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8pil

E. coli transcription complex paused at ops site and bound to RfaH and NusA

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 167.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Transcription antitermination protein RfaH

Escherichia coli

UniProt P0AFW0

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 7 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物数一致 链 P； UniProt 1–162 未记录 DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A8T7） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） non-template DNA × 1 template DNA × 1 RNA × 1 Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （P0AFF6） ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8PIL Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2OUG Crystal structure of the RfaH transcription factor at 2.1A resolution 提交 2007-02-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–162（162 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG MME 5000, 50mM sodium cacodylate, 20 mM Co chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.273
2OUG Crystal structure of the RfaH transcription factor at 2.1A resolution 提交 2007-02-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 1–162（162 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG MME 5000, 50mM sodium cacodylate, 20 mM Co chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.273
2OUG Crystal structure of the RfaH transcription factor at 2.1A resolution 提交 2007-02-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 1–162（162 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG MME 5000, 50mM sodium cacodylate, 20 mM Co chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.273
2OUG Crystal structure of the RfaH transcription factor at 2.1A resolution 提交 2007-02-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 1–162（162 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；277 K；20% PEG MME 5000, 50mM sodium cacodylate, 20 mM Co chloride, pH 6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.273
5OND RfaH from Escherichia coli in complex with ops DNA 提交 2017-08-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 A 1–162（162 aa）
突变：L162A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；protein:DNA molar ratio: 1:1 reservoir solution: 21 %(w/v) PEG monomethyl ether 550, 44.4 mM HEPES (pH 7.0), 4 mM MgCl2; drops: 2ul protein/DNA solution + 2 ul reservoir solution
分辨率 2.10 Å R-free 0.233
5OND RfaH from Escherichia coli in complex with ops DNA 提交 2017-08-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白–DNA 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：dimeric
链 B 1–162（162 aa）
突变：L162A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.8；277 K；protein:DNA molar ratio: 1:1 reservoir solution: 21 %(w/v) PEG monomethyl ether 550, 44.4 mM HEPES (pH 7.0), 4 mM MgCl2; drops: 2ul protein/DNA solution + 2 ul reservoir solution
分辨率 2.10 Å R-free 0.233
6C6S CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–162（162 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6C6T CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–162（162 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8PEN fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (alternative state of RfaH) 提交 2023-06-14 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 P 1–162（162 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFG autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex), not fully complementary scaffold 提交 2023-06-15 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 P 1–162（162 aa）
突变：F51C, S139C ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFJ fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not fully complementary scaffold; alternative state of RfaH) 提交 2023-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 P 1–162（162 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8PHK fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site 提交 2023-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 P 1–162（162 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PIB autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex) 提交 2023-06-21 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 P 1–162（162 aa）
突变：F51C, S139C ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8PID backtracked E. coli transcription complex paused at ops site and bound to RfaH 提交 2023-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 P 1–162（162 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8PIM fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not complementary scaffold) 提交 2023-06-22 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 P 1–162（162 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å

共 11 个其他 PDB 条目、15 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RFAH_ECOLI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 P； PDB构建体 3–164； UniProt 1–162

DNA-directed RNA polymerase subunit beta

Escherichia coli

UniProt P0A8V2

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 7 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物数一致 链 I； UniProt 1–1342 未记录 Transcription antitermination protein RfaH × 1 （P0AFW0） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A8T7） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） non-template DNA × 1 template DNA × 1 RNA × 1 Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （P0AFF6） ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8PIL Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
10MA Closed Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with a closed active site (closed TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
10MB Open1 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
10MC Open2 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
10MD Open3 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
3IYD Three-dimensional EM structure of an intact activator-dependent transcription initiation complex 提交 2009-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM HEPES, 100 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.2 mM cAMP；pH 8；25 mM HEPES, 100 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.2 mM cAMP
分辨率 19.80 Å
3LTI Crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase beta subunit beta2-betai4 domains 提交 2010-02-16 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 152–443（292 aa） 片段：beta2-beta-i-4 domains
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；298 K；0.2 M potassium-sodium tartrate, 20% PEG 3350, pH 8, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 1.60 Å R-free 0.230
3LU0 Molecular model of Escherichia coli core RNA polymerase 提交 2010-02-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 Tris-HCl；pH 8；Tris-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.20 Å
3TBI Crystal structure of T4 gp33 bound to E. coli RNAP beta-flap domain 提交 2011-08-06 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 831–1057（227 aa） 片段：beta-flap domain (UNP residues 831-1057)
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；pH 8.5；295 K；0.1 M triethylamine N-oxide, 20% PEG2000 MME, 0.1 M Tris, pH 8.5, VAPOR DIFFUSION, temperature 295K
分辨率 3.00 Å R-free 0.295
4JK1 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with Guanosine tetraphosphate (ppGpp) 提交 2013-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.320
4JK1 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with Guanosine tetraphosphate (ppGpp) 提交 2013-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.320
4JK2 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with guanosine pentaphosphate (pppGpp) 提交 2013-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 0O2 guanosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) 3'-(trihydrogen diphosphate) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.20 Å R-free 0.322
4JK2 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with guanosine pentaphosphate (pppGpp) 提交 2013-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.20 Å R-free 0.322
4KMU X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Rifampin 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.85 Å R-free 0.321
4KMU X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Rifampin 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 1–1342（1342 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.85 Å R-free 0.321
4KN4 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2b 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 1RL Benzoxazinorifamycin-2b × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.96 Å R-free 0.315
4KN4 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2b 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 1–1342（1342 aa）
未记录 1RL Benzoxazinorifamycin-2b × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.96 Å R-free 0.315
4KN7 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2c 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 1RM Benzoxazinorifamycin-2c × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.69 Å R-free 0.309
4KN7 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2c 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 H 1–1342（1342 aa）
未记录 1RM Benzoxazinorifamycin-2c × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.69 Å R-free 0.309
4MEX Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with salinamide A 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.325
4MEX Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with salinamide A 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.325
4MEY Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase holoenzyme 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.95 Å R-free 0.325
4MEY Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase holoenzyme 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.95 Å R-free 0.325
4ZH2 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBR703 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 4OB N-hydroxy-N'-phenyl-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.20 Å R-free 0.288
4ZH2 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBR703 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 4OB N-hydroxy-N'-phenyl-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.20 Å R-free 0.288
4ZH3 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRH16-Br 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 4OD N'-(3-bromophenyl)-4-fluoro-N-hydroxy-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.08 Å R-free 0.267
4ZH3 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRH16-Br 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 4OD N'-(3-bromophenyl)-4-fluoro-N-hydroxy-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.08 Å R-free 0.267
4ZH4 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRP18 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 4OE 5-(4-fluorophenyl)-4-[4-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 3.99 Å R-free 0.283
4ZH4 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRP18 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 4OE 5-(4-fluorophenyl)-4-[4-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 3.99 Å R-free 0.283
5IPL SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 DPO DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.60 Å R-free 0.293
5IPM SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.20 Å R-free 0.330
5IPN SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.61 Å R-free 0.345
5MS0 pseudo-atomic model of the RNA polymerase lambda-based antitermination complex solved by cryo-EM 提交 2016-12-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.80 Å
5NSR Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holo enzyme with promoter DNA closed complex 提交 2017-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5NSS Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holoenzyme with promoter DNA and transcription activator PspF intermedate complex 提交 2017-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5NWT Crystal Structure of Escherichia coli RNA polymerase - Sigma54 Holoenzyme complex 提交 2017-05-08 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；291 K；9% PEG8000, 18% Ethylene glycol, 100mM Sodium HEPES/MOPS Buffer, 0.03M NaF, 0.03M NaBr, 0.03M NaI, 0-10mM DTT
分辨率 3.76 Å R-free 0.370
5UAC Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, wild-type 提交 2016-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.295
5UAC Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, wild-type 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.295
5UAG Escherichia coli RNA polymerase mutant - RpoB D516V 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：D516V MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.40 Å R-free 0.311
5UAG Escherichia coli RNA polymerase mutant - RpoB D516V 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
突变：D516V MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.40 Å R-free 0.311
5UAH Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB D516V mutant 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：D516V RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.287
5UAH Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB D516V mutant 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
突变：D516V MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.287
5UAJ Escherichia coli RNA polymerase RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：S531L MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.92 Å R-free 0.307
5UAJ Escherichia coli RNA polymerase RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
突变：S531L MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.92 Å R-free 0.307
5UAL Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：S531L RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.89 Å R-free 0.286
5UAL Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
突变：S531L MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.89 Å R-free 0.286
5UAQ Escherichia coli RNA polymerase RpoB H526Y mutant 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：H526Y MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
5UAQ Escherichia coli RNA polymerase RpoB H526Y mutant 提交 2016-12-19 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
突变：H526Y MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
5VSW X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA/ppGpp complex 提交 2017-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 0.2 M calcium acetate, 25 % PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.29 Å R-free 0.259
5VSW X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA/ppGpp complex 提交 2017-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 0.2 M calcium acetate, 25 % PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.29 Å R-free 0.259
5VT0 Escherichia coli 6S RNA derivative in complex with Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme 提交 2017-05-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 3.81 Å R-free 0.262
5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 3.81 Å R-free 0.262
5W1T X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M CA-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 4.50 Å R-free 0.276
5W1T X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M CA-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 4.50 Å R-free 0.276
6ALF CryoEM structure of crosslinked E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM KCl, 5mM MgCl2, 5mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6ALG CryoEM structure of HK022 Nun - E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM Potassium Chloride, 5 mM Magnesium Chloride, 5 mM Dithreitol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6ALH CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM KCl, 5mM MgCl2, 5mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6ASX CryoEM structure of E.coli his pause elongation complex 提交 2017-08-25 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM potassium glutamate, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6BJS CryoEM structure of E.coli his pause elongation complex without pause hairpin 提交 2017-11-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM potassium glutamate, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6BYU X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase (RpoB-H526Y) and ppApp complex 提交 2017-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ECJ (5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-({[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-oxo-4,5-dihydrofuran-3-yl trihydrogen diphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M MgCl2, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.311
6BYU X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase (RpoB-H526Y) and ppApp complex 提交 2017-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ECJ (5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-({[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-oxo-4,5-dihydrofuran-3-yl trihydrogen diphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M MgCl2, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.311
6C6S CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6C6T CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6C6U CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with NusG 提交 2018-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6C9Y Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma70 holoenzyme 提交 2018-01-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6CA0 Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma70 open complex 提交 2018-01-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6CUX Escherichia coli RpoB S531L mutant RNA polymerase holoenzyme in complex with Kanglemycin A 提交 2018-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 KNG Kanglemycin A × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.255
6CUX Escherichia coli RpoB S531L mutant RNA polymerase holoenzyme in complex with Kanglemycin A 提交 2018-03-26 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.255
6FLP CryoEM structure of E.coli RNA polymerase paused elongation complex without RNA hairpin bound to NusA 提交 2018-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6FLQ CryoEM structure of E.coli RNA polymerase paused elongation complex bound to NusA 提交 2018-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GFW Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme initial transcribing complex 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6GH5 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme transcription open complex 提交 2018-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6GH6 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme intermediate partially loaded complex 提交 2018-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6JBQ CryoEM structure of Escherichia coli sigmaE transcription initiation complex containing 5nt of RNA 提交 2019-01-26 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.02 Å
6JNX Cryo-EM structure of a Q-engaged arrested complex 提交 2019-03-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
6K4Y CryoEM structure of sigma appropriation complex 提交 2019-05-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
6KJ6 cryo-EM structure of Escherichia coli Crl transcription activation complex 提交 2019-07-21 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 8 seconds before plunging
分辨率 3.80 Å
6LDI The cryo-EM structure of E. coli CueR transcription activation complex 提交 2019-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 AG SILVER ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
6N57 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation I 提交 2018-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6N58 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation II 提交 2018-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
6N60 Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream fork promoter DNA and Microcin J25 (MccJ25) 提交 2018-11-23 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M HEPES, pH 6.7, 0.2 M magnesium chloride, 7% w/v PEG3350, 4% v/v glycerol
分辨率 3.68 Å R-free 0.306
6N61 Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream fork promoter DNA and Capistruin 提交 2018-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M HEPES, pH 6.8, 0.2 M magnesium chloride, 7% w/v PEG3350, 4% v/v glycerol, 4% v/v ethylene glycol
分辨率 3.25 Å R-free 0.316
6P18 Q21 transcription antitermination complex: loading complex 提交 2019-05-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6P19 Q21 transcription antitermination complex: loaded complex 提交 2019-05-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6R9B Cryo-EM structure of bacterial RNAP with a DNA mimic protein Ocr from T7 phage 提交 2019-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6R9G Structural basis of transcription inhibition by the DNA mimic Ocr protein of bacteriophage T7 提交 2019-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RH3 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase elongation complex bound to CTP substrate 提交 2019-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6RI7 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase elongation complex bound to GreB transcription factor 提交 2019-04-23 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6RI9 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex in non-swiveled state 提交 2019-04-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RIN Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex bound to GreB transcription factor 提交 2019-04-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RIP Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex in swiveled state 提交 2019-04-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6UTV E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA ("Fresh" crystal soaked with CTP, UTP, GTP, and ddATP for 150 seconds) 提交 2019-10-30 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 CCC 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.45 Å R-free 0.348
6XAS CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6XAV CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex bound with NusG 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6ZTL E. coli 70S-RNAP expressome complex in collided state bound to NusG 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：62-meric
链 CC 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 441 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7BEF Structures of class II bacterial transcription complexes 提交 2020-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7C17 The cryo-EM structure of E. coli CueR transcription activation complex with fully duplex promoter DNA 提交 2020-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 AG SILVER ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.22 Å
7C97 Cryo-EM structure of an Escherichia coli RNAP-promoter open complex (RPo) with SspA 提交 2020-06-05 突变/修饰不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：D516V MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
7CHW Cryo-EM structure of an Escherichia coli RNAP-promoter open complex (RPo) 提交 2020-07-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
分辨率 3.58 Å
7DY6 A refined cryo-EM structure of an Escherichia coli RNAP-promoter open complex (RPo) with SspA 提交 2021-01-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
7EGS The crystal structure of lobe domain of E. coli RNA polymerase complexed with the C-terminal domain of UvrD 提交 2021-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 152–443（292 aa）
未记录 GOL GLYCEROL × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M HEPES pH 7.0, 10% w/v polyethylene glycol 4000, 10 % (v/v) isopropanol
分辨率 1.70 Å R-free 0.234
7KHB Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter open complex 提交 2020-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
7KHC Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter closed complex 提交 2020-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
7KHE Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter pre-open complex with DksA/ppGpp 提交 2020-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7KHI Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter complex with DksA/ppGpp 提交 2020-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7QV9 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7QWP CryoEM structure of bacterial transcription close complex (RPc) 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM KCl, 10 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7QXI Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holo enzyme with promoter DNA closed complex 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM KCl, 10 mM MgCl2,8 mM CHAPSO
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7SZJ Cryo-EM structure of Rifamycin bound to E. coli RNAP and rrnBP1 promoter complex 提交 2021-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7SZK Cryo-EM structure of 27a bound to E. coli RNAP and rrnBP1 promoter complex 提交 2021-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 D9X (2S,7R,7aR,13aP,16Z,18E,20S,21S,22R,23R,24R,25S,26R,27S,28E)-5,21,23-trihydroxy-27-methoxy-2,4,16,20,22,24,26-heptamethyl-10-[4-(2-methylpropyl)piperazin-1-yl]-12-({4-[(morpholin-4-yl)methyl]phenyl}methoxy)-1,6,15-trioxo-1,2,7,7a-tetrahydro-6H-2,7-(epoxypentadeca[1,11,13]trienoimino)[1]benzofuro[4,5-a]phenoxazin-25-yl acetate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7VWY Cryo-EM structure of Rob-dependent transcription activation complex in a unique conformation 提交 2021-11-12 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：D516V ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.57 Å
7VWZ Cryo-EM structure of Rob-dependent transcription activation complex in a unique conformation 提交 2021-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7W5W Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with micF promoter DNA 提交 2021-11-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：D516V ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
7W5X Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with zwf promoter DNA 提交 2021-11-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：D516V 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7W5Y Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with fpr promoter DNA 提交 2021-11-30 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：D516V 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XUE Cryo-EM structure of HK022 putRNA-associated E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.17 Å
7XUG cryo-EM structure of HK022 putRNA-less E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.57 Å
7XUI Cryo-EM structure of sigma70 bound HK022 putRNA-associated E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.61 Å
7YP9 Cryo-EM structure of Escherichia coli paused complex of transcription termination (TTC-pause) 提交 2022-08-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7YPA Cryo-EM structure of Escherichia coli hairpin-nucleation complex of transcription termination (TTC-hairpin) 提交 2022-08-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
7YPB Cryo-EM structure of Escherichia coli release complex of transcription termination (TTC-release) 提交 2022-08-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
8ABY RNA polymerase bound to purified in vitro transcribed regulatory RNA putL - pause prone, closed clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 3.70 Å
8ABZ RNA polymerase at U-rich pause bound to non-regulatory RNA - pause prone, closed clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 3.40 Å
8AC0 RNA polymerase at U-rich pause bound to regulatory RNA putL - active, closed clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.10 Å
8AC1 RNA polymerase at U-rich pause bound to non-regulatory RNA - inactive, open clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.06 Å
8AC2 RNA polymerase- post-terminated, open clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 3.70 Å
8ACP RNA polymerase at U-rich pause bound to regulatory RNA putL - inactive, open clamp state 提交 2022-07-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.50 Å
8AD1 RNA polymerase at U-rich pause bound to RNA putL triple mutant - pause prone, closed clamp state 提交 2022-07-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.10 Å
8F1I SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to mismatch fragment dhsU36mm1 (-12T) 提交 2022-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8F1J SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to mismatch DNA fragment dhsU36mm2 (-12A) 提交 2022-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8F1K SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to full duplex DNA fragment dhsU36 (-12T) 提交 2022-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8F3C Cryo-EM consensus structure of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase minus preQ1 ligand 提交 2022-11-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION WAS CARRIED OUT IN A CHAMBER WITH THE TEMPERATURE SET TO 4 DEGREES CELSIUS.
分辨率 3.40 Å
8FIX Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex harboring a terminal mismatch 提交 2022-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8FIY Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase Elongation complex in the Transcription-Translation Complex (RNAP in an anti-swiveled conformation) 提交 2022-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：heptameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
8FTD Structure of Escherichia coli CedA in complex with transcription initiation complex 提交 2023-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8FVR CryoEM structure of E.coli transcription elongation complex 提交 2023-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 F 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 10 uM ZnCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.42 Å
8FVW CryoEM structure of E.coli transcription elongation complex bound to ppGpp 提交 2023-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 F 1–1342（1342 aa）
未记录 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 10 uM ZnCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.10 Å
8G00 Cryo-EM structure of 3DVA component 0 of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase minus preQ1 ligand 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION WAS CARRIED OUT IN A CHAMBER WITH THE TEMPERATURE SET TO 4 DEGREES CELSIUS.
分辨率 3.40 Å
8G1S Cryo-EM structure of 3DVA component 1 of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase minus preQ1 ligand 提交 2023-02-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；50 mM TRIS-HCl, pH 7.5; 100 mM potassium chloride, 1mM
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Vitrification was carried out in a chamber with the temperature set to 4 C.
分辨率 3.70 Å
8HKC Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma32 complex 提交 2022-11-25 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 C 2–1342（1341 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
8IGR Cryo-EM structure of CII-dependent transcription activation complex 提交 2023-02-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8IGS Cryo-EM structure of RNAP-promoter open complex at lambda promoter PRE 提交 2023-02-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8K58 The cryo-EM map of close TIEA-TEC complex 提交 2023-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 3–1342（1340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
8K59 The cryo-EM map of TIC-TIEA complex 提交 2023-07-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 C 3–1342（1340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8K5A The cryo-EM map of open TIEA-TEC complex 提交 2023-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 3–1342（1340 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PDY E. coli RNA polymerase paused at ops site 提交 2023-06-13 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PEN fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (alternative state of RfaH) 提交 2023-06-14 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFG autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex), not fully complementary scaffold 提交 2023-06-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFJ fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not fully complementary scaffold; alternative state of RfaH) 提交 2023-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8PH9 E. coli RNA polymerase paused at ops site (non-complementary scaffold) 提交 2023-06-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8PHK fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site 提交 2023-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PIB autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex) 提交 2023-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8PID backtracked E. coli transcription complex paused at ops site and bound to RfaH 提交 2023-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8PIM fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not complementary scaffold) 提交 2023-06-22 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8RE4 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 5nt pre-translocated complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1341（1341 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8REA Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 5nt post-translocated complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1341（1341 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8REB Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 6nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1341（1341 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8REC Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 7nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1341（1341 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8RED Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 8nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1341（1341 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8REE Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 9nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1341（1341 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8SY5 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dS-BTP base pair in the active site 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X0F 2-oxo-2-hydroadenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8SY6 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dB-UTP base pair in the active site 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 DGP 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
8SY7 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dB-STP base pair in the active site 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X0O [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S})-5-(4-azanyl-1-methyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8SZW Reconstituted E. coli RNA polymerase post-termination complex on negatively-supercoiled DNA: open duplex DNA (rPTCo) 提交 2023-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
8T02 Reconstituted E. coli RNA polymerase post-termination complex on negatively-supercoiled DNA: unwinding duplex DNA (rPTCi) 提交 2023-05-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
8TO1 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1a) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.80 Å
8TO6 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1d) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TO8 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1b) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TOE Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1c) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TOM Escherichia coli RNA polymerase closed complex intermediate at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final.
分辨率 3.10 Å
8TXO E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound to the unnatural dZ-PTP base pair in the active site 提交 2023-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：heptameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 S9F [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanyl-2-oxidanylidene-1$l^{4},3,5,7-tetrazabicyclo[4.3.0]nona-1(6),3,8-trien-7-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8U3B Cryo-EM structure of E. coli NarL-transcription activation complex at 3.2A 提交 2023-09-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
8UPO Escherichia coli transcription-translation coupled complex class A (TTC-A) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 21 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-23 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
8UPR Escherichia coli transcription-translation coupled complex class A (TTC-A) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 21 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-23 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8UQL Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH in loaded state, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8UQM Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH in loaded state, NusA, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8UQP Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UR0 Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8URH Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 27 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-26 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8URI Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 27 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-26 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8URX Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8URY Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNA in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VKV Escherichia coli transcription-translation coupled complex (TTC-B) containing mRNA with a 33 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VL1 Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 36 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-11 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8VOO Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 39 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8VOP Escherichia coli transcription-translation coupled complex (TTC-B) containing mRNA with a 36 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.00 Å
8VOQ Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 39 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.30 Å
8VOR Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 51 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VOS Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 60 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8Y5K E.coli transcription translation coupling complex in TTC-A state 2 containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
8Y5L E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8Y5M E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 2 containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5N E.coli transcription translation coupling complex in TTC-A state 3 containing mRNA with 21-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5O E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8Y5P E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 1) containing mRNA with 24-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：67-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
8Y5Q E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：66-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8Y5R E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 1) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5S E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5T E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 3) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8Y6U Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with transcription factor GcvA 提交 2024-02-03 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 C 1–1342（1342 aa）
突变：D516V 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.97 Å
8YDE E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 3) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
8YDF E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDG E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
8YDH E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass1) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
8YDI E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDJ E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 B2 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
9GDA RNAP-TopoI complex on duplex scaffold 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9GDB RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - consensus reconstruction 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9GDC RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - single-bubble configuration 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9GDD RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - two-bubble configuration 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9GDE RNAP-TopoI complex on long-overhang scaffold - orientation 1 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9GDH RNAP-TopoI complex on long-overhang scaffold - orientation 2 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9GUR 30S mRNA delivery complex TEC resolved (TEC only) 提交 2024-09-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 3 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9GUW 30S-TEC (TEC in expressome position) Inactive state 2 提交 2024-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：30-meric
链 3 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 118 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9GUX 30S-TEC (TEC in expressome position) Inactive state 1 提交 2024-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：31-meric
链 3 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 132 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9L0X Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with Escherichia phage Mu late transcription activator C 提交 2024-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
9L0Y Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with Escherichia phage Mu middle transcription activator Mor 提交 2024-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
9MSE de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with pre-catalytic bEBP state (RPi1 open ring) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9MSF de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with post-catalytic bEBP state (RPi1 closed ring) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9MSG De novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with bound SigN-RII 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9MSH de novo SigN RNA polymerase open complex (RPo) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9MSJ de novo SigN RNA polymerase NTP-bound open complex (RPo+2A) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9Q90 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9Q91 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 6 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 1–1341（1341 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
9Q92 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 5 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 1–1341（1341 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
9Q93 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 4 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 C 1–1341（1341 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
9Q94 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 3 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
9Q95 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -10 to -1 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
9Q96 Cryo-EM Structure of Bacterial RNA polymerase-sigma54 transcription open complex with wild type sigma54, from RPi(-10-1) 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
9Q97 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 2 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
9Q98 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 1 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.30 Å
9Y79 Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC^walked) containing mRNA with a 39 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2025-09-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AA 1–1342（1342 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å
9YMU De novo initial transcribing RNA polymerase with 2-mer RNA and bound CTP / Michaelis complex (RPitc2+CTP) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMV De novo initial transcribing RNA polymerase with pretranslocated 3-mer RNA / product complex (RPitc3) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9YMW De novo initial transcribing RNA polymerase with 5-mer RNA CCAUC (RPitc5a) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMX De novo initial transcribing RNA polymerase with 5-mer RNA AUCUA (RPitc5b) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMY De novo initial transcribing RNA polymerase with 9-mer RNA (RPitc9) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YN0 De novo initial transcribing RNA polymerase with sigma 70 region 1.1 bound (RPitc-s70_1.1) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 I 1–1342（1342 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YNP Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription initiation complex with GpA and pseudouridimycin (PUM) 提交 2025-10-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 PUM (1S)-1,4-anhydro-5-[(N-carbamimidoylglycyl-N~2~-hydroxy-L-glutaminyl)amino]-5-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-D-ribitol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
9YNQ Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription initiation complex with GpA and des-hydroxy pseudouridimycin (des-hydroxy PUM) 提交 2025-10-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–1342（1342 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 A1CYH (1S)-1,4-anhydro-5-[(N-carbamimidoylglycyl-L-glutaminyl)amino]-5-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-D-ribitol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å

共 219 个其他 PDB 条目、240 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

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UniProt名称 RPOB_ECOLI
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 I； PDB构建体 1–1342； UniProt 1–1342

;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ;

Escherichia coli

UniProt P0A8T7

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 7 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物数一致 链 J； UniProt 2–1407 未记录 Transcription antitermination protein RfaH × 1 （P0AFW0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V2） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） non-template DNA × 1 template DNA × 1 RNA × 1 Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （P0AFF6） ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8PIL Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
10MA Closed Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with a closed active site (closed TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
10MB Open1 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
10MC Open2 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
10MD Open3 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 10 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 D 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 11 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 B 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 C 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 D 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 B 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 C 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 D 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 E 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 B 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 C 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 D 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 E 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 B 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 C 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 D 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 E 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2AUK Structure of E. coli RNA polymerase beta' G/G' insert 提交 2005-08-28 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 9 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric
链 B 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 C 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
链 E 944–1129（186 aa） 片段：residues 5-190
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 9.5；298 K；CHES/sodium formate/dioxane, pH 9.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.30 Å R-free 0.264
2LMC Structure of T7 transcription factor Gp2-E. coli RNAp jaw domain complex 提交 2011-11-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 1151–1213（63 aa） 片段：UNP residues 1151-1213
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.05；压力 ambient
NMR样品组成 300 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Gp2-Jaw complex, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3IYD Three-dimensional EM structure of an intact activator-dependent transcription initiation complex 提交 2009-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM HEPES, 100 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.2 mM cAMP；pH 8；25 mM HEPES, 100 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.2 mM cAMP
分辨率 19.80 Å
3LU0 Molecular model of Escherichia coli core RNA polymerase 提交 2010-02-16 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 Tris-HCl；pH 8；Tris-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.20 Å
4IQZ The crystal structure of a large insert in RNA polymerase (RpoC) subunit from E. coli 提交 2013-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 932–1141（210 aa） 片段：unp residues 932-1141
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IOD IODIDE ION × 15 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；0.2 M KCl, 0.04 M Tris pH 7.9, 0.1 M Phosphate-Citrate, 1.6 M Sodium di-Hydrogen Phosphate, 0.4 M di-Potassium Hydrogen Phosphate, 0.05 M Sodium Iodide , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.240
4IQZ The crystal structure of a large insert in RNA polymerase (RpoC) subunit from E. coli 提交 2013-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 932–1141（210 aa） 片段：unp residues 932-1141
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IOD IODIDE ION × 13 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；0.2 M KCl, 0.04 M Tris pH 7.9, 0.1 M Phosphate-Citrate, 1.6 M Sodium di-Hydrogen Phosphate, 0.4 M di-Potassium Hydrogen Phosphate, 0.05 M Sodium Iodide , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.240
4IQZ The crystal structure of a large insert in RNA polymerase (RpoC) subunit from E. coli 提交 2013-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 932–1141（210 aa） 片段：unp residues 932-1141
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IOD IODIDE ION × 11 NA SODIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；0.2 M KCl, 0.04 M Tris pH 7.9, 0.1 M Phosphate-Citrate, 1.6 M Sodium di-Hydrogen Phosphate, 0.4 M di-Potassium Hydrogen Phosphate, 0.05 M Sodium Iodide , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.240
4IQZ The crystal structure of a large insert in RNA polymerase (RpoC) subunit from E. coli 提交 2013-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 932–1141（210 aa） 片段：unp residues 932-1141
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IOD IODIDE ION × 13 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；0.2 M KCl, 0.04 M Tris pH 7.9, 0.1 M Phosphate-Citrate, 1.6 M Sodium di-Hydrogen Phosphate, 0.4 M di-Potassium Hydrogen Phosphate, 0.05 M Sodium Iodide , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.240
4IQZ The crystal structure of a large insert in RNA polymerase (RpoC) subunit from E. coli 提交 2013-01-14 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 932–1141（210 aa） 片段：unp residues 932-1141
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） IOD IODIDE ION × 4 NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.2；277 K；0.2 M KCl, 0.04 M Tris pH 7.9, 0.1 M Phosphate-Citrate, 1.6 M Sodium di-Hydrogen Phosphate, 0.4 M di-Potassium Hydrogen Phosphate, 0.05 M Sodium Iodide , VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K
分辨率 2.10 Å R-free 0.240
4JK1 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with Guanosine tetraphosphate (ppGpp) 提交 2013-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.320
4JK1 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with Guanosine tetraphosphate (ppGpp) 提交 2013-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.320
4JK2 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with guanosine pentaphosphate (pppGpp) 提交 2013-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 0O2 guanosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) 3'-(trihydrogen diphosphate) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.20 Å R-free 0.322
4JK2 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with guanosine pentaphosphate (pppGpp) 提交 2013-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.20 Å R-free 0.322
4KMU X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Rifampin 提交 2013-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.85 Å R-free 0.321
4KMU X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Rifampin 提交 2013-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1407（1407 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.85 Å R-free 0.321
4KN4 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2b 提交 2013-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 1RL Benzoxazinorifamycin-2b × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.96 Å R-free 0.315
4KN4 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2b 提交 2013-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1407（1407 aa）
未记录 1RL Benzoxazinorifamycin-2b × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.96 Å R-free 0.315
4KN7 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2c 提交 2013-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 1RM Benzoxazinorifamycin-2c × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.69 Å R-free 0.309
4KN7 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2c 提交 2013-05-08 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1407（1407 aa）
未记录 1RM Benzoxazinorifamycin-2c × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.69 Å R-free 0.309
4MEX Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with salinamide A 提交 2013-08-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.325
4MEX Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with salinamide A 提交 2013-08-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.325
4MEY Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase holoenzyme 提交 2013-08-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.95 Å R-free 0.325
4MEY Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase holoenzyme 提交 2013-08-27 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.95 Å R-free 0.325
4ZH2 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBR703 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 4OB N-hydroxy-N'-phenyl-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.20 Å R-free 0.288
4ZH2 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBR703 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 4OB N-hydroxy-N'-phenyl-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.20 Å R-free 0.288
4ZH3 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRH16-Br 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 4OD N'-(3-bromophenyl)-4-fluoro-N-hydroxy-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.08 Å R-free 0.267
4ZH3 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRH16-Br 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 4OD N'-(3-bromophenyl)-4-fluoro-N-hydroxy-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.08 Å R-free 0.267
4ZH4 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRP18 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 4OE 5-(4-fluorophenyl)-4-[4-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 3.99 Å R-free 0.283
4ZH4 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRP18 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 4OE 5-(4-fluorophenyl)-4-[4-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 3.99 Å R-free 0.283
5IPL SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 DPO DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.60 Å R-free 0.293
5IPM SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.20 Å R-free 0.330
5IPN SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.61 Å R-free 0.345
5MS0 pseudo-atomic model of the RNA polymerase lambda-based antitermination complex solved by cryo-EM 提交 2016-12-29 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.80 Å
5MY1 E. coli expressome 提交 2017-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：26-meric
链 Y 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
5NSR Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holo enzyme with promoter DNA closed complex 提交 2017-04-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5NSS Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holoenzyme with promoter DNA and transcription activator PspF intermedate complex 提交 2017-04-26 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：octameric
链 D 1–98（98 aa）
链 D 99–1407（1309 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5NWT Crystal Structure of Escherichia coli RNA polymerase - Sigma54 Holoenzyme complex 提交 2017-05-08 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；291 K；9% PEG8000, 18% Ethylene glycol, 100mM Sodium HEPES/MOPS Buffer, 0.03M NaF, 0.03M NaBr, 0.03M NaI, 0-10mM DTT
分辨率 3.76 Å R-free 0.370
5UAC Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, wild-type 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.295
5UAC Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, wild-type 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.295
5UAG Escherichia coli RNA polymerase mutant - RpoB D516V 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.40 Å R-free 0.311
5UAG Escherichia coli RNA polymerase mutant - RpoB D516V 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.40 Å R-free 0.311
5UAH Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB D516V mutant 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.287
5UAH Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB D516V mutant 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.287
5UAJ Escherichia coli RNA polymerase RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.92 Å R-free 0.307
5UAJ Escherichia coli RNA polymerase RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.92 Å R-free 0.307
5UAL Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.89 Å R-free 0.286
5UAL Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.89 Å R-free 0.286
5UAQ Escherichia coli RNA polymerase RpoB H526Y mutant 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
5UAQ Escherichia coli RNA polymerase RpoB H526Y mutant 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
5VSW X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA/ppGpp complex 提交 2017-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 0.2 M calcium acetate, 25 % PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.29 Å R-free 0.259
5VSW X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA/ppGpp complex 提交 2017-05-12 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 0.2 M calcium acetate, 25 % PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.29 Å R-free 0.259
5VT0 Escherichia coli 6S RNA derivative in complex with Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme 提交 2017-05-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 3.81 Å R-free 0.262
5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 3.81 Å R-free 0.262
5W1T X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA complex 提交 2017-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M CA-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 4.50 Å R-free 0.276
5W1T X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA complex 提交 2017-06-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M CA-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 4.50 Å R-free 0.276
6ALF CryoEM structure of crosslinked E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM KCl, 5mM MgCl2, 5mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6ALG CryoEM structure of HK022 Nun - E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM Potassium Chloride, 5 mM Magnesium Chloride, 5 mM Dithreitol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6ALH CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM KCl, 5mM MgCl2, 5mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6ASX CryoEM structure of E.coli his pause elongation complex 提交 2017-08-25 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM potassium glutamate, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6BJS CryoEM structure of E.coli his pause elongation complex without pause hairpin 提交 2017-11-06 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM potassium glutamate, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6BYU X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase (RpoB-H526Y) and ppApp complex 提交 2017-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ECJ (5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-({[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-oxo-4,5-dihydrofuran-3-yl trihydrogen diphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M MgCl2, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.311
6BYU X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase (RpoB-H526Y) and ppApp complex 提交 2017-12-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ECJ (5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-({[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-oxo-4,5-dihydrofuran-3-yl trihydrogen diphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M MgCl2, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.311
6C6S CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6C6T CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6C6U CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with NusG 提交 2018-01-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6C9Y Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma70 holoenzyme 提交 2018-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6CA0 Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma70 open complex 提交 2018-01-29 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6CUX Escherichia coli RpoB S531L mutant RNA polymerase holoenzyme in complex with Kanglemycin A 提交 2018-03-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 KNG Kanglemycin A × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.255
6CUX Escherichia coli RpoB S531L mutant RNA polymerase holoenzyme in complex with Kanglemycin A 提交 2018-03-26 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.255
6FLP CryoEM structure of E.coli RNA polymerase paused elongation complex without RNA hairpin bound to NusA 提交 2018-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6FLQ CryoEM structure of E.coli RNA polymerase paused elongation complex bound to NusA 提交 2018-01-26 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GFW Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme initial transcribing complex 提交 2018-05-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6GH5 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme transcription open complex 提交 2018-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6GH6 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme intermediate partially loaded complex 提交 2018-05-04 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6JBQ CryoEM structure of Escherichia coli sigmaE transcription initiation complex containing 5nt of RNA 提交 2019-01-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.02 Å
6JNX Cryo-EM structure of a Q-engaged arrested complex 提交 2019-03-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
6K4Y CryoEM structure of sigma appropriation complex 提交 2019-05-27 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
6KJ6 cryo-EM structure of Escherichia coli Crl transcription activation complex 提交 2019-07-21 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 8 seconds before plunging
分辨率 3.80 Å
6LDI The cryo-EM structure of E. coli CueR transcription activation complex 提交 2019-11-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 AG SILVER ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
6N57 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation I 提交 2018-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6N58 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation II 提交 2018-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
6N60 Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream fork promoter DNA and Microcin J25 (MccJ25) 提交 2018-11-23 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 2–1407（1406 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M HEPES, pH 6.7, 0.2 M magnesium chloride, 7% w/v PEG3350, 4% v/v glycerol
分辨率 3.68 Å R-free 0.306
6N61 Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream fork promoter DNA and Capistruin 提交 2018-11-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 2–1407（1406 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M HEPES, pH 6.8, 0.2 M magnesium chloride, 7% w/v PEG3350, 4% v/v glycerol, 4% v/v ethylene glycol
分辨率 3.25 Å R-free 0.316
6OMF CryoEM structure of SigmaS-transcription initiation complex with activator Crl 提交 2019-04-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.26 Å
6P18 Q21 transcription antitermination complex: loading complex 提交 2019-05-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6P19 Q21 transcription antitermination complex: loaded complex 提交 2019-05-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6P1K Cryo-EM structure of Escherichia coli sigma70 bound RNAP polymerase holoenzyme 提交 2019-05-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.05 Å
6PSQ Escherichia coli RNA polymerase closed complex (TRPc) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6PSR Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi1) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6PSS Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi1.5a) with TraR and mutant rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6PST Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi1.5b) with TraR and mutant rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6PSU Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi2) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6PSV Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TpreRPo) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6PSW Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPo) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R9B Cryo-EM structure of bacterial RNAP with a DNA mimic protein Ocr from T7 phage 提交 2019-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6R9G Structural basis of transcription inhibition by the DNA mimic Ocr protein of bacteriophage T7 提交 2019-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RH3 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase elongation complex bound to CTP substrate 提交 2019-04-18 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6RI7 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase elongation complex bound to GreB transcription factor 提交 2019-04-23 构建体不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6RI9 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex in non-swiveled state 提交 2019-04-23 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RIN Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex bound to GreB transcription factor 提交 2019-04-24 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RIP Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex in swiveled state 提交 2019-04-24 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6UTV E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA ("Fresh" crystal soaked with CTP, UTP, GTP, and ddATP for 150 seconds) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.45 Å R-free 0.348
6UTW E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA ("Fresh" crystal) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.85 Å R-free 0.329
6UTX E. coli sigma-S transcription initiation complex with an empty bubble ("Old" crystal) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.05 Å R-free 0.349
6UTY E. coli sigma-S transcription initiation complex with a mismatching CTP ("Old" crystal soaked with CTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.15 Å R-free 0.370
6UTZ E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA ("Fresh" crystal soaked with CTP and UTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.80 Å R-free 0.343
6UU0 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 3-nt RNA and a mismatching GTP ("Fresh" crystal soaked with GTP for 1 hour) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.90 Å R-free 0.368
6UU1 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and a CTP ("Fresh" crystal soaked with CTP, GTP, and ddTTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.10 Å R-free 0.396
6UU2 E. coli sigma-S transcription initiation complex with 3-nt RNA ("Old" crystal soaked with GTP and ATP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.40 Å R-free 0.363
6UU3 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and a CTP ("Old" crystal soaked with GTP, ATP, CTP, and ddTTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 D4M [(5R)-5-(5-METHYL-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDROPYRIMIDIN-1(2H)-YL)-2,5-DIHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN PHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.00 Å R-free 0.380
6UU4 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 3-nt RNA ("old" crystal soaked with GTP and dinucleotide GpA for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.30 Å R-free 0.364
6UU5 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA ("Old" crystal soaked with GTP, UTP, CTP, and dinucleotide GpA for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 5.40 Å R-free 0.362
6UU6 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and a UTP ("Old" crystal soaked with UTP, ddCTP, and dinucleotide ApG for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.20 Å R-free 0.389
6UU7 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA and an NTP ("Old" crystal soaked with UTP, CTP, ddGTP, and dinucleotide ApG for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 DG3 2'-3'-DIDEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.40 Å R-free 0.390
6UU8 E. coli mutant sigma-S transcription initiation complex with a 7-nt RNA ("Fresh" mutant crystal soaked with GTP, UTP, and CTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.40 Å R-free 0.380
6UU9 E. coli mutant sigma-S transcription initiation complex with an 8-nt RNA ("Fresh" mutant crystal soaked with GTP, UTP, CTP, and ddATP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 2DA 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 5.40 Å R-free 0.362
6UUA E. coli sigma-S transcription initiation complex with a mismatching CTP ("Fresh" crystal soaked with CTP for 2 hours) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.00 Å R-free 0.365
6UUB E. coli sigma-S transcription initiation complex with a mismatching UTP ("Fresh" crystal soaked with UTP for 2 hours) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.96 Å R-free 0.375
6UUC E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 3-nt RNA and a mismatching ATP ("Fresh" crystal soaked with ATP for 2 hours) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 DDD 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.10 Å R-free 0.380
6VJS Escherichia coli RNA polymerase and ureidothiophene-2-carboxylic acid complex 提交 2020-01-17 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 QZY 3-{[benzyl(ethyl)carbamoyl]amino}-5-(4-phenoxyphenyl)thiophene-2-carboxylic acid × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；300 K；0.1M Hepes-NaOH (pH 8), 0.2M CaAcetate, 15% PEG400
分辨率 4.02 Å R-free 0.276
6VJS Escherichia coli RNA polymerase and ureidothiophene-2-carboxylic acid complex 提交 2020-01-17 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 I 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；300 K；0.1M Hepes-NaOH (pH 8), 0.2M CaAcetate, 15% PEG400
分辨率 4.02 Å R-free 0.276
6WMU E. coli RNAPs70-SspA-gadA DNA complex 提交 2020-04-21 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：dodecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.18 Å
6XAS CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6XAV CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex bound with NusG 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
7BEF Structures of class II bacterial transcription complexes 提交 2020-12-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7C17 The cryo-EM structure of E. coli CueR transcription activation complex with fully duplex promoter DNA 提交 2020-05-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 AG SILVER ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.22 Å
7DY6 A refined cryo-EM structure of an Escherichia coli RNAP-promoter open complex (RPo) with SspA 提交 2021-01-20 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：undecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.68 Å
7KHB Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter open complex 提交 2020-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
7KHC Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter closed complex 提交 2020-10-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
7KHE Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter pre-open complex with DksA/ppGpp 提交 2020-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7KHI Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter complex with DksA/ppGpp 提交 2020-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7QV9 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF 提交 2022-01-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7QWP CryoEM structure of bacterial transcription close complex (RPc) 提交 2022-01-25 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM KCl, 10 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7QXI Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holo enzyme with promoter DNA closed complex 提交 2022-01-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM KCl, 10 mM MgCl2,8 mM CHAPSO
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7SZJ Cryo-EM structure of Rifamycin bound to E. coli RNAP and rrnBP1 promoter complex 提交 2021-11-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7SZK Cryo-EM structure of 27a bound to E. coli RNAP and rrnBP1 promoter complex 提交 2021-11-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 D9X (2S,7R,7aR,13aP,16Z,18E,20S,21S,22R,23R,24R,25S,26R,27S,28E)-5,21,23-trihydroxy-27-methoxy-2,4,16,20,22,24,26-heptamethyl-10-[4-(2-methylpropyl)piperazin-1-yl]-12-({4-[(morpholin-4-yl)methyl]phenyl}methoxy)-1,6,15-trioxo-1,2,7,7a-tetrahydro-6H-2,7-(epoxypentadeca[1,11,13]trienoimino)[1]benzofuro[4,5-a]phenoxazin-25-yl acetate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7UBM Transcription antitermination complex: "pre-engaged" Qlambda-loading complex 提交 2022-03-15 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
7UBN Transcription antitermination complex: NusA-containing "engaged" Qlambda-loading complex 提交 2022-03-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
7UWE CryoEM Structure of E. coli Transcription-Coupled Ribonucleotide Excision Repair (TC-RER) complex 提交 2022-05-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.90 Å
7UWH CryoEM Structure of E. coli Transcription-Coupled Ribonucleotide Excision Repair (TC-RER) complex bound to ribonucleotide substrate 提交 2022-05-03 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.10 Å
7VWY Cryo-EM structure of Rob-dependent transcription activation complex in a unique conformation 提交 2021-11-12 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.57 Å
7VWZ Cryo-EM structure of Rob-dependent transcription activation complex in a unique conformation 提交 2021-11-12 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7W5W Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with micF promoter DNA 提交 2021-11-30 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
7W5X Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with zwf promoter DNA 提交 2021-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7W5Y Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with fpr promoter DNA 提交 2021-11-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XUE Cryo-EM structure of HK022 putRNA-associated E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.17 Å
7XUG cryo-EM structure of HK022 putRNA-less E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.57 Å
7XUI Cryo-EM structure of sigma70 bound HK022 putRNA-associated E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.61 Å
7YP9 Cryo-EM structure of Escherichia coli paused complex of transcription termination (TTC-pause) 提交 2022-08-03 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7YPA Cryo-EM structure of Escherichia coli hairpin-nucleation complex of transcription termination (TTC-hairpin) 提交 2022-08-03 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
7YPB Cryo-EM structure of Escherichia coli release complex of transcription termination (TTC-release) 提交 2022-08-03 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
8E3F Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 18 nt long RNA spacer, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-17 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 B 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
8E5K Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 21 nt long RNA spacer, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-22 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 B 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8E5O Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 24 nt long RNA spacer, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-22 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 B 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8E6X Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 18 nt long RNA spacer, lambda-tR1 rut RNA, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-23 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 B 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.27 Å
8E6Z Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 18 nt long RNA spacer, dC75 rut mimic RNA, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-23 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 B 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8F1I SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to mismatch fragment dhsU36mm1 (-12T) 提交 2022-11-05 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8F1J SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to mismatch DNA fragment dhsU36mm2 (-12A) 提交 2022-11-05 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8F1K SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to full duplex DNA fragment dhsU36 (-12T) 提交 2022-11-05 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8FIX Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex harboring a terminal mismatch 提交 2022-12-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8FIY Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase Elongation complex in the Transcription-Translation Complex (RNAP in an anti-swiveled conformation) 提交 2022-12-17 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：heptameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
8FTD Structure of Escherichia coli CedA in complex with transcription initiation complex 提交 2023-01-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8FVR CryoEM structure of E.coli transcription elongation complex 提交 2023-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 10 uM ZnCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.42 Å
8FVW CryoEM structure of E.coli transcription elongation complex bound to ppGpp 提交 2023-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 2–1407（1406 aa）
未记录 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 10 uM ZnCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.10 Å
8HKC Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma32 complex 提交 2022-11-25 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 F 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
8IGR Cryo-EM structure of CII-dependent transcription activation complex 提交 2023-02-21 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8IGS Cryo-EM structure of RNAP-promoter open complex at lambda promoter PRE 提交 2023-02-21 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8K58 The cryo-EM map of close TIEA-TEC complex 提交 2023-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 14–1376（1363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
8K59 The cryo-EM map of TIC-TIEA complex 提交 2023-07-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 D 14–1376（1363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8K5A The cryo-EM map of open TIEA-TEC complex 提交 2023-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 14–1376（1363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PDY E. coli RNA polymerase paused at ops site 提交 2023-06-13 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PEN fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (alternative state of RfaH) 提交 2023-06-14 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFG autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex), not fully complementary scaffold 提交 2023-06-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFJ fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not fully complementary scaffold; alternative state of RfaH) 提交 2023-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8PH9 E. coli RNA polymerase paused at ops site (non-complementary scaffold) 提交 2023-06-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8PHK fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site 提交 2023-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PIB autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex) 提交 2023-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8PID backtracked E. coli transcription complex paused at ops site and bound to RfaH 提交 2023-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8PIM fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not complementary scaffold) 提交 2023-06-22 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 2–1407（1406 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8RE4 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 5nt pre-translocated complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 4–1376（1373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8REA Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 5nt post-translocated complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 4–1376（1373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8REB Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 6nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 4–1376（1373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8REC Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 7nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 4–1376（1373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8RED Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 8nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 4–1376（1373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8REE Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 9nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 4–1376（1373 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8SY5 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dS-BTP base pair in the active site 提交 2023-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X0F 2-oxo-2-hydroadenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8SY6 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dB-UTP base pair in the active site 提交 2023-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 DGP 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
8SY7 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dB-STP base pair in the active site 提交 2023-05-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X0O [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S})-5-(4-azanyl-1-methyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8TO1 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1a) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.80 Å
8TO6 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1d) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TO8 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1b) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TOE Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1c) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TOM Escherichia coli RNA polymerase closed complex intermediate at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final.
分辨率 3.10 Å
8TXO E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound to the unnatural dZ-PTP base pair in the active site 提交 2023-08-23 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：heptameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 S9F [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanyl-2-oxidanylidene-1$l^{4},3,5,7-tetrazabicyclo[4.3.0]nona-1(6),3,8-trien-7-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8U3B Cryo-EM structure of E. coli NarL-transcription activation complex at 3.2A 提交 2023-09-07 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
8UPO Escherichia coli transcription-translation coupled complex class A (TTC-A) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 21 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-23 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
8UPR Escherichia coli transcription-translation coupled complex class A (TTC-A) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 21 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-23 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8UQL Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH in loaded state, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 构建体不同 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8UQM Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH in loaded state, NusA, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8UQP Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UR0 Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-25 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8URH Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 27 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8URI Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 27 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-26 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8URX Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8URY Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNA in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VKV Escherichia coli transcription-translation coupled complex (TTC-B) containing mRNA with a 33 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-10 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VL1 Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 36 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-11 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8VOO Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 39 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8VOP Escherichia coli transcription-translation coupled complex (TTC-B) containing mRNA with a 36 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.00 Å
8VOQ Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 39 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.30 Å
8VOR Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 51 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VOS Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 60 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 构建体不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8Y5K E.coli transcription translation coupling complex in TTC-A state 2 containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
8Y5L E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8Y5M E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 2 containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5N E.coli transcription translation coupling complex in TTC-A state 3 containing mRNA with 21-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5O E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8Y5P E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 1) containing mRNA with 24-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：67-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
8Y5Q E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：66-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8Y5R E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 1) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5S E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5T E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 3) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8Y6U Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with transcription factor GcvA 提交 2024-02-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.97 Å
8YDE E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 3) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
8YDF E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDG E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
8YDH E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass1) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
8YDI E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDJ E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 B1 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
9GDA RNAP-TopoI complex on duplex scaffold 提交 2024-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9GDB RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - consensus reconstruction 提交 2024-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9GDC RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - single-bubble configuration 提交 2024-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9GDD RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - two-bubble configuration 提交 2024-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9GDE RNAP-TopoI complex on long-overhang scaffold - orientation 1 提交 2024-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9GDH RNAP-TopoI complex on long-overhang scaffold - orientation 2 提交 2024-08-05 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9GUR 30S mRNA delivery complex TEC resolved (TEC only) 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 4 15–1373（1359 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9L0X Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with Escherichia phage Mu late transcription activator C 提交 2024-12-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
9L0Y Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with Escherichia phage Mu middle transcription activator Mor 提交 2024-12-13 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
9MSE de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with pre-catalytic bEBP state (RPi1 open ring) 提交 2025-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9MSF de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with post-catalytic bEBP state (RPi1 closed ring) 提交 2025-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9MSH de novo SigN RNA polymerase open complex (RPo) 提交 2025-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9MSJ de novo SigN RNA polymerase NTP-bound open complex (RPo+2A) 提交 2025-01-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9Q90 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9Q91 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 6 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
9Q92 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 5 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
9Q93 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 4 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
9Q94 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 3 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–1376（1376 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
9Q95 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -10 to -1 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–1376（1376 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
9Q96 Cryo-EM Structure of Bacterial RNA polymerase-sigma54 transcription open complex with wild type sigma54, from RPi(-10-1) 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
9Q97 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 2 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
9Q98 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 1 提交 2025-02-26 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.30 Å
9Y79 Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC^walked) containing mRNA with a 39 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2025-09-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AE 1–1407（1407 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å
9YMU De novo initial transcribing RNA polymerase with 2-mer RNA and bound CTP / Michaelis complex (RPitc2+CTP) 提交 2025-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMV De novo initial transcribing RNA polymerase with pretranslocated 3-mer RNA / product complex (RPitc3) 提交 2025-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9YMW De novo initial transcribing RNA polymerase with 5-mer RNA CCAUC (RPitc5a) 提交 2025-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMX De novo initial transcribing RNA polymerase with 5-mer RNA AUCUA (RPitc5b) 提交 2025-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMY De novo initial transcribing RNA polymerase with 9-mer RNA (RPitc9) 提交 2025-10-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YN0 De novo initial transcribing RNA polymerase with sigma 70 region 1.1 bound (RPitc-s70_1.1) 提交 2025-10-10 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 J 1–1407（1407 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YNP Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription initiation complex with GpA and pseudouridimycin (PUM) 提交 2025-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 PUM (1S)-1,4-anhydro-5-[(N-carbamimidoylglycyl-N~2~-hydroxy-L-glutaminyl)amino]-5-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-D-ribitol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
9YNQ Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription initiation complex with GpA and des-hydroxy pseudouridimycin (des-hydroxy PUM) 提交 2025-10-11 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 D 1–1407（1407 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 A1CYH (1S)-1,4-anhydro-5-[(N-carbamimidoylglycyl-L-glutaminyl)amino]-5-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-D-ribitol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å

共 239 个其他 PDB 条目、275 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPOC_ECOLI
Isoform —
PDB实体 3
链与序列区间 作者链 J； PDB构建体 2–1407； UniProt 2–1407

DNA-directed RNA polymerase subunit omega

Escherichia coli

UniProt P0A800

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 7 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物数一致 链 K； UniProt 1–91 未记录 Transcription antitermination protein RfaH × 1 （P0AFW0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A8T7） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） non-template DNA × 1 template DNA × 1 RNA × 1 Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （P0AFF6） ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8PIL Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
10MA Closed Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with a closed active site (closed TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
10MB Open1 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
10MC Open2 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
10MD Open3 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
3IYD Three-dimensional EM structure of an intact activator-dependent transcription initiation complex 提交 2009-08-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 E 2–91（90 aa）
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM HEPES, 100 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.2 mM cAMP；pH 8；25 mM HEPES, 100 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.2 mM cAMP
分辨率 19.80 Å
3LU0 Molecular model of Escherichia coli core RNA polymerase 提交 2010-02-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 Tris-HCl；pH 8；Tris-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.20 Å
4KMU X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Rifampin 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.85 Å R-free 0.321
4KMU X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Rifampin 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–91（91 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.85 Å R-free 0.321
4KN4 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2b 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 1RL Benzoxazinorifamycin-2b × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.96 Å R-free 0.315
4KN4 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2b 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–91（91 aa）
未记录 1RL Benzoxazinorifamycin-2b × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.96 Å R-free 0.315
4KN7 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2c 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 1RM Benzoxazinorifamycin-2c × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.69 Å R-free 0.309
4KN7 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2c 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 J 1–91（91 aa）
未记录 1RM Benzoxazinorifamycin-2c × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.69 Å R-free 0.309
4MEX Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with salinamide A 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.325
4MEX Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with salinamide A 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.325
4MEY Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase holoenzyme 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.95 Å R-free 0.325
4MEY Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase holoenzyme 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.95 Å R-free 0.325
4ZH2 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBR703 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 4OB N-hydroxy-N'-phenyl-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.20 Å R-free 0.288
4ZH2 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBR703 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 4OB N-hydroxy-N'-phenyl-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.20 Å R-free 0.288
4ZH3 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRH16-Br 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 4OD N'-(3-bromophenyl)-4-fluoro-N-hydroxy-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.08 Å R-free 0.267
4ZH3 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRH16-Br 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 4OD N'-(3-bromophenyl)-4-fluoro-N-hydroxy-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.08 Å R-free 0.267
4ZH4 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRP18 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 4OE 5-(4-fluorophenyl)-4-[4-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 3.99 Å R-free 0.283
4ZH4 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRP18 提交 2015-04-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 4OE 5-(4-fluorophenyl)-4-[4-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 3.99 Å R-free 0.283
5EZK RNA polymerase model placed by Molecular replacement into X-ray diffraction map of DNA-bound RNA Polymerase-Sigma 54 holoenzyme complex. 提交 2015-11-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；291 K；8% PGA-LM, 300mM Ammonium Formate, 100mM Hepes
分辨率 8.50 Å R-free 0.470
5IPL SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–91（90 aa）
未记录 DPO DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.60 Å R-free 0.293
5IPM SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.20 Å R-free 0.330
5IPN SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.61 Å R-free 0.345
5MS0 pseudo-atomic model of the RNA polymerase lambda-based antitermination complex solved by cryo-EM 提交 2016-12-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tetradecameric
链 O 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.80 Å
5NSR Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holo enzyme with promoter DNA closed complex 提交 2017-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5NSS Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holoenzyme with promoter DNA and transcription activator PspF intermedate complex 提交 2017-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5NWT Crystal Structure of Escherichia coli RNA polymerase - Sigma54 Holoenzyme complex 提交 2017-05-08 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；291 K；9% PEG8000, 18% Ethylene glycol, 100mM Sodium HEPES/MOPS Buffer, 0.03M NaF, 0.03M NaBr, 0.03M NaI, 0-10mM DTT
分辨率 3.76 Å R-free 0.370
5UAC Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, wild-type 提交 2016-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.295
5UAC Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, wild-type 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.295
5UAG Escherichia coli RNA polymerase mutant - RpoB D516V 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.40 Å R-free 0.311
5UAG Escherichia coli RNA polymerase mutant - RpoB D516V 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.40 Å R-free 0.311
5UAH Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB D516V mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.287
5UAH Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB D516V mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.287
5UAJ Escherichia coli RNA polymerase RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.92 Å R-free 0.307
5UAJ Escherichia coli RNA polymerase RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.92 Å R-free 0.307
5UAL Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.89 Å R-free 0.286
5UAL Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.89 Å R-free 0.286
5UAQ Escherichia coli RNA polymerase RpoB H526Y mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
5UAQ Escherichia coli RNA polymerase RpoB H526Y mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
5VSW X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA/ppGpp complex 提交 2017-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 0.2 M calcium acetate, 25 % PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.29 Å R-free 0.259
5VSW X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA/ppGpp complex 提交 2017-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 0.2 M calcium acetate, 25 % PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.29 Å R-free 0.259
5VT0 Escherichia coli 6S RNA derivative in complex with Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme 提交 2017-05-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 3.81 Å R-free 0.262
5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 3.81 Å R-free 0.262
5W1T X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M CA-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 4.50 Å R-free 0.276
5W1T X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M CA-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 4.50 Å R-free 0.276
6ALF CryoEM structure of crosslinked E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–80（80 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM KCl, 5mM MgCl2, 5mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6ALG CryoEM structure of HK022 Nun - E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM Potassium Chloride, 5 mM Magnesium Chloride, 5 mM Dithreitol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6ALH CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–80（80 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM KCl, 5mM MgCl2, 5mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6ASX CryoEM structure of E.coli his pause elongation complex 提交 2017-08-25 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–84（84 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM potassium glutamate, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6BJS CryoEM structure of E.coli his pause elongation complex without pause hairpin 提交 2017-11-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM potassium glutamate, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6BYU X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase (RpoB-H526Y) and ppApp complex 提交 2017-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ECJ (5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-({[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-oxo-4,5-dihydrofuran-3-yl trihydrogen diphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M MgCl2, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.311
6BYU X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase (RpoB-H526Y) and ppApp complex 提交 2017-12-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ECJ (5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-({[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-oxo-4,5-dihydrofuran-3-yl trihydrogen diphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M MgCl2, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.311
6C6S CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6C6T CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6C6U CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with NusG 提交 2018-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6C9Y Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma70 holoenzyme 提交 2018-01-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6CA0 Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma70 open complex 提交 2018-01-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6CUX Escherichia coli RpoB S531L mutant RNA polymerase holoenzyme in complex with Kanglemycin A 提交 2018-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 KNG Kanglemycin A × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.255
6CUX Escherichia coli RpoB S531L mutant RNA polymerase holoenzyme in complex with Kanglemycin A 提交 2018-03-26 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.255
6FLP CryoEM structure of E.coli RNA polymerase paused elongation complex without RNA hairpin bound to NusA 提交 2018-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6FLQ CryoEM structure of E.coli RNA polymerase paused elongation complex bound to NusA 提交 2018-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GFW Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme initial transcribing complex 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6GH5 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme transcription open complex 提交 2018-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6GH6 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme intermediate partially loaded complex 提交 2018-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6JBQ CryoEM structure of Escherichia coli sigmaE transcription initiation complex containing 5nt of RNA 提交 2019-01-26 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.02 Å
6JNX Cryo-EM structure of a Q-engaged arrested complex 提交 2019-03-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
6K4Y CryoEM structure of sigma appropriation complex 提交 2019-05-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
6KJ6 cryo-EM structure of Escherichia coli Crl transcription activation complex 提交 2019-07-21 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 8 seconds before plunging
分辨率 3.80 Å
6LDI The cryo-EM structure of E. coli CueR transcription activation complex 提交 2019-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 AG SILVER ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
6N4C EM structure of the DNA wrapping in bacterial open transcription initiation complex 提交 2018-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 2–91（90 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
分辨率 17.00 Å
6N57 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation I 提交 2018-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6N58 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation II 提交 2018-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
6N60 Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream fork promoter DNA and Microcin J25 (MccJ25) 提交 2018-11-23 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M HEPES, pH 6.7, 0.2 M magnesium chloride, 7% w/v PEG3350, 4% v/v glycerol
分辨率 3.68 Å R-free 0.306
6N61 Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream fork promoter DNA and Capistruin 提交 2018-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–90（90 aa）
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M HEPES, pH 6.8, 0.2 M magnesium chloride, 7% w/v PEG3350, 4% v/v glycerol, 4% v/v ethylene glycol
分辨率 3.25 Å R-free 0.316
6P18 Q21 transcription antitermination complex: loading complex 提交 2019-05-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6P19 Q21 transcription antitermination complex: loaded complex 提交 2019-05-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6R9G Structural basis of transcription inhibition by the DNA mimic Ocr protein of bacteriophage T7 提交 2019-04-03 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 E 1–80（80 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RI7 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase elongation complex bound to GreB transcription factor 提交 2019-04-23 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6RI9 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex in non-swiveled state 提交 2019-04-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RIN Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex bound to GreB transcription factor 提交 2019-04-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RIP Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex in swiveled state 提交 2019-04-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6TQN rrn anti-termination complex without S4 提交 2019-12-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6TQO rrn anti-termination complex 提交 2019-12-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6UTV E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA ("Fresh" crystal soaked with CTP, UTP, GTP, and ddATP for 150 seconds) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.45 Å R-free 0.348
6UTW E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA ("Fresh" crystal) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.85 Å R-free 0.329
6UTX E. coli sigma-S transcription initiation complex with an empty bubble ("Old" crystal) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.05 Å R-free 0.349
6UTY E. coli sigma-S transcription initiation complex with a mismatching CTP ("Old" crystal soaked with CTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.15 Å R-free 0.370
6UTZ E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA ("Fresh" crystal soaked with CTP and UTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.80 Å R-free 0.343
6UU0 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 3-nt RNA and a mismatching GTP ("Fresh" crystal soaked with GTP for 1 hour) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.90 Å R-free 0.368
6UU1 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and a CTP ("Fresh" crystal soaked with CTP, GTP, and ddTTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.10 Å R-free 0.396
6UU2 E. coli sigma-S transcription initiation complex with 3-nt RNA ("Old" crystal soaked with GTP and ATP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.40 Å R-free 0.363
6UU3 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and a CTP ("Old" crystal soaked with GTP, ATP, CTP, and ddTTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 D4M [(5R)-5-(5-METHYL-2,4-DIOXO-3,4-DIHYDROPYRIMIDIN-1(2H)-YL)-2,5-DIHYDROFURAN-2-YL]METHYL DIHYDROGEN PHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.00 Å R-free 0.380
6UU4 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 3-nt RNA ("old" crystal soaked with GTP and dinucleotide GpA for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 GTP GUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.30 Å R-free 0.364
6UU5 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA ("Old" crystal soaked with GTP, UTP, CTP, and dinucleotide GpA for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 5.40 Å R-free 0.362
6UU6 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and a UTP ("Old" crystal soaked with UTP, ddCTP, and dinucleotide ApG for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.20 Å R-free 0.389
6UU7 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA and an NTP ("Old" crystal soaked with UTP, CTP, ddGTP, and dinucleotide ApG for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 DG3 2'-3'-DIDEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.40 Å R-free 0.390
6UU8 E. coli mutant sigma-S transcription initiation complex with a 7-nt RNA ("Fresh" mutant crystal soaked with GTP, UTP, and CTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.40 Å R-free 0.380
6UU9 E. coli mutant sigma-S transcription initiation complex with an 8-nt RNA ("Fresh" mutant crystal soaked with GTP, UTP, CTP, and ddATP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 2DA 2',3'-DIDEOXYADENOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 5.40 Å R-free 0.362
6UUA E. coli sigma-S transcription initiation complex with a mismatching CTP ("Fresh" crystal soaked with CTP for 2 hours) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.00 Å R-free 0.365
6UUB E. coli sigma-S transcription initiation complex with a mismatching UTP ("Fresh" crystal soaked with UTP for 2 hours) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.96 Å R-free 0.375
6UUC E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 3-nt RNA and a mismatching ATP ("Fresh" crystal soaked with ATP for 2 hours) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 EEE 2–91（90 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.10 Å R-free 0.380
6XAS CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6XAV CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex bound with NusG 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6Z9P Transcription termination intermediate complex 1 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6Z9Q Transcription termination intermediate complex 2 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
6Z9R Transcription termination intermediate complex 3 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6Z9S Transcription termination intermediate complex 4 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6Z9T Transcription termination intermediate complex 5 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6ZTJ E. coli 70S-RNAP expressome complex in NusG-coupled state (38 nt intervening mRNA) 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 CE 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 479 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6ZTL E. coli 70S-RNAP expressome complex in collided state bound to NusG 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：62-meric
链 CE 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 441 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6ZTN E. coli 70S-RNAP expressome complex in NusG-coupled state (42 nt intervening mRNA) 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：63-meric
链 CE 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 487 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6ZTO E. coli 70S-RNAP expressome complex in uncoupled state 1 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：62-meric
链 CE 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 487 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6ZTP E. coli 70S-RNAP expressome complex in uncoupled state 6 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：62-meric
链 CE 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 487 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6ZU1 E. coli 70S-RNAP expressome complex in uncoupled state 2 提交 2020-07-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：62-meric
链 CE 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 487 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ADB Transcription termination intermediate complex 1 delta NusG 提交 2020-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7ADC Transcription termination intermediate complex 3 delta NusG 提交 2020-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ADD Transcription termination intermediate complex IIIa 提交 2020-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7ADE Transcription termination complex IVa 提交 2020-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 W 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7BEF Structures of class II bacterial transcription complexes 提交 2020-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7BEG Structures of class I bacterial transcription complexes 提交 2020-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7C17 The cryo-EM structure of E. coli CueR transcription activation complex with fully duplex promoter DNA 提交 2020-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 AG SILVER ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.22 Å
7KHB Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter open complex 提交 2020-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
7KHC Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter closed complex 提交 2020-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
7KHE Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter pre-open complex with DksA/ppGpp 提交 2020-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7KHI Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter complex with DksA/ppGpp 提交 2020-10-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7MKN Escherichia coli RNA polymerase and RapA elongation complex 提交 2021-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7MKO Escherichia coli RNA polymerase elongation complex 提交 2021-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 2TM 5'-O-[(S)-hydroxy{[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]methyl}phosphoryl]cytidine × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
7MKP Escherichia coli RNA polymerase core enzyme 提交 2021-04-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.41 Å
7MKQ Escherichia coli RNA polymerase and RapA binary complex 提交 2021-04-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.80 Å
7PY0 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusG (NusG-EC in more-swiveled conformation) 提交 2021-10-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7PY1 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusG (the consensus NusG-EC) 提交 2021-10-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7PY3 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA (the consensus NusA-EC) 提交 2021-10-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7PY5 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (the consensus NusA-NusG-EC) 提交 2021-10-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7PY6 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (NusA and NusG elongation complex in less-swiveled conformation) 提交 2021-10-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7PY7 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (NusA and NusG elongation complex in more-swiveled conformation) 提交 2021-10-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7PY8 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusG (NusG-EC in less-swiveled conformation) 提交 2021-10-09 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7PYJ CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA (NusA elongation complex in less-swiveled conformation) 提交 2021-10-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7PYK CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA (NusA elongation complex in more-swiveled conformation) 提交 2021-10-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7Q0J RNA polymerase elongation complex in more-swiveled conformation 提交 2021-10-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7Q0K RNA polymerase elongation complex in less-swiveled conformation 提交 2021-10-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7QV9 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7QWP CryoEM structure of bacterial transcription close complex (RPc) 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM KCl, 10 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7QXI Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holo enzyme with promoter DNA closed complex 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM KCl, 10 mM MgCl2,8 mM CHAPSO
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7SZJ Cryo-EM structure of Rifamycin bound to E. coli RNAP and rrnBP1 promoter complex 提交 2021-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7SZK Cryo-EM structure of 27a bound to E. coli RNAP and rrnBP1 promoter complex 提交 2021-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 D9X (2S,7R,7aR,13aP,16Z,18E,20S,21S,22R,23R,24R,25S,26R,27S,28E)-5,21,23-trihydroxy-27-methoxy-2,4,16,20,22,24,26-heptamethyl-10-[4-(2-methylpropyl)piperazin-1-yl]-12-({4-[(morpholin-4-yl)methyl]phenyl}methoxy)-1,6,15-trioxo-1,2,7,7a-tetrahydro-6H-2,7-(epoxypentadeca[1,11,13]trienoimino)[1]benzofuro[4,5-a]phenoxazin-25-yl acetate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7VWY Cryo-EM structure of Rob-dependent transcription activation complex in a unique conformation 提交 2021-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.57 Å
7VWZ Cryo-EM structure of Rob-dependent transcription activation complex in a unique conformation 提交 2021-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7W5W Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with micF promoter DNA 提交 2021-11-30 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
7W5X Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with zwf promoter DNA 提交 2021-11-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7W5Y Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with fpr promoter DNA 提交 2021-11-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XUE Cryo-EM structure of HK022 putRNA-associated E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.17 Å
7XUG cryo-EM structure of HK022 putRNA-less E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.57 Å
7XUI Cryo-EM structure of sigma70 bound HK022 putRNA-associated E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.61 Å
7YP9 Cryo-EM structure of Escherichia coli paused complex of transcription termination (TTC-pause) 提交 2022-08-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7YPA Cryo-EM structure of Escherichia coli hairpin-nucleation complex of transcription termination (TTC-hairpin) 提交 2022-08-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
7YPB Cryo-EM structure of Escherichia coli release complex of transcription termination (TTC-release) 提交 2022-08-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
8ABY RNA polymerase bound to purified in vitro transcribed regulatory RNA putL - pause prone, closed clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 3.70 Å
8ABZ RNA polymerase at U-rich pause bound to non-regulatory RNA - pause prone, closed clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 3.40 Å
8AC0 RNA polymerase at U-rich pause bound to regulatory RNA putL - active, closed clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.10 Å
8AC1 RNA polymerase at U-rich pause bound to non-regulatory RNA - inactive, open clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.06 Å
8AC2 RNA polymerase- post-terminated, open clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 3.70 Å
8ACP RNA polymerase at U-rich pause bound to regulatory RNA putL - inactive, open clamp state 提交 2022-07-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.50 Å
8AD1 RNA polymerase at U-rich pause bound to RNA putL triple mutant - pause prone, closed clamp state 提交 2022-07-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.10 Å
8F1I SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to mismatch fragment dhsU36mm1 (-12T) 提交 2022-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8F1J SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to mismatch DNA fragment dhsU36mm2 (-12A) 提交 2022-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8F1K SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to full duplex DNA fragment dhsU36 (-12T) 提交 2022-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8FIX Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex harboring a terminal mismatch 提交 2022-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8FTD Structure of Escherichia coli CedA in complex with transcription initiation complex 提交 2023-01-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8FVR CryoEM structure of E.coli transcription elongation complex 提交 2023-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 H 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 10 uM ZnCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.42 Å
8FVW CryoEM structure of E.coli transcription elongation complex bound to ppGpp 提交 2023-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 H 1–91（91 aa）
未记录 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 10 uM ZnCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.10 Å
8G00 Cryo-EM structure of 3DVA component 0 of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase minus preQ1 ligand 提交 2023-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION WAS CARRIED OUT IN A CHAMBER WITH THE TEMPERATURE SET TO 4 DEGREES CELSIUS.
分辨率 3.40 Å
8G2W Cryo-EM structure of 3DVA component 2 of Escherichia coli que-PEC (paused elongation complex) RNA Polymerase minus preQ1 ligand 提交 2023-02-06 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 2–80（79 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；VITRIFICATION WAS CARRIED OUT IN A CHAMBER WITH THE TEMPERATURE SET TO 4 DEGREES CELSIUS.
分辨率 3.70 Å
8IGR Cryo-EM structure of CII-dependent transcription activation complex 提交 2023-02-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8IGS Cryo-EM structure of RNAP-promoter open complex at lambda promoter PRE 提交 2023-02-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8JO2 Structural basis of transcriptional activation by the OmpR/PhoB-family response regulator PmrA 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
8K58 The cryo-EM map of close TIEA-TEC complex 提交 2023-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–77（76 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
8K59 The cryo-EM map of TIC-TIEA complex 提交 2023-07-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 E 2–77（76 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8K5A The cryo-EM map of open TIEA-TEC complex 提交 2023-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–77（76 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PBL E. coli RNA polymerase elongation complex stalled at thymine dimer lesion 提交 2023-06-09 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 H 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.87 Å
8PDY E. coli RNA polymerase paused at ops site 提交 2023-06-13 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PEN fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (alternative state of RfaH) 提交 2023-06-14 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFG autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex), not fully complementary scaffold 提交 2023-06-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFJ fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not fully complementary scaffold; alternative state of RfaH) 提交 2023-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8PH9 E. coli RNA polymerase paused at ops site (non-complementary scaffold) 提交 2023-06-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8PHK fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site 提交 2023-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PIB autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex) 提交 2023-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8PID backtracked E. coli transcription complex paused at ops site and bound to RfaH 提交 2023-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8PIM fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not complementary scaffold) 提交 2023-06-22 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8RE4 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 5nt pre-translocated complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–75（74 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8REA Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 5nt post-translocated complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–75（74 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8REB Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 6nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–75（74 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8REC Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 7nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–75（74 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8RED Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 8nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–75（74 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8REE Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 9nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 2–75（74 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8SY5 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dS-BTP base pair in the active site 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X0F 2-oxo-2-hydroadenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8SY6 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dB-UTP base pair in the active site 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 DGP 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
8SZW Reconstituted E. coli RNA polymerase post-termination complex on negatively-supercoiled DNA: open duplex DNA (rPTCo) 提交 2023-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
8T02 Reconstituted E. coli RNA polymerase post-termination complex on negatively-supercoiled DNA: unwinding duplex DNA (rPTCi) 提交 2023-05-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
8TO1 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1a) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.80 Å
8TO6 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1d) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TO8 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1b) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TOE Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1c) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TOM Escherichia coli RNA polymerase closed complex intermediate at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final.
分辨率 3.10 Å
8U3B Cryo-EM structure of E. coli NarL-transcription activation complex at 3.2A 提交 2023-09-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
8UPR Escherichia coli transcription-translation coupled complex class A (TTC-A) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 21 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-23 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8UQL Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH in loaded state, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8UQM Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH in loaded state, NusA, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8UQP Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UR0 Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8URH Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 27 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-26 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8URI Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 27 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-26 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8URX Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8URY Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNA in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VKV Escherichia coli transcription-translation coupled complex (TTC-B) containing mRNA with a 33 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VL1 Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 36 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-11 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8VOO Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 39 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8VOP Escherichia coli transcription-translation coupled complex (TTC-B) containing mRNA with a 36 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.00 Å
8VOQ Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 39 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.30 Å
8VOR Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 51 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VOS Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 60 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8Y5K E.coli transcription translation coupling complex in TTC-A state 2 containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
8Y5L E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8Y5M E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 2 containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5N E.coli transcription translation coupling complex in TTC-A state 3 containing mRNA with 21-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5O E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8Y5P E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 1) containing mRNA with 24-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：67-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
8Y5Q E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：66-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8Y5R E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 1) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5S E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5T E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 3) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8Y6U Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with transcription factor GcvA 提交 2024-02-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.97 Å
8YDE E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 3) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
8YDF E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDG E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
8YDH E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass1) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
8YDI E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDJ E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 W0 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
9GDA RNAP-TopoI complex on duplex scaffold 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9GDB RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - consensus reconstruction 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9GDC RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - single-bubble configuration 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9GDD RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - two-bubble configuration 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9GDE RNAP-TopoI complex on long-overhang scaffold - orientation 1 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9GDH RNAP-TopoI complex on long-overhang scaffold - orientation 2 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9GUR 30S mRNA delivery complex TEC resolved (TEC only) 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 5 4–74（71 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9GUW 30S-TEC (TEC in expressome position) Inactive state 2 提交 2024-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：30-meric
链 5 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 118 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9GUX 30S-TEC (TEC in expressome position) Inactive state 1 提交 2024-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：31-meric
链 5 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 132 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9L0X Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with Escherichia phage Mu late transcription activator C 提交 2024-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
9L0Y Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with Escherichia phage Mu middle transcription activator Mor 提交 2024-12-13 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
9MSE de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with pre-catalytic bEBP state (RPi1 open ring) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9MSF de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with post-catalytic bEBP state (RPi1 closed ring) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9MSG De novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with bound SigN-RII 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9MSH de novo SigN RNA polymerase open complex (RPo) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9MSJ de novo SigN RNA polymerase NTP-bound open complex (RPo+2A) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9N07 Mfd-bound E.coli RNA polymerase elongation complex + ADP-BeF3 - L1 state 提交 2025-01-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
9N11 Mfd-bound E.coli RNA polymerase elongation complex + ADP-BeF3 - L1.5 state 提交 2025-01-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.29 Å
9Q90 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9Q91 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 6 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
9Q92 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 5 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
9Q93 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 4 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
9Q94 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 3 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
9Q95 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -10 to -1 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
9Q96 Cryo-EM Structure of Bacterial RNA polymerase-sigma54 transcription open complex with wild type sigma54, from RPi(-10-1) 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
9Q97 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 2 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
9Q98 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 1 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.30 Å
9Y79 Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC^walked) containing mRNA with a 39 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2025-09-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AF 1–91（91 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å
9YMU De novo initial transcribing RNA polymerase with 2-mer RNA and bound CTP / Michaelis complex (RPitc2+CTP) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMV De novo initial transcribing RNA polymerase with pretranslocated 3-mer RNA / product complex (RPitc3) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9YMW De novo initial transcribing RNA polymerase with 5-mer RNA CCAUC (RPitc5a) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMX De novo initial transcribing RNA polymerase with 5-mer RNA AUCUA (RPitc5b) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMY De novo initial transcribing RNA polymerase with 9-mer RNA (RPitc9) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YN0 De novo initial transcribing RNA polymerase with sigma 70 region 1.1 bound (RPitc-s70_1.1) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 K 1–91（91 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YNP Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription initiation complex with GpA and pseudouridimycin (PUM) 提交 2025-10-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 PUM (1S)-1,4-anhydro-5-[(N-carbamimidoylglycyl-N~2~-hydroxy-L-glutaminyl)amino]-5-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-D-ribitol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
9YNQ Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription initiation complex with GpA and des-hydroxy pseudouridimycin (des-hydroxy PUM) 提交 2025-10-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 E 1–91（91 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 A1CYH (1S)-1,4-anhydro-5-[(N-carbamimidoylglycyl-L-glutaminyl)amino]-5-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-D-ribitol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å

共 258 个其他 PDB 条目、277 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPOZ_ECOLI
Isoform —
PDB实体 4
链与序列区间 作者链 K； PDB构建体 1–91； UniProt 1–91

DNA-directed RNA polymerase subunit alpha

Escherichia coli

UniProt P0A7Z4

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 7 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物数一致 链 G； UniProt 1–329 链 H； UniProt 1–329 未记录 Transcription antitermination protein RfaH × 1 （P0AFW0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A8T7） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） non-template DNA × 1 template DNA × 1 RNA × 1 Transcription termination/antitermination protein NusA × 1 （P0AFF6） ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8PIL Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
10MA Closed Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with a closed active site (closed TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
10MB Open1 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
10MC Open2 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
10MD Open3 Eco-ePEC: Cryo-EM structure of Eco RNAP his-elemental paused elongation complex with an open active site (open TL, SI3 and RH-FL) 提交 2026-01-27 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
1BDF STRUCTURE OF ESCHERICHIA COLI RNA POLYMERASE ALPHA SUBUNIT N-TERMINAL DOMAIN 提交 1998-05-08 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–235（235 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN RESIDUES 1-235
链 B 1–235（235 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN RESIDUES 1-235
链 C 1–235（235 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN RESIDUES 1-235
链 D 1–235（235 aa） 片段：N-TERMINAL DOMAIN RESIDUES 1-235
突变：R45A 突变：R45A 突变：R45A 突变：R45A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 8.75；pH 8.75
分辨率 2.50 Å R-free 0.308
1COO THE COOH-TERMINAL DOMAIN OF RNA POLYMERASE ALPHA SUBUNIT 提交 1995-10-09 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 233–329（97 aa） 片段：COOH-TERMINAL DOMAIN
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR mmCIF 未提供已读取条件 分辨率未提供
1LB2 Structure of the E. coli alpha C-terminal domain of RNA polymerase in complex with CAP and DNA 提交 2002-04-01 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 B 246–329（84 aa） 片段：alpha CTD, alpha Carboxy terminal domain
链 E 246–329（84 aa） 片段：alpha CTD, alpha Carboxy terminal domain
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；NaCl, NaAcetate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.10 Å R-free 0.244
1XS9 A MODEL OF THE TERNARY COMPLEX FORMED BETWEEN MARA, THE ALPHA-CTD OF RNA POLYMERASE AND DNA 提交 2004-10-18 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：tetrameric
链 D 249–329（81 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.7
NMR样品组成 AS DESCRIBED IN PAPER
分辨率未提供
2JZB Solution structure of the complex between E.coli NusA-AR2 and RNAP-aCTD 提交 2008-01-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 233–329（97 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] actd, 2.1 mM ar2, 10 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.7 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] ar2, 2.1 mM actd, 10 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
3IYD Three-dimensional EM structure of an intact activator-dependent transcription initiation complex 提交 2009-08-01 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 25 mM HEPES, 100 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.2 mM cAMP；pH 8；25 mM HEPES, 100 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT, 0.2 mM cAMP
分辨率 19.80 Å
3K4G Crystal structure of E. coli RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain 提交 2009-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 245–329（85 aa） 片段：Alpha C-terminal domain, residues 245-329
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M hepes, 1.4M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.236
3K4G Crystal structure of E. coli RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain 提交 2009-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 B 245–329（85 aa） 片段：Alpha C-terminal domain, residues 245-329
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M hepes, 1.4M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.236
3K4G Crystal structure of E. coli RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain 提交 2009-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 C 245–329（85 aa） 片段：Alpha C-terminal domain, residues 245-329
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M hepes, 1.4M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.236
3K4G Crystal structure of E. coli RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain 提交 2009-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 D 245–329（85 aa） 片段：Alpha C-terminal domain, residues 245-329
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M hepes, 1.4M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.236
3K4G Crystal structure of E. coli RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain 提交 2009-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 5 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 E 245–329（85 aa） 片段：Alpha C-terminal domain, residues 245-329
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M hepes, 1.4M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.236
3K4G Crystal structure of E. coli RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain 提交 2009-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 6 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 F 245–329（85 aa） 片段：Alpha C-terminal domain, residues 245-329
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M hepes, 1.4M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.236
3K4G Crystal structure of E. coli RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain 提交 2009-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 7 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 G 245–329（85 aa） 片段：Alpha C-terminal domain, residues 245-329
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） NA SODIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M hepes, 1.4M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.236
3K4G Crystal structure of E. coli RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain 提交 2009-10-05 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 8 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 H 245–329（85 aa） 片段：Alpha C-terminal domain, residues 245-329
非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点） 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；0.1M hepes, 1.4M sodium citrate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K
分辨率 2.05 Å R-free 0.236
3LU0 Molecular model of Escherichia coli core RNA polymerase 提交 2010-02-16 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：pentameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 Tris-HCl；pH 8；Tris-HCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 11.20 Å
3N4M E. coli RNA polymerase alpha subunit C-terminal domain in complex with CAP and DNA 提交 2010-05-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 B 246–329（84 aa） 片段：alpha subunit C-terminal domain, residues 246-329
链 C 246–329（84 aa） 片段：alpha subunit C-terminal domain, residues 246-329
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 4 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.5；293.2 K；100 mM sodium acetate (pH 4.5), 625 mM NaCl, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 293.2K
分辨率 2.99 Å R-free 0.224
3N97 RNA polymerase alpha C-terminal domain (E. coli) and sigma region 4 (T. aq. mutant) bound to (UP,-35 element) DNA 提交 2010-05-28 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：hexameric
链 B 246–329（84 aa） 片段：alpha subunit C-terminal domain, residues 246-329
链 C 246–329（84 aa） 片段：alpha subunit C-terminal domain, residues 246-329
未记录 ACT ACETATE ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.6；289.15 K；28% (w/v) PEG4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.01 M sarcosine, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 289.15K
分辨率 3.25 Å R-free 0.295
4JK1 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with Guanosine tetraphosphate (ppGpp) 提交 2013-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.320
4JK1 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with Guanosine tetraphosphate (ppGpp) 提交 2013-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 3.90 Å R-free 0.320
4JK2 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with guanosine pentaphosphate (pppGpp) 提交 2013-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 0O2 guanosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) 3'-(trihydrogen diphosphate) × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.20 Å R-free 0.322
4JK2 X-ray crystal structure of Escherichia coli sigma70 holoenzyme in complex with guanosine pentaphosphate (pppGpp) 提交 2013-03-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1 M Hepes-HCl (pH 7.0), 0.2 M CaAcetate, ~15 % PEG400, 10 mM Tri(2-carboxyethyl)phosphine (TCEP), VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 4.20 Å R-free 0.322
4KMU X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Rifampin 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.85 Å R-free 0.321
4KMU X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Rifampin 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.85 Å R-free 0.321
4KN4 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2b 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 1RL Benzoxazinorifamycin-2b × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.96 Å R-free 0.315
4KN4 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2b 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 1RL Benzoxazinorifamycin-2b × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.96 Å R-free 0.315
4KN7 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2c 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 1RM Benzoxazinorifamycin-2c × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.69 Å R-free 0.309
4KN7 X-ray crystal structure of the Escherichia coli RNA polymerase in complex with Benzoxazinorifamycin-2c 提交 2013-05-08 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 1RM Benzoxazinorifamycin-2c × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；300 K；0.1 M HEPES-HCl, pH 7.0, 0.2 M calcium acetate, ~15% PEG400, 10 mM DTT, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 300K
分辨率 3.69 Å R-free 0.309
4MEX Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with salinamide A 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.325
4MEX Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with salinamide A 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.90 Å R-free 0.325
4MEY Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase holoenzyme 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.95 Å R-free 0.325
4MEY Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase holoenzyme 提交 2013-08-27 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1M HEPES, 0.2M calcium chloride, 18% PEG400, pH 7.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 295K
分辨率 3.95 Å R-free 0.325
4ZH2 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBR703 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–329（328 aa）
链 B 2–329（328 aa）
未记录 4OB N-hydroxy-N'-phenyl-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.20 Å R-free 0.288
4ZH2 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBR703 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 2–329（328 aa）
链 H 2–329（328 aa）
未记录 4OB N-hydroxy-N'-phenyl-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.20 Å R-free 0.288
4ZH3 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRH16-Br 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–329（328 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
链 B 2–329（328 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 4OD N'-(3-bromophenyl)-4-fluoro-N-hydroxy-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.08 Å R-free 0.267
4ZH3 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRH16-Br 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 2–329（328 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
链 H 2–329（328 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 4OD N'-(3-bromophenyl)-4-fluoro-N-hydroxy-3-(trifluoromethyl)benzenecarboximidamide × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 4.08 Å R-free 0.267
4ZH4 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRP18 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 2–329（328 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
链 B 2–329（328 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
未记录 4OE 5-(4-fluorophenyl)-4-[4-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 3.99 Å R-free 0.283
4ZH4 Crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase in complex with CBRP18 提交 2015-04-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 2–329（328 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
链 H 2–329（328 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
未记录 4OE 5-(4-fluorophenyl)-4-[4-fluoro-3-(trifluoromethyl)phenyl]-1H-pyrazole × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；295 K；0.1 M HEPES, 0.2 M calcium chloride, 18% PEG400
分辨率 3.99 Å R-free 0.283
5CIZ E. coli RNA polymerase alpha subunit CTD in complex with CAP and DNA: A(5)-tract binding site for alpha CTD 提交 2015-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：octameric
链 B 246–329（84 aa）
未记录 CMP ADENOSINE-3',5'-CYCLIC-MONOPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；28% (w/v) PEG4000, 0.2 M ammonium acetate, 0.01 M sarcosine, 0.1 M sodium citrate, pH 5.6
分辨率 5.01 Å R-free 0.214
5IPL SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–235（235 aa） 片段：UNP residues 1-235
链 B 1–235（235 aa） 片段：UNP residues 1-235
未记录 DPO DIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.60 Å R-free 0.293
5IPM SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–235（235 aa） 片段：UNP residues 1-235
链 B 1–235（235 aa） 片段：UNP residues 1-235
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.20 Å R-free 0.330
5IPN SigmaS-transcription initiation complex with 4-nt nascent RNA 提交 2016-03-09 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–235（235 aa） 片段：UNP residues 1-235
链 B 1–235（235 aa） 片段：UNP residues 1-235
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.61 Å R-free 0.345
5MS0 pseudo-atomic model of the RNA polymerase lambda-based antitermination complex solved by cryo-EM 提交 2016-12-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.80 Å
5MY1 E. coli expressome 提交 2017-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 25 PDB 声明：26-meric
链 V 1–329（329 aa）
链 W 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.60 Å
5NSR Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holo enzyme with promoter DNA closed complex 提交 2017-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
5NSS Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holoenzyme with promoter DNA and transcription activator PspF intermedate complex 提交 2017-04-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
5NWT Crystal Structure of Escherichia coli RNA polymerase - Sigma54 Holoenzyme complex 提交 2017-05-08 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.9；291 K；9% PEG8000, 18% Ethylene glycol, 100mM Sodium HEPES/MOPS Buffer, 0.03M NaF, 0.03M NaBr, 0.03M NaI, 0-10mM DTT
分辨率 3.76 Å R-free 0.370
5UAC Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, wild-type 提交 2016-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.295
5UAC Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, wild-type 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.80 Å R-free 0.295
5UAG Escherichia coli RNA polymerase mutant - RpoB D516V 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–320（320 aa）
链 B 1–320（320 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.40 Å R-free 0.311
5UAG Escherichia coli RNA polymerase mutant - RpoB D516V 提交 2016-12-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–320（320 aa）
链 H 1–320（320 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.40 Å R-free 0.311
5UAH Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB D516V mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.287
5UAH Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB D516V mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.287
5UAJ Escherichia coli RNA polymerase RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.92 Å R-free 0.307
5UAJ Escherichia coli RNA polymerase RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.92 Å R-free 0.307
5UAL Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.89 Å R-free 0.286
5UAL Escherichia coli RNA polymerase and Rifampin complex, RpoB S531L mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.89 Å R-free 0.286
5UAQ Escherichia coli RNA polymerase RpoB H526Y mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
5UAQ Escherichia coli RNA polymerase RpoB H526Y mutant 提交 2016-12-19 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.305
5VSW X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA/ppGpp complex 提交 2017-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 0.2 M calcium acetate, 25 % PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.29 Å R-free 0.259
5VSW X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA/ppGpp complex 提交 2017-05-12 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；300 K；0.1 M HEPES (pH 7.0), 0.2 M calcium acetate, 25 % PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.29 Å R-free 0.259
5VT0 Escherichia coli 6S RNA derivative in complex with Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme 提交 2017-05-15 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–RNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：heptameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 3.81 Å R-free 0.262
5W1S X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and TraR complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M Ca-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 3.81 Å R-free 0.262
5W1T X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M CA-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 4.50 Å R-free 0.276
5W1T X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase and DksA complex 提交 2017-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；298 K；0.1M HEPES-HCL (PH7), 0.2M CA-ACETATE, 15% PEG400
分辨率 4.50 Å R-free 0.276
6ALF CryoEM structure of crosslinked E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM KCl, 5mM MgCl2, 5mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6ALG CryoEM structure of HK022 Nun - E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM Potassium Chloride, 5 mM Magnesium Chloride, 5 mM Dithreitol
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6ALH CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2017-08-07 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM KCl, 5mM MgCl2, 5mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6ASX CryoEM structure of E.coli his pause elongation complex 提交 2017-08-25 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM potassium glutamate, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6BJS CryoEM structure of E.coli his pause elongation complex without pause hairpin 提交 2017-11-06 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH8.0, 150 mM potassium glutamate, 5 mM MgCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
6BYU X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase (RpoB-H526Y) and ppApp complex 提交 2017-12-21 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
突变：H526Y 突变：H526Y ECJ (5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-({[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-oxo-4,5-dihydrofuran-3-yl trihydrogen diphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M MgCl2, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.311
6BYU X-ray crystal structure of Escherichia coli RNA polymerase (RpoB-H526Y) and ppApp complex 提交 2017-12-21 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
突变：H526Y 突变：H526Y ECJ (5R)-5-(6-amino-9H-purin-9-yl)-2-({[(S)-hydroxy(phosphonooxy)phosphoryl]oxy}methyl)-4-oxo-4,5-dihydrofuran-3-yl trihydrogen diphosphate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION；300 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M MgCl2, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 3.60 Å R-free 0.311
6C6S CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6C6T CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with RfaH 提交 2018-01-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6C6U CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound with NusG 提交 2018-01-19 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–234（234 aa）
链 H 1–234（234 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6C9Y Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma70 holoenzyme 提交 2018-01-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.25 Å
6CA0 Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma70 open complex 提交 2018-01-29 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.75 Å
6CUX Escherichia coli RpoB S531L mutant RNA polymerase holoenzyme in complex with Kanglemycin A 提交 2018-03-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 KNG Kanglemycin A × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.255
6CUX Escherichia coli RpoB S531L mutant RNA polymerase holoenzyme in complex with Kanglemycin A 提交 2018-03-26 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；295 K；0.1 M HEPES-HCl (pH 6.7), 0.2 M Ca Acetate, 30% PEG400, 10 mM DTT
分辨率 4.10 Å R-free 0.255
6FLP CryoEM structure of E.coli RNA polymerase paused elongation complex without RNA hairpin bound to NusA 提交 2018-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6FLQ CryoEM structure of E.coli RNA polymerase paused elongation complex bound to NusA 提交 2018-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6GFW Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme initial transcribing complex 提交 2018-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 信息不足 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6GH5 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme transcription open complex 提交 2018-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6GH6 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 holoenzyme intermediate partially loaded complex 提交 2018-05-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6JBQ CryoEM structure of Escherichia coli sigmaE transcription initiation complex containing 5nt of RNA 提交 2019-01-26 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.02 Å
6JNX Cryo-EM structure of a Q-engaged arrested complex 提交 2019-03-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.08 Å
6K4Y CryoEM structure of sigma appropriation complex 提交 2019-05-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
6KJ6 cryo-EM structure of Escherichia coli Crl transcription activation complex 提交 2019-07-21 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；blot for 8 seconds before plunging
分辨率 3.80 Å
6LDI The cryo-EM structure of E. coli CueR transcription activation complex 提交 2019-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 AG SILVER ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.69 Å
6N4C EM structure of the DNA wrapping in bacterial open transcription initiation complex 提交 2018-11-19 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 6–321（316 aa）
链 B 6–315（310 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
分辨率 17.00 Å
6N57 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation I 提交 2018-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6N58 Cryo-EM structure of Escherichia coli RNAP polymerase bound with TraR in conformation II 提交 2018-11-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
6N60 Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream fork promoter DNA and Microcin J25 (MccJ25) 提交 2018-11-23 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–234（234 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
链 B 1–234（234 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M HEPES, pH 6.7, 0.2 M magnesium chloride, 7% w/v PEG3350, 4% v/v glycerol
分辨率 3.68 Å R-free 0.306
6N61 Escherichia coli RNA polymerase sigma70-holoenzyme bound to upstream fork promoter DNA and Capistruin 提交 2018-11-24 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–234（234 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
链 B 1–234（234 aa） 片段：N-terminal domain (UNP residues 1-234)
未记录 EDO 1,2-ETHANEDIOL × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 EPE 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.8；295 K；0.1 M HEPES, pH 6.8, 0.2 M magnesium chloride, 7% w/v PEG3350, 4% v/v glycerol, 4% v/v ethylene glycol
分辨率 3.25 Å R-free 0.316
6P18 Q21 transcription antitermination complex: loading complex 提交 2019-05-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6P19 Q21 transcription antitermination complex: loaded complex 提交 2019-05-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6P1K Cryo-EM structure of Escherichia coli sigma70 bound RNAP polymerase holoenzyme 提交 2019-05-20 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.05 Å
6PSQ Escherichia coli RNA polymerase closed complex (TRPc) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6PSR Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi1) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6PSS Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi1.5a) with TraR and mutant rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6PST Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi1.5b) with TraR and mutant rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6PSU Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPi2) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6PSV Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TpreRPo) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6PSW Escherichia coli RNA polymerase promoter unwinding intermediate (TRPo) with TraR and rpsT P2 promoter 提交 2019-07-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6R9B Cryo-EM structure of bacterial RNAP with a DNA mimic protein Ocr from T7 phage 提交 2019-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6R9G Structural basis of transcription inhibition by the DNA mimic Ocr protein of bacteriophage T7 提交 2019-04-03 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RH3 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase elongation complex bound to CTP substrate 提交 2019-04-18 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6RI7 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase elongation complex bound to GreB transcription factor 提交 2019-04-23 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6RI9 Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex in non-swiveled state 提交 2019-04-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RIN Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex bound to GreB transcription factor 提交 2019-04-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
6RIP Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex in swiveled state 提交 2019-04-24 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6TQN rrn anti-termination complex without S4 提交 2019-12-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：tetradecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6TQO rrn anti-termination complex 提交 2019-12-17 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 3 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6UTW E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA ("Fresh" crystal) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 AAA 1–235（235 aa）
链 BBB 1–235（235 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.85 Å R-free 0.329
6UTX E. coli sigma-S transcription initiation complex with an empty bubble ("Old" crystal) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 AAA 1–235（235 aa）
链 BBB 1–235（235 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.05 Å R-free 0.349
6UTY E. coli sigma-S transcription initiation complex with a mismatching CTP ("Old" crystal soaked with CTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 AAA 1–235（235 aa）
链 BBB 1–235（235 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.15 Å R-free 0.370
6UU5 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA ("Old" crystal soaked with GTP, UTP, CTP, and dinucleotide GpA for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 AAA 1–235（235 aa）
链 BBB 1–235（235 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 5.40 Å R-free 0.362
6UU6 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 4-nt RNA and a UTP ("Old" crystal soaked with UTP, ddCTP, and dinucleotide ApG for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 AAA 1–235（235 aa）
链 BBB 1–235（235 aa）
未记录 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.20 Å R-free 0.389
6UU7 E. coli sigma-S transcription initiation complex with a 6-nt RNA and an NTP ("Old" crystal soaked with UTP, CTP, ddGTP, and dinucleotide ApG for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 AAA 1–235（235 aa）
链 BBB 1–235（235 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 DG3 2'-3'-DIDEOXYGUANOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.40 Å R-free 0.390
6UU8 E. coli mutant sigma-S transcription initiation complex with a 7-nt RNA ("Fresh" mutant crystal soaked with GTP, UTP, and CTP for 30 minutes) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 AAA 1–235（235 aa）
链 BBB 1–235（235 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 DPO DIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 4.40 Å R-free 0.380
6UUB E. coli sigma-S transcription initiation complex with a mismatching UTP ("Fresh" crystal soaked with UTP for 2 hours) 提交 2019-10-30 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 AAA 1–235（235 aa）
链 BBB 1–235（235 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；295 K；PEG3350, sodium chloride, HEPES
分辨率 3.96 Å R-free 0.375
6VJS Escherichia coli RNA polymerase and ureidothiophene-2-carboxylic acid complex 提交 2020-01-17 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 QZY 3-{[benzyl(ethyl)carbamoyl]amino}-5-(4-phenoxyphenyl)thiophene-2-carboxylic acid × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；300 K；0.1M Hepes-NaOH (pH 8), 0.2M CaAcetate, 15% PEG400
分辨率 4.02 Å R-free 0.276
6VJS Escherichia coli RNA polymerase and ureidothiophene-2-carboxylic acid complex 提交 2020-01-17 聚集状态不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：hexameric
链 F 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8；300 K；0.1M Hepes-NaOH (pH 8), 0.2M CaAcetate, 15% PEG400
分辨率 4.02 Å R-free 0.276
6XAS CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 H 1–329（329 aa）
链 K 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6XAV CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex bound with NusG 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 H 1–329（329 aa）
链 K 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
6Z9P Transcription termination intermediate complex 1 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6Z9Q Transcription termination intermediate complex 2 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
6Z9R Transcription termination intermediate complex 3 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6Z9S Transcription termination intermediate complex 4 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
6Z9T Transcription termination intermediate complex 5 提交 2020-06-04 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
6ZTJ E. coli 70S-RNAP expressome complex in NusG-coupled state (38 nt intervening mRNA) 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 CA 1–329（329 aa）
链 CB 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 479 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
6ZTL E. coli 70S-RNAP expressome complex in collided state bound to NusG 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：62-meric
链 CA 1–329（329 aa）
链 CB 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 441 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
6ZTM E. coli 70S-RNAP expressome complex in collided state without NusG 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 52 PDB 声明：60-meric
链 CA 1–329（329 aa）
链 CB 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 421 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
6ZTN E. coli 70S-RNAP expressome complex in NusG-coupled state (42 nt intervening mRNA) 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：63-meric
链 CA 1–329（329 aa）
链 CB 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 487 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
6ZTO E. coli 70S-RNAP expressome complex in uncoupled state 1 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：62-meric
链 CA 1–329（329 aa）
链 CB 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 487 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6ZTP E. coli 70S-RNAP expressome complex in uncoupled state 6 提交 2020-07-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：62-meric
链 CA 1–329（329 aa）
链 CB 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 487 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
6ZU1 E. coli 70S-RNAP expressome complex in uncoupled state 2 提交 2020-07-21 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 54 PDB 声明：62-meric
链 CA 1–329（329 aa）
链 CB 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 487 PHE PHENYLALANINE × 1 ZN ZINC ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
7ADB Transcription termination intermediate complex 1 delta NusG 提交 2020-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
7ADC Transcription termination intermediate complex 3 delta NusG 提交 2020-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7ADD Transcription termination intermediate complex IIIa 提交 2020-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7ADE Transcription termination complex IVa 提交 2020-09-14 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 U 1–329（329 aa）
链 V 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 6 BEF BERYLLIUM TRIFLUORIDE ION × 5 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7BEF Structures of class II bacterial transcription complexes 提交 2020-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7BEG Structures of class I bacterial transcription complexes 提交 2020-12-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris pH 8, 50 mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7C17 The cryo-EM structure of E. coli CueR transcription activation complex with fully duplex promoter DNA 提交 2020-05-02 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 AG SILVER ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.22 Å
7KHB Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter open complex 提交 2020-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.53 Å
7KHC Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter closed complex 提交 2020-10-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 1N7 CHAPSO × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.14 Å
7KHE Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter pre-open complex with DksA/ppGpp 提交 2020-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–236（236 aa）
链 B 1–236（236 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7KHI Escherichia coli RNA polymerase and rrnBP1 promoter complex with DksA/ppGpp 提交 2020-10-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–236（236 aa）
链 B 1–236（236 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 3 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.62 Å
7PY0 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusG (NusG-EC in more-swiveled conformation) 提交 2021-10-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
7PY1 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusG (the consensus NusG-EC) 提交 2021-10-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7PY3 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA (the consensus NusA-EC) 提交 2021-10-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7PY5 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (the consensus NusA-NusG-EC) 提交 2021-10-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7PY6 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (NusA and NusG elongation complex in less-swiveled conformation) 提交 2021-10-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7PY7 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (NusA and NusG elongation complex in more-swiveled conformation) 提交 2021-10-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7PY8 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusG (NusG-EC in less-swiveled conformation) 提交 2021-10-09 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7PYJ CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA (NusA elongation complex in less-swiveled conformation) 提交 2021-10-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7PYK CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA (NusA elongation complex in more-swiveled conformation) 提交 2021-10-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7Q0J RNA polymerase elongation complex in more-swiveled conformation 提交 2021-10-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
7Q0K RNA polymerase elongation complex in less-swiveled conformation 提交 2021-10-15 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7QV9 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF 提交 2022-01-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
7QWP CryoEM structure of bacterial transcription close complex (RPc) 提交 2022-01-25 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM KCl, 10 mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7QXI Cryo-EM structure of RNA polymerase-sigma54 holo enzyme with promoter DNA closed complex 提交 2022-01-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-HCl pH 8.0, 150 mM KCl, 10 mM MgCl2,8 mM CHAPSO
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7SZJ Cryo-EM structure of Rifamycin bound to E. coli RNAP and rrnBP1 promoter complex 提交 2021-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 RFP RIFAMPICIN × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.11 Å
7SZK Cryo-EM structure of 27a bound to E. coli RNAP and rrnBP1 promoter complex 提交 2021-11-28 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 D9X (2S,7R,7aR,13aP,16Z,18E,20S,21S,22R,23R,24R,25S,26R,27S,28E)-5,21,23-trihydroxy-27-methoxy-2,4,16,20,22,24,26-heptamethyl-10-[4-(2-methylpropyl)piperazin-1-yl]-12-({4-[(morpholin-4-yl)methyl]phenyl}methoxy)-1,6,15-trioxo-1,2,7,7a-tetrahydro-6H-2,7-(epoxypentadeca[1,11,13]trienoimino)[1]benzofuro[4,5-a]phenoxazin-25-yl acetate × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.94 Å
7UBM Transcription antitermination complex: "pre-engaged" Qlambda-loading complex 提交 2022-03-15 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.13 Å
7UBN Transcription antitermination complex: NusA-containing "engaged" Qlambda-loading complex 提交 2022-03-15 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：undecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.36 Å
7UWE CryoEM Structure of E. coli Transcription-Coupled Ribonucleotide Excision Repair (TC-RER) complex 提交 2022-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 2.90 Å
7UWH CryoEM Structure of E. coli Transcription-Coupled Ribonucleotide Excision Repair (TC-RER) complex bound to ribonucleotide substrate 提交 2022-05-03 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 OTHER
分辨率 3.10 Å
7VWY Cryo-EM structure of Rob-dependent transcription activation complex in a unique conformation 提交 2021-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.57 Å
7VWZ Cryo-EM structure of Rob-dependent transcription activation complex in a unique conformation 提交 2021-11-12 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
7W5W Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with micF promoter DNA 提交 2021-11-30 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
7W5X Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with zwf promoter DNA 提交 2021-11-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
7W5Y Cryo-EM structure of SoxS-dependent transcription activation complex with fpr promoter DNA 提交 2021-11-30 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7XUE Cryo-EM structure of HK022 putRNA-associated E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.17 Å
7XUG cryo-EM structure of HK022 putRNA-less E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.57 Å
7XUI Cryo-EM structure of sigma70 bound HK022 putRNA-associated E.coli RNA polymerase elongation complex 提交 2022-05-18 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；pH adjustment at 4'C
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；using two layers of blot papers
分辨率 3.61 Å
7YP9 Cryo-EM structure of Escherichia coli paused complex of transcription termination (TTC-pause) 提交 2022-08-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.58 Å
7YPA Cryo-EM structure of Escherichia coli hairpin-nucleation complex of transcription termination (TTC-hairpin) 提交 2022-08-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.05 Å
7YPB Cryo-EM structure of Escherichia coli release complex of transcription termination (TTC-release) 提交 2022-08-03 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.48 Å
8ABY RNA polymerase bound to purified in vitro transcribed regulatory RNA putL - pause prone, closed clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 3.70 Å
8ABZ RNA polymerase at U-rich pause bound to non-regulatory RNA - pause prone, closed clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 3.40 Å
8AC0 RNA polymerase at U-rich pause bound to regulatory RNA putL - active, closed clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.10 Å
8AC1 RNA polymerase at U-rich pause bound to non-regulatory RNA - inactive, open clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.06 Å
8AC2 RNA polymerase- post-terminated, open clamp state 提交 2022-07-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 3.70 Å
8ACP RNA polymerase at U-rich pause bound to regulatory RNA putL - inactive, open clamp state 提交 2022-07-06 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.50 Å
8AD1 RNA polymerase at U-rich pause bound to RNA putL triple mutant - pause prone, closed clamp state 提交 2022-07-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM Tris-glutamate pH 8.0, 50 mM K-glutamate, 10 mM Mg-glutamate, 0.001 mM ZnCl2, 2mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Quantifoil UltrAuFoil R1.2/1.3 300 mesh holey gold grids were plasma cleaned on a Model 1070 (Fischione Instruments) for 30 sec at 70% power and with an 80% Argon and 20% Oxygen mixture prior to the application of 0.004 ml of sample. Grids were plunge frozen into liquid ethane using a Vitrobot mark IV (FEI) with 95% chamber humidity at 283K.
分辨率 4.10 Å
8E3F Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 18 nt long RNA spacer, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-17 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–329（329 aa）
链 D 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
8E5K Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 21 nt long RNA spacer, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–329（329 aa）
链 D 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8E5O Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 24 nt long RNA spacer, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-22 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–329（329 aa）
链 D 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8E6X Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 18 nt long RNA spacer, lambda-tR1 rut RNA, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–329（329 aa）
链 D 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.27 Å
8E6Z Escherichia coli Rho-dependent transcription pre-termination complex containing 18 nt long RNA spacer, dC75 rut mimic RNA, Mg-ADP-BeF3, and NusG; TEC part 提交 2022-08-23 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 C 1–329（329 aa）
链 D 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8F1I SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to mismatch fragment dhsU36mm1 (-12T) 提交 2022-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8F1J SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to mismatch DNA fragment dhsU36mm2 (-12A) 提交 2022-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8F1K SigN RNA polymerase early-melted intermediate bound to full duplex DNA fragment dhsU36 (-12T) 提交 2022-11-05 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8FIX Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase backtracked elongation complex harboring a terminal mismatch 提交 2022-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8FIY Cryo-EM structure of E. coli RNA polymerase Elongation complex in the Transcription-Translation Complex (RNAP in an anti-swiveled conformation) 提交 2022-12-17 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.30 Å
8FTD Structure of Escherichia coli CedA in complex with transcription initiation complex 提交 2023-01-11 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 R 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.76 Å
8FVR CryoEM structure of E.coli transcription elongation complex 提交 2023-01-19 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 D 1–329（329 aa）
链 E 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 10 uM ZnCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.42 Å
8FVW CryoEM structure of E.coli transcription elongation complex bound to ppGpp 提交 2023-01-19 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 D 1–329（329 aa）
链 E 1–329（329 aa）
未记录 G4P GUANOSINE-5',3'-TETRAPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 2 NA SODIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20 mM HEPES, pH 8.0, 150 mM NaCl, 10 mM MgCl2, 10 uM ZnCl2, 5 mM DTT
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.10 Å
8HKC Cryo-EM structure of E. coli RNAP sigma32 complex 提交 2022-11-25 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.49 Å
8IGR Cryo-EM structure of CII-dependent transcription activation complex 提交 2023-02-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：dodecameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8IGS Cryo-EM structure of RNAP-promoter open complex at lambda promoter PRE 提交 2023-02-21 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8JO2 Structural basis of transcriptional activation by the OmpR/PhoB-family response regulator PmrA 提交 2023-06-06 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：decameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.3
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.74 Å
8K58 The cryo-EM map of close TIEA-TEC complex 提交 2023-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 6–236（231 aa）
链 B 6–236（231 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.15 Å
8K59 The cryo-EM map of TIC-TIEA complex 提交 2023-07-21 构建体不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 A 7–236（230 aa）
链 B 7–236（230 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8K5A The cryo-EM map of open TIEA-TEC complex 提交 2023-07-21 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 6–236（231 aa）
链 B 6–236（231 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
8PDY E. coli RNA polymerase paused at ops site 提交 2023-06-13 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8PEN fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (alternative state of RfaH) 提交 2023-06-14 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFG autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex), not fully complementary scaffold 提交 2023-06-15 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PFJ fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not fully complementary scaffold; alternative state of RfaH) 提交 2023-06-16 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8PH9 E. coli RNA polymerase paused at ops site (non-complementary scaffold) 提交 2023-06-19 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8PHK fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site 提交 2023-06-20 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8PIB autoinhibited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (encounter complex) 提交 2023-06-21 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8PID backtracked E. coli transcription complex paused at ops site and bound to RfaH 提交 2023-06-21 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.00 Å
8PIM fully recruited RfaH bound to E. coli transcription complex paused at ops site (not complementary scaffold) 提交 2023-06-22 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8RE4 Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 5nt pre-translocated complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 4–324（321 aa）
链 B 4–324（321 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
8REA Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 5nt post-translocated complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 4–324（321 aa）
链 B 4–324（321 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8REB Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 6nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 4–324（321 aa）
链 B 4–324（321 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8REC Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 7nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 4–324（321 aa）
链 B 4–324（321 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
8RED Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 8nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 4–324（321 aa）
链 B 4–324（321 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8REE Cryo-EM structure of bacterial RNA polymerase-sigma54 initial transcribing complex - 9nt complex 提交 2023-12-10 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 4–324（321 aa）
链 B 4–324（321 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8SY5 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dS-BTP base pair in the active site 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X0F 2-oxo-2-hydroadenosine 5'-(tetrahydrogen triphosphate) × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8SY6 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dB-UTP base pair in the active site 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 DGP 2'-DEOXYGUANOSINE-5'-MONOPHOSPHATE × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 UTP URIDINE 5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
8SY7 E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound the unnatural dB-STP base pair in the active site 提交 2023-05-24 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 X0O [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{S})-5-(4-azanyl-1-methyl-2-oxidanylidene-pyrimidin-5-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；20mM Tris (pH 8.0), 40mM KCl, 5mM DTT and 5mM MgCl2
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.65 Å
8SZW Reconstituted E. coli RNA polymerase post-termination complex on negatively-supercoiled DNA: open duplex DNA (rPTCo) 提交 2023-05-30 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.63 Å
8T02 Reconstituted E. coli RNA polymerase post-termination complex on negatively-supercoiled DNA: unwinding duplex DNA (rPTCi) 提交 2023-05-31 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 5 PDB 声明：heptameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.79 Å
8TO1 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1a) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.80 Å
8TO6 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1d) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-02 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TO8 Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1b) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 4QM (3R,5S,7R,8R,9S,10S,12S,13R,14S,17R)-10,13-dimethyl-17-[(2R)-pentan-2-yl]-2,3,4,5,6,7,8,9,11,12,14,15,16,17-tetradecahydro-1H-cyclopenta[a]phenanthrene-3,7,12-triol × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TOE Escherichia coli RNA polymerase unwinding intermediate (I1c) at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 3 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final in each sample just prior to spray mixing.
分辨率 2.90 Å
8TOM Escherichia coli RNA polymerase closed complex intermediate at the lambda PR promoter 提交 2023-08-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
链 M 1–329（329 aa）
未记录 1N7 CHAPSO × 4 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；CHAPSO was added (from 80 mM stock) to 8 mM final.
分辨率 3.10 Å
8TXO E. coli DNA-directed RNA polymerase transcription elongation complex bound to the unnatural dZ-PTP base pair in the active site 提交 2023-08-23 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：heptameric
链 A 1–329（329 aa）
链 G 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 S9F [[(2~{R},3~{S},4~{R},5~{R})-5-(4-azanyl-2-oxidanylidene-1$l^{4},3,5,7-tetrazabicyclo[4.3.0]nona-1(6),3,8-trien-7-yl)-3,4-bis(oxidanyl)oxolan-2-yl]methoxy-oxidanyl-phosphoryl] phosphono hydrogen phosphate × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8U3B Cryo-EM structure of E. coli NarL-transcription activation complex at 3.2A 提交 2023-09-07 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：11-meric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.23 Å
8UPO Escherichia coli transcription-translation coupled complex class A (TTC-A) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 21 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-23 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.50 Å
8UPR Escherichia coli transcription-translation coupled complex class A (TTC-A) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 21 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-23 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8UQL Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH in loaded state, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 聚集状态不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.20 Å
8UQM Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH in loaded state, NusA, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8UQP Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-24 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
8UR0 Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 24 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-25 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8URH Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 27 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-26 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.70 Å
8URI Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 27 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-26 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8URX Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNAs in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
8URY Escherichia coli transcription-translation coupled complex class B (TTC-B) containing RfaH bound to ops signal, NusA, mRNA with a 30 nt long spacer, and fMet-tRNA in E-site and P-site of the ribosome 提交 2023-10-27 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.6
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8VKV Escherichia coli transcription-translation coupled complex (TTC-B) containing mRNA with a 33 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-10 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VL1 Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 36 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-11 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.30 Å
8VOO Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 39 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.40 Å
8VOP Escherichia coli transcription-translation coupled complex (TTC-B) containing mRNA with a 36 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.00 Å
8VOQ Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 39 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.30 Å
8VOR Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 51 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
8VOS Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 60 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2024-01-15 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8Y5K E.coli transcription translation coupling complex in TTC-A state 2 containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.90 Å
8Y5L E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8Y5M E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 2 containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5N E.coli transcription translation coupling complex in TTC-A state 3 containing mRNA with 21-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：67-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5O E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8Y5P E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 1) containing mRNA with 24-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：67-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
8Y5Q E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：66-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8Y5R E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 1) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5S E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5T E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 3) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8Y6U Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with transcription factor GcvA 提交 2024-02-03 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 9 PDB 声明：11-meric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
链 I 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.9
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.97 Å
8YDE E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 3) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
8YDF E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDG E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
8YDH E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass1) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
8YDI E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDJ E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 A1 1–329（329 aa）
链 A2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
9GDA RNAP-TopoI complex on duplex scaffold 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9GDB RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - consensus reconstruction 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
9GDC RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - single-bubble configuration 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9GDD RNAP-TopoI complex on bubble scaffold - two-bubble configuration 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.30 Å
9GDE RNAP-TopoI complex on long-overhang scaffold - orientation 1 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.00 Å
9GDH RNAP-TopoI complex on long-overhang scaffold - orientation 2 提交 2024-08-05 聚集状态不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
9GUR 30S mRNA delivery complex TEC resolved (TEC only) 提交 2024-09-20 构建体不同 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 1 6–234（229 aa）
链 2 4–233（230 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
9GUW 30S-TEC (TEC in expressome position) Inactive state 2 提交 2024-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 26 PDB 声明：30-meric
链 1 1–329（329 aa）
链 2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 118 ZN ZINC ION × 3 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9GUX 30S-TEC (TEC in expressome position) Inactive state 1 提交 2024-09-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 27 PDB 声明：31-meric
链 1 1–329（329 aa）
链 2 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 132 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
9L0X Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with Escherichia phage Mu late transcription activator C 提交 2024-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
链 P 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.22 Å
9L0Y Cryo-EM structure of E.coli transcription initiation complex with Escherichia phage Mu middle transcription activator Mor 提交 2024-12-13 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 11 PDB 声明：13-meric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
链 P 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.78 Å
9MSE de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with pre-catalytic bEBP state (RPi1 open ring) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 6 MG MAGNESIUM ION × 3 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9MSF de novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with post-catalytic bEBP state (RPi1 closed ring) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：16-meric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9MSG De novo SigN RNA polymerase transcription initiation intermediate with bound SigN-RII 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 5 MG MAGNESIUM ION × 2 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9MSH de novo SigN RNA polymerase open complex (RPo) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
9MSJ de novo SigN RNA polymerase NTP-bound open complex (RPo+2A) 提交 2025-01-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8；40 mM Tris-HCl, pH 8/RT, 200 mM KCl, 10 mM MgCl2, 1 mM DTT; fluorinated fos-choline-8 (FC8F) added to a final concentration of 1.5 mM during grid preparation
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9Q90 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 4 MG MAGNESIUM ION × 4 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.50 Å
9Q91 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 6 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.20 Å
9Q92 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 5 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
9Q93 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 4 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：14-meric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.60 Å
9Q94 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 3 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.80 Å
9Q95 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -10 to -1 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.80 Å
9Q96 Cryo-EM Structure of Bacterial RNA polymerase-sigma54 transcription open complex with wild type sigma54, from RPi(-10-1) 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
9Q97 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 2 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
9Q98 CryoEM structure of bacterial transcription intermediate complex mediated by activator PspF containing nifH promoter DNA containing mismatch from -11 to -8 - conformation 1 提交 2025-02-26 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白–DNA 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：tetradecameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ADP ADENOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 5 AF3 ALUMINUM FLUORIDE × 5 MG MAGNESIUM ION × 5 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 8.30 Å
9Y79 Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC^walked) containing mRNA with a 39 nt long spacer, NusG, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site 提交 2025-09-09 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 AC 1–329（329 aa）
链 AD 1–329（329 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY mmCIF 未提供已读取条件 分辨率 3.20 Å
9YMU De novo initial transcribing RNA polymerase with 2-mer RNA and bound CTP / Michaelis complex (RPitc2+CTP) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 2 ZN ZINC ION × 2 CTP CYTIDINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMV De novo initial transcribing RNA polymerase with pretranslocated 3-mer RNA / product complex (RPitc3) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 ATP ADENOSINE-5'-TRIPHOSPHATE × 1 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
9YMW De novo initial transcribing RNA polymerase with 5-mer RNA CCAUC (RPitc5a) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMX De novo initial transcribing RNA polymerase with 5-mer RNA AUCUA (RPitc5b) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
9YMY De novo initial transcribing RNA polymerase with 9-mer RNA (RPitc9) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
9YN0 De novo initial transcribing RNA polymerase with sigma 70 region 1.1 bound (RPitc-s70_1.1) 提交 2025-10-10 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 G 1–329（329 aa）
链 H 1–329（329 aa）
未记录 POP PYROPHOSPHATE 2- × 1 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.90 Å
9YNP Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription initiation complex with GpA and pseudouridimycin (PUM) 提交 2025-10-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 PUM (1S)-1,4-anhydro-5-[(N-carbamimidoylglycyl-N~2~-hydroxy-L-glutaminyl)amino]-5-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-D-ribitol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.06 Å
9YNQ Cryo-EM structure of Escherichia coli transcription initiation complex with GpA and des-hydroxy pseudouridimycin (des-hydroxy PUM) 提交 2025-10-11 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 A 1–329（329 aa）
链 B 1–329（329 aa）
未记录 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 A1CYH (1S)-1,4-anhydro-5-[(N-carbamimidoylglycyl-L-glutaminyl)amino]-5-deoxy-1-(2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydropyrimidin-5-yl)-D-ribitol × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.32 Å

共 276 个其他 PDB 条目、305 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RPOA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 5
链与序列区间 作者链 G； PDB构建体 1–329； UniProt 1–329 作者链 H； PDB构建体 1–329； UniProt 1–329

Transcription termination/antitermination protein NusA

Escherichia coli

UniProt P0AFF6

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 其他组合 异源复合物 蛋白 × 7 DNA 2 RNA 1 PDB 声明：decameric（10） 与全部聚合物数一致 链 F； UniProt 1–495 未记录 Transcription antitermination protein RfaH × 1 （P0AFW0） DNA-directed RNA polymerase subunit beta × 1 （P0A8V2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit beta' ; × 1 （P0A8T7） DNA-directed RNA polymerase subunit omega × 1 （P0A800） DNA-directed RNA polymerase subunit alpha × 2 （P0A7Z4） non-template DNA × 1 template DNA × 1 RNA × 1 ZN ZINC ION × 2 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY cryo-EM缓冲液：pH 7.5 cryo-EM玻璃化条件：冷冻剂 ETHANE 分辨率 3.20 Å

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 8PIL Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
2JZB Solution structure of the complex between E.coli NusA-AR2 and RNAP-aCTD 提交 2008-01-02 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 424–495（72 aa）
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.4；298 K；压力 ambient
NMR样品组成 0.7 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] actd, 2.1 mM ar2, 10 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.7 mM [U-98% 13C; U-98% 15N] ar2, 2.1 mM actd, 10 mM potassium phosphate, 50 mM sodium chloride, 1 mM beta-mercaptoethanol, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
分辨率未提供
2KWP Solution structure of the aminoterminal domain of E. coli NusA 提交 2010-04-15 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 1–125（125 aa） 片段：N-terminal domain
未记录 未记录非水小分子 SOLUTION NMR
NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）50；压力 ambient
NMR样品组成 0.4mM [U-98% 13C; U-98% 15N] protein-1, 10mM potassium phosphate-2, 50mM sodium chloride-3, 0.05mM EDTA-4, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成 0.4mM [U-98% 13C; U-98% 15N] protein-5, 10mM potassium phosphate-6, 50mM sodium chloride-7, 0.05mM EDTA-8, 100% D2O | 100% D2O
分辨率未提供
5LM9 Structure of E. coli NusA 提交 2016-07-29 构建体不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白单体 单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric
链 A 101–426（326 aa） 片段：UNP residues 101-426
未记录 SO4 SULFATE ION × 5 MG MAGNESIUM ION × 1 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；295 K；0.1 M HEPES, pH 7.5, 0.1 M NaCl, 1.6 M (NH4)2SO4
分辨率 2.14 Å R-free 0.244
5MS0 pseudo-atomic model of the RNA polymerase lambda-based antitermination complex solved by cryo-EM 提交 2016-12-29 聚集状态不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 10 PDB 声明：tetradecameric
链 M 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 9.80 Å
6FLQ CryoEM structure of E.coli RNA polymerase paused elongation complex bound to NusA 提交 2018-01-26 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：octameric
链 F 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
6XAS CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：pentadecameric
链 G 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
6XAV CryoEM Structure of E. coli Rho-dependent Transcription Pre-termination Complex bound with NusG 提交 2020-06-04 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 13 PDB 声明：hexadecameric
链 G 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 7.70 Å
7PY3 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA (the consensus NusA-EC) 提交 2021-10-08 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 F 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7PY5 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (the consensus NusA-NusG-EC) 提交 2021-10-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 F 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
7PY6 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (NusA and NusG elongation complex in less-swiveled conformation) 提交 2021-10-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 F 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7PY7 CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA and NusG (NusA and NusG elongation complex in more-swiveled conformation) 提交 2021-10-09 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 7 PDB 声明：decameric
链 F 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
7PYJ CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA (NusA elongation complex in less-swiveled conformation) 提交 2021-10-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 F 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
7PYK CryoEM structure of E.coli RNA polymerase elongation complex bound to NusA (NusA elongation complex in more-swiveled conformation) 提交 2021-10-10 聚集状态不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 6 PDB 声明：nonameric
链 F 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ZN ZINC ION × 2 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.10 Å
8Y5L E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.70 Å
8Y5M E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 2 containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5O E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass1) containing mRNA with 30-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.20 Å
8Y5P E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 1) containing mRNA with 24-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：67-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 6.50 Å
8Y5Q E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 4 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 59 PDB 声明：66-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.90 Å
8Y5R E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 1) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5S E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 2) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and GDPCP 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GCP PHOSPHOMETHYLPHOSPHONIC ACID GUANYLATE ESTER × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.50 Å
8Y5T E.coli Transcription translation coupling complex in TTC-B state 5 (subclass 3) containing mRNA with 27-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and fusidic acid 提交 2024-01-31 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：66-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 FUA FUSIDIC ACID × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.40 Å
8YDE E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 3) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.00 Å
8YDF E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDG E.coli transcription translation coupling complex in TTC-B state 3 (subclass2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å
8YDH E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass1) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.55 Å
8YDI E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P state 1 (subclass 2) containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 58 PDB 声明：67-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.60 Å
8YDJ E.coli transcription translation coupling complex in TTC-P containing mRNA with 39-mer spacer, NusG, NusA, fMet-tRNA(iMet), Phe-tRNA(Phe), and viomycin 提交 2024-02-20 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 其他组合 异源复合物；蛋白 × 60 PDB 声明：68-meric
链 NA 1–495（495 aa）
未记录 MG MAGNESIUM ION × 1 GDP GUANOSINE-5'-DIPHOSPHATE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 1 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.4
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 5.10 Å

共 27 个其他 PDB 条目、27 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUSA_ECOLI
Isoform —
PDB实体 9
链与序列区间 作者链 F； PDB构建体 3–497； UniProt 1–495

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8pil

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8pil
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id8pil
沉积日期 deposition_date2023-06-22
最后修订 last_revision2024-04-24
结构标题 titleE. coli transcription complex paused at ops site and bound to RfaH and NusA
关键词 keywordstranscription complex, ops, RfaH, NusA, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY
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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier51.06 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron51.12 Å
零角强度 I(0) i02955980000.00
分子量 molecular_weight434490.0 kDa
排除体积 excluded_volume536130 ų
包络体积 envelope_volume789970 ų
水化壳体积 shell_volume122820 ų
包络直径 envelope_diameter179.9 Å
壳层 Rg shell_rg58.52 Å
包络 Rg envelope_rg50.92 Å
形状 Rg shape_rg51.14 Å
总 Rg total_rg51.24 Å
总原子数 total_atoms30413
残基数 n_residues3740
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax167.2 Å
Rg (实空间) rg_real50.93 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.40 Å
I(0) (实空间) i0_real2.9560e+09
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.5620e+07
Rg (倒空间) rg_reciprocal51.17 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal2957000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8679
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary64.7 Å
偏度 Skewness skewness0.288
峰度 Kurtosis kurtosis-0.247
角度范围 angular_range— – 0.1550 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha519500000.0000
实空间数据点数 n_real_points32
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.835; Stabil: 0.999; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.984; Smooth: 0.790
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (11)

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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)