8vl1

;Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 36 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site ;

Method: ELECTRON MICROSCOPY Dmax: 308.9 Å Quality: GOOD

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 8vl1

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 8vl1
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1. 结构基本信息 1. Structure Basics

条目编号 entry_id8vl1
沉积日期 deposition_date2024-01-11
结构标题 title;Escherichia coli transcription-translation loosely coupled complex (TTC-LC) containing mRNA with a 36 nt long spacer, ops signal, RfaH, NusA, and fMet-tRNAs in E-site and P-site ;
关键词 keywordsTranscription, translation, coupling, RfaH, NusA, ops, TTC; TRANSCRIPTION
实验方法 methodELECTRON MICROSCOPY

2. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 2. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier
回转半径 Rg (电子) rg_electron111.30
零角强度 I(0) i0205722000000.00
分子量 molecular_weight2675800.0 kDa
排除体积 excluded_volume2853900 ų
包络体积 envelope_volume5436500 ų
水化壳体积 shell_volume405050 ų
包络直径 envelope_diameter402.4
壳层 Rg shell_rg108.50
包络 Rg envelope_rg111.70
形状 Rg shape_rg111.60
总 Rg total_rg110.70
总原子数 total_atoms280046
残基数 n_residues14965
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 −1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3

3. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 3. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax308.9
Rg (实空间) rg_real100.10
Rg 误差 (实空间) rg_real_error1.36
I(0) (实空间) i0_real1.9840e+11
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error4.2070e+09
Rg (倒空间) rg_reciprocal98.11
I(0) (倒空间) i0_reciprocal202000000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8997
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks2
主峰位置 r_peak_primary110.3
偏度 Skewness skewness0.587
峰度 Kurtosis kurtosis-0.019
角度范围 angular_range— – 0.0700 −1
当前正则化参数 α current_alpha0.9690
最高正则化参数 α highest_alpha5428000000.0000
实空间数据点数 n_real_points15
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.002; Oscil: 0.878; Stabil: 0.978; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.972; Smooth: 0.160

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合体信息 (68)

7. 引用文献 (1)

8. 文件与曲线 (10)