8fee

Structure of Mce1 transporter from Mycobacterium smegmatis in the absence of LucB (Map2)

Method: ELECTRON MICROSCOPY

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Virulence factor Mce family protein

物种未注明

UniProt A0QNR2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 A; UniProt 1–409 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR3) MCE-family protein MCE1c × 1 (I7G2J2) Virulence factor mce family protein × 1 (A0QNR5) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR6) Mce-family protein mce1f × 1 (A0QNR7) ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera × 2 (A0QS64,P42212) Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a × 1 (I7F4Q4) ABC-transporter integral membrane protein × 1 (A0QNR1) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0QNR2_MYCS2
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–409; UniProt 1–409

Virulence factor Mce family protein

物种未注明

UniProt A0QNR3

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 B; UniProt 1–343 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR2) MCE-family protein MCE1c × 1 (I7G2J2) Virulence factor mce family protein × 1 (A0QNR5) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR6) Mce-family protein mce1f × 1 (A0QNR7) ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera × 2 (A0QS64,P42212) Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a × 1 (I7F4Q4) ABC-transporter integral membrane protein × 1 (A0QNR1) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A0QNR3_MYCS2
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 1–343; UniProt 1–343

MCE-family protein MCE1c

物种未注明

UniProt I7G2J2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 C; UniProt 1–524 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR2) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR3) Virulence factor mce family protein × 1 (A0QNR5) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR6) Mce-family protein mce1f × 1 (A0QNR7) ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera × 2 (A0QS64,P42212) Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a × 1 (I7F4Q4) ABC-transporter integral membrane protein × 1 (A0QNR1) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 I7G2J2_MYCS2
Isoform
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–524; UniProt 1–524

Virulence factor mce family protein

物种未注明

UniProt A0QNR5

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 D; UniProt 1–547 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR2) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR3) MCE-family protein MCE1c × 1 (I7G2J2) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR6) Mce-family protein mce1f × 1 (A0QNR7) ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera × 2 (A0QS64,P42212) Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a × 1 (I7F4Q4) ABC-transporter integral membrane protein × 1 (A0QNR1) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A0QNR5_MYCS2
Isoform
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 D; PDB构建体 1–547; UniProt 1–547

Virulence factor Mce family protein

物种未注明

UniProt A0QNR6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 E; UniProt 1–390 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR2) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR3) MCE-family protein MCE1c × 1 (I7G2J2) Virulence factor mce family protein × 1 (A0QNR5) Mce-family protein mce1f × 1 (A0QNR7) ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera × 2 (A0QS64,P42212) Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a × 1 (I7F4Q4) ABC-transporter integral membrane protein × 1 (A0QNR1) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 A0QNR6_MYCS2
Isoform
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 E; PDB构建体 1–390; UniProt 1–390

Mce-family protein mce1f

物种未注明

UniProt A0QNR7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 F; UniProt 1–518 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR2) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR3) MCE-family protein MCE1c × 1 (I7G2J2) Virulence factor mce family protein × 1 (A0QNR5) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR6) ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera × 2 (A0QS64,P42212) Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a × 1 (I7F4Q4) ABC-transporter integral membrane protein × 1 (A0QNR1) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0QNR7_MYCS2
Isoform
PDB实体 6
链与序列区间 作者链 F; PDB构建体 1–518; UniProt 1–518

ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera

物种未注明

UniProt A0QS64

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 1–360 链 H; UniProt 1–360 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR2) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR3) MCE-family protein MCE1c × 1 (I7G2J2) Virulence factor mce family protein × 1 (A0QNR5) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR6) Mce-family protein mce1f × 1 (A0QNR7) Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a × 1 (I7F4Q4) ABC-transporter integral membrane protein × 1 (A0QNR1) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0QS64_MYCS2
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360 作者链 H; PDB构建体 1–360; UniProt 1–360

ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera

物种未注明

UniProt P42212

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 G; UniProt 33–238 链 H; UniProt 33–238 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR2) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR3) MCE-family protein MCE1c × 1 (I7G2J2) Virulence factor mce family protein × 1 (A0QNR5) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR6) Mce-family protein mce1f × 1 (A0QNR7) Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a × 1 (I7F4Q4) ABC-transporter integral membrane protein × 1 (A0QNR1) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 568 个其他 PDB 条目、744 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GFP_AEQVI
Isoform
PDB实体 7
链与序列区间 作者链 G; PDB构建体 424–629; UniProt 33–238 作者链 H; PDB构建体 424–629; UniProt 33–238

Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a

物种未注明

UniProt I7F4Q4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 I; UniProt 1–266 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR2) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR3) MCE-family protein MCE1c × 1 (I7G2J2) Virulence factor mce family protein × 1 (A0QNR5) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR6) Mce-family protein mce1f × 1 (A0QNR7) ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera × 2 (A0QS64,P42212) ABC-transporter integral membrane protein × 1 (A0QNR1) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 I7F4Q4_MYCS2
Isoform
PDB实体 8
链与序列区间 作者链 I; PDB构建体 1–266; UniProt 1–266

ABC-transporter integral membrane protein

物种未注明

UniProt A0QNR1

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 信息不足 异源复合物 蛋白 × 10 PDB 声明:decameric(10) 与蛋白拷贝数一致 链 J; UniProt 1–289 未记录 Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR2) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR3) MCE-family protein MCE1c × 1 (I7G2J2) Virulence factor mce family protein × 1 (A0QNR5) Virulence factor Mce family protein × 1 (A0QNR6) Mce-family protein mce1f × 1 (A0QNR7) ABC transporter, ATP-binding protein,Green fluorescent protein chimera × 2 (A0QS64,P42212) Conserved hypothetical integral membrane protein Yrbe1a × 1 (I7F4Q4) UNL UNKNOWN LIGAND × 31 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液:pH 7.5;50 mM Tris-HCl pH 7.5, 5 mM MgSO4, 150 mM NaCl, 1 mM DDM, 1 mM DTT cryo-EM玻璃化条件:冷冻剂 ETHANE 分辨率 2.90 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly, “相对当前条目”直接指出证据层面的不同;没有差异标签表示当前已读取字段一致。

共 2 个其他 PDB 条目、2 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 A0QNR1_MYCS2
Isoform
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 J; PDB构建体 1–289; UniProt 1–289

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

暂无 SAXS 图

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

暂无 P(r) 图
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8fee
沉积日期 deposition_date2022-12-06
结构标题 titleStructure of Mce1 transporter from Mycobacterium smegmatis in the absence of LucB (Map2)
关键词 keywordsMembrane protein complex, ABC transporter, Virulence factor, Lipid transport, MEMBRANE PROTEIN; MEMBRANE PROTEIN
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

该条目暂无 SAXS 数据。

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

该条目暂无 P(r) 分析数据。

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (10)

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id8feeG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases
结构域编号 domain_id8feeH01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (0)