当前蛋白身份:Q13409
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相关结构差异明细
一行代表一个 PDB 条目中的一个 biological assembly;同一蛋白的多个单体会分别列出。
| PDB 条目 | Assembly / 聚集状态 | 构建体 | 突变与修饰 | 配体、离子与非聚合物 | 实验方法 | 实验环境 | 结构质量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5JPW Molecular basis for protein recognition specificity of the DYNLT1/Tctex1 canonical binding groove. Characterization of the interaction with activin receptor IIB 提交 2016-05-04 | Assembly 1 信息不足 同源多聚体;蛋白 × 2 PDB 声明:dimeric(2) 与蛋白数一致 |
链 A
134–154(21 aa)
片段:UNP residues 1-113,UNP residues 134-154
链 B
134–154(21 aa)
片段:UNP residues 1-113,UNP residues 134-154
|
未记录 | 未记录非水小分子 | SOLUTION NMR |
NMR测量条件
pH 7;298 K;压力 1
NMR样品组成
100 uM DYNLT1/Tctex1-DIC chimera, 100 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
100 uM [U-99% 15N] DYNLT1/Tctex1-DIC chimera, 100 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
100 uM [U-99% 13C; U-99% 15N] DYNLT1/Tctex1-DIC chimera, 100 mM potassium phosphate, 1 mM DTT, 50 uM DSS, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
|
分辨率未提供 |
| 6F1T Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and BICDR1 提交 2017-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 45 PDB 声明:45-meric(45) 与蛋白数一致 |
链 g
1–612(612 aa)
链 h
1–612(612 aa)
链 o
1–612(612 aa)
链 p
1–612(612 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 6F1U N terminal region of dynein tail domains in complex with dynactin filament and BICDR-1 提交 2017-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 13 PDB 声明:tridecameric(13) 与蛋白数一致 |
链 h
1–612(612 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6F1Z Roadblock-1 region of the dynein tail/dynactin/BICDR1 complex 提交 2017-11-23 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 4 PDB 声明:tetrameric(4) 与蛋白数一致 |
链 o
1–612(612 aa)
链 p
1–612(612 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.40 Å |
| 6F38 Cryo-EM structure of two dynein tail domains bound to dynactin and HOOK3 提交 2017-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 45 PDB 声明:45-meric(45) 与蛋白数一致 |
链 g
1–612(612 aa)
链 h
1–612(612 aa)
链 o
1–612(612 aa)
链 p
1–612(612 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.70 Å |
| 6F3A Cryo-EM structure of a single dynein tail domain bound to dynactin and BICD2N 提交 2017-11-28 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 36 PDB 声明:36-meric(36) 与蛋白数一致 |
链 g
1–612(612 aa)
链 h
1–612(612 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 7Z8F Composite structure of dynein-dynactin-BICDR on microtubules 提交 2022-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 43 PDB 声明:43-meric(43) 与蛋白数一致 |
链 g
1–638(638 aa)
链 h
1–638(638 aa)
链 o
1–638(638 aa)
链 p
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 13 MG MAGNESIUM ION × 14 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 ZN ZINC ION × 3 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 8 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 20.00 Å |
| 7Z8I The barbed end complex of dynactin bound to BICDR1 and the cytoplasmic dynein tails (A2, B1, B2) 提交 2022-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 17 PDB 声明:heptadecameric(17) 与蛋白数一致 |
链 h
1–638(638 aa)
链 o
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 6 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 3.30 Å |
| 7Z8J Cytoplasmic dynein (A2) bound to BICDR1 提交 2022-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 h
1–638(638 aa)
链 o
1–638(638 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 3.93 Å |
| 7Z8K Cytoplasmic dynein (A1) bound to BICDR1 提交 2022-03-17 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 h
72–638(567 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE;20 second incubation
|
分辨率 4.37 Å |
| 8PQW Cytoplasmic dynein-1 motor domain bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 H
1–612(612 aa)
链 I
1–612(612 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.20 Å |
| 8PQZ Cytoplasmic dynein-1 A1/A2 motor domains bound to LIS1 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致 |
链 H
1–612(612 aa)
链 I
1–612(612 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 4 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |
| 8PR0 Cytoplasmic dynein-A heavy chain bound to dynactin-p150glued and IC-LC tower 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 11 PDB 声明:undecameric(11) 与蛋白数一致 |
链 C
1–612(612 aa)
链 D
1–612(612 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 9.40 Å |
| 8PR1 Cytoplasmic dynein-B heavy chain bound to IC-LC tower 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致 |
链 I
1–612(612 aa)
链 J
1–612(612 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.20 Å |
| 8PR2 Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-LZI 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 6 PDB 声明:hexameric(6) 与蛋白数一致 |
链 h
1–612(612 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.80 Å |
| 8PR3 Cytoplasmic dynein-1 heavy chain bound to JIP3-RH1 提交 2023-07-12 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 h
1–612(612 aa)
链 o
1–612(612 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.90 Å |
| 8PTK Composite structure of Dynein-Dynactin-JIP3-LIS1 提交 2023-07-14 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 53 PDB 声明:53-meric(53) 与蛋白数一致 |
链 g
1–612(612 aa)
链 h
1–612(612 aa)
链 o
1–612(612 aa)
链 p
1–612(612 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 16 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 6 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 10.00 Å |
| 9BLY Composite structure of full-length human dynein-1 in phi-particle conformation 提交 2024-05-02 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:12-meric(12) 与蛋白数一致 |
链 C
1–638(638 aa)
链 D
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 5 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.50 Å |
| 9E12 Full-length human dynein-1 in phi comformation under Lis1 condition 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 C
1–638(638 aa)
链 D
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9E13 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Lis1 condition 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致 |
链 C
1–638(638 aa)
链 D
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.50 Å |
| 9E14 Full-length human dynein-1 in phi-like comformation bound to a Lis1 dimer under Nde1-Lis1 condition 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 14 PDB 声明:tetradecameric(14) 与蛋白数一致 |
链 C
1–638(638 aa)
链 D
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2;25 mM HEPES pH 7.2, 150 mM KCl, 1 mM MgCl2, 5 mM DTT, 3 mM ATP
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.00 Å |
| 9E23 Cryo-EM structure of Pre-Chi dynein tail 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:16-meric(16) 与蛋白数一致 |
链 D
1–612(612 aa)
链 H
1–612(612 aa)
链 g
1–612(612 aa)
链 h
1–612(612 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 6.20 Å |
| 9E28 Cryo-EM structure of Phi dynein tail 提交 2024-10-21 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 16 PDB 声明:16-meric(16) 与蛋白数一致 |
链 D
1–612(612 aa)
链 H
1–612(612 aa)
链 g
1–612(612 aa)
链 h
1–612(612 aa)
|
未记录 | 未记录非水小分子 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE-PROPANE
|
分辨率 4.40 Å |
| 9HHL Structure of Dynein-Dynactin-NuMA-LIS1 提交 2024-11-21 | Assembly 1 信息不足 异源复合物;蛋白 × 41 PDB 声明:41-meric(41) 与蛋白数一致 |
链 g
1–612(612 aa)
链 h
1–612(612 aa)
链 o
1–612(612 aa)
链 p
1–612(612 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 8 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 6.53 Å |
| 9YNC Motor domains of phi-like human dynein-1 bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白数一致 |
链 G
1–638(638 aa)
链 H
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 3.93 Å |
| 9YND Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B and LIS1 提交 2025-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 9 PDB 声明:nonameric(9) 与蛋白数一致 |
链 F
1–638(638 aa)
链 G
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.26 Å |
| 9YNE Motor domain of human dynein-1 in pre-power stroke bound to dynactin-p150glued-CC1B-ICD and LIS1 提交 2025-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 12 PDB 声明:dodecameric(12) 与蛋白数一致 |
链 D
1–638(638 aa)
链 E
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 3 MG MAGNESIUM ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 8.46 Å |
| 9YNG Dynactin and dynein-1 tail region of dynein-dynactin complex on microtubule in the presence of LIS1 提交 2025-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 31 PDB 声明:31-meric(31) 与蛋白数一致 |
链 g
1–638(638 aa)
链 h
1–638(638 aa)
链 o
1–638(638 aa)
链 p
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 9 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 3 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 4.07 Å |
| 9YNH Full-length human cytoplasmic dynein-1 in phi-like state bound to dynactin-p150glued and LIS1 提交 2025-10-10 | Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物;蛋白 × 18 PDB 声明:octadecameric(18) 与蛋白数一致 |
链 C
1–638(638 aa)
链 D
1–638(638 aa)
链 U
1–638(638 aa)
链 V
1–638(638 aa)
|
未记录 | ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 6 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 2 MG MAGNESIUM ION × 4 | ELECTRON MICROSCOPY |
cryo-EM缓冲液
pH 7.2
cryo-EM玻璃化条件
冷冻剂 ETHANE
|
分辨率 5.50 Å |