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5iyc

Human core-PIC in the initial transcribing state

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 196.1 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1

物种未注明

UniProt P24928

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 A； UniProt 1–1970 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2GHQ CTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide C-terminal domain of RNA polymerase II 提交 2006-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1795–1803（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；(1)0.5M Ammonium sulfate, 0.2M Lithium sulfate, 100mM HEPES 7.5 (2) 1M sodium tartrate, 100mM Tris pH 8.5 , pH 7.5 - 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.05 Å R-free 0.248
2GHQ CTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide C-terminal domain of RNA polymerase II 提交 2006-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1795–1803（9 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；(1)0.5M Ammonium sulfate, 0.2M Lithium sulfate, 100mM HEPES 7.5 (2) 1M sodium tartrate, 100mM Tris pH 8.5 , pH 7.5 - 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 2.05 Å R-free 0.248
2GHT CTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide from C-terminal domain of RNA polymerase II 提交 2006-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1796–1803（8 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；(1) 0.5M Ammonium sulfate, 0.2M Lithium sulfate, 100mM HEPES 7.5 (2) 2M sodium tartrate, 100mM Tris pH 8.5, pH 7.5 - 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
2GHT CTD-specific phosphatase Scp1 in complex with peptide from C-terminal domain of RNA polymerase II 提交 2006-03-27 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1796–1803（8 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；298 K；(1) 0.5M Ammonium sulfate, 0.2M Lithium sulfate, 100mM HEPES 7.5 (2) 2M sodium tartrate, 100mM Tris pH 8.5, pH 7.5 - 8.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 298K
分辨率 1.80 Å R-free 0.232
2LTO TDRD3 complex 提交 2012-05-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1804–1816（13 aa） 片段：UNP residues 1804-1816
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；293.15 K；离子强度（mmCIF原始值）150；压力 ambient
NMR样品组成 1.7 mM [U-99% 13C; U-99% 15N] protein_1, 50 mM sodium phosphate, 10 mM beta-mercaptoethanol, 150 mM sodium chloride, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
4JXT CID of human RPRD1A in complex with a phosphorylated peptide from RPB1-CTD 提交 2013-03-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1612–1630（19 aa） 片段：UNP residues 1612-1630
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） UNX UNKNOWN LIGAND × 6 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.5；291 K；20% PEG-4000, 10% isopropanol, 0.1M HEPES., pH 7.5, vapor diffusion, temperature 291K
分辨率 1.90 Å R-free 0.237
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6G0R Crystal Structure of the first bromodomain of human BRD4 in complex with an acetylated POLR2A peptide (K775ac/K778ac) 提交 2018-03-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 772–782（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7；277 K；20.0 % PEG 6K 10.0 % EtGly 0.1 M HEPES pH 7.0 0.1 M MgCl2
分辨率 1.25 Å R-free 0.175
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 o 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 o 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7YCX The structure of INTAC-PEC complex 提交 2022-07-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 1 1–1699（1699 aa）
链 1 1704–1856（153 aa）
链 1 1865–1970（106 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.18 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9B9L RPRD1B C-terminal interacting domain bound to a pThr4 CTD peptide 提交 2024-04-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1616–1630（15 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；293 K；Co-crystallization of CID with CTD peptide occurred in a reservoir solution of 20-32% PEG3350 and 0.1M lithium sulfate. 1:3 molar ratio of protein to peptide was used
分辨率 2.50 Å R-free 0.347
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI2 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to an apo RECQL5 helicase (RECQL5 IRI Module focused-classified) 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 A 1–1970（1970 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9HM8 NMR solution structure of RPRD2 CTD-interacting domain and pS2,7 RNAPII CTD peptide. 提交 2024-12-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1612–1622（11 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；293.15 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 0.4 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPRD2 CID, 1 mM pS2pS7 CTD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
9IA7 NMR solution structure of RPRD2 CTD-interacting domain and pT4 RNAPII CTD peptide. 提交 2025-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1612–1623（12 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 8；293.15 K；离子强度（mmCIF原始值）100；压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPRD2 CID, 1.5 mM pT4 CTD, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
9QPX BRCA1 BRCT tandem repeat with RNA polymerase II pSer5-CTD peptide 提交 2025-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1615–1628（14 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M PCB buffer (sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane in the molar ratios 2:1:2) pH 6, 25%PEG 1500
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
9QPX BRCA1 BRCT tandem repeat with RNA polymerase II pSer5-CTD peptide 提交 2025-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1615–1628（14 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M PCB buffer (sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane in the molar ratios 2:1:2) pH 6, 25%PEG 1500
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
9QPX BRCA1 BRCT tandem repeat with RNA polymerase II pSer5-CTD peptide 提交 2025-03-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1615–1628（14 aa）
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6；277 K；0.1M PCB buffer (sodium propionate, sodium cacodylate, BIS-TRIS propane in the molar ratios 2:1:2) pH 6, 25%PEG 1500
分辨率 3.00 Å R-free 0.312
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 1 1–1970（1970 aa）
链 m 1618–1631（14 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 33 个其他 PDB 条目、37 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–1970； UniProt 1–1970

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

物种未注明

UniProt P30876

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 B； UniProt 1–1174 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 B 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 2 1–1174（1174 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–1174； UniProt 1–1174

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

物种未注明

UniProt P19387

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 C； UniProt 1–275 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 C 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 3 1–275（275 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C； PDB构建体 1–275； UniProt 1–275

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

物种未注明

UniProt O15514

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 D； UniProt 1–142 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 1–142（142 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 D 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 l 1–142（142 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 21 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D； PDB构建体 1–142； UniProt 1–142

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5

物种未注明

UniProt P19388

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 E； UniProt 1–210 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–210（210 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 M 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 E 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 4 1–210（210 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 56 个其他 PDB 条目、56 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E； PDB构建体 1–210； UniProt 1–210

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6

物种未注明

UniProt P61218

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–127 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 E 1–127（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DTH Solution structure of RPB6, common subunit of RNA polymerases I, II, and III 提交 2021-01-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–127（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR样品组成 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 2.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7DTI Solution structure of the complex between RNA polymerase subunit RPB6 and TFIIH p62 PH domain 提交 2021-01-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–127（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）25；压力 1
NMR样品组成 0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 0.38 mM TFIIH p62, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] RPB6, 0.38 mM TFIIH p62, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH p62, 0.38 mM RPB6, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.38 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH p62, 0.38 mM RPB6, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 N 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 F 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 5 1–127（127 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 58 个其他 PDB 条目、58 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 1–127； UniProt 1–127

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

物种未注明

UniProt P62487

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 1–172 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
2C35 Subunits Rpb4 and Rpb7 of human RNA polymerase II 提交 2005-10-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 1–172（172 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 7.4；291 K；VAPOUR DIFFUSION AT 18C USING EQUAL VOLUMES OF PROTEIN AT 15MG/ML IN 20MM PIPES PH 6.8, 100MM NACL, 15% GLYCEROL, PRECIPITANT CONTAINING 100MM PIPES PH 7.4, 25% PEG (MW4000), 15% GLYCEROL.
分辨率 2.70 Å R-free 0.266
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 k 1–172（172 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 21 个其他 PDB 条目、24 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB7_HUMAN
Isoform —
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–172； UniProt 1–172

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8

物种未注明

UniProt P52434

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 H； UniProt 1–150 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2F3I Solution Structure of a Subunit of RNA Polymerase II 提交 2005-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–150（150 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.3；303 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM；压力 ambient
NMR样品组成 0.5mM RNA Polymerase II Subunit U-15N,13C | 20mM potassium phosphate buffer, 10mM DTT; 90% H2O, 10% D2O
分辨率未提供
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 D 1–150（150 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 O 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 H 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 6 1–150（150 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 57 个其他 PDB 条目、57 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB3_HUMAN
Isoform —
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 H； PDB构建体 1–150； UniProt 1–150

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P36954

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–125 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 7 1–125（125 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB9_HUMAN
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–125； UniProt 1–125

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10

物种未注明

UniProt P62875

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 1–67 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 B 1–67（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 Q 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 J 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 8 1–67（67 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 54 个其他 PDB 条目、54 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB5_HUMAN
Isoform —
PDB实体 10
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 1–67； UniProt 1–67

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a

物种未注明

UniProt P52435

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–117 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 K 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 9 1–117（117 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 20 个其他 PDB 条目、20 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPB11_HUMAN
Isoform —
PDB实体 11
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–117； UniProt 1–117

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12

物种未注明

UniProt P53803

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 L； UniProt 1–58 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6DRD RNA Pol II(G) 提交 2018-06-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6XRE Structure of the p53/RNA polymerase II assembly 提交 2020-07-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：tridecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 8 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；The assembled p53/Pol II co-complex was applied directly on the grid for 10 sec followed by 5.5 sec of blotting. The sample grid was then washed with 3.5% trehalose in 0.1 M KCl/HEM buffer (20 mM HEPES, 0.2 mM EDTA, 2 mM MgCl2 at pH 7.9) for 10 sec, blotted for 5.5 sec, and finally frozen in liquid ethane.
分辨率 4.60 Å
7A6H Cryo-EM structure of human apo RNA Polymerase III 提交 2020-08-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.30 Å
7AE1 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 1 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 2.80 Å
7AE3 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 3 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.10 Å
7AEA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase III elongation complex 2 提交 2020-09-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Wait time 10 s Blot force 4 Blot time 4 s
分辨率 3.40 Å
7AST Apo Human RNA Polymerase III 提交 2020-10-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 C 1–58（58 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7D58 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in elongating state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7D59 cryo-EM structure of human RNA polymerase III in apo state 提交 2020-09-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：heptadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
7DN3 Structure of Human RNA Polymerase III elongation complex 提交 2020-12-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7DU2 RNA polymerase III EC complex in post-translocation state 提交 2021-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 6 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.35 Å
7FJI human Pol III elongation complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7FJJ human Pol III pre-termination complex 提交 2021-08-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 17 PDB 声明：eicosameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 7 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
分辨率 3.60 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7OB9 Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in elongation state 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 2.70 Å
7OBA Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I in complex with RRN3 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 14 PDB 声明：tetradecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.10 Å
7OBB Cryo-EM structure of human RNA Polymerase I Open Complex 提交 2021-04-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot force 3, blot time 0 s, wait time 0 s
分辨率 3.30 Å
7VBA Structure of the pre state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.89 Å
7VBB Structure of the post state human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.81 Å
7VBC Back track state of human RNA Polymerase I Elongation Complex 提交 2021-08-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.01 Å
8A43 Human RNA polymerase I 提交 2022-06-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.09 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8XRJ RNA polymerase II elongation complex with upstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8XRM RNA polymerase II elongation complex with DSIF, SPT6, and ELOF1 transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
8XSO RNA polymerase II elongation complex transcribing genomic DNA extracted from human nuclei 提交 2024-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：15-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8XVS RNA polymerase II elongation complex with downstream nucleosome extracted from human nuclei 提交 2024-01-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
9EHZ Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex in an Intermediate Translocation State 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9EI1 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the absence of nucleotide 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI3 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of AMPPNP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ANP PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
9EI4 Cryo-EM structure of Human RNA polymerase II Elongation Complex bound to the RECQL5 helicase in the presence of ADP 提交 2024-11-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 P 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K2G Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 13 (TC13) 提交 2024-10-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K36 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 12 (TC12) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.90 Å
9K38 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.10 Å
9K39 Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 8 (TC8) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 2.80 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LKT Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 (TC10) 提交 2025-01-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å
9LXO Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 6 (TC6)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 18 PDB 声明：21-meric
链 L 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.60 Å
9VD9 Cryo-EM structure of the human DSS1-INTAC-PEC complex 提交 2025-06-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 35 PDB 声明：38-meric
链 a 1–58（58 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MN MANGANESE (II) ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å

共 56 个其他 PDB 条目、56 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPAB4_HUMAN
Isoform —
PDB实体 12
链与序列区间 作者链 L； PDB构建体 1–58； UniProt 1–58

Transcription initiation factor IIB

Homo sapiens

UniProt Q00403

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 M； UniProt 1–316 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 E 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 I 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 M 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 Q 110–316（207 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1DL6 SOLUTION STRUCTURE OF HUMAN TFIIB N-TERMINAL DOMAIN 提交 1999-12-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–59（58 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7；298 K；压力 AMBIENT
NMR样品组成 3MM HTFIIB N-TERMINAL DOMAIN U-15N; 50MM PHOSPHATE; 90% H2O, 10% D2O
分辨率未提供
1RLY RDC-derived models of the zinc ribbon domain of human general transcription TFIIB (zinc bound structures) 提交 2003-11-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–60（60 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 0.6mM TFIIB Uniform labeling with 15N: U-98% 15N, 20mM [2H4]-imidazole hydrochloride, 2.5mM ZnCl2, 5% glycerol, 20mM sodium sulfate at pH 6.5, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.6mM TFIIB Uniform labeling with 15N: U-98% 15N, 20mM [2H4]-imidazole hydrochloride, 2.5mM ZnCl2, 5% glycerol, 20mM sodium sulfate at pH 6.5, 12mg/mL of filamentous phage, Pf1, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
1RO4 RDC-derived models of the zinc ribbon domain of human general transcription factor TFIIB (zinc free structures) 提交 2003-12-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–60（60 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 0.6mM TFIIB Uniform labeling with 15N: U-98% 15N, 20mM [2H4]-imidazole hydrochloride, 5% glycerol and 20mM sodium sulfate at pH 6.5, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
NMR样品组成 0.6mM TFIIB Uniform labeling with 15N: U-98% 15N, 20mM [2H4]-imidazole hydrochloride, 5% glycerol and 20mM sodium sulfate at pH 6.5, 12mg/mL of filamentous phage, Pf1, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
1TFB NMR STUDIES OF HUMAN GENERAL TRANSCRIPTION FACTOR TFIIB: DYNAMICS AND INTERACTION WITH VP16 ACTIVATION DOMAIN, 20 STRUCTURES 提交 1996-11-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 112–316（205 aa） 片段：CONSTRUCT COMPRISES RESIDUES 1 - 3 AND 112 - 316 OF FULL LENGTH HUMAN TFIIB
突变：DEL(4 - 111) 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1VOL TFIIB (HUMAN CORE DOMAIN)/TBP (A.THALIANA)/TATA ELEMENT TERNARY COMPLEX 提交 1996-04-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 A 113–316（204 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 2.70 Å R-free 0.318
2PHG Model for VP16 binding to TFIIB 提交 2007-04-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 112–316（205 aa） 片段：c-terminal core domain
突变：D111S 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 5.6；298 K；离子强度（mmCIF原始值）100 mM；压力 1
NMR样品组成 0.2 mM VP16ad U-15N, 0-0.2 mM TFIIBc, 50 mM KCl, 50 mM phosphate buffer pH 5.6, 95% H2O, 5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5WH1 Apo form of the C-terminal region of human Transcription Factor IIB 提交 2017-07-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 107–316（210 aa） 片段：C-terminal residues 107-316
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；100 mM sodium acetate trihydrate pH 4.5, 2 M ammonium sulfate
分辨率 3.39 Å R-free 0.214
5WH1 Apo form of the C-terminal region of human Transcription Factor IIB 提交 2017-07-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 107–316（210 aa） 片段：C-terminal residues 107-316
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；100 mM sodium acetate trihydrate pH 4.5, 2 M ammonium sulfate
分辨率 3.39 Å R-free 0.214
5WH1 Apo form of the C-terminal region of human Transcription Factor IIB 提交 2017-07-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 107–316（210 aa） 片段：C-terminal residues 107-316
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；100 mM sodium acetate trihydrate pH 4.5, 2 M ammonium sulfate
分辨率 3.39 Å R-free 0.214
5WH1 Apo form of the C-terminal region of human Transcription Factor IIB 提交 2017-07-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 107–316（210 aa） 片段：C-terminal residues 107-316
未记录 SO4 SULFATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；298 K；100 mM sodium acetate trihydrate pH 4.5, 2 M ammonium sulfate
分辨率 3.39 Å R-free 0.214
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 BA 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 BA 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 O 1–316（316 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7ZWC Structure of SNAPc:TBP-TFIIA-TFIIB sub-complex bound to U5 snRNA promoter 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZXE Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 BA 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 BA 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 M 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.47 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 R 1–316（316 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.13 Å

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UniProt名称 TF2B_HUMAN
Isoform —
PDB实体 13
链与序列区间 作者链 M； PDB构建体 1–316； UniProt 1–316

Transcription initiation factor IIA subunit 1

Homo sapiens

UniProt P52655

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 N； UniProt 1–376 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NVP HUMAN TFIIA/TBP/DNA COMPLEX 提交 2003-02-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 B 2–58（57 aa） 片段：N-terminal 58 amino acids
链 C 303–376（74 aa） 片段：c-terminal 76 amino acids
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；PEG6000, lithium nitrate, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 B 9–51（43 aa）
链 C 330–376（47 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.50 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 N 1–376（376 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 N 1–376（376 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 N 1–376（376 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 N 1–376（376 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 N 1–376（376 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 N 1–376（376 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 N 1–376（376 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5M4S Transcription factor TFIIA as a single chain protein 提交 2016-10-19 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–58（57 aa）
链 A 328–376（49 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20mM Tris (8.0), 1mM DTT, 0.5mM EDTA and 25mM NaCl
分辨率 2.38 Å R-free 0.242
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 N 1–376（376 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.75 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.64 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 M 1–376（376 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7ZWC Structure of SNAPc:TBP-TFIIA-TFIIB sub-complex bound to U5 snRNA promoter 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZXE Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 DQ 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 DQ 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 U 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.47 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 Q 1–376（376 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.13 Å

共 50 个其他 PDB 条目、50 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TF2AA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 14
链与序列区间 作者链 N； PDB构建体 1–376； UniProt 1–376

Transcription initiation factor IIA subunit 2

Homo sapiens

UniProt P52657

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 O； UniProt 1–109 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1NVP HUMAN TFIIA/TBP/DNA COMPLEX 提交 2003-02-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 D 2–109（108 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；PEG6000, lithium nitrate, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 D 3–99（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.50 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5M4S Transcription factor TFIIA as a single chain protein 提交 2016-10-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 2–103（102 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；20mM Tris (8.0), 1mM DTT, 0.5mM EDTA and 25mM NaCl
分辨率 2.38 Å R-free 0.242
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 X 3–99（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N
分辨率 7.50 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.75 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 DO 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 DO 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 N 1–109（109 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7ZWC Structure of SNAPc:TBP-TFIIA-TFIIB sub-complex bound to U5 snRNA promoter 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZXE Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 DO 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 DO 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 V 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.47 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 O 1–109（109 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.13 Å

共 53 个其他 PDB 条目、53 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 T2AG_HUMAN
Isoform —
PDB实体 15
链与序列区间 作者链 O； PDB构建体 1–109； UniProt 1–109

TATA-box-binding protein

Homo sapiens

UniProt P20226

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 P； UniProt 1–339 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 F 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 J 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 N 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1C9B CRYSTAL STRUCTURE OF A HUMAN TBP CORE DOMAIN-HUMAN TFIIB CORE DOMAIN COMPLEX BOUND TO AN EXTENDED, MODIFIED ADENOVIRAL MAJOR LATE PROMOTER (ADMLP) 提交 1999-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 R 158–337（180 aa） 片段：C-TERMINAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；277 K；PEG 8000, TRIS.HCL, AMMONIUM ACETATE, MAGNESIUM CHLORIDE, POTASSIUM CHLORIDE, SODIUM CITRATE, DTT, GLYCEROL, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.65 Å R-free 0.260
1CDW HUMAN TBP CORE DOMAIN COMPLEXED WITH DNA 提交 1996-04-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 159–337（179 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 1.90 Å R-free 0.258
1JFI Crystal Structure of the NC2-TBP-DNA Ternary Complex 提交 2001-06-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 C 159–339（181 aa） 片段：RESIDUES 359-539
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.5；293 K；PEG 4000, sodium citrate, potassium chloride, magnesium chloride, DTT, pH 5.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.62 Å R-free 0.277
1NVP HUMAN TFIIA/TBP/DNA COMPLEX 提交 2003-02-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 A 159–339（181 aa） 片段：C-TERMINAL 181 AMINO ACIDS
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；295 K；PEG6000, lithium nitrate, calcium chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 2.10 Å R-free 0.247
1TGH TATA BINDING PROTEIN (TBP)/DNA COMPLEX 提交 1996-02-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：trimeric
链 A 113–297（185 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8；pH 8.00
分辨率 2.90 Å R-free 0.294
4ROC Human TFIIB-related factor 2 (Brf2) and TBP bound to U6#2 promoter 提交 2014-10-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 159–339（181 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；293 K；10-20% PEG 3350, 50-100 mM MgCl2, 2 mM DTT, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 1.90 Å R-free 0.215
4ROD Human TFIIB-related factor 2 (Brf2) and TBP bound to TRNAU1 promoter 提交 2014-10-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 159–339（181 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；293 K；10-20% PEG 3350, 50-100 mM MgCl2, 2 mM DTT, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.70 Å R-free 0.247
4ROE Human TFIIB-related factor 2 (Brf2) and TBP bound to RPPH1 promoter 提交 2014-10-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 B 159–339（181 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.9；293 K；10-20% PEG 3350, 50-100 mM MgCl2, 2 mM DTT, pH 7.9, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.222
5FUR Structure of human TFIID-IIA bound to core promoter DNA 提交 2016-01-29 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 A 1–339（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40；pH 7.9；10 MM HEPES, 10 MM MGCL2, 50 MM KCL, 3% TREHALOSE 1 MM DTT, 0.0125% NP-40
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；LIQUID ETHANE
分辨率 8.50 Å
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5N9G TFIIIB -TBP/Brf2/DNA and SANT domain of Bdp1- 提交 2017-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 B 159–339（181 aa） 片段：UNP residues 159-339
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-16% PEG 8000, 150-200 mM KCl, 100 mM MES pH 6.5, 10-15 mM MgCl2, 1 mM TCEP
分辨率 2.70 Å R-free 0.234
5N9G TFIIIB -TBP/Brf2/DNA and SANT domain of Bdp1- 提交 2017-02-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：pentameric
链 G 159–339（181 aa） 片段：UNP residues 159-339
未记录 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；293 K；10-16% PEG 8000, 150-200 mM KCl, 100 mM MES pH 6.5, 10-15 mM MgCl2, 1 mM TCEP
分辨率 2.70 Å R-free 0.234
6MZD Human TFIID Lobe A canonical 提交 2018-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric
链 T 1–339（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N
分辨率 9.80 Å
6MZL Human TFIID canonical state 提交 2018-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 T 1–339（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N
分辨率 23.00 Å
6MZM Human TFIID bound to promoter DNA and TFIIA 提交 2018-11-05 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：heptadecameric
链 T 1–339（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；BT 4s; BF 15N
分辨率 7.50 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7EGD SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in initial TBP-loading state 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.75 Å
7EGE TFIID in canonical conformation 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：eicosameric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.00 Å
7EGF TFIID lobe A subcomplex 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：decameric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.16 Å
7EGI TFIID in rearranged conformation 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：22-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.82 Å
7EGJ SCP promoter-bound TFIID-TFIIA in post TBP-loading state 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.64 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 DP 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 DP 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7ZWC Structure of SNAPc:TBP-TFIIA-TFIIB sub-complex bound to U5 snRNA promoter 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZXE Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 DP 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 DP 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8ITY human RNA polymerase III pre-initiation complex closed DNA 1 提交 2023-03-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 U 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.90 Å
8IUE RNA polymerase III pre-initiation complex melting complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 U 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.10 Å
8IUH RNA polymerase III pre-initiation complex open complex 1 提交 2023-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 U 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.40 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 O 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.47 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 P 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.13 Å
9FSO Human RNA Polymerase III Class III Open Pre-initiation Complex 1 (OC1) 提交 2024-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 R 159–339（181 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
9FSP RNA Polymerase III Class III Open Pre-initation Complex 2 (OC2) 提交 2024-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 R 159–339（181 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.39 Å
9FSQ RNA Polymerase III Class III Melting Pre-Initiation Complex (MC) 提交 2024-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 R 159–339（181 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.51 Å
9FSR RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-initiation Complex 1 (OC1-mini) 提交 2024-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 R 159–339（181 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.76 Å
9FSS RNA Polymerase III Class III Open Mini Pre-Initiation complex 2 (OC2-mini) 提交 2024-06-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：25-meric
链 R 159–339（181 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
9K3B Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 10 overall (TC10-overall) 提交 2024-10-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 U 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 6 MG MAGNESIUM ION × 1 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 4.80 Å
9K3U Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 U 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.00 Å
9K3V Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 4 (TC4) 提交 2024-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 U 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 3AT 3'-DEOXYADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.50 Å
9LXN Human RNA Polymerase III de novo transcribing complex 5 (TC5)(without 3'dATP) 提交 2025-02-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 23 PDB 声明：26-meric
链 U 1–339（339 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 7 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE
分辨率 3.30 Å

共 76 个其他 PDB 条目、81 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TBP_HUMAN
Isoform —
PDB实体 16
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 1–339； UniProt 1–339

General transcription factor IIE subunit 1

Homo sapiens

UniProt P29083

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 Q； UniProt 1–439 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1VD4 Solution structure of the zinc finger domain of TFIIE alpha 提交 2004-03-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 113–174（62 aa） 片段：Zinc Finger Domain
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；305 K；离子强度（mmCIF原始值）50mM NaCl；压力 ambient
NMR样品组成 3-4mM TFIIE alpha Zinc finger domain, U-15N, U-15N, 13C; 20mM potassium phosphate beffer, 0.03mM ZnCl2, 5mM d-DTT | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 3-4mM TFIIE alpha Zinc finger domain, U-15N, U-15N, 13C; 20mM potassium phosphate beffer, 0.03mM ZnCl2, 5mM d-DTT | 99.9% D2O
分辨率未提供
2JTX NMR structure of the TFIIE-alpha carboxyl terminus 提交 2007-08-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 336–439（104 aa） 片段：carboxyl terminus, residues 336-439
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）0.2；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM TFIIE-alpha;, 20 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 15N] TFIIE-alpha;, 20 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-alpha;, 20 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-alpha;, 20 mM sodium phosphate, 200 mM sodium chloride, 1 mM EDTA, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2RNQ Solution structure of the C-terminal acidic domain of TFIIE alpha 提交 2008-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 378–439（62 aa） 片段：C-terminal acidic doman, UNP residues 378-439
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；295 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 1-2mM TFIIE-ALPHA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1-2mM TFIIE-ALPHA, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 1-2mM [U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1-2mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1-2mM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
2RNR Solution structure of the complex between TFIIE alpha C-terminal acidic domain and TFIIH p62 PH domain 提交 2008-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 378–439（62 aa） 片段：C-terminal acidic domain, UNP residues 378-439
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；305 K；离子强度（mmCIF原始值）0；压力 ambient
NMR样品组成 0.5MM [U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 0.5MM TFIIH P62; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 0.5MM TFIIH P62; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIE-ALPHA, 0.5MM TFIIH P62; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成 0.5MM [U-100% 15N] TFIIH P62, 0.5mM TFIIE-ALPHA; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH P62, 0.5MM TFIIE-ALPHA; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.5MM [U-100% 13C; U-100% 15N] TFIIH P62, 0.5MM TFIIE-ALPHA; 20MM POTASSIUM PHOSPHATE, 5MM [U-99% 2H] DTT, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
5GPY Crystal structure of the human TFIIE complex 提交 2016-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 1–217（217 aa） 片段：UNP residues 1-217
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.9；293 K；12% PEG3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.237
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 Q 1–439（439 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 Q 1–439（439 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 Q 1–439（439 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 Q 1–439（439 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 Q 1–439（439 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 Q 1–439（439 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 Q 1–439（439 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 Q 1–439（439 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 EA 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 EA 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 Q 1–439（439 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7NVV XPB-containing part of TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVW TFIIH in a pre-translocated state (without ADP-BeF3) 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7NVX TFIIH in a post-translocated state (with ADP-BeF3) 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tridecameric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 7 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 W 1–273（273 aa）
链 W 274–439（166 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 W 1–196（196 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 EA 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 EA 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 W 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.47 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 U 1–439（439 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.13 Å

共 47 个其他 PDB 条目、47 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 T2EA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 17
链与序列区间 作者链 Q； PDB构建体 1–439； UniProt 1–439

Transcription initiation factor IIE subunit beta

Homo sapiens

UniProt P29084

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 R； UniProt 1–291 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1D8J SOLUTION STRUCTURE OF THE CENTRAL CORE DOMAIN OF TFIIE BETA 提交 1999-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 66–146（81 aa） 片段：CENTRAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）500mM NACL；压力 AMBIENT
NMR样品组成 1-2MM PROTEIN U-15N,13C; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL
NMR样品组成 1-2MM PROTEIN ; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL
分辨率未提供
1D8K SOLUTION STRUCTURE OF THE CENTRAL CORE DOMAIN OF TFIIE BETA 提交 1999-10-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 66–146（81 aa） 片段：CENTRAL CORE DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6；300 K；离子强度（mmCIF原始值）500mM NACL；压力 AMBIENT
NMR样品组成 1-2MM PROTEIN U-15N,13C; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL
NMR样品组成 1-2MM PROTEIN U-15N; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL
NMR样品组成 1-2MM PROTEIN ; 20MM PHOSPHATE BUFFER, 500MM NACL
分辨率未提供
5GPY Crystal structure of the human TFIIE complex 提交 2016-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 141–244（104 aa） 片段：UNP residues 141-244
未记录 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8.9；293 K；12% PEG3350
分辨率 2.10 Å R-free 0.237
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 R 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 R 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 R 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 R 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 R 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 R 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 R 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 R 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 EB 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 EB 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 R 1–291（291 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 EB 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 EB 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 X 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.47 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 V 1–291（291 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.13 Å

共 41 个其他 PDB 条目、41 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 T2EB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 18
链与序列区间 作者链 R； PDB构建体 1–291； UniProt 1–291

General transcription factor IIF subunit 1

Homo sapiens

UniProt P35269

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 S； UniProt 1–517 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 2–172（171 aa） 片段：RESIDUES 2-172
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 2–172（171 aa） 片段：RESIDUES 2-172
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 F 2–172（171 aa） 片段：RESIDUES 2-172
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 H 2–172（171 aa） 片段：RESIDUES 2-172
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1I27 CRYSTAL STRUCTURE OF THE C-TERMINAL DOMAIN OF THE RAP74 SUBUNIT OF HUMAN TRANSCRIPTION FACTOR IIF (TFIIF) 提交 2001-02-07 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 449–517（69 aa） 片段：RAP74 SUBUNIT, C-TERMINAL DOMAIN
突变：YES ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.4；282 K；Zinc Sulfate, Lithium chloride, PEG 2000 MME, polyvinylpyrrolidone 15K, glucosamine hydrochloride, pH 6.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 282K
分辨率 1.02 Å R-free 0.146
1J2X Crystal structure of RAP74 C-terminal domain complexed with FCP1 C-terminal peptide 提交 2003-01-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 449–517（69 aa） 片段：C-terminal domain
未记录 SO4 SULFATE ION × 2 ZN ZINC ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；277 K；PEGMME 550, zinc sulfate, MES, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277.0K
分辨率 2.00 Å R-free 0.254
1NHA Solution Structure of the Carboxyl-Terminal Domain of RAP74 and NMR Characterization of the FCP-Binding Sites of RAP74 and CTD of RAP74, the subunit of Human TFIIF 提交 2002-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 436–517（82 aa） 片段：C-Terminal Domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM sodium phosphate buffer；压力 ambient
NMR样品组成 1mM cterRAP74 unlabeled, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 100% D2O
NMR样品组成 1mM cterRAP74 U-15N, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM cterRAP74 U-15N and U-13C, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM cterRAP74 U-15N and U-13C, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 100% D2O
分辨率未提供
1ONV NMR Structure of a Complex Containing the TFIIF Subunit RAP74 and the RNAP II CTD Phosphatase FCP1 提交 2003-03-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 436–517（82 aa） 片段：C-Terminal Domain of RAP74, sequence database residues 436-517
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）20mM sodium phosphate buffer；压力 ambient
NMR样品组成 1mM cterRAP74/cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 100% D2O
NMR样品组成 1mM U-15N cterRAP74/cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM U-15N,13C cterRAP74/cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM cterRAP74/U-15N cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM cterRAP74/U-15N,13C cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1mM U-15N,C13 cterRAP74/cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA; | 100% D2O
NMR样品组成 1mM cterRAP74/U-15N,13C cterFCP1, 20mM sodium phosphate, and 1mM EDTA | 100% D2O
分辨率未提供
2K7L NMR structure of a complex formed by the C-terminal domain of human RAP74 and a phosphorylated peptide from the central domain of the FCP1 提交 2008-08-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 451–517（67 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；300 K；离子强度（mmCIF原始值）10-40；压力 ambient
NMR样品组成 1 mM [U-98% 15N] cterRAP74, 1 mM centFCP1-T584PO4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] cterRAP74, 1 mM centFCP1-T584PO4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 1 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] cterRAP74, 1 mM centFCP1-T584PO4, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 FA 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 FA 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 FA 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 FA 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 Q 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.47 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 S 1–517（517 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å

共 60 个其他 PDB 条目、63 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 T2FA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 19
链与序列区间 作者链 S； PDB构建体 1–517； UniProt 1–517

General transcription factor IIF subunit 2

Homo sapiens

UniProt P13984

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 T； UniProt 1–249 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） Transcription elongation factor A protein 1 × 1 （P23193） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1BBY DNA-BINDING DOMAIN FROM HUMAN RAP30, NMR, MINIMIZED AVERAGE 提交 1998-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 175–243（69 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；297 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM PHOSPHATE, 50mM NACL；压力 1
NMR样品组成 AQUEOUS
分辨率未提供
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 2–119（118 aa） 片段：RESIDUES 2-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 2–119（118 aa） 片段：RESIDUES 2-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 E 2–119（118 aa） 片段：RESIDUES 2-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.70 Å R-free 0.260
1F3U CRYSTAL STRUCTURE OF THE RAP30/74 INTERACTION DOMAINS OF HUMAN TFIIF 提交 2000-06-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 G 2–119（118 aa） 片段：RESIDUES 2-119
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；278 K；PEG 1500, lithium nitrate, bis-Tris, DTT, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 278K
分辨率 1.70 Å R-free 0.260
2BBY DNA-BINDING DOMAIN FROM HUMAN RAP30, NMR, 30 STRUCTURES 提交 1998-04-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 175–243（69 aa） 片段：DNA-BINDING DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.2；297 K；离子强度（mmCIF原始值）10mM PHOSPHATE, 50mM NACL；压力 1
NMR样品组成 AQUEOUS
分辨率未提供
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IY9 Human holo-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：29-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 10 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 6.30 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
5IYD Human core-PIC in the initial transcribing state (no IIS) 提交 2016-03-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7EDX p53-bound TFIID-based core PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7EG7 TFIID-based core PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.20 Å
7EG8 TFIID-based core PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 37 PDB 声明：39-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.40 Å
7EG9 TFIID-based intermediate PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
7EGA TFIID-based intermediate PIC on PUMA promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 39 PDB 声明：41-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7EGB TFIID-based holo PIC on SCP promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7EGC p53-bound TFIID-based holo PIC on HDM2 promoter 提交 2021-03-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 49 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7ENA TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in pre-assembled state (pre-hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 FB 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.07 Å
7ENC TFIID-based PIC-Mediator holo-complex in fully-assembled state (hPIC-MED) 提交 2021-04-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 74 PDB 声明：76-meric
链 FB 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.13 Å
7LBM Structure of the human Mediator-bound transcription pre-initiation complex 提交 2021-01-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：56-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 16 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7NVR Human Mediator with RNA Polymerase II Pre-initiation complex 提交 2021-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 56 PDB 声明：58-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 18 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7NVS RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7NVT RNA polymerase II core pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
7NVU RNA polymerase II core pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：22-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.50 Å
7NVY RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in proximal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
7NVZ RNA polymerase II pre-initiation complex with closed promoter DNA in distal position 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
7NW0 RNA polymerase II pre-initiation complex with open promoter DNA 提交 2021-03-16 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：32-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 15 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
7ZWD Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U5 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ZX7 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (CC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7ZX8 Structure of SNAPc containing Pol II pre-initiation complex bound to U1 snRNA promoter (OC) 提交 2022-05-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 22 PDB 声明：24-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8BVW RNA polymerase II pre-initiation complex with the distal +1 nucleosome (PIC-Nuc18W) 提交 2022-12-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 40 PDB 声明：42-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 17 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
8BYQ RNA polymerase II pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (PIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 38 PDB 声明：40-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ZN ZINC ION × 16 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8BZ1 RNA polymerase II core pre-initiation complex with the proximal +1 nucleosome (cPIC-Nuc10W) 提交 2022-12-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：28-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8GXQ PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in MH-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 FB 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.04 Å
8GXS PIC-Mediator in complex with +1 nucleosome (T40N) in H-binding state 提交 2022-09-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 83 PDB 声明：87-meric
链 FB 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 19 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.16 Å
8S51 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 8 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8S52 RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 10 nt 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
8S54 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state b (composite structure) 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：18-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S55 RNA polymerase II early elongation complex bound to TFIIE and TFIIF - state a (composite structure) 提交 2024-02-22 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：19-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8S5N RNA polymerase II core initially transcribing complex with an ordered RNA of 12 nt 提交 2024-02-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 20 PDB 声明：23-meric
链 R 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8WAK Structure of transcribing complex 2 (TC2), the initially transcribing complex with Pol II positioned 2nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.47 Å
8WAL Structure of transcribing complex 3 (TC3), the initially transcribing complex with Pol II positioned 3nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.52 Å
8WAN Structure of transcribing complex 4 (TC4), the initially transcribing complex with Pol II positioned 4nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.07 Å
8WAO Structure of transcribing complex 5 (TC5), the initially transcribing complex with Pol II positioned 5nt downstream of TSS. 提交 2023-09-07 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å
8WAP Structure of transcribing complex 6 (TC6), the initially transcribing complex with Pol II positioned 6nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.85 Å
8WAQ Structure of transcribing complex 7 (TC7), the initially transcribing complex with Pol II positioned 7nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.29 Å
8WAR Structure of transcribing complex 8 (TC8), the initially transcribing complex with Pol II positioned 8nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
8WAS Structure of transcribing complex 9 (TC9), the initially transcribing complex with Pol II positioned 9nt downstream of TSS. 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 48 PDB 声明：51-meric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.13 Å
8WAT De novo transcribing complex 10 (TC10), the early elongation complex with Pol II positioned 10nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.82 Å
8WAU De novo transcribing complex 11 (TC11), the early elongation complex with Pol II positioned 11nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.78 Å
8WAV De novo transcribing complex 12 (TC12), the early elongation complex with Pol II positioned 12nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.72 Å
8WAW De novo transcribing complex 13 (TC13), the early elongation complex with Pol II positioned 13nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.02 Å
8WAX De novo transcribing complex 14 (TC14), the early elongation complex with Pol II positioned 14nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.75 Å
8WAY De novo transcribing complex 15 (TC15), the early elongation complex with Pol II positioned 15nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.85 Å
8WAZ De novo transcribing complex 16 (TC16), the early elongation complex with Pol II positioned 16nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8WB0 De novo transcribing complex 17 (TC17), the early elongation complex with Pol II positioned 17nt downstream of TSS 提交 2023-09-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 15 PDB 声明：octadecameric
链 T 1–249（249 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 W0F [[(2~{S},3~{R},4~{S},5~{R})-5-(2-azanyl-6-oxidanylidene-3~{H}-purin-9-yl)-3-methoxy-4-oxidanyl-oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å

共 57 个其他 PDB 条目、60 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 T2FB_HUMAN
Isoform —
PDB实体 20
链与序列区间 作者链 T； PDB构建体 1–249； UniProt 1–249

Transcription elongation factor A protein 1

Homo sapiens

UniProt P23193

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白–DNA 异源复合物 蛋白 × 21 DNA 2 PDB 声明：23-meric（23） 与全部聚合物数一致 链 U； UniProt 1–301 未记录 DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P24928） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P30876） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P19387） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （O15514） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB5 × 1 （P19388） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB6 × 1 （P61218） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P62487） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB8 × 1 （P52434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P36954） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB10 × 1 （P62875） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a × 1 （P52435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB12 × 1 （P53803） Transcription initiation factor IIB × 1 （Q00403） Transcription initiation factor IIA subunit 1 × 1 （P52655） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P52657） TATA-box-binding protein × 1 （P20226） General transcription factor IIE subunit 1 × 1 （P29083） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P29084） General transcription factor IIF subunit 1 × 1 （P35269） General transcription factor IIF subunit 2 × 1 （P13984） SCP-X × 1 SCP-Y × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.9 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV). 分辨率 3.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 5IYC Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
1TFI A NOVEL ZN FINGER MOTIF IN THE BASAL TRANSCRIPTIONAL MACHINERY: THREE-DIMENSIONAL NMR STUDIES OF THE NUCLEIC-ACID BINDING DOMAIN OF TRANSCRIPTIONAL ELONGATION FACTOR TFIIS 提交 1993-04-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 252–301（50 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
3NDQ Structure of Human TFIIS Domain II 提交 2010-06-07 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 131–232（102 aa） 片段：TFIIS Domain II, residues 131-232
未记录 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；289 K；1.0 M Ammonium sulphate, 0.1 M 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid , pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289K
分辨率 1.93 Å R-free 0.208
5IY6 Human holo-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 U 1–301（301 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.20 Å
5IY7 Human holo-PIC in the open state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 U 1–301（301 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 8.60 Å
5IY8 Human holo-PIC in the initial transcribing state 提交 2016-03-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：29-meric
链 U 1–301（301 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 7.90 Å
5IYA Human core-PIC in the closed state 提交 2016-03-24 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 U 1–301（301 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 5.40 Å
5IYB Human core-PIC in the open state 提交 2016-03-24 当前字段一致 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 21 PDB 声明：23-meric
链 U 1–301（301 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 11 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Blot for 4 seconds before plunging into liquid ethane (FEI VITROBOT MARK IV).
分辨率 3.90 Å
6O9L Human holo-PIC in the closed state 提交 2019-03-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：33-meric
链 U 1–301（301 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 17 SF4 IRON/SULFUR CLUSTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
6ZUY Human TFIIS N-terminal domain (TND) 提交 2020-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–79（79 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）225；压力 1
NMR样品组成 0.5 mM [U-13C; U-15N] TFIIS, 25 mM deuterated TRIS, 200 mM sodium phospate, 1 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
6ZV4 Human TFIIS N-terminal domain in complex with IWS1 提交 2020-07-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–77（77 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 7.4；298 K；离子强度（mmCIF原始值）225；压力 1
NMR样品组成 0.35 mM [U-13C; U-15N] TFIIS-IWS1, 25 mM [U-2H] TRIS, 200 mM sodium chloride, 1 mM TCEP, 95% H2O/5% D2O | 95% H2O/5% D2O
分辨率未提供
7CNF Solution strcture of HsTFIIS LW domain 提交 2020-07-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–96（96 aa） 片段：LW domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.8；298 K；离子强度（mmCIF原始值）175；压力 1
NMR样品组成 2.5 g/L [U-95% 13C] glucose, 0.5 g/L [U-15N] Ammonium Chloride, 25 mM NA sodium phosphate, 2 mM NA EDTA, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
7UNC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS complex with rewrapped nucleosome 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric
链 O 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7UND Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-nucleosome complex (stalled at +38) 提交 2022-04-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 30 PDB 声明：33-meric
链 O 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8A40 Structure of mammalian Pol II-TFIIS elongation complex 提交 2022-06-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 11 MG MAGNESIUM ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8UIS Structure of transcription complex Pol II-DSIF-NELF-TFIIS 提交 2023-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 16 PDB 声明：nonadecameric
链 S 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 8 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
9EGX RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-hexasome, bp +27 提交 2024-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 29 PDB 声明：32-meric
链 S 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9EGY RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 S 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9EGZ RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, bp +27 提交 2024-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 S 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 12 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9EH0 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 30 bp upstream 提交 2024-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 S 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
9EH1 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-nucleosome, 20 bp upstream 提交 2024-11-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 S 132–301（170 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9EH2 RNA polymerase II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-SETD2-FACT nucleosome upstream 提交 2024-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 S 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9J0N Paused elongation complex of mammalian RNA polymerase II with nucleosome (PEC2-nuc) 提交 2024-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：30-meric
链 M 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
9MLC Pol II-DSIF-SPT6-PAF1c-TFIIS-IWS1-ELOF1-LEDGF-nucleosome activated elongation complex Composite map T 提交 2024-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 24 PDB 声明：27-meric
链 S 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 10 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.40 Å
9S0U State 3 MAP 3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 bound to distal upstream H3 提交 2025-07-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 32 PDB 声明：35-meric
链 S 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.72 Å
9S3G State 1 MAP3 RNA Pol II activated elongation complex with SETD2 and upstream hexasome 提交 2025-07-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 31 PDB 声明：34-meric
链 S 1–301（301 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 9 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.40 Å

共 25 个其他 PDB 条目、25 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 TCEA1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 21
链与序列区间 作者链 U； PDB构建体 1–301； UniProt 1–301

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 5iyc

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 5iyc
下载 Download
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id5iyc
沉积日期 deposition_date2016-03-24
结构标题 titleHuman core-PIC in the initial transcribing state
关键词 keywordsinitiation, RNA polymerase II, human, TRANSCRIPTION, TRANSFERASE-DNA complex; TRANSCRIPTION, TRANSFERASE/DNA
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier60.35 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron59.95 Å
零角强度 I(0) i07341630000.00
分子量 molecular_weight686140.0 kDa
排除体积 excluded_volume843560 ų
包络体积 envelope_volume1276200 ų
水化壳体积 shell_volume167700 ų
包络直径 envelope_diameter202.5 Å
壳层 Rg shell_rg67.89 Å
包络 Rg envelope_rg59.68 Å
形状 Rg shape_rg59.98 Å
总 Rg total_rg59.98 Å
总原子数 total_atoms47927
残基数 n_residues5737
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax196.1 Å
Rg (实空间) rg_real60.09 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.67 Å
I(0) (实空间) i0_real7.3420e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error1.4000e+08
Rg (倒空间) rg_reciprocal60.56 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal7347000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8684
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary75.4 Å
偏度 Skewness skewness0.229
峰度 Kurtosis kurtosis-0.371
角度范围 angular_range— – 0.1300 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha1123000000.0000
实空间数据点数 n_real_points27
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.865; Stabil: 0.998; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.946; Smooth: 0.750
▶

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (25)

▼

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 23 domains

CATH v4.4 (23 domains)

结构域编号 domain_id5iycA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology274 — Enzyme I; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily100 — RNA polymerase Rpb1, domain 3
结构域编号 domain_id5iycA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
结构域编号 domain_id5iycB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2
结构域编号 domain_id5iycB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology1800 — DCoH-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase alpha subunit dimerisation domain
结构域编号 domain_id5iycC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit
结构域编号 domain_id5iycC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain
结构域编号 domain_id5iycD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1250 — Growth Hormone; Chain: A;
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — RNA Polymerase II, Rpb4 subunit
结构域编号 domain_id5iycE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology1340 — Dna-directed Rna Polymerases I, Ii, And Iii 27 Kd Polypeptide; Chain: A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, Rpb5, N-terminal domain
结构域编号 domain_id5iycE02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — RPB5-like RNA polymerase subunit
结构域编号 domain_id5iycF00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase subunit, RPB6/omega
结构域编号 domain_id5iycG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 — RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain
结构域编号 domain_id5iycG02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id5iycH01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 — Nucleic acid-binding proteins
结构域编号 domain_id5iycI02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology25 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id5iycJ00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 — Homeodomain-like
结构域编号 domain_id5iycK00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit
结构域编号 domain_id5iycL00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — RNA polymerase ii, chain L
结构域编号 domain_id5iycM01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
结构域编号 domain_id5iycM02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology472 — Cyclin A; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cyclin-like
结构域编号 domain_id5iycO01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily190 — Transcription factor IIA gamma subunit, alpha-helical domain
结构域编号 domain_id5iycO02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology18 — TATA box binding Protein, subunit D; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Transcription factor IIA (TFIIA), beta-barrel domain
结构域编号 domain_id5iycP01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology310 — TATA-Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TATA-Binding Protein
结构域编号 domain_id5iycP02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology310 — TATA-Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — TATA-Binding Protein
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)