of amyloid precursor protein V44M 提交 2012-09-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
699–726（28 aa）
链 B
699–726（28 aa）
|
突变：V21M 突变：V21M | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；313 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] peptide, sodium phosphate, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5 mM [U-99% 15N] peptide, sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2M4J 40-residue beta-amyloid fibril derived from Alzheimer's disease brain 提交 2013-02-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 B
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 C
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 D
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 E
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 F
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 G
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 H
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 I
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
1-2 mg selectively and uniformly labeled samples beta-amyloid peptide | none
|
分辨率未提供 |
| 2M9R 3D NMR structure of a complex between the amyloid beta peptide (1-40) and the polyphenol epsilon-viniferin glucoside 提交 2013-06-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 23Y (2S,3S)-3-(3,5-dihydroxyphenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)-4-[(E)-2-(4-hydroxyphenyl)ethenyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-6-yl beta-D-glucopyranoside × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
300 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM amyloid peptide, 100% DMSO-d6 | 100% DMSO-d6
|
分辨率未提供 |
| 2M9S 3D NMR structure of a complex between the amyloid beta peptide (1-40) and the polyphenol epsilon-viniferin glucoside 提交 2013-06-19 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 23Y (2S,3S)-3-(3,5-dihydroxyphenyl)-2-(4-hydroxyphenyl)-4-[(E)-2-(4-hydroxyphenyl)ethenyl]-2,3-dihydro-1-benzofuran-6-yl beta-D-glucopyranoside × 2 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
300 K；压力 ambient
NMR样品组成
1 mM amyloid peptide, 100% DMSO-d6 | 100% DMSO-d6
|
分辨率未提供 |
| 2MGT Zinc induced dimer of the metal binding domain 1-16 of human amyloid beta-peptide with Alzheimer's disease pathogenic English mutation H6R 提交 2013-11-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
672–687（16 aa）
片段：metal binding domain, UNP residues 672-687
链 B
672–687（16 aa）
片段：metal binding domain, UNP residues 672-687
|
突变：H6R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：H6R 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.8；274 K；压力 ambient
NMR测量条件
278 K；压力 ambient
NMR样品组成
2 mM protein_1-1, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-2, 40 uM d4 (100%) TSP-3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM protein_1-4, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-5, 40 uM d4 (100%) TSP-6, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
2 mM protein_1-7, 1 mM zinc cloride-8, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-9, 40 uM d4 (100%) TSP-10, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
2 mM protein_1-11, 1 mM zinc cloride-12, 20 mM [U-99% 2H] bis-Tris-13, 40 uM d4 (100%) TSP-14, 100% D2O | 100% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MJ1 NMR structure of the soluble A beta 17-34 peptide 提交 2013-12-23 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
688–705（18 aa）
片段：UNP RESIDUES 688-705
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；278 K；离子强度（mmCIF原始值）0.12；压力 ambient
NMR样品组成
50 mM sodium phosphate-1, 0.2 uM sodium azide-2, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2MPZ Atomic model of the Abeta D23N "Iowa" mutant using solid-state NMR, EM and Rosetta modeling 提交 2014-06-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 27 PDB 声明：27-meric（27） 与蛋白数一致 |
链 A
686–711（26 aa）
链 B
686–711（26 aa）
链 C
686–711（26 aa）
链 D
686–711（26 aa）
链 E
686–711（26 aa）
链 F
686–711（26 aa）
链 G
686–711（26 aa）
链 H
686–711（26 aa）
链 I
686–711（26 aa）
链 J
686–711（26 aa）
链 K
686–711（26 aa）
链 L
686–711（26 aa）
链 M
686–711（26 aa）
链 N
686–711（26 aa）
链 O
686–711（26 aa）
链 P
686–711（26 aa）
链 Q
686–711（26 aa）
链 R
686–711（26 aa）
链 S
686–711（26 aa）
链 T
686–711（26 aa）
链 U
686–711（26 aa）
链 V
686–711（26 aa）
链 W
686–711（26 aa）
链 X
686–711（26 aa）
链 Y
686–711（26 aa）
链 Z
686–711（26 aa）
链 a
686–711（26 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 ambient
NMR样品组成
25 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] Abeta D23N, solid
|
分辨率未提供 |
| 2MVX Atomic-resolution 3D structure of amyloid-beta fibrils: the Osaka mutation 提交 2014-10-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 B
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 C
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 D
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 E
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 F
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 G
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 H
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 I
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
链 J
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta 突变：E22Delta | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 13C] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 13C]/[U-100% 15N] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 2-13C-glucose; U-100% 15N] amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
15 mg/mL [U-100% 13C; U-100% 15N]/natural abundance amyloid beta, 100% H2O | 100% H2O
|
分辨率未提供 |
| 2MXU 42-Residue Beta Amyloid Fibril 提交 2015-01-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 J
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 K
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 L
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；283 K；压力 ambient
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] AB42, 10 mM sodium phosphate, 100% H2O | 100% H2O
|
分辨率未提供 |
| 2NAO Atomic resolution structure of a disease-relevant Abeta(1-42) amyloid fibril 提交 2016-01-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；277 K；压力 ambient
NMR样品组成
100 mM sodium chloride, 100 mM sodium phosphate, 100 uM zinc chloride, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2OTK Structure of Alzheimer Ab peptide in complex with an engineered binding protein 提交 2007-02-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
672–711（40 aa）
片段：residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phophate；压力 ambient
NMR测量条件
pH 7.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20 mM sodium phosphate；压力 ambient
NMR样品组成
400 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Abeta peptide, 400 uM ZAb3 dimers, 20 mM Na-phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
400 uM Abeta peptide, 400 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] ZAb3 dimers, 20 mM Na-phosphate buffer, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 2R0W PFA2 FAB complexed with Abeta1-8 提交 2007-08-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
672–679（8 aa）
片段：octapeptide
|
未记录 | NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.3；295 K；25% PEG-MME 5000, 0.1 M OAc, pH 5.3, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.277 |
| 2WK3 Crystal structure of human insulin-degrading enzyme in complex with amyloid-beta (1-42) 提交 2009-06-05 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
672–713（42 aa）
片段：BETA-AMYLOID PROTEIN 42, RESIDUES 672-713
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.59 Å R-free 0.232 |
| 2WK3 Crystal structure of human insulin-degrading enzyme in complex with amyloid-beta (1-42) 提交 2009-06-05 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
672–713（42 aa）
片段：BETA-AMYLOID PROTEIN 42, RESIDUES 672-713
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.59 Å R-free 0.232 |
| 2Y29 Structure of segment KLVFFA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 16-21), alternate polymorph III 提交 2010-12-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
687–692（6 aa）
片段：SEGMENT KLVFFA, RESIDUES 687-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；AB16-21 FORM III CRYSTALS WERE OBTAINED AFTER THE SEGMENT WAS DISSOLVED IN WATER AT 5 MG/ML AND MIXED WITH 0.2M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M TRIS BUFFER PH 8.5 AND 30% ISOPROPANOL.
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.260 |
| 2Y2A Structure of segment KLVFFA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 16-21), alternate polymorph I 提交 2010-12-14 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
687–692（6 aa）
片段：SEGMENT KLVFFA, RESIDUES 687-692
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.5；AB16-21 FORM I CRYSTALS WERE OBTAINED AFTER THE SEGMENT WAS DISSOLVED IN WATER AT 5 MG/ML AND MIXED WITH 0.2 M AMMONIUM ACETATE, 0.1 M BIS-TRIS PH 5.5, 45 % V/V MPD
|
分辨率 1.91 Å R-free 0.248 |
| 2Y3J Structure of segment AIIGLM from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 30-35) 提交 2010-12-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 B
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 C
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 D
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；AB3035 WAS DISSOLVED IN WATER AT 1MG/ML AND MIXED WITH 2 M SODIUM CHLORIDE, pH 7
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.267 |
| 2Y3J Structure of segment AIIGLM from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 30-35) 提交 2010-12-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 E
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 F
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 G
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
链 H
701–706（6 aa）
片段：RESIDUES 701-706
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7；AB3035 WAS DISSOLVED IN WATER AT 1MG/ML AND MIXED WITH 2 M SODIUM CHLORIDE, pH 7
|
分辨率 1.99 Å R-free 0.267 |
| 2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 B
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 D
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 F
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 2Y3K Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 1 提交 2010-12-21 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 H
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 5.6；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 1.26 M NA PHOSPHATE MONOBASIC MONOHYDRATE, 0.14 M K PHOSPHATE DIBASIC, PH 5.6 (CRYSTAL FORM I)
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.231 |
| 2Y3L Structure of segment MVGGVVIA from the amyloid-beta peptide (Ab, residues 35-42), alternate polymorph 2 提交 2010-12-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 B
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 C
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
链 G
706–713（8 aa）
片段：RESIDUES 706-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 7.5；AB3542 CRYSTALS (FIRST DISSOLVED IN WATER) WERE FOUND IN 1.5-YEAR-OLD TRAYS SET AT 0.5 MG/ML IN 0.1 M HEPES PH 7.5, 0.5 M MG FORMATE (CRYSTAL FORM II)
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.247 |
| 3AYU Crystal structure of MMP-2 active site mutant in complex with APP-drived decapeptide inhibitor 提交 2011-05-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
586–595（10 aa）
片段：UNP residues 586-595
|
未记录 | ZN ZINC ION × 2 CA CALCIUM ION × 3 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.00 Å R-free 0.205 |
| 3DXC Crystal structure of the intracellular domain of human APP in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl,0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.238 |
| 3DXC Crystal structure of the intracellular domain of human APP in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl,0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.238 |
| 3DXD Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668E mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
突变：T668E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.247 |
| 3DXD Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668E mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
突变：T668E | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.247 |
| 3DXE Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668A mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
突变：T668A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3DXE Crystal structure of the intracellular domain of human APP (T668A mutant) in complex with Fe65-PTB2 提交 2008-07-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
739–770（32 aa）
片段：APP intracellular domain, UNP residues 739-770
|
突变：T668A | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 4.6；293 K；3.2 M NaCl, 0.1 M sodium acetate , pH 4.6, VAPOR DIFFUSION, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.241 |
| 3GCI Crystal Structure of the Complex Formed Between a New Isoform of Phospholipase A2 with C-terminal Amyloid Beta Heptapeptide at 2 A Resolution 提交 2009-02-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
707–713（7 aa）
片段：UNP residues 707-713
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；10mM Sodium phosphate, pH 6.0, 1mM CaCl2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 2.04 Å R-free 0.221 |
| 3IFL X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12A11) complex 提交 2009-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；Protein: 15 mg/ml, 10 mM Hepes, pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.1. Reservoir: 32% PEG400, 0.1M Tris pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.206 |
| 3IFN X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-40:12A11) complex 提交 2009-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
672–711（40 aa）
片段：residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Protein: 5.3 mg/ml, 10 mM Hepes, pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:4.5. Reservoir: 0.2M NaCl, 25% Peg 4K, 0.1M Hepes pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.212 |
| 3IFO X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:10D5) complex 提交 2009-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Protein: 15 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:2. Reservoir: 30% PEG4K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.218 |
| 3IFO X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:10D5) complex 提交 2009-07-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；295 K；Protein: 15 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:2. Reservoir: 30% PEG4K, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.15 Å R-free 0.218 |
| 3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.269 |
| 3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 Q
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.269 |
| 3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 R
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.269 |
| 3IFP X-ray structure of amyloid beta peptide:antibody (Abeta1-7:12B4) complex 提交 2009-07-24 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 S
672–678（7 aa）
片段：residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；Protein: 4.1 mg/ml, 10 mM Hepes pH 7.5, 75 mM NaCl. Protein:peptide molar ratio: 1:1.8. Reservoir: 30%PEG8K, 0.1M Hepes pH 7.0, 0.2M (NH4)2SO4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.95 Å R-free 0.269 |
| 3JTI Crystal structure of the complex formed between Phospholipase A2 with beta-amyloid fragment, Lys-Gly-Ala-Ile-Ile-Gly-Leu-Met at 1.8 A resolution 提交 2009-09-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
699–706（8 aa）
片段：UNP residues 699-706
|
未记录 | CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；290 K；10MM SODIUM PHOSPHATE, 1mM CACL2, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 290K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.210 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
链 C
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 10 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 F
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 11 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 G
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 12 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 H
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
链 D
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 2 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
链 H
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
链 G
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 2 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3KTM Structure of the Heparin-induced E1-Dimer of the Amyloid Precursor Protein (APP) 提交 2009-11-25 | Assembly 9 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 E
18–190（173 aa）
片段：UNP residues 18-190
|
未记录 | BU4 (3R)-butane-1,3-diol × 1 SO4 SULFATE ION × 1 ACT ACETATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5；293 K；pH 5.0, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.250 |
| 3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
290–341（52 aa）
片段：UNP residues 290-341
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 9 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.256 |
| 3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
290–341（52 aa）
片段：UNP residues 290-341
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 6 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.256 |
| 3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
290–341（52 aa）
片段：UNP residues 290-341
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 3 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.256 |
| 3L33 Human mesotrypsin complexed with amyloid precursor protein inhibitor(APPI) 提交 2009-12-16 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
290–341（52 aa）
片段：UNP residues 290-341
|
未记录 | FMT FORMIC ACID × 1 CA CALCIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；4M sodium formate solution, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.48 Å R-free 0.256 |
| 3L81 Crystal structure of adaptor protein complex 4 (AP-4) mu4 subunit C-terminal domain, in complex with a sorting peptide from the amyloid precursor protein (APP) 提交 2009-12-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
761–767（7 aa）
片段：C-terminus, residues 761-767
|
未记录 | GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；10% PEG 3350, 10mM magnesium chloride, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15% PEG 6000, 3% trimethylamine N-oxide dihydrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 1.60 Å R-free 0.252 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | Assembly 2 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | Assembly 3 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 C
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | Assembly 4 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 D
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3MOQ Amyloid beta(18-41) peptide fusion with new antigen receptor variable domain from sharks 提交 2010-04-23 | Assembly 5 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
689–712（24 aa）
链 B
689–712（24 aa）
链 C
689–712（24 aa）
链 D
689–712（24 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；20% PEG 6000, 0.2M AMMONIUM CHLORIDE, 0.1M MES, pH 6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298.0K
|
分辨率 2.05 Å R-free 0.249 |
| 3NYJ Crystal Structure Analysis of APP E2 domain 提交 2010-07-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
365–567（203 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | OS OSMIUM ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；pH 5.6；298 K；20% PEG 4000, 20% isopropanol, 0.1M Na Citrate, pH 5.6, vapor diffusion, temperature 298K
|
分辨率 3.20 Å R-free 0.380 |
| 3OVJ Structure of an amyloid forming peptide KLVFFA from amyloid beta in complex with orange G 提交 2010-09-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 B
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 C
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 D
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
|
未记录 | ORA 7-hydroxy-8-[(E)-phenyldiazenyl]naphthalene-1,3-disulfonic acid × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 30% w/v Polyethylene glycol 1,500, 20% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 10% w/v Polyethylene glycol 1,500, 30% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.220 |
| 3OW9 Structure of an amyloid forming peptide KLVFFA from amyloid beta, alternate polymorph II 提交 2010-09-17 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
链 B
687–692（6 aa）
片段：KLVFFA (UNP residues 687-692)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 30% (v/v) Jeffamine M-600, 0.1M Mes pH 6.5 ; 0.05M CsCl, 1mM FDDNP, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.258 |
| 3PZZ Structure of an amyloid forming peptide GAIIGL (29-34) from amyloid beta 提交 2010-12-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
700–705（6 aa）
片段：GAIIGL hexapeptide segment (UNP residues 700-705)
链 B
700–705（6 aa）
片段：GAIIGL hexapeptide segment (UNP residues 700-705)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 14.4% PEG 8000, 0.08 M Na Cacodylate pH 6.5, 0.16 M Calcium Acetate, 20% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.29 Å R-free 0.196 |
| 3Q2X Structure of an amyloid forming peptide NKGAII (residues 27-32) from amyloid beta 提交 2010-12-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
698–703（6 aa）
片段：NKGAII hexapeptide segment (UNP residues 698-703)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；291 K；reservoir contained 2.4M Sodium Malonate, 15% v/v Glycerol, vapor diffusion, hanging drop, temperature 291K
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.259 |
| 3SV1 Crystal structure of APP peptide bound rat Mint2 PARM 提交 2011-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
754–767（14 aa）
片段：C-terminal peptide, residues 754-767
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 36% PEG200, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.301 |
| 3SV1 Crystal structure of APP peptide bound rat Mint2 PARM 提交 2011-07-12 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
754–767（14 aa）
片段：C-terminal peptide, residues 754-767
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 36% PEG200, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.301 |
| 3SV1 Crystal structure of APP peptide bound rat Mint2 PARM 提交 2011-07-12 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
754–767（14 aa）
片段：C-terminal peptide, residues 754-767
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 36% PEG200, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 3.30 Å R-free 0.301 |
| 3U0T Fab-antibody complex 提交 2011-09-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
701–711（11 aa）
片段：UNP residues 701-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3U0T Fab-antibody complex 提交 2011-09-29 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
701–711（11 aa）
片段：UNP residues 701-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION | mmCIF 未提供已读取条件 | 分辨率 2.50 Å R-free 0.268 |
| 3UMH X-ray structure of the E2 domain of the human amyloid precursor protein (APP) in complex with cadmium 提交 2011-11-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
370–575（206 aa）
片段：HUMAN AMYLOID PRECURSOR PROTEIN E2 DOMAIN
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 2 CD CADMIUM ION × 9 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 mM HEPES, 1 M sodium acetate, 10 mM MgCl2, 50 mM CdSO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.240 |
| 3UMI X-ray structure of the E2 domain of the human amyloid precursor protein (APP) in complex with zinc 提交 2011-11-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
370–575（206 aa）
片段：HUMAN AMYLOID PRECURSOR PROTEIN E2 DOMAIN
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 ZN ZINC ION × 1 CD CADMIUM ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 mM HEPES, 1 M sodium acetate, 10 mM MgCl2, 50 mM CdSO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.40 Å R-free 0.245 |
| 3UMK X-ray structure of the E2 domain of the human amyloid precursor protein (APP) in complex with copper 提交 2011-11-13 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
370–575（206 aa）
片段：HUMAN AMYLOID PRECURSOR PROTEIN E2 DOMAIN
|
未记录 | ACT ACETATE ION × 1 CU COPPER (II) ION × 2 CD CADMIUM ION × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.4；293 K；0.1 mM HEPES, 1 M sodium acetate, 10 mM MgCl2, 50 mM CdSO4, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.60 Å R-free 0.239 |
| 4HIX Crystal structure of a humanised 3D6 Fab bound to amyloid beta peptide 提交 2012-10-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
672–699（28 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；sodium formate, PEG 3350, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.220 |
| 4JFN Crystal structure of the N-terminal, growth factor-like domain of the amyloid precursor protein bound to copper 提交 2013-02-28 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
23–185（163 aa）
片段：growth factor-like domain (GFLD), UNP residues 23-185
|
未记录 | CU COPPER (II) ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；291 K；6% (w/v) PEG 3350, 0.1 M Hepes, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
|
分辨率 1.75 Å R-free 0.230 |
| 4M1C Crystal Structure Analysis of Fab-Bound Human Insulin Degrading Enzyme (IDE) in Complex with Amyloid-Beta (1-40) 提交 2013-08-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 G
672–711（40 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；0.1M Sodium cacodylate, pH6.5, 0.2M MgCl2, 10% PEG-3000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.270 |
| 4M1C Crystal Structure Analysis of Fab-Bound Human Insulin Degrading Enzyme (IDE) in Complex with Amyloid-Beta (1-40) 提交 2013-08-02 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 H
672–711（40 aa）
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；0.1M Sodium cacodylate, pH6.5, 0.2M MgCl2, 10% PEG-3000, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 3.50 Å R-free 0.270 |
| 4MDR Crystal structure of adaptor protein complex 4 (AP-4) mu4 subunit C-terminal domain D190A mutant, in complex with a sorting peptide from the amyloid precursor protein (APP) 提交 2013-08-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
758–767（10 aa）
片段：C-terminus, residues 761-767
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；15% PEG 6000, 3% trimethylamine N-oxide dihydrate, 0.1M HEPES, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295.0K
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.260 |
| 4MVI Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin US7) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta(1-40) 提交 2013-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.25；293 K；30 % (w/v) PEG 4000, 100 mM sodium acetate, pH 5.25, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 1.70 Å R-free 0.212 |
| 4MVK Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin US7) in complex with the Alzheimer amyloid peptide fragment VFFAED 提交 2013-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
689–694（6 aa）
片段：UNP residues 689-694
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；293 K；27 % (w/v) PEG 8000, 100 mM MES, pH 6.5, vapor diffusion, hanging drop, temperature 293K
|
分辨率 1.50 Å R-free 0.186 |
| 4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 F
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 | Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 G
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 4MVL Crystal structure of an engineered lipocalin (Anticalin H1GA) in complex with the Alzheimer amyloid peptide Abeta1-40 提交 2013-09-24 | Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 H
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 672-711
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；293 K；24 % (w/v) PEG 3350, pH 8.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.279 |
| 4NGE Crystal Structure of Human Presequence Protease in Complex with Amyloid-beta (1-40) 提交 2013-11-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 572-711
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 1 ACT ACETATE ION × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；15.2% w/v PEG8000, 15 mM TCEP, 80 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 160 mM calcium acetate, 20% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4NGE Crystal Structure of Human Presequence Protease in Complex with Amyloid-beta (1-40) 提交 2013-11-01 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
672–711（40 aa）
片段：UNP residues 572-711
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；291.15 K；15.2% w/v PEG8000, 15 mM TCEP, 80 mM sodium cacodylate, pH 6.5, 160 mM calcium acetate, 20% v/v glycerol, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291.15K
|
分辨率 2.70 Å R-free 0.232 |
| 4OJF Humanised 3D6 Fab complexed to amyloid beta 1-8 提交 2014-01-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
672–679（8 aa）
片段：UNP residues 672-679
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；293 K；0.1M HEPES, 25%(w/v) PEG 6000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.215 |
| 4ONF Fab fragment of 3D6 in complex with amyloid beta 1-7 提交 2014-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
672–678（7 aa）
片段：unp residues 672-678
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9；295 K；30% Peg400, 0.1 M Tris, pH 9.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.203 |
| 4ONG Fab fragment of 3D6 in complex with amyloid beta 1-40 提交 2014-01-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
672–711（40 aa）
片段：unp residues 672-711
|
未记录 | ZN ZINC ION × 27 IMD IMIDAZOLE × 3 CL CHLORIDE ION × 11 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；2.5 M NaCl, 0.1 Imidazole pH 8.0, 0.2 ZnAc2., VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 295K
|
分辨率 2.20 Å R-free 0.227 |
| 4PQD The longer crystal structure of the grow factor like domain from Beta amypoid precusor protein (APP22-126) 提交 2014-03-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
22–126（105 aa）
片段：the N-terminal GFLD doamin of APP, UNP residues 22-126
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；288 K；60% v/v TacsimateTM pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 288K
|
分辨率 1.33 Å R-free 0.186 |
| 4PWQ HIGH-RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE E1-DOMAIN of THE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN 提交 2014-03-21 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
18–190（173 aa）
片段：E1 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；283 K；0.1M Na-citrate, 20% PEG4000, 11% 2-propanole, 10mM sarcosine, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.185 |
| 4PWQ HIGH-RESOLUTION CRYSTAL STRUCTURE OF THE E1-DOMAIN of THE AMYLOID PRECURSOR PROTEIN 提交 2014-03-21 | Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 B
18–190（173 aa）
片段：E1 domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；283 K；0.1M Na-citrate, 20% PEG4000, 11% 2-propanole, 10mM sarcosine, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 283K
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.185 |
| 4XXD Crystal Structure of mid-region amyloid beta capture by solanezumab 提交 2015-01-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 C
683–699（17 aa）
片段：UNP residues 683-699
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；PEG 3350, sodium citrate
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.290 |
| 4XXD Crystal Structure of mid-region amyloid beta capture by solanezumab 提交 2015-01-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 F
683–699（17 aa）
片段：UNP residues 683-699
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4；292 K；PEG 3350, sodium citrate
|
分辨率 2.41 Å R-free 0.290 |
| 5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 R
675–681（7 aa）
片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
675–681（7 aa）
片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 | Assembly 3 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 S
675–681（7 aa）
片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 2 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 5AM8 Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 4-10 提交 2015-03-10 | Assembly 4 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Q
675–681（7 aa）
片段：FRAGMENT 4-10, UNP RESIDUES 675-681
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 SO4 SULFATE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 5 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.224 |
| 5AMB Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 35-42 提交 2015-03-10 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 P
706–713（8 aa）
片段：UNP RESIDUES 706-713
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 3 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/ BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.181 |
| 5AMB Crystal structure of the Angiotensin-1 converting enzyme N-domain in complex with amyloid-beta 35-42 提交 2015-03-10 | Assembly 2 其他组合 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 Q
706–713（8 aa）
片段：UNP RESIDUES 706-713
|
未记录 | ZN ZINC ION × 1 CL CHLORIDE ION × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1 P6G HEXAETHYLENE GLYCOL × 2 PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
pH 8.5；0.06 M DIVALENT CATIONS, 0.1 M TRIS/ BICINE PH 8.5, 30 % PEG550MME/PEG20000
|
分辨率 1.55 Å R-free 0.181 |
| 5BUO A receptor molecule 提交 2015-06-04 | Assembly 1 其他组合 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
351–691（341 aa）
片段：UNP Residues 351-691
链 B
351–691（341 aa）
片段：UNP Residues 351-691
|
未记录 | ZN ZINC ION × 6 CA CALCIUM ION × 1 GOL GLYCEROL × 3 ACT ACETATE ION × 1 SCN THIOCYANATE ION × 3 SO4 SULFATE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；PEG3350, ammonium acetate, bis-tris, zinc, thiocyanate
|
分辨率 2.31 Å R-free 0.241 |
| 5C67 Human Mesotrypsin in complex with amyloid precursor protein inhibitor variant APPI-M17G/I18F/F34V 提交 2015-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
294–346（53 aa）
|
突变：M15G, I16F, F32V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5, and 20% PEG-1000
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.267 |
| 5C67 Human Mesotrypsin in complex with amyloid precursor protein inhibitor variant APPI-M17G/I18F/F34V 提交 2015-06-22 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
294–346（53 aa）
|
突变：M15G, I16F, F32V | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1 M ammonium sulfate, 0.1 M Tris pH 7.5, and 20% PEG-1000
|
分辨率 1.83 Å R-free 0.267 |
| 5CSZ CRYSTAL STRUCTURE OF GANTENERUMAB FAB FRAGMENT IN COMPLEX WITH ABETA 1-11 提交 2015-07-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
672–682（11 aa）
片段：UNP residues 672-682
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25 % PEG 3350, 0.1M Bis-Tris 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 5CSZ CRYSTAL STRUCTURE OF GANTENERUMAB FAB FRAGMENT IN COMPLEX WITH ABETA 1-11 提交 2015-07-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
672–682（11 aa）
片段：UNP residues 672-682
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 1 SO4 SULFATE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；25 % PEG 3350, 0.1M Bis-Tris 6.5, 0.2 M ammonium sulfate
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.230 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOX X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. Synchrotron data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33Sar 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.1；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 29% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 1.90 Å R-free 0.250 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 B
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 C
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5HOY X-ray crystallographic structure of an A-beta 17_36 beta-hairpin. X-ray diffractometer data set. (LVFFAEDCGSNKCAII(SAR)LMV). 提交 2016-01-19 | Assembly 5 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 D
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 E
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
链 F
687–707（21 aa）
片段：UNP residues 687-707
|
突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：V24C, G29C, G33SAR 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | JEF O-(O-(2-AMINOPROPYL)-O'-(2-METHOXYETHYL)POLYPROPYLENE GLYCOL 500) × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.9；296 K；0.1 M HEPES Buffer, 27% (v/v) Jeffamine M-600
|
分辨率 2.29 Å R-free 0.276 |
| 5KK3 Atomic Resolution Structure of Monomorphic AB42 Amyloid Fibrils 提交 2016-06-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 18 PDB 声明：octadecameric（18） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 J
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 K
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 L
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 M
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 N
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 O
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 P
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 Q
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 R
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 8；277 K；离子强度（mmCIF原始值）1；压力 1
NMR样品组成
1 mg/uL [U-100% 13C; U-100% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
1 mg/uL [U-30% 13C; U-30% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
1 mg/uL [1,6-13C-glucose, U-100% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
NMR样品组成
1 mg/uL [2-13C-glycerol, U-100% 15N] AB42-M01-42, 20 mM sodium phosphate, 0.2 mM EDTA, 0.02 % sodium azide, 100% H2O | 100% H2O
|
分辨率未提供 |
| 5MYO Structure of Pyroglutamate-Abeta-specific Fab c#6 in complex with human Abeta-pE3-12-PEGb 提交 2017-01-27 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 E
674–683（10 aa）
片段：UNP residues 674-683
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 2 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；286 K；25.5% w/v PEG 4000
15% glycerol
170 mM ammonium sulfate
|
分辨率 1.59 Å R-free 0.215 |
| 5NX1 Combinatorial Engineering of Proteolytically Resistant APPI Variants that Selectively Inhibit Human Kallikrein 6 for Cancer Therapy 提交 2017-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
289–301（13 aa）
片段：UNP residues 289-301
链 C
289–346（58 aa）
片段：UNP residues 289-346
链 D
302–346（45 aa）
片段：UNP residues 302-346
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；293 K；0.2M Ammonium Sulfate, 0.1M Bis-Tris pH 5.5, 25% Polyethylene Glycol 3350
|
分辨率 1.85 Å R-free 0.226 |
| 5NX3 Combinatorial Engineering of Proteolytically Resistant APPI Variants that Selectively Inhibit Human Kallikrein 6 for Cancer Therapy 提交 2017-05-09 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 B
289–301（13 aa）
片段：Inhibitor domain, UNP Residues 294-346
链 C
289–346（58 aa）
片段：Inhibitor domain, UNP Residues 289-346
链 D
306–346（41 aa）
片段：Inhibitor domain, UNP Residues 306-346
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M tri-Na Citrate pH 5.6, 20% 2-propanol , 20% Polyethylene Glycol 4000
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.226 |
| 5OQV Near-atomic resolution fibril structure of complete amyloid-beta(1-42) by cryo-EM 提交 2017-08-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 2；in water
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；2.5 microL sample was applied to the grid, blotted for 2.5 s before plunging.
|
分辨率 4.00 Å |
| 5TXD Structure of amyloid-beta derived peptide - NKGAIF 提交 2016-11-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 Z
698–703（6 aa）
片段：unp residues 698-703
|
未记录 | PO4 PHOSPHATE ION × 8 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；298 K；reservoir contained 20% PEG 3350, 0.2M Potassium Phosphate dibasic
|
分辨率 1.45 Å R-free 0.191 |
| 5VZY Crystal structure of crenezumab Fab in complex with Abeta 提交 2017-05-29 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
682–696（15 aa）
片段：UNP residues 682-696
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；277 K；0.2 M magnesium chloride hexahydrate, 0.1 M Tris hydrochloride pH 8.5, 30% w/v polyethylene glycol 4000
|
分辨率 2.32 Å R-free 0.249 |
| 5W3P ANTIBODY C706 IN COMPLEX WTH BETA-AMYLOID PEPTIDE 1-16 提交 2017-06-08 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 P
671–688（18 aa）
片段：RESIDUES 1-16
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | SO4 SULFATE ION × 4 GOL GLYCEROL × 3 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 4.5；293 K；2.0 M AMMONIUM SULFATE, 0.1 M SODIUM ACETATE, PH 4.5
|
分辨率 1.92 Å R-free 0.236 |
| 6GFI Structure of Human Mesotrypsin in complex with APPI variant T11V/M17R/I18F/F34V 提交 2018-04-30 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
294–346（53 aa）
|
未记录 | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium Chloride, 0.1M Bis-Tris pH 6.8 , 1.42M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.301 |
| 6GFI Structure of Human Mesotrypsin in complex with APPI variant T11V/M17R/I18F/F34V 提交 2018-04-30 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 C
294–346（53 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；0.1M Sodium Chloride, 0.1M Bis-Tris pH 6.8 , 1.42M Ammonium Sulfate
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.301 |
| 6IYC Recognition of the Amyloid Precursor Protein by Human gamma-secretase 提交 2018-12-14 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
688–770（83 aa）
片段：C83
|
突变：V8C | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 6NB9 Amyloid-Beta (20-34) with L-isoaspartate 23 提交 2018-12-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
691–705（15 aa）
片段：residues 20-34
|
突变：L-isoaspartate 23 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件
BATCH；pH 7.6；310 K；0.05M Tris-HCl, 0.15M NaCl, 1% DMSO
|
分辨率 1.05 Å R-free 0.246 |
| 6O4J Amyloid Beta KLVFFAENVGS 16-26 D23N Iowa mutation 提交 2019-02-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
687–697（11 aa）
片段：UNP residues 687-697
链 B
687–697（11 aa）
片段：UNP residues 687-697
|
突变：D23N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 突变：D23N 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON CRYSTALLOGRAPHY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
X-ray结晶条件
UNSPECIFIED
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.283 |
| 6OC9 S8 phosphorylated beta amyloid 40 fibrils 提交 2019-03-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 B
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 C
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 D
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 E
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 F
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 G
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 H
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 I
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
链 J
653–692（40 aa）
片段：residues 616-655
|
未记录 | 2PO PHOSPHONATE × 10 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；280 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1
NMR样品组成
50 uM 13C, 15N-uniformly labeled E3, G9, V18, F20, D23, S26, K28 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled A2, F4, D7, Y10, V24, G25 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled Q15, F19, A21, I31, L34, V36, G37 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled V12, E22, G29, A30, M35 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled E11, L17, N27, I32, G33, G38, V39 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled F19, L34 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled E3, F4, V24, G25, S26 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled V12, F20, E22 beta amyloid peptide, 50 uM 13C, 15N-uniformly labeled I31, G33, V39 beta amyloid peptide, water | water
NMR样品组成
50 uM 2H labeled L17, 2H-CD3 beta amyloid peptide, 50 uM 2H labeled F19, 2H-ring-D5 beta amyloid peptide, 50 2H labeled uM L34, 2H-CD3 beta amyloid peptide, 50 uM 2H labeled M35, 2H-CD3 beta amyloid peptide, 50 uM 2H labeled V36, 2H-CD3 beta amyloid peptide, water | water
NMR样品组成
50 uM 13C selective labeled A2-CH3, V12-CO beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled V18-CO, A21-CH3 beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled V24-CO, A30-CH3 beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled G33-CO, V39-Ca beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled V36-Ca, G38-CO beta amyloid peptide, 50 uM 13C selective labeled G9-CO beta amyloid peptide, water | water
|
分辨率未提供 |
| 6RHY Structure of pore-forming amyloid-beta tetramers 提交 2019-04-23 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 8.5；310.15 K；压力 1
NMR测量条件
pH 9.5；310.15 K；压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-15N] Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N; U-2H] Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-2H,13C,15N]-Ile-[13CH3]d1, Ala-[13CH3], Leu/Val-[13CH3]proR Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
1 mM [U-2H,15N]-Ile-[13CH3]d1, Ala-[13CH3], Leu/Val-[13CH3]proR Amyloid-beta A4 protein, 10 mM [U-2H] TRIS-d11, 28.5 mM [U-2H] DPC-d38, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6SHS Abeta fibril (Morphology I) 提交 2019-08-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
616–655（40 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
616–655（40 aa）
链 E
616–655（40 aa）
链 F
616–655（40 aa）
链 G
616–655（40 aa）
链 H
616–655（40 aa）
链 I
616–655（40 aa）
链 J
616–655（40 aa）
链 K
616–655（40 aa）
链 L
616–655（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 6SZF Solution structure of the amyloid beta-peptide (1-42) 提交 2019-10-02 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.4；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
0.5 mM Amyloid beta-peptide (1-42), 50% H2O/50% HFIP | 50% H2O/50% HFIP
|
分辨率未提供 |
| 6TI5 A New Structural Model of Abeta(1-40) Fibrils 提交 2019-11-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
616–655（40 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
616–655（40 aa）
链 E
616–655（40 aa）
链 F
616–655（40 aa）
链 G
616–655（40 aa）
链 H
616–655（40 aa）
链 I
616–655（40 aa）
链 J
616–655（40 aa）
链 K
616–655（40 aa）
链 L
616–655（40 aa）
链 M
616–655（40 aa）
链 N
616–655（40 aa）
链 O
616–655（40 aa）
链 P
616–655（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 8.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
100 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid beta peptide 1-40, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 6TI6 Mixing Abeta(1-40) and Abeta(1-42) peptides generates unique amyloid fibrils 提交 2019-11-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
598–639（42 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
598–639（42 aa）
链 E
616–655（40 aa）
链 F
598–639（42 aa）
链 G
616–655（40 aa）
链 H
598–639（42 aa）
链 I
616–655（40 aa）
链 J
598–639（42 aa）
链 K
616–655（40 aa）
链 L
598–639（42 aa）
链 M
616–655（40 aa）
链 N
598–639（42 aa）
链 O
616–655（40 aa）
链 P
598–639（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 8.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
70 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 30 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
50 uM Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 6TI7 Mixing Abeta(1-40) and Abeta(1-42) peptides generates unique amyloid fibrils 提交 2019-11-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 16 PDB 声明：hexadecameric（16） 与蛋白数一致 |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
598–639（42 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
598–639（42 aa）
链 E
616–655（40 aa）
链 F
598–639（42 aa）
链 G
616–655（40 aa）
链 H
598–639（42 aa）
链 I
598–639（42 aa）
链 J
616–655（40 aa）
链 K
598–639（42 aa）
链 L
616–655（40 aa）
链 M
598–639（42 aa）
链 N
616–655（40 aa）
链 O
598–639（42 aa）
链 P
616–655（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 8.5；283 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 1
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
70 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-40, 30 uM Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
50 uM Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 13C; U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
NMR样品组成
50 uM [U-100% 13C] Amyloid-beta peptide 1-40, 50 uM [U-100% 15N] Amyloid-beta peptide 1-42, 50 mM ammonium acetate, H2O | H2O
|
分辨率未提供 |
| 6W0O Amyloid-beta(1-40) fibril derived from Alzheimer's disease cortical tissue 提交 2020-03-02 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 1
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 2
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 3
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 4
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 5
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 6
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 | 未声明 |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；10 mM phosphate buffer with 0.01% NaN3 to avoid microbial contamination. Buffers were filtered to avoid contamination.
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；The grids were preblotted for 10 seconds and blotted for 6 seconds before plunging.
NMR测量条件
pH 7.4；297 K；离子强度（mmCIF原始值）10；压力 1
NMR样品组成
100 uM U-15N,13C amyloid-beta(1-40), phosphate buffer | phosphate buffer
|
分辨率 2.77 Å |
| 6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
685–706（22 aa）
链 B
685–706（22 aa）
链 C
685–706（22 aa）
链 D
685–706（22 aa）
链 E
685–706（22 aa）
链 F
685–706（22 aa）
链 G
685–706（22 aa）
链 H
685–706（22 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 7 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.218 |
| 6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
685–706（22 aa）
链 J
685–706（22 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.218 |
| 6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 | Assembly 3 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白数一致 |
链 I
685–706（22 aa）
链 J
685–706（22 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | HEZ HEXANE-1,6-DIOL × 6 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.218 |
| 6WXM X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 16-36 提交 2020-05-11 | Assembly 4 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 K
685–706（22 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5；296.15 K；0.1 M sodium acetate (pH 5.0), 0.1 M CoCl2, 1.1 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.30 Å R-free 0.218 |
| 6XOV CryoEM structure of human presequence protease in partial closed state 1 提交 2020-07-07 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 B
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.7；20 mM Tris, pH 7.7, 150 mM NaCl, 10mM KCl, 20 mM EDTA and 1 mM 2-mercaptoethanol
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 6YHF Solution NMR Structure of APP TMD 提交 2020-03-29 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP WT, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 6YHI Solution NMR Structure of APP G38L mutant TMD 提交 2020-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP G38L, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 6YHO Solution NMR Structure of APP G38P mutant TM 提交 2020-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
突变：G38P | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP G38P, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 6YHP Solution NMR Structure of APP V44M mutant TMD 提交 2020-03-30 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
突变：V44M | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP V44M, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 6YHX Solution NMR Structure of APP I45T mutant TMD 提交 2020-03-31 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
697–726（30 aa）
片段：Amyloid precursor protein transmembrane domain
|
突变：I45T | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成
500 uM APP I45T, 80% TFE-d2, 20% H2O | 80% TFE-d2, 20% H2O
|
分辨率未提供 |
| 7B3J Dynamic complex between all-D-enantiomeric peptide D3 with wild-type amyloid precursor protein 672-726 fragment (amyloid beta 1-55) 提交 2020-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
579–633（55 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP672-726, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP672-726, 0.2 mM D3cys(MTSL), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP672-726, 0.2 mM (MTSL)cysD3, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7B3K Dynamic complex between all-D-enantiomeric peptide D3 with L723P mutant of amyloid precursor protein (APP) 672-726 fragment (amyloid beta 1-55) 提交 2020-12-01 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
579–633（55 aa）
|
突变：V52P | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 6.9；303 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP_L723P_672-726, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.2 mM [U-13C; U-15N] APP_L723P_672-726, 0.2 mM D3cys(MTSL), 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 7JXN Beta hairpin derived from Abeta17-36 with an F20Cha mutation 提交 2020-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
686–706（21 aa）
链 D
686–706（21 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 2 NA SODIUM ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297.15 K；Bis-Tris buffer, ammonium acetate, and methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.301 |
| 7JXN Beta hairpin derived from Abeta17-36 with an F20Cha mutation 提交 2020-08-27 | Assembly 2 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 B
686–706（21 aa）
链 C
686–706（21 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297.15 K；Bis-Tris buffer, ammonium acetate, and methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.00 Å R-free 0.301 |
| 7JXO Triangular trimer of beta-hairpins derived from Abeta17-36 with an F20Cha mutation 提交 2020-08-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
686–706（21 aa）
链 B
686–706（21 aa）
链 C
686–706（21 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；297.15 K；Tris buffer, MgCl2, and 1,6-hexanediol
|
分辨率 2.81 Å R-free 0.320 |
| 7O1Q Amyloid beta oligomer displayed on the alpha hemolysin scaffold 提交 2021-03-30 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric（7） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8；50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 500 mM NaCl, 250 mM imidazole and 0.38 mM DDM
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 7OW1 Crystal Structure of TAP01 in complex with amyloid beta peptide 提交 2021-06-16 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
674–685（12 aa）
片段：UNP residues 674-683
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | FLC CITRATE ANION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；20% PEG3350
0.2 M ammonium citrate
|
分辨率 1.40 Å R-free 0.200 |
| 7OXN Crystal Structure of TAP01 in complex with cyclised amyloid beta peptide 提交 2021-06-22 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 A
672–685（14 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；292 K；20% PEG 6K
0.1 M HEPES, pH 7.0
0.01 M zinc chloride
|
分辨率 2.50 Å R-free 0.265 |
| 7Q4B Type I beta-amyloid 42 Filaments from Human Brain 提交 2021-10-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 R
672–713（42 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 7Q4M Type II beta-amyloid 42 Filaments from Human Brain 提交 2021-11-01 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | UNX UNKNOWN LIGAND × 10 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 7RTZ X-ray crystallographic structure of a beta-hairpin peptide derived from amyloid beta 14-40 提交 2021-08-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 A
682–711（30 aa）
链 B
682–711（30 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | CL CHLORIDE ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；296.15 K；0.2 M magnesium acetate tetrahydrate, 0.1 M sodium cacodylate trihydrate pH 6.5, and 30% (v/v) 2-methyl-2,4-pentanediol
|
分辨率 2.10 Å R-free 0.293 |
| 7U4P Covalently stabilized triangular trimer composed of Abeta17-36 beta-hairpins 提交 2022-02-28 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
687–707（21 aa）
链 B
687–707（21 aa）
链 C
687–707（21 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298.15 K；0.1 M Tris at pH 8.3, 0.2 M MgCl2, 2.8 M 1,6-hexanediol
|
分辨率 1.80 Å R-free 0.247 |
| 7Y8Q Amyloid-beta assemblage on GM1-containing membranes 提交 2022-06-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLID-STATE NMR |
NMR测量条件
pH 7.4；288 K；离子强度（mmCIF原始值）5；压力 1
NMR样品组成
1 mM [U-13C; U-15N] Amyloid beta(1-40), 8 mM GM1, 2 mM DMPC, none | none
|
分辨率未提供 |
| 8AZS Type I amyloid-beta 42 filaments from high-spin supernatants of aqueous extracts from Alzheimer's disease brains | ABeta42 提交 2022-09-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 H
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8AZT Type II amyloid-beta 42 filaments from high-spin supernatants of aqueous extracts from Alzheimer's disease brains | ABeta42 提交 2022-09-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 B
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8BFA Sarkosyl-extracted AppNL-G-F Abeta42 fibril structure 提交 2022-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；6s blot
|
分辨率 3.00 Å |
| 8BFB Sarkosyl-extracted AppNL-G-F Abeta42 fibril structure (Methoxy-X04-labelled mice) 提交 2022-10-24 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；6s blot
|
分辨率 3.20 Å |
| 8BFZ Amyloid-beta 42 filaments extracted from the human brain with Arctic mutation (E22G) of Alzheimer's disease | ABeta42 提交 2022-10-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 8BG0 Amyloid-beta tetrameric filaments with the Arctic mutation (E22G) from Alzheimer's disease brains | ABeta40 提交 2022-10-27 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
616–655（40 aa）
链 B
616–655（40 aa）
链 C
616–655（40 aa）
链 D
616–655（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 1.99 Å |
| 8C3H Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex a long aspartimide degron peptide 提交 2022-12-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 D
763–770（8 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；274 K；0.5 M (NH4)H2PO4
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.210 |
| 8C3H Cereblon isoform 4 from Magnetospirillum gryphiswaldense in complex a long aspartimide degron peptide 提交 2022-12-23 | Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2） 与蛋白数一致 |
链 E
763–770（8 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | ZN ZINC ION × 1 | X-RAY DIFFRACTION |
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION；274 K；0.5 M (NH4)H2PO4
|
分辨率 1.71 Å R-free 0.210 |
| 8EZD Brain-derived 42-residue amyloid-beta fibril type A 提交 2022-10-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；10mM Na-phosphate, 0.1% sodium azide
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Preblot for 12-13 seconds and blot for 2.5-3.0 seconds before plunging
|
分辨率 2.83 Å |
| 8EZE Brain-derived 42-residue amyloid-beta fibril type B 提交 2022-10-31 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4；10mM Na-phosphate, 0.1% sodium azide
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE；Preblot for 12-13 seconds and blot for 2.5-3.0 seconds before plunging
|
分辨率 2.76 Å |
| 8FF2 Amyloid-beta (1-40) fibrils derived from a CAA patient 提交 2022-12-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 B
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 C
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 D
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 E
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 F
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 G
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 I
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 J
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 K
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.87 Å |
| 8FF3 Amyloid-beta (1-40) fibrils derived from familial Dutch-type CAA patient (population B) 提交 2022-12-07 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 B
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 C
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 a
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 b
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
链 c
653–692（40 aa）
片段：UNP residues 653-692
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.09 Å |
| 8KEW The cryo-EM structure of type1 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-13 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
链 G
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8KF1 The cryo-EM structure of AV-45 bound type1 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
链 G
1–770（770 aa）
链 H
1–770（770 aa）
链 I
1–770（770 aa）
链 J
1–770（770 aa）
链 K
1–770（770 aa）
链 L
1–770（770 aa）
|
未记录 | VW6 4-[2-[6-[2-[2-(2-fluoranylethoxy)ethoxy]ethoxy]pyridin-3-yl]ethyl]-~{N}-methyl-aniline × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8KF3 The cryo-EM structure of type3 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
链 G
1–770（770 aa）
链 H
1–770（770 aa）
链 I
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8KF4 The cryo-EM structure of type1 amyloid beta 42 fibril in AD2 patient. 提交 2023-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8KF5 The cryo-EM structure of type1 amyloid beta 42 fibril in AD3. 提交 2023-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8KF6 The cryo-EM structure of AV-45 bound type3 amyloid beta 42 fibril. 提交 2023-08-15 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 9 PDB 声明：nonameric（9） 与蛋白数一致 |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
链 G
1–770（770 aa）
链 H
1–770（770 aa）
链 I
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 8OL2 Murine type II Abeta fibril from APP23 mouse 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8OL3 Murine type III Abeta fibril from APP/PS1 mouse 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8OL5 Murine type II Abeta fibril from ARTE10 mouse 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 8OL6 Murine type II Abeta fibril from tgAPPSwe mouse 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8OL7 MurineArc type I Abeta fibril from tg-APPArcSwe mouse 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8OLG DI2 Abeta fibril from tg-SwDI mouse 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8OLN DI1 Abeta fibril from tg-SwDI mouse 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8OLO Murine type III Abeta fibril from ARTE10 mouse 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8OLQ DI3 Abeta fibril from tg-SwDI mouse 提交 2023-03-30 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 8OTF Ab typeII filament from Guam ALS/PDC 提交 2023-04-20 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 A
1–770（770 aa）
链 B
1–770（770 aa）
链 C
1–770（770 aa）
链 D
1–770（770 aa）
链 E
1–770（770 aa）
链 F
1–770（770 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 8SEJ Type I beta-amyloid 42 Filaments from Down syndrome 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
680–713（34 aa）
链 B
680–713（34 aa）
链 C
680–713（34 aa）
链 D
680–713（34 aa）
链 E
680–713（34 aa）
链 F
680–713（34 aa）
链 G
680–713（34 aa）
链 H
680–713（34 aa）
链 I
680–713（34 aa）
链 J
680–713（34 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.17 Å |
| 8SEK Type IIIa beta-amyloid 40 Filaments from Down syndrome 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 8SEL Type IIIb beta-amyloid 40 Filaments from Down Syndrome 提交 2023-04-10 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
链 S
672–711（40 aa）
链 T
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8X52 Cryo-EM structure of human gamma-secretase in complex with Abeta49 提交 2023-11-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
540–639（100 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 2 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8X53 Cryo-EM structure of human gamma-secretase in complex with Abeta46 提交 2023-11-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
541–586（46 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3 CLR CHOLESTEROL × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 8X54 Cryo-EM structure of human gamma-secretase in complex with APP-C99 提交 2023-11-16 | Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric（5） 与蛋白数一致 |
链 E
540–639（100 aa）
|
未记录 | NAG 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 6 PC1 1,2-DIACYL-SN-GLYCERO-3-PHOSPHOCHOLINE × 3 CLR CHOLESTEROL × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 8Z9V Amyloid beta and TTR 提交 2024-04-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric（3） 与蛋白数一致 |
链 e
678–713（36 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.82
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 7.84 Å |
| 9CK6 Cryo-EM structure of sarkosyl insoluble amyloid-beta 42 filaments extracted from human brain tissue 提交 2024-07-08 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 R
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.00 Å |
| 9CKI Cryo-EM structure of the poly(4-styrenesulfonic acid-co-maleic acid) [PSCMA]-extractable amyloid-beta 42 oligomer from human brain tissue (Conformation 2) 提交 2024-07-09 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 J
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 3.10 Å |
| 9CO4 Cryo-EM structure of the receptor-bound amyloid-beta 42 oligomer from human brain tissue (Conformation 1) 提交 2024-07-16 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 B
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 C
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 D
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 E
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 F
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 G
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 H
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 I
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
链 J
672–713（42 aa）
片段：UNP residues 672-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 NITROGEN
|
分辨率 2.80 Å |
| 9CZN Type Ic amyloid-beta 42 filaments in dominantly inherited Alzheimer disease with cotton wool plaques 提交 2024-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 B
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 C
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 D
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 E
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 F
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 G
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 H
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 I
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 J
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 K
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 L
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 M
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 N
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 O
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 P
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 Q
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 R
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 S
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 T
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9CZP Type Id amyloid-beta 42 filaments in dominantly inherited Alzheimer disease with cotton wool plaques 提交 2024-08-05 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 B
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 C
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 D
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 E
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 F
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 G
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 H
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 I
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 J
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 K
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 L
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 M
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 N
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 O
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 P
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 Q
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 R
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 S
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
链 T
680–713（34 aa）
片段：UNP residues 680-713
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9FH2 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 1 提交 2024-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.70 Å |
| 9FH3 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 2 提交 2024-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 9FH4 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 3 提交 2024-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.00 Å |
| 9FH5 Cryo-EM Structure of Amyloid-beta Fibrils Carrying the Uppsala AbetaUpp(1-42)delta(19-24) Mutation - Polymorph 4 提交 2024-05-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 20 PDB 声明：20-meric（20） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
链 K
672–713（42 aa）
链 L
672–713（42 aa）
链 M
672–713（42 aa）
链 N
672–713（42 aa）
链 O
672–713（42 aa）
链 P
672–713（42 aa）
链 Q
672–713（42 aa）
链 R
672–713（42 aa）
链 S
672–713（42 aa）
链 T
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 2；30% (v/v) acetonitrile (AcN), 0.1% (v/v) trifluoroacetic acid (TFA) at pH 2 (~300 uM monomer concentration)
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 9IIO J-shaped conformer of amyloid beta (1-40) 提交 2024-06-21 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 40 PDB 声明：40-meric（40） 与蛋白数一致 |
链 2
672–711（40 aa）
链 3
672–711（40 aa）
链 4
672–711（40 aa）
链 5
672–711（40 aa）
链 6
672–711（40 aa）
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
链 S
672–711（40 aa）
链 T
672–711（40 aa）
链 U
672–711（40 aa）
链 V
672–711（40 aa）
链 W
672–711（40 aa）
链 X
672–711（40 aa）
链 Y
672–711（40 aa）
链 Z
672–711（40 aa）
链 a
672–711（40 aa）
链 b
672–711（40 aa）
链 c
672–711（40 aa）
链 d
672–711（40 aa）
链 e
672–711（40 aa）
链 f
672–711（40 aa）
链 g
672–711（40 aa）
链 h
672–711（40 aa）
链 i
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9JAZ Cryo-EM structure of the class I amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at position 23 提交 2024-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 AA
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 BB
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 CC
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 DD
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 EE
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 FF
672–713（42 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.00 Å |
| 9JB0 Cryo-EM structure of the class II amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at position 23 提交 2024-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 AA
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 BB
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 CC
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 DD
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 EE
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 FF
672–713（42 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9JB1 Cryo-EM structure of the type I amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at positions 7 and 23 提交 2024-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 FF
672–713（42 aa）
链 FG
672–713（42 aa）
链 FH
672–713（42 aa）
链 FI
672–713（42 aa）
链 FJ
672–713（42 aa）
链 FK
672–713（42 aa）
链 FL
672–713（42 aa）
链 FM
672–713（42 aa）
链 FN
672–713（42 aa）
链 FO
672–713（42 aa）
链 FP
672–713（42 aa）
链 FQ
672–713（42 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.50 Å |
| 9JB2 Cryo-EM structure of the type II amyloid-beta 42 fibril containing a D-Asp at positions 7 and 23 提交 2024-08-26 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 15 PDB 声明：pentadecameric（15） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 BA
672–713（42 aa）
链 BB
672–713（42 aa）
链 BC
672–713（42 aa）
链 BD
672–713（42 aa）
链 BE
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 CA
672–713（42 aa）
链 CB
672–713（42 aa）
链 CC
672–713（42 aa）
链 CD
672–713（42 aa）
链 CE
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.90 Å |
| 9K0D Cryo-EM structure of Amyloid-beta42-4b polymorph 1 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：18-meric（18） 与蛋白数一致 |
链 B
680–692（13 aa）
链 F
680–692（13 aa）
链 K
680–692（13 aa）
链 L
680–692（13 aa）
链 S
680–692（13 aa）
链 T
680–692（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.60 Å |
| 9K0E Cryo-EM structure of Amyloid-beta42-4b polymorph 2 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
680–692（13 aa）
链 D
680–692（13 aa）
链 E
680–692（13 aa）
链 F
680–692（13 aa）
链 L
680–692（13 aa）
链 M
680–692（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9K0F Cryo-EM structure of Amyloid-beta42-4b polymorph 3 提交 2024-10-15 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：12-meric（12） 与蛋白数一致 |
链 K
680–692（13 aa）
链 N
680–692（13 aa）
链 O
680–692（13 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.80 Å |
| 9LLM Structure of C-Terminal of AB40 Peptide containing GXXXG Motif in SDS Micelles 提交 2025-01-17 | Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric（1） 与蛋白数一致 |
链 A
692–711（20 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 5.2；298 K；离子强度（mmCIF原始值）20；压力 1
NMR样品组成
1 mM AV20, 0.1 mM SDS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 9M5P I-type amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-03-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric（6） 与蛋白数一致 |
链 1
672–711（40 aa）
链 2
672–711（40 aa）
链 3
672–711（40 aa）
链 4
672–711（40 aa）
链 5
672–711（40 aa）
链 6
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9M5Q V-type (V1-type) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-03-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 AL
672–711（40 aa）
链 AM
672–711（40 aa）
链 AN
672–711（40 aa）
链 AO
672–711（40 aa）
链 AP
672–711（40 aa）
链 AQ
672–711（40 aa）
链 AR
672–711（40 aa）
链 AS
672–711（40 aa）
链 AT
672–711（40 aa）
链 AU
672–711（40 aa）
链 AV
672–711（40 aa）
链 AW
672–711（40 aa）
链 AX
672–711（40 aa）
链 AY
672–711（40 aa）
链 AZ
672–711（40 aa）
链 Aa
672–711（40 aa）
链 Ab
672–711（40 aa）
链 Ac
672–711（40 aa）
链 Ad
672–711（40 aa）
链 Ae
672–711（40 aa）
链 Af
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.30 Å |
| 9M5R ES-type (short pitch) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-03-06 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 172 PDB 声明：172-meric（172） 与蛋白数一致 |
链 0
672–711（40 aa）
链 1
672–711（40 aa）
链 2
672–711（40 aa）
链 3
672–711（40 aa）
链 4
672–711（40 aa）
链 5
672–711（40 aa）
链 6
672–711（40 aa）
链 7
672–711（40 aa）
链 8
672–711（40 aa）
链 9
672–711（40 aa）
链 A
672–711（40 aa）
链 A0
672–711（40 aa）
链 A1
672–711（40 aa）
链 A2
672–711（40 aa）
链 A3
672–711（40 aa）
链 A4
672–711（40 aa）
链 A5
672–711（40 aa）
链 A6
672–711（40 aa）
链 A7
672–711（40 aa）
链 A8
672–711（40 aa）
链 A9
672–711（40 aa）
链 AA
672–711（40 aa）
链 AB
672–711（40 aa）
链 AC
672–711（40 aa）
链 AD
672–711（40 aa）
链 AE
672–711（40 aa）
链 AF
672–711（40 aa）
链 AG
672–711（40 aa）
链 AH
672–711（40 aa）
链 AI
672–711（40 aa）
链 AJ
672–711（40 aa）
链 AK
672–711（40 aa）
链 AL
672–711（40 aa）
链 AM
672–711（40 aa）
链 AN
672–711（40 aa）
链 AO
672–711（40 aa）
链 AP
672–711（40 aa）
链 AQ
672–711（40 aa）
链 AR
672–711（40 aa）
链 AS
672–711（40 aa）
链 AT
672–711（40 aa）
链 AU
672–711（40 aa）
链 AV
672–711（40 aa）
链 AW
672–711（40 aa）
链 AX
672–711（40 aa）
链 AY
672–711（40 aa）
链 AZ
672–711（40 aa）
链 Aa
672–711（40 aa）
链 Ab
672–711（40 aa）
链 Ac
672–711（40 aa）
链 Ad
672–711（40 aa）
链 Ae
672–711（40 aa）
链 Af
672–711（40 aa）
链 Ag
672–711（40 aa）
链 Ah
672–711（40 aa）
链 Ai
672–711（40 aa）
链 Aj
672–711（40 aa）
链 Ak
672–711（40 aa）
链 Al
672–711（40 aa）
链 Am
672–711（40 aa）
链 An
672–711（40 aa）
链 Ao
672–711（40 aa）
链 Ap
672–711（40 aa）
链 Aq
672–711（40 aa）
链 Ar
672–711（40 aa）
链 As
672–711（40 aa）
链 At
672–711（40 aa）
链 Au
672–711（40 aa）
链 Av
672–711（40 aa）
链 Aw
672–711（40 aa）
链 Ax
672–711（40 aa）
链 Ay
672–711（40 aa）
链 Az
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 BA
672–711（40 aa）
链 BB
672–711（40 aa）
链 BC
672–711（40 aa）
链 BD
672–711（40 aa）
链 BE
672–711（40 aa）
链 BF
672–711（40 aa）
链 BG
672–711（40 aa）
链 BH
672–711（40 aa）
链 BI
672–711（40 aa）
链 BJ
672–711（40 aa）
链 BK
672–711（40 aa）
链 BL
672–711（40 aa）
链 BM
672–711（40 aa）
链 BN
672–711（40 aa）
链 BO
672–711（40 aa）
链 BP
672–711（40 aa）
链 BQ
672–711（40 aa）
链 BR
672–711（40 aa）
链 BS
672–711（40 aa）
链 BT
672–711（40 aa）
链 BU
672–711（40 aa）
链 BV
672–711（40 aa）
链 BW
672–711（40 aa）
链 BX
672–711（40 aa）
链 BY
672–711（40 aa）
链 BZ
672–711（40 aa）
链 Ba
672–711（40 aa）
链 Bb
672–711（40 aa）
链 Bc
672–711（40 aa）
链 Bd
672–711（40 aa）
链 Be
672–711（40 aa）
链 Bf
672–711（40 aa）
链 Bg
672–711（40 aa）
链 Bh
672–711（40 aa）
链 Bi
672–711（40 aa）
链 Bj
672–711（40 aa）
链 Bk
672–711（40 aa）
链 Bl
672–711（40 aa）
链 Bm
672–711（40 aa）
链 Bn
672–711（40 aa）
链 Bo
672–711（40 aa）
链 Bp
672–711（40 aa）
链 Bq
672–711（40 aa）
链 Br
672–711（40 aa）
链 Bs
672–711（40 aa）
链 Bt
672–711（40 aa）
链 Bu
672–711（40 aa）
链 Bv
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
链 K
672–711（40 aa）
链 L
672–711（40 aa）
链 M
672–711（40 aa）
链 N
672–711（40 aa）
链 O
672–711（40 aa）
链 P
672–711（40 aa）
链 Q
672–711（40 aa）
链 R
672–711（40 aa）
链 S
672–711（40 aa）
链 T
672–711（40 aa）
链 U
672–711（40 aa）
链 V
672–711（40 aa）
链 W
672–711（40 aa）
链 X
672–711（40 aa）
链 Y
672–711（40 aa）
链 Z
672–711（40 aa）
链 a
672–711（40 aa）
链 b
672–711（40 aa）
链 c
672–711（40 aa）
链 d
672–711（40 aa）
链 e
672–711（40 aa）
链 f
672–711（40 aa）
链 g
672–711（40 aa）
链 h
672–711（40 aa）
链 i
672–711（40 aa）
链 j
672–711（40 aa）
链 k
672–711（40 aa）
链 l
672–711（40 aa）
链 m
672–711（40 aa）
链 n
672–711（40 aa）
链 o
672–711（40 aa）
链 p
672–711（40 aa）
链 q
672–711（40 aa）
链 r
672–711（40 aa）
链 s
672–711（40 aa）
链 t
672–711（40 aa）
链 u
672–711（40 aa）
链 v
672–711（40 aa）
链 w
672–711（40 aa）
链 x
672–711（40 aa）
链 y
672–711（40 aa）
链 z
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.60 Å |
| 9OBK A-beta42-Met-R-SO amyloidal fibril 提交 2025-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
685–712（28 aa）
链 B
685–712（28 aa）
链 C
685–712（28 aa）
链 D
685–712（28 aa）
链 E
685–712（28 aa）
链 F
685–712（28 aa）
链 G
685–712（28 aa）
链 H
685–712（28 aa）
链 I
685–712（28 aa）
链 J
685–712（28 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.01 Å |
| 9ONC A-beta42-Met-R-SO amyloidal fibril - class3 提交 2025-05-14 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
688–713（26 aa）
链 B
688–713（26 aa）
链 C
688–713（26 aa）
链 D
688–713（26 aa）
链 E
688–713（26 aa）
链 F
688–713（26 aa）
链 G
688–713（26 aa）
链 H
688–713（26 aa）
链 I
688–713（26 aa）
链 J
688–713（26 aa）
|
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.64 Å |
| 9RIV Population B fibril generated from the Heterotypic interaction of Abeta40 and Medin. 提交 2025-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric（10） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
链 I
672–711（40 aa）
链 J
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 2.63 Å |
| 9RIW Population A fibril generated from the Heterotypic interaction of Abeta40 and Medin. 提交 2025-06-11 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric（8） 与蛋白数一致 |
链 A
672–711（40 aa）
链 B
672–711（40 aa）
链 C
672–711（40 aa）
链 D
672–711（40 aa）
链 E
672–711（40 aa）
链 F
672–711（40 aa）
链 G
672–711（40 aa）
链 H
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9UMH V-type (V2-type) amyloid fibril (40) of Tottori (D7N) mutant 提交 2025-04-22 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 21 PDB 声明：21-meric（21） 与蛋白数一致 |
链 AL
672–711（40 aa）
链 AM
672–711（40 aa）
链 AN
672–711（40 aa）
链 AO
672–711（40 aa）
链 AP
672–711（40 aa）
链 AQ
672–711（40 aa）
链 AR
672–711（40 aa）
链 AS
672–711（40 aa）
链 AT
672–711（40 aa）
链 AU
672–711（40 aa）
链 AV
672–711（40 aa）
链 AW
672–711（40 aa）
链 AX
672–711（40 aa）
链 AY
672–711（40 aa）
链 AZ
672–711（40 aa）
链 Aa
672–711（40 aa）
链 Ab
672–711（40 aa）
链 Ac
672–711（40 aa）
链 Ad
672–711（40 aa）
链 Ae
672–711（40 aa）
链 Af
672–711（40 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 8
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.10 Å |
| 9WAO Structure of type II Abeta fibrils from 5xFAD mice 提交 2025-08-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
链 K
672–713（42 aa）
链 L
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9WAP Structure of Type II Abeta fibrils from AppNL-FPsen1P117L mice 提交 2025-08-12 | Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric（12） 与蛋白数一致 |
链 A
672–713（42 aa）
链 B
672–713（42 aa）
链 C
672–713（42 aa）
链 D
672–713（42 aa）
链 E
672–713（42 aa）
链 F
672–713（42 aa）
链 G
672–713（42 aa）
链 H
672–713（42 aa）
链 I
672–713（42 aa）
链 J
672–713（42 aa）
链 K
672–713（42 aa）
链 L
672–713（42 aa）
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.22 Å |