5oqj

STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH

Method: ELECTRON MICROSCOPY

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–1733； UniProt 1–1733

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

物种未注明

UniProt P08518

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–1224； UniProt 1–1224

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

物种未注明

UniProt P16370

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–318； UniProt 1–318

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

物种未注明

UniProt P20433

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPB4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–221； UniProt 1–221

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

物种未注明

UniProt P20434

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–215； UniProt 1–215

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

物种未注明

UniProt P20435

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPAB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–155； UniProt 1–155

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

物种未注明

UniProt P34087

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPB7_YEAST
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–171； UniProt 1–171

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

物种未注明

UniProt P20436

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPAB3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–146； UniProt 1–146

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

物种未注明

UniProt P27999

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPB9_YEAST
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 I； PDB构建体 1–122； UniProt 1–122

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

物种未注明

UniProt P22139

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	RPAB5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 J； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11

物种未注明

UniProt P38902

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPB11_YEAST
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–120； UniProt 1–120

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4

物种未注明

UniProt P40422

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPAB4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–70； UniProt 1–70

Transcription initiation factor IIB

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P29055

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TF2B_YEAST
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 M； PDB构建体 1–345； UniProt 1–345

TATA-box-binding protein

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P13393

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TBP_YEAST
Isoform	—
PDB实体	15
链与序列区间	作者链 O； PDB构建体 1–240； UniProt 1–240

Transcription initiation factor IIF subunit alpha

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P41895

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	T2FA_YEAST
Isoform	—
PDB实体	16
链与序列区间	作者链 Q； PDB构建体 1–735； UniProt 1–735

Transcription initiation factor IIF subunit beta

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P41896

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2FB_YEAST
Isoform	—
PDB实体	17
链与序列区间	作者链 R； PDB构建体 1–400； UniProt 1–400

Transcription initiation factor IIA large subunit

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P32773

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TOA1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	19
链与序列区间	作者链 U； PDB构建体 1–286； UniProt 1–286

Transcription initiation factor IIA subunit 2

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P32774

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2AG_YEAST
Isoform	—
PDB实体	20
链与序列区间	作者链 V； PDB构建体 1–122； UniProt 1–122

Transcription initiation factor IIE subunit alpha

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P36100

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2EA_YEAST
Isoform	—
PDB实体	21
链与序列区间	作者链 W； PDB构建体 1–194； UniProt 1–194 作者链 W； PDB构建体 514–586； UniProt 410–482

Transcription initiation factor IIE subunit beta

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P36145

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	T2EB_YEAST
Isoform	—
PDB实体	22
链与序列区间	作者链 X； PDB构建体 1–328； UniProt 1–328

DNA repair helicase RAD3

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P06839

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RAD3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	23
链与序列区间	作者链 0； PDB构建体 1–293； UniProt 1–293 作者链 0； PDB构建体 327–778； UniProt 327–778

RNA polymerase II transcription factor B subunit 1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt P32776

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TFB1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	24
链与序列区间	作者链 1； PDB构建体 1–218； UniProt 1–218 作者链 1； PDB构建体 250–295； UniProt 250–295 作者链 1； PDB构建体 536–640； UniProt 537–642

RNA polymerase II transcription factor B subunit 2

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q02939

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TFB2_YEAST
Isoform	—
PDB实体	25
链与序列区间	作者链 2； PDB构建体 1–112； UniProt 1–112 作者链 2； PDB构建体 160–194； UniProt 160–194 作者链 2； PDB构建体 215–281； UniProt 215–281 作者链 2； PDB构建体 382–462； UniProt 433–513

RNA polymerase II transcription factor B subunit 3

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q03290

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TFB3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	26
链与序列区间	作者链 3； PDB构建体 1–321； UniProt 1–321

RNA polymerase II transcription factor B subunit 4

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q12004

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TFB4_YEAST
Isoform	—
PDB实体	27
链与序列区间	作者链 4； PDB构建体 1–88； UniProt 1–88 作者链 4； PDB构建体 115–256； UniProt 115–256 作者链 4； PDB构建体 274–338； UniProt 274–338

RNA polymerase II transcription factor B subunit 5

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q3E7C1

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	TFB5_YEAST
Isoform	—
PDB实体	28
链与序列区间	作者链 5； PDB构建体 1–72； UniProt 1–72

Suppressor of stem-loop protein 1

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q04673

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） DNA repair helicase RAD25 × 1 （Q00578） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	SSL1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	29
链与序列区间	作者链 6； PDB构建体 1–307； UniProt 1–307 作者链 6； PDB构建体 325–372； UniProt 325–372 作者链 6； PDB构建体 387–411； UniProt 387–411 作者链 6； PDB构建体 425–461； UniProt 425–461

DNA repair helicase RAD25

Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)

UniProt Q00578

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白–DNA	异源复合物	蛋白 29 DNA 2	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1 × 1 （P04050） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2 × 1 （P08518） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3 × 1 （P16370） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4 × 1 （P20433） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1 × 1 （P20434） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2 × 1 （P20435） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7 × 1 （P34087） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3 × 1 （P20436） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9 × 1 （P27999） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5 × 1 （P22139） DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11 × 1 （P38902） DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4 × 1 （P40422） Transcription initiation factor IIB × 1 （P29055） NONTEMPLATE DNA × 1 TATA-box-binding protein × 1 （P13393） Transcription initiation factor IIF subunit alpha × 1 （P41895） Transcription initiation factor IIF subunit beta × 1 （P41896） TEMPLATE DNA × 1 Transcription initiation factor IIA large subunit × 1 （P32773） Transcription initiation factor IIA subunit 2 × 1 （P32774） Transcription initiation factor IIE subunit alpha × 1 （P36100） Transcription initiation factor IIE subunit beta × 1 （P36145） DNA repair helicase RAD3 × 1 （P06839） RNA polymerase II transcription factor B subunit 1 × 1 （P32776） RNA polymerase II transcription factor B subunit 2 × 1 （Q02939） RNA polymerase II transcription factor B subunit 3 × 1 （Q03290） RNA polymerase II transcription factor B subunit 4 × 1 （Q12004） RNA polymerase II transcription factor B subunit 5 × 1 （Q3E7C1） Suppressor of stem-loop protein 1 × 1 （Q04673） Unknown protein × 1 ZINC ION × 16 MAGNESIUM ION × 1 IRON/SULFUR CLUSTER × 1	与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RAD25_YEAST
Isoform	—
PDB实体	30
链与序列区间	作者链 7； PDB构建体 1–425； UniProt 1–425 作者链 7； PDB构建体 452–462； UniProt 452–462 作者链 7； PDB构建体 482–843； UniProt 482–843

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	5oqj
沉积日期 deposition_date	2017-08-11
结构标题 title	STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH
关键词 keywords	transcription initiation, TRANSCRIPTION, macromolecular complex; TRANSCRIPTION
实验方法 method	ELECTRON MICROSCOPY

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

5oqj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

5oqj__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

5oqj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	82.01 Å
Rg（电子密度）	81.34 Å
总 Rg	80.73 Å
原子数	62931
残基数	8336
排除体积	1102300 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`5oqj__assembly_1__model_1`	31-meric （31）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (34)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1
分子量 formula_weight	191821.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	62931

MVGQQYSSAPLRTVKEVQFGLFSPEEVRAISVAKIRFPETMDETQTRAKIGGLNDPRLGSIDRNLKCQTCQEGMNECPGHFGHIDLAKPVFHVGFIAKIKKVCECVCMHCGKLLLDEHNELMRQALAIKDSKKRFAAIWTLCKTKMVCETDVPSEDDPTQLVSRGGCGNTQPTIRKDGLKLVGSWKKDRATGDADEPELRVLSTEEILNIFKHISVKDFTSLGFNEVFSRPEWMILTCLPVPPPPVRPSISFNESQRGEDDLTFKLADILKANISLETLEHNGAPHHAIEEAESLLQFHVATYMDNDIAGQPQALQKSGRPVKSIRARLKGKEGRIRGNLMGKRVDFSARTVISGDPNLELDQVGVPKSIAKTLTYPEVVTPYNIDRLTQLVRNGPNEHPGAKYVIRDSGDRIDLRYSKRAGDIQLQYGWKVERHIMDNDPVLFNRQPSLHKMSMMAHRVKVIPYSTFRLNLSVTSPYNADFDGDEMNLHVPQSEETRAELSQLCAVPLQIVSPQSNKPCMGIVQDTLCGIRKLTLRDTFIELDQVLNMLYWVPDWDGVIPTPAIIKPKPLWSGKQILSVAIPNGIHLQRFDEGTTLLSPKDNGMLIIDGQIIFGVVEKKTVGSSNGGLIHVVTREKGPQVCAKLFGNIQKVVNFWLLHNGFSTGIGDTIADGPTMREITETIAEAKKKVLDVTKEAQANLLTAKHGMTLRESFEDNVVRFLNEARDKAGRLAEVNLKDLNNVKQMVMAGSKGSFINIAQMSACVGQQSVEGKRIAFGFVDRTLPHFSKDDYSPESKGFVENSYLRGLTPQEFFFHAMGGREGLIDTAVKTAETGYIQRRLVKALEDIMVHYDNTTRNSLGNVIQFIYGEDGMDAAHIEKQSLDTIGGSDAAFEKRYRVDLLNTDHTLDPSLLESGSEILGDLKLQVLLDEEYKQLVKDRKFLREVFVDGEANWPLPVNIRRIIQNAQQTFHIDHTKPSDLTIKDIVLGVKDLQENLLVLRGKNEIIQNAQRDAVTLFCCLLRSRLATRRVLQEYRLTKQAFDWVLSNIEAQFLRSVVHPGEMVGVLAAQSIGEPATQMTLNTFHFAGVASKKVTSGVPRLKEILNVAKNMKTPSLTVYLEPGHAADQEQAKLIRSAIEHTTLKSVTIASEIYYDPDPRSTVIPEDEEIIQLHFSLLDEEAEQSFDQQSPWLLRLELDRAAMNDKDLTMGQVGERIKQTFKNDLFVIWSEDNDEKLIIRCRVVRPKSLDAETEAEEDHMLKKIENTMLENITLRGVENIERVVMMKYDRKVPSPTGEYVKEPEWVLETDGVNLSEVMTVPGIDPTRIYTNSFIDIMEVLGIEAGRAALYKEVYNVIASDGSYVNYRHMALLVDVMTTQGGLTSVTRHGFNRSNTGALMRCSFEETVEILFEAGASAELDDCRGVSENVILGQMAPIGTGAFDVMIDEESLVKYMPEQKITEIEDGQDGGVTPYSNESGLVNADLDVKDELMFSPLVDSGSNDAMAGGFTAYGGADYGEATSPFGAYGEAPTSPGFGVSSPGFSPTSPTYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPAYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPSYSPTSPNYSPTSPSYSPTSPGYSPGSPAYSPKQDEQKHNENENSR

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2
分子量 formula_weight	138937.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MSDLANSEKYYDEDPYGFEDESAPITAEDSWAVISAFFREKGLVSQQLDSFNQFVDYTLQDIICEDSTLILEQLAQHTTESDNISRKYEISFGKIYVTKPMVNESDGVTHALYPQEARLRNLTYSSGLFVDVKKRTYEAIDVPGRELKYELIAEESEDDSESGKVFIGRLPIMLRSKNCYLSEATESDLYKLKECPFDMGGYFIINGSEKVLIAQERSAGNIVQVFKKAAPSPISHVAEIRSALEKGSRFISTLQVKLYGREGSSARTIKATLPYIKQDIPIVIIFRALGIIPDGEILEHICYDVNDWQMLEMLKPCVEDGFVIQDRETALDFIGRRGTALGIKKEKRIQYAKDILQKEFLPHITQLEGFESRKAFFLGYMINRLLLCALDRKDQDDRDHFGKKRLDLAGPLLAQLFKTLFKKLTKDIFRYMQRTVEEAHDFNMKLAINAKTITSGLKYALATGNWGEQKKAMSSRAGVSQVLNRYTYSSTLSHLRRTNTPIGRDGKLAKPRQLHNTHWGLVCPAETPEGQACGLVKNLSLMSCISVGTDPMPIITFLSEWGMEPLEDYVPHQSPDATRVFVNGVWHGVHRNPARLMETLRTLRRKGDINPEVSMIRDIREKELKIFTDAGRVYRPLFIVEDDESLGHKELKVRKGHIAKLMATEYQDIEGGFEDVEEYTWSSLLNEGLVEYIDAEEEESILIAMQPEDLEPAEANEENDLDVDPAKRIRVSHHATTFTHCEIHPSMILGVAASIIPFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVFLTNYNVRMDTMANILYYPQKPLGTTRAMEYLKFRELPAGQNAIVAIACYSGYNQEDSMIMNQSSIDRGLFRSLFFRSYMDQEKKYGMSITETFEKPQRTNTLRMKHGTYDKLDDDGLIAPGVRVSGEDVIIGKTTPISPDEEELGQRTAYHSKRDASTPLRSTENGIVDQVLVTTNQDGLKFVKVRVRTTKIPQIGDKFASRHGQKGTIGITYRREDMPFTAEGIVPDLIINPHAIPSRMTVAHLIECLLSKVAALSGNEGDASPFTDITVEGISKLLREHGYQSRGFEVMYNGHTGKKLMAQIFFGPTYYQRLRHMVDDKIHARARGPMQVLTRQPVEGRSRDGGLRFGEMERDCMIAHGAASFLKERLMEASDAFRVHICGICGLMTVIAKLNHNQFECKGCDNKIDIYQIHIPYAAKLLFQELMAMNITPRLYTDRSRDF

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3
分子量 formula_weight	35330.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

MSEEGPQVKIREASKDNVDFILSNVDLAMANSLRRVMIAEIPTLAIDSVEVETNTTVLADEFIAHRLGLIPLQSMDIEQLEYSRDCFCEDHCDKCSVVLTLQAFGESESTTNVYSKDLVIVSNLMGRNIGHPIIQDKEGNGVLICKLRKGQELKLTCVAKKGIAKEHAKWGPAAAIEFEYDPWNKLKHTDYWYEQDSAKEWPQSKNCEYEDPPNEGDPFDYKAQADTFYMNVESVGSIPVDQVVVRGIDTLQKKVASILLALTQMDQDKVNFASGDNNTASNMLGSNEDVMMTGAEQDPYSNASQMGNTGSGGYDNAW

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4
分子量 formula_weight	25451.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D

MNVSTSTFQTRRRRLKKVEEEENAATLQLGQEFQLKQINHQGEEEELIALNLSEARLVIKEALVERRRAFKRSQKKHKKKHLKHENANDETTAVEDEDDDLDEDDVNADDDDFMHSETREKELESIDVLLEQTTGGNNKDLKNTMQYLTNFSRFRDQETVGAVIQLLKSTGLHPFEVAQLGSLACDTADEAKTLIPSLNNKISDDELERILKELSNLETLY

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1
分子量 formula_weight	25117.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E

MDQENERNISRLWRAFRTVKEMVKDRGYFITQEEVELPLEDFKAKYCDSMGRPQRKMMSFQANPTEESISKFPDMGSLWVEFCDEPSVGVKTMKTFVIHIQEKNFQTGIFVYQNNITPSAMKLVPSIPPATIETFNEAALVVNITHHELVPKHIRLSSDEKRELLKRYRLKESQLPRIQRADPVALYLGLKRGEVVKIIRKSETSGRYASYRICM

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2
分子量 formula_weight	17931.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F

MSDYEEAFNDGNENFEDFDVEHFSDEETYEEKPQFKDGETTDANGKTIVTGGNGPEDFQQHEQIRRKTLKEKAIPKDQRATTPYMTKYERARILGTRALQISMNAPVFVDLEGETDPLRIAMKELAEKKIPLVIRRYLPDGSFEDWSVEELIVDL

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7
分子量 formula_weight	19081.1 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G

MFFIKDLSLNITLHPSFFGPRMKQYLKTKLLEEVEGSCTGKFGYILCVLDYDNIDIQRGRILPTDGSAEFNVKYRAVVFKPFKGEVVDGTVVSCSQHGFEVQVGPMKVFVTKHLMPQDLTFNAGSNPPSYQSSEDVITIKSRIRVKIEGCISQVSSIHAIGSIKEDYLGAI

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3
分子量 formula_weight	16525.4 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H

MSNTLFDDIFQVSEVDPGRYNKVCRIEAASTTQDQCKLTLDINVELFPVAAQDSLTVTIASSLNLEDTPANDSSATRSWRPPQAGDRSLADDYDYVMYGTAYKFEEVSKDLIAVYYSFGGLLMRLEGNYRNLNNLKQENAYLLIRR

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9
分子量 formula_weight	14308.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	I

MTTFRFCRDCNNMLYPREDKENNRLLFECRTCSYVEEAGSPLVYRHELITNIGETAGVVQDIGSDPTLPRSDRECPKCHSRENVFFQSQQRRKDTSMVLFFVCLSCSHIFTSDQKNKRTQFS

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5
分子量 formula_weight	8290.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	J

MIVPVRCFSCGKVVGDKWESYLNLLQEDELDEGTALSRLGLKRYCCRRMILTHVDLIEKFLRYNPLEKRD

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11
分子量 formula_weight	13633.5 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K

MNAPDRFELFLLGEGESKLKIDPDTKAPNAVVITFEKEDHTLGNLIRAELLNDRKVLFAAYKVEHPFFARFKLRIQTTEGYDPKDALKNACNSIINKLGALKTNFETEWNLQTLAADDAF

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4
分子量 formula_weight	7730.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L

MSREGFQIPTNLDAAAAGTSQARTATLKYICAECSSKLSLSRTDAVRCKDCGHRILLKARTKRLVQFEAR

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	Transcription initiation factor IIB
分子量 formula_weight	38257.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	M

MMTRESIDKRAGRRGPNLNIVLTCPECKVYPPKIVERFSEGDVVCALCGLVLSDKLVDTRSEWRTFSNDDHNGDDPSRVGEASNPLLDGNNLSTRIGKGETTDMRFTKELNKAQGKNVMDKKDNEVQAAFAKITMLCDAAELPKIVKDCAKEAYKLCHDEKTLKGKSMESIMAASILIGCRRAEVARTFKEIQSLIHVKTKEFGKTLNIMKNILRGKSEDGFLKIDTDNMSGAQNLTYIPRFCSHLGLPMQVTTSAEYTAKKCKEIKEIAGKSPITIAVVSIYLNILLFQIPITAAKVGQTLQVTEGTIKSGYKILYEHRDKLVDPQLIANGVVSLDNLPGVEKK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 14 Entity 14 polymer

描述 description	NONTEMPLATE DNA
分子量 formula_weight	32717.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	N

CGAGAACAGTAGCACGCTGTGTATATAATAGCTATGGAACGTTCGATTCACCTCCGATGTGTGTTGTACATACATAAAAATATCATAGCACAACTGCGCTGTGTCA

实体 15 Entity 15 polymer

描述 description	TATA-box-binding protein
分子量 formula_weight	27042.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	O

MADEERLKEFKEANKIVFDPNTRQVWENQNRDGTKPATTFQSEEDIKRAAPESEKDTSATSGIVPTLQNIVATVTLGCRLDLKTVALHARNAEYNPKRFAAVIMRIREPKTTALIFASGKMVVTGAKSEDDSKLASRKYARIIQKIGFAAKFTDFKIQNIVGSCDVKFPIRLEGLAFSHGTFSSYEPELFPGLIYRMVKPKIVLLIFVSGKIVLTGAKQREEIYQAFEAIYPVLSEFRKM

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 16 Entity 16 polymer

描述 description	Transcription initiation factor IIF subunit alpha
分子量 formula_weight	82320.6 kDa
突变 mutation	;Residues indicated as UNK are of uncertain amino acid register and may deviate from the given register by few amino acids. For details about modelling of the subunits refer to the associated publication. Residues indicated as UNK with the chain identifier Z are part of an assembly between the clutch domains of Tfb2 and Ssl2 but could not be assigned to any of the two proteins with confidence since domain swapping/beta-strand exchange may occur. To account for this uncertainty, a theoretical chain Z was introduced for this residue range but not assigned to any of the PIC components. Submission based on experimental data from EMDB EMD-3846. ;
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

MSRRNPPGSRNGGGPTNASPFIKRDRMRRNFLRMRMGQNGSNSSSPGVPNGDNSRGSLVKKDDPEYAEEREKMLLQIGVEADAGRSNVKVKDEDPNEYNEFPLRAIPKEDLENMRTHLLKFQSKKKINPVTDFHLPVRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEISEYKKKAEQERSTPNSGGMNKSGTVSLNNTVKDGSQTPTVDSVTKDNTANGVNSSIPTVTGSSVPPASPTTVSAVESNGLSNGSTSAANGLDGNASTANLANGRPLVTKLEDAGPAEDPTKVGMVKYDGKEVTNEPEFEEGTMDPLADVAPDGGGRAKRGNLRRKTRQLKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDFDGYNTWVGSYEAGNSDSYVLLSVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIDEAEKRMDKKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTRRKLKAVADQQAMDEDDRDDNSEVELDYDEEFADDEEAPIIDGNEQENKESEQRIKKEMLQANAMGLRDEEAPSENEEDELFGEKKIDEDGERIKKALQKTELAALYSSDENEINPYLSESDIENKENESPVKKEEDSDTLSKSKRSSPKKQQKKATNAHVHKEPTLRVKSIKNCVIILKGDKKILKSFPEGEWNPQTTKAVDSSNNASNTVPSPIKQEEGLNSTVAEREETPAPTITEKDIIEAIGDGKVNIKEFGKFIRRKYPGAENKKLMFAIVKKLCRKVGNDHMELKKE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 17 Entity 17 polymer

描述 description	Transcription initiation factor IIF subunit beta
分子量 formula_weight	46684.5 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	R

MSSGSAGAPALSNNSTNSVAKEKSGNISGDEYLSQEEEVFDGNDIENNETKVYEESLDLDLERSNRQVWLVRLPMFLAEKWRDRNNLHGQELGKIRINKDGSKITLLLNENDNDSIPHEYDLELTKKVVENEYVFTEQNLKKYQQRKKELEADPEKQRQAYLKKQEREEELKKKQQQQKRRNNRKKFNHRVMTDRDGRDRYIPYVKTIPKKTAIVGTVCHECQVMPSMNDPNYHKIVEQRRNIVKLNNKERITTLDETVGVTMSHTGMSMRSDNSNFLKVGREKAKSNIKSIRMPKKEILDYLFKLFDEYDYWSLKGLKERTRQPEAHLKECLDKVATLVKKGPYAFKYTLRPEYKKLKEEERKATLGELADEQTGSAGDNAQGDAEADLEDEIEMEDVV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 18 Entity 18 polymer

描述 description	TEMPLATE DNA
分子量 formula_weight	32680.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polydeoxyribonucleotide
链编号 strand_id	T

TGACACAGCGCAGTTGTGCTATGATATTTTTATGTATGTACAACACACATCGGAGGTGAATCGAACGTTCCATAGCTATTATATACACAGCGTGCTACTGTTCTCG

实体 19 Entity 19 polymer

描述 description	Transcription initiation factor IIA large subunit
分子量 formula_weight	32230.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	U

MSNAEASRVYEIIVESVVNEVREDFENAGIDEQTLQDLKNIWQKKLTETKVTTFSWDNQFNEGNINGVQNDLNFNLATPGVNSSEFNIKEENTGNEGLILPNINSNNNIPHSGETNINTNTVEATNNSGATLNTNTSGNTNADVTSQPKIEVKPEIELTINNANITTVENIDDESEKKDDEEKEEDVEKTRKEKEQIEQVKLQAKKEKRSALLDTDEVGSELDDSDDDYLISEGEEDGPDENLMLCLYDKVTRTKARWKCSLKDGVVTINRNDYTFQKAQVEAEWV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 20 Entity 20 polymer

描述 description	Transcription initiation factor IIA subunit 2
分子量 formula_weight	13473.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	V

MAVPGYYELYRRSTIGNSLVDALDTLISDGRIEASLAMRVLETFDKVVAETLKDNTQSKLTVKGNLDTYGFCDDVWTFIVKNCQVTVEDSHRDASQNGSGDSQSVISVDKLRIVACNSKKSE

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 21 Entity 21 polymer

描述 description	Transcription initiation factor IIE subunit alpha
分子量 formula_weight	57538.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	W

MDRPIDDIVKNLLKFVVRGFYGGSFVLVLDAILFHSVLAEDDLKQLLSINKTELGPLIARLRSDRLISIHKQREYPPNSKSVERVYYYVKYPHAIDAIKWKVHQVVQRLKDDLDKNSEPNGYMCPICLTKYTQLEAVQLLNFDRTEFLCSLCDEPLVEDDSGKKNKEKQDKLNRLMDQIQPIIDSLKKIDDSRIXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXEDEFEDVTDTAGTAKTESNTSNDVKQESINDKTEDAVNATATASGPSANAKPNDGDDDDDDDDDEMDIEFEDV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 22 Entity 22 polymer

描述 description	Transcription initiation factor IIE subunit beta
分子量 formula_weight	37050.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	X

MSKNRDPLLANLNAFKSKVKSAPVIAPAKVGQKKTNDTVITIDGNTRKRTASERAQENTLNSAKNPVLVDIKKEAGSNSSNAISLDDDDDDEDFGSSPSKKVRPGSIAAAALQANQTDISKSHDSSKLLWATEYIQKKGKPVLVNELLDYLSMKKDDKVIELLKKLDRIEFDPKKGTFKYLSTYDVHSPSELLKLLRSQVTFKGISCKDLKDGWPQCDETINQLEEDSKILVLRTKKDKTPRYVWYNSGGNLKCIDEEFVKMWENVQLPQFAELPRKLQDLGLKPASVDPATIKRQTKRVEVKKKRQRKGKITNTHMTGILKDYSHRV

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli BL21(DE3)

实体 23 Entity 23 polymer

描述 description	DNA repair helicase RAD3
分子量 formula_weight	89064.6 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12,3.6.4.12,3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	0

MKFYIDDLPVLFPYPKIYPEQYNYMCDIKKTLDVGGNSILEMPSGTGKTVSLLSLTIAYQMHYPEHRKIIYCSRTMSEIEKALVELENLMDYRTKELGYQEDFRGLGLTSRKNLCLHPEVSKERKGTVVDEKCRRMTNGQAKRKLEEDPEANVELCEYHENLYNIEVEDYLPKGVFSFEKLLKYCEEKTLCPYFIVRRMISLCNIIIYSYHYLLDPKIAERVSNEVSKDSIVIFDEAHNIDNVCIESLSLDLTTDALRRATRGANALDERISEVRKVDSQKLQDEYEKLVQGLXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXRAEHFVSFLKRLIEYLKTRMKVLHVISETPKSFLQHLKQLTFIERKPLRFCSERLSLLVRTLEVTEVEDFTALKDIATFATLISTYEEGFLLIIEPYEIENAAVPNPIMRFTCLDASIAIKPVFERFSSVIITSGTISPLDMYPRMLNFKTVLQKSYAMTLAKKSFLPMIITKGSDQVAISSRFEIRNDPSIVRNYGSMLVEFAKITPDGMVVFFPSYLYMESIVSMWQTMGILDEVWKHKLILVETPDAQETSLALETYRKACSNGRGAILLSVARGKVSEGIDFDHQYGRTVLMIGIPFQYTESRILKARLEFMRENYRIRENDFLSFDAMRHAAQCLGRVLRGKDDYGVMVLADRRFSRKRSQLPKWIAQGLSDADLNLSTDMAISNTKQFLRTMAQPTDPKDQEGVSVWSYEDLIKHQNSRKDQGGFIENENKEGEQDEDEDEDIEMQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 24 Entity 24 polymer

描述 description	RNA polymerase II transcription factor B subunit 1
分子量 formula_weight	65440.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	1

MSHSGAAIFEKVSGIIAINEDVSPAELTWRSTDGDKVHTVVLSTIDKLQATPASSEKMMLRLIGKVDESKKRKDNEGNEVVPKPQRHMFSFNNRTVMDNIKMTLQQIISRYKDADIYEEKRRREESAQHTETPMSSSSVTAGTPTPHLDTPQLNNGAPLINTAKLDDSLSKEKLLTNLKLQQSLLKGNKVLMKVFQETVINAGLPPSEFWSTRIPLLRXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXNLSREKILNIFENYPIVKKAYTDNVPKNFKEPEFWARFFSSKLFRKXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXEVKSTLPIDLLESCRMLHTTCCEFLKHFYIHFQSGEQKQASTVKKLYNHLKDCIEKLNELFQDVLNGDGESMSNTCTAYLKPVLNSITLATHKYDEYFNEYNNNSN

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 25 Entity 25 polymer

描述 description	RNA polymerase II transcription factor B subunit 2
分子量 formula_weight	48406.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	2

MSDYSLKHSVTQYLEEIPQQVQNRLYTSPATCLAIYRILPPLAKFFIMAMVFNENEVPLLDLDKWVNSNGKLQFQNAIKSMKSLHLLIPNKSSGTLMINLNPTFKISLRNALXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXSEKVLNLLKHSKLMEEVNSTGEFKITNEGFQFLLQXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXKMDLVDVLHFIFMLGALEVGKAYKIDALSETQRIMLQDMRDYGLVFQKHSNDSIFYPTKLALMLTSDXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLPPTVVDQIRLWQLELDRVITYEGSLYSDFETSQEYNLLSKYAQDIGVLLWKDDKKKKFFISKEGNSQVLDFAKRKLKKKQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 26 Entity 26 polymer

描述 description	RNA polymerase II transcription factor B subunit 3
分子量 formula_weight	38188.4 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	3

MLMDEYEENKDMCPICKTDRYLSPDVKFLVNPECYHRICESCVDRIFSLGPAQCPYKGCDKILRKNKFKTQIFDDVEVEKEVDIRKRVFNVFNKTIDDFNGDLVEYNKYLEEVEDIIYKLDHGIDVAKTEEKLRTYEELNKQLIMNNLERSRTEIESFEQRQKFEKEMKLKKRLLERQIEEEERMNKEWTKKEIVNRLSTTTQDINETIEGVKNTVKLKKSSARRKLEELNRVLKNNPYFNSNVNVQNSRLKDAVPFTPFNGDREAHPRFTLKGSVYNDPFIKDLEHRKEFIASGFNTNYAYERVLTEAFMGLGCVISEEL

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 27 Entity 27 polymer

描述 description	RNA polymerase II transcription factor B subunit 4
分子量 formula_weight	36403.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	4

MDAISDPTFKHARSRKQVTEESPSLLTVIIEIAPKLWTTFDEEGNEKGSIIKVLEALIVFLNAHLAFNSANKVAVIAAYSQGIKYLYPXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXYRRFRNVDETLVEEIYKLFELEKKQIEQNSQRSTLAGAMSAGLTYVNRISKESVTTSLKSRLLVLTCGSGSSKDEIFQYIPIMNCIFSATKMKCPIDVVKIGGSKESTFLQQTTDATNGVYLHVESTEGLIQYLATAMFIDPXXXXXXXXXXXXXXXXXTSCYLTGRVVAVGFICSVCLCVLSIIPPGNKCPACDSQFDEHVIAKLKRKPVVPRLKAKKKVTKP

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 28 Entity 28 polymer

描述 description	RNA polymerase II transcription factor B subunit 5
分子量 formula_weight	8243.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	5

MARARKGALVQCDPSIKALILQIDAKMSDIVLEELDDTHLLVNPSKVEFVKHELNRLLSKNIYNPMDEEENQ

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 29 Entity 29 polymer

描述 description	Suppressor of stem-loop protein 1
分子量 formula_weight	51122.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	6

MAPVVISESEEDEDRVAITRRTKRQVHFDGEGDDRVDQQQQQHSSSHRDRDKHVQRKKKKRLSNRNLQGSNGGYAWEDEIKRSWDLVKVDDEGDMASLVASIVEARKKRTAKKNITPYQRGIIRSLILTLDCSEAMLEKDLRPNRHAMIIQYAIDFVHEFFDQNPISQMGIIIMRNGLAQLVSQVSGNPQDHIDALKSIRKQEPKGNPSLQNALEMARGLLLPVPAHCTREVLIVFGSLSTTDPGDIHQTIDSLVSEKIRVKVLGLSAQVAICKELCKATNYGDESFYKILLDETHLKELFNEAVTPXXXXXXXXXXXXXXXXXPTRIFEDTPTFCSCHSKLVYGGYFCPNCHSKVCSLPTVCPCCDLMLILXXXXXXXXXXXXXXKTFAEVPTTEKFRSEDCFSCQSRFPXXXXXXXXXXXXXSRYRCEDCKQEFCVDCDVFIHEILHNCPGCESKPVIT

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 30 Entity 30 polymer

描述 description	DNA repair helicase RAD25
分子量 formula_weight	94049.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.4.12,3.6.4.12,3.6.4.12,3.6.4.12,3.6.4.12
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	7

MTDVEGYQPKSKGKIFPDMGESFFSSDEDSPATDAEIDENYDDNRETSEGRGERDTGAMVTGLKKPRKKTKSSRHTAADSSMNQMDAKDKALLQDTNSDIPADFVPDSVSGMFRSHDFSYLRLRPDHASRPLWISPSDGRIILESFSPLAEQAQDFLVTIAEPISRPSHIHEYKITAYSLYAAVSVGLETDDIISVLDRLSKVPVAESIINFIKGATISYGKVKLVIKHNRYFVETTQADILQMLLNDSVIGPLRIDSDHQVQPPEDVLQQQLQQTAGKPATNVNPNDVEAVFSAVIGGDNEREEEDDDIDAVHSFEIANESVEVVKKRCQEIDYPVLEEYDFRNDHRNPDLDIDLKPSTQIRPYQEKSLSKMFGNGRARSGIIVLPCGAGKTLVGITAACTIKKSVIVLCTSSVSVMQWRQQFLXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXLVVSTYSMVANXXXXXXXXXXXXXXXXXXXWGFIILDEVHVVPAAMFRRVVSTIAAHAKLGLTATLVREDDKIGDLNFLIGPKLYEANWMELSQKGHIANVQCAEVWCPMTAEFYQEYLRETARKRMLLYIMNPTKFQACQFLIQYHERRGDKIIVFSDNVYALQEYALKMGKPFIYGSTPQQERMNILQNFQYNDQINTIFLSKVGDTSIDLPEATCLIQISSHYGSRRQEAQRLGRILRAKRRNDEGFNAFFYSLVSKDTQEMYYSTKRQAFLVDQGYAFKVITHLHGMENIPNLAYASPRERRELLQEVLLKNEEAAGIEVGDDADNSVGRGSNGHKRFKSKAVRGEGSLSGLAGGEDMAYMEYSTNKNKELKEHHPLIRKMYYKNLKK

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 31 Entity 31 polymer

描述 description	Unknown protein
分子量 formula_weight	3677.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Z

XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Trichoplusia ni

实体 32 Entity 32 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	16

实体 33 Entity 33 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 34 Entity 34 non-polymer

描述 description	IRON/SULFUR CLUSTER
分子量 formula_weight	351.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

▶

分辨率 resolution	4.70 Å
分辨率测定方法 resolution_method	—
颗粒数 num_particles	58000

STRUCTURE OF YEAST TRANSCRIPTION PRE-INITIATION COMPLEX WITH TFIIH

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC5

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体